Бактериоцин
Семейство лактококциноподобных | |||
---|---|---|---|
Идентификаторы | |||
Символ | лактококцин | ||
Пфам | PF04369 | ||
Пфам Клан | CL0400 | ||
ИнтерПро | ИПР007464 | ||
TCDB | 1.С.22 | ||
Суперсемейство OPM | 141 | ||
белок OPM | 6гнз | ||
|
Бактериоцин (Lactococcin_972) | |||
---|---|---|---|
Идентификаторы | |||
Символ | Лактококцин_972 | ||
Пфам | PF09683 | ||
ИнтерПро | ИПР006540 | ||
TCDB | 1.С.37 | ||
Суперсемейство OPM | 457 | ||
белок OPM | 2lgn | ||
|
Бактериоцины представляют собой белковые или пептидные токсины, продуцируемые бактериями для ингибирования роста аналогичных или близкородственных бактериальных штаммов. Они подобны факторам уничтожения дрожжей и парамеций и структурно, функционально и экологически разнообразны. Применение бактериоцинов тестируется для оценки их применения в качестве антибиотиков узкого спектра действия. [ 1 ]
Бактериоцины были впервые открыты Андре Гратиа в 1925 году. [ 2 ] [ 3 ] Он участвовал в процессе поиска способов уничтожения бактерий, что также привело к разработке антибиотиков и открытию бактериофага , и все это в течение нескольких лет. Свое первое открытие он назвал колицином, потому что оно было сделано кишечной палочкой .
Классификация
[ редактировать ]Бактериоцины классифицируются по нескольким признакам, включая возникновение штамма, общие механизмы устойчивости и механизм уничтожения. Существует несколько крупных категорий бактериоцинов, которые связаны между собой только феноменологически. К ним относятся бактериоцины грамположительных бактерий, колицины , [ 4 ] микроцины . бактериоцины архей и Бактериоцины E. coli называются колицинами (ранее называвшимися «колицинами», что означает «убийцы кишечной палочки»). Это наиболее давно изученные бактериоцины. Они представляют собой разнообразную группу бактериоцинов и не включают все бактериоцины, продуцируемые E. coli. Фактически, один из старейших известных так называемых колицинов назывался колицином V , а теперь известен как микроцин V. Он намного меньше, производится и секретируется иначе, чем классические колицины.
Эта система именования проблематична по ряду причин. Во-первых, наименование бактериоцинов по тому, что они предположительно убивают, было бы более точным, если бы их спектр уничтожения совпадал с обозначением рода или вида. Бактериоцины часто обладают спектром, выходящим за пределы названных ими таксонов, и почти никогда не убивают большинство таксонов, в честь которых они названы. Кроме того, первоначальное название обычно происходит не от чувствительного штамма, который убивает бактериоцин, а от организма, продуцирующего бактериоцин. Это делает использование этой системы именования проблематичной основой для теории; таким образом, альтернативные системы классификации. [ нужна ссылка ]
Бактериоцины, содержащие модифицированную аминокислоту лантионин, в своей структуре называются лантибиотиками . Однако попытки реорганизовать номенклатуру семейства природных продуктов рибосомально синтезируемых и посттрансляционно модифицированных пептидов (RiPP) привели к дифференциации лантипептидов от бактериоцинов на основе биосинтетических генов. [ 5 ]
Методы классификации
[ редактировать ]Альтернативные методы классификации включают: метод уничтожения ( порообразование , активность нуклеазы , ингибирование продукции пептидогликана и т. д.), генетику (большие плазмиды , малые плазмиды, хромосомные ), молекулярную массу и химию (крупный белок, пептид или без него) , с сахаром . фрагмент, содержащий атипичные аминокислоты, такие как лантионин), и способ получения ( рибосомальный , пострибосомальные модификации, нерибосомальный).
Из грамотрицательных бактерий
[ редактировать ]Грамотрицательные бактериоцины обычно классифицируются по размеру. Микроцины имеют размер менее 20 кДа, колициноподобные бактериоцины имеют размер от 20 до 90 кДа и тайлоцины или так называемые высокомолекулярные бактериоцины, которые представляют собой многосубъединичные бактериоцины, напоминающие хвосты бактериофагов. Эта классификация размеров также совпадает с генетическим, структурным и функциональным сходством.
Микроцины
[ редактировать ]См. основную статью о микроцинах .
Колициноподобные бактериоцины
[ редактировать ]Колицины — это бактериоцины, обнаруженные в грамотрицательной кишечной палочке . Подобные бактериоцины (CLB, колициноподобные бактериоцины) встречаются и у других грамотрицательных бактерий. CLB обычно нацелены на одни и те же виды и имеют видоспецифичные названия: клебицины от Klebsiella и пестицины от Yersia pestis . [ 6 ] Род Pseudomonas производит бактериоцины, называемые пиоцинами . Пиоцины S-типа относятся к CLB, а пиоцины R- и F-типа относятся к тайлоцинам. [ 7 ]
CLB отличаются от грамположительных бактериоцинов. Это модульные белки размером от 20 до 90 кДа. Они часто состоят из рецепторсвязывающего домена, транслокационного домена и цитотоксического домена. Комбинации этих доменов между различными CLB часто встречаются в природе и могут быть созданы в лаборатории. Благодаря этим комбинациям дальнейшая подклассификация может быть основана либо на механизме импорта (группы А и В), либо на цитотоксическом механизме (нуклеазы, порообразующие, М-тип, L-тип). [ 4 ]
Тайлоцины
[ редактировать ]Наиболее хорошо изучены тайлоцины Pseudomonas aeruginosa . Их можно подразделить на пиоцины R-типа и F-типа. [ 8 ] Некоторые исследования были проведены с целью идентифицировать пиоцины и показать, как они участвуют в межклеточной конкуренции между близкородственными бактериями Pseudomonas.
Два типа тайлоцинов различаются по своей структуре; оба они состоят из оболочки и полой трубки, образующей длинную геликоидальную гексамерную структуру, прикрепленную к опорной пластине. Есть несколько хвостовых волокон, которые позволяют вирусной частице связываться с клеткой-мишенью. Однако R-пиоцины представляют собой большую жесткую сократительную структуру, похожую на хвост, тогда как F-пиоцины представляют собой небольшую гибкую, несокращающуюся структуру, похожую на хвост.
Тайлоцины кодируются профаговыми последовательностями в геноме бактерий, и их производство происходит, когда родственные бактерии обнаруживаются в среде конкурирующих бактерий. Частицы синтезируются в центре клеток и после созревания мигрируют к полюсу клетки через структуру тубулина. Затем тайлоцины будут выброшены в среду при лизисе клеток. Они могут проецироваться на расстояние до нескольких десятков микрометров благодаря очень высокому тургорному давлению клетки. Высвободившиеся тайлоцины затем распознают родственные бактерии и связываются с ними, чтобы убить их. [ 9 ]
Из грамположительных бактерий
[ редактировать ]Бактериоцины грамположительных бактерий обычно подразделяют на класс I, класс IIa/b/c и класс III. [ 10 ]
Бактериоцины I класса
[ редактировать ]Бактериоцины класса I представляют собой небольшие пептидные ингибиторы и включают низин и другие лантибиотики .
Бактериоцины II класса
[ редактировать ]Бактериоцины класса II представляют собой небольшие (<10 кДа) термостабильные белки. Этот класс подразделяется на пять подклассов. Бактериоцины класса IIa (педиоциноподобные бактериоцины) представляют собой самую крупную подгруппу и содержат N-концевую консенсусную последовательность -Tyr-Gly-Asn-Gly-Val-Xaa-Cys во всей этой группе. [ 11 ] [ 12 ] С-конец отвечает за видоспецифическую активность, вызывая утечку клеток за счет проницаемости клеточной стенки-мишени.
- Бактериоцины класса IIa имеют большой потенциал для использования в консервировании пищевых продуктов , а также в медицинских целях благодаря их сильной антилистериозной активности и широкому спектру активности. Одним примером бактериоцина класса IIa является педиоцин PA-1 . [ 13 ]
- Бактериоцины класса IIb (двупептидные бактериоцины) для своей активности требуют двух разных пептидов. Одним из таких примеров является лактококцин G , который проникает через клеточные мембраны для одновалентных катионов натрия и калия , но не для двухвалентных катионов. Почти все эти бактериоцины имеют мотивы GxxxG. Этот мотив также встречается в трансмембранных белках , где они участвуют во взаимодействиях спираль-спираль. Соответственно, мотивы бактериоцина GxxxG могут взаимодействовать с мотивами в мембранах бактериальных клеток, убивая клетки. [ 14 ]
- Класс IIc включает циклические пептиды , у которых N-концевая и C-концевая области ковалентно связаны. Энтероцин АС-48 является прототипом этой группы.
- Класс IId включает однопептидные бактериоцины, которые не модифицируются посттрансляционно и не имеют признаков, подобных педиоцину. Лучшим примером этой группы является высокостабильный ауреоцин А53 . Этот бактериоцин стабилен в сильнокислых условиях, при высоких температурах и не подвергается воздействию протеаз . [ 15 ]
Последний предложенный подкласс — это класс IIe, который включает бактериоцины, состоящие из трех или четырех непедиоциноподобных пептидов. Лучшим примером является ауреоцин А70 , четырехпептидный бактериоцин, высокоактивный против Listeria monocytogenes , имеющий потенциальное биотехнологическое применение. [ 16 ]
Бактериоцины III класса
[ редактировать ]Бактериоцины класса III представляют собой крупные термолабильные (> 10 кДа) белковые бактериоцины. Этот класс подразделяется на два подкласса: подкласс IIIa (бактериолизины) и подкласс IIIb. Подкласс IIIa включает пептиды, которые убивают бактериальные клетки путем разрушения клеточной стенки , вызывая тем самым лизис клеток. Наиболее изученным бактериолизином является лизостафин , пептид массой 27 кДа, который гидролизует клеточные стенки нескольких видов стафилококков , главным образом S. aureus . [ 17 ] Подкласс IIIb, напротив, включает те пептиды, которые не вызывают лизис клеток, убивая клетки-мишени путем нарушения потенциала плазматической мембраны.
Бактериоцины IV класса
[ редактировать ]Бактериоцины класса IV определяются как сложные бактериоцины, содержащие липидные или углеводные фрагменты. Подтверждение экспериментальными данными было установлено при характеристике субланцина и гликоцина F (GccF) двумя независимыми группами. [ 18 ] [ 19 ]
Базы данных
[ редактировать ]Доступны две базы данных бактериоцинов: BAGEL. [ 20 ] и БАКТИБАЗА. [ 21 ] [ 22 ]
Использование
[ редактировать ]По состоянию на 2016 год низин был единственным бактериоцином, признанным FDA безопасным, и использовался в качестве пищевого консерванта в нескольких странах. [ 23 ] Как правило, бактериоцины бесполезны в качестве пищевых консервантов, поскольку их производство дорогое, они расщепляются в пищевых продуктах, повреждают некоторые белки в пищевых продуктах и воздействуют на слишком узкий круг микробов. [ 23 ]
Кроме того, в растениях были получены бактериоцины, активные против E. coli , Salmonella и Pseudomonas aeruginosa, с целью их использования в качестве пищевых добавок. [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] в целом считает использование бактериоцинов в пищевых продуктах безопасным FDA . [ 24 ]
Более того, недавно было продемонстрировано, что бактериоцины, активные против фитопатогенных бактерий, могут экспрессироваться в растениях, обеспечивая надежную устойчивость растений к болезням. [ 27 ]
Актуальность для здоровья человека
[ редактировать ]Бактериоцины производятся непатогенными лактобактериями во влагалище и помогают поддерживать стабильность вагинального микробиома . [ 28 ]
Исследовать
[ редактировать ]Бактериоцины были предложены в качестве замены антибиотиков, к которым патогенные бактерии приобрели устойчивость . Потенциально бактериоцины могут вырабатываться бактериями, намеренно введенными пациенту для борьбы с инфекцией. [ 1 ] Существует несколько стратегий, с помощью которых можно обнаружить новые бактериоцины. В прошлом бактериоцины приходилось идентифицировать с помощью интенсивных культуральных исследований. скрининг на антимикробную активность в отношении подходящих мишеней и последующую очистку с использованием строгих методов перед тестированием. Однако с наступлением геномной эры доступность последовательностей бактериального генома произвела революцию в подходе к идентификации бактериоцинов. Недавно разработанные in silico методы могут быть применены для быстрого скрининга тысяч бактериальных геномов с целью идентификации новых антимикробных пептидов. [ 29 ]
По состоянию на 2014 год некоторые бактериоцины были изучены в исследованиях in vitro , чтобы выяснить, могут ли они остановить репликацию вирусов, а именно стафилококцин 188 против вируса болезни Ньюкасла , вируса гриппа и колифагального вируса HSA; каждый из энтероцина AAR-71 класса IIa, энтероцина AAR-74 класса IIa и эрвиниоцина NA4 против колифагального вируса HSA; каждый из энтероцина ST5Ha, энтероцина NKR-5-3C и субтилозина против HSV-1; каждый из энтероцина ST4V и энтероцина CRL35 класса IIa против HSV-1 и HSV-2; лабиринтопептин А1 против ВИЧ-1 и ВПГ-1; и бактериоцин из Lactobacillus delbrueckii против вируса гриппа. [ 30 ]
По состоянию на 2009 год некоторые бактериоцины, цитолизин , пиоцин S2, колицины A и E1 и микроцин MccE492 [ 31 ] был протестирован на линиях эукариотических клеток и на мышиной модели рака. [ 32 ]
По имени
[ редактировать ]- ацидоцин
- актагардин
- агроцин
- альвейцин
- ауреоцин
- ауреоцин А53
- ауреоцин А70
- голод
- карноцин
- карноциклин
- казеицин
- крупа [ 33 ]
- циркулярин А [ 34 ]
- колицин
- курватицин
- диверцин
- дурамицин
- энтероцин
- энтеролизин
- эпидермин/галлидермин
- эрвиниоцин
- гардимицин
- гасерицин А [ 35 ]
- глицинецин
- галоцин
- галодурацин
- клебицин
- лактоцин С [ 36 ]
- лактококцин
- лакцин
- лейкокцин
- лизостафин
- мацедоцин
- мерсацидин
- мезентерицин
- микробиспорицин
- микроцин
- микроцин С
- мутация
- низин
- пенибациллин
- планопорицин
- педиоцин
- пентоцин
- плантарицин
- пневмоциклицин [ 37 ]
- пиоцин [ 38 ]
- реутерицин 6 [ 39 ]
- реутерициклин
- маршрутизатор
- небрежность
- саливарицин [ 40 ]
- субланцин
- субтилин
- сульфобицин
- тасмансин [ 41 ]
- турицин 17
- трифолитоксин
- вариацин
- вибриоцин
- варнерицин
- Уорнерс
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б Коттер П.Д., Росс Р.П., Хилл С. (февраль 2013 г.). «Бактериоцины – жизнеспособная альтернатива антибиотикам?». Обзоры природы. Микробиология . 11 (2): 95–105. дои : 10.1038/nrmicro2937 . ПМИД 23268227 . S2CID 37563756 .
- ^ Грация А (1925). «О замечательном примере антагонизма между двумя штаммами койлбацилл». Счет Возвращает. Соц. Биол. (на французском языке). 93 :1040–2. НАИД 10027104803 .
- ^ Грация JP (октябрь 2000 г.). «Андре Гратиа: предшественник микробной и вирусной генетики» . Генетика . 156 (2): 471–6. дои : 10.1093/генетика/156.2.471 . ПМЦ 1461273 . ПМИД 11014798 .
- ^ Перейти обратно: а б Каскальс Э., Бьюкенен С.К., Дюше Д., Клеантус С., Ллубес Р., Постл К. и др. (март 2007 г.). «Колициновая биология» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 71 (1): 158–229. дои : 10.1128/MMBR.00036-06 . ПМЦ 1847374 . ПМИД 17347522 .
- ^ Арнисон П.Г., Бибб М.Дж., Бирбаум Г., Бауэрс А.А., Бугни Т.С., Булай Г. и др. (январь 2013 г.). «Рибосомально синтезированные и посттрансляционно модифицированные пептидные природные продукты: обзор и рекомендации по универсальной номенклатуре» . Отчеты о натуральных продуктах . 30 (1): 108–60. дои : 10.1039/c2np20085f . ПМЦ 3954855 . ПМИД 23165928 .
- ^ Беренс Х.М., Шесть А, Уокер Д., Клеантхаус К. (апрель 2017 г.). Уокер Д. (ред.). «Терапевтический потенциал бактериоцинов как белковых антибиотиков» . Новые темы в науках о жизни . 1 (1): 65–74. дои : 10.1042/ETLS20160016 . ПМЦ 7243282 . ПМИД 33525816 .
- ^ Мишель-Бриан Ю., Байсс К. (май 2002 г.). «Пиоцины Pseudomonas aeruginosa». Биохимия . 84 (5–6): 499–510. дои : 10.1016/S0300-9084(02)01422-0 . ПМИД 12423794 .
- ^ Гекуйр М.Г., Де Мот Р. (июль 2014 г.). «Рибосомально-кодируемые антибактериальные белки и пептиды Pseudomonas» . Обзоры микробиологии FEMS . 38 (4): 523–68. дои : 10.1111/1574-6976.12079 . ПМИД 24923764 .
- ^ Вашерон Дж., Хейман К.М., Кил К. (январь 2021 г.). «Динамика производства живых клеток, взрывное высвобождение и убивающая активность фагового хвостообразного оружия для исключения родственников Pseudomonas» . Коммуникационная биология . 87 (4): 87. дои : 10.1038/s42003-020-01581-1 . ПМЦ 7815802 . ПМИД 33469108 .
- ^ Коттер П.Д., Хилл С., Росс Р.П. (февраль 2006 г.). «Что в названии? Классовое различие бактериоцинов» . Обзоры природы Микробиология . 4 (2): 160. doi : 10.1038/nrmicro1273-c2 . S2CID 29421506 . ответ автора на комментарий к статье: Коттер П.Д., Хилл С., Росс Р.П. (октябрь 2005 г.). «Бактериоцины: развитие врожденного иммунитета к пище». Обзоры природы. Микробиология . 3 (10): 777–88. дои : 10.1038/nrmicro1273 . ПМИД 16205711 . S2CID 19040535 .
- ^ Чжу, Лиян; Цзэн, Цзяньвэй; Ван, Чанг; Ван, Цзявэй (08 февраля 2022 г.). «Структурные основы образования пор в системе маннозофосфотрансферазы педиоцином ПА-1» . Прикладная и экологическая микробиология . 88 (3): e0199221. дои : 10.1128/АЕМ.01992-21 . ISSN 1098-5336 . ПМЦ 8824269 . ПМИД 34851716 .
- ^ Чжу, Лиян; Цзэн, Цзяньвэй; Ван, Цзявэй (15 июня 2022 г.). «Структурные основы механизмов иммунитета педиоциноподобных бактериоцинов» . Прикладная и экологическая микробиология . 88 (13): e0048122. дои : 10.1128/aem.00481-22 . ISSN 1098-5336 . ПМЦ 9275228 . ПМИД 35703550 .
- ^ Хенг, Северная Каролина, Уэскомб, Пенсильвания, Бертон Дж.П., Джек Р.В., Тагг-младший (2007). «Разнообразие бактериоцинов грамположительных бактерий». Бактериоцины . стр. 45–92. дои : 10.1007/978-3-540-36604-1_4 . ISBN 978-3-540-36603-4 .
- ^ Ниссен-Мейер Дж., Рогне П., Оппегорд К., Хауген Х.С., Кристиансен П.Е. (январь 2009 г.). «Структурно-функциональные взаимоотношения бактериоцинов, не содержащих лантионин (класс II), продуцируемых грамположительными бактериями». Современная фармацевтическая биотехнология . 10 (1): 19–37. дои : 10.2174/138920109787048661 . ПМИД 19149588 .
- ^ Netz DJ, Pohl R, Beck-Sickinger AG, Selmer T, Pierik AJ, Bastos M, Sahl HG (июнь 2002 г.). «Биохимическая характеристика и генетический анализ ауреоцина А53, нового атипичного бактериоцина из Staphylococcus aureus». Журнал молекулярной биологии . 319 (3): 745–56. дои : 10.1016/S0022-2836(02)00368-6 . ПМИД 12054867 .
- ^ Netz DJ, Sahl HG, Marcelino R, dos Santos Nascimento J, de Oliveira SS, Soares MB и др. (август 2001 г.). «Молекулярная характеристика ауреоцина А70, мультипептидного бактериоцина, выделенного из золотистого стафилококка». Журнал молекулярной биологии . 311 (5): 939–49. дои : 10.1006/jmbi.2001.4885 . ПМИД 11531330 .
- ^ Бастос, доктор медицинских наук, Коутиньо Б.Г., Коэльо М.Л. (апрель 2010 г.). «Лизостафин: стафилококковый бактериолизин с потенциальным клиническим применением» . Фармацевтика . 3 (4): 1139–1161. дои : 10.3390/ph3041139 . ПМК 4034026 . ПМИД 27713293 .
- ^ Оман Т.Дж., Беттчер Дж.М., Ван Х., Окалибе X.Н., ван дер Донк В.А. (февраль 2011 г.). «Субланцин — это не лантибиотик, а S-связанный гликопептид» . Химическая биология природы . 7 (2): 78–80. дои : 10.1038/nchembio.509 . ПМК 3060661 . ПМИД 21196935 .
- ^ Степпер Дж., Шастри С., Лу Т.С., Престон Дж.К., Новак П., Ман П. и др. (февраль 2011 г.). «Цистеин S-гликозилирование, новая посттрансляционная модификация, обнаруженная в гликопептидных бактериоцинах». Письма ФЭБС . 585 (4): 645–50. doi : 10.1016/j.febslet.2011.01.023 . ПМИД 21251913 . S2CID 29992601 .
- ^ де Йонг А., ван Хиюм С.А., Бийлсма Дж.Дж., Кок Дж., Койперс ОП (июль 2006 г.). «БАГЕЛЬ: сетевой инструмент для анализа генома бактериоцинов» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (проблема с веб-сервером): W273-9. дои : 10.1093/нар/gkl237 . ПМЦ 1538908 . ПМИД 16845009 .
- ^ Хаммами Р., Зухир А., Бен Хамида Дж., Флисс И. (октябрь 2007 г.). «BACTIBASE: новая доступная в Интернете база данных для характеристики бактериоцинов» . БМК Микробиология . 7 (1): 89. дои : 10.1186/1471-2180-7-89 . ПМК 2211298 . ПМИД 17941971 .
- ^ Хаммами Р., Зухир А., Ле Лей С., Бен Хамида Дж., Флисс И. (январь 2010 г.). «Второй выпуск BACTIBASE: база данных и инструментальная платформа для характеристики бактериоцинов» . БМК Микробиология . 10 (1): 22. дои : 10.1186/1471-2180-10-22 . ПМЦ 2824694 . ПМИД 20105292 .
- ^ Перейти обратно: а б Фахим Х.А., Хайралла А.С., Эль-Генди АО (16 сентября 2016 г.). «Нанотехнология: ценная стратегия улучшения составов бактериоцинов» . Границы микробиологии . 7 : 1385. дои : 10.3389/fmicb.2016.01385 . ПМК 5026012 . ПМИД 27695440 .
- ^ Перейти обратно: а б Шульц С., Стефан А., Хан С., Бортези Л., Ярчовски Ф., Беттманн У. и др. (октябрь 2015 г.). «Широкий и эффективный контроль основных пищевых патогенных штаммов Escherichia coli с помощью смесей колицинов растительного происхождения» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (40): Е5454-60. Бибкод : 2015PNAS..112E5454S . дои : 10.1073/pnas.1513311112 . ПМК 4603501 . ПМИД 26351689 .
- ^ Шнайдер Т., Хан-Лёбман С., Стефан А., Шульц С., Гирич А., Науманн М. и др. (март 2018 г.). «Растительные бактериоцины сальмонеллы сальмоцины для борьбы с патоварами сальмонеллы» . Научные отчеты . 8 (1): 4078. Бибкод : 2018НатСР...8.4078С . дои : 10.1038/s41598-018-22465-9 . ПМК 5840360 . ПМИД 29511259 .
- ^ Пашкевичюс С.Х., Старкевич У., Мисюнас А., Виткаускиен А., Глеба Ю., Радянскиен А. (3 октября 2017 г.). «Растительные пиоцины для борьбы с Pseudomonas aeruginosa» . ПЛОС ОДИН . 12 (10): e0185782. Бибкод : 2017PLoSO..1285782P . дои : 10.1371/journal.pone.0185782 . ПМК 5626474 . ПМИД 28973027 .
- ^ Руни В.М., Гринтер Р.В., Коррейя А., Паркхилл Дж., Уокер Д.С., Милнер Дж.Дж. (май 2020 г.). «Инженерная бактериоцин-опосредованная устойчивость к патогену растений Pseudomonas syringae» . Журнал биотехнологии растений . 18 (5): 1296–1306. дои : 10.1111/pbi.13294 . ПМК 7152609 . ПМИД 31705720 .
- ^ Нардис С., Моска Л., Мастромарино П. (сентябрь – октябрь 2013 г.). «Вагинальная микробиота и вирусные заболевания, передающиеся половым путем». Анналы гигиены . 25 (5): 443–56. дои : 10.7416/ai.2013.1946 . ПМИД 24048183 .
- ^ Резаи Джаван Р., ван Тондер А.Дж., Кинг Дж.П., Харролд К.Л., Брюггеманн А.Б. (август 2018 г.). «Секвенирование генома раскрывает большой и разнообразный набор антимикробных пептидов» . Границы микробиологии . 9 (9): 2012. doi : 10.3389/fmicb.2018.02012 . ПМК 6120550 . ПМИД 30210481 .
- ^ Аль Кассаа И., Хобер Д., Хамзе М., Чихиб Н.Э., Дридер Д. (декабрь 2014 г.). «Противовирусный потенциал молочнокислых бактерий и их бактериоцинов». Пробиотики и антимикробные белки . 6 (3–4): 177–85. дои : 10.1007/s12602-014-9162-6 . ПМИД 24880436 . S2CID 43785241 .
- ^ Хуан К., Цзэн Дж., Лю Х, Цзян Т., Ван Дж. (апрель 2021 г.). «Структура системы маннозофосфотрансферазы (человек-ПТС) в комплексе с микроцином Е492, порообразующим бактериоцином» . Открытие клеток . 7 (1): 20. дои : 10.1038/s41421-021-00253-6 . ПМК 8021565 . ПМИД 33820910 .
- ^ Лагос Р., Тельо М., Меркадо Г., Гарсия В., Монастерио О. (январь 2009 г.). «Антибактериальные и противоопухолевые свойства микроцина Е492, порообразующего бактериоцина». Современная фармацевтическая биотехнология . 10 (1): 74–85. дои : 10.2174/138920109787048643 . HDL : 10533/142500 . ПМИД 19149591 .
- ^ Наклерио Дж., Рикка Э., Сакко М., Де Феличе М. (декабрь 1993 г.). «Антимикробная активность недавно выявленного бактериоцина Bacillus cereus» . Прикладная и экологическая микробиология . 59 (12): 4313–6. Бибкод : 1993ApEnM..59.4313N . дои : 10.1128/АЕМ.59.12.4313-4316.1993 . ЧВК 195902 . ПМИД 8285719 .
- ^ Каваи Ю., Кемперман Р., Кок Дж., Сайто Т. (октябрь 2004 г.). «Циркулярные бактериоцины гасерицин А и циркулярин А» (PDF) . Современная наука о белках и пептидах . 5 (5): 393–8. дои : 10.2174/1389203043379549 . ПМИД 15544534 . S2CID 25735597 .
- ^ Пандей Н., Малик Р.К., Кошик Дж.К., Сингроха Г. (ноябрь 2013 г.). «Гассерицин А: кольцевой бактериоцин, продуцируемый молочнокислыми бактериями Lactobacillus gasseri». Всемирный журнал микробиологии и биотехнологии . 29 (11): 1977–87. дои : 10.1007/s11274-013-1368-3 . ПМИД 23712477 . S2CID 30931536 .
- ^ Мёртведт К.И., Ниссен-Мейер Дж., Слеттен К., Нес И.Ф. (июнь 1991 г.). «Очистка и аминокислотная последовательность лактоцина S, бактериоцина, продуцируемого Lactobacillus Sake L45» . Прикладная и экологическая микробиология . 57 (6): 1829–34. Бибкод : 1991ApEnM..57.1829M . дои : 10.1128/АЕМ.57.6.1829-1834.1991 . ЧВК 183476 . ПМИД 1872611 .
- ^ Богардт С., ван Тондер А.Дж., Брюггеманн А.Б. (июль 2015 г.). «Геномный анализ пневмококков выявил широкое разнообразие бактериоцинов, включая пневмоциклицин, новый кольцевой бактериоцин» . БМК Геномика . 16 (1): 554. doi : 10.1186/s12864-015-1729-4 . ПМЦ 4517551 . ПМИД 26215050 .
- ^ Мишель-Бриан Ю, Байсс С (2002). «Пиоцины Pseudomonas aeruginosa». Биохимия . 84 (5–6): 499–510. дои : 10.1016/s0300-9084(02)01422-0 . ПМИД 12423794 .
- ^ Кабуки Т., Сайто Т., Каваи Ю., Уэмура Дж., Ито Т. (февраль 1997 г.). «Производство, очистка и характеристика реутерицина 6, бактериоцина с литической активностью, продуцируемого Lactobacillus reuteri LA6». Международный журнал пищевой микробиологии . 34 (2): 145–56. дои : 10.1016/s0168-1605(96)01180-4 . ПМИД 9039561 .
- ^ Уэскомб П.А., Аптон М., Дирксен К.П., Рагланд Н.Л., Сивабалан С., Вираван Р.Э. и др. (февраль 2006 г.). «Продукция лантибиотика саливарицина А и его вариантов пероральными стрептококками и использование специфического индукционного анализа для обнаружения их присутствия в слюне человека» . Прикладная и экологическая микробиология . 72 (2): 1459–66. Бибкод : 2006ApEnM..72.1459W . дои : 10.1128/aem.72.2.1459-1466.2006 . ПМК 1392966 . ПМИД 16461700 .
- ^ Мюллер И., Лурц Р., Гейдер К. (июль 2012 г.). «Тасманцин и лизогенные бактериофаги, индуцированные штаммами Erwinia tasmaniensis». Микробиологические исследования . 167 (7): 381–7. дои : 10.1016/j.micres.2012.01.005 . ПМИД 22381912 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- База данных бактериоцинов для бубликов
- База данных BACTIBASE
- Бактериоцины Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)