Jump to content

Кортиковирус

(Перенаправлено с вируса Pseudoalteromonas PM2 )

Кортиковирус
Собранный капсид состоит из белков P2 и P3. [ 1 ]
Классификация вирусов Изменить эту классификацию
(без рейтинга): Вирус
Область : Вариднавирия
Королевство: Бэмфордвире
Тип: Преплазмовирус
Сорт: Тектиливирицеты
Заказ: Винавирусы
Семья: Кортиковирусы
Род: Кортиковирус

Кортиковирусы — род вирусов семейства Corticoviridae . [ 2 ] Кортиковирусы являются бактериофагами ; то есть их естественными хозяевами являются бактерии . Род включает два вида. [ 2 ] [ 3 ] Название происходит от латинского cortex , corticis (что означает «корка» или «кора»). Однако профаги , тесно связанные с PM2, широко распространены в геномах водных бактерий, что позволяет предположить, что экологическое значение кортиковирусов может быть недооценено. [ 4 ] Бактериофаг PM2 был впервые описан в 1968 году после выделения из морской воды , отобранной у побережья Чили . [ 5 ]

Таксономия

[ редактировать ]

Род включает следующие виды: [ 6 ]

Другие неназначенные фаги: [ 7 ]

Вирусология

[ редактировать ]

Вироны состоят из круглого, икосаэдрического , безоболочечного капсида диаметром 60 нм и внутренней липидной мембраны , расположенной между внешней и внутренней белковой оболочкой. [ 8 ] Раковины состоят из трех слоев, на поверхности которых виден узор с отличительными чертами. [ 9 ] включая кустообразные шипы, торчащие из двенадцати вершин . [ 10 ]

Икосаэдрический капсид (T = 21) имеет диаметр 56 нанометров (нм) и состоит из 1200 белков P1 (шип) и 60 белков P2 (капсид). Шипы, связывающие пентамерные рецепторы, выступают из 12 пятикратных осей. Капсид окружает внутреннее липидное ядро, содержащее структурные белки от P3 до P10. [ нужна ссылка ]

Геном не сегментирован, составляет 13% веса вируса и содержит одну молекулу кольцевой, сверхспиральной , двухцепочечной ДНК 10 тысяч оснований длиной . В геноме содержание g + c составляет 43%. [ 11 ] Он кодирует ~21 белок.

Транскрипция организована в три оперона.

Репликация генома осуществляется по механизму катящегося круга, инициируемому эндонуклеазой P12, кодируемой вирусом. [ нужна ссылка ]

Род Структура Симметрия Капсид Геномное расположение Геномная сегментация
Кортиковирус Многогранник Т=21 Без конверта Круговой Однодольный

Жизненный цикл

[ редактировать ]
Механизм проникновения фага Pseudoalteromonas PM2

Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем адсорбции на поверхности клетки-хозяина с последующим слиянием вирусной мембраны с внешней мембраной клетки-хозяина и последующей доставкой генома внутрь клетки. [ 12 ] Транскрипция с помощью ДНК-матрицы - это метод транскрипции. бактерии родов Pseudoalteromonas , Marinomonas и Vibrio Естественным хозяином служат . Кортиковирус PM2 является литическим вирусом и в конце цикла заражения разрушает клетку-хозяина с помощью уникальной системы лизиса, состоящей из кодируемых фагом белков P17 и P18, а также неопознанного аутолизина хозяина. [ 13 ] Однако идентификация PM2-подобных провирусов в бактериальных геномах указывает на то, что другие члены этого семейства могут быть вирусами умеренного климата. Пути передачи – пассивная диффузия. [ 3 ]

Род Сведения о хосте Тканевой тропизм Детали входа Подробности выпуска Сайт репликации Монтажный участок Передача инфекции
Кортиковирус Бактерии Никто Инъекция Лизис Цитоплазма Цитоплазма Пассивная диффузия
  1. ^ Абресия, Никола Г.А.; Граймс, Джонатан М.; Кивеля, Ханна М.; Ассенберг, Рене; Саттон, Джефф К.; Мясник, Сара Дж.; Бэмфорд, Яана К.Х.; Бэмфорд, Деннис Х.; Стюарт, Дэвид И. (сентябрь 2008 г.). «Понимание эволюции вирусов и мембранного биогенеза на основе структуры морского липидсодержащего бактериофага PM2» . Молекулярная клетка . 31 (5): 749–761. doi : 10.1016/j.molcel.2008.06.026 . ПМИД   18775333 .
  2. ^ Jump up to: а б «Кортиковирусы» . ICTV Online (10-й) репортаж .
  3. ^ Jump up to: а б «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
  4. ^ Крупович М., Бэмфорд Д.Х. (2007). «Предположительные профаги, родственные литическому бесхвостому морскому фагу дцДНК PM2, широко распространены в геномах водных бактерий» . БМК Геномика . 8 : 236. дои : 10.1186/1471-2164-8-236 . ЧВК   1950889 . ПМИД   17634101 .
  5. ^ Эспехо, Ромилио Т.; Канело, Элиана С. (апрель 1968 г.). «Свойства бактериофага PM2: липидсодержащего бактериального вируса». Вирусология . 34 (4): 738–747. дои : 10.1016/0042-6822(68)90094-9 . ПМИД   5655723 .
  6. ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 22 мая 2021 г.
  7. ^ Кортиковирусы . Таксономия NCBI.
  8. ^ Кивелд, Х.М., Калккинен, Н. и Бэмфорд, Д.Х. (2002). Бактериофаг РМ2 имеет белковый капсид, окружающий сферическое липидно-белковое ядро» J. Virol. 76, 8169-8178.
  9. ^ Кивелд, Х.М., Мяннисто, Р.Х., Калккинен, Н. и Бэмфорд, Д.Х. (1999). Очистка и белковый состав PM2, первого выделенного липидсодержащего бактериального вируса» Virology 262, 364-374.
  10. ^ Харрисон, СК, Каспар, Д.Л., Камерини-Отеро, Р.Д. и Франклин, РМ (1971). Расположение липидов и белков в бактериофаге PM2. Нат. Новая Биол., 229, 197-201.
  11. ^ Мяннисто, Р.Х., Кивела, Х.М., Паулин, Л., Бэмфорд, Д.Х. и Бэмфорд, Дж.К.Х. (1999). Полная последовательность генома PM2, первого выделенного липидсодержащего бактериального вируса» Virology 262, 355-363.
  12. ^ Цвиркайте-Крупович В., Крупович М., Дагелавичюс Р., Бэмфорд Д.Х. (2010). «Зависимое от ионов кальция проникновение мембраносодержащего бактериофага PM2 в хозяина Pseudoalteromonas» . Вирусология . 405 (1): 120–128. дои : 10.1016/j.virol.2010.05.021 . ПМИД   20646729 .
  13. ^ Крупович М., Дагелавичюс Р., Бэмфорд Д.Х. (2007). «Новая система лизиса в PM2, липидсодержащем морском бактериофаге с двухцепочечной ДНК» . Мол Микробиол . 64 (6): 1635–48. дои : 10.1111/j.1365-2958.2007.05769.x . ПМИД   17555443 .
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 1307eaca481787696e15383456bc92e9__1701197760
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/13/e9/1307eaca481787696e15383456bc92e9.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Corticovirus - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)