Кортиковирус
| Кортиковирус | |
|---|---|
| |
| Собранный капсид состоит из белков P2 и P3. [ 1 ] | |
Классификация вирусов 
| |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Вариднавирия |
| Королевство: | Бэмфордвире |
| Тип: | Преплазмовирус |
| Сорт: | Тектиливирицеты |
| Заказ: | Винавирусы |
| Семья: | Кортиковирусы |
| Род: | Кортиковирус |
Кортиковирусы — род вирусов семейства Corticoviridae . [ 2 ] Кортиковирусы являются бактериофагами ; то есть их естественными хозяевами являются бактерии . Род включает два вида. [ 2 ] [ 3 ] Название происходит от латинского cortex , corticis (что означает «корка» или «кора»). Однако профаги , тесно связанные с PM2, широко распространены в геномах водных бактерий, что позволяет предположить, что экологическое значение кортиковирусов может быть недооценено. [ 4 ] Бактериофаг PM2 был впервые описан в 1968 году после выделения из морской воды , отобранной у побережья Чили . [ 5 ]
Таксономия
[ редактировать ]Род включает следующие виды: [ 6 ]
Другие неназначенные фаги: [ 7 ]
Вирусология
[ редактировать ]Вироны состоят из круглого, икосаэдрического , безоболочечного капсида диаметром 60 нм и внутренней липидной мембраны , расположенной между внешней и внутренней белковой оболочкой. [ 8 ] Раковины состоят из трех слоев, на поверхности которых виден узор с отличительными чертами. [ 9 ] включая кустообразные шипы, торчащие из двенадцати вершин . [ 10 ]
Икосаэдрический капсид (T = 21) имеет диаметр 56 нанометров (нм) и состоит из 1200 белков P1 (шип) и 60 белков P2 (капсид). Шипы, связывающие пентамерные рецепторы, выступают из 12 пятикратных осей. Капсид окружает внутреннее липидное ядро, содержащее структурные белки от P3 до P10. [ нужна ссылка ]
Геном
[ редактировать ]Геном не сегментирован, составляет 13% веса вируса и содержит одну молекулу кольцевой, сверхспиральной , двухцепочечной ДНК 10 тысяч оснований длиной . В геноме содержание g + c составляет 43%. [ 11 ] Он кодирует ~21 белок.
Транскрипция организована в три оперона.
Репликация генома осуществляется по механизму катящегося круга, инициируемому эндонуклеазой P12, кодируемой вирусом. [ нужна ссылка ]
| Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
|---|---|---|---|---|---|
| Кортиковирус | Многогранник | Т=21 | Без конверта | Круговой | Однодольный |
Жизненный цикл
[ редактировать ]
Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем адсорбции на поверхности клетки-хозяина с последующим слиянием вирусной мембраны с внешней мембраной клетки-хозяина и последующей доставкой генома внутрь клетки. [ 12 ] Транскрипция с помощью ДНК-матрицы - это метод транскрипции. бактерии родов Pseudoalteromonas , Marinomonas и Vibrio Естественным хозяином служат . Кортиковирус PM2 является литическим вирусом и в конце цикла заражения разрушает клетку-хозяина с помощью уникальной системы лизиса, состоящей из кодируемых фагом белков P17 и P18, а также неопознанного аутолизина хозяина. [ 13 ] Однако идентификация PM2-подобных провирусов в бактериальных геномах указывает на то, что другие члены этого семейства могут быть вирусами умеренного климата. Пути передачи – пассивная диффузия. [ 3 ]
| Род | Сведения о хосте | Тканевой тропизм | Детали входа | Подробности выпуска | Сайт репликации | Монтажный участок | Передача инфекции |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Кортиковирус | Бактерии | Никто | Инъекция | Лизис | Цитоплазма | Цитоплазма | Пассивная диффузия |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Абресия, Никола Г.А.; Граймс, Джонатан М.; Кивеля, Ханна М.; Ассенберг, Рене; Саттон, Джефф К.; Мясник, Сара Дж.; Бэмфорд, Яана К.Х.; Бэмфорд, Деннис Х.; Стюарт, Дэвид И. (сентябрь 2008 г.). «Понимание эволюции вирусов и мембранного биогенеза на основе структуры морского липидсодержащего бактериофага PM2» . Молекулярная клетка . 31 (5): 749–761. doi : 10.1016/j.molcel.2008.06.026 . ПМИД 18775333 .
- ^ Jump up to: а б «Кортиковирусы» . ICTV Online (10-й) репортаж .
- ^ Jump up to: а б «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
- ^ Крупович М., Бэмфорд Д.Х. (2007). «Предположительные профаги, родственные литическому бесхвостому морскому фагу дцДНК PM2, широко распространены в геномах водных бактерий» . БМК Геномика . 8 : 236. дои : 10.1186/1471-2164-8-236 . ЧВК 1950889 . ПМИД 17634101 .
- ^ Эспехо, Ромилио Т.; Канело, Элиана С. (апрель 1968 г.). «Свойства бактериофага PM2: липидсодержащего бактериального вируса». Вирусология . 34 (4): 738–747. дои : 10.1016/0042-6822(68)90094-9 . ПМИД 5655723 .
- ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 22 мая 2021 г.
- ^ Кортиковирусы . Таксономия NCBI.
- ^ Кивелд, Х.М., Калккинен, Н. и Бэмфорд, Д.Х. (2002). Бактериофаг РМ2 имеет белковый капсид, окружающий сферическое липидно-белковое ядро» J. Virol. 76, 8169-8178.
- ^ Кивелд, Х.М., Мяннисто, Р.Х., Калккинен, Н. и Бэмфорд, Д.Х. (1999). Очистка и белковый состав PM2, первого выделенного липидсодержащего бактериального вируса» Virology 262, 364-374.
- ^ Харрисон, СК, Каспар, Д.Л., Камерини-Отеро, Р.Д. и Франклин, РМ (1971). Расположение липидов и белков в бактериофаге PM2. Нат. Новая Биол., 229, 197-201.
- ^ Мяннисто, Р.Х., Кивела, Х.М., Паулин, Л., Бэмфорд, Д.Х. и Бэмфорд, Дж.К.Х. (1999). Полная последовательность генома PM2, первого выделенного липидсодержащего бактериального вируса» Virology 262, 355-363.
- ^ Цвиркайте-Крупович В., Крупович М., Дагелавичюс Р., Бэмфорд Д.Х. (2010). «Зависимое от ионов кальция проникновение мембраносодержащего бактериофага PM2 в хозяина Pseudoalteromonas» . Вирусология . 405 (1): 120–128. дои : 10.1016/j.virol.2010.05.021 . ПМИД 20646729 .
- ^ Крупович М., Дагелавичюс Р., Бэмфорд Д.Х. (2007). «Новая система лизиса в PM2, липидсодержащем морском бактериофаге с двухцепочечной ДНК» . Мол Микробиол . 64 (6): 1635–48. дои : 10.1111/j.1365-2958.2007.05769.x . ПМИД 17555443 .