Jump to content

Липоксигеназа

(Перенаправлено с Липооксигеназы )
Липоксигеназа
Структура 15S-липоксигеназы ретикулоцитов кролика. [ 1 ]
Идентификаторы
Символ Липоксигеназа
Пфам PF00305
ИнтерПро ИПР013819
PROSITE PDOC00077
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 2сбл / СКОПе / СУПФАМ
Суперсемейство OPM 80
белок OPM 2ч0м
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

Липоксигеназы ( EC 1.13.11.- ( LOX семейство (негемовых ) железосодержащих ферментов ) представляют собой , точнее окислительных ферментов большинство из которых катализирует диоксигенацию ) полиненасыщенных , жирных кислот в липидах, содержащих цис, цис-1. ,4- пентадиен в клеточные сигнальные агенты, которые выполняют различные роли в качестве аутокринных сигналов, регулирующих функцию родительских клеток, паракринных сигналов. которые регулируют функцию близлежащих клеток, и эндокринные сигналы, которые регулируют функцию удаленных клеток.

Липоксигеназы родственны друг другу на основании их схожей генетической структуры и активности диоксигенации. Однако одна липоксигеназа, ALOXE3, хотя и имеет генетическую структуру липоксигеназы, обладает относительно небольшой диоксигенационной активностью; скорее, его основная активность заключается в изомеразной активности, которая катализирует превращение гидропероксиненасыщенных жирных кислот в их 1,5- гидроксильные эпоксидные производные .

Липоксигеназы обнаружены у эукариот (растений, грибов, животных, простейших); в то время как третий домен наземной жизни, археи , обладает белками с небольшим (~ 20%) сходством аминокислотной последовательности с липоксигеназами, в этих белках отсутствуют железосвязывающие остатки, и поэтому, по прогнозам, они не будут обладать липоксигеназной активностью. [ 2 ]

Биохимия

[ редактировать ]

На основании подробного анализа 15-липоксигеназы 1 и стабилизированной 5-липоксигеназы структуры липоксигеназы состоят из 15 килодальтон N-концевого домена бета-барреля массой , небольшого (например, ~0,6 килодальтон) линкерного междомена (см. Белковый домен § Домены и гибкость белка) . ) и относительно большой С-концевой каталитический домен, который содержит негемовое железо, имеющее решающее значение для ферментов. каталитическая активность. [ 3 ] Большинство липоксигеназ (за исключением ALOXE3) катализируют реакцию Полиненасыщенные жирные кислоты + О 2 жирных кислот → гидропероксид в четыре стадии:

  • лимитирующая скорость стадия отделения водорода от бисаллильного метиленового углерода с образованием радикала жирной кислоты у этого углерода
  • перегруппировка радикала на другой углеродный центр
  • присоединение молекулярного кислорода (O 2 ) к перегруппированному углеродному радикальному центру, тем самым образуя связь пероксирадикала (-OO·) с этим углеродом.
  • восстановление пероксирадикала до соответствующего аниона (—OO )

(—OO ) остаток затем может быть протонирован с образованием гидропероксидной группы (-OOH) и дополнительно метаболизирован липоксигеназой, например, до лейкотриенов , гепоксилинов и различных специализированных про-расщепляющих медиаторов , или восстановлен повсеместно распространенными клеточными глутатионпероксидазами до гидроксигруппы, образуя, таким образом, гидроксилированный (-OOH) остаток. -OH) полиненасыщенные жирные кислоты, такие как гидроксиэйкозатетраеновые кислоты и HODE. (т.е. гидроксиоктадекаеновые кислоты). [ 3 ]

Полиненасыщенные жирные кислоты, которые служат субстратами для одной или нескольких липоксигеназ, включают жирные кислоты омега-6 , арахидоновую кислоту , линолевую кислоту , дигомо-γ-линоленовую кислоту и адрениновую кислоту ; жирные кислоты омега -3 , эйкозапентаеновая кислота , докозагексаеновая кислота и альфа-линоленовая кислота ; и жирные кислоты омега-9 , медовухи . [ 4 ] Некоторые типы липоксигеназ, например человеческая и мышиная 15-липоксигеназа 1, 12-липоксигеназа В и ALOXE3, способны метаболизировать субстраты жирных кислот, которые являются составляющими фосфолипидов, эфиров холестерина или сложных липидов кожи. [ 3 ] Большинство липоксигеназ катализируют образование первоначально образующихся гидропероксипродуктов, обладающих S- хиральностью . Исключением из этого правила являются 12R-липоксигеназы человека и других млекопитающих (см. ниже). [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]

Липоксигеназы зависят от доступности их субстратов полиненасыщенных жирных кислот, которые, особенно в клетках млекопитающих, обычно поддерживаются на чрезвычайно низких уровнях. В общем, различные фосфолипазы А2 и диацилглицеринлипазы активируются во время стимуляции клеток, начинают высвобождать эти жирные кислоты из мест их хранения и, таким образом, являются ключевыми регуляторами образования липоксигеназ-зависимых метаболитов. [ 3 ] Кроме того, клетки, активированные таким образом, могут передавать высвобожденные полиненасыщенные жирные кислоты соседним или близлежащим клеткам, которые затем метаболизируют их через свои липоксигеназные пути в процессе, называемом трансклеточным метаболизмом или трансклеточным биосинтезом. [ 6 ]

Биологическая функция и классификация

[ редактировать ]

Эти ферменты наиболее распространены в растениях, где они могут участвовать в ряде различных аспектов физиологии растений, включая рост и развитие, устойчивость к вредителям и старение или реакцию на повреждения. [ 7 ] участвует ряд изоферментов липоксигеназ. У млекопитающих в метаболизме эйкозаноидов (таких как простагландины , лейкотриены и неклассические эйкозаноиды ) [ 8 ] Данные о последовательностях доступны для следующих липоксигеназ:

Растительные липоксигеназы

[ редактировать ]

Растения экспрессируют множество цитозольных липоксигеназ ( EC 1.13.11.12 ; InterPro : IPR001246 ), а также то, что, по-видимому, является изозимом хлоропластов. [ 9 ] Растительная липоксигеназа в сочетании с гидропероксидлиазами ответственна за многие ароматы и другие сигнальные соединения. Одним из примеров является цис-3-гексеналь , запах свежескошенной травы .

Иллюстративная трансформация с участием гидропероксидлиазы. Здесь цис-3-гексеналь образуется из линоленовой кислоты в гидропероксид под действием липоксигеназы, а затем лиазы. [ 10 ]

Человеческие липоксигеназы

[ редактировать ]

За исключением гена, кодирующего 5-LOX ( ALOX5 ), который расположен на хромосоме 10q11.2, все шесть генов LOX человека расположены на хромосоме 17.p13 и кодируют одноцепочечный белок массой 75–81 килодальтон , состоящий из 662–711 аминокислот. млекопитающих Гены LOX содержат 14 ( ALOX5 , ALOX12 , ALOX15 , ALOX15B ) или 15 ( ALOX12B , ALOXE3 ) экзонов с границами экзонов и интронов в высококонсервативных положениях. [ 11 ] [ 12 ] Шесть липоксигеназ человека, а также некоторые из основных продуктов, которые они производят, а также некоторые из их связей с генетическими заболеваниями, следующие: [ 11 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ]

  • Арахидонат-5-липоксигеназа (ALOX5) ( EC 1.13.11.34 ; InterPro : IPR001885 ), также называемая 5-липоксигеназой, 5-LOX и 5-LO. Основные продукты: метаболизирует арахидоновую кислоту до 5-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (5-HpETE), которая превращается в 1) 5-гидроксиикозатетраеновую кислоту (5-HETE), а затем в 5-оксо-эйкозатетраеновую кислоту (5-оксо-ETE). , 2) лейкотриен A4 (LTA4), который затем может превращаться в лейкотриен B4 (LTB4) или лейкотриен C4 (LTC4) (LTC4 может далее метаболизироваться до лейкотриена D4 [LTD4], а затем до лейкотриена E4 [LTE4]), или 3) действуя последовательно с ALOX15, на специализированные про-рассасывающиеся медиаторы , липоксины A4 и B4. ALOX5 также метаболизирует эйкозапентаеновую кислоту с образованием набора метаболитов, которые содержат 5 двойных связей (т.е. 5-HEPE, 5-оксо-EPE, LTB5, LTC5, LTD5 и LTE5) в отличие от 4 метаболитов арахидоновой кислоты, содержащих двойные связи. Фермент, действуя последовательно с другими ферментами липоксигеназой, циклооксигеназой или цитохромом Р450 , способствует метаболизму эйкозапентаеновой кислоты до резольвинов Е-серии (см. Резольвин § Резольвин Es ) и докозагексаеновой кислоты в резольвины серии D (см. Резольвин § Резольвин Ds ). Эти резольвины также классифицируются как специализированные медиаторы разрешения.
  • Арахидонат-12-липоксигеназа (ALOX12) ( EC 1.13.11.31 ; InterPro : IPR001885 ), также называемая 12-липоксигеназой тромбоцитарного типа (или 12-липоксигеназой тромбоцитарного типа) 12-LOX и 12-LO. Он метаболизирует арахидоновую кислоту до 12-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (12-HpETE), которая далее метаболизируется до 12-гидроксиэйкозатетраеновой кислоты (12-HETE) или до различных гепоксилинов (см. также 12-гидроксиэйкозатетраеновая кислота ).
  • Арахидонат-15-липоксигеназа-1 (ALOX15) ( EC 1.13.11.33 ; InterPro : IPR001885 ), также называемая 15-липоксигеназой-1, 15-липоксигеназа эритроцитарного типа (или 15-липоксигеназа эритроцитарного типа), 15-липоксигеназа ретикулоцитарного типа (или 15-липоксигеназа ретикулоцитарного типа), 15-LO-1 и 15-LOX-1. Он метаболизирует арахидоновую кислоту в основном до 1) 15-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (15-HpETE), которая далее метаболизируется до 15-гидроксиикозатетраеновой кислоты (15-HETE), а также до гораздо меньших количеств 2) 12-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (12-HpETE), которая далее метаболизируется до 12-гидроксиэйкозатетраеновой кислоты и, возможно, гепоксилинов . ALOX15 фактически предпочитает линолевую кислоту арахидоновой кислоте, метаболизируя линолевую кислоту до 12-гидропероксиоктадекаеновой кислоты (13-HpODE), которая далее метаболизируется до 13-гидроксиоктадекадиеновой кислоты (13-HODE). ALOX15 может метаболизировать полиненасыщенные жирные кислоты, которые этерифицированы до фосфолипидов и/или холестерина , т.е. эфиров холестерина , в липопротеинах . Это свойство, а также его двойная специфичность в метаболизме арахидоновой кислоты до 12-HpETE и 15-HpETE аналогичны свойствам мышиного Alox15 и привели к тому, что оба фермента были названы 12/15-липоксигеназами.
  • Арахидонат-15-липоксигеназа типа II ( ALOX15B ), также называемая 15-липоксигеназой-2, 15-LOX-2 и 15-LOX-2. [ 17 ] Он метаболизирует арахидоновую кислоту до 15-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (15-HpETE), которая далее метаболизируется до 15-гидроксиикозатетраеновой кислоты . ALOX15B обладает незначительной способностью или вообще не метаболизировать арахидоновую кислоту до 12-гидропероксиокзатетраеновой кислоты (12-(HpETE) и лишь минимальной способностью метаболизировать линолевую кислоту до 13-гидропероксиоктадекаеновой кислоты (13-HpODE).
  • Арахидонат-12-липоксигеназа типа 12R ( ALOX12B ), также называемая 12 R -липоксигеназой, 12 R -LOX и 12 R -LO. [ 18 ] Он метаболизирует арахидоновую кислоту до 12 R -гидроксиэйкозатетраеновой кислоты, но делает это только с низкой каталитической активностью; его наиболее физиологически важным субстратом считается сфингозин , который содержит омега-гидроксильную жирную кислоту с очень длинной цепью (16-34 атома углерода), которая находится в амидной связи с азотом sn-2 сфингозина на его карбоксильном конце и этерифицирована до линолевой кислоты. на его омега-гидроксильном конце. В эпидермальных клетках кожи ALOX12B метаболизирует линолеат этого этерифицированного омега-гидроксиацилсфингозина (EOS) до его 9R - гидропероксианалога. Инактивирующие мутации ALOX12B связаны с кожным заболеванием человека — аутосомно-рецессивной врожденной ихтиозиформной эритродермией (ARCI). [ 18 ] [ 19 ]
  • Липоксигеназа эпидермального типа ( ALOXE3 ), также называемая eLOX3, и липоксигеназа эпидермального типа. [ 20 ] В отличие от других липоксигеназ, ALOXE3 проявляет только скрытую диоксигеназную активность. Скорее, его основная активность заключается в том, что он является гидропероксидизомеразой, которая метаболизирует некоторые ненасыщенные гидропероксижирные кислоты до соответствующих им эпоксидных спиртов и эпоксикетопроизводных и поэтому также классифицируется как гепоксилинсинтаза . Хотя ALOXE3 может метаболизировать 12 S -гидропероксиэйкозатетраеновую кислоту (12 S -HpETE) до R -стереоизомеров гепоксилинов A3 и B3, ALOXE3 способствует метаболизму R -гидропероксиненасыщенных жирных кислот и эффективно превращает 9( R )-гидропероксианалог EOS, образуемый ALOX15B, в его 9R ( 10R ) ,13R - транс-эпокси-11E , 13R и 9-кето-10E , 12Z аналоги ЭОС. [ 19 ] Считается, что ALOXE3 действует вместе с ALOX12B в эпидермисе кожи, образуя два последних аналога EOS; Инактивационные мутации ALOX3, подобно инактивирующим мутациям ALOX12B, связаны с аутосомно-рецессивной врожденной ихтиозиформной эритродермией у людей. [ 19 ] [ 20 ] Инактивирующие мутации в ALOX3 также связаны с заболеванием человека пластинчатым ихтиозом (см. § Типы ихтиоза – пункт 5 таблицы).

Две липоксигеназы могут действовать последовательно, образуя дигидрокси- или тригидроксипродукты, активность которых совершенно отличается от активности продуктов любой из липоксиэназ. Этот последовательный метаболизм может происходить в разных типах клеток, которые экспрессируют только одну из двух липоксигеназ в процессе, называемом трансклеточным метаболизмом. Например, ALOX5 и ALOX15 или, альтернативно, ALOX5 и ALOX12 могут действовать последовательно, метаболизируя арахидоновую кислоту в липоксины (см. 15-гидроксиикозатетраеновая кислота §§ Дальнейший метаболизм и активность 15(S)-HpETE, 15(S)-HETE, 15). (R)-HpETE, 15(R)-HETE и 15-оксо-ETE и липоксин § Синтез ), в то время как ALOX15 и, возможно, ALOX15B могут действовать вместе с ALOX5, метаболизируя эйкозапентаеновую кислоту до резольвина D (см. Резолвин § Биохимия и производство ).

Мышиные липоксигеназы

[ редактировать ]

Мышь является распространенной моделью для изучения функции липоксигеназы. Однако существуют некоторые ключевые различия между липоксигеназами у мышей и мужчин, которые затрудняют экстраполяцию исследований на мышах на человека. В отличие от 6 функциональных липоксигеназ у человека, мыши имеют 7 функциональных липоксигеназ, и некоторые из последних обладают метаболической активностью, отличной от их человеческих ортологов . [ 11 ] [ 19 ] [ 21 ] В частности, мышиный Alox15, в отличие от человеческого ALOX15, метаболизирует арахидоновую кислоту преимущественно до 12-HpETE, а мышиный Alox15b, в отличие от человеческого ALOX15b, представляет собой преимущественно 8-липоксигеназу, метаболизирующую арахдионовую кислоту до 8-HpETE; у людей не существует сопоставимой 8-HpETE-образующей липоксигеназы. [ 22 ]

  • Alox5 , по-видимому, аналогичен по функциям ALOX5 человека.
  • Alox12 отличается от человеческого ALOX12, который преимущественно метаболизирует арахидоновую кислоту до 12-HpETE, но также и до значительных количеств 15-HpETE, тем, что метаболизирует арахидоновую кислоту почти исключительно до 12-HpETE.
  • Alox15 (также называемый 12-Lox лейкоцитарного типа, 12-Lox-1 и 12/15-Lox) отличается от человеческого ALOX15, который при стандартных условиях анализа метаболизирует арахидоновую кислоту до продуктов 15-HpETE и 12-HpETE в соотношении 89-15-Lox. Соотношение 11 метаболизирует арахидоновую кислоту до 15-Hpete и 12-HpETE в соотношении 1 к 6, т.е. ее основным метаболитом является 12-HpETE. Кроме того, человеческий ALOX15 предпочитает в качестве субстрата линолевую кислоту арахидоновой кислоте, метаболизируя ее до 13-HpODE, в то время как Alox15 мало или вообще не проявляет активности в отношении линолевой кислоты. Alox15 может метаболизировать полиненасыщенные жирные кислоты, которые этерифицируются до фосфолипидов и холестерина (т.е. эфиров холестерина ). Это свойство, а также его двойная специфичность в метаболизме арахидоновой кислоты до 12-HpETE и 15-HpETE аналогичны свойствам человеческого ALOX15 и привели к тому, что оба фермента были названы 12/15-липоксигеназами.
  • Alox15b (также называемый 8-липоксигеназой, 8-lox и 15-липоксигеназой типа II), в отличие от ALOX15B, который метаболизирует арахидоновую кислоту преимущественно до 15-HpETE и в меньшей степени линолевой кислоты до 13-HpODE, метаболизирует арахидоновую кислоту преимущественно до 13-HpODE. 8 S -HpETE и линолевая кислота 9-ГпоДЭ. Alox15b столь же эффективен, как и ALOX5, в метаболизме 5-HpETE до лейкотриенов.
  • Alox12e (12-Lox-e, 12-Lox эпидермального типа) является ортологом человеческого гена ALOX12P, который претерпел повреждающие мутации и не экспрессируется. ALox12e предпочитает метиловые эфиры неэтерифицированным субстратам полиненасыщенных жирных кислот, метаболизируя эфир линолевой кислоты до его 13-гидроперокси-аналога и в меньшей степени эфир арахидоновой кислоты до его 12-гидроперокси-аналога.
  • Alox12b (e-LOX2, Lox-12 эпидермального типа), по-видимому, действует аналогично ALOX12B, метаболизируя фрагмент линолевой кислоты EOS до его 9 R -гидроперокси-аналога и тем самым способствуя целостности кожи и водонепроницаемости; у мышей, обедненных Alox12b, развивается серьезный дефект кожи, похожий на врожденную ихтиозиформную эритродермию. В отличие от человеческого ALOX12B, который метаболизирует арахидоновую кислоту до 12 R -HETE с низкой скоростью, Alox12b не метаболизирует арахидоновую кислоту в виде свободной кислоты, но метаболизирует дозу метилового эфира арахидоновой кислоты до ее 12 R -гидроперокси-аналога.
  • Aloxe3 (Lox-3 эпидермального типа, eLox3), по-видимому, действует аналогично ALOXe3 при метаболизме 9R - гидропероксилинолеатного производного EOS до его эпоксидных и кетопроизводных, а также участвует в поддержании целостности кожи и водонепроницаемости. Делеция AloxE3 приводит к дефекту, сходному с врожденной ихтиозиформной эритродермией.
Кроличья 15-липоксигеназа (синяя) с ингибитором (желтым), связанным в активном центре

Известно несколько структур липоксигеназы, в том числе: липоксигеназа сои L1 и L3, 8-липоксигеназа коралла, 5-липоксигеназа человека, 15-липоксигеназа кролика и каталитический домен 12-липоксигеназы свиньи. Белок состоит из небольшого N-концевого домена PLAT и основного C-концевого каталитического домена (см. базу данных Pfam ), который содержит активный сайт . В ферментах как растений, так и млекопитающих N-концевой домен содержит восьмицепочечный антипараллельный β-цилиндр, однако у липоксигеназ сои этот домен значительно больше, чем у фермента кролика. Растительные липоксигеназы можно ферментативно расщепить на два фрагмента, которые остаются прочно связанными, пока фермент остается активным; разделение двух доменов приводит к потере каталитической активности. С-концевой (каталитический) домен состоит из 18-22 спиралей и одного (у фермента кролика) или двух (у ферментов сои) антипараллельных β-листов на противоположном конце от N-концевого β-цилиндра.

Активный сайт

[ редактировать ]

Атом железа в липоксигеназах связан четырьмя лигандами, три из которых представляют собой остатки гистидина. [ 23 ] Шесть гистидинов консервативны во всех последовательностях липоксигеназы, пять из них сгруппированы в участок из 40 аминокислот. Эта область содержит два из трех лигандов цинка; другие гистидины были показаны [ 24 ] играют важную роль в активности липоксигеназ.

Две длинные центральные спирали пересекаются в активном сайте; обе спирали включают внутренние участки π-спирали , которые доставляют три гистидиновых (His) лиганда к железу активного центра. Две полости в основном домене липоксигеназы-1 сои (полости I и II) простираются от поверхности к активному центру. Воронкообразная полость I может функционировать как дикислородный канал; длинная узкая полость II предположительно является карманом для подложки. Более компактный фермент млекопитающих содержит только одну полость в форме сапога (полость II). В липоксигеназе-3 сои имеется третья полость, которая проходит от участка железа до границы раздела β-бочонка и каталитического домена. Полость III, участок железа и полость II образуют непрерывный проход по всей молекуле белка.

Железо активного центра координируется N е трех консервативных остатков His и одного кислорода С-концевой карбоксильной группы. Кроме того, в соевых ферментах боковой цепи кислород аспарагина слабо связан с железом. В липоксигеназе кролика этот остаток Asn заменен на His, который координирует железо через N. д атом. Таким образом, координационное число железа равно пяти или шести, с гидроксильным или водным лигандом к гексакоординированному железу.

Подробности об особенностях активного центра липоксигеназы выявлены в структуре каталитического доменного комплекса 12-липоксигеназы лейкоцитов свиньи. [ 23 ] [ 25 ] В 3D-структуре аналог субстрата-ингибитор занимал U-образный канал, открытый рядом с сайтом железа. Этот канал может аккумулировать арахидоновую кислоту без особых вычислений, определяя детали связывания субстрата для липоксигеназной реакции. Кроме того, вероятный канал доступа, который перехватывает канал связывания субстрата и простирается до поверхности белка, можно считать кислородным путем.

Биохимическая классификация

[ редактировать ]
ЭК 1.13.11.12 липоксигеназа (линолеат:кислород-13-оксидоредуктаза) линолеат + O 2 = (9 Z ,11 E ,13 S )-13-гидропероксиоктадека-9,11-диеноат
ЭК 1.13.11.31 арахидонат-12-липоксигеназа (арахидонат:кислород-12-оксидоредуктаза) арахидонат + O 2 = (5 Z ,8 Z ,10 E ,12 S ,14 Z )-12-гидропероксикоза-5,8,10,14-тетраеноат
ЭК 1.13.11.33 арахидонат-15-липоксигеназа (арахидонат:кислород-15-оксидоредуктаза) арахидонат + O 2 = (5 Z ,8 Z ,11 Z ,13 E ,15 S )-15-гидропероксикоза-5,8,11,13-тетраеноат
ЭК 1.13.11.34 арахидонат-5-липоксигеназа (арахидонат:кислород 5-оксидоредуктаза) арахидонат + О 2 = лейкотриен А 4 + Н 2
ЭК 1.13.11.40 арахидонат-8-липоксигеназа (арахидонат:кислород-8-оксидоредуктаза) арахидонат + O 2 = (5 Z ,8 R ,9 E ,11 Z ,14 Z )-8-гидропероксикоза-5,9,11,14-тетраеноат

Соевая липоксигеназа 1 демонстрирует наибольший кинетический изотопный эффект H/D (KIE) на kcat (kH/kD) (81 при комнатной температуре), о котором до сих пор сообщалось для биологической системы. Недавно чрезвычайно повышенный KIE от 540 до 730 был обнаружен у двойной мутантной соевой липоксигеназы 1. [ 26 ] Из-за большой величины KIE соевая липоксигеназа 1 послужила прототипом ферментативно-катализируемых реакций туннелирования водорода.

Человеческие белки, экспрессируемые из семейства липоксигеназ, включают ALOX12 , ALOX12B , ALOX15 , ALOX15B , ALOX5 и ALOXE3 . Хотя люди также обладают геном ALOX12P2 , который является ортологом хорошо экспрессируемого у мышей гена Alox12P , человеческий ген является псевдогеном ; следовательно, белок ALOX12P2 у человека не обнаруживается. [ 27 ]

  1. ^ Чой Дж., Чон Дж.К., Ким С., Шин В. (февраль 2008 г.). «Конформационная гибкость 15S-липоксигеназы млекопитающих: новая интерпретация кристаллографических данных». Белки . 70 (3): 1023–32. дои : 10.1002/прот.21590 . ПМИД   17847087 . S2CID   40013415 .
  2. ^ Пауэлл В.С., Рокач Дж. (2015). «Биосинтез, биологические эффекты и рецепторы гидроксиэйкозатетраеновых кислот (HETE) и оксоэйкозатетраеновых кислот (оксо-ETE), полученных из арахидоновой кислоты» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1851 (4): 340–55. дои : 10.1016/j.bbalip.2014.10.008 . ПМК   5710736 . ПМИД   25449650 .
  3. ^ Перейти обратно: а б с д и Кун Х., Бантия С., ван Лейен К. (2015). «Липоксигеназы млекопитающих и их биологическое значение» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1851 (4): 308–30. дои : 10.1016/j.bbalip.2014.10.002 . ПМК   4370320 . ПМИД   25316652 .
  4. ^ Перейти обратно: а б Габбс М., Ленг С., Девасси Дж.Г., Монируджаман М., Аукема Х.М. (2015). «Достижения в нашем понимании оксилипинов, полученных из пищевых ПНЖК» . Достижения в области питания . 6 (5): 513–40. дои : 10.3945/ан.114.007732 . ПМЦ   4561827 . ПМИД   26374175 .
  5. ^ Машима Р., Окуяма Т. (2015). «Роль липоксигеназ в патофизиологии; новые идеи и перспективы на будущее» . Редокс-биология . 6 : 297–310. дои : 10.1016/j.redox.2015.08.006 . ПМЦ   4556770 . ПМИД   26298204 .
  6. ^ Капра В., Ровати Дж.Е., Мангано П., Буччеллати С., Мерфи Р.К., Сала А. (2015). «Транклеточный биосинтез эйкозаноидных липидных медиаторов». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1851 (4): 377–82. дои : 10.1016/j.bbalip.2014.09.002 . ПМИД   25218301 .
  7. ^ Вик Б.А., Циммерман, округ Колумбия (1987). «Окислительные системы модификации жирных кислот: путь липоксигеназы». Окислительные системы модификации жирных кислот: липоксигеназный путь . Том. 9. стр. 53–90. дои : 10.1016/b978-0-12-675409-4.50009-5 . ISBN  9780126754094 .
  8. ^ Нидлман П., Терк Дж., Якщик Б.А., Моррисон А.Р., Лефковит Дж.Б. (1986). «Метаболизм арахидоновой кислоты». Анну. Преподобный Биохим . 55 : 69–102. дои : 10.1146/annurev.bi.55.070186.000441 . ПМИД   3017195 .
  9. ^ Танака К., Охта Х., Пэн Ю.Л., Ширано Ю., Хибино Т., Шибата Д. (1994). «Новая липоксигеназа из риса. Первичная структура и специфическая экспрессия при несовместимом заражении рисовым ожогом» . Ж. Биол. Хим . 269 ​​(5): 3755–3761. дои : 10.1016/S0021-9258(17)41924-7 . ПМИД   7508918 .
  10. ^ КенджиМацуи (2006). «Летучие вещества зеленых листьев: гидропероксидлиазный путь метаболизма оксилипина». Современное мнение в области биологии растений . 9 (3): 274–280. Бибкод : 2006COPB....9..274M . дои : 10.1016/j.pbi.2006.03.002 . ПМИД   16595187 .
  11. ^ Перейти обратно: а б с Криг, П; Фюрстенбергер, Г (2014). «Роль липоксигеназ в эпидермисе». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1841 (3): 390–400. дои : 10.1016/j.bbalip.2013.08.005 . ПМИД   23954555 .
  12. ^ «ALOX5 арахидонат-5-липоксигеназа [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» .
  13. ^ Хэггстрем, JZ; Фанк, компакт-диск (2011). «Липоксигеназные и лейкотриеновые пути: биохимия, биология и роль в заболеваниях». Химические обзоры . 111 (10): 5866–98. дои : 10.1021/cr200246d . ПМИД   21936577 .
  14. ^ Барден А.Е., Мас Э., Мори Т.А. (2016). «Добавки жирных кислот n-3 и медиаторы воспаления, способствующие разрешению воспаления» . Современное мнение в липидологии . 27 (1): 26–32. дои : 10.1097/MOL.0000000000000262 . ПМИД   26655290 . S2CID   45820130 .
  15. ^ Цюй Цюй, Сюань В, Фань Г.Х. (2015). «Роль резольвинов в разрешении острого воспаления». Международная клеточная биология . 39 (1): 3–22. дои : 10.1002/cbin.10345 . ПМИД   25052386 . S2CID   10160642 .
  16. ^ Романо М., Чианчи Э., Симиеле Ф., Реккиути А. (2015). «Липоксины и липоксины, вызываемые аспирином, в разрешении воспаления». Европейский журнал фармакологии . 760 : 49–63. дои : 10.1016/j.ejphar.2015.03.083 . ПМИД   25895638 .
  17. ^ «WikiGenes — Совместное издание» . WikiGenes — Совместное издательство . Проверено 17 апреля 2018 г.
  18. ^ Перейти обратно: а б «WikiGenes — Совместное издание» . WikiGenes — Совместное издательство . Проверено 17 апреля 2018 г.
  19. ^ Перейти обратно: а б с д Муньос-Гарсия, А; Томас, CP; Кини, Д.С.; Чжэн, Ю; Браш, Арканзас (2014). «Важность пути липоксигеназа-гепоксилин в эпидермальном барьере млекопитающих» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1841 (3): 401–8. дои : 10.1016/j.bbalip.2013.08.020 . ПМЦ   4116325 . ПМИД   24021977 .
  20. ^ Перейти обратно: а б «WikiGenes — Совместное издание» . WikiGenes — Совместное издательство . Проверено 17 апреля 2018 г.
  21. ^ Тейлор, PR; Хайдек, Д; Джонс, GW; Кренке, Г; Фанк, компакт-диск; Кнаппер, С; Адамс, Д; Кюн, Х; О'Доннелл, В.Б. (2012). «Развитие миелопролиферативных заболеваний при дефиците 12/15-липоксигеназы» . Кровь . 119 (25): 6173–4, ответ автора 6174–5. doi : 10.1182/blood-2012-02-410928 . ПМК   3392071 . ПМИД   22730527 .
  22. ^ Коул, Британская Колумбия; Либ, округ Колумбия; Добриан, AD; Надлер, Дж. Л. (2013). «12- и 15-липоксигеназы при воспалении жировой ткани» . Простагландины и другие липидные медиаторы . 104–105: 84–92. doi : 10.1016/j.prostaglandins.2012.07.004 . ПМЦ   3526691 . ПМИД   22951339 .
  23. ^ Перейти обратно: а б Бойингтон Дж.К., Гаффни Б.Дж., Амзель Л.М. (1993). «Трехмерная структура 15-липоксигеназы арахидоновой кислоты». Наука . 260 (5113): 1482–1486. Бибкод : 1993Sci...260.1482B . дои : 10.1126/science.8502991 . ПМИД   8502991 .
  24. ^ Стечко Дж., Донохо Г.П., Клеменс Дж.К., Диксон Дж.Э., Аксельрод Б. (1992). «Консервативные остатки гистидина в липоксигеназе сои: функциональные последствия их замены». Биохимия . 31 (16): 4053–4057. дои : 10.1021/bi00131a022 . ПМИД   1567851 .
  25. ^ Сюй, С.; Мюзер ТЦ; Марнетт Л.Дж.; Фанк МО (2012). «Кристаллическая структура комплекса каталитический домен-ингибитор 12-липоксигеназы определяет канал связывания субстрата для катализа» . Структура . 20 (9): 1490–7. дои : 10.1016/j.str.2012.06.003 . ПМК   5226221 . ПМИД   22795085 .
  26. ^ Ху, С; Шарма, Южная Каролина; Скурас, AD; Судаков А.В.; Карр, Калифорния; Хаммес-Шиффер, С; Альбер, Т; Клинман, JP (2014). «Чрезвычайно повышенные кинетические изотопные эффекты при комнатной температуре количественно определяют критическую роль ширины барьера в ферментативной активации CH» . Журнал Американского химического общества . 136 (23): 8157–60. дои : 10.1021/ja502726s . ПМЦ   4188422 . ПМИД   24884374 .
  27. ^ «WikiGenes — Совместное издание» . WikiGenes — Совместное издательство . Проверено 17 апреля 2018 г.
[ редактировать ]
В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR001024.
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: a992afa858fee2e4b8a09aedd29d2a70__1713832080
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/a9/70/a992afa858fee2e4b8a09aedd29d2a70.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Lipoxygenase - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)