Тобамовирус

Тобамовирус
	Схема вируса табачной мозаики (ВТМ) и электронная микрофотография вирионов
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Китриновирикота
Сорт:	Алсувирицетес
Заказ:	Мартелливиралес
Семья:	Виргавирусиды
Род:	Тобамовирус

Тобамовирусы — род РНК-содержащих вирусов с положительной цепью. ^{[ 2 ]} из семейства Virgaviridae . ^{[ 3 ]} Многие растения, ^{[ 2 ]} включая табак , картофель , помидоры и тыкву , служат естественными хозяевами. К заболеваниям, связанным с этим родом, относятся: некротические поражения листьев. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Название «Табамовирус» происходит от имени хозяина и симптомов первого обнаруженного вируса ( вируса табачной мозаики ). ^{[ 5 ]}

Внутри этого рода выделяют четыре неофициальные подгруппы: это тобамовирусы, поражающие капустные , тыквенные , мальвовые и пасленовые растения. Основные различия между этими группами заключаются в последовательностях генома и соответствующем диапазоне растений-хозяев. ^{[ нужна ссылка ]} В этом роде 37 видов. ^{[ 6 ]}

Структура

Тобамовирусы безоболочечные, со спиральным стержнем. ^{[ 2 ]} геометрии и винтовой симметрии. Диаметр около 18 нм, длина 300–310 нм. Геномы линейные и несегментированные, длиной около 6,3–6,5 КБ. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

Геном

Геном РНК кодирует как минимум четыре полипептида : ^{[ 3 ]} это неструктурный белок и продукт считывания, которые участвуют в репликации вируса (РНК-зависимая РНК-полимераза, RdRp); ( белок движения MP), который необходим вирусу для перемещения между клетками, и белок оболочки (CP). Часть RdRp, предназначенная для считывания, может экспрессироваться в виде отдельного белка в ВТМ. ^{[ 7 ]} Вирус способен размножаться без движения или белков оболочки, но два других необходимы. У неструктурного белка есть домены, позволяющие предположить, что он участвует в кэпировании РНК, а продукт считывания имеет мотив РНК-полимеразы. Белки движения производятся на очень ранних стадиях инфекционного цикла и локализуются в плазмодесмах . Они, вероятно, участвуют в специфичности хозяина, поскольку считается, что они взаимодействуют с некоторыми факторами клетки-хозяина. ^{[ нужна ссылка ]}

Жизненный цикл

Репликация вируса цитоплазматическая. Вход в клетку-хозяина достигается путем проникновения в клетку-хозяина. Репликация соответствует модели репликации вируса с положительной многоцепочечной РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит путем подавления терминации. Вирус покидает клетку-хозяина путем моночастного движения вируса, не направляемого канальцами. Растения служат естественным хозяином. ^{[ 2 ]} Пути передачи механические. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

Ферменты

тобамовируса РНК-полимеразы гомологичны РНК - бромовирусам зависимые , иларвирусам , тобравирусам и вирусу гвоздичной пятнистости . ^{[ 2 ]}

Пути заражения

Инфекция изначально локализована, но если вирус останется незамеченным, он распространится через сосудистую систему в системную инфекцию. взаимодействие пектинметилэстеразы важного , клеточного фермента, для метаболизма клеточной стенки и развития растения, с белком движения. Точный механизм, который вирус использует для перемещения по растению, неизвестен, но предполагается ^{[ 8 ]}

Эволюция

Существует по крайней мере 3 отдельные клады тобамовирусов, которые в некоторой степени соответствуют диапазону своих хозяев: то есть есть один поражающий пасленовые вид, ; второй заражает тыквенные и бобовые культуры , а третий заражает крестоцветные. ^{[ 9 ]}

Классификация

Разновидность

Род включает следующие виды: ^{[ 6 ]}

Вирус крапчатости болгарского перца (BPeMV)
Вирус легкой крапчатости бругмансии
Вирус легкой крапчатости кактусов (CMMoV) ^{[ 10 ]}
Вирус желтой крапчатости клитории
Вирус пятнистой мозаики плодов огурца
Вирус зеленой пятнистой мозаики огурца (CGMMV)
Вирус крапчатости огурца
Вирус мозаики франжипани (FrMV)
Латентный вирус Форт-Пирса гибискуса (HLFPV)
Латентный сингапурский вирус гибискуса (HLSV)
Вирус зеленой крапчатой мозаики Кюри
Вирус мозаики Маракуйи (MarMV)
Вирус перца Обуда (ObPV)
Вирус кольцевой пятнистости Odontoglossum (ORSV)
Вирус хлоротичной кольцевой пятнистости опунции
Вирус легкой крапчатости паприки
Вирус мозаики маракуйи
Вирус легкой крапчатости перца (PMMoV)
Вирус мозаики плюмерии
Вирус, ассоциированный с некрозом кактуса крысиного хвоста (RCNaV)
Вирус мозаики ремании
Вирус мозаики рибграсса (ВСР)
Вирус Опунции Саммонса (SOV)
Вирус разрыва цветков стрептокарпуса
Вирус солнечно-конопляной мозаики (SHMV)
Латентный вирус табака
Вирус легкой зеленой мозаики табака
Вирус табачной мозаики (ВТМ)
Вирус коричнево-морщинистых плодов томата (ToBRFV)
Вирус мозаики томата (ToMV)
Вирус пятнистой мозаики томата
Вирус тропической мозаики содового яблока
Вирус очищения вен репы (TVCV)
Вирус легкой крапчатости Ullucus
Вирус крапчатости васаби (WMoV)
Вирус легкой крапчатости желтого хвоста
Вирус мозаики Youcai (YoMV), также известный как вирус мозаики масличного рапса (ORMV)
Вирус зеленой крапчатой мозаики кабачков ^{[ 11 ]}

Предлагаемые члены

Предлагаемые, но в настоящее время непризнанные представители этого рода включают: ^{[ 11 ]}

Вирус Chara corallina (CCV)
Вирус мозаики Nicotiana velutina (NVMV)

Ссылки

^ «Таксономия вирусов: выпуск 2018b» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2019. Архивировано из оригинала 20 марта 2020 года . Проверено 18 марта 2019 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Штраус, Дж. Х.; Штраус, Э.Г. (1988). «Эволюция РНК-вирусов». Ежегодный обзор микробиологии . 42 (1). Годовые обзоры : 657–683. дои : 10.1146/annurev.mi.42.100188.003301 . ISSN 0066-4227 . ПМИД 3060004 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и «Онлайн-отчет ICTV Virgaviridae» . Архивировано из оригинала 9 июля 2023 года . Проверено 21 сентября 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с «Вирусная зона» . ЭксПАСи. Архивировано из оригинала 27 июня 2015 года . Проверено 15 июня 2015 г.
^ «Протокол ТРЕТЬЕГО ЗАСЕДАНИЯ ICTV, состоявшегося в МАДРИДЕ, 12 и 16 сентября 1975 г.» (PDF) . Архивировано (PDF) из оригинала 9 апреля 2023 года . Проверено 9 июля 2023 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Архивировано из оригинала 20 марта 2020 г. Проверено 14 мая 2021 г.
^ Крегер, Анджела Н.Х.; Шольтхоф, Карен-Бет Г.; Цитовский, Виталий; Шольтгоф, Герман Б. (март 1999 г.). «Вирус табачной мозаики: новаторские исследования столетия» . Растительная клетка . 11 (3): 301–8. дои : 10.1105/tpc.11.3.301 . ПМЦ 1464663 . ПМИД 10072391 .
^ Чен, Миннесота; Цитовский, В. (август 2003 г.). «Системное перемещение тобамовируса требует пектинметилэстеразы клетки-хозяина» . Заводской журнал . 35 (3): 386–92. дои : 10.1046/j.1365-313X.2003.01818.x . ПМИД 12887589 .
^ Ларти, RT; Восс, TC; Мельчер, У. (1996). «Эволюция тобамовируса: перекрытие генов, рекомбинация и таксономические последствия» (PDF) . Молекулярная биология и эволюция . 13 (10): 1327–1338. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025579 . ПМИД 8952077 .
^ Мин, БЭ; Чунг, Б.Н.; Ким, MJ; Ха, Дж. Х.; Ли, BY; Рю, К.Х. (январь 2006 г.). «Вирус легкой крапчатости кактусов - это новый тобамовирус, инфицирующий кактусы». Архив вирусологии . 151 (1): 13–21. дои : 10.1007/s00705-005-0617-7 . ПМИД 16132178 . S2CID 40760030 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Описания вирусов растений: группа тобамовирусов» . Ассоциация прикладных биологов (ААБ). Архивировано из оригинала 17 ноября 2007 года . Проверено 7 апреля 2008 г.

Дальнейшее чтение

, Тецуо; Цучия, Томохиро; Исикава, Масаюки (январь 2003 г.). Хагивара, Юка; Комода, Яманака, Такуя; Тамаи, Меши Репликация РНК тобамовируса» . Журнал EMBO . 22 (2): 344–53. doi : / cdg033 PMC 140108. 39785019 PMID 12514140. emboi S2CID 10.1093 / .

Внешние ссылки

[1] «Таксономия вирусов: выпуск 2018b» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2019. Архивировано из оригинала 20 марта 2020 года . Проверено 18 марта 2019 г.

[Strauss-Strauss-1988-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Штраус, Дж. Х.; Штраус, Э.Г. (1988). «Эволюция РНК-вирусов». Ежегодный обзор микробиологии . 42 (1). Годовые обзоры : 657–683. дои : 10.1146/annurev.mi.42.100188.003301 . ISSN 0066-4227 . ПМИД 3060004 .

[ICTVReport-3] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и «Онлайн-отчет ICTV Virgaviridae» . Архивировано из оригинала 9 июля 2023 года . Проверено 21 сентября 2017 г.

[ViralZone-4] Перейти обратно: ^а ^б ^с «Вирусная зона» . ЭксПАСи. Архивировано из оригинала 27 июня 2015 года . Проверено 15 июня 2015 г.

[5] «Протокол ТРЕТЬЕГО ЗАСЕДАНИЯ ICTV, состоявшегося в МАДРИДЕ, 12 и 16 сентября 1975 г.» (PDF) . Архивировано (PDF) из оригинала 9 апреля 2023 года . Проверено 9 июля 2023 г.

[ICTV-6] Перейти обратно: ^а ^б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Архивировано из оригинала 20 марта 2020 г. Проверено 14 мая 2021 г.

[54kDa_protein_of_TMV-7] Крегер, Анджела Н.Х.; Шольтхоф, Карен-Бет Г.; Цитовский, Виталий; Шольтгоф, Герман Б. (март 1999 г.). «Вирус табачной мозаики: новаторские исследования столетия» . Растительная клетка . 11 (3): 301–8. дои : 10.1105/tpc.11.3.301 . ПМЦ 1464663 . ПМИД 10072391 .

[8] Чен, Миннесота; Цитовский, В. (август 2003 г.). «Системное перемещение тобамовируса требует пектинметилэстеразы клетки-хозяина» . Заводской журнал . 35 (3): 386–92. дои : 10.1046/j.1365-313X.2003.01818.x . ПМИД 12887589 .

[Lartey1996-9] Ларти, RT; Восс, TC; Мельчер, У. (1996). «Эволюция тобамовируса: перекрытие генов, рекомбинация и таксономические последствия» (PDF) . Молекулярная биология и эволюция . 13 (10): 1327–1338. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025579 . ПМИД 8952077 .

[10] Мин, БЭ; Чунг, Б.Н.; Ким, MJ; Ха, Дж. Х.; Ли, BY; Рю, К.Х. (январь 2006 г.). «Вирус легкой крапчатости кактусов - это новый тобамовирус, инфицирующий кактусы». Архив вирусологии . 151 (1): 13–21. дои : 10.1007/s00705-005-0617-7 . ПМИД 16132178 . S2CID 40760030 .

[descrip-11] Перейти обратно: ^а ^б «Описания вирусов растений: группа тобамовирусов» . Ассоциация прикладных биологов (ААБ). Архивировано из оригинала 17 ноября 2007 года . Проверено 7 апреля 2008 г.

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

Тобамовирус

Схема вируса табачной мозаики (ВТМ) и электронная микрофотография вирионов
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Китриновирикота
Сорт:	Алсувирицетес
Заказ:	Мартелливиралес
Семья:	Виргавирусиды
Род:	*Тобамовирус*