Археопластида
Археопластида Временной диапазон: | |
---|---|
Хвойные деревья , травы , водоросли и кустарники и вокруг нее , штат Орегон. на реке Спрэг | |
Научная классификация | |
Домен: | Эукариоты |
Клэйд : | потогонные средства |
(без рейтинга): | Археопластида Адл и др. , 2005 г. [1] |
Подгруппы | |
| |
Синонимы | |
|
Archaeplastida фотоавтотрофные (или царство Plantae sensu lato «в широком смысле»; произносится / ɑːr k ɪ ˈ p l æ s t ɪ d ə / ) — основная группа эукариот , включающая красные водоросли (Rhodophyta), зеленые водоросли , наземные растения и малая группа глаукофитов . [6] Он также включает нефотосинтезирующую линию Rhodelphidia , хищную (эукариотрофную) жгутиконосцу, родственную Rhodophyta, и, вероятно, микроскопических пикозойных . [7] У архепластид есть хлоропласты окруженные двумя мембранами, что позволяет предположить, что они были приобретены непосредственно в результате одного эндосимбиоза путем фагоцитоза цианобактерий , . [8] Все другие группы, имеющие хлоропласты, кроме амебоидного рода Paulinella , имеют хлоропласты, окруженные тремя или четырьмя мембранами, что позволяет предположить, что они были приобретены вторично из красных или зеленых водорослей. [примечание 1] В отличие от красных и зеленых водорослей, глаукофиты никогда не участвовали во вторичных явлениях эндосимбиоза. [10]
В клетках Archaeplastida обычно отсутствуют центриоли и имеются митохондрии с плоскими кристами . Обычно у них есть клеточная стенка , содержащая целлюлозу , а пища хранится в виде крахмала . Однако эти характеристики присущи и другим эукариотам. Основное свидетельство того, что архепластиды образуют монофилетическую группу, получено в результате генетических исследований, которые указывают на то, что их пластиды , вероятно, имели единое происхождение. Это свидетельство оспаривается. [11] [12] На основании имеющихся на сегодняшний день данных невозможно подтвердить или опровергнуть альтернативные сценарии эволюции единственному первичному эндосимбиозу . [13] Фотосинтезирующие организмы с пластидами различного происхождения (например, бурые водоросли ) не относятся к архепластидам.
Археопластиды делятся на две основные эволюционные линии. Красные водоросли пигментированы хлорофиллом а и фикобилипротеинами , как и большинство цианобактерий, и накапливают крахмал вне хлоропластов. Зеленые водоросли и наземные растения, известные под общим названием Viridiplantae (лат. «зеленые растения») или Chloroplastida, пигментированы хлорофиллами a и b , но лишены фикобилипротеинов, а крахмал накапливается внутри хлоропластов. [14] Глаукофиты имеют типичные цианобактериальные пигменты, но их пластиды (называемые цианеллами) отличаются наличием внешнего слоя пептидогликана. [1]
Не следует путать Archaeplastida со старым и устаревшим названием Archiplastideae, которое относится к цианобактериям и другим группам бактерий. [15] [16]
Таксономия
[ редактировать ]Консенсус 2005 года, когда группа, состоящая из глаукофитов, красных и зеленых водорослей и наземных растений, была названа «Археопластида», [1] заключалось в том, что это была клада , т.е. была монофилетична . Многие исследования, опубликованные с тех пор, предоставили подтверждающие доказательства. [17] [18] [19] [20] Однако другие исследования предположили, что эта группа является парафилетической . [21] [22] [23] [12] [24] На сегодняшний день ситуация кажется нерешенной, но в недавнем исследовании был продемонстрирован сильный сигнал о монофилии Plantae (Archaeplastida) (с обогащением генов красных водорослей). [25] Здесь делается предположение, что Archaeplastida является действительной кладой.
Группе давались разные названия. Некоторые авторы просто называют эту группу растениями или Plantae. [26] [27] Однако название Plantae неоднозначно, поскольку оно также применялось к менее инклюзивным кладам , таким как Viridiplantae и эмбриофиты . Чтобы различать, большую группу иногда называют Plantae sensu lato («растения в широком смысле»).
Во избежание двусмысленности были предложены другие названия. Primoplantae, появившееся в 2004 году, кажется, является первым новым названием, предложенным для этой группы. [5] Другое название, применяемое к этому узлу, - пластида, определяемое как разделяющая кладу «пластиды первичного (прямого прокариотного) происхождения [как] в Magnolia Virginiana Linnaeus 1753». [28]
Хотя многие исследования показали, что Archaeplastida образуют монофилетическую группу, [29] в статье 2009 года утверждается, что они на самом деле парафилетичны . [23] Обогащение новыми генами красных водорослей в недавнем исследовании демонстрирует сильный сигнал о монофилии Plantae (Archaeplastida) и столь же сильный сигнал об истории совместного использования генов между красными/зелеными водорослями и другими линиями. [25] Это исследование дает представление о том, насколько богатые данные о генах мезофильных красных водорослей имеют решающее значение для проверки спорных вопросов эволюции эукариот и для понимания сложных закономерностей наследования генов у простейших.
Название Archaeplastida было предложено в 2005 году большой международной группой авторов (Адл и др. ), которые стремились создать классификацию эукариот , учитывающую морфологию, биохимию и филогенетику и обладающую «некоторой стабильностью в ближайшем будущем». срок." Они отвергли использование формальных таксономических рангов в пользу иерархической структуры, в которой названия клад не обозначают ранг. Таким образом, название типа «Glaucophyta» и название класса «Rhodophyceae» находятся на одном уровне в их классификации. Предложенные подразделения Archaeplastida показаны ниже как в табличной, так и в схематической форме . [1]
Археопластида :
- Glaucophyta Skuja, 1954 (Glaucocystophyta Kies & Kremer, 1986 ) – глаукофиты.
- Глаукофиты — небольшая группа пресноводных одноклеточных водорослей. Их хлоропласты, называемые цианеллами , имеют слой пептидогликана , что делает их более похожими на цианобактерии, чем на таковые у остальных архепластид.
- Rhodophyceae Thuret, 1855, исправить. Рабенхорст, 1863 г., изд. Аддл и др. , 2005 (Rhodophyta Wettstein 1901 ) – красные водоросли.
- Красные водоросли образуют одну из крупнейших групп водорослей. Большинство из них — морские водоросли, многоклеточные и морские. Их красный цвет обусловлен фикобилипротеинами , которые используются в качестве вспомогательных пигментов при захвате света для фотосинтеза.
- Хлоропластида Адл и др. , 2005 (Viridiplantae Cavalier-Smith 1981 ; Chlorobionta Jeffrey 1982, исправлено. Bremer 1985, исправлено. Lewis and McCourt 2004 ; Chlorobiota Kendrick and Crane 1997 ).
- Хлоропластида — это термин, выбранный Adl et al. для группы, состоящей из зеленых водорослей и наземных растений (эмбриофитов). За исключением случаев вторичной потери, все хлоропласты имеют слой пептидогликана и лишены фикобилипротеинов.
- Chlorophyta Pascher, 1914, исправить. Льюис и МакКорт, 2004 – зеленые водоросли (часть)
- Адл и др. использовать узкое определение Chlorophyta; другие источники включают Chlorodendrales и Prasinophytae, которые сами по себе могут быть объединены.
- Ulvophyceae Mattox и Стюарт, 1984 г.
- Trebouxiophyceae Friedl, 1995 (Pleurastrophyceae Mattox et al. 1984 ; Microthamniales Melkonian 1990 )
- Хлорофицеи Кристенсен, 1994 г.
- Chlorodendrales Fritsch, 1917 - зеленые водоросли (часть)
- Prasinophytae Cavalier-Smith, 1998, исправлено. Льюис и МакКорт, 2004 – зеленые водоросли (часть)
- Мезостигма Лаутерборн, 1894 г., исправлено. МакКорт в Adl et al. , 2005 (Mesostigmata Turmel, Otis и Lemieux, 2002 )
- Charophyta Karol et al. , 2001, исправлено. Lewis & McCourt, 2004 (Charophyceae Smith 1938, исправлено Mattox and Stewart 1984 ) – зеленые водоросли (часть) и наземные растения.
- Charophyta sensu lato , использованный Adl et al. , представляет собой монофилетическую группу, состоящую из некоторых зеленых водорослей, в том числе костяных (Charophyta sensu stricto ), а также наземных растений (эмбриофитов).
- Другие подразделения, кроме Streptophytina (ниже), Adl et al. не указали.
- Другие источники включают группы зеленых водорослей Chlorokybales , Klebsormidiales , Zygnematales и Coleochaetales . [30]
- Streptophytina Lewis & McCourt, 2004 - костянки и наземные растения.
Внешняя филогения
[ редактировать ]Ниже представлена консенсусная реконструкция взаимоотношений Archaeplastida с ее ближайшими соседями, основанная главным образом на молекулярных данных. [31] [32] [33] [34]
Были разногласия относительно корня Archaeplastida, например, возникла ли Cryptista внутри Archaeplastida. В 2014 году был опубликован подробный обзор этих несоответствий. [35] Положение Telonemia и Picozoa неясно. Также Hacrobia (Haptista + Cryptista) может быть полностью связана с кладой SAR. SAR часто рассматривают как гибриды эукариот-эукариот, что приводит к путанице в генетическом анализе. Сестра Gloeomargaritalitophora была поглощена предком Archaeplastida, что привело к появлению пластид , которые живут в постоянном эндосимбиозе в большинстве потомственных линий. Поскольку и Gloeomargarita, и родственные цианобактерии, в дополнение к наиболее примитивным архепластидам, живут в пресной воде, кажется, что Archaeplastida возникла в пресной воде и колонизировала океаны только в позднем протерозое. [36] [37]
Внутренняя филогения
[ редактировать ]В 2019 году была предложена филогения Archaeplastida на основе геномов и транскриптомов 1153 видов растений. [38] Расположение групп водорослей подтверждается филогениями, основанными на геномах Mesostigmatophyceae и Chlorokybophyceae, которые с тех пор были секвенированы. В этом анализе как «хлорофитные водоросли», так и «стрептофитные водоросли» рассматриваются как парафилетические (вертикальные полосы рядом с филогенетической древовидной диаграммой). [39] [40] Классификация Bryophyta поддерживается Puttick et al. 2018, [41] и филогениями, включающими геномы роголистника, которые с тех пор также были секвенированы. [42] [43]
Археопластида |
| «хлорофитные водоросли» «водоросли-стрептофиты» | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Недавние исследования нефотосинтезирующих водорослей считают родельфидию сестрой Rhodophyta или Glaucophyta и Viridiplantae; [44] [45] и сестра Picozoa этой пары групп. [46]
Морфология
[ редактировать ]Все архепластиды имеют пластиды (хлоропласты), которые осуществляют фотосинтез и, как полагают, происходят от эндосимбиотических цианобактерий. У глаукофитов, возможно, самых примитивных представителей группы, хлоропласт называется цианеллой и имеет некоторые общие черты с цианобактериями, включая клеточную стенку пептидогликана, которые не сохраняются у других членов группы. Сходство цианелл с цианобактериями подтверждает эндосимбиотическую теорию .
Клетки большинства архепластид имеют стенки, обычно, но не всегда, состоящие из целлюлозы. [ нужна ссылка ]
Археопластиды широко различаются по степени клеточной организации: от изолированных клеток до нитей, колоний и многоклеточных организмов. Самые ранние были одноклеточными, и многие группы остаются таковыми и сегодня. Многоклеточность развивалась отдельно в нескольких группах, включая красные водоросли, ульвофитные зеленые водоросли и зеленые водоросли, давшие начало каменщикам и наземным растениям.
Эндосимбиоз
[ редактировать ]Поскольку предполагается, что предковый архепластидан приобрел свои хлоропласты непосредственно путем поглощения цианобактерий, это событие известно как первичный эндосимбиоз (что отражено в названии, выбранном для группы «Археепластида», то есть «древние пластиды»). В 2013 году было обнаружено, что один вид зеленых водорослей, Cymbomonas Tetramitiformis из отряда Pyramimonadales , является миксотрофом и способен поддерживать себя как за счет фаготрофии , так и за счет фототрофии . Пока неизвестно, является ли это примитивным признаком и, следовательно, определяет последнего общего предка Archaeplastida, что могло бы объяснить, как он получил свои хлоропласты, или это признак, восстановленный в результате горизонтального переноса генов . [47] С тех пор было обнаружено больше видов миксотрофных зеленых водорослей, таких как Pyramimonas tychotreta и Mantoniella antarctica . [48]
Доказательства первичного эндосимбиоза включают наличие двойной мембраны вокруг хлоропластов; одна мембрана принадлежала бактерии, а другая захватившему ее эукариоту. Со временем многие гены из хлоропласта были перенесены в ядро клетки-хозяина посредством эндосимбиотического переноса генов (EGT). Подсчитано, что 6–20% генома архепластидана состоят из генов, переданных от эндосимбионта. [49] Присутствие таких генов в ядрах эукариот без хлоропластов позволяет предположить, что этот перенос произошел на ранних этапах эволюции группы. [50]
Другие эукариоты с хлоропластами, по-видимому, получили их, поглотив одноклеточный архепластидан своими собственными хлоропластами бактериального происхождения. Поскольку эти события включают эндосимбиоз клеток, имеющих собственных эндосимбионтов, этот процесс называется вторичным эндосимбиозом . Хлоропласты таких эукариот обычно окружены более чем двумя мембранами, что отражает историю множественного поглощения. Хлоропласты эвгленид , хлорарахниофитов и небольшой группы динофлагеллят , по-видимому, захвачены зелеными водорослями, [51] тогда как остающиеся фотосинтезирующие эукариоты, такие как гетероконтовые водоросли, криптофиты , гаптофиты и динофлагелляты, по-видимому, представляют собой захваченные красные водоросли. [52]
Ископаемая запись
[ редактировать ]Возможно, самые древние останки Archaeplastida — это предполагаемые красные водоросли ( Rafatazmia ) в строматолитах пород возрастом 1600 млн лет назад (миллионы лет назад) в Индии. [53] а также возможные окаменелости водорослей ( Туаньшаньцзия ) из биоты Гаоючжуан в Китае того же возраста. [54] Несколько более поздними являются микроокаменелости из группы Ропер в северной Австралии. Структура этих одноклеточных окаменелостей напоминает структуру современных зеленых водорослей. Они датируются мезопротерозойской эрой, примерно 1500–1300 млн лет назад. [55] Эти окаменелости согласуются с исследованием молекулярных часов , в ходе которого было подсчитано, что эта клада разошлась около 1500 млн лет назад. [56] Самая старая окаменелость, которую можно отнести к определенной современной группе, — это красная водоросль Bangiomorpha , возраст которой составляет 1200 млн лет назад. [57]
В поздней неопротерозойской эре окаменелости водорослей стали более многочисленными и разнообразными. В конце концов, в палеозойскую эру растения появились на суше и продолжают процветать до настоящего времени.
Примечания
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д Адл, С.М.; и др. (2005). «Новая классификация эукариот более высокого уровня с акцентом на таксономию протистов» . Журнал эукариотической микробиологии . 52 (5): 399–451. дои : 10.1111/j.1550-7408.2005.00053.x . ПМИД 16248873 . S2CID 8060916 .
- ^ Перейти обратно: а б Ядзаки, Юки; Ябуки, Акинори; Имаидзуми, Аяка; Куме, Кейтаро; Хасимото, Тецуо; Инагаки, Юдзи (31 августа 2021 г.). «Филогеномика ссылается на кладу, в которой обитают Cryptista, Archaeplastid и Microheliella maris ». bioRxiv 10.1101/2021.08.29.458128 .
- ^ Шен, Мэн; Златогурский В.В.; Сингх, РП; и др. (17 ноября 2021 г.). «Одноклеточная геномика показывает, что пикозоа, лишенные пластид, являются близкими родственниками красных водорослей» . Природные коммуникации . 12:6651 (1):6651. Бибкод : 2021NatCo..12.6651S . дои : 10.1038/s41467-021-26918-0 . ISSN 2041-1723 . ПМК 8599508 . ПМИД 34789758 .
- ^ Кавальер-Смит, Т. (1981). «Королевства эукариот: семь или девять?» ". BioSystems . 14 (3–4): 461–481. Бибкод : 1981BiSys..14..461C . doi : 10.1016/0303-2647(81)90050-2 . PMID 7337818 .
- ^ Перейти обратно: а б Палмер, Джеффри Д.; Солтис, Дуглас Э.; Чейз, Марк В. (2004). «Растительное древо жизни: обзор и некоторые точки зрения» . Американский журнал ботаники . 91 (10): 1437–1445. дои : 10.3732/ajb.91.10.1437 . ПМИД 21652302 .
- ^ Болл, С.; Коллеони, К. (январь 2011 г.). «Эволюция метаболизма гликогена и крахмала у эукариот дает молекулярные ключи к пониманию возникновения пластидного эндосимбиоза» . Журнал экспериментальной ботаники . 62 (6). Ченчи, У.; Радж, Дж. Н.; Тиртьо, К.: 1775–1801. дои : 10.1093/jxb/erq411 . ПМИД 21220783 .
- ^ В конце концов, пикозои - это водоросли: исследование | Журнал «Ученый»®
- ^ Институт биологии внутренних вод имени Папанина РАН; Тихоненков, Денис В. (2020). «Хищные жгутиконосцы – новые, недавно обнаруженные глубокие ветви эукариотического дерева и их эволюционное и экологическое значение» (PDF) . Протистология . 14 (1). дои : 10.21685/1680-0826-2020-14-1-2 .
- ^ Уэтерби, Ричард; Джексон, Кристофер Дж.; Репетти, Соня И.; Клементсон, Лесли А.; Коста, Джоана Ф.; ван де Мин, Эллисон; Кроуфорд, Саймон; Вербрюгген, Хероен (9 декабря 2018 г.). «Золотой парадокс - новая линия гетероконтов с хлоропластами, окруженными двумя мембранами». Журнал психологии . 22 (2): 257–278. дои : 10.1111/jpy.12822 . hdl : 11343/233613 . ПМИД 30536815 . S2CID 54477112 .
- ^ Справочник по морским микроводорослям: достижения биотехнологии
- ^ Парфри. ЛВ; Барберо, Э.; Лассер, Э; и др. (декабрь 2006 г.). «Оценка поддержки текущей классификации эукариотического разнообразия» . ПЛОС Генетика . 2 (12): е220. дои : 10.1371/journal.pgen.0020220 . ПМЦ 1713255 . ПМИД 17194223 .
- ^ Перейти обратно: а б Ким, Э; Грэм, Луизиана (июль 2008 г.). Редфилд, Розмари Джин (ред.). «Анализ EEF2 бросает вызов монофилии Archaeplastida и Chromalveolata» . ПЛОС ОДИН . 3 (7): e2621. Бибкод : 2008PLoSO...3.2621K . дои : 10.1371/journal.pone.0002621 . ПМК 2440802 . ПМИД 18612431 .
- ^ Мацкевич, П.; Гагат, П. (2014). «Монофилия супергруппы Archaeplastida и взаимоотношения между ее линиями в свете филогенетических и филогеномных исследований. Близки ли мы к консенсусу?» . Acta Societatis Botanicorum Poloniae . 83 (4): 263–280. дои : 10.5586/asbp.2014.044 .
- ^ Виола, Р.; Нивалл, П.; Педерсен, М. (2001). «Уникальные особенности метаболизма крахмала у красных водорослей» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 268 (1474): 1417–1422. дои : 10.1098/rspb.2001.1644 . ПМЦ 1088757 . ПМИД 11429143 .
- ^ Коупленд, HF (1956). Классификация низших организмов . Пало-Альто: Pacific Books, стр. 29, [1] .
- ^ Бесси, CE (1907). «Краткий обзор типов растений» . унив. Исследования Небраски . 7 : 275–358.
- ^ Бурки, Фабьен; Кямран Шалчян-Тебризи; Марианна Минге; Осмунд Скьевеланд; Сергей Иванович Николаев; Кжетилл С. Якобсен; Ян Павловский (2007). Батлер, Джеральдин (ред.). «Филогеномика меняет супергруппы эукариот» . ПЛОС ОДИН . 2 (8): е790. Бибкод : 2007PLoSO...2..790B . дои : 10.1371/journal.pone.0000790 . ЧВК 1949142 . ПМИД 17726520 .
- ^ Бурки, Ф.; Инагаки, Ю.; Брейт, Дж.; Арчибальд, Дж. М.; Килинг, П.Дж.; Кавальер-Смит, Т.; и др. (2009). «Крупномасштабный филогеномический анализ показывает, что две загадочные линии протистов, Telonemia и Centroheliozoa, связаны с фотосинтезирующими хромальвеолатами» . Геномная биология и эволюция . 1 : 231–238. дои : 10.1093/gbe/evp022 . ПМК 2817417 . ПМИД 20333193 .
- ^ Кавалер-Смит, Томас (2009). «Царства Protozoa и Chromista и эозойный корень эукариотического дерева» . Письма по биологии . 6 (3): 342–345. дои : 10.1098/rsbl.2009.0948 . ПМК 2880060 . ПМИД 20031978 .
- ^ Рогозин И.Б.; Басу, МК; Чюрёш М. и Кунин Е.В. (2009). «Анализ редких геномных изменений не подтверждает филогению Униконт-Биконт и предполагает цианобактериальный симбиоз как точку первичного излучения эукариот» . Геномная биология и эволюция . 1 : 99–113. дои : 10.1093/gbe/evp011 . ПМК 2817406 . ПМИД 20333181 .
- ^ Балдауф, Сандра Л.; Роджер, Эй Джей; Венк-Зиферт, И.; Дулитл, WF (2000). «Филогения эукариот на уровне царства на основе комбинированных данных о белках». Наука . 290 (5493): 972–977. Бибкод : 2000Sci...290..972B . дои : 10.1126/science.290.5493.972 . ПМИД 11062127 .
- ^ Липскомб, Диана. 1991. Широкая классификация: царства и простейшие. В: Паразитические простейшие, Vol. 1, 2-е изд., Дж. П. Крейер, Дж. Р. Бейкер (ред.), стр. 81–136. Академическое издательство, Сан-Диего.
- ^ Перейти обратно: а б Нодзаки, Х.; Маруяма, С.; Мацузаки, М.; Накада, Т.; Като, С.; Мисава, К. (декабрь 2009 г.). «Филогенетические положения Glaucophyta, зеленых растений (Archaeplastida) и Haptophyta (Chromalveolata), выведенные на основе медленно развивающихся ядерных генов». Молекулярная филогенетика и эволюция . 53 (3): 872–80. дои : 10.1016/j.ympev.2009.08.015 . ПМИД 19698794 .
- ^ Палмгрен М., Соренсен Д.М., Халльстрем Б.М., Салл Т., Броберг К. (август 2019 г.). «Эволюция АТФаз P2A и P5A: повторение древних дупликаций генов и связи красных водорослей с зелеными растениями» . Физиол. Растение . 168 (3): 630–647. дои : 10.1111/чел.13008 . ПМК 7065118 . PMID 31268560 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Перейти обратно: а б Чан, CX; Ян, ЕС; Банерджи, Т.; Юн, HS; Мартоне, ПТ; Эстевес, Дж. М.; Бхаттачарья, Д. (2011). «Монофилия красных и зеленых водорослей и обширное совместное использование генов обнаружены в богатом репертуаре генов красных водорослей» . Современная биология . 21 (4): 328–333. Бибкод : 2011CBio...21..328C . дои : 10.1016/j.cub.2011.01.037 . ПМИД 21315598 . S2CID 7162977 .
- ^ Т. Кавальер-Смит (1981). «Королевства эукариот: семь или девять?». БиоСистемы . 14 (3–4): 461–481. Бибкод : 1981BiSys..14..461C . дои : 10.1016/0303-2647(81)90050-2 . ПМИД 7337818 .
- ^ Бхаттачарья, Дебашиш; Юн, Хван Су; Хакетт, Иеремия (2003). «Фотосинтезирующие эукариоты объединяются: эндосимбиоз соединяет точки». Биоэссе . 26 (1): 50–60. дои : 10.1002/bies.10376 . ПМИД 14696040 .
- ^ Симпсон, AGB (2004). «Таксоны высшего уровня среди эукариот». Первое международное совещание по филогенетической номенклатуре. Париж, 6–9 июля .
- ^ Виноградов С.Н.; Фернандес, И.; Хогевейс, Д.; Арредондо-Питер, Р. (октябрь 2010 г.). «Филогенетические связи 3/3 и 2/2 гемоглобинов в геномах архепластид с бактериальными и другими эукариотными гемоглобинами» . Молекулярный завод . 4 (1): 42–58. дои : 10.1093/mp/ssq040 . ПМИД 20952597 .
- ^ Термель, М.; Отис, К.; Лемье, К. (2005). «Полные последовательности ДНК хлоропластов харовых зеленых водорослей Staurastrum и Zygnema показывают, что геном хлоропластов претерпел значительные изменения в ходе эволюции Zygnematales» . БМК Биология . 3:22 . дои : 10.1186/1741-7007-3-22 . ПМЦ 1277820 . ПМИД 16236178 .
- ^ Лелиарт, Фредерик; Смит, Дэвид Р.; Моро, Эрве; Херрон, Мэтью Д.; Вербрюгген, Хероен; Делвич, Чарльз Ф.; Де Клерк, Оливье (2012). «Филогения и молекулярная эволюция зеленых водорослей» (PDF) . Критические обзоры по наукам о растениях . 31 (1): 1–46. Бибкод : 2012CRvPS..31....1L . дои : 10.1080/07352689.2011.615705 . S2CID 17603352 . Архивировано из оригинала (PDF) 24 сентября 2015 г. Проверено 15 октября 2017 г.
- ^ Кук, Марта Э.; Грэм, Линда Э. (2017). «Chlorokybophyceae, Klebsormidiophyceae, Coleochaetophyceae». В Арчибальде, Джон М.; Симпсон, Аластер ГБ; Сламовиц, Клаудио Х. (ред.). Справочник протистов . Международное издательство Спрингер. стр. 185–204. дои : 10.1007/978-3-319-28149-0_36 . ISBN 9783319281476 .
- ^ Льюис, Луиза А.; МакКорт, Ричард М. (2004). «Зеленые водоросли и происхождение наземных растений». Американский журнал ботаники . 91 (10): 1535–1556. дои : 10.3732/ajb.91.10.1535 . ПМИД 21652308 .
- ^ Адл, Сина М.; Симпсон, Аластер ГБ; Лейн, Кристофер Э.; Лукеш, Юлиус; Басс, Дэвид; Баузер, Сэмюэл С.; Браун, Мэтью В.; Бурки, Фабьен; Данторн, Мика (1 сентября 2012 г.). «Пересмотренная классификация эукариот» . Журнал эукариотической микробиологии . 59 (5): 429–514. дои : 10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x . ПМЦ 3483872 . ПМИД 23020233 .
- ^ Мацкевич, Павел; Гагат, Пшемыслав (31 декабря 2014 г.). «Монофилия супергруппы Archaeplastida и взаимоотношения между ее линиями в свете филогенетических и филогеномных исследований. Близки ли мы к консенсусу?» . Acta Societatis Botanicorum Poloniae . 83 (4): 263–280. дои : 10.5586/asbp.2014.044 .
- ^ де Врис, Ян; Арчибальд, Джон М. (2017). «Эндосимбиоз: эволюционировали ли пластиды из пресноводной цианобактерии?» . Современная биология . 27 (3): Р103–Р105. Бибкод : 2017CBio...27.R103D . дои : 10.1016/j.cub.2016.12.006 . ПМИД 28171752 .
- ^ Льюис, Луизиана (2017). «Держи соль: пресноводное происхождение первичных пластид» . ПНАС . 114 (37): 9759–9760. Бибкод : 2017PNAS..114.9759L . дои : 10.1073/pnas.1712956114 . ПМК 5604047 . ПМИД 28860199 .
- ^ Либенс-Мак, М.; Баркер, М.; Карпентер, Э.; и др. (2019). «Тысяча растительных транскриптомов и филогеномика зеленых растений» . Природа . 574 (7780): 679–685. дои : 10.1038/s41586-019-1693-2 . ПМК 6872490 . PMID 31645766 .
- ^ Лян, Чжэ; и др. (2019). «Геном и транскриптом Mesostigma viride дают представление о происхождении и эволюции Streptophyta» . Передовая наука . 7 (1): 1901850. doi : 10.1002/advs.201901850 . ПМК 6947507 . ПМИД 31921561 .
- ^ Ван, Сибо; и др. (2020). «Геномы рано дивергентных водорослей-стрептофитов проливают свет на террестриализацию растений» . Природные растения . 6 (2): 95–106. дои : 10.1038/s41477-019-0560-3 . ПМК 7027972 . ПМИД 31844283 .
- ^ Путтик, Марк; и др. (2018). «Взаимоотношения наземных растений и природа предкового эмбриофита» . Современная биология . 28 (5): 733–745. Бибкод : 2018CBio...28E.733P . дои : 10.1016/j.cub.2018.01.063 . hdl : 1983/ad32d4da-6cb3-4ed6-add2-2415f81b46da . ПМИД 29456145 .
- ^ Чжан, Цзянь; и др. (2020). «Геном роголистника и ранняя эволюция наземных растений» . Природные растения . 6 (2): 107–118. дои : 10.1038/s41477-019-0588-4 . ПМК 7027989 . ПМИД 32042158 .
- ^ Ли, Фэй Вэй; и др. (2020). «Геномы Anthoceros проливают свет на происхождение наземных растений и уникальную биологию роголистников» . Природные растения . 6 (3): 259–272. дои : 10.1038/s41477-020-0618-2 . ПМЦ 8075897 . ПМИД 32170292 .
- ^ Гаврилюк, Райан М.Р.; Тихоненков Денис Владимирович; Хехенбергер, Элизабет; Гусник, Филип; Мыльников Александр П.; Килинг, Патрик Дж. (17 июля 2019 г.). «Нефотосинтезирующие хищники — сестры красных водорослей». Природа . 572 (7768): 240–243. дои : 10.1038/s41586-019-1398-6 . ПМИД 31316212 . S2CID 197542583 .
- ^ Новак, Лукас В.Ф.; Муньос-Гомес, Серхио А.; Беверен, Фабиан ван; Джон, Мэри; Мать, Лора; Лопес-Гарсия, «Очищение»; Морейра, Дэвид (11 марта 2024 г.), Филогеномика нуклеоморфов предполагает глубокое и древнее происхождение криптофитных пластид внутри Rhodophyta , doi : 10.1101/2024.03.10.584144 , получено 6 июня 2024 г.
- ^ Шён, Макс Э.; Златогурский Василий Владимирович; Сингх, Рохан П.; Пуарье, Камилла; Уилкен, Сюзанна; Матур, Варша; Штрассерт, Юрген Ф.Х.; Пинхасси, Хароне; Уорден, Александра З.; Килинг, Патрик Дж.; Эттема, Тейс Дж.Г.; Уайдман, Джереми Г.; Бурки, Фабьен (17 ноября 2021 г.). «Одноклеточная геномика показывает, что пикозоа, лишенные пластид, являются близкими родственниками красных водорослей» . Природные коммуникации . 12 (1): 6651. Бибкод : 2021NatCo..12.6651S . дои : 10.1038/s41467-021-26918-0 . ПМЦ 8599508 . ПМИД 34789758 .
- ^ Рэйвен, Джон А. (2013). «Клетки внутри клеток: симбиоз и продолжающаяся фаготрофия» . Современная биология . 23 (12): 530–531 р. Бибкод : 2013CBio...23.R530R . дои : 10.1016/j.cub.2013.05.006 . ПМИД 23787050 .
- ^ Бок, Николас А.; Шарве, Софи; Бернс, Джон; Гьялтшен, Янгтшо; Розенберг, Андрей; Дюамель, Соланж; Ким, Ынсу (2021). «Экспериментальная идентификация и прогнозирование in silico бактериозности зеленых водорослей» . Журнал ISME . 15 (7): 1987–2000. Бибкод : 2021ISMEJ..15.1987B . doi : 10.1038/s41396-021-00899-w . ПМЦ 8245530 . PMID 33649548 .
- ^ Цю, Хуан; Юн, Хван Су; Бхаттачарья, Дебашиш (2013). «Водорослевые эндосимбионты как векторы горизонтального переноса генов у фотосинтезирующих эукариот» . Границы в науке о растениях . 4 : 366. дои : 10.3389/fpls.2013.00366 . ПМК 3777023 . ПМИД 24065973 .
- ^ Андерссон, Ян О.; Роджер, Эндрю Дж. (2002). «Ген цианобактерий у нефотосинтезирующих простейших – раннее приобретение хлоропластов у эукариот?» . Современная биология . 12 (2): 115–119. Бибкод : 2002CBio...12..115A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00649-2 . ПМИД 11818061 . S2CID 18809784 .
- ^ Килинг, Патрик Дж. (2010). «Эндсимбиотическое происхождение, диверсификация и судьба пластид» . Философские труды Королевского общества B: Биологические науки . 365 (1541): 729–748. дои : 10.1098/rstb.2009.0103 . ПМК 2817223 . ПМИД 20124341 .
- ^ Стадничук И.Н.; Кузнецов, В.В. (2021). «Эндосимбиотическое происхождение хлоропластов в эволюции растительных клеток». Российский журнал физиологии растений . 68 (1): 1–16. дои : 10.1134/S1021443721010179 . S2CID 255012748 .
- ^ Бенгтсон, Стефан; Сальштедт, Тереза; Беливанова, Венета; Уайтхаус, Мартин (2017). «Трехмерная сохранность клеточных и субклеточных структур позволяет предположить, что красным водорослям коронной группы возрастом 1,6 миллиарда лет» . ПЛОС Биология . 15 (3): e2000735. doi : 10.1371/journal.pbio.2000735 . ПМК 5349422 . ПМИД 28291791 .
- ^ Чен, К.; Мяо, Л.; Чжао, Ф.; Чжу, М. (2023). «Углеродистые макрофоссилии из ранней мезопротерозойской формации Гаоючжуан в хребте Яньшань, Северный Китай». Докембрийские исследования . 392 . 107074. Бибкод : 2023PreR..39207074C . doi : 10.1016/j.precamres.2023.107074 .
- ^ Жаво, Эммануэль Ж.; Нолл, Эндрю Х.; Уолтер, Малкольм Р. (2004). «Доказательства TEM эукариотического разнообразия в среднепротерозойских океанах». Геобиология . 2 (3): 121–132. Бибкод : 2004Gbio....2..121J . дои : 10.1111/j.1472-4677.2004.00027.x . S2CID 53600639 .
- ^ Юн, Хван Су; Хакетт, Джеремия Д.; Чинилья, Клаудия; Пинто, Габриэль; Бхаттачарья, Дебашиш (2004). «Молекулярная хронология происхождения фотосинтезирующих эукариот» . Молекулярная биология и эволюция . 21 (5): 809–818. дои : 10.1093/molbev/msh075 . ПМИД 14963099 .
- ^ Баттерфилд, Николас Дж. (2000). « Bangiomorpha pubescens n. gen., n. sp.: значение для эволюции пола, многоклеточности и мезопротерозойской/неопротерозойской радиации эукариот». Палеобиология . 26 (3): 386–404. Бибкод : 2000Pbio...26..386B . doi : 10.1666/0094-8373(2000)026<0386:BPNGNS>2.0.CO;2 . S2CID 36648568 .