Jump to content

Археопластида

(Перенаправлено с Археопластида )

Археопластида
Хвойные деревья , травы , водоросли и кустарники и в ее окрестностях , штат Орегон. на реке Спрэг
Научная классификация Изменить эту классификацию
Домен: Эукариоты
Клэйд : потогонные средства
(без рейтинга): Археопластида
Адл и др. , 2005 г. [1]
Подгруппы
Синонимы
  • Планте Кавальер-Смит, 1981 год. [4]
  • Примопластобиота Ревьерс, 2002 г. [ нужна ссылка ]
  • Primoplantae Palmer et al. 2004 г. [5]

Archaeplastida фотоавтотрофные (или царство Plantae sensu lato «в широком смысле»; произносится / ɑːr k ɪ ˈ p l æ s t ɪ d ə / ) — основная группа эукариот , включающая красные водоросли (Rhodophyta), зеленые водоросли , наземные растения и малая группа глаукофитов . [6] Он также включает нефотосинтезирующую линию Rhodelphidia , хищную (эукариотрофную) жгутиконосцу, родственную Rhodophyta, и, вероятно, микроскопических пикозойных . [7] У архепластид есть хлоропласты окруженные двумя мембранами, что позволяет предположить, что они были приобретены непосредственно в результате одного эндосимбиоза путем фагоцитоза цианобактерий , . [8] Все другие группы, имеющие хлоропласты, кроме амебоидного рода Paulinella , имеют хлоропласты, окруженные тремя или четырьмя мембранами, что позволяет предположить, что они были приобретены вторично из красных или зеленых водорослей. [примечание 1] В отличие от красных и зеленых водорослей, глаукофиты никогда не участвовали во вторичных явлениях эндосимбиоза. [10]

В клетках Archaeplastida обычно отсутствуют центриоли и имеются митохондрии с плоскими кристами . Обычно у них есть клеточная стенка , содержащая целлюлозу , а пища хранится в виде крахмала . Однако эти характеристики присущи и другим эукариотам. Основное свидетельство того, что архепластиды образуют монофилетическую группу, получено в результате генетических исследований, которые указывают на то, что их пластиды , вероятно, имели единое происхождение. Это свидетельство оспаривается. [11] [12] На основании имеющихся на сегодняшний день данных невозможно подтвердить или опровергнуть альтернативные сценарии эволюции единственного первичного эндосимбиоза . [13] Фотосинтезирующие организмы с пластидами различного происхождения (например, бурые водоросли ) не относятся к архепластидам.

Археопластиды делятся на две основные эволюционные линии. Красные водоросли пигментированы хлорофиллом а и фикобилипротеинами , как и большинство цианобактерий, и накапливают крахмал вне хлоропластов. Зеленые водоросли и наземные растения, известные под общим названием Viridiplantae (лат. «зеленые растения») или Chloroplastida, пигментированы хлорофиллами a и b , но лишены фикобилипротеинов, а крахмал накапливается внутри хлоропластов. [14] Глаукофиты имеют типичные цианобактериальные пигменты, но их пластиды (называемые цианеллами) отличаются наличием внешнего слоя пептидогликана. [1]

Не следует путать Archaeplastida со старым и устаревшим названием Archiplastideae, которое относится к цианобактериям и другим группам бактерий. [15] [16]

Таксономия

[ редактировать ]

Консенсус 2005 года, когда группа, состоящая из глаукофитов, красных и зеленых водорослей и наземных растений, была названа «Археопластида», [1] заключалось в том, что это была клада , т.е. была монофилетична . Многие исследования, опубликованные с тех пор, предоставили подтверждающие доказательства. [17] [18] [19] [20] Однако другие исследования показали, что эта группа является парафилетической . [21] [22] [23] [12] [24] На сегодняшний день ситуация кажется нерешенной, но в недавнем исследовании был продемонстрирован сильный сигнал о монофилии Plantae (Archaeplastida) (с обогащением генов красных водорослей). [25] Здесь делается предположение, что Archaeplastida является действительной кладой.

Группе давались разные названия. Некоторые авторы просто называют эту группу растениями или Plantae. [26] [27] Однако название Plantae неоднозначно, поскольку оно также применялось к менее инклюзивным кладам , таким как Viridiplantae и эмбриофиты . Чтобы различать, большую группу иногда называют Plantae sensu lato («растения в широком смысле»).

Во избежание двусмысленности были предложены другие названия. Primoplantae, появившееся в 2004 году, кажется, является первым новым названием, предложенным для этой группы. [5] Другое название, применяемое к этому узлу, - пластида, определяемое как разделяющая кладу «пластиды первичного (прямого прокариотного) происхождения [как] в Magnolia Virginiana Linnaeus 1753». [28]

Хотя многие исследования показали, что Archaeplastida образуют монофилетическую группу, [29] в статье 2009 года утверждается, что они на самом деле парафилетичны . [23] Обогащение новыми генами красных водорослей в недавнем исследовании демонстрирует сильный сигнал о монофилии Plantae (Archaeplastida) и столь же сильный сигнал об истории совместного использования генов между красными/зелеными водорослями и другими линиями. [25] Это исследование дает представление о том, насколько богатые данные о генах мезофильных красных водорослей имеют решающее значение для проверки спорных вопросов эволюции эукариот и для понимания сложных закономерностей наследования генов у простейших.

Название Archaeplastida было предложено в 2005 году большой международной группой авторов (Адл и др. ), которые стремились создать классификацию эукариот , учитывающую морфологию, биохимию и филогенетику и обладающую «некоторой стабильностью в ближайшем будущем». срок." Они отвергли использование формальных таксономических рангов в пользу иерархической структуры, в которой названия клад не обозначают ранг. Таким образом, название типа «Glaucophyta» и название класса «Rhodophyceae» находятся на одном уровне в их классификации. Предложенные подразделения Archaeplastida показаны ниже как в табличной, так и в схематической форме . [1]

Археопластида :

Глаукофит . Glaucocystis
  • Glaucophyta Skuja, 1954 (Glaucocystophyta Kies & Kremer, 1986 ) – глаукофиты.
  • Глаукофиты — небольшая группа пресноводных одноклеточных водорослей. Их хлоропласты, называемые цианеллами , имеют слой пептидогликана , что делает их более похожими на цианобактерии, чем на таковые у остальных архепластид.
Родофит Лауренсия
  • Rhodophyceae Thuret, 1855, исправить. Рабенхорст, 1863 г., изд. Аддл и др. , 2005 (Rhodophyta Wettstein 1901 ) – красные водоросли.
Красные водоросли образуют одну из крупнейших групп водорослей. Большинство из них — морские водоросли, многоклеточные и морские. Их красный цвет обусловлен фикобилипротеинами , которые используются в качестве вспомогательных пигментов при захвате света для фотосинтеза.
  • Хлоропластида Адл и др. , 2005 (Viridiplantae Cavalier-Smith 1981 ; Chlorobionta Jeffrey 1982, исправлено. Bremer 1985, исправлено. Lewis and McCourt 2004 ; Chlorobiota Kendrick and Crane 1997 ).
Хлоропластида — это термин, выбранный Adl et al. для группы, состоящей из зеленых водорослей и наземных растений (эмбриофитов). За исключением случаев вторичной потери, все хлоропласты имеют слой пептидогликана и лишены фикобилипротеинов.
Хлорофит стигеоклониум
  • Chlorophyta Pascher, 1914, исправить. Льюис и МакКорт, 2004 – зеленые водоросли (часть)
Адл и др. использовать узкое определение Chlorophyta; другие источники включают Chlorodendrales и Prasinophytae, которые сами по себе могут быть объединены.
  • Chlorodendrales Fritsch, 1917 - зеленые водоросли (часть)
  • Prasinophytae Cavalier-Smith, 1998, исправлено. Льюис и МакКорт, 2004 – зеленые водоросли (часть)
  • Мезостигма Лаутерборн, 1894 г., исправлено. МакКорт в Adl et al. , 2005 (Mesostigmata Turmel, Otis и Lemieux, 2002 )
  • Charophyta Karol et al. , 2001, исправлено. Lewis & McCourt, 2004 (Charophyceae Smith 1938, исправлено Mattox and Stewart 1984 ) – зеленые водоросли (часть) и наземные растения.
Charophyta sensu lato , использованный Adl et al. , представляет собой монофилетическую группу, состоящую из некоторых зеленых водорослей, в том числе костяных (Charophyta sensu stricto ), а также наземных растений (эмбриофитов).
  • Другие подразделения, кроме Streptophytina (ниже), Adl et al. не указали.
Другие источники включают группы зеленых водорослей Chlorokybales , Klebsormidiales , Zygnematales и Coleochaetales . [30]
  • Streptophytina Lewis & McCourt, 2004 - косточковые и наземные растения.
  • Харалес Линдли 1836 (Charophytae Engler, 1887 ) - каменницы.
  • Plantae Haeckel 1866 (Cormophyta Nimmer, 1836 ; Embryophyta Nimmer, 1836, исправлено. Lewis & McCourt, 2004 ) – наземные растения (эмбриофиты)

Внешняя филогения

[ редактировать ]

Ниже представлена ​​консенсусная реконструкция взаимоотношений Archaeplastida с ее ближайшими соседями, основанная главным образом на молекулярных данных. [31] [32] [33] [34]

потогонные средства

Были разногласия относительно корня Archaeplastida, например, возникла ли Cryptista внутри Archaeplastida. В 2014 году был опубликован подробный обзор этих несоответствий. [35] Положение Telonemia и Picozoa неясно. Также Hacrobia (Haptista + Cryptista) может быть полностью связана с кладой SAR. SAR часто рассматривают как гибриды эукариот-эукариот, что приводит к путанице в генетическом анализе. Сестра Gloeomargaritalitophora была поглощена предком Archaeplastida, что привело к появлению пластид , которые живут в постоянном эндосимбиозе в большинстве потомственных линий. Поскольку и Gloeomargarita, и родственные цианобактерии, в дополнение к наиболее примитивным архепластидам, живут в пресной воде, кажется, что Archaeplastida возникла в пресной воде и колонизировала океаны только в позднем протерозое. [36] [37]

Внутренняя филогения

[ редактировать ]

В 2019 году была предложена филогения Archaeplastida на основе геномов и транскриптомов 1153 видов растений. [38] Расположение групп водорослей подтверждается филогениями, основанными на геномах Mesostigmatophyceae и Chlorokybophyceae, которые с тех пор были секвенированы. В этом анализе как «хлорофитные водоросли», так и «стрептофитные водоросли» рассматриваются как парафилетические (вертикальные полосы рядом с филогенетической древовидной диаграммой). [39] [40] Классификация Bryophyta поддерживается Puttick et al. 2018, [41] и филогениями, включающими геномы роголистника, которые с тех пор также были секвенированы. [42] [43]

Недавние исследования нефотосинтезирующих водорослей считают родельфидию сестрой Rhodophyta или Glaucophyta и Viridiplantae; [44] [45] и сестра Picozoa этой пары групп. [46]

Морфология

[ редактировать ]

Все архепластиды имеют пластиды (хлоропласты), которые осуществляют фотосинтез и, как полагают, происходят от эндосимбиотических цианобактерий. У глаукофитов, возможно, самых примитивных представителей группы, хлоропласт называется цианеллой и имеет некоторые общие черты с цианобактериями, включая клеточную стенку пептидогликана, которые не сохраняются у других членов группы. Сходство цианелл с цианобактериями подтверждает эндосимбиотическую теорию .

Клетки большинства архепластид имеют стенки, обычно, но не всегда, состоящие из целлюлозы. [ нужна ссылка ]

Археопластиды широко различаются по степени клеточной организации: от изолированных клеток до нитей, колоний и многоклеточных организмов. Самые ранние из них были одноклеточными, и многие группы остаются таковыми и сегодня. Многоклеточность развивалась отдельно в нескольких группах, включая красные водоросли, ульвофитные зеленые водоросли и зеленые водоросли, давшие начало каменщикам и наземным растениям.

Эндосимбиоз

[ редактировать ]

Поскольку предполагается, что предковый архепластидан приобрел свои хлоропласты непосредственно путем поглощения цианобактерий, это событие известно как первичный эндосимбиоз (что отражено в названии, выбранном для группы «Археепластида», то есть «древние пластиды»). В 2013 году было обнаружено, что один вид зеленых водорослей, Cymbomonas Tetramitiformis из отряда Pyramimonadales , является миксотрофом и способен поддерживать себя как за счет фаготрофии , так и за счет фототрофии . Пока неизвестно, является ли это примитивным признаком и, следовательно, определяет последнего общего предка Archaeplastida, что могло бы объяснить, как он получил свои хлоропласты, или это признак, восстановленный в результате горизонтального переноса генов . [47] С тех пор было обнаружено больше видов миксотрофных зеленых водорослей, таких как Pyramimonas tychotreta и Mantoniella antarctica . [48]

Доказательства первичного эндосимбиоза включают наличие двойной мембраны вокруг хлоропластов; одна мембрана принадлежала бактерии, а другая захватившему ее эукариоту. Со временем многие гены из хлоропласта были перенесены в ядро ​​клетки-хозяина посредством эндосимбиотического переноса генов (EGT). Подсчитано, что 6–20% генома архепластидана состоят из генов, переданных от эндосимбионта. [49] Присутствие таких генов в ядрах эукариот без хлоропластов позволяет предположить, что этот перенос произошел на ранних этапах эволюции группы. [50]

Другие эукариоты с хлоропластами, по-видимому, получили их, поглотив одноклеточный архепластидан своими собственными хлоропластами бактериального происхождения. Поскольку эти события включают эндосимбиоз клеток, имеющих собственных эндосимбионтов, этот процесс называется вторичным эндосимбиозом . Хлоропласты таких эукариот обычно окружены более чем двумя мембранами, что отражает историю множественного поглощения. Хлоропласты эвгленид , хлорарахниофитов и небольшой группы динофлагеллят , по-видимому, захвачены зелеными водорослями, [51] тогда как остающиеся фотосинтезирующие эукариоты, такие как гетероконтовые водоросли, криптофиты , гаптофиты и динофлагелляты, по-видимому, представляют собой захваченные красные водоросли. [52]

Ископаемая запись

[ редактировать ]

Возможно, самые древние останки Archaeplastida — это предполагаемые красные водоросли ( Rafatazmia ) в строматолитах пород возрастом 1600 млн лет назад (миллионы лет назад) в Индии. [53] а также возможные окаменелости водорослей ( Туаньшаньцзия ) из биоты Гаоючжуан в Китае того же возраста. [54] Несколько более поздними являются микроокаменелости из группы Ропер в северной Австралии. Структура этих одноклеточных окаменелостей напоминает структуру современных зеленых водорослей. Они датируются мезопротерозойской эрой, примерно 1500–1300 млн лет назад. [55] Эти окаменелости согласуются с исследованием молекулярных часов , в ходе которого было подсчитано, что эта клада разошлась около 1500 млн лет назад. [56] Самая старая окаменелость, которую можно отнести к определенной современной группе, — это красная водоросль Bangiomorpha , возраст которой составляет 1200 млн лет назад. [57]

В поздней неопротерозойской эре окаменелости водорослей стали более многочисленными и разнообразными. В конце концов, в палеозойскую эру растения появились на суше и продолжают процветать до настоящего времени.

Примечания

[ редактировать ]
  1. ^ Исключительные две пластидные мембраны страменопильной водоросли Chrysoparadoxa , вероятно, являются результатом вторичной редукции. [9]
  1. ^ Jump up to: а б с д Адл, С.М.; и др. (2005). «Новая классификация эукариот более высокого уровня с акцентом на таксономию протистов» . Журнал эукариотической микробиологии . 52 (5): 399–451. дои : 10.1111/j.1550-7408.2005.00053.x . ПМИД   16248873 . S2CID   8060916 .
  2. ^ Jump up to: а б Ядзаки, Юки; Ябуки, Акинори; Имаидзуми, Аяка; Куме, Кейтаро; Хасимото, Тецуо; Инагаки, Юдзи (31 августа 2021 г.). «Филогеномика ссылается на кладу, в которой обитают Cryptista, Archaeplastid и Microheliella maris ». bioRxiv   10.1101/2021.08.29.458128 .
  3. ^ Шен, Мэн; Златогурский В.В.; Сингх, РП; и др. (17 ноября 2021 г.). «Одноклеточная геномика показывает, что пикозоа, лишенные пластид, являются близкими родственниками красных водорослей» . Природные коммуникации . 12:6651 (1):6651. Бибкод : 2021NatCo..12.6651S . дои : 10.1038/s41467-021-26918-0 . ISSN   2041-1723 . ПМК   8599508 . ПМИД   34789758 .
  4. ^ Кавалер-Смит, Т. (1981). «Королевства эукариот: семь или девять?» ". BioSystems . 14 (3–4): 461–481. Бибкод : 1981BiSys..14..461C . doi : 10.1016/0303-2647(81)90050-2 . PMID   7337818 .
  5. ^ Jump up to: а б Палмер, Джеффри Д.; Солтис, Дуглас Э.; Чейз, Марк В. (2004). «Растительное древо жизни: обзор и некоторые точки зрения» . Американский журнал ботаники . 91 (10): 1437–1445. дои : 10.3732/ajb.91.10.1437 . ПМИД   21652302 .
  6. ^ Болл, С.; Коллеони, К. (январь 2011 г.). «Эволюция метаболизма гликогена и крахмала у эукариот дает молекулярные ключи к пониманию возникновения пластидного эндосимбиоза» . Журнал экспериментальной ботаники . 62 (6). Ченчи, У.; Радж, Дж. Н.; Тиртьо, К.: 1775–1801. дои : 10.1093/jxb/erq411 . ПМИД   21220783 .
  7. ^ В конце концов, пикозои - это водоросли: исследование | Журнал «Ученый»®
  8. ^ Институт биологии внутренних вод им. Папанина РАН; Тихоненков, Денис В. (2020). «Хищные жгутиконосцы – новые, недавно обнаруженные глубокие ветви эукариотического дерева и их эволюционное и экологическое значение» (PDF) . Протистология . 14 (1). дои : 10.21685/1680-0826-2020-14-1-2 .
  9. ^ Уэтерби, Ричард; Джексон, Кристофер Дж.; Репетти, Соня И.; Клементсон, Лесли А.; Коста, Джоана Ф.; ван де Мин, Эллисон; Кроуфорд, Саймон; Вербрюгген, Хероен (9 декабря 2018 г.). «Золотой парадокс - новая линия гетероконтов с хлоропластами, окруженными двумя мембранами». Журнал психологии . 22 (2): 257–278. дои : 10.1111/jpy.12822 . hdl : 11343/233613 . ПМИД   30536815 . S2CID   54477112 .
  10. ^ Справочник по морским микроводорослям: достижения биотехнологии
  11. ^ Парфри. ЛВ; Барберо, Э.; Лассер, Э; и др. (декабрь 2006 г.). «Оценка поддержки текущей классификации эукариотического разнообразия» . ПЛОС Генетика . 2 (12): е220. дои : 10.1371/journal.pgen.0020220 . ПМЦ   1713255 . ПМИД   17194223 .
  12. ^ Jump up to: а б Ким, Э; Грэм, Луизиана (июль 2008 г.). Редфилд, Розмари Джин (ред.). «Анализ EEF2 бросает вызов монофилии Archaeplastida и Chromalveolata» . ПЛОС ОДИН . 3 (7): е2621. Бибкод : 2008PLoSO...3.2621K . дои : 10.1371/journal.pone.0002621 . ПМК   2440802 . ПМИД   18612431 .
  13. ^ Мацкевич, П.; Гагат, П. (2014). «Монофилия супергруппы Archaeplastida и взаимоотношения между ее линиями в свете филогенетических и филогеномных исследований. Близки ли мы к консенсусу?» . Acta Societatis Botanicorum Poloniae . 83 (4): 263–280. дои : 10.5586/asbp.2014.044 .
  14. ^ Виола, Р.; Нивалл, П.; Педерсен, М. (2001). «Уникальные особенности метаболизма крахмала у красных водорослей» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 268 (1474): 1417–1422. дои : 10.1098/rspb.2001.1644 . ПМЦ   1088757 . ПМИД   11429143 .
  15. ^ Коупленд, HF (1956). Классификация низших организмов . Пало-Альто: Pacific Books, стр. 29, [1] .
  16. ^ Бесси, CE (1907). «Краткий обзор типов растений» . унив. Исследования Небраски . 7 : 275–358.
  17. ^ Бурки, Фабьен; Кямран Шалчян-Тебризи; Марианна Минге; Осмунд Скьевеланд; Сергей Иванович Николаев; Кжетилл С. Якобсен; Ян Павловский (2007). Батлер, Джеральдин (ред.). «Филогеномика меняет супергруппы эукариот» . ПЛОС ОДИН . 2 (8): е790. Бибкод : 2007PLoSO...2..790B . дои : 10.1371/journal.pone.0000790 . ЧВК   1949142 . ПМИД   17726520 .
  18. ^ Бурки, Ф.; Инагаки, Ю.; Брейт, Дж.; Арчибальд, Дж. М.; Килинг, П.Дж.; Кавальер-Смит, Т.; и др. (2009). «Крупномасштабный филогеномический анализ показывает, что две загадочные линии протистов, Telonemia и Centroheliozoa, связаны с фотосинтезирующими хромальвеолатами» . Геномная биология и эволюция . 1 : 231–238. дои : 10.1093/gbe/evp022 . ПМК   2817417 . ПМИД   20333193 .
  19. ^ Кавальер-Смит, Томас (2009). «Царства Protozoa и Chromista и эозойный корень эукариотического дерева» . Письма по биологии . 6 (3): 342–345. дои : 10.1098/rsbl.2009.0948 . ПМК   2880060 . ПМИД   20031978 .
  20. ^ Рогозин И.Б.; Басу, МК; Чюрёш М. и Кунин Е.В. (2009). «Анализ редких геномных изменений не подтверждает филогению Униконт-Биконт и предполагает цианобактериальный симбиоз как точку первичного излучения эукариот» . Геномная биология и эволюция . 1 : 99–113. дои : 10.1093/gbe/evp011 . ПМК   2817406 . ПМИД   20333181 .
  21. ^ Балдауф, Сандра Л.; Роджер, Эй Джей; Венк-Зиферт, И.; Дулитл, WF (2000). «Филогения эукариот на уровне царства на основе комбинированных данных о белках». Наука . 290 (5493): 972–977. Бибкод : 2000Sci...290..972B . дои : 10.1126/science.290.5493.972 . ПМИД   11062127 .
  22. ^ Липскомб, Диана. 1991. Широкая классификация: царства и простейшие. В: Паразитические простейшие, Vol. 1, 2-е изд., Дж. П. Крейер, Дж. Р. Бейкер (ред.), стр. 81–136. Академическое издательство, Сан-Диего.
  23. ^ Jump up to: а б Нодзаки, Х.; Маруяма, С.; Мацузаки, М.; Накада, Т.; Като, С.; Мисава, К. (декабрь 2009 г.). «Филогенетические положения Glaucophyta, зеленых растений (Archaeplastida) и Haptophyta (Chromalveolata), выведенные на основе медленно развивающихся ядерных генов». Молекулярная филогенетика и эволюция . 53 (3): 872–80. дои : 10.1016/j.ympev.2009.08.015 . ПМИД   19698794 .
  24. ^ Палмгрен М., Соренсен Д.М., Халльстрем Б.М., Салл Т., Броберг К. (август 2019 г.). «Эволюция АТФаз P2A и P5A: повторение древних дупликаций генов и связи красных водорослей с зелеными растениями» . Физиол. Растение . 168 (3): 630–647. дои : 10.1111/чел.13008 . ПМК   7065118 . PMID   31268560 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  25. ^ Jump up to: а б Чан, CX; Ян, ЕС; Банерджи, Т.; Юн, HS; Мартоне, ПТ; Эстевес, Дж. М.; Бхаттачарья, Д. (2011). «Монофилия красных и зеленых водорослей и обширное совместное использование генов обнаружены в богатом репертуаре генов красных водорослей» . Современная биология . 21 (4): 328–333. Бибкод : 2011CBio...21..328C . дои : 10.1016/j.cub.2011.01.037 . ПМИД   21315598 . S2CID   7162977 .
  26. ^ Т. Кавальер-Смит (1981). «Королевства эукариот: семь или девять?». БиоСистемы . 14 (3–4): 461–481. Бибкод : 1981BiSys..14..461C . дои : 10.1016/0303-2647(81)90050-2 . ПМИД   7337818 .
  27. ^ Бхаттачарья, Дебашиш; Юн, Хван Су; Хакетт, Иеремия (2003). «Фотосинтезирующие эукариоты объединяются: эндосимбиоз соединяет точки». Биоэссе . 26 (1): 50–60. дои : 10.1002/bies.10376 . ПМИД   14696040 .
  28. ^ Симпсон, AGB (2004). «Таксоны высшего уровня среди эукариот». Первое международное совещание по филогенетической номенклатуре. Париж, 6–9 июля .
  29. ^ Виноградов С.Н.; Фернандес, И.; Хогевейс, Д.; Арредондо-Питер, Р. (октябрь 2010 г.). «Филогенетические связи 3/3 и 2/2 гемоглобинов в геномах архепластид с бактериальными и другими эукариотными гемоглобинами» . Молекулярный завод . 4 (1): 42–58. дои : 10.1093/mp/ssq040 . ПМИД   20952597 .
  30. ^ Термель, М.; Отис, К.; Лемье, К. (2005). «Полные последовательности ДНК хлоропластов харовых зеленых водорослей Staurastrum и Zygnema показывают, что геном хлоропластов претерпел значительные изменения в ходе эволюции Zygnematales» . БМК Биология . 3:22 . дои : 10.1186/1741-7007-3-22 . ПМЦ   1277820 . ПМИД   16236178 .
  31. ^ Лелиарт, Фредерик; Смит, Дэвид Р.; Моро, Эрве; Херрон, Мэтью Д.; Вербрюгген, Хероен; Делвич, Чарльз Ф.; Де Клерк, Оливье (2012). «Филогения и молекулярная эволюция зеленых водорослей» (PDF) . Критические обзоры по наукам о растениях . 31 (1): 1–46. Бибкод : 2012CRvPS..31....1L . дои : 10.1080/07352689.2011.615705 . S2CID   17603352 . Архивировано из оригинала (PDF) 24 сентября 2015 г. Проверено 15 октября 2017 г.
  32. ^ Кук, Марта Э.; Грэм, Линда Э. (2017). «Chlorokybophyceae, Klebsormidiophyceae, Coleochaetophyceae». В Арчибальде, Джон М.; Симпсон, Аластер ГБ; Сламовиц, Клаудио Х. (ред.). Справочник протистов . Международное издательство Спрингер. стр. 185–204. дои : 10.1007/978-3-319-28149-0_36 . ISBN  9783319281476 .
  33. ^ Льюис, Луиза А.; МакКорт, Ричард М. (2004). «Зеленые водоросли и происхождение наземных растений». Американский журнал ботаники . 91 (10): 1535–1556. дои : 10.3732/ajb.91.10.1535 . ПМИД   21652308 .
  34. ^ Адл, Сина М.; Симпсон, Аластер ГБ; Лейн, Кристофер Э.; Лукеш, Юлиус; Басс, Дэвид; Баузер, Сэмюэл С.; Браун, Мэтью В.; Бурки, Фабьен; Данторн, Мика (1 сентября 2012 г.). «Пересмотренная классификация эукариот» . Журнал эукариотической микробиологии . 59 (5): 429–514. дои : 10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x . ПМЦ   3483872 . ПМИД   23020233 .
  35. ^ Мацкевич, Павел; Гагат, Пшемыслав (31 декабря 2014 г.). «Монофилия супергруппы Archaeplastida и взаимоотношения между ее линиями в свете филогенетических и филогеномных исследований. Близки ли мы к консенсусу?» . Acta Societatis Botanicorum Poloniae . 83 (4): 263–280. дои : 10.5586/asbp.2014.044 .
  36. ^ де Врис, Ян; Арчибальд, Джон М. (2017). «Эндосимбиоз: произошли ли пластиды от пресноводной цианобактерии?» . Современная биология . 27 (3): Р103–Р105. Бибкод : 2017CBio...27.R103D . дои : 10.1016/j.cub.2016.12.006 . ПМИД   28171752 .
  37. ^ Льюис, Луизиана (2017). «Держи соль: пресноводное происхождение первичных пластид» . ПНАС . 114 (37): 9759–9760. Бибкод : 2017PNAS..114.9759L . дои : 10.1073/pnas.1712956114 . ПМК   5604047 . ПМИД   28860199 .
  38. ^ Либенс-Мак, М.; Баркер, М.; Карпентер, Э.; и др. (2019). «Тысяча растительных транскриптомов и филогеномика зеленых растений» . Природа . 574 (7780): 679–685. дои : 10.1038/s41586-019-1693-2 . ПМК   6872490 . PMID   31645766 .
  39. ^ Лян, Чжэ; и др. (2019). «Геном и транскриптом Mesostigma viride дают представление о происхождении и эволюции Streptophyta» . Передовая наука . 7 (1): 1901850. doi : 10.1002/advs.201901850 . ПМК   6947507 . ПМИД   31921561 .
  40. ^ Ван, Сибо; и др. (2020). «Геномы рано расходящихся водорослей-стрептофитов проливают свет на террестриализацию растений» . Природные растения . 6 (2): 95–106. дои : 10.1038/s41477-019-0560-3 . ПМК   7027972 . ПМИД   31844283 .
  41. ^ Путтик, Марк; и др. (2018). «Взаимоотношения наземных растений и природа предкового эмбриофита» . Современная биология . 28 (5): 733–745. Бибкод : 2018CBio...28E.733P . дои : 10.1016/j.cub.2018.01.063 . hdl : 1983/ad32d4da-6cb3-4ed6-add2-2415f81b46da . ПМИД   29456145 .
  42. ^ Чжан, Цзянь; и др. (2020). «Геном роголистника и ранняя эволюция наземных растений» . Природные растения . 6 (2): 107–118. дои : 10.1038/s41477-019-0588-4 . ПМК   7027989 . ПМИД   32042158 .
  43. ^ Ли, Фэй Вэй; и др. (2020). «Геномы антоцероса проливают свет на происхождение наземных растений и уникальную биологию роголистников» . Природные растения . 6 (3): 259–272. дои : 10.1038/s41477-020-0618-2 . ПМЦ   8075897 . ПМИД   32170292 .
  44. ^ Гаврилюк, Райан М.Р.; Тихоненков Денис Владимирович; Хехенбергер, Элизабет; Гусник, Филип; Мыльников Александр П.; Килинг, Патрик Дж. (17 июля 2019 г.). «Нефотосинтезирующие хищники — сестры красных водорослей». Природа . 572 (7768): 240–243. дои : 10.1038/s41586-019-1398-6 . ПМИД   31316212 . S2CID   197542583 .
  45. ^ Новак, Лукас В.Ф.; Муньос-Гомес, Серхио А.; Беверен, Фабиан ван; Чобану, Мария; Эме, Лаура; Лопес-Гарсия, «Очищение»; Морейра, Дэвид (11 марта 2024 г.), Филогеномика нуклеоморфов предполагает глубокое и древнее происхождение криптофитных пластид внутри Rhodophyta , doi : 10.1101/2024.03.10.584144 , получено 8 июня 2024 г.
  46. ^ Шён, Макс Э.; Златогурский Василий Владимирович; Сингх, Рохан П.; Пуарье, Камилла; Уилкен, Сюзанна; Матур, Варша; Штрассерт, Юрген Ф.Х.; Пинхасси, Хароне; Уорден, Александра З.; Килинг, Патрик Дж.; Эттема, Тейс Дж.Г.; Уайдман, Джереми Г.; Бурки, Фабьен (17 ноября 2021 г.). «Одноклеточная геномика показывает, что пикозоа, лишенные пластид, являются близкими родственниками красных водорослей» . Природные коммуникации . 12 (1): 6651. Бибкод : 2021NatCo..12.6651S . дои : 10.1038/s41467-021-26918-0 . ПМК   8599508 . ПМИД   34789758 .
  47. ^ Рэйвен, Джон А. (2013). «Клетки внутри клеток: симбиоз и продолжающаяся фаготрофия» . Современная биология . 23 (12): 530–531 р. Бибкод : 2013CBio...23.R530R . дои : 10.1016/j.cub.2013.05.006 . ПМИД   23787050 .
  48. ^ Бок, Николас А.; Шарве, Софи; Бернс, Джон; Гьялтшен, Янгтшо; Розенберг, Андрей; Дюамель, Соланж; Ким, Ынсу (2021). «Экспериментальная идентификация и прогнозирование in silico бактериозности зеленых водорослей» . Журнал ISME . 15 (7): 1987–2000. Бибкод : 2021ISMEJ..15.1987B . doi : 10.1038/s41396-021-00899-w . ПМЦ   8245530 . PMID   33649548 .
  49. ^ Цю, Хуан; Юн, Хван Су; Бхаттачарья, Дебашиш (2013). «Водорослевые эндосимбионты как векторы горизонтального переноса генов у фотосинтезирующих эукариот» . Границы в науке о растениях . 4 : 366. дои : 10.3389/fpls.2013.00366 . ПМК   3777023 . ПМИД   24065973 .
  50. ^ Андерссон, Ян О.; Роджер, Эндрю Дж. (2002). «Ген цианобактерий у нефотосинтезирующих простейших – раннее приобретение хлоропластов у эукариот?» . Современная биология . 12 (2): 115–119. Бибкод : 2002CBio...12..115A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00649-2 . ПМИД   11818061 . S2CID   18809784 .
  51. ^ Килинг, Патрик Дж. (2010). «Эндсимбиотическое происхождение, диверсификация и судьба пластид» . Философские труды Королевского общества B: Биологические науки . 365 (1541): 729–748. дои : 10.1098/rstb.2009.0103 . ПМК   2817223 . ПМИД   20124341 .
  52. ^ Стадничук И.Н.; Кузнецов, В.В. (2021). «Эндосимбиотическое происхождение хлоропластов в эволюции растительных клеток». Российский журнал физиологии растений . 68 (1): 1–16. дои : 10.1134/S1021443721010179 . S2CID   255012748 .
  53. ^ Бенгтсон, Стефан; Сальштедт, Тереза; Беливанова, Венета; Уайтхаус, Мартин (2017). «Трехмерная сохранность клеточных и субклеточных структур позволяет предположить, что красным водорослям коронной группы возрастом 1,6 миллиарда лет» . ПЛОС Биология . 15 (3): e2000735. doi : 10.1371/journal.pbio.2000735 . ПМК   5349422 . ПМИД   28291791 .
  54. ^ Чен, К.; Мяо, Л.; Чжао, Ф.; Чжу, М. (2023). «Углеродистые макрофоссилии из ранней мезопротерозойской формации Гаоючжуан в хребте Яньшань, Северный Китай». Докембрийские исследования . 392 . 107074. Бибкод : 2023PreR..39207074C . doi : 10.1016/j.precamres.2023.107074 .
  55. ^ Жаво, Эммануэль Ж.; Нолл, Эндрю Х.; Уолтер, Малкольм Р. (2004). «Доказательства TEM эукариотического разнообразия в среднепротерозойских океанах». Геобиология . 2 (3): 121–132. Бибкод : 2004Gbio....2..121J . дои : 10.1111/j.1472-4677.2004.00027.x . S2CID   53600639 .
  56. ^ Юн, Хван Су; Хакетт, Джеремия Д.; Чинилья, Клаудия; Пинто, Габриэле; Бхаттачарья, Дебашиш (2004). «Молекулярная хронология происхождения фотосинтезирующих эукариот» . Молекулярная биология и эволюция . 21 (5): 809–818. дои : 10.1093/molbev/msh075 . ПМИД   14963099 .
  57. ^ Баттерфилд, Николас Дж. (2000). « Bangiomorpha pubescens n. gen., n. sp.: значение для эволюции пола, многоклеточности и мезопротерозойской/неопротерозойской радиации эукариот». Палеобиология . 26 (3): 386–404. Бибкод : 2000Pbio...26..386B . doi : 10.1666/0094-8373(2000)026<0386:BPNGNS>2.0.CO;2 . S2CID   36648568 .
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: b9992a3051b44be477ff6d9dcff73bde__1721656980
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/b9/de/b9992a3051b44be477ff6d9dcff73bde.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Archaeplastida - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)