Липоксигеназа
Липоксигеназа | |||
---|---|---|---|
Идентификаторы | |||
Символ | Липоксигеназа | ||
Пфам | PF00305 | ||
ИнтерПро | ИПР013819 | ||
PROSITE | PDOC00077 | ||
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 2сбл / СКОПе / СУПФАМ | ||
Суперсемейство OPM | 80 | ||
белок OPM | 2ч0м | ||
|
Липоксигеназы ( EC 1.13.11.- ( LOX семейство (негемовых ) железосодержащих ферментов ) представляют собой , точнее окислительных ферментов большинство из которых катализирует диоксигенацию ) полиненасыщенных , жирных кислот в липидах, содержащих цис, цис-1. ,4- пентадиен в клеточные сигнальные агенты, которые выполняют различные роли в качестве аутокринных сигналов, регулирующих функцию родительских клеток, паракринных сигналов. которые регулируют функцию близлежащих клеток, и эндокринные сигналы, которые регулируют функцию удаленных клеток.
Липоксигеназы родственны друг другу на основании их схожей генетической структуры и активности диоксигенации. Однако одна липоксигеназа, ALOXE3, хотя и имеет генетическую структуру липоксигеназы, обладает относительно небольшой диоксигенационной активностью; скорее, его основная активность заключается в изомеразной активности, которая катализирует превращение гидропероксиненасыщенных жирных кислот в их 1,5- гидроксильные эпоксидные производные .
Липоксигеназы обнаружены у эукариот (растений, грибов, животных, простейших); в то время как третий домен наземной жизни, археи , обладает белками с небольшим (~ 20%) сходством аминокислотной последовательности с липоксигеназами, в этих белках отсутствуют железосвязывающие остатки, и поэтому, по прогнозам, они не будут обладать липоксигеназной активностью. [ 2 ]
Биохимия
[ редактировать ]На основании подробного анализа 15-липоксигеназы 1 и стабилизированной 5-липоксигеназы структуры липоксигеназы состоят из 15 килодальтон N-концевого домена бета-барреля массой , небольшого (например, ~0,6 килодальтон) линкерного междомена (см. Белковый домен § Домены и гибкость белка) . ) и относительно большой С-концевой каталитический домен, который содержит негемовое железо, имеющее решающее значение для ферментов. каталитическая активность. [ 3 ] Большинство липоксигеназ (за исключением ALOXE3) катализируют реакцию Полиненасыщенные жирные кислоты + О 2 жирных кислот → гидропероксид в четыре стадии:
- лимитирующая скорость стадия отделения водорода от бисаллильного метиленового углерода с образованием радикала жирной кислоты у этого углерода
- перегруппировка радикала на другой углеродный центр
- присоединение молекулярного кислорода (O 2 ) к перегруппированному углеродному радикальному центру, тем самым образуя связь пероксирадикала (-OO·) с этим углеродом.
- восстановление пероксирадикала до соответствующего аниона (—OO − )
(—OO − ) остаток затем может быть протонирован с образованием гидропероксидной группы (-OOH) и дополнительно метаболизирован липоксигеназой, например, до лейкотриенов , гепоксилинов и различных специализированных про-расщепляющих медиаторов , или восстановлен повсеместно распространенными клеточными глутатионпероксидазами до гидроксигруппы, образуя, таким образом, гидроксилированный (-OOH) остаток. -OH) полиненасыщенные жирные кислоты, такие как гидроксиэйкозатетраеновые кислоты и HODE. (т.е. гидроксиоктадекаеновые кислоты). [ 3 ]
Полиненасыщенные жирные кислоты, которые служат субстратами для одной или нескольких липоксигеназ, включают жирные кислоты омега-6 , арахидоновую кислоту , линолевую кислоту , дигомо-γ-линоленовую кислоту и адрениновую кислоту ; жирные кислоты омега -3 , эйкозапентаеновая кислота , докозагексаеновая кислота и альфа-линоленовая кислота ; и жирные кислоты омега-9 , медовухи . [ 4 ] Некоторые типы липоксигеназ, например человеческая и мышиная 15-липоксигеназа 1, 12-липоксигеназа В и ALOXE3, способны метаболизировать субстраты жирных кислот, которые являются составляющими фосфолипидов, эфиров холестерина или сложных липидов кожи. [ 3 ] Большинство липоксигеназ катализируют образование первоначально образующихся гидропероксипродуктов, обладающих S- хиральностью . Исключением из этого правила являются 12R-липоксигеназы человека и других млекопитающих (см. ниже). [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]
Липоксигеназы зависят от доступности их субстратов полиненасыщенных жирных кислот, которые, особенно в клетках млекопитающих, обычно поддерживаются на чрезвычайно низких уровнях. В общем, различные фосфолипазы А2 и диацилглицеринлипазы активируются во время стимуляции клеток, начинают высвобождать эти жирные кислоты из мест их хранения и, таким образом, являются ключевыми регуляторами образования липоксигеназ-зависимых метаболитов. [ 3 ] Кроме того, клетки, активированные таким образом, могут передавать высвобожденные полиненасыщенные жирные кислоты соседним или близлежащим клеткам, которые затем метаболизируют их через свои липоксигеназные пути в процессе, называемом трансклеточным метаболизмом или трансклеточным биосинтезом. [ 6 ]
Биологическая функция и классификация
[ редактировать ]Эти ферменты наиболее распространены в растениях, где они могут участвовать в ряде различных аспектов физиологии растений, включая рост и развитие, устойчивость к вредителям и старение или реакцию на повреждения. [ 7 ] участвует ряд изоферментов липоксигеназ. У млекопитающих в метаболизме эйкозаноидов (таких как простагландины , лейкотриены и неклассические эйкозаноиды ) [ 8 ] Данные о последовательностях доступны для следующих липоксигеназ:
Растительные липоксигеназы
[ редактировать ]Растения экспрессируют множество цитозольных липоксигеназ ( EC 1.13.11.12 ; InterPro : IPR001246 ), а также то, что, по-видимому, является изозимом хлоропластов. [ 9 ] Растительная липоксигеназа в сочетании с гидропероксидлиазами ответственна за многие ароматы и другие сигнальные соединения. Одним из примеров является цис-3-гексеналь , запах свежескошенной травы .
Человеческие липоксигеназы
[ редактировать ]За исключением гена, кодирующего 5-LOX ( ALOX5 ), который расположен на хромосоме 10q11.2, все шесть генов LOX человека расположены на хромосоме 17.p13 и кодируют одноцепочечный белок массой 75–81 килодальтон , состоящий из 662–711 аминокислот. млекопитающих Гены LOX содержат 14 ( ALOX5 , ALOX12 , ALOX15 , ALOX15B ) или 15 ( ALOX12B , ALOXE3 ) экзонов с границами экзонов и интронов в высококонсервативных положениях. [ 11 ] [ 12 ] Шесть липоксигеназ человека, а также некоторые из основных продуктов, которые они производят, а также некоторые из их связей с генетическими заболеваниями, следующие: [ 11 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ]
- Арахидонат-5-липоксигеназа (ALOX5) ( EC 1.13.11.34 ; InterPro : IPR001885 ), также называемая 5-липоксигеназой, 5-LOX и 5-LO. Основные продукты: метаболизирует арахидоновую кислоту до 5-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (5-HpETE), которая превращается в 1) 5-гидроксиикозатетраеновую кислоту (5-HETE), а затем в 5-оксо-эйкозатетраеновую кислоту (5-оксо-ETE). , 2) лейкотриен A4 (LTA4), который затем может превращаться в лейкотриен B4 (LTB4) или лейкотриен C4 (LTC4) (LTC4 может далее метаболизироваться до лейкотриена D4 [LTD4], а затем до лейкотриена E4 [LTE4]), или 3) действуя последовательно с ALOX15, на специализированные про-рассасывающиеся медиаторы , липоксины A4 и B4. ALOX5 также метаболизирует эйкозапентаеновую кислоту с образованием набора метаболитов, которые содержат 5 двойных связей (т.е. 5-HEPE, 5-оксо-EPE, LTB5, LTC5, LTD5 и LTE5) в отличие от 4 метаболитов арахидоновой кислоты, содержащих двойные связи. Фермент, действуя последовательно с другими ферментами липоксигеназой, циклооксигеназой или цитохромом Р450 , способствует метаболизму эйкозапентаеновой кислоты до резольвинов Е-серии (см. Резольвин § Резольвин Es ) и докозагексаеновой кислоты в резольвины серии D (см. Резольвин § Резольвин Ds ). Эти резольвины также классифицируются как специализированные медиаторы разрешения.
- Арахидонат-12-липоксигеназа (ALOX12) ( EC 1.13.11.31 ; InterPro : IPR001885 ), также называемая 12-липоксигеназой тромбоцитарного типа (или 12-липоксигеназой тромбоцитарного типа) 12-LOX и 12-LO. Он метаболизирует арахидоновую кислоту до 12-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (12-HpETE), которая далее метаболизируется до 12-гидроксиэйкозатетраеновой кислоты (12-HETE) или до различных гепоксилинов (см. также 12-гидроксиэйкозатетраеновая кислота ).
- Арахидонат-15-липоксигеназа-1 (ALOX15) ( EC 1.13.11.33 ; InterPro : IPR001885 ), также называемая 15-липоксигеназой-1, 15-липоксигеназа эритроцитарного типа (или 15-липоксигеназа эритроцитарного типа), 15-липоксигеназа ретикулоцитарного типа (или 15-липоксигеназа ретикулоцитарного типа), 15-LO-1 и 15-LOX-1. Он метаболизирует арахидоновую кислоту в основном до 1) 15-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (15-HpETE), которая далее метаболизируется до 15-гидроксиикозатетраеновой кислоты (15-HETE), а также до гораздо меньших количеств 2) 12-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (12-HpETE), которая далее метаболизируется до 12-гидроксиэйкозатетраеновой кислоты и, возможно, гепоксилинов . ALOX15 фактически предпочитает линолевую кислоту арахидоновой кислоте, метаболизируя линолевую кислоту до 12-гидропероксиоктадекаеновой кислоты (13-HpODE), которая далее метаболизируется до 13-гидроксиоктадекадиеновой кислоты (13-HODE). ALOX15 может метаболизировать полиненасыщенные жирные кислоты, которые этерифицированы до фосфолипидов и/или холестерина , т.е. эфиров холестерина , в липопротеинах . Это свойство, а также его двойная специфичность в метаболизме арахидоновой кислоты до 12-HpETE и 15-HpETE аналогичны свойствам мышиного Alox15 и привели к тому, что оба фермента были названы 12/15-липоксигеназами.
- Арахидонат-15-липоксигеназа типа II ( ALOX15B ), также называемая 15-липоксигеназой-2, 15-LOX-2 и 15-LOX-2. [ 17 ] Он метаболизирует арахидоновую кислоту до 15-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (15-HpETE), которая далее метаболизируется до 15-гидроксиикозатетраеновой кислоты . ALOX15B обладает незначительной способностью или вообще не метаболизировать арахидоновую кислоту до 12-гидропероксиокзатетраеновой кислоты (12-(HpETE) и лишь минимальной способностью метаболизировать линолевую кислоту до 13-гидропероксиоктадекаеновой кислоты (13-HpODE).
- Арахидонат-12-липоксигеназа типа 12R ( ALOX12B ), также называемая 12 R -липоксигеназой, 12 R -LOX и 12 R -LO. [ 18 ] Он метаболизирует арахидоновую кислоту до 12 R -гидроксиэйкозатетраеновой кислоты, но делает это только с низкой каталитической активностью; его наиболее физиологически важным субстратом считается сфингозин , который содержит омега-гидроксильную жирную кислоту с очень длинной цепью (16-34 атома углерода), которая находится в амидной связи с азотом sn-2 сфингозина на его карбоксильном конце и этерифицирована до линолевой кислоты. на его омега-гидроксильном конце. В эпидермальных клетках кожи ALOX12B метаболизирует линолеат этого этерифицированного омега-гидроксиацилсфингозина (EOS) до его 9R - гидропероксианалога. Инактивирующие мутации ALOX12B связаны с кожным заболеванием человека — аутосомно-рецессивной врожденной ихтиозиформной эритродермией (ARCI). [ 18 ] [ 19 ]
- Липоксигеназа эпидермального типа ( ALOXE3 ), также называемая eLOX3, и липоксигеназа эпидермального типа. [ 20 ] В отличие от других липоксигеназ, ALOXE3 проявляет только скрытую диоксигеназную активность. Скорее, его основная активность заключается в том, что он является гидропероксидизомеразой, которая метаболизирует некоторые ненасыщенные гидропероксижирные кислоты до соответствующих им эпоксидных спиртов и эпоксикетопроизводных и поэтому также классифицируется как гепоксилинсинтаза . Хотя ALOXE3 может метаболизировать 12 S -гидропероксиэйкозатетраеновую кислоту (12 S -HpETE) до R -стереоизомеров гепоксилинов A3 и B3, ALOXE3 способствует метаболизму R -гидропероксиненасыщенных жирных кислот и эффективно превращает 9( R )-гидропероксианалог EOS, образуемый ALOX15B, в его 9R ( 10R ) ,13R - транс-эпокси-11E , 13R и 9-кето-10E , 12Z аналоги ЭОС. [ 19 ] Считается, что ALOXE3 действует вместе с ALOX12B в эпидермисе кожи, образуя два последних аналога EOS; Инактивационные мутации ALOX3, подобно инактивирующим мутациям ALOX12B, связаны с аутосомно-рецессивной врожденной ихтиозиформной эритродермией у людей. [ 19 ] [ 20 ] Инактивирующие мутации в ALOX3 также связаны с заболеванием человека пластинчатым ихтиозом (см. § Типы ихтиоза – пункт 5 таблицы).
Две липоксигеназы могут действовать последовательно, образуя дигидрокси- или тригидроксипродукты, активность которых совершенно отличается от активности продуктов любой из липоксиэназ. Этот последовательный метаболизм может происходить в разных типах клеток, которые экспрессируют только одну из двух липоксигеназ в процессе, называемом трансклеточным метаболизмом. Например, ALOX5 и ALOX15 или, альтернативно, ALOX5 и ALOX12 могут действовать последовательно, метаболизируя арахидоновую кислоту в липоксины (см. 15-гидроксиикозатетраеновая кислота §§ Дальнейший метаболизм и активность 15(S)-HpETE, 15(S)-HETE, 15). (R)-HpETE, 15(R)-HETE и 15-оксо-ETE и липоксин § Синтез ), в то время как ALOX15 и, возможно, ALOX15B могут действовать вместе с ALOX5, метаболизируя эйкозапентаеновую кислоту до резольвина D (см. Резолвин § Биохимия и производство ).
Мышиные липоксигеназы
[ редактировать ]Мышь является распространенной моделью для изучения функции липоксигеназы. Однако существуют некоторые ключевые различия между липоксигеназами у мышей и мужчин, которые затрудняют экстраполяцию исследований на мышах на человека. В отличие от 6 функциональных липоксигеназ у человека, мыши имеют 7 функциональных липоксигеназ, и некоторые из последних обладают метаболической активностью, отличной от их человеческих ортологов . [ 11 ] [ 19 ] [ 21 ] В частности, мышиный Alox15, в отличие от человеческого ALOX15, метаболизирует арахидоновую кислоту преимущественно до 12-HpETE, а мышиный Alox15b, в отличие от человеческого ALOX15b, представляет собой преимущественно 8-липоксигеназу, метаболизирующую арахдионовую кислоту до 8-HpETE; у людей не существует сопоставимой 8-HpETE-образующей липоксигеназы. [ 22 ]
- Alox5 , по-видимому, аналогичен по функциям ALOX5 человека.
- Alox12 отличается от человеческого ALOX12, который преимущественно метаболизирует арахидоновую кислоту до 12-HpETE, но также и до значительных количеств 15-HpETE, тем, что метаболизирует арахидоновую кислоту почти исключительно до 12-HpETE.
- Alox15 (также называемый 12-Lox лейкоцитарного типа, 12-Lox-1 и 12/15-Lox) отличается от человеческого ALOX15, который при стандартных условиях анализа метаболизирует арахидоновую кислоту до продуктов 15-HpETE и 12-HpETE в соотношении 89-15-Lox. Соотношение 11 метаболизирует арахидоновую кислоту до 15-Hpete и 12-HpETE в соотношении 1 к 6, т.е. ее основным метаболитом является 12-HpETE. Кроме того, человеческий ALOX15 предпочитает в качестве субстрата линолевую кислоту арахидоновой кислоте, метаболизируя ее до 13-HpODE, в то время как Alox15 мало или вообще не проявляет активности в отношении линолевой кислоты. Alox15 может метаболизировать полиненасыщенные жирные кислоты, которые этерифицируются до фосфолипидов и холестерина (т.е. эфиров холестерина ). Это свойство, а также его двойная специфичность в метаболизме арахидоновой кислоты до 12-HpETE и 15-HpETE аналогичны свойствам человеческого ALOX15 и привели к тому, что оба фермента были названы 12/15-липоксигеназами.
- Alox15b (также называемый 8-липоксигеназой, 8-lox и 15-липоксигеназой типа II), в отличие от ALOX15B, который метаболизирует арахидоновую кислоту преимущественно до 15-HpETE и в меньшей степени линолевой кислоты до 13-HpODE, метаболизирует арахидоновую кислоту преимущественно до 13-HpODE. 8 S -HpETE и линолевая кислота 9-ГпоДЭ. Alox15b столь же эффективен, как и ALOX5, в метаболизме 5-HpETE до лейкотриенов.
- Alox12e (12-Lox-e, 12-Lox эпидермального типа) является ортологом человеческого гена ALOX12P, который претерпел повреждающие мутации и не экспрессируется. ALox12e предпочитает метиловые эфиры неэтерифицированным субстратам полиненасыщенных жирных кислот, метаболизируя эфир линолевой кислоты до его 13-гидроперокси-аналога и в меньшей степени эфир арахидоновой кислоты до его 12-гидроперокси-аналога.
- Alox12b (e-LOX2, Lox-12 эпидермального типа), по-видимому, действует аналогично ALOX12B, метаболизируя фрагмент линолевой кислоты EOS до его 9 R -гидроперокси-аналога и тем самым способствуя целостности кожи и водонепроницаемости; у мышей, обедненных Alox12b, развивается серьезный дефект кожи, похожий на врожденную ихтиозиформную эритродермию. В отличие от человеческого ALOX12B, который метаболизирует арахидоновую кислоту до 12 R -HETE с низкой скоростью, Alox12b не метаболизирует арахидоновую кислоту в виде свободной кислоты, но метаболизирует дозу метилового эфира арахидоновой кислоты до ее 12 R -гидроперокси-аналога.
- Aloxe3 (Lox-3 эпидермального типа, eLox3), по-видимому, действует аналогично ALOXe3 при метаболизме 9R - гидропероксилинолеатного производного EOS до его эпоксидных и кетопроизводных, а также участвует в поддержании целостности кожи и водонепроницаемости. Делеция AloxE3 приводит к дефекту, сходному с врожденной ихтиозиформной эритродермией.
3D structure
[ редактировать ]Известно несколько структур липоксигеназы, в том числе: липоксигеназа сои L1 и L3, 8-липоксигеназа коралла, 5-липоксигеназа человека, 15-липоксигеназа кролика и каталитический домен 12-липоксигеназы свиньи. Белок состоит из небольшого N-концевого домена PLAT и основного C-концевого каталитического домена (см. базу данных Pfam ), который содержит активный сайт . В ферментах как растений, так и млекопитающих N-концевой домен содержит восьмицепочечный антипараллельный β-цилиндр, однако у липоксигеназ сои этот домен значительно больше, чем у фермента кролика. Растительные липоксигеназы можно ферментативно расщепить на два фрагмента, которые остаются прочно связанными, пока фермент остается активным; разделение двух доменов приводит к потере каталитической активности. С-концевой (каталитический) домен состоит из 18-22 спиралей и одного (у фермента кролика) или двух (у ферментов сои) антипараллельных β-листов на противоположном конце от N-концевого β-цилиндра.
Активный сайт
[ редактировать ]Атом железа в липоксигеназах связан четырьмя лигандами, три из которых представляют собой остатки гистидина. [ 23 ] Шесть гистидинов консервативны во всех последовательностях липоксигеназы, пять из них сгруппированы в участок из 40 аминокислот. Эта область содержит два из трех лигандов цинка; другие гистидины были показаны [ 24 ] играют важную роль в активности липоксигеназ.
Две длинные центральные спирали пересекаются в активном сайте; обе спирали включают внутренние участки π-спирали , которые доставляют три гистидиновых (His) лиганда к железу активного центра. Две полости в основном домене липоксигеназы-1 сои (полости I и II) простираются от поверхности к активному центру. Воронкообразная полость I может функционировать как дикислородный канал; длинная узкая полость II предположительно является карманом для подложки. Более компактный фермент млекопитающих содержит только одну полость в форме сапога (полость II). В липоксигеназе-3 сои имеется третья полость, которая проходит от участка железа до границы раздела β-бочонка и каталитического домена. Полость III, участок железа и полость II образуют непрерывный проход по всей молекуле белка.
Железо активного центра координируется N е трех консервативных остатков His и одного кислорода С-концевой карбоксильной группы. Кроме того, в соевых ферментах боковой цепи кислород аспарагина слабо связан с железом. В липоксигеназе кролика этот остаток Asn заменен на His, который координирует железо через N. д атом. Таким образом, координационное число железа равно пяти или шести, с гидроксильным или водным лигандом к гексакоординированному железу.
Подробности об особенностях активного центра липоксигеназы выявлены в структуре каталитического доменного комплекса 12-липоксигеназы лейкоцитов свиньи. [ 23 ] [ 25 ] В 3D-структуре аналог субстрата-ингибитор занимал U-образный канал, открытый рядом с сайтом железа. Этот канал может аккумулировать арахидоновую кислоту без особых вычислений, определяя детали связывания субстрата для липоксигеназной реакции. Кроме того, вероятный канал доступа, который перехватывает канал связывания субстрата и простирается до поверхности белка, можно считать кислородным путем.
Биохимическая классификация
[ редактировать ]ЭК 1.13.11.12 | липоксигеназа | (линолеат:кислород-13-оксидоредуктаза) | линолеат + O 2 = (9 Z ,11 E ,13 S )-13-гидропероксиоктадека-9,11-диеноат |
ЭК 1.13.11.31 | арахидонат-12-липоксигеназа | (арахидонат:кислород-12-оксидоредуктаза) | арахидонат + O 2 = (5 Z ,8 Z ,10 E ,12 S ,14 Z )-12-гидропероксикоза-5,8,10,14-тетраеноат |
ЭК 1.13.11.33 | арахидонат-15-липоксигеназа | (арахидонат:кислород-15-оксидоредуктаза) | арахидонат + O 2 = (5 Z ,8 Z ,11 Z ,13 E ,15 S )-15-гидропероксикоза-5,8,11,13-тетраеноат |
ЭК 1.13.11.34 | арахидонат-5-липоксигеназа | (арахидонат:кислород 5-оксидоредуктаза) | арахидонат + О 2 = лейкотриен А 4 + Н 2 |
ЭК 1.13.11.40 | арахидонат-8-липоксигеназа | (арахидонат:кислород-8-оксидоредуктаза) | арахидонат + O 2 = (5 Z ,8 R ,9 E ,11 Z ,14 Z )-8-гидропероксикоза-5,9,11,14-тетраеноат |
Соевая липоксигеназа 1 демонстрирует наибольший кинетический изотопный эффект H/D (KIE) на kcat (kH/kD) (81 при комнатной температуре), о котором до сих пор сообщалось для биологической системы. Недавно чрезвычайно повышенный KIE от 540 до 730 был обнаружен у двойной мутантной соевой липоксигеназы 1. [ 26 ] Из-за большой величины KIE соевая липоксигеназа 1 послужила прототипом ферментативно-катализируемых реакций туннелирования водорода.
Человеческие белки, экспрессируемые из семейства липоксигеназ, включают ALOX12 , ALOX12B , ALOX15 , ALOX15B , ALOX5 и ALOXE3 . Хотя люди также обладают геном ALOX12P2 , который является ортологом хорошо экспрессируемого у мышей гена Alox12P , человеческий ген является псевдогеном ; следовательно, белок ALOX12P2 у человека не обнаруживается. [ 27 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Чой Дж., Чон Дж.К., Ким С., Шин В. (февраль 2008 г.). «Конформационная гибкость 15S-липоксигеназы млекопитающих: новая интерпретация кристаллографических данных». Белки . 70 (3): 1023–32. дои : 10.1002/прот.21590 . ПМИД 17847087 . S2CID 40013415 .
- ^ Пауэлл В.С., Рокач Дж. (2015). «Биосинтез, биологические эффекты и рецепторы гидроксиэйкозатетраеновых кислот (HETE) и оксоэйкозатетраеновых кислот (оксо-ETE), полученных из арахидоновой кислоты» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1851 (4): 340–55. дои : 10.1016/j.bbalip.2014.10.008 . ПМК 5710736 . ПМИД 25449650 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Кун Х., Бантия С., ван Лейен К. (2015). «Липоксигеназы млекопитающих и их биологическое значение» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1851 (4): 308–30. дои : 10.1016/j.bbalip.2014.10.002 . ПМК 4370320 . ПМИД 25316652 .
- ^ Перейти обратно: а б Габбс М., Ленг С., Девасси Дж.Г., Монируджаман М., Аукема Х.М. (2015). «Достижения в нашем понимании оксилипинов, полученных из пищевых ПНЖК» . Достижения в области питания . 6 (5): 513–40. дои : 10.3945/ан.114.007732 . ПМЦ 4561827 . ПМИД 26374175 .
- ^ Машима Р., Окуяма Т. (2015). «Роль липоксигеназ в патофизиологии; новые идеи и перспективы на будущее» . Редокс-биология . 6 : 297–310. дои : 10.1016/j.redox.2015.08.006 . ПМЦ 4556770 . ПМИД 26298204 .
- ^ Капра В., Ровати Дж.Е., Мангано П., Буччеллати С., Мерфи Р.К., Сала А. (2015). «Транклеточный биосинтез эйкозаноидных липидных медиаторов». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1851 (4): 377–82. дои : 10.1016/j.bbalip.2014.09.002 . ПМИД 25218301 .
- ^ Вик Б.А., Циммерман, округ Колумбия (1987). «Окислительные системы модификации жирных кислот: путь липоксигеназы». Окислительные системы модификации жирных кислот: липоксигеназный путь . Том. 9. стр. 53–90. дои : 10.1016/b978-0-12-675409-4.50009-5 . ISBN 9780126754094 .
- ^ Нидлман П., Терк Дж., Якщик Б.А., Моррисон А.Р., Лефковит Дж.Б. (1986). «Метаболизм арахидоновой кислоты». Анну. Преподобный Биохим . 55 : 69–102. дои : 10.1146/annurev.bi.55.070186.000441 . ПМИД 3017195 .
- ^ Танака К., Охта Х., Пэн Ю.Л., Ширано Ю., Хибино Т., Шибата Д. (1994). «Новая липоксигеназа из риса. Первичная структура и специфическая экспрессия при несовместимом заражении рисовым ожогом» . Ж. Биол. Хим . 269 (5): 3755–3761. дои : 10.1016/S0021-9258(17)41924-7 . ПМИД 7508918 .
- ^ КенджиМацуи (2006). «Летучие вещества зеленых листьев: гидропероксидлиазный путь метаболизма оксилипина». Современное мнение в области биологии растений . 9 (3): 274–280. Бибкод : 2006COPB....9..274M . дои : 10.1016/j.pbi.2006.03.002 . ПМИД 16595187 .
- ^ Перейти обратно: а б с Криг, П; Фюрстенбергер, Г (2014). «Роль липоксигеназ в эпидермисе». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1841 (3): 390–400. дои : 10.1016/j.bbalip.2013.08.005 . ПМИД 23954555 .
- ^ «ALOX5 арахидонат-5-липоксигеназа [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» .
- ^ Хэггстрем, JZ; Фанк, компакт-диск (2011). «Липоксигеназные и лейкотриеновые пути: биохимия, биология и роль в заболеваниях». Химические обзоры . 111 (10): 5866–98. дои : 10.1021/cr200246d . ПМИД 21936577 .
- ^ Барден А.Е., Мас Э., Мори Т.А. (2016). «Добавки жирных кислот n-3 и медиаторы воспаления, способствующие разрешению воспаления» . Современное мнение в липидологии . 27 (1): 26–32. дои : 10.1097/MOL.0000000000000262 . ПМИД 26655290 . S2CID 45820130 .
- ^ Цюй Цюй, Сюань В, Фань Г.Х. (2015). «Роль резольвинов в разрешении острого воспаления». Международная клеточная биология . 39 (1): 3–22. дои : 10.1002/cbin.10345 . ПМИД 25052386 . S2CID 10160642 .
- ^ Романо М., Чианчи Э., Симиеле Ф., Реккиути А. (2015). «Липоксины и липоксины, вызываемые аспирином, в разрешении воспаления». Европейский журнал фармакологии . 760 : 49–63. дои : 10.1016/j.ejphar.2015.03.083 . ПМИД 25895638 .
- ^ «WikiGenes — Совместное издание» . WikiGenes — Совместное издательство . Проверено 17 апреля 2018 г.
- ^ Перейти обратно: а б «WikiGenes — Совместное издание» . WikiGenes — Совместное издательство . Проверено 17 апреля 2018 г.
- ^ Перейти обратно: а б с д Муньос-Гарсия, А; Томас, CP; Кини, Д.С.; Чжэн, Ю; Браш, Арканзас (2014). «Важность пути липоксигеназа-гепоксилин в эпидермальном барьере млекопитающих» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1841 (3): 401–8. дои : 10.1016/j.bbalip.2013.08.020 . ПМЦ 4116325 . ПМИД 24021977 .
- ^ Перейти обратно: а б «WikiGenes — Совместное издание» . WikiGenes — Совместное издательство . Проверено 17 апреля 2018 г.
- ^ Тейлор, PR; Хайдек, Д; Джонс, GW; Кренке, Г; Фанк, компакт-диск; Кнаппер, С; Адамс, Д; Кюн, Х; О'Доннелл, В.Б. (2012). «Развитие миелопролиферативных заболеваний при дефиците 12/15-липоксигеназы» . Кровь . 119 (25): 6173–4, ответ автора 6174–5. doi : 10.1182/blood-2012-02-410928 . ПМК 3392071 . ПМИД 22730527 .
- ^ Коул, Британская Колумбия; Либ, округ Колумбия; Добриан, AD; Надлер, Дж. Л. (2013). «12- и 15-липоксигеназы при воспалении жировой ткани» . Простагландины и другие липидные медиаторы . 104–105: 84–92. doi : 10.1016/j.prostaglandins.2012.07.004 . ПМЦ 3526691 . ПМИД 22951339 .
- ^ Перейти обратно: а б Бойингтон Дж.К., Гаффни Б.Дж., Амзель Л.М. (1993). «Трехмерная структура 15-липоксигеназы арахидоновой кислоты». Наука . 260 (5113): 1482–1486. Бибкод : 1993Sci...260.1482B . дои : 10.1126/science.8502991 . ПМИД 8502991 .
- ^ Стечко Дж., Донохо Г.П., Клеменс Дж.К., Диксон Дж.Э., Аксельрод Б. (1992). «Консервативные остатки гистидина в липоксигеназе сои: функциональные последствия их замены». Биохимия . 31 (16): 4053–4057. дои : 10.1021/bi00131a022 . ПМИД 1567851 .
- ^ Сюй, С.; Мюзер ТЦ; Марнетт Л.Дж.; Фанк МО (2012). «Кристаллическая структура комплекса каталитический домен-ингибитор 12-липоксигеназы определяет канал связывания субстрата для катализа» . Структура . 20 (9): 1490–7. дои : 10.1016/j.str.2012.06.003 . ПМК 5226221 . ПМИД 22795085 .
- ^ Ху, С; Шарма, Южная Каролина; Скурас, AD; Судаков А.В.; Карр, Калифорния; Хаммес-Шиффер, С; Альбер, Т; Клинман, JP (2014). «Чрезвычайно повышенные кинетические изотопные эффекты при комнатной температуре количественно определяют критическую роль ширины барьера в ферментативной активации CH» . Журнал Американского химического общества . 136 (23): 8157–60. дои : 10.1021/ja502726s . ПМЦ 4188422 . ПМИД 24884374 .
- ^ «WikiGenes — Совместное издание» . WikiGenes — Совместное издательство . Проверено 17 апреля 2018 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- LOX-DB - База данных по липоксигеназам
- Железосвязывающая область липоксигеназ. Архивировано 12 сентября 2019 г. в Wayback Machine на PROSITE.
- PDB : 1YGE – структура липоксигеназы-1 из соевых бобов ( Glycine max )
- PDB : 1IK3 – структура липоксигеназы-3 сои в комплексе с (9 Z ,11 E ,13 S )-13-гидропероксиоктадека-9,11-диеновой кислотой.
- PDB : 1LOX – структура 15-липоксигеназы кролика в комплексе с ингибитором.
- PDB : 3RDE – структура каталитического домена 12-липоксигеназы свиных лейкоцитов с ингибитором
- UMich Orientation of Proteins in Membranes семейства/суперсемейства-87 – липоксигеназы животных
- Липоксигеназа Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- Влияние времени бланширования и сорта на качество замороженной и хранимой кукурузы и брокколи – инактивация ферментов липоксигеназы, пероксидазы, цистинлиазы при бланшировании