Кластер передового опыта макромолекулярных комплексов во Франкфурте

Франкфуртский кластер передового опыта «Макромолекулярные комплексы» ( CEF ) был основан в 2006 году Франкфуртским университетом имени Гёте совместно с Институтом биофизики Макса Планка и Институтом исследований мозга Макса Планка в рамках Инициативы совершенствования немецких университетов . Финансирование было предоставлено Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) в октябре 2019 года. CEF вырос из многолетних совместных исследований мембранных белков и молекул РНК и усилил исследовательскую деятельность в этих областях, наняв новых ученых во Франкфурт-на-Майне. CEF объединил исследовательскую деятельность до 45 исследовательских групп, большинство из которых базировались в кампусе Ридберг во Франкфурте-на-Майне . CEF основал Институт молекулярных наук о жизни имени Бухмана (BMLS) .

Цели

Ученые CEF задались целью изучить структуру и функции крупных макромолекулярных комплексов, в частности мембранных белков и их сборок, комплексов, участвующих в передаче сигналов и контроле качества, а также комплексов РНК-белок.

Исследовать

В CEF определены важные структуры макромолекулярных комплексов. Примеры важных мембранных комплексов включают атомные структуры комплекса I и АТФ-синтазы и дыхательной цепи митохондрий транспортера, связанного с процессингом антигена (TAP). Исследования структуры и функции РНК привели к определению принципов регуляции термочувствительных рибопереключателей , структурно-функциональных взаимоотношений РНК-полимеразы I , функций микроРНК и механизмов созревания рРНК и последующих процессов во время биогенеза и рециклинга рибосом. Например, ученые CEF идентифицировали рецепторы цепей убиквитина на протеасоме , расшифровали роль линейных цепей убиквитина и описали макромолекулы, регулирующие митофагию , ксенофагию и ER-фагию. Они определили роль сумойлирования в контроле качества рибосом и охарактеризовали процесс генетического контроля качества в ооцитах . Усилия в этих трех областях исследований сопровождались подходами к созданию или перепрограммированию макромолекулярных комплексов и новыми методами, разработанными для расширения и без того большого опыта. Ученые CEF установили и продвинули принципы оптогенетика , а также биохимические методы регуляции света. Они также разработали биофизические методы структурной и функциональной характеристики макромолекул. Примером могут служить молекулы с переключателем света, разработанные для внутриклеточного применения, и методы с временным разрешением для изучения сворачивания РНК. Были усовершенствованы световая флуоресцентная микроскопия для наблюдения за развитием и масс-спектрометрия LILBID для анализа мембранных комплексов. PELDOR-EPR был разработан с разрешением, позволяющим проводить внутриклеточные измерения. Кластер способствовал научному обмену посредством ряда программ, а также посредством семинаров, международных конференций и серий лекций. «методом года» во всех областях науки и техники Оптогенетика и световая флуоресцентная микроскопия были выбраны междисциплинарным исследовательским журналом Nature Methods в 2010 и 2014 годах соответственно. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Пять направлений исследований CEF включали: (A) Структура, механизмы и динамика комплексов в мембране, (B) Состав и динамика макромолекулярных комплексов в контроле качества и передаче сигналов, (C) Динамика комплексов рибонуклеиновая кислота-белок, ( D) Дизайн макромолекулярных комплексов и (E) Методы изучения макромолекулярных комплексов.

Область исследований CEF A – Структура, механизмы и динамика комплексов в мембране

Биологические мембраны играют очень важную роль в жизненных процессах, поскольку все, что нужно клетке для жизни, роста и реагирования, должно либо проходить через них, либо воздействовать на них. Процессы преобразования энергии клеточного дыхания и фотосинтеза происходят в мембранах, каждый сенсорный стимул и обработка информации в мозгу опосредуются ими. Этот комплекс разнообразных действий осуществляется большим количеством различных мембранных белков . В условиях скученности клеточной мембраны большинство мембранных белков объединяются в сложные динамические ансамбли для выполнения различных задач. По этой причине, а также потому, что они встроены в липидный бислой мембраны, большинство мембранных белков трудно изучать, а их функции часто трудно поддаются изучению. Ученые CEF проделали новаторскую работу по преодолению некоторых из этих проблем и внесли большой вклад в выяснение структуры, механизмов и регуляции ряда важных крупных комплексов, включая дыхательный комплекс I. , ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} ротационные АТФазы , ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} суперкомплекс I ₁ III ₂ IV ₁ , ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} цитохром cbb3 оксидаза, ^{[ 11 ]} цитохром bd оксидаза, ^{[ 12 ]} сульфид:хиноноксидоредуктаза, ^{[ 13 ]} грибной основной комплекс TOM, ^{[ 14 ]} бактериальная двухпоровая система поглощения K+ KtrAB, ^{[ 15 ]} Na+-независимый карнитин/бутиробетаиновый антипортер CaiT, ^{[ 16 ]} симпортер бетаина/Na+ BetP, ^{[ 17 ]} транспортер оттока нескольких лекарств AcrB ^{[ 18 ]}^{[ 19 ]} и шаперон и редактирование комплекса TAPBPR-MHC I ^{[ 20 ]} и комплекс загрузки пептида MHC-I человека. ^{[ 21 ]} Распознавание антигенного пептида на TAP определялось с помощью твердотельной ЯМР-спектроскопии с усилением DNP. ^{[ 22 ]} Конформационное сопряжение и транс-ингибирование в ортологе переносчика антигенов человека TmrAB были решены с помощью диполярной ЭПР-спектроскопии. ^{[ 23 ]} Прогресс в определении трехмерной структуры мембранных белков методами рентгеновской кристаллографии и криоэлектронной микроскопии создал возрастающую потребность и возможности для углубленных механистических исследований методами магнитного резонанса. Из-за проблем, присущих мембранным белкам, прогресс зависит от наличия технологий, находящихся на переднем крае разработки методов. В частности, твердотельный ЯМР (MAS) позволяет преодолеть разрыв между «статическими» структурами и биохимическими данными, исследуя мембранные белки непосредственно в двухслойной среде. Такие эксперименты сложны, и прорывы могут быть достигнуты только благодаря наличию динамической ядерной поляризации для повышения чувствительности и очень сильных магнитных полей для спектрального разрешения. Ученые CEF смогли по-новому взглянуть на каталитический механизм транспортеров ABC. На основе 31P-MAS-ЯМР в реальном времени они обнаружили, что гомодимерная липид А- флиппаза MsbA способна катализировать обратную аденилат-киназоподобную реакцию в дополнение к гидролизу АТФ. ^{[ 24 ]} Кроме того, цикл гидролиза АТФ транспортера ABC LmrA был исследован с помощью сайт-направленного спинового мечения и спектроскопии импульсного электрон-электронного двойного резонанса (PELDOR/DEER). ^{[ 25 ]} Вторичный насос EmrE, откачивающий несколько лекарств, из E. coli был тщательно изучен с помощью твердотельного ЯМР, усиленного 31P и DNP. ^{[ 26 ]} Кроме того, ряд фоторецепторов , таких как микробные родопсины, участвуют в процессах трансмембранного транспорта. Например, группы CEF внесли фундаментальный вклад в структурное и функциональное описание протеородопсина, пентамерного светоуправляемого протонного насоса. ^{[ 27 ]}^{[ 28 ]}^{[ 29 ]} Исследователи CEF разработали подходы масс-спектрометрии, специально подходящие для больших мембранных белковых комплексов. Лазерно-индуцированная масс-спектрометрия с десорбцией ионов жидкого пучка/шариков (LILBID) позволяет проводить массовый анализ комплексов белков всей мембраны с молекулярной массой 1 МДа и более. ^{[ 30 ]} Команда ученых CEF раскрыла механизм подтиповой селективности рецепторов брадикинина усиленного DNP, человека к их пептидным агонистам путем интеграции твердотельного ядерного магнитного резонанса, с передовым молекулярным моделированием и стыковкой. ^{[ 31 ]}

Область исследований CEF B – Состав и динамика макромолекулярных комплексов в контроле качества и передаче сигналов

Характеристика функции и структурного состава сигнальных комплексов, контролирующих программы контроля качества клеток, была одной из основных тем исследований CEF. Представление о том, что белки действуют как отдельные объекты, было заменено концепцией, предполагающей, что динамическая реорганизация мультимерных растворимых комплексов, обозначенных как сигналосомы, важна для передачи сигналов в клетке. Регуляция активности этих комплексов достигается за счет их динамического состава, а также за счет посттрансляционных модификаций (ПТМ) белков. Домены, которые распознают эти модификации, играют решающую роль в способности клетки реагировать на изменения в ее микроокружении. CEF добился значительного прогресса в характеристике нескольких сигнальных путей и их регуляции с помощью PTM, включая убиквитилирование , фосфорилирование и ацетилирование . Особое внимание в исследованиях CEF уделялось механизмам контроля качества белков, которые лежат в основе аутофагического и убиквитин/протеасомного путей, двух клеточных систем, используемых для разрушения дефектных или лишних белков, комплексов и органелл. Дополнительными направлениями исследований CEF были контроль генетического качества в ооциты и эпителиальные стволовые клетки с помощью белка p53 и регуляции и киназ .

Исследования аутофагии

Во время селективной аутофагии груз специально подвергается деградации, и были описаны отдельные рецепторы груза, которые регулируют селективность. Этому процессу способствуют рецепторы аутофагии, специфически распознающие, связывающие свой груз и доставляющие его к фагофору. У человека существует шесть различных белков LC3/ GABARAP , которые играют центральную роль, соединяя возникающие мембраны аутофагосом и нагруженные грузом рецепторы аутофагии, чтобы облегчить поглощение, иногда опосредованное или поддерживаемое дополнительными адаптерными белками. ^{[ 32 ]} Ученые CEF показали, что белки GABARAP участвуют не только в аутофагии, но и в убиквитин-зависимой деградации TIAM1 . ^{[ 33 ]} Были достигнуты прорывы в том, как клетки борются с внутриклеточными патогенами и как внутриклеточные бактерии пытаются обойти эти меры противодействия. Киназа Tbk1 была идентифицирована как важная для обеспечения ксенофагии на основе оптиневрина, направленной на удаление бактерий из инфицированных клеток. ^{[ 34 ]} С помощью масс-спектрометрии был проведен глобальный анализ убиквитинома клеток, инфицированных сальмонеллой , что позволило ученым CEF идентифицировать конкретные мишени бактериальных лигаз , секретируемых в клеточную цитоплазму патогенами. ^{[ 35 ]} Ученые CEF также выявили молекулярный механизм нового типа убиквитинирования фосфорибозил-связанного серина эффекторным SdeA возбудителя Legionella , который сильно отличается от канонического механизма убиквитинирования на основе лизина . ^{[ 36 ]}^{[ 37 ]} Они также показали, что другой эффектор бактерий Legionella , SidJ, противостоит токсичности SidE в клетках дрожжей и млекопитающих. ^{[ 38 ]} Масс-спектрометрический анализ показал, что SidJ представляет собой глутамилазу, которая модифицирует каталитический глутамат в моно-АДФ-рибозилтрансферазном домене SdeA, блокируя тем самым активность убиквитинлигазы SdeA. Далее они обнаружили, что белки типа ретикулона действуют как ER-специфичные рецепторы аутофагии, и смоделировали их влияние на кривизну мембраны. ^{[ 39 ]}^{[ 40 ]}

Убиквитинирование

Убиквитинирование играет центральную роль в маркировке белков, подлежащих деградации либо по пути аутофагии, либо через протеасому . Несколько групп CEF внесли свой вклад в понимание того, как передача сигналов убиквитина не только используется в качестве сигнала деградации, но также участвует в некоторых других клеточных процессах. ^{[ 41 ]}^{[ 42 ]}^{[ 43 ]}^{[ 44 ]}^{[ 45 ]}^{[ 46 ]}

стр.63

Исследования TP63 , также известного как p63, показали, что этот белок играет важную роль как для пролиферации и дифференцировки многослойных эпителиальных тканей, так и для наблюдения за генетическим качеством женских половых клеток. Исследования ученых CEF показали, что специфическая изоформа р63 высоко экспрессируется в примордиальных ооцитах, которые задерживаются в профазе мейоза I. Эта изоформа принимает закрытую, неактивную и только димерную конформацию, в которой как взаимодействие с ДНК, так и с транскрипционный аппарат значительно снижается ^{[ 47 ]} Ингибирование достигается путем блокирования границы раздела тетрамеризации домена олигомеризации шестицепочечным антипараллельным бета-листом. ^{[ 48 ]} Активация требует фосфорилирования и осуществляется по подпружиненному необратимому механизму активации. ^{[ 49 ]} Эти открытия открывают возможность разработки терапии для сохранения ооцитов во время химиотерапии , которая у онкологических больных женщин обычно приводит к бесплодию и преждевременному наступлению менопаузы . Ученые CEF также помогли определить молекулярный механизм, вызывающий синдром анкилоблефарон-эктодермальной дисплазии-расщелины губы/неба, заболевание, характеризующееся эрозиями кожи, аномалиями расщелины полости рта и сросшимися веками, которое основано на мутациях в домене SAM или на C-конце. р63. ^{[ 50 ]} Комплексы, участвующие в онкогенезе, изучались несколькими группами CEF, включая лейкемогенный слитый белок AF4-MLL. ^{[ 51 ]} и цитозольные комплексы, содержащие RIP1, которые имеют решающее значение для инициации и точной настройки различных форм гибели клеток , то есть апоптоза и некроптоза. ^{[ 52 ]}^{[ 53 ]}

СГК Франкфурт

В 2017 году Университет Гете стал членом Консорциума структурной геномики (SGC), международного консорциума и государственно-частного партнерства, занимающегося определением структур важных белков и разработкой ингибиторов и зондов для биологических макромолекул, которые будут использоваться в функциональных исследованиях. Университет Гете также стал домом и справочным центром для программы безвозмездных исследований SGC, благодаря которой малые молекулы больше не будут использоваться промышленностью в качестве мишеней для лекарств, свободно доступных исследователям во всем мире. ^{[ 54 ]}). Ученые CEF разработали ингибиторы бромодомена , которые можно использовать для изучения функции этих связывающих доменов модификации ацетил-лизина. Набор зондов был охарактеризован и проверен как инструмент для исследования конкретных бромодоменов. ^{[ 55 ]}

Взаимодействие с растворимыми доменами на мембране

CEF показал, что рецептор фактора роста эндотелия сосудов -2 должен быть интернализован и регулируется путем его ассоциации с эфрином B2 в эндотелиальных клетках. ^{[ 56 ]} Также было обнаружено, что эфрин B2 необходим для контроля уровней АМРА-рецепторов на синаптической мембране. ^{[ 57 ]} Механизм внедрения в мембрану белков, заякоренных в хвосте, изучали путем структурной и биохимической характеристики взаимодействия растворимого белка Get3 с цитоплазматическими доменами мембраносвязанных рецепторов Get1 и Get2. ^{[ 58 ]}

Область исследований CEF C – Динамика комплексов рибонуклеиновая кислота-белок

Многие открытия, включая идентификацию нескольких классов некодирующих РНК и регуляторных элементов РНК, расширили взгляд на функцию РНК от пассивного переносчика информации до активного клеточного компонента. Его структурное и функциональное описание необходимо для понимания молекулярных взаимодействий и связанной с ними динамики.

Структурное описание элементов РНК и их динамика

Комбинация анализа структур РНК на основе ЯМР высокого разрешения ^{[ 59 ]}^{[ 60 ]} и индуцированное лигандом рефолдинг РНК с разрешением по времени путем помещения в клетку различных конформаций. ^{[ 61 ]} вместе с методами импульсного электронного парамагнитного резонанса (PELDOR) после спиновой маркировки по основанию ^{[ 62 ]}^{[ 63 ]}^{[ 64 ]} и сверхбыстрая лазерная спектроскопия динамики РНК ^{[ 65 ]}^{[ 66 ]} привело к описанию структурной динамики нескольких РНК. Ученые CEF показали, что механизм регуляции аденин-чувствительного рибопереключателя патогенной для человека бактерии Vibrio vulnificus заметно отличается от механизма переключения с двумя состояниями, поскольку он включает три различные стабильные конформации. Этот трансляционный аденин-чувствительный рибопереключатель представляет собой первый пример температурно-компенсированного регуляторного элемента РНК. ^{[ 67 ]} Состав и структуру комплекса РНК-лиганд TAR ВИЧ анализировали методами LILBID и ЯМР . ^{[ 68 ]}^{[ 69 ]} что приводит к описанию сложности сайтов связывания пептидов в РНК. Кроме того, гуанин-чувствительный рибопереключатель- аптамерный домен Bacillus subtilis xpt-pbuX оперона Дильса-Альдеразы , рибозимы ^{[ 70 ]} термометр на основе РНК, ^{[ 71 ]} и N1– рибостамицин комплекс ^{[ 72 ]} были структурно и функционально проанализированы. Ученые CEF также показали, что для гуанин-чувствительного рибопереключателя xpt-pbuX B. subtilis конформация полноразмерных транскриптов статична: он заселяет исключительно функциональное выключенное состояние, но не может переключиться во включенное состояние, независимо от наличие или отсутствие лиганда. Только комбинированное совпадение скоростей транскрипции и связывания лигандов позволяет промежуточным продуктам транскрипции подвергаться лиганд-зависимому конформационному рефолдингу. ^{[ 73 ]}(Штайнерт и др., 2017).

Компоненты, участвующие в биогенезе рибосом у эукариот

Ученые CEF в сотрудничестве с Институтом биофизической химии Макса Планка визуализировали РНК-полимеразу I (Pol I) в процессе активной транскрипции генов рибосом в клеточной среде и определили ее структуру с нуклеиновыми кислотами и без них с разрешением 3,8 Å с помощью крио-ЭМ. . ^{[ 74 ]} Их структуры объясняют регуляцию элонгации транскрипции , при которой сжатая и расширенная конформации полимеразы связаны с активным и неактивным состояниями соответственно.

Работа, проведенная в сотрудничестве нескольких групп CEF, раскрыла молекулярную природу синдрома Боуэна-Конради , продемонстрировав, что вызывающая заболевание точечная мутация фактора биогенеза рибосом Nep1 нарушает его ядрышковую локализацию и связывание РНК. ^{[ 75 ]}^{[ 76 ]} Другое исследование, проведенное в сотрудничестве с Эдинбургским университетом, проанализировало РНК-хеликазу Prp43 путем сшивания РНК и анализа кДНК (CRAC) и дало первое представление о функциональной роли этого фермента в биогенезе рибосом. ^{[ 77 ]} Ученые CEF также определили специфичные для растений факторы биогенеза рибосом у A. thaliana, которые играют важную роль в рРНК. процессинге ^{[ 78 ]} и показали, что 60S -ассоциированный фактор биогенеза рибосом LSG1-2 необходим для созревания 40S у A. thaliana . ^{[ 79 ]}

Распределение РНК-модифицирующих ферментов и молекул РНК

Динамику РНП в нативной среде в эукариотических клетках визуализировали и количественно оценивали с помощью микроскопии высокого разрешения. ^{[ 80 ]} Редактирование РНК аденозин-инозин (A-to-I), которое катализируется аденозиндезаминазой, действующей на ферменты РНК (ADAR), играет важную роль в эпитранскриптомной регуляции метаболизма РНК. мРНК катепсина S (CTSS), которая кодирует цистеиновую протеазу, связанную с ангиогенезом и атеросклерозом Было показано, что , сильно редактируется в эндотелиальных клетках человека . ^{[ 81 ]} Редактирование РНК A-to-I контролирует экспрессию катепсина S при атеросклерозе, обеспечивая HuR-опосредованную посттранскрипционную регуляцию.

Экспорт мРНК из ядра в цитоплазму является строго регулируемым этапом экспрессии генов . Ученые CEF оценили члены семейства белков SR (SRSF1–7) на предмет их потенциала действовать в качестве адаптеров фактора ядерного экспорта 1 (NXF1) и тем самым связывать процессинг пре-мРНК с экспортом мРНК. ^{[ 82 ]} Они обнаружили, что более 1000 эндогенных мРНК требуют отдельных белков SR для ядерного экспорта in vivo . Чтобы разобраться в этом механизме, профили связывания РНК NXF1 и SRSF1-7 по всему транскриптому были определены параллельно с помощью УФ-сшивки с разрешением отдельных нуклеотидов и иммунопреципитации ( iCLIP ). SRSF3 оказался наиболее мощным адаптером NXF1, придающим специфичность последовательности связыванию РНК с помощью NXF1 в последних экзонах. Многочисленные заболевания человека характеризуются широко распространенным нарушением регуляции РНК-связывающих белков (RBP) и значительными изменениями структуры транскриптома . Ученые CEF использовали вычислительные методы для изучения механизмов посттранскрипционной регуляции в транскриптомном масштабе в сотрудничестве с исследователями из IMB Майнца . ^{[ 83 ]}

Некодирующие РНК

Ученые CEF также исследовали влияние новых |некодирующих РНК]], таких как длинные некодирующие РНК (днРНК) и микроРНК (миРНК), на клеточную функцию. микроРНК регулируют экспрессию генов, связываясь с мРНК-мишенями и предотвращая их трансляцию. В одном из фокусных проектов CEF удалось наблюдать зависимое от активности пространственно-локализованное созревание микроРНК в дендритах нейронов . ^{[ 84 ]} Было обнаружено, что локальное созревание микроРНК связано с локальным снижением синтеза белка, показывая, что локализованное созревание микроРНК может модулировать экспрессию целевого гена с локальной и временной точностью. Было обнаружено, что LncRNA Meg3 контролирует старение эндотелиальных клеток, и ее ингибирование может служить потенциальной терапевтической стратегией для спасения опосредованного старением нарушения функции эндотелиальных клеток. ^{[ 85 ]} Было обнаружено, что LncRNA MALAT1 регулирует функцию эндотелиальных клеток и рост сосудов. ^{[ 86 ]} и защищает от атеросклероза, регулируя воспаление . ^{[ 87 ]}

Область исследований CEF D – Проектирование макромолекулярных комплексов

Основным направлением работы CEF была разработка и использование методов, а также исследование белков , которые позволяют модулировать клеточные и молекулярные функции с помощью света. В области оптогенетики контроль мембранного потенциала и внутриклеточной передачи сигналов в нейронах и других клетках достигается за счет экспрессии фотосенсорных белков, в большинстве случаев микробного происхождения, например, ионных каналов или насосов, а также активируемых светом ферментов. Оптохимические подходы, напротив, используют химически сконструированные молекулы для достижения световых эффектов в биологических тканях.

Оптогенетика

Истоки оптогенетики лежат в работе группы Бамберга из MPI биофизики во Франкфурте, которая показала, что канал родопсин-2 (ChR2) представляет собой светозависимый катионный канал, который может деполяризовать клетки, в которых он экспрессируется. ^{[ 88 ]}^{[ 89 ]} Во время CEF лаборатория Бамберга продолжала работать в этой области и предоставила несколько основополагающих статей, например, по характеристике ^{[ 90 ]}^{[ 91 ]}^{[ 92 ]} но также и о разработке ChR2 для оптогенетических инструментов с различными свойствами. ^{[ 93 ]} Первое использование ChR2 для деполяризации клеток млекопитающих и создание первого ChR2-трансгенного животного состоялось во Франкфурте. Лаборатория Готшалка ввела ChR2, галородопсин, управляемый светом, и другие родопсины, в нервную систему нематоды C. elegans , чтобы стимулировать отдельные нейроны и коррелировать их функцию с поведенческими результатами. ^{[ 94 ]}^{[ 95 ]}^{[ 96 ]} Кроме того, они изучали синаптическую передачу после фотостимуляции , используя ChR2 и фотоактивируемую аденилатциклазу (PAC) в сочетании с электрофизиологией и электронной микроскопией. ^{[ 97 ]}^{[ 98 ]} и представили модифицированные или новые оптогенетические инструменты с измененными свойствами для блокирования синаптической передачи или для манипулирования циклическим GMP . ^{[ 99 ]}^{[ 100 ]}^{[ 101 ]} Несколько групп CEF объединили усилия не только для того, чтобы разгадать фотоцикл ChR2 в разных временных масштабах. ^{[ 102 ]} но также предоставил в сотрудничестве с Исследовательским центром Юлиха структурное понимание ионной проводимости ChR2. ^{[ 103 ]} Они также создали несколько мутантных версий ChR2 с измененной ионной проводимостью (например, повышенным содержанием Ca ²⁺-проницаемость в "CatCh", a Ca ²⁺ транспортирующий каналродопсин) или кинетику, что представляет собой весьма полезное дополнение к арсеналу оптогенетических инструментов. ^{[ 104 ]} В 2015 году ученые CEF представили первое ЯМР- исследование, в котором были раскрыты структурные детали ретинального кофактора ChR2. Это исследование стало возможным только потому, что DNP (гибридный метод, связывающий ЭПР с твердотельной ЯМР-спектроскопией ) увеличил чувствительность обнаружения в 60 раз, так что можно было обнаруживать метастабильные промежуточные соединения. Таким образом, были получены первые недвусмысленные доказательства исключительной полностью транс-конформации сетчатки в темном состоянии и можно было идентифицировать новый фотопромежуточный продукт. Исследование показало, что ЯМР твердого тела с усилением DNP является ключевым методом, позволяющим преодолеть разрыв между рентгеновским структурным анализом и функциональными исследованиями для получения молекулярной картины с высоким разрешением. ^{[ 105 ]}

Постепенно выяснилось, что родопсины обладают широким спектром функций и распространения и встречаются во всех типах жизни . С появлением новых родопсинов было обнаружено, что они представляют собой довольно универсальное семейство белков, сохраняя при этом структурный каркас из семи трансмембранных спиралей сетчатки, с хромофором связанным с консервативным лизином . ^{[ 106 ]} Ученые CEF изучили структуру, а также функции микробных родопсинов. Одним из них является протеородопсин , обнаруженный у морских микробов, который является наиболее распространенным фоторецептором сетчатки на нашей планете. Варианты протеородопсинов демонстрируют высокий уровень адаптации к окружающей среде, поскольку их цвета настроены на оптимальную длину волны доступного света. ^{[ 107 ]}^{[ 108 ]}^{[ 109 ]}^{[ 110 ]}^{[ 111 ]}

Ученые CEF вместе с коллегами из других немецких университетов разработали новый подход к изменению функциональных свойств оптогенетических инструментов родопсина, а именно путем модификации хромофора сетчатки. Синтетические аналоги сетчатки вводили в ChR2 или другие инструменты родопсина в клетках C. elegans , Drosophila и человека, чтобы изменить светочувствительность, кинетику фотоцикла и цветовой спектр оптогенетических актуаторов . ^{[ 112 ]} Они также создали жестко регулируемый светом гуанилилциклазный опсин CyclOp, который обеспечивает быстрое увеличение цГМФ, вызываемое светом. ^{[ 113 ]} Ученые CEF также использовали оптогенетические инструменты для анализа нейронных цепей и того, как они управляют поведением. ^{[ 114 ]}^{[ 115 ]}^{[ 116 ]}

Оптохимические подходы

Для управления белками и нуклеиновыми кислотами с помощью света ученые CEF разработали и применили целый ряд фотопереключаемых привязей, рибонуклеозидов и нуклеиновых кислот, РНК-аптамеров и «маяков». ^{[ 117 ]}^{[ 118 ]}^{[ 119 ]}^{[ 120 ]}^{[ 121 ]} Они также разработали подход к химиоферментативному синтезу специфично модифицированной РНК для биофизических исследований, включая контроль света. ^{[ 122 ]} Кроме того, были реализованы светоактивируемое взаимодействие наноархитектур ДНК, светозависимые конформационные изменения нуклеиновых кислот, светозависимая интерференция РНК и светозависимая транскрипция. ^{[ 123 ]}^{[ 124 ]} Для нуклеиновых кислот было установлено избирательное по длине волны срабатывание света. ^{[ 125 ]} а также трехмерный контроль гибридизации ДНК путем ортогонального двухцветного двухфотонного разблокирования. ^{[ 126 ]} Ученые CEF разработали группу клеток, состоящую только из двух фотонов со смещением в красную область, для трехмерного фотовысвобождения. ^{[ 127 ]} Они также разработали минимальный светопереключаемый модуль, позволяющий формировать межмолекулярную и конформационно четко определенную структуру G-квадруплекса ДНК с фотопереключаемым азобензольным остатком как часть структуры основной цепи. ^{[ 128 ]} Важной была также разработка индуцируемого флуоресцентного зонда , который позволил обнаружить зависимое от активности пространственно локализованное созревание микроРНК в дендритах нейронов . ^{[ 129 ]} Используя индуцируемые светом антимиР , ученые CEF также исследовали, имеет ли локально ограниченная активность целевой микроРНК терапевтическую пользу при заживлении диабетических ран, и обнаружили, что свет можно использовать для локальной активации терапевтически активных антимиР in vivo . ^{[ 130 ]}

новые принципы построения ДНК-наноархитектур В CEF установили ^{[ 131 ]}^{[ 132 ]}^{[ 133 ]} новые рибопереключатели Кроме того, были разработаны РНК, которые можно запускать с помощью небольших метаболитов , экзогенных молекул или изменений температуры, а также аптамеры или саморасщепляющиеся рибозимы , которые можно использовать для контроля экспрессии генов in vivo . ^{[ 134 ]} Делая макромолекулы более доступными для манипулирования в наномасштабе, CEF разработал общеприменимые методы организации макромолекулярных комплексов в двух измерениях с очень высокой точностью, а также небольшие синтетические привратники и новые «выключатели света» для управления биомолекулярными взаимодействиями и сборкой макромолекулярных комплексов. ^{[ 135 ]}^{[ 136 ]}^{[ 137 ]}^{[ 138 ]}^{[ 139 ]} Был разработан подход к сборке трехмерных белковых сетей путем двухфотонной активации. ^{[ 140 ]} Ученые CEF также добились оптического контроля транслокации антигенов с помощью синтетических фотоусловных вирусных ингибиторов. ^{[ 141 ]}

Белковая инженерия

Ученые CEF использовали детальные структурные знания мегакомплекса синтазы жирных кислот (FAS) для разработки FAS для биосинтеза короткоцепочечных жирных кислот и поликетидов , руководствуясь комбинированным подходом in vitro и in silico . ^{[ 142 ]} Они перепрограммировали контроль длины цепи FAS Saccharomyces cerevisiae , чтобы создать пекарские дрожжи, способные производить жирные кислоты с короткой цепью. Был использован рациональный и минимально инвазивный подход к белковой инженерии, который оставил молекулярные механизмы ФАС неизмененными и выявил пять мутаций, которые могут заставить пекарские дрожжи производить жирные кислоты с короткой цепью. ^{[ 143 ]} Чтобы целенаправленно манипулировать фотоциклом белка, группы CEF объединились, чтобы модифицировать флавопротеин додецин по его ключевой аминокислоте триптофану с помощью заместителей, тщательно отобранных с учетом их структурного и электронного влияния. ^{[ 144 ]}

Область исследований CEF E – Методы исследования макромолекулярных комплексов

Разработка передовых методологий, включая электронный парамагнитный резонанс с временным разрешением (ЭПР), спектроскопию ядерного магнитного резонанса (ЯМР), передовую флуоресцентную микроскопию , а также оптогенетику и оптохимическую биологию, сыграла важную роль в исследовательских усилиях CEF. Кластер также интегрировал новые разработки в области электронной микроскопии и томографии , а также микроскопии сверхвысокого разрешения в портфель методов кампуса Ридберг.

Криоэлектронная микроскопия

Криоэлектронная микроскопия , Природный метод 2015 года ^{[ 145 ]} и метод, за который была присуждена Нобелевская премия в 2017 году, ^{[ 146 ]} широко использовался несколькими группами CEF, в MPI биофизики , а также в . Бухмана при Университете Гете им Институте молекулярной биологии . ^{[ 147 ]}^{[ 148 ]}^{[ 149 ]}^{[ 150 ]}^{[ 151 ]} Детекторы прямых электронов, в разработке которых принимал участие ИМБ Биофизики, превзошли все ожидания ^{[ 152 ]}^{[ 153 ]} С помощью этих детекторов изображения можно получать с гораздо более высокой контрастностью, чем с использовавшимися ранее ПЗС-камерами , и это привело к поразительному прогрессу в структурной биологии. Инвестируя в эту новую технологию, члены CEF смогли ускорить определение структуры, а также определить структуры макромолекулярных комплексов, которые не поддавались рентгеновским кристаллографическим исследованиям. Еще одним направлением деятельности электронных микроскопов CEF было выявление макромолекулярной организации живых клеток с помощью криоэлектронной томографии . Крио-ЭТ — единственный метод, позволяющий получить изображения интактных клеток с молекулярным разрешением в квазинативной среде. Такие томограммы содержат большой объем информации, поскольку по сути представляют собой трехмерную карту клеточного протеома и отображают всю сеть макромолекулярных взаимодействий. интеллектуального анализа информации Алгоритмы используют структурные данные, полученные различными методами, идентифицируют отдельные макромолекулы и вычислительно подбирают структуры атомного разрешения в клеточных томограммах, тем самым устраняя разрыв в разрешении. ^{[ 154 ]}

Световая микроскопия

Кластер также решительно поддерживает новые разработки в области передовой световой микроскопии. Особенно важным методом, добавленным CEF в портфель исследовательских методов во Франкфурте, является световая флуоресцентная микроскопия (LSFM). ^{[ 155 ]}^{[ 156 ]}). В LSFM оптическое секционирование в процессе возбуждения сводит к минимуму обесцвечивание флуорофора и фототоксические эффекты. Поскольку с помощью LSFM биологические образцы выдерживают долговременное трехмерное изображение с высоким пространственно-временным разрешением, такие микроскопы стали предпочтительным инструментом в биологии развития . Влияние LSFM было признано в 2015 году, когда журнал Nature Methods назвал его «Методом 2014 года». ^{[ 157 ]} Ученые CEF использовали LSFM, например, для детального изображения полного эмбрионального развития различных эволюционно неродственных насекомых, а также для установления правил и свойств самоорганизации постэмбриональных моделей деления клеток органов растений. ^{[ 158 ]}^{[ 159 ]}^{[ 160 ]} Большой объем данных, полученных с помощью современной световой микроскопии, сделал автоматический анализ изображений необходимым, и CEF способствовал улучшению обработки данных и моделированию данных современной световой микроскопии. ^{[ 161 ]}^{[ 162 ]} Другие новые методы световой микроскопии, используемые учеными CEF, включают методы, которые обеспечивают чувствительность одиночных молекул и пространственное разрешение ниже дифракционного предела для изучения структурной организации биомолекул в клетках. Программные инструменты, разработанные учеными CEF, включают, например, SuReSim, программное обеспечение, разработанное в сотрудничестве с Гейдельбергским университетом, которое моделирует данные локализации произвольных трехмерных структур, представленных наземными моделями, что позволяет пользователям систематически исследовать, как изменение экспериментальных параметров может повлиять на потенциальные результаты визуализации. . ^{[ 163 ]} Используя недавно разработанные методы, ученые CEF смогли установить роль линейной убиквитиновой оболочки вокруг цитозольного патогена Salmonella Typhimurium в качестве локальной сигнальной платформы NF-κB и предоставили представление о функции OTULIN в активации NF-κB во время бактериального патогенеза. ^{[ 164 ]} Другим примером является идентификация ретикулона 3 (RTN3) как специфического рецептора деградации канальцев ЭР . ^{[ 165 ]} Тесная совместная работа консорциума позволила решить две основные задачи в микроскопии живых клеток, а также микроскопии локализации одиночных молекул: эффективную доставку флуорофоров через клеточные мембраны и отслеживание белков высокой плотности с помощью сверхмалых меток. ^{[ 166 ]}^{[ 167 ]} В совокупности новые инструменты открывают дополнительные возможности для целенаправленного манипулирования и захвата клеточных белков и в то же время для считывания данных с высоким разрешением с помощью микроскопии одиночных молекул.

Методы спектроскопии

В рамках CEF был доступен широкий спектр методов спектроскопии для биологических применений, и ученые CEF добились значительного прогресса в дальнейшей разработке биомолекулярного ЯМР и ЭПР. Сотрудники Центра биомолекулярного магнитного резонанса (БМРЗ) улучшили чувствительность ЯМР жидкостей и твердых тел с помощью спектрометра с динамической ядерной поляризацией (ДНП). Совместно с исследователями Российской академии наук ученые CEF разработали мощный гиротронный источник для ДНП. Источник работает на частоте 260 ГГц с выходной мощностью 20 Вт и соединен квазиоптическим гофрированным волноводом с одним жидкостным и одним твердотельным ЯМР-спектрометром 400 МГц. СВЧ-плата, которая обнаруживает сигнал ЭПР и соединяет мощный микроволновый источник с ЯМР-зондом, была создана совместно с учеными Украинской академии наук . В основе этого уникального устройства лежит металлодиэлектрическая волноводная система, гарантирующая сверхнизкие потери в сочетании с высокой степенью гибкости конструкции прибора. Ученые CEF продемонстрировали усиление сигнала протонного ЯМР в водных жидкостях до 80 раз при магнитных полях 9 Тл. ^{[ 168 ]} таким образом, превосходя теоретические предсказания более чем в 20 раз. Первые применения к макромолекулярным комплексам были столь же успешными. Они также зафиксировали усиление сигнала до 40 раз в вращения образца под магическим углом условиях (MAS) при 100 К с протеородопсином, восстановленным в липидные бислои . Путем интеграции твердотельной ЯМР-спектроскопии, усиленной DNP, с передовым молекулярным моделированием и докингом, был раскрыт механизм подтиповой селективности человеческих кининовых G-белковых рецепторов к их пептидным агонистам. ^{[ 169 ]} Твердотельная ЯМР-спектроскопия с усилением DNP позволила ученым CEF определить конформацию основной цепи с атомным разрешением антигенного пептида, связанного с человеческим транспортером ABC TAP . Их данные ЯМР также предоставили беспрецедентное понимание природы взаимодействий между боковыми цепями пептида антигена и TAP. Их результаты выявили структурную и химическую основу правил выбора субстрата, которые определяют решающую функцию этого переносчика ABC в иммунитете и здоровье человека. Эта работа была первым ЯМР-исследованием эукариотического комплекса белков-переносчиков и продемонстрировала возможности твердотельного ЯМР в этой области. ^{[ 170 ]} Они также продемонстрировали возможности твердотельного ЯМР с усилением DNP для преодоления разрыва между функциональными и структурными данными и моделями. ^{[ 171 ]} Параллельно с разработками ДНП был создан импульсный спектрометр двойного электрон-электронного резонанса (ПЭЛДОР) с магнитным полем 6,4 Тл. Концентрации белка всего 10 пМоль достаточно для измерения при 40 К. С помощью этого прибора ученые CEF смогли определить димерную структуру нековалентных белковых комплексов. Этот метод также применим к мембранным белкам и спин-меченой РНК и ДНК молекулам in vivo . ^{[ 172 ]} PELDOR-спектроскопия оказалась универсальным инструментом для структурных исследований белков, даже в клеточной среде. Чтобы исследовать, например, структурные последствия асимметричных нуклеотидсвязывающих доменов и механизм транс-ингибирования в ортологах TAP, пары спин-меток были введены через двойные цистеиновые мутанты в нуклеотидсвязывающие домены и трансмембранные домены в TmrAB (функциональный гомолог транслокационного комплекса человеческого антигена TAP), а конформационные изменения и равновесные популяции отслеживали с помощью PELDOR-спектроскопии. ^{[ 173 ]} Это исследование определило механистическую основу транс-ингибирования, которое осуществляется путем обратного перехода из состояния, обращенного наружу, через закрытую конформацию. Результаты выявили центральную роль обратимого конформационного равновесия в функционировании и регуляции экспортера ABC и создали механистическую основу для будущих исследований других важных с медицинской точки зрения транспортеров с импринтированной асимметрией. Исследование также впервые продемонстрировало возможность определения равновесных популяций в нескольких доменах и их взаимозависимость для глобальных конформационных изменений в большом мембранном белковом комплексе.

Масс-спектрометрия

Нативная масс-спектрометрия стала важным инструментом структурной биологии . Преимуществами масс-спектрометрии по сравнению с другими методами, такими как рентгеновская кристаллография или ядерный магнитный резонанс, являются, например, более низкие пределы обнаружения, скорость и способность работать с гетерогенными образцами. CEF внес вклад в разработку масс-спектрометрии с десорбцией ионов с помощью лазерных шариков (LILBID), метода, разработанного в Университете Гете, который особенно подходит для анализа больших мембранных белковых комплексов. ^{[ 174 ]} Задачей нативной масс-спектрометрии является сохранение характеристик интересующих белков, таких как олигомерное состояние, связанные лиганды или конформация белкового комплекса, во время перевода из раствора в газовую фазу. Это является важной предпосылкой, позволяющей сделать выводы о состоянии белкового комплекса в растворе на основе измерений газовой фазы. Поэтому необходимы методы мягкой ионизации. Хотя стандартные методы, такие как nESI и матричная лазерная десорбция/ионизация (MALDI), надежно дают ценные результаты для растворимых белков, они не универсально применимы к более сложным матрицам, которые часто требуются для мембранных белковых комплексов. Обычно для поддержания мембранного белкового комплекса в его нативном состоянии вне клеточной среды требуется искусственная мембраноподобная среда. ^{[ 175 ]}^{[ 176 ]} С помощью LILBID анализируемое вещество переносится в масс-спектрометр в виде небольших капель (диаметром 30 или 50 мкм) раствора образца, получаемого с помощью пьезогенератора капель, и десорбируется из водного раствора путем облучения лазером среднего ИК-диапазона. Это приводит к образованию биомолекулярных ионов с более низкими зарядовыми состояниями, более близкими к нативным, по сравнению с nESI. В условиях сверхмягкой десорбции даже слабо взаимодействующие субъединицы крупных белковых комплексов остаются связанными, так что можно определить массу всего комплекса. При более высоких интенсивностях лазера комплекс диссоциирует путем термолиза и регистрируются массы субъединиц. С помощью LILBID был проанализирован широкий спектр макромолекулярных комплексов из областей исследований CEF A, C и D, включая комплекс I , АТФ-синтазу , транспортеры лекарств со связывающими белками, ионные каналы , протеородопсины и комплексы ДНК/РНК. ^{[ 177 ]}^{[ 178 ]}^{[ 179 ]}^{[ 180 ]}

Спектроскопия с временным разрешением

Фемтосекундная спектроскопия с временным разрешением использовалась учеными CEF для изучения молекулярной динамики и функций. Этот метод позволяет наблюдать чрезвычайно быстрые химические и биологические реакции в реальном времени с участием самых разных молекул — от небольших органических соединений до сложных ферментов. Исследования включали молекулярные системы, такие как оптические переключатели, природные и неприродные фотосинтетические модельные системы и мембранные белковые комплексы. Были исследованы фундаментальные процессы молекулярной физической химии, такие как фотоизомеризация, перенос энергии и электронов, а также динамика реакций на поверхностях. Были использованы и получили дальнейшее развитие современные методы квантовой оптики генерации фемтосекундных импульсов соответствующей формы и перестройки в видимом и инфракрасном диапазоне спектра. Примеры этих исследований включают изучение и расшифровку динамики фотопереключаемых или фотолабильных соединений как основы для дизайна фоточувствительных биомакромолекул, динамики первичной реакции каналородопсина-2 (ChR2) и конформационной динамики антибиотиксвязывающих аптамеров: Фотохромные спиропираны представляют собой органические молекулы, которые можно использовать для запуска биологических реакций. ^{[ 181 ]}^{[ 182 ]}^{[ 183 ]}^{[ 184 ]}^{[ 185 ]}

Теоретическая биофизика и биоинформатика

Разработка методов теоретической биофизики играет все более важную роль в изучении макромолекулярных комплексов и вносит существенный вклад во многие исследования в других областях исследований CEF. Объединяя фундаментальную физику, химию и биологию, ученые CEF изучали биомолекулярные процессы в широком диапазоне разрешений: от квантовой механики до химической кинетики, от атомистических описаний физических процессов и химических реакций в молекулярно-динамическом (МД) моделировании до весьма крупнозернистых моделей неравновесная работа молекулярных машин и сетевые описания белковых взаимодействий. Их цель — разработать подробные и количественные описания ключевых биомолекулярных процессов, включая преобразование энергии, молекулярный транспорт, передачу сигнала и ферментативный катализ. В рамках CEF они работали в тесном сотрудничестве с учеными-экспериментаторами, использующими самые разные методы. Их вычислительные и теоретические исследования помогли интерпретировать все более сложные измерения и определили план будущих экспериментов. ^{[ 186 ]}^{[ 187 ]}^{[ 188 ]}^{[ 189 ]}^{[ 190 ]} Междисциплинарная область биоинформатики открыла новые перспективы молекулярных процессов и клеточных функций. Ученые CEF использовали специально разработанный код и конвейеры для быстрого и эффективного анализа. ^{[ 191 ]} данных омики с упором на взаимодействие белок-РНК и посттранскрипционную регуляцию. ^{[ 192 ]}^{[ 193 ]}^{[ 194 ]} Они также разрабатывают алгоритмы для решения проблем молекулярной биологии, от анализа структуры атомного белка до вычислительной системной биологии. Их инструменты используют теорию графов, сети Петри и логические сети. ^{[ 195 ]}^{[ 196 ]} с широким применением в рамках CEF. Их сотрудничество охватывает разнообразные темы: от метаболомики растений, ^{[ 197 ]} к сетям передачи сигналов человека ^{[ 198 ]} и рассечение макромолекулярного комплексома. ^{[ 199 ]}^{[ 200 ]}

Организация

Ассамблея CEF координировала исследование и избрала спикера CEF и Совет директоров CEF. Ассамблея CEF состояла из главных следователей, дополнительных следователей, старших следователей, а также ассоциированных членов. Среди спикеров CEF были Вернер Мюллер-Эстерль (ноябрь 2006 г. - январь 2009 г.), Харальд Швальбе (февраль 2009 г. - февраль 2013 г.) и Фолькер Дётч (март 2013 г. - октябрь 2019 г.). ^{[ 201 ]}^{[ 202 ]}

Публикации

За время существования Кластера ученые CEF опубликовали более 2600 оригинальных научных публикаций (в том числе 479 научных статей в журналах с импакт-фактором ≥10). Полный список можно найти здесь .

Почести и премии учёным ЦЭФ

Полный список можно найти здесь .

Ссылки

^ «Метод года 2010» . Природные методы . 8 (1): 1. 2010. doi : 10.1038/nmeth.f.321 .
^ «Световая флуоресцентная микроскопия может отображать живые образцы в трех измерениях с относительно низкой фототоксичностью и на высокой скорости» . Природные методы . 12 (1): 1. 2014. doi : 10.1038/nmeth.3251 . ПМИД 25699311 .
^ Хант С., Цикерманн В., Брандт У. (2010). «Функциональные модули и структурные основы конформационного сопряжения в митохондриальном комплексе I». Наука . 329 (5990): 448–51. Бибкод : 2010Sci...329..448H . дои : 10.1126/science.1191046 . ПМИД 20595580 . S2CID 11159551 .
^ Цикерманн В., Вирт С., Насири Х., Зигмунд К., Швальбе Х., Хант С., Брандт У. (2015). «Механистическое понимание кристаллической структуры митохондриального комплекса I» . Наука . 347 (6217): 44–49. Бибкод : 2015Sci...347...44Z . дои : 10.1126/science.1259859 . ПМИД 25554780 . S2CID 23582849 .
^ Хан А., Парей К., Бублиц М., Миллс Дерик Дж., Цикерманн В., Вонк Дж., Кюльбрандт В., Мейер Т. (2016). «Структура полного димера АТФ-синтазы раскрывает молекулярную основу морфологии внутренней митохондриальной мембраны» . Мол Клетка . 63 (3): 445–56. doi : 10.1016/j.molcel.2016.05.037 . ПМЦ 4980432 . ПМИД 27373333 .
^ Мюлейп А.В., Йоос Ф., Вигге С., Франгакис А.С., Кюльбрандт В., Дэвис К.М. (2016). «Спиральные массивы U-образных димеров АТФ-синтазы образуют трубчатые кристы в реснитчатых митохондриях» . Proc Natl Acad Sci США . 113 (30): 8442–8447. Бибкод : 2016PNAS..113.8442M . дои : 10.1073/pnas.1525430113 . ПМЦ 4968746 . ПМИД 27402755 .
^ Мерфи Б.Дж., Клюш Н., Лангер Дж., Миллс DJ, Йилдиз О., Кюльбрандт В. (2019). «Вращающиеся подсостояния митохондриальной АТФ-синтазы раскрывают основу гибкого сцепления F1-Fo» . Наука . 364 (6446): eaaw9128. Бибкод : 2019Sci...364.9128M . дои : 10.1126/science.aaw9128 . ПМИД 31221832 . S2CID 195188479 .
^ Хан А., Вонк Дж., Миллс DJ, Мейер Т., Кюльбрандт В. (2018). «Структура, механизм и регуляция АТФ-синтазы хлоропластов» . Наука . 360 (6389): 620. doi : 10.1126/science.aat4318 . ПМК 7116070 . ПМИД 29748256 .
^ Дэвис К.М., Штраус М., Даум Б., Киф Дж.Х., Осевач Х.Д., Рыковска А., Цикерманн В., Кюльбрандт В. (2011). «Макромолекулярная организация АТФ-синтазы и комплекса I в целых митохондриях» . Proc Natl Acad Sci США . 108 (34): 14121–14126. Бибкод : 2011PNAS..10814121D . дои : 10.1073/pnas.1103621108 . ПМК 3161574 . ПМИД 21836051 .
^ Дэвис К.М., Блюм Т.Б., Кюльбрандт В. (2018). «Консервативное расположение комплексов I и III2 in situ в суперкомплексах митохондриальной дыхательной цепи млекопитающих, дрожжей и растений» . Proc Natl Acad Sci США . 115 (12): 3024–3029. Бибкод : 2018PNAS..115.3024D . дои : 10.1073/pnas.1720702115 . ПМЦ 5866595 . ПМИД 29519876 .
^ Бушманн С., Варкентин Э., Се Х., Лангер Дж.Д., Эрмлер У., Мишель Х. (2010). «Структура цитохромоксидазы cbb3 дает представление о перекачке протонов» . Наука . 329 (5989): 327–329. Бибкод : 2010Sci...329..327B . дои : 10.1126/science.1187303 . ПМИД 20576851 . S2CID 5083670 .
^ Сафариан С., Раджендран С., Мюллер Х., Преу Дж., Лангер Дж.Д., Овчинников С., Хиросе Т., Кусумото Т., Сакамото Дж., Мишель Х. (2016). «Структура bd-оксидазы указывает на аналогичные механизмы для встроенных в мембрану кислородредуктаз» . Наука . 352 (6285): 583–586. Бибкод : 2016Sci...352..583S . doi : 10.1126/science.aaf2477 . ПМЦ 5515584 . ПМИД 27126043 .
^ Марсия М., Эрмлер Ю., Пэн Г.Х., Мишель Х. (2009). «Структура Aquifex aeolicus сульфид: хинон-оксидоредуктаза, основа для понимания детоксикации сульфидов и дыхания» . Proc Natl Acad Sci США . 106 (24): 9625–9630. Бибкод : 2009PNAS..106.9625M . дои : 10.1073/pnas.0904165106 . ПМЦ 2689314 . ПМИД 19487671 .
^ Баусевейн Т., Миллс Д.Д., Лангер Дж.Д., Нитшке Б., Нуссбергер С., Кюльбрандт В. (2017). «Крио-ЭМ структура основного комплекса ТОМ Neurospora crassa» . Клетка . 170 (4): 693–700.e7. дои : 10.1016/j.cell.2017.07.012 . ПМИД 28802041 .
^ Дисковски М., Мехдипур А.Р., Вуннике Д., Миллс Д.Д., Микусевич В., Берланд Н., Хоффманн Дж., Моргнер Н., Стейнхофф Х.Дж., Хаммер Г., Вонк Дж., Ханелт И. (2017). «Спиральные складные ножи управляют воротами двухпоровой системы поглощения K+ KtrAB» . электронная жизнь . 6 : е24303. doi : 10.7554/eLife.24303 . ПМК 5449183 . ПМИД 28504641 .
^ Шульце С., Костер С., Гельдмахер У., Тервисша ван Шелтинга А.С., Кюльбрандт В. (2010). «Структурная основа Na+-независимого и кооперативного антипорта субстрат/продукт в CaiT» (PDF) . Природа . 467 (7312): 233–6. Бибкод : 2010Natur.467..233S . дои : 10.1038/nature09310 . ПМИД 20829798 . S2CID 4341977 .
^ Рессл С., Тервисша ван Шелтинга А.С., Фонрейн С., Отт В., Циглер С. (2009). «Молекулярные основы транспорта и регуляции симпортера Na + / бетаина BetP» (PDF) . Природа . 458 (7234): 47–52. Бибкод : 2009Natur.458...47R . дои : 10.1038/nature07819 . ПМИД 19262666 . S2CID 205216142 .
^ Эйхер Т., Сигер М.А., Ансельми С., Чжоу В., Брандштеттер Л., Веррей Ф., Дидерихс К., Фаральдо-Гомес Дж.Д., Пос К.М. (2014). «Сочетание механизмов дистанционного транспорта попеременного доступа для протонов и субстратов в эффлюксном насосе с несколькими лекарствами AcrB» . электронная жизнь . 3 : e03145. дои : 10.7554/eLife.03145.001 . ПМЦ 4359379 . ПМИД 25248080 .
^ Эйхер Т., Ча Х.Дж., Сигер М.А., Брандстаттер Л., Эль-Делик Дж., Бонерт Дж.А., Керн В.В., Веррей Ф., Груттер М.Г., Дидерихс К., Пос К.М. (2012). «Транспортировка лекарств с помощью мультилекарственного транспортера AcrB включает доступ и глубокий связывающий карман, которые разделены переключающей петлей» . Proc Natl Acad Sci США . 109 (15): 5687–92. Бибкод : 2012PNAS..109.5687E . дои : 10.1073/pnas.1114944109 . ПМК 3326505 . ПМИД 22451937 .
^ Томас С., Тампе Р. (2017). «Структура комплекса TAPBPR-MHC I определяет механизм загрузки и редактирования пептидов» . Наука . 358 (6366): 1060–1064. Бибкод : 2017Sci...358.1060T . дои : 10.1126/science.aao6001 . ПМИД 29025996 .
^ Блис А., Джанулиен Д., Хофманн Т., Коллер Н., Шмидт С., Тровитч С., Мёллер А., Тампе Р. (2017). «Структура человеческого комплекса загрузки пептида MHC-I». Природа . 551 (7681): 525–528. Бибкод : 2017Natur.551..525B . дои : 10.1038/nature24627 . ПМИД 29107940 . S2CID 4447406 .
^ Ленерт Э., Мао Дж., Мехдипур А.Р., Хаммер Г., Абеле Р., Глаубиц С., Тампе Р. (2016). «Распознавание антигенного пептида на человеческом транспортере ABC TAP, определенное с помощью твердотельной ЯМР-спектроскопии с усилением DNP». J Am Chem Soc . 138 (42): 13967–13974. дои : 10.1021/jacs.6b07426 . ПМИД 27659210 .
^ Барт К., Хэнк С., Спиндлер П.Е., Приснер Т.Ф., Тампе Р., Джозеф Б. (2018). «Конформационное сопряжение и транс-ингибирование в ортологе переносчика антигенов человека TmrAB, выявленное с помощью диполярной ЭПР-спектроскопии». J Am Chem Soc . 140 (13): 4527–4533. дои : 10.1021/jacs.7b12409 . ПМИД 29308886 .
^ Каур Х, Лакатос-Кароли А, Фогель Р, Нёлль А, Тампе Р, Глаубиц С (2016). «Связанная АТФаза-аденилаткиназная активность в транспортерах ABC» . Нат Коммун . 7 : 13864. Бибкод : 2016NatCo...713864K . дои : 10.1038/ncomms13864 . ПМК 5192220 . ПМИД 28004795 .
^ Хеллмих У.А., Любенова С., Кальтенборн Е., Доши Р., ван Вин Х.В., Приснер Т.Ф., Глаубиц С. (2012). «Изучение цикла гидролиза АТФ мультилекарственного переносчика ABC LmrA с помощью импульсной ЭПР-спектроскопии». J Am Chem Soc . 134 (13): 5857–62. дои : 10.1021/ja211007t . ПМИД 22397466 .
^ Онг Ю.С., Лакатос А., Беккер-Бальдус Дж., Пос К.М., Глаубиц С. (2013). «Обнаружение субстратов, связанных со вторичным насосом оттока нескольких лекарств EmrE, с помощью твердотельного ЯМР с усилением DNP». J Am Chem Soc . 135 (42): 15754–62. дои : 10.1021/Ja402605s . ПМИД 24047229 .
^ Хемпельманн Ф., Хельпер С., Верхуфен М.К., Вернер А.С., Келер Т., Фидлер С.А., Пфлегер Н., Вахтвейтль Дж., Глаубиц К. (2011). «Кластер His75-Asp97 в зеленом протеородопсине». J Am Chem Soc . 133 (12): 4645–4654. дои : 10.1021/ja111116a . ПМИД 21366243 .
^ Рекель С., Готтштейн Д., Штеле Дж., Лёр Ф., Верхуфен М.К., Такеда М., Сильверс Р., Кайношо М., Глаубиц К., Вахтвейтль Дж., Бернхард Ф., Швальбе Х., Гюнтерт П., Дётч В. (2011). «Структура ЯМР раствора протеородопсина» . Angewandte Chemie, международное издание . 50 (50): 11942–11946. дои : 10.1002/anie.201105648 . ПМК 4234116 . ПМИД 22034093 .
^ Мачейко Дж., Каур Дж., Беккер-Бальдус Дж., Глаубиц С. (2019). «Фотоциклозависимые конформационные изменения в кросс-протомерной триаде протеородопсина Asp-His-Trp, выявленные с помощью MAS-ЯМР с усилением DNP» . Proc Natl Acad Sci США . 116 (17): 8342–8349. Бибкод : 2019PNAS..116.8342M . дои : 10.1073/pnas.1817665116 . ПМК 6486740 . ПМИД 30948633 .
^ Моргнер Н., Кляйншрот Т., Барт Х.Д., Людвиг Б., Брутши Б. (2007). «Новый подход к анализу мембранных белков с помощью лазерной масс-спектрометрии: от белковых субъединиц к целостному комплексу» . J Am Soc Масс-спектр . 18 (8): 1429–1438. дои : 10.1016/j.jasms.2007.04.013 . ПМИД 17544294 .
^ Джодике Л., Мао Дж., Куэнце Г., Рейнхарт С., Калавакерла Т., Йонкер Х.Р., Рихтер С., Швальбе Х., Мейлер Дж., Преу Дж., Мишель Х., Глаубиц К. (2018). «Молекулярные основы селективности подтипов человеческих кининовых G-белковых рецепторов» . Nat Chem Biol . 14 (3): 284–290. дои : 10.1038/nchembio.2551 . ПМЦ 7992120 . ПМИД 29334381 .
^ Дикич И, Элазар З (2018). «Механизм и медицинские последствия аутофагии млекопитающих». Nat Rev Mol Cell Biol . 19 (6): 349–364. дои : 10.1038/s41580-018-0003-4 . ПМИД 29618831 . S2CID 4594197 .
^ Генау Х.М., Хубер Дж., Баскьери Ф., Акуцу М., Дётч В., Фархан Х., Рогов В., Берендс С. (2015). «Убиквитинлигаза CUL3-KBTBD6/KBTBD7 взаимодействует с белками GABARAP, пространственно ограничивая передачу сигналов TIAM1-RAC1» . Мол Клетка . 57 (6): 995–1010. дои : 10.1016/j.molcel.2014.12.040 . ПМИД 25684205 .
^ Уайлд П., Фархан Х., Макьюэн Д.Г., Вагнер С., Рогов В.В., Брейди Н.Р., Рихтер Б., Корач Дж., Вайдманн О., Чоудхари С., Дётч В., Буманн Д., Дикич И. (2011). «Фосфорилирование рецептора аутофагии оптиневрина ограничивает рост сальмонеллы» . Наука . 333 (6039): 228–33. Бибкод : 2011Sci...333..228W . дои : 10.1126/science.1205405 . ПМЦ 3714538 . ПМИД 21617041 .
^ Фискин Э., Бионда Т., Дикич И., Берендс С. (2016). «Глобальный анализ убиквитинома хозяина и бактерий в ответ на инфекцию Salmonella Typhimurium» . Мол Клетка . 62 (6): 967–981. doi : 10.1016/j.molcel.2016.04.015 . ПМИД 27211868 .
^ Бхогараджу С., Калайил С., Лю Й., Бонн Ф., Колби Т., Матич И., Дикич И. (2016). «Фосфорибозилирование убиквитина способствует убиквитинированию серина и ухудшает обычное убиквитинирование» . Клетка . 167 (6): 1636–1649.e13. дои : 10.1016/j.cell.2016.11.019 . ПМИД 27912065 .
^ Калайил С., Бхогараджу С., Бонн Ф., Шин Д., Лю Ю., Ган Н., Басквин Дж., Грумати П., Луо ЗК, Дикич И. (2018). «Понимание катализа и функции убиквитинирования серина, связанного фосфорибозилом» . Природа 557 (7707): 734–738. Бибкод : 2018Nature.557..734K дои : 10.1038/ s41586-018-0145-8 ПМЦ 5980784 . ПМИД 29795347 .
^ Бхогараджу С., Бонн Ф., Мукерджи Р., Адамс М., Пфлайдерер М.М., Галей В.П., Маткович В., Лопес-Москеда Дж., Калайил С., Шин Д., Дикич И. (2019). «Ингибирование бактериальных убиквитинлигаз глутамилированием, катализируемым SidJ-кальмодулином» . Природа . 572 (7769): 382–386. Бибкод : 2019Natur.572..382B . дои : 10.1038/s41586-019-1440-8 . ПМК 6715450 . ПМИД 31330532 .
^ Хаминец А, Генрих Т, Мари М, Грумати П, Хюбнер А.К., Акуцу М, Либманн Л, Штольц А, Ницше С, Кох Н, Маут М, Катона И, Квалманн Б, Вейс Дж, Реджиори Ф, Курт И, Хюбнер К.А. , Дикич I (2015). «Регуляция оборота эндоплазматической сети путем селективной аутофагии». Природа . 522 (7556): 354–8. Бибкод : 2015Natur.522..354K . дои : 10.1038/nature14498 . ПМИД 26040720 . S2CID 4449106 .
^ Бхаскара Р.М., Грумати П., Гарсия-Пардо Дж., Калайил С., Коваррубиас-Пинто А., Чен В., Кудряшев М., Дикич И., Хаммер Г. (2019). «Индукция кривизны и ремоделирование мембраны с помощью домена гомологии ретикулона FAM134B способствует селективной ER-фагии» . Нат Коммун . 10 (1): 2370. Бибкод : 2019NatCo..10.2370B . дои : 10.1038/s41467-019-10345-3 . ПМК 6542808 . ПМИД 31147549 .
^ Хусняк К., Эльзассер С., Чжан Н.С., Чен Х., Рэндлс Л., Ши Ю., Хофманн К., Уолтерс К.Дж., Финли Д., Дикич И. (2008). «Протеасомная субъединица Rpn13 представляет собой новый рецептор убиквитина» . Природа . 453 (7194): 481–488. Бибкод : 2008Natur.453..481H . дои : 10.1038/nature06926 . ПМЦ 2839886 . ПМИД 18497817 .
^ Рахиги С., Икеда Ф., Кавасаки М., Акуцу М., Сузуки Н., Като Р., Кенше Т., Уэджима Т., Блур С., Коммандер Д., Рандоу Ф., Вакацуки С., Дикич И. (2009). «Специфическое распознавание линейных цепей убиквитина с помощью NEMO важно для активации NF-κB» . Ячейка 136 (6): 1098–1109. дои : 10.1016/j.cell.2009.03.007 . ПМИД 19303852 . S2CID 3683855 .
^ Икеда Ф, Дерибе Ю.Л., Сконеланд С.С., Штиглиц Б., Граббе С., Франц-Вахтель М., ван Вейк С.Дж., Госвами П., Надь В., Терзич Дж., Токунага Ф., Андроулидаки А., Накагава Т., Паспаракис М., Иваи К., Сундберг Дж.П. , Шефер Л , Риттингер К , Мачек Б , Дикич И (2011). «SHARPIN образует линейный комплекс убиквитинлигазы, регулирующий активность NF-каппа B и апоптоз» . Природа 471 (7340): 637–641. Бибкод : 2011Nature.471..637I . дои : 10.1038/nature09814 . ПМК 3085511 . ПМИД 21455181 .
^ фон Дельбрюк М, Книсс А, Рогов ВВ, Плюска Л, Багола К, Лёр Ф, Гюнтерт П, Зоммер Т, Дётч В (2016). «Домен CUE Cue1 выравнивает растущие цепи убиквитина с Ubc7 для быстрого удлинения» . Мол Клетка . 62 (6): 918–928. doi : 10.1016/j.molcel.2016.04.031 . ПМИД 27264873 .
^ ван Вейк С.Дж., Фрике Ф., Херхаус Л., Гупта Дж., Хётте К., Пампалони Ф., Грумати П., Каулич М., Соу Ю.С., Комацу М., Гретен Ф.Р., Фульда С., Хайлеманн М., Дикич И. (2017). «Линейное убиквитинирование цитозольной Salmonella Typhimurium активирует NF-κB и ограничивает пролиферацию бактерий». Нат Микробиол . 2 (7):17066.doi : 10.1038 /nmicrobiol.2017.66 . ПМИД 28481361 . S2CID 1329736 .
^ Книсс А, Шуец Д, Каземи С, Плюска Л, Шпиндлер П.Е., Рогов В.В., Хусняк К., Дикич И., Гюнтерт П., Зоммер Т., Приснер Т.Ф., Дётч В. (2018). «Процессы сборки и разборки цепей по-разному влияют на конформационное пространство цепей убиквитина» . Структура . 26 (2): 249–258.е4. дои : 10.1016/j.str.2017.12.011 . ПМИД 29358025 .
^ Дойч ГБ, Зелонка Э.М., Кутандин Д., Вебер Т.А., Шефер Б., Ханневальд Дж., Лух Л.М., Дерст Ф.Г., Ибрагим М., Хоффманн Дж., Низен Ф.Х., Сентюрк А., Кункель Х., Брутши Б., Шляйфф Е., Кнапп С., Акер- Палмер А., Грез М., МакКеон Ф., Дётч В. (2011). «Повреждение ДНК в ооцитах вызывает переключение фактора контроля качества TAp63a с димера на тетрамер» . Клетка . 144 (4): 566–576. дои : 10.1016/j.cell.2011.01.013 . ПМК 3087504 . ПМИД 21335238 .
^ Кутанден Д., Остербург С., Шривастав Р.К., Сумик М., Керлёссер С., Гебель Дж., Туппи М., Ханневальд Дж., Шафер Б., Салах Е., Матеа С., Мюллер-Куллер У., Даутч Дж., Грез М., Кнапп С., Дётч В. ( 2016). «Контроль качества ооцитов с помощью р63 основан на подпружиненном механизме активации на молекулярном и клеточном уровне» . электронная жизнь . 5 : е13909. doi : 10.7554/eLife.13909 . ПМЦ 4876613 . ПМИД 27021569 .
^ Туппи М, Керлёссер С, Кутанден Д.В., Росси В., Лух Л.М., Штрубель А., Хётте К., Хоффмайстер М., Шефер Б., Де Оливейра Т., Гретен Ф., Стельцер Э.Х., Кнапп С., Де Феличи М., Берендс С., Клингер Ф.Г., Дётч В. (2018). «Контроль качества повреждения ДНК ооцитов требует последовательного взаимодействия CHK2 и CK1 для активации p63». Nat Struct Мол Биол . 25 (3): 261–269. дои : 10.1038/s41594-018-0035-7 . ПМИД 29483652 . S2CID 3685994 .
^ Руссо С., Остербург С., Сирико А., Антонини Д., Амбросио Р., Вюрц Дж.М., Ринненталь Дж., Ферниани М., Керлёссер С., Шефер Б., Гюнтерт П., Синха С., Дётч В., Миссеро (2018). «Агрегация белка фактора транскрипции p63 лежит в основе тяжелой хрупкости кожи при синдроме AEC» . Proc Natl Acad Sci США . 115 (5): Е906–Е915. Бибкод : 2018PNAS..115E.906R . дои : 10.1073/pnas.1713773115 . ПМЦ 5798343 . ПМИД 29339502 .
^ Бенедикт А., Балтрушат С., Шольц Б., Бурсен А., Арри Т.Н., Мейер Б., Вараньоло Л., Мюллер А.М., Карас М., Дингерманн Т., Маршалек Р. (2011). «Лейкемогенный слитый белок AF4-MLL вызывает активацию киназы P-TEFb и изменение эпигенетических признаков» . Лейкемия . 25 (1): 135–44. дои : 10.1038/leu.2010.249 . ПМИД 21030982 .
^ Шмидт Н., Ковальд Л., Вейк С., Фульда С. (2019). «Дифференциальное участие передачи сигналов TAK1, RIPK1 и NF-kappaB в гибели клеток, индуцированной миметиком Smac, в клетках рака молочной железы». Биол хим . 400 (2): 171–180. дои : 10.1515/hsz-2018-0324 . ПМИД 30391931 . S2CID 53241442 .
^ Белц К., Шенебергер Х., Венер С., Вейгерт А., Бониг Х., Клингебиль Т., Фихтнер И., Фульда С. (2014). «Миметик Smac и глюкокортикоиды действуют совместно, вызывая апоптоз при ОЛЛ у детей, способствуя сборке рипоптосом» . Кровь . 124 (2): 240–50. doi : 10.1182/blood-2013-05-500918 . ПМИД 24855207 .
^ Мюллер С; Эклу С; Эроусмит CH; Баузер М; Барыза Ж.Л.; Блэгг Дж; Бетчер Дж; Боунтра С; Браун Пи Джей; Баннаж МЕНЯ; Картер Эй Джей; Дамерелл Д; Дётч В; Дрюри Д.Х.; Эдвардс AM; Эдвардс Дж; Элкинс Дж.М.; Фишер С; Фрай С.В.; Голлнер А; Гримшоу CE; Эйзерман А; Ханке Т; Хартунг IV; Хичкок С; Хау Т; Хьюз ТВ; Лауфер С; Ли ВМЖ; Лирас С; Марсден Б.Д.; Мацуи Х; Матиас Дж; О'Хаган RC; Оуэн Д.Р.; Панде V; Раух Д; Розенберг С.Х.; Рот Б.Л .; Шнайдер Н.С.; Схолтен С; Сингх Сайкатенду К.; Симеонов А; Такидзава М; Це С; Томпсон PR; Трайбер Д.К.; Виана АЙИ; Уэллс К.И.; Уилсон ТМ; Цурхер В.Дж.; Кнапп С; Мюллер-Фарнов А (2018). «Пожертвованные химические зонды для открытой науки» . электронная жизнь . 7 : е34311. дои : 10.7554/eLife.34311 . ПМК 5910019 . ПМИД 29676732 .
^ Ву Ц, Хайденрайх Д., Чжоу С., Аклу С., Кремер А., Накка К., Лима-Фернандес Е., Деблуа Г., Дуан С., Велланки Р.Н., Ли Ф., Ведади М., Дилворт Дж., Лупиен М., Бреннан П.Е., Эрроусмит CH, Мюллер С., Федоров О., Филиппакопулос П., Кнапп С. (2019). «Химический набор инструментов для изучения бромодоменов и эпигенетической передачи сигналов» . Нат Коммун 10 ): 1915. Бибкод : 2019NatCo..10.1915W. (10: 1915 дои : 10.1038/ s41467-019-09672-2 ПМЦ 6478789 . ПМИД 31015424 .
^ Савамипхак С., Зайдель С., Эссманн К.Л., Уилкинсон Г.А., Питулеску М.Е., Акер Т., Акер-Палмер А. (2010). «Эфрин-B2 регулирует функцию VEGFR2 в процессе развития и опухолевого ангиогенеза». Природа . 465 (7297): 487–91. Бибкод : 2010Natur.465..487S . дои : 10.1038/nature08995 . ПМИД 20445540 . S2CID 4423684 .
^ Эссманн К.Л., Мартинес Э., Гейгер Дж.К., Циммер М., Траут М.Х., Штейн В., Кляйн Р., Акер-Палмер А. (2008). «Сериновое фосфорилирование эфрина B2 регулирует перемещение синаптических рецепторов AMPA». Нат Нейроски . 11 (9): 1035–1043. дои : 10.1038/nn.2171 . ПМИД 19160501 . S2CID 698572 .
^ Стефер С., Райц С., Ван Ф., Вильд К., Панг Й.Ю., Шварц Д., Бомке Дж., Хайн С., Лёр Ф., Бернхард Ф., Деник В., Дётч В., Синнинг И. (2011). «Структурная основа биогенеза мембранных белков, закрепленных на хвосте, с помощью комплекса Get3-рецептор» . Наука . 333 (6043): 758–62. Бибкод : 2011Sci...333..758S . дои : 10.1126/science.1207125 . ПМК 3601824 . ПМИД 21719644 .
^ Черепанов А.В., Глаубиц С., Швальбе Х (2010). «Исследование с высоким разрешением равномерно меченной 13C,15N РНК методом твердотельной ЯМР-спектроскопии». Angewandte Chemie, международное издание . 49 (28): 4747–50. дои : 10.1002/anie.200906885 . ПМИД 20533472 .
^ Шнидерс Р., Вольтер А.С., Рихтер С., Вёнерт Дж., Швальбе Х., Фюртиг Б. (2019). «Новые (13) эксперименты ЯМР с обнаружением C для точного определения структуры РНК» . Angewandte Chemie, международное издание . 58 (27): 9140–9144. дои : 10.1002/anie.201904057 . ПМК 6617721 . ПМИД 31131949 .
^ Бак Дж., Фюртиг Б., Ноеске Дж., Вёнерт Дж., Швальбе Х. (2007). «Методы ЯМР с временным разрешением, разрешающие сворачивание РНК, индуцированное лигандом, с атомным разрешением» . Proc Natl Acad Sci США . 104 (40): 15699–704. Бибкод : 2007PNAS..10415699B . дои : 10.1073/pnas.0703182104 . ПМК 2000436 . ПМИД 17895388 .
^ Крстич И., Фролов О., Сезер Д., Эндевард Б., Вейганд Дж.Э., Зюсс Б., Энгельс Дж.В., Приснер Т.Ф. (2010). «PELDOR-спектроскопия выявляет предварительную организацию третичной структуры рибопереключателя, реагирующего на неомицин». J Am Chem Soc . 132 (5): 1454–5. дои : 10.1021/ja9077914 . ПМИД 20078041 .
^ Шиман О., Питон Н., Плакмейер Дж., Боде Б.Е., Приснер Т.Ф., Энгельс Дж.В. (2007). «Спиновое мечение олигонуклеотидов нитроксидом ТРА и использование PELDOR, метода импульсной ЭПР, для измерения внутримолекулярных расстояний». Нат Проток . 2 (4): 904–23. дои : 10.1038/нпрот.2007.97 . ПМИД 17446891 . S2CID 6442268 .
^ Вайнрих Т., Яуманн Э.А., Шеффер У., Приснер Т.Ф., Гёбель М.В. (2018). «Цитидинфосфорамидит с защищенной нитроксидной спиновой меткой: синтез полноразмерной РНК TAR и исследование с помощью линейного зондирования и ЭПР-спектроскопии». Химия: Европейский журнал . 24 (23): 6202–6207. дои : 10.1002/chem.201800167 . ПМИД 29485736 .
^ Фёрстер У, Грюневальд С, Энгельс ЙВ, Вахтвейтль Й (2010). «Сверхбыстрая динамика 1-этинилпирен-модифицированной РНК: фотофизический зонд интеркаляции». J Phys Chem B. 114 (35): 11638–45. дои : 10.1021/jp103176q . ПМИД 20707369 .
^ Густманн Х, Сеглер А.Дж., Гофан Д.Б., Ройсс А.Дж., Грюневальд С., Браун М., Вейганд Дж.Е., Сигурдссон С.Т., Вахтвейтль Дж. (2019). «Структурно-ориентированная флуоресцентная маркировка раскрывает двухэтапный механизм связывания неомицина с его РНК-аптамером» . Нуклеиновые кислоты Рез . 47 (1): 15–28. дои : 10.1093/nar/gky1110 . ПМК 6326822 . ПМИД 30462266 .
^ Рейнинг А, Нозинович С, Шлепков К, Бур Ф, Фюртиг Б, Швальбе Х (2013). «Трехуровневый механизм связывает лиганд и измерение температуры в рибопереключателях». Природа . 499 (7458): 355–9. Бибкод : 2013Natur.499..355R . дои : 10.1038/Nature12378 . ПМИД 23842498 . S2CID 4414719 .
^ Фернер Дж., Сухартоно М., Брейтунг С., Йонкер Х.Р., Хенниг М., Вёнерт Дж., Гобель М., Швальбе Х. (2009). «Структуры комплексов РНК-лиганд TAR ВИЧ обнаруживают более высокую стехиометрию связывания». ХимБиоХим . 10 (9): 1490–1494. дои : 10.1002/cbic.200900220 . ПМИД 19444830 . S2CID 44300779 .
^ Моргнер Н., Барт Х.Д., Брутши Б., Шеффер У., Брейтунг С., Гобель М. (2008). «Сайты связывания элемента вирусной РНК TAR и мутантов TAR для различных пептидных лигандов, исследованные с помощью LILBID: новая лазерная масс-спектрометрия» . J Am Soc Масс-спектр . 19 (11): 1600–1611. дои : 10.1016/j.jasms.2008.07.001 . ПМИД 18693035 .
^ Манохаран В., Фюртиг Б., Яшке А., Швальбе Х. (2009). «Индуцированное металлом сворачивание рибозимов диель-альдеразы, изученное с помощью статической ЯМР-спектроскопии с временным разрешением». J Am Chem Soc . 131 (17): 6261–6270. дои : 10.1021/ja900244x . ПМИД 19354210 .
^ Кортманн Дж, Шодрок С, Ринненталь Дж, Швальбе Х, Нарберхаус Ф (2011). «Перевод по требованию простым термосенсором на основе РНК» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (7): 2855–2868. дои : 10.1093/нар/gkq1252 . ПМК 3074152 . ПМИД 21131278 .
^ Дюхардт-Фернер Э., Вейганд Дж.Э., Оленшлагер О., Штнидтке С.Р., Зюсс Б., Вёнерт Дж. (2010). «Высокомодульная структура и связывание лигандов путем конформационного захвата в минималистическом рибопереключателе». Angewandte Chemie, международное издание . 49 (35): 6216–6219. дои : 10.1002/anie.201001339 . ПМИД 20632338 .
^ Штайнерт Х, Сохор Ф, Вакер А, Бак Дж, Хелмлинг С, Хиллер Ф, Кейхани С, Ноэске Дж, Гримм СК, Рудольф ММ, Келлер Х, Муни Р.А., Ландик Р, Зюсс Б, Фюртиг Б, Вёнерт Дж, Швальбе Х (2017). «Пауза направляет сворачивание РНК для заполнения временно стабильных структур РНК для регуляции транскрипции на основе рибопереключателя» . электронная жизнь . 6 : е21297. doi : 10.7554/eLife.21297 . ПМЦ 5459577 . ПМИД 28541183 .
^ Нейер С., Кунц М., Гейсс С., Ханче М., Ходирнау В.В., Зейберт А., Энгель С., Шеффер М.П., Крамер П., Франгакис А.С. (2016). «Структура РНК-полимеразы I, транскрибирующей гены рибосомальной ДНК». Природа . 540 (7634): 607–610. Бибкод : 2016Natur.540..607N . дои : 10.1038/nature20561 . ПМИД 27842382 . S2CID 205252425 .
^ Мейер Б., Вурм Дж.П., Коттер П., Лейзеганг М.С., Шиллинг В., Буххаупт М., Хелд М., Бахр У., Карас М., Хекель А., Бонсак М.Т., Вёнерт Дж., Энтиан К.Д. (2011). «Белок Nep1 синдрома Боуэна-Конради (Emg1) играет двойную роль в биогенезе эукариотических рибосом: в качестве важного фактора сборки и в метилировании Psi 1191 в 18S рРНК дрожжей» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (4): 1526–37. дои : 10.1093/нар/gkq931 . ПМК 3045603 . ПМИД 20972225 .
^ Вурм Дж.П., Мейер Б., Бахр У., Хелд М., Фролов О., Коттер П., Энгельс Дж.В., Хекель А., Карас М., Энтиан К.Д., Вёнерт Дж. (2010). «Фактор сборки рибосомы Nep1, ответственный за синдром Боуэна-Конради, представляет собой псевдоуридин-N1-специфическую метилтрансферазу» . Нуклеиновые кислоты Рез . 38 (7): 2387–98. дои : 10.1093/nar/gkp1189 . ПМЦ 2853112 . ПМИД 20047967 .
^ Бонсак М.Т., Мартин Р., Граннеман С., Рупрехт М., Шляйфф Э., Толлерви Д. (2009). «Prp43, связанный с разными сайтами пре-рРНК, выполняет разные функции в синтезе рибосом» . Мол Клетка . 36 (4): 583–92. doi : 10.1016/j.molcel.2009.09.039 . ПМК 2806949 . ПМИД 19941819 .
^ Палм Д., Стрейт Д., Шанмугам Т., Вейс Б.Л., Рупрехт М., Симм С., Шляйфф Э. (2019). «Растительно-специфические факторы биогенеза рибосом у Arabidopsis thaliana, обладающие важной функцией в процессинге рРНК» . Нуклеиновые кислоты Рез . 47 (4): 1880–1895. дои : 10.1093/nar/gky1261 . ПМК 6393314 . ПМИД 30576513 .
^ Вайс Б.Л., Миссбах С., Марци Дж., Бонсак М.Т., Шляйфф Э. (2014). «Фактор биогенеза рибосом LSG1-2, ассоциированный с 60S, необходим для созревания 40S у Arabidopsis thaliana » . Плант Дж . 80 (6): 1043–56. дои : 10.1111/tpj.12703 . ПМИД 25319368 .
^ Эндесфельдер У, Финан К, Холден С.Дж., Кук П.Р., Капанидис А.Н., Хайлеманн М. (2013). «Многомасштабная пространственная организация РНК-полимеразы в Escherichia coli» . Биофиз Дж . 105 (1): 172–181. Бибкод : 2013BpJ...105..172E . дои : 10.1016/j.bpj.2013.05.048 . ПМЦ 3699759 . ПМИД 23823236 .
^ Стеллос К, Гациу А, Стамателопулос К, Перишич Матич Л, Джон Д, Лунелла ФФ, Джэ Н, Россбах О, Амрайн К, Сигала Ф, Бун Р.А., Фуртиг Б, Манавски Ю, Ю Х, Учида С, Келлер Т, Бёкель ЙН, Франко-Сереседа А, Мегдефессель Л, Чен В, Швальбе Х, Биндерейф А, Эрикссон П, Хедин У, Зейхер А.М., Диммелер С. (2016). «Редактирование РНК аденозин-инозин контролирует экспрессию катепсина S при атеросклерозе, обеспечивая HuR-опосредованную посттранскрипционную регуляцию». НатМед . 22 (10): 1140–1150. дои : 10.1038/nm.4172 . ПМИД 27595325 . S2CID 3397638 .
^ Мюллер-МакНиколл М., Ботти В., Домингес А.М., Брандл Х., Швич О.Д., Штайнер М.С., Курк Т., Позер I, Зарнак К., Нойгебауэр К.М. (2016). «Белки SR представляют собой адаптеры NXF1, которые связывают альтернативный процессинг РНК с экспортом мРНК» . Генс Дев . 30 (5): 553–66. дои : 10.1101/gad.276477.115 . ПМЦ 4782049 . ПМИД 26944680 .
^ Браун С., Энкулеску М., Сетти С.Т., Кортес-Лопес М., де Алмейда Б.П., Сутанди Ф.С., Шульц Л., Буш А., Зайлер М., Эберсбергер С., Барбоза-Морайс Н.Л., Легеви С., Кениг Дж., Зарнак К. (2018). «Расшифровка решения о сплайсинге, связанном с раком, в протоонкогене RON с использованием высокопроизводительного мутагенеза» . Нат Коммун . 9 (1): 3315. Бибкод : 2018NatCo...9.3315B . дои : 10.1038/s41467-018-05748-7 . ПМК 6098099 . ПМИД 30120239 .
^ Самбандан С., Акбалик Г., Кохен Л., Ринне Дж., Кальстат Дж., Глок С., Тушев Г., Альварес-Кастелао Б., Хекель А., Шуман Э.М. (2017). «Зависимое от активности пространственно локализованное созревание микроРНК в дендритах нейронов». Наука . 355 (6325): 634–637. Бибкод : 2017Sci...355..634S . doi : 10.1126/science.aaf8995 . ПМИД 28183980 . S2CID 17159252 .
^ Бун Р.А., Хофманн П., Михалик К.М., Лозано-Видал Н., Бергхаузер Д., Фишер А., Кнау А., Джае Н., Шурманн С., Диммелер С. (2016). «Длинная некодирующая РНК Meg3 контролирует старение эндотелиальных клеток и влияет на функции регенеративного ангиогенеза» . Дж Ам Колл Кардиол . 68 (23): 2589–2591. дои : 10.1016/j.jacc.2016.09.949 . ПМИД 27931619 .
^ Михалик К.М., Ю Х, Манавски Ю., Доддабаллапур А., Цорниг М., Браун Т., Джон Д., Пономарева Ю., Чен В., Учида С., Бун Р.А., Диммелер С. (2014). «Длинная некодирующая РНК MALAT1 регулирует функцию эндотелиальных клеток и рост сосудов» . Цир Рес . 114 (9): 1389–1397. дои : 10.1161/circresaha.114.303265 . ПМИД 24602777 .
^ Кремер С., Михалик К.М., Фишер А., Пфистерер Л., Хаэ Н., Винтер С., Бун Р.А., Мухли-Рейнхольц М., Джон Д., Учида С., Вебер С., Поллер В., Гюнтер С., Браун Т., Ли Д.И., Мегдефессель Л., Матич Перишич Л., Хедин У., Зенляйн О., Зейхер А., Диммелер С. (2019). «Гематопоэтический дефицит длинной некодирующей РНК MALAT1 способствует атеросклерозу и воспалению бляшек» . Тираж . 139 (10): 1320–1334. дои : 10.1161/circulationaha.117.029015 . ПМИД 30586743 . S2CID 58561771 .
^ Нагель Г., Селлас Т., Хун В., Катерия С., Адеишвили Н., Бертольд П., Оллиг Д., Хегеманн П., Бамберг Э. (2003). «Канал родопсин-2, катион-селективный мембранный канал с прямым светом» . Proc Natl Acad Sci США . 100 (24): 13940–5. Бибкод : 2003PNAS..10013940N . дои : 10.1073/pnas.1936192100 . ПМЦ 283525 . ПМИД 14615590 .
^ Бойден Э.С., Чжан Ф., Бамберг Э., Нагель Г., Дейссерот К. (2005). «Генетически целенаправленный оптический контроль нейронной активности в миллисекундном масштабе». Нат Нейроски . 8 (9): 1263–1268. дои : 10.1038/nn1525 . ПМИД 16116447 . S2CID 6809511 .
^ Фельдбауэр К., Циммерманн Д., Пинчовиус В., Шпиц Дж., Баманн С., Бамберг Э. (2009). «Каналродопсин-2 — это протонный насос с утечкой» . Proc Natl Acad Sci США . 106 (30): 12317–12322. Бибкод : 2009PNAS..10612317F . дои : 10.1073/pnas.0905852106 . ПМК 2718366 . ПМИД 19590013 .
^ Лоренц-Фонфриа В.А., Реслер Т., Краузе Н., Нак М., Госсинг М., Фишер фон Моллард Г., Баманн С., Бамберг Е., Шлезингер Р., Хеберле Дж. (2013). «Транзиторные изменения протонирования в канальном родопсине-2 и их значение для открытия каналов» . Proc Natl Acad Sci США . 110 (14): E1273-81. Бибкод : 2013PNAS..110E1273L . дои : 10.1073/pnas.1219502110 . ПМЦ 3619329 . ПМИД 23509282 .
^ Нойманн-Верхуфен М.К., Нойманн К., Баманн С., Раду И., Хеберле Дж., Бамберг Э., Вахтвейтль Дж. (2013). «Сверхбыстрая инфракрасная спектроскопия канального родопсина-2 обнаруживает эффективную передачу энергии от хромофора сетчатки к белку». J Am Chem Soc . 135 (18): 6968–6976. дои : 10.1021/Ja400554y . ПМИД 23537405 .
^ Кляйнлогель С., Терпиц У., Легрум Б., Гокбугет Д., Бойден Э.С., Баманн С., Вуд П.Г., Бамберг Е. (2011). «Стратегия слияния генов для стехиометрической и колокализованной экспрессии светозависимых мембранных белков». Нат-методы . 8 (12): 1083–1088. дои : 10.1038/nmeth.1766 . ПМИД 22056675 . S2CID 11567708 .
^ Чжан Ф., Ван Л.П., Браунер М., Ливальд Дж.Ф., Кей К., Вацке Н., Вуд П.Г., Бамберг Э., Нагель Г., Готшалк А., Дейссерот К. (2007). «Мультимодальный быстрый оптический опрос нейронных цепей». Природа . 446 (7136): 633–9. Бибкод : 2007Natur.446..633Z . дои : 10.1038/nature05744 . ПМИД 17410168 . S2CID 4415339 .
^ Орант А, Шультейс С, Толстенков О, Эрбгут К, Нагпал Дж, Хайн Д, Браунер М, Вабниг С, Стойер Коста В, МакВиртер РД, Зелс С, Палумбос С, Миллер III DM, Битс I, Готшалк А (2018). «Ощущение еды модулирует локомоцию посредством передачи сигналов дофамина и нейропептидов в распределенной нейронной сети» . Нейрон . 100 (6): 1414–1428. дои : 10.1016/j.neuron.2018.10.024 . ПМИД 30392795 .
^ Стирман Дж. Н., Крейн М. М., Хассон С. Дж., Вабниг С., Шультейс С., Готшалк А., Лу Х (2011). «Мультимодальный оптический контроль в реальном времени нейронов и мышц свободно ведущих себя Caenorhabditis elegans» . Нат-методы . 8 (2): 153–8. дои : 10.1038/nmeth.1555 . ПМК 3189501 . ПМИД 21240278 .
^ Ливальд Дж. Ф., Браунер М., Стивенс Г. Дж., Бухур М., Шультайс С., Жен М., Готшалк А. (2008). «Оптогенетический анализ синаптической функции». Нат-методы . 5 (10): 895–902. дои : 10.1038/nmeth.1252 . ПМИД 18794862 . S2CID 17102550 .
^ Киттельманн М, Ливальд Дж. Ф., Хегерманн Дж., Шультайс К., Браунер М., Стойер Коста В., Вабниг С., Элмер С., Готшалк А. (2013). «Восстановление синапсов in vivo после оптогенетической гиперстимуляции» . Proc Natl Acad Sci США . 110 (32): Е3007-16. Бибкод : 2013PNAS..110E3007K . дои : 10.1073/pnas.1305679110 . ПМЦ 3740886 . ПМИД 23878262 .
^ Азими Хашеми Н, Бергс АС, Шулер С, Шейве АР, Стойер Коста В, Бах М, Ливальд Й.Ф., Готшалк А (2019). «Инструменты визуализации напряжения на основе родопсина для использования в мышцах и нейронах Caenorhabditis elegans» . Proc Natl Acad Sci США . 116 (34): 17051–17060. Бибкод : 2019PNAS..11617051A . дои : 10.1073/pnas.1902443116 . ПМК 6708366 . ПМИД 31371514 .
^ Азими Хашеми Н., Эрбгут К., Фогт А., Рименспергер Т., Раух Э., Вудманси Д., Нагпал Дж., Браунер М., Шевес М., Фиала А., Каттнер Л., Траунер Д., Хегеманн П., Готшальк А., Ливальд Дж. Ф. (2014). «Синтетические аналоги сетчатки изменяют спектральные и кинетические характеристики микробных оптогенетических инструментов родопсина» . Нат Коммун . 5 : 5810. Бибкод : 2014NatCo...5.5810A . дои : 10.1038/Ncomms6810 . ПМИД 25503804 .
^ Гао С.К., Нагпал Дж., Шнайдер М.В., Козьяк-Павлович В., Нагель Г., Готшалк А. (2015). «Оптогенетическое манипулирование цГМФ в клетках и животных с помощью жестко регулируемого светом гуанилилциклазного опсина CyclOp» . Нат Коммун . 6 : 8046. Бибкод : 2015NatCo...6.8046G . дои : 10.1038/ncomms9046 . ПМЦ 4569695 . ПМИД 26345128 .
^ Верхуфен М.К., Баманн С., Блёхер Р., Фёрстер У., Бамберг Э., Вахтвейтль Дж. (2010). «Фотоцикл каналородопсина-2: динамика сверхбыстрой реакции и последующие этапы реакции». ХимияФизХим . 11 (14): 3113–22. дои : 10.1002/cphc.201000181 . ПМИД 20730849 .
^ Volkov O, Kovalev K, Polovinkin V, Borshchevskiy V, Bamann C, Astashkin R, Marin E, Popov A, Balandin T, Willbold D, Buldt G, Bamberg E, Gordeliy V (2017). "Structural insights into ion conduction by channelrhodopsin 2" . Science . 358 (6366): eaan8862. doi : 10.1126/science.aan8862 . PMID 29170206 .
^ Кляйнлогель С., Фельдбауэр К., Демпски Р.Э., Фотис Х., Вуд П.Г., Баманн С., Бамберг Э. (2011). «Сверхсветочувствительная и быстрая активация нейронов с помощью Ca(2+)-проницаемого канала родопсина CatCh» (PDF) . Нат Нейроски . 14 (4): 513–8. дои : 10.1038/nn.2776 . ПМИД 21399632 . S2CID 5907240 .
^ Беккер-Бальдус Дж., Баманн С., Саксена К., Густманн Х., Браун Л.Дж., Браун Р.К., Райтер С., Бамберг Е., Вахтвейтль Дж., Швальбе Х., Глаубиц К. (2015). «Просветление фотоактивного сайта каналородопсина-2 с помощью твердотельной ЯМР-спектроскопии с усилением ДНП» . Proc Natl Acad Sci США . 112 (32): 9896–901. Бибкод : 2015PNAS..112.9896B . дои : 10.1073/pnas.1507713112 . ПМЦ 4538646 . ПМИД 26216996 .
^ Баманн С., Бамберг Э., Вахтвейтль Дж., Глаубиц С. (2014). «Протеородопсин» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — Биоэнергетика . 1837 (5): 614–25. дои : 10.1016/j.bbabio.2013.09.010 . ПМИД 24060527 .
^ Мао Дж. Ф., До Н. Н., Шольц Ф., Реджи Л., Мелер М., Лакатос А., Онг Ю. С., Ульрих С. Дж., Браун Л. Дж., Браун Р. К., Беккер-Бальдус Дж., Вахтвейтль Дж., Глаубиц С. (2014). «Структурная основа переключения зелено-синего цвета в протеородопсине, определенная методом ЯМР-спектроскопии». J Am Chem Soc . 136 (50): 17578–17590. дои : 10.1021/ja5097946 . ПМИД 25415762 .
^ Мачейко Дж., Мелер М., Каур Дж., Либлейн Т., Моргнер Н., Уари О., Тордо П., Беккер-Бальдус Дж., Глаубиц С. (2015). «Визуализация специфических межпротомерных взаимодействий в гомоолигомерном мембранном белке протеородопсине с помощью твердотельного ЯМР с усилением динамической ядерной поляризации». J Am Chem Soc . 137 (28): 9032–9043. дои : 10.1021/jacs.5b03606 . ПМИД 26102160 .
^ Мачейко Дж., Каур Дж., Беккер-Бальдус Дж., Глаубиц С. (2019). «Фотоциклозависимые конформационные изменения в кросс-протомерной триаде протеородопсина Asp-His-Trp, выявленные с помощью MAS-ЯМР с усилением DNP» . Proc Natl Acad Sci США . 116 (17): 8342–8349. Бибкод : 2019PNAS..116.8342M . дои : 10.1073/pnas.1817665116 . ПМК 6486740 . ПМИД 30948633 .
^ Хемпельманн Ф., Хельпер С., Верхуфен М.К., Вернер А.С., Келер Т., Фидлер С.А., Пфлегер Н., Вахтвейтль Дж., Глаубиц К. (2011). «Кластер His75-Asp97 в зеленом протеородопсине». J Am Chem Soc . 133 (12): 4645–4654. дои : 10.1021/ja111116a . ПМИД 21366243 .
^ Мелер М., Эккерт CE, Лидер А.Дж., Каур Дж., Фишер Т., Кубатова Н., Браун Л.Дж., Браун Р.К., Беккер-Бальдус Дж., Вахтвейтль Дж., Глаубиц С. (2017). «Хромофорные искажения в фотопромежуточных продуктах протеородопсина, визуализированные с помощью твердотельного ЯМР с усилением ядерной поляризации» (PDF) . J Am Chem Soc . 139 (45): 16143–16153. дои : 10.1021/jacs.7b05061 . ПМИД 29027800 .
^ Азими Хашеми Н., Эрбгут К., Фогт А., Рименспергер Т., Раух Э., Вудманси Д., Нагпал Дж., Браунер М., Шевес М., Фиала А., Каттнер Л., Траунер Д., Хегеманн П., Готшальк А., Льевальд Дж. Ф. (2014). «Синтетические аналоги сетчатки изменяют спектральные и кинетические характеристики микробных оптогенетических инструментов родопсина» . Нат Коммун . 5 : 5810. Бибкод : 2014NatCo...5.5810A . дои : 10.1038/Ncomms6810 . ПМИД 25503804 .
^ Гао С.К., Нагпал Дж., Шнайдер М.В., Козьяк-Павлович В., Нагель Г., Готшалк А. (2015). «Оптогенетическое манипулирование цГМФ в клетках и животных с помощью жестко регулируемого светом гуанилилциклазного опсина CyclOp» . Нат Коммун . 6 : 8046. Бибкод : 2015NatCo...6.8046G . дои : 10.1038/ncomms9046 . ПМЦ 4569695 . ПМИД 26345128 .
^ Хассон С.Дж., Стойер Коста В., Вабниг С., Стирман Дж.Н., Уотсон Дж.Д., Спенсер В.К., Акербум Дж., Лугер Л.Л., Трейнин М., Миллер Д.М. 3-й, Лу Х., Готшалк А. (2012). «Оптогенетический анализ ноцицепторного нейрона и сети обнаруживает ионные каналы, действующие ниже первичных сенсоров» . Курр Биол . 22 (9): 743–52. дои : 10.1016/j.cub.2012.02.066 . ПМК 3350619 . ПМИД 22483941 .
^ Орант А, Шультейс С, Толстенков О, Эрбгут К, Нагпал Дж, Хайн Д, Браунер М, Вабниг С, Стойер Коста В, МакВиртер РД, Зелс С, Палумбос С, Миллер III DM, Битс I, Готшалк А (2018). «Ощущение еды модулирует локомоцию посредством передачи сигналов дофамина и нейропептидов в распределенной нейронной сети» . Нейрон . 100 (6): 1414–1428.e10. дои : 10.1016/j.neuron.2018.10.024 . ПМИД 30392795 .
^ Стойер Коста В, Ван дер Аувера П, Глок С, Ливальд Дж. Ф., Бах М, Шулер С, Вабниг С, Орант А, Масурат Ф, Брингманн Х, Шуфс Л, Стельцер Э., Фишер СК, Готшалк А (2019). «ГАМКергический и пептидергический нейрон сна как стоп-нейрон локомоции с разделенной динамикой Ca2+» . Нат Коммун . 10 (1): 4095. Бибкод : 2019NatCo..10.4095S . дои : 10.1038/s41467-019-12098-5 . ПМК 6736843 . ПМИД 31506439 .
^ Бафф MC, Шефер Ф, Вульффен Б, Мюллер Дж, Петч Б, Хекель А, Майер Г (2010). «Зависимость активности аптамеров от противоположных концевых расширений: повышение эффективности светорегуляции» . Нуклеиновые кислоты Рез . 38 (6): 2111–8. дои : 10.1093/nar/gkp1148 . ПМЦ 2847219 . ПМИД 20007153 .
^ Джоши К.Б., Влахос А., Микат В., Деллер Т., Хекель А. (2012). «Светоактивируемые молекулярные маяки с последовательностью замкнутой петли». Хим Коммун . 48 (22): 2746–8. дои : 10.1039/c2cc16654b . ПМИД 22159276 .
^ Лотц Т.С., Халбриттер Т., Кайзер С., Рудольф М.М., Краус Л., Грохер Ф., Стейнванд С., Вахтвейтль Дж., Хекель А., Зюсс Б. (2019). «Светочувствительный РНК-аптамер производного азобензола» . Нуклеиновые кислоты Рез . 47 (4): 2029–2040. дои : 10.1093/nar/gky1225 . ПМК 6393235 . ПМИД 30517682 .
^ Рорбах Ф., Шефер Ф., Фихте М.А., Пфайффер Ф., Мюллер Дж., Петч Б., Хекель А., Майер Г. (2013). «Клетка под управлением аптамера для селективной маскировки белковых доменов». Международное издание «Прикладная химия» . 52 (45): 11912–11915. дои : 10.1002/anie.201306686 . ПМИД 24127310 .
^ Сейфрид П., Эйден Л., Гребеновский Н., Майер Г., Хекель А. (2017). «Фотопривязки для (мульти)циклического конформационного каркаса длинных олигонуклеотидов». Angewandte Chemie, международное издание . 56 (1): 359–363. дои : 10.1002/anie.201610025 . ПМИД 27897376 .
^ Кейхани С., Голдау Т., Блюмлер А., Хекель А., Швальбе Х. (2018). «Хемо-ферментативный синтез РНК, модифицированной по положению, для биофизических исследований, включая контроль света и ЯМР-спектроскопию». Angewandte Chemie, международное издание . 57 (37): 12017–12021. дои : 10.1002/anie.201807125 . ПМИД 30007102 . S2CID 51629476 .
^ Хелмлинг С., Клетцнер Д.П., Сохор Ф., Муни Р.А., Вакер А., Ландик Р., Фюртиг Б., Хекель А., Швальбе Х (2018). «Время жизни метастабильных состояний управляет регуляторной передачей сигналов в транскрипционных рибопереключателях» . Нат Коммун . 9 (1): 944. Бибкод : 2018NatCo...9..944H . дои : 10.1038/s41467-018-03375-w . ПМЦ 5838219 . ПМИД 29507289 .
^ Штайнерт Х.С., Шефер Ф., Йонкер Х.Р., Хекель А., Швальбе Х. (2014). «Влияние абсолютной конфигурации цитозина, содержащего NPE, на стабильность одной пары оснований ДНК». Angewandte Chemie, международное издание . 53 (4): 1072–1075. дои : 10.1002/anie.201307852 . ПМИД 24339185 .
^ Шефер Ф., Джоши К.Б., Фихте М.А., Мак Т., Вахтвейтль Дж., Хекель А. (2011). «Селективное по длине волны освобождение остатков dA и dC». Орг. письмо . 13 (6): 1450–3. дои : 10.1021/ol200141v . ПМИД 21341754 .
^ Фихте М.А., Вейель Х.М., Юнек С., Шефер Ф., Хербиво С., Гольднер М., Шпехт А., Вахтвейтль Дж., Хекель А. (2016). «Трехмерный контроль гибридизации ДНК путем ортогонального двухцветного двухфотонного разблокирования». Angewandte Chemie, международное издание . 55 (31): 8948–8952. дои : 10.1002/anie.201603281 . ПМИД 27294300 .
^ Беккер Ю, Унгер Э, Фихте М.А., Гацек Д.А., Дреу А., Вахтвейтль Дж., Уолла П.Дж., Хекель А. (2018). «Смещенная в красную сторону группа клеток, содержащая только два фотона, для трехмерного фотовысвобождения» . Химическая наука . 9 (10): 2797–2802. дои : 10.1039/c7sc05182d . ПМЦ 5914290 . ПМИД 29732066 .
^ Теварпадам Дж., Бесси И., Бинас О., Гонсалвес Д.П., Славов С., Йонкер Х.Р., Рихтер С., Вахтвейтль Дж., Швальбе Х., Хекель А. (2016). «Фотореактивное образование межмолекулярного минимального мотива G-квадруплекса». Angewandte Chemie, международное издание . 55 (8): 2738–2742. дои : 10.1002/anie.201510269 . ПМИД 26805928 .
^ Самбандан С., Акбалик Г., Кохен Л., Ринне Дж., Кальстат Дж., Глок С., Тушев Г., Альварес-Кастелао Б., Хекель А., Шуман Э.М. (2017). «Зависимое от активности пространственно локализованное созревание микроРНК в дендритах нейронов». Наука . 355 (6325): 634–637. Бибкод : 2017Sci...355..634S . doi : 10.1126/science.aaf8995 . ПМИД 28183980 . S2CID 17159252 .
^ Лукас Т., Шефер Ф., Мюллер П., Эмиг С., Хекель А., Диммелер С. (2017). «Светоиндуцируемая антимиР-92а как терапевтическая стратегия, способствующая восстановлению кожи у мышей с диабетом, у которых нарушено заживление» . Нат Коммун . 8 : 15162. Бибкод : 2017NatCo...815162L . дои : 10.1038/ncomms15162 . ПМЦ 5418571 . ПМИД 28462946 .
^ Акерманн Д., Шмидт Т.Л., Ханнам Дж.С., Пурохит К.С., Хекель А., Фамулок М. (2010). «Двухцепочечная ДНК ротаксан». Нат Нанотехнол . 5 (6): 436–42. Бибкод : 2010НатНа...5..436А . дои : 10.1038/nnano.2010.65 . ПМИД 20400967 .
^ Гребеновский Н., Гольдау Т., Болте М., Хекель А. (2018). «Световая регуляция димеризации миникольца ДНК с помощью азобензольных С-нуклеозидов». Химия: Европейский журнал . 24 (14): 3425–3428. дои : 10.1002/chem.201706003 . ПМИД 29418024 .
^ Шмидт Т.Л., Кеппель М.Б., Теварпадам Дж., Гонсалвес Д.П., Хекель А. (2011). «Световой триггер для нанотехнологий ДНК». Маленький . 7 (15): 2163–7. дои : 10.1002/smll.201100182 . ПМИД 21638782 .
^ Рейнинг А, Нозинович С, Шлепков К, Бур Ф, Фюртиг Б, Швальбе Х (2013). «Трехуровневый механизм связывает лиганд и измерение температуры в рибопереключателях». Природа . 499 (7458): 355–9. Бибкод : 2013Natur.499..355R . дои : 10.1038/Nature12378 . ПМИД 23842498 . S2CID 4414719 .
^ Дидерихс Т., Пью Г., Дори А., Син Ю., Бернс-младший, Хунг Нгуен К., Торнов М., Тампе Р., Ховорка С. (2019). «Синтетические белково-проводящие мембранные нанопоры, построенные из ДНК» . Нат Коммун . 10 (1): 5018. Бибкод : 2019NatCo..10.5018D . дои : 10.1038/s41467-019-12639-y . ПМК 6828756 . PMID 31685824 .
^ Грюнвальд К., Шульце К., Райхель А., Вайс В.Ю., Блаас Д., Пилер Дж., Висмюллер К.Х., Тампе Р. (2010). «Сборка макромолекулярных комплексов in situ, запускаемая светом» . Proc Natl Acad Sci США . 107 (14): 6146–6151. Бибкод : 2010PNAS..107.6146G . дои : 10.1073/pnas.0912617107 . ПМК 2852015 . ПМИД 20200313 .
^ Кляйн А., Хэнк С., Раульф А., Йост Э.Ф., Тиссен Ф., Хайлеманн М., Винеке Р., Тампе Р. (2018). «Метка эндогенных белков живыми клетками с нанометровой точностью трансдуцированными нанотелами» . Химическая наука . 9 (40): 7835–7842. дои : 10.1039/C8SC02910E . ПМК 6194584 . ПМИД 30429993 .
^ Коллманнспергер А, Шарей А, Раульф А, Хайлеманн М, Лангер Р, Йенсен КФ, Винеке Р, Тампе Р (2016). «Маркировка белков живых клеток с нанометровой точностью путем сжатия клеток» . Нат Коммун . 7 : 10372. Бибкод : 2016NatCo...710372K . дои : 10.1038/ncomms10372 . ПМК 4740111 . ПМИД 26822409 .
^ Винеке Р., Раульф А., Коллманнспергер А., Хайлеманн М., Тампе Р. (2015). «Маленькая пара меток для визуализации одиночных молекул со сверхвысоким разрешением». Angewandte Chemie, международное издание . 54 (35): 10216–9. дои : 10.1002/anie.201503215 . ПМИД 26201868 .
^ Гаттердам В., Рамадасс Р., Штесс Т., Фихте М.А., Вахтвейтль Дж., Хекель А., Тампе Р. (2014). «Трехмерные белковые сети, собранные путем двухфотонной активации». Angewandte Chemie, международное издание . 53 (22): 5680–5684. дои : 10.1002/anie.201309930 . ПМИД 24729568 .
^ Бранер М., Коллер Н., Кнауэр Дж., Хербринг В., Хэнк С., Винеке Р., Тампе Р. (2019). «Оптический контроль транслокации антигена с помощью синтетических фотоусловных вирусных ингибиторов» . Химическая наука . 10 (7): 2001–2005. дои : 10.1039/c8sc04863k . ПМК 6385481 . ПМИД 30881629 .
^ Гаевски Дж., Бюэленс Ф., Сердюков С., Янсен М., Кортина Н., Грубмюллер Х., Гринингер М. (2017). «Инженерия синтаз жирных кислот для направленного производства поликетидов». Nat Chem Biol . 13 (4): 363–365. дои : 10.1038/nchembio.2314 . hdl : 11858/00-001M-0000-002C-8359-6 . ПМИД 28218912 .
^ Гаевски Дж., Павлович Р., Фишер М., Болес Э., Гринингер М. (2017). «Инженерный синтез жирных кислот de novo грибами для производства короткоцепочечных жирных кислот» . Нат Коммун . 8 : 14650. Бибкод : 2017NatCo...814650G . дои : 10.1038/ncomms14650 . ПМЦ 5353594 . ПМИД 28281527 .
^ Штаудт Х, Хёсл М.Г., Дреу А., Сердюков С., Остерхельт Д., Будиса Н., Вахтвейтль Дж., Гринингер М. (2013). «Направленное манипулирование фотоциклом флавопротеинов». Angewandte Chemie, международное издание . 52 (32): 8463–6. дои : 10.1002/anie.201302334 . ПМИД 23818044 .
^ «Метод года 2015» . Природные методы . 13 (1): 1 января 2016 г. doi : 10.1038/nmeth.3730 . ПМИД 27110621 .
^ «Нобелевская премия по химии 2017» . Проверено 9 марта 2020 г.
^ Аллегретти М., Клюш Н., Миллс DJ, Вонк Дж., Кюльбрандт В., Дэвис К.М. (2015). «Горизонтальные мембранные альфа-спирали в статорной a-субъединице АТФ-синтазы F-типа». Природа . 521 (7551): 237–40. Бибкод : 2015Natur.521..237A . дои : 10.1038/nature14185 . ПМИД 25707805 . S2CID 205242498 .
^ Ельцов М., Дубе Н., Ю З., Пасакарнис Л., Хазельманн-Вайс У., Бруннер Д., Франгакис А.С. (2015). «Количественный анализ реорганизации цитоскелета при уплотнении эпителиальной ткани методом крупнообъемной электронной томографии». Nat Cell Biol . 17 (5): 605–14. дои : 10.1038/ncb3159 . ПМИД 25893916 . S2CID 6543151 .
^ Нейер С., Кунц М., Гейсс С., Ханче М., Ходирнау В.В., Зейберт А., Энгель С., Шеффер М.П., Крамер П., Франгакис А.С. (2016). «Структура РНК-полимеразы I, транскрибирующей гены рибосомальной ДНК». Природа . 540 (7634): 607–610. Бибкод : 2016Natur.540..607N . дои : 10.1038/nature20561 . ПМИД 27842382 . S2CID 205252425 .
^ Хан А., Вонк Дж., Миллс DJ, Мейер Т., Кюльбрандт В. (2018). «Структура, механизм и регуляция АТФ-синтазы хлоропластов» . Наука . 360 (6389): 620. doi : 10.1126/science.aat4318 . ПМК 7116070 . ПМИД 29748256 .
^ Хофманн С., Джанулиен Д., Мехдипур А.Р., Томас С., Стефан Э., Брюхерт С., Кун Б.Т., Гертсма Э.Р., Хаммер Г., Тампе Р., Мёллер А. (2019). «Конформационное пространство гетеродимерного ABC-экспортера в условиях оборота» . Природа . 571 (7766): 580–583. дои : 10.1038/s41586-019-1391-0 . ПМЦ 7612745 . ПМИД 31316210 . S2CID 197543295 .
^ Фаруки А.Р., Хендерсон Р. (2007). «Электронные детекторы для электронной микроскопии». Курс. Мнение. Структура. Биол . 17 (5): 549–55. дои : 10.1016/j.sbi.2007.08.014 . ПМИД 17913494 .
^ Кюльбрандт В (2014). «Революция разрешения». Наука . 343 (6178): 1443–1444. Бибкод : 2014Sci...343.1443K . дои : 10.1126/science.1251652 . ПМИД 24675944 . S2CID 35524447 .
^ Ельцов М., Дубе Н., Ю З., Пасакарнис Л., Хазельманн-Вайс У., Бруннер Д., Франгакис А.С. (2015). «Количественный анализ реорганизации цитоскелета при уплотнении эпителиальной ткани методом крупнообъемной электронной томографии». Nat Cell Biol . 17 (5): 605–14. дои : 10.1038/ncb3159 . ПМИД 25893916 . S2CID 6543151 .
^ Келлер П.Дж., Шмидт А.Д., Сантелла А., Хайри К., Бао З., Виттбродт Дж., Стельцер Э.Х. (2010). «Быстрая высококонтрастная визуализация развития животных с помощью сканирующей световой микроскопии со структурированным освещением» . Нат-методы . 7 (8): 637–642. дои : 10.1038/nmeth.1476 . ПМЦ 4418465 . ПМИД 20601950 .
^ Стельцер Э.Х. (2015). «Световая флуоресцентная микроскопия для количественной биологии». Нат-методы . 12 (1): 23–26. дои : 10.1038/nmeth.3219 . ПМИД 25549266 . S2CID 34063754 .
^ «Метод года 2014» . Природные методы . 12 (1): 1. 2015. doi : 10.1038/nmeth.3251 . ПМИД 25699311 .
^ Штробль Ф., Шмитц А., Стельцер Э.Х. (2015). «Живое изображение эмбрионального развития Tribolium castaneum с использованием световой флуоресцентной микроскопии». Нат Проток . 10 (10): 1486–1507. дои : 10.1038/нпрот.2015.093 . ПМИД 26334868 . S2CID 24774566 .
^ Штробль Ф., Шмитц А., Штельцер Э.Х. (2017). «Улучшение четырехмерного изображения: путешествие через десятилетие исследований флуоресцентной микроскопии на основе световых листов». Нат Проток . 12 (6): 1103–1109. дои : 10.1038/нпрот.2017.028 . ПМИД 28471459 . S2CID 38354456 .
^ фон Вангенхайм Д., Фангерау Дж., Шмитц А., Смит Р.С., Лейтте Х., Стельцер Э.Х., Майзель А. (2016). «Правила и свойства самоорганизации постэмбриональных моделей деления клеток органов растений» . Курр Биол . 26 (4): 439–449. дои : 10.1016/j.cub.2015.12.047 . hdl : 11858/00-001M-0000-002B-1640-B . ПМИД 26832441 .
^ Мэтью Б., Шмитц А., Муньос-Дескальсо С., Ансари Н., Пампалони Ф., Стельцер Э.Х., Фишер С.С. (2015). «Надежная и автоматизированная трехмерная сегментация плотно упакованных ядер клеток в различных биологических образцах с разложением по лучам видимости» . БМК Биоинформатика . 16 : 187. дои : 10.1186/s12859-015-0617-x . ПМЦ 4458345 . ПМИД 26049713 .
^ Шмитц А., Фишер С.К., Маттейер С., Пампалони Ф., Стельцер Э.Х. (2017). «Многомасштабный анализ изображений выявляет структурную гетерогенность клеточного микроокружения в гомотипических сфероидах» . Научный представитель . 7 : 43693. Бибкод : 2017NatSR...743693S . дои : 10.1038/srep43693 . ПМК 5334646 . ПМИД 28255161 .
^ Венкатарамани В., Хермансдорфер Ф., Хайлеманн М., Кунер Т. (2016). «SuReSim: моделирование экспериментов по локализационной микроскопии на основе реальных моделей». Нат-методы . 13 (4): 319–321. дои : 10.1038/Nmeth.3775 . ПМИД 26928761 . S2CID 3776898 .
^ ван Вейк С.Дж., Фрике Ф., Херхаус Л., Гупта Дж., Хётте К., Пампалони Ф., Грумати П., Каулич М., Соу Ю.С., Комацу М., Гретен Ф.Р., Фульда С., Хайлеманн М., Дикич И. (2017). «Линейное убиквитинирование цитозольной Salmonella Typhimurium активирует NF-κB и ограничивает пролиферацию бактерий». Нат Микробиол . 2 (7):17066.doi : 10.1038 /nmicrobiol.2017.66 . ПМИД 28481361 . S2CID 1329736 .
^ Грумати П., Мороцци Г., Холпер С., Мари М., Харвардт М.И., Ян Р., Мюллер С., Реджиори Ф., Хайлеманн М., Дикич И. (2017). «Полноразмерный RTN3 регулирует оборот канальцевой эндоплазматической сети посредством селективной аутофагии» . электронная жизнь . 6 : е25555. дои : 10.7554/eLife.25555 . ПМК 5517149 . ПМИД 28617241 .
^ Винеке Р., Раульф А., Коллманнспергер А., Хайлеманн М., Тампе Р. (2015). «Маленькая пара меток для визуализации одиночных молекул со сверхвысоким разрешением». Angewandte Chemie, международное издание . 54 (35): 10216–9. дои : 10.1002/anie.201503215 . ПМИД 26201868 .
^ Коллманнспергер А, Шарей А, Раульф А, Хайлеманн М, Лангер Р, Йенсен КФ, Винеке Р, Тампе Р (2016). «Маркировка белков живых клеток с нанометровой точностью путем сжатия клеток» . Нат Коммун . 7 : 10372. Бибкод : 2016NatCo...710372K . дои : 10.1038/ncomms10372 . ПМК 4740111 . ПМИД 26822409 .
^ Прандолини М.Дж., Денисенков В.П., Гафуров М., Эндевард Б., Приснер Т.Ф. (2009). «Сильнополевая динамическая ядерная поляризация в водных растворах». J Am Chem Soc . 131 (17): 6090–2. дои : 10.1021/ja901496g . ПМИД 19361195 .
^ Джодике Л., Мао Дж., Куэнце Г., Рейнхарт С., Калавакерла Т., Йонкер Х.Р., Рихтер С., Швальбе Х., Мейлер Дж., Преу Дж., Мишель Х., Глаубиц К. (2018). «Молекулярные основы селективности подтипов человеческих кининовых G-белковых рецепторов» . Nat Chem Biol . 14 (3): 284–290. дои : 10.1038/nchembio.2551 . ПМЦ 7992120 . ПМИД 29334381 .
^ Ленерт Э., Мао Дж., Мехдипур А.Р., Хаммер Г., Абеле Р., Глаубиц С., Тампе Р. (2016). «Распознавание антигенного пептида на человеческом транспортере ABC TAP, определенное с помощью твердотельной ЯМР-спектроскопии с усилением DNP». J Am Chem Soc . 138 (42): 13967–13974. дои : 10.1021/jacs.6b07426 . ПМИД 27659210 .
^ Мелер М., Эккерт CE, Лидер А.Дж., Каур Дж., Фишер Т., Кубатова Н., Браун Л.Дж., Браун Р.К., Беккер-Бальдус Дж., Вахтвейтль Дж., Глаубиц С. (2017). «Хромофорные искажения в фотопромежуточных продуктах протеородопсина, визуализированные с помощью твердотельного ЯМР с усилением ядерной поляризации» (PDF) . J Am Chem Soc . 139 (45): 16143–16153. дои : 10.1021/jacs.7b05061 . ПМИД 29027800 .
^ Крстич И, Гензель Р, Ромаинчик О, Энгельс Й.В., Дётч В., Приснер Т.Ф. (2011). «Измерения нуклеиновых кислот в клетках на больших расстояниях методом импульсной ЭПР-спектроскопии». Angewandte Chemie, международное издание . 50 (22): 5070–5074. дои : 10.1002/anie.201100886 . ПМИД 21506223 .
^ Барт К., Хэнк С., Спиндлер П.Е., Приснер Т.Ф., Тампе Р., Джозеф Б. (2018). «Конформационное сопряжение и транс-ингибирование в ортологе переносчика антигенов человека TmrAB, выявленное с помощью диполярной ЭПР-спектроскопии». J Am Chem Soc . 140 (13): 4527–4533. дои : 10.1021/jacs.7b12409 . ПМИД 29308886 .
^ Моргнер Н., Хоффманн Дж., Барт Х.Д., Мейер Т., Брутши Б. (2008). «LILBID-масс-спектрометрия, применяемая для массового анализа РНК-полимеразы II и F1Fo-АТФ-синтазы». Int J Масс-спектр . 277 (1–3): 309–313. Бибкод : 2008IJMSp.277..309M . дои : 10.1016/j.ijms.2008.08.001 .
^ Хеллвиг Н., Питц О., Ахдаш З., Таскон И., Бут П.Дж., Микусевич В., Дисковски М., Политис А., Хеллмих Ю., Ханельт И., Ридинг Э., Моргнер Н. (2018). «Ативная масс-спектрометрия становится более естественной: исследование мембранных белковых комплексов непосредственно из SMALP» . Хим Коммун . 54 (97): 13702–13705. дои : 10.1039/c8cc06284f . ПМК 6289172 . ПМИД 30452022 .
^ Питц О, Хеллвиг Н, Хенрих Э, Межирова Й, Дётч В, Бернхард Ф, Моргнер Н (2019). «LILBID и nESI: различные методы местной масс-спектрометрии как инструменты структурной биологии» . J Am Soc Масс-спектр . 30 (1): 181–191. Бибкод : 2019JASMS..30..181P . дои : 10.1007/s13361-018-2061-4 . ПМК 6318263 . ПМИД 30225732 .
^ Ангерер Х, Шенборн С, Горка Дж, Бахр У, Карас М, Виттиг И, Хайдлер Дж, Хоффманн Дж, Моргнер Н, Цикерманн В (2017). «Ацильная модификация и связывание митохондриальной ACP с мультибелковыми комплексами» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1864 (10): 1913–1920. дои : 10.1016/j.bbamcr.2017.08.006 . ПМИД 28802701 .
^ Дисковски М., Мехдипур А.Р., Вуннике Д., Миллс Д.Д., Микусевич В., Берланд Н., Хоффманн Дж., Моргнер Н., Стейнхофф Х.Дж., Хаммер Г., Вонк Дж., Ханелт И. (2017). «Спиральные складные ножи управляют воротами двухпоровой системы поглощения K+ KtrAB» . электронная жизнь . 6 : е24303. doi : 10.7554/eLife.24303 . ПМК 5449183 . ПМИД 28504641 .
^ Хоффманн Дж., Соколова Л., Прейсс Л., Хикс Д.Б., Крулвич Т.А., Моргнер Н., Виттиг И., Шеггер Х., Мейер Т., Брутши Б. (2010). «АТФ-синтазы: клеточные наномоторы, охарактеризованные с помощью масс-спектрометрии LILBID» . Физ хим хим физ . 12 (41): 13375–13382. Бибкод : 2010PCCP...1213375H . дои : 10.1039/c0cp00733a . ПМЦ 2955850 . ПМИД 20820587 .
^ Мачейко Дж., Мелер М., Каур Дж., Либлейн Т., Моргнер Н., Уари О., Тордо П., Беккер-Бальдус Дж., Глаубиц С. (2015). «Визуализация специфических межпротомерных взаимодействий в гомоолигомерном мембранном белке протеородопсине с помощью твердотельного ЯМР с усилением динамической ядерной поляризации». J Am Chem Soc . 137 (28): 9032–9043. дои : 10.1021/jacs.5b03606 . ПМИД 26102160 .
^ Коль-Ландграф Дж., Браун М., Озкобан С., Гонсалвес Д.П., Хекель А., Вахтвейтль Дж. (2012). «Сверхбыстрая динамика спиропирана в воде». J Am Chem Soc . 134 (34): 14070–14077. дои : 10.1021/ja304395k . ПМИД 22803805 .
^ Стейнванд С., Ю З., Хехт С., Вахтвейтль Дж. (2016). «Сверхбыстрая динамика фотоизомеризации и последующего разворачивания олигоазобензольного фолдамера». J Am Chem Soc . 138 (39): 12997–13005. дои : 10.1021/jacs.6b07720 . ПМИД 27598007 .
^ Фёрстер У., Вейганд Дж. Э., Трояновски П., Зюсс Б., Вахтвейтль Дж. (2012). «Конформационная динамика тетрациклинсвязывающего аптамера» . Нуклеиновые кислоты Рез . 40 (4): 1807–17. дои : 10.1093/nar/gkr835 . ПМК 3287181 . ПМИД 22053085 .
^ Хэлбриттер Т., Кайзер С., Вахтвейтль Дж., Хекель А. (2017). «Производное пиридина-спиропирана как стойкая обратимая фотокислота в воде». J Орг. хим . 82 (15): 8040–8047. дои : 10.1021/acs.joc.7b01268 . ПМИД 28686024 .
^ Густманн Х, Сеглер А.Дж., Гофан Д.Б., Ройсс А.Дж., Грюневальд С., Браун М., Вейганд Дж.Е., Сигурдссон С.Т., Вахтвейтль Дж. (2019). «Структурно-ориентированная флуоресцентная маркировка раскрывает двухэтапный механизм связывания неомицина с его РНК-аптамером» . Нуклеиновые кислоты Рез . 47 (1): 15–28. дои : 10.1093/nar/gky1110 . ПМК 6326822 . ПМИД 30462266 .
^ Хофманн С., Джанулиен Д., Мехдипур А.Р., Томас С., Стефан Э., Брюхерт С., Кун Б.Т., Гертсма Э.Р., Хаммер Г., Тампе Р., Мёллер А. (2019). «Конформационное пространство гетеродимерного ABC-экспортера в условиях оборота» . Природа . 571 (7766): 580–583. дои : 10.1038/s41586-019-1391-0 . ПМЦ 7612745 . ПМИД 31316210 . S2CID 197543295 .
^ Шин Д., Мукерджи Р., Лю Й., Гонсалес А., Бонн Ф., Лю Й., Рогов В.В., Хайнц М., Штольц А., Хаммер Г., Дётч В., Луо ЗК, Бхогараджу С., Дикич И. (2020). «Регуляция убиквитинирования фосфорибозильно-связанного серина деубиквитиназами DupA и DupB» . Мол Сотовый 77 (1): 164–179.e6. дои : 10.1016/j.molcel.2019.10.019 . ПМК 6941232 . ПМИД 31732457 .
^ Оказаки К.И., Вёлерт Д., Варнау Дж., Юнг Х., Йилдиз О., Кюльбрандт В., Хаммер Г. (2019). «Механизм электронейтрального натрий / протонного антипортера PaNhaP от стрельбы по переходному пути» . Нат Коммун . 10 (1): 1742. Бибкод : 2019NatCo..10.1742O . дои : 10.1038/s41467-019-09739-0 . ПМК 6465308 . ПМИД 30988359 .
^ Хальблейб К., Песек К., Ковино Р., Хофбауэр Х.Ф., Вуннике Д., Ханельт И., Хаммер Г., Эрнст Р. (2017). «Активация развернутого белкового ответа стрессом липидного бислоя» . Мол Клетка . 67 (4): 673–684.e8. doi : 10.1016/j.molcel.2017.06.012 . ПМИД 28689662 .
^ Ленерт Э., Мао Дж., Мехдипур А.Р., Хаммер Г., Абеле Р., Глаубиц С., Тампе Р. (2016). «Распознавание антигенного пептида на человеческом транспортере ABC TAP, определенное с помощью твердотельной ЯМР-спектроскопии с усилением DNP». J Am Chem Soc . 138 (42): 13967–13974. дои : 10.1021/jacs.6b07426 . ПМИД 27659210 .
^ Кох I ; Шефер Т. (2018). «Супервторичная структура белка и топология четвертичной структуры: теоретическое описание и применение». Современное мнение в области структурной биологии . 50 : 134–143. дои : 10.1016/j.sbi.2018.02.005 . ПМИД 29558676 . S2CID 3991944 .
^ Буш А., Брюггеманн М., Эберсбергер С., Зарнак К. (2019). «Анализ данных iCLIP: полный конвейер от чтения секвенирования до сайтов связывания RBP» . Методы . 178 : 49–62. дои : 10.1016/j.ymeth.2019.11.008 . ПМИД 31751605 .
^ Ди Лиддо А., де Оливейра Фрейтас Мачадо С., Фишер С., Эберсбергер С., Хоймюллер А.В., Вейганд Дж.Э., Мюллер-МакНиколл М., Зарнак К. (2019). «Комбинированный вычислительный конвейер для обнаружения кольцевых РНК в раковых клетках человека в условиях гипоксического стресса» . J Мол Клеточная Биол . 11 (10): 829–844. дои : 10.1093/jmcb/mjz094 . ПМК 6884703 . ПМИД 31560396 .
^ Хаберман Н, Хупперц И, Аттиг Дж, Кениг Дж, Ван З, Хауэр С, Хентце М.В., Кулозик А.Е., Ле Хир Х., Курк Т., Сибли С.Р., Зарнак К., Уле Дж. (2017). «Взгляд на дизайн и интерпретацию экспериментов iCLIP» . Геном Биол . 18 (1): 7. дои : 10.1186/s13059-016-1130-x . ПМК 5240381 . ПМИД 28093074 .
^ Эйнлофт Дж; Акерманн Дж; Нотен Дж; Кох I (2013). «МонаЛиза — визуализация и анализ функциональных модулей биохимических сетей» . Биоинформатика . 29 (11): 1469–70. doi : 10.1093/биоинформатика/btt165 . ПМИД 23564846 .
^ Филипп О, Хаманн А, Осевач Х.Д., Кох И. (2017). «Сеть взаимодействия аутофагии модели старения Podospora anserina» . БМК Биоинформатика . 18 (1): 196. дои : 10.1186/s12859-017-1603-2 . ПМК 5369006 . ПМИД 28347269 .
^ Кох И., Нётен Дж., Шляйфф Э. (2017). «Моделирование метаболизма Arabidopsis thaliana: применение сетевой декомпозиции и сокращения сети в контексте сетей Петри» . Фронт Генет . 8 : 85. дои : 10.3389/fgene.2017.00085 . ПМК 5491931 . ПМИД 28713420 .
^ Амштайн Л., Акерманн Дж., Шайдель Дж., Фульда С., Дикич И., Кох И. (2017). «Инварианты ламантинов раскрывают функциональные пути в сигнальных сетях» . BMC Сист Биол . 11 (1): 72. дои : 10.1186/s12918-017-0448-7 . ПМЦ 5534052 . ПМИД 28754124 .
^ Гизе Х., Акерманн Дж., Хайде Х., Блейер Л., Дрозе С., Виттиг И., Брандт У., Кох И. (2015). «NOVA: программное обеспечение для анализа данных профилирования комплексомов» . Биоинформатика . 31 (3): 440–1. doi : 10.1093/биоинформатика/btu623 . ПМИД 25301849 .
^ Хайде Х., Блейер Л., Стегер М., Акерманн Дж., Дрёзе С., Швамб Б., Цёрниг М., Райхерт А.С., Кох И., Виттиг И., Брандт У. (2012). «Профилирование комплексома идентифицирует TMEM126B как компонент комплекса сборки митохондриального комплекса I» . Клеточные метаб . 16 (4): 538–549. дои : 10.1016/j.cmet.2012.08.009 . ПМИД 22982022 .
^ «EXC 115: Макромолекулярные комплексы» . База данных GEPRIS Немецкого исследовательского фонда DFG . Проверено 13 марта 2020 г.
^ «Кластер передовых макромолекулярных комплексов в действии» (PDF) . СЕФ . Проверено 13 марта 2020 г.

Внешние ссылки

[1] «Метод года 2010» . Природные методы . 8 (1): 1. 2010. doi : 10.1038/nmeth.f.321 .

[2] «Световая флуоресцентная микроскопия может отображать живые образцы в трех измерениях с относительно низкой фототоксичностью и на высокой скорости» . Природные методы . 12 (1): 1. 2014. doi : 10.1038/nmeth.3251 . ПМИД 25699311 .

[3] Хант С., Цикерманн В., Брандт У. (2010). «Функциональные модули и структурные основы конформационного сопряжения в митохондриальном комплексе I». Наука . 329 (5990): 448–51. Бибкод : 2010Sci...329..448H . дои : 10.1126/science.1191046 . ПМИД 20595580 . S2CID 11159551 .

[4] Цикерманн В., Вирт С., Насири Х., Зигмунд К., Швальбе Х., Хант С., Брандт У. (2015). «Механистическое понимание кристаллической структуры митохондриального комплекса I» . Наука . 347 (6217): 44–49. Бибкод : 2015Sci...347...44Z . дои : 10.1126/science.1259859 . ПМИД 25554780 . S2CID 23582849 .

[5] Хан А., Парей К., Бублиц М., Миллс Дерик Дж., Цикерманн В., Вонк Дж., Кюльбрандт В., Мейер Т. (2016). «Структура полного димера АТФ-синтазы раскрывает молекулярную основу морфологии внутренней митохондриальной мембраны» . Мол Клетка . 63 (3): 445–56. doi : 10.1016/j.molcel.2016.05.037 . ПМЦ 4980432 . ПМИД 27373333 .

[6] Мюлейп А.В., Йоос Ф., Вигге С., Франгакис А.С., Кюльбрандт В., Дэвис К.М. (2016). «Спиральные массивы U-образных димеров АТФ-синтазы образуют трубчатые кристы в реснитчатых митохондриях» . Proc Natl Acad Sci США . 113 (30): 8442–8447. Бибкод : 2016PNAS..113.8442M . дои : 10.1073/pnas.1525430113 . ПМЦ 4968746 . ПМИД 27402755 .

[7] Мерфи Б.Дж., Клюш Н., Лангер Дж., Миллс DJ, Йилдиз О., Кюльбрандт В. (2019). «Вращающиеся подсостояния митохондриальной АТФ-синтазы раскрывают основу гибкого сцепления F1-Fo» . Наука . 364 (6446): eaaw9128. Бибкод : 2019Sci...364.9128M . дои : 10.1126/science.aaw9128 . ПМИД 31221832 . S2CID 195188479 .

[8] Хан А., Вонк Дж., Миллс DJ, Мейер Т., Кюльбрандт В. (2018). «Структура, механизм и регуляция АТФ-синтазы хлоропластов» . Наука . 360 (6389): 620. doi : 10.1126/science.aat4318 . ПМК 7116070 . ПМИД 29748256 .

[9] Дэвис К.М., Штраус М., Даум Б., Киф Дж.Х., Осевач Х.Д., Рыковска А., Цикерманн В., Кюльбрандт В. (2011). «Макромолекулярная организация АТФ-синтазы и комплекса I в целых митохондриях» . Proc Natl Acad Sci США . 108 (34): 14121–14126. Бибкод : 2011PNAS..10814121D . дои : 10.1073/pnas.1103621108 . ПМК 3161574 . ПМИД 21836051 .

[10] Дэвис К.М., Блюм Т.Б., Кюльбрандт В. (2018). «Консервативное расположение комплексов I и III2 in situ в суперкомплексах митохондриальной дыхательной цепи млекопитающих, дрожжей и растений» . Proc Natl Acad Sci США . 115 (12): 3024–3029. Бибкод : 2018PNAS..115.3024D . дои : 10.1073/pnas.1720702115 . ПМЦ 5866595 . ПМИД 29519876 .

[11] Бушманн С., Варкентин Э., Се Х., Лангер Дж.Д., Эрмлер У., Мишель Х. (2010). «Структура цитохромоксидазы cbb3 дает представление о перекачке протонов» . Наука . 329 (5989): 327–329. Бибкод : 2010Sci...329..327B . дои : 10.1126/science.1187303 . ПМИД 20576851 . S2CID 5083670 .

[12] Сафариан С., Раджендран С., Мюллер Х., Преу Дж., Лангер Дж.Д., Овчинников С., Хиросе Т., Кусумото Т., Сакамото Дж., Мишель Х. (2016). «Структура bd-оксидазы указывает на аналогичные механизмы для встроенных в мембрану кислородредуктаз» . Наука . 352 (6285): 583–586. Бибкод : 2016Sci...352..583S . doi : 10.1126/science.aaf2477 . ПМЦ 5515584 . ПМИД 27126043 .

[13] Марсия М., Эрмлер Ю., Пэн Г.Х., Мишель Х. (2009). «Структура Aquifex aeolicus сульфид: хинон-оксидоредуктаза, основа для понимания детоксикации сульфидов и дыхания» . Proc Natl Acad Sci США . 106 (24): 9625–9630. Бибкод : 2009PNAS..106.9625M . дои : 10.1073/pnas.0904165106 . ПМЦ 2689314 . ПМИД 19487671 .

[14] Баусевейн Т., Миллс Д.Д., Лангер Дж.Д., Нитшке Б., Нуссбергер С., Кюльбрандт В. (2017). «Крио-ЭМ структура основного комплекса ТОМ Neurospora crassa» . Клетка . 170 (4): 693–700.e7. дои : 10.1016/j.cell.2017.07.012 . ПМИД 28802041 .

[15] Дисковски М., Мехдипур А.Р., Вуннике Д., Миллс Д.Д., Микусевич В., Берланд Н., Хоффманн Дж., Моргнер Н., Стейнхофф Х.Дж., Хаммер Г., Вонк Дж., Ханелт И. (2017). «Спиральные складные ножи управляют воротами двухпоровой системы поглощения K+ KtrAB» . электронная жизнь . 6 : е24303. doi : 10.7554/eLife.24303 . ПМК 5449183 . ПМИД 28504641 .

[16] Шульце С., Костер С., Гельдмахер У., Тервисша ван Шелтинга А.С., Кюльбрандт В. (2010). «Структурная основа Na+-независимого и кооперативного антипорта субстрат/продукт в CaiT» (PDF) . Природа . 467 (7312): 233–6. Бибкод : 2010Natur.467..233S . дои : 10.1038/nature09310 . ПМИД 20829798 . S2CID 4341977 .

[17] Рессл С., Тервисша ван Шелтинга А.С., Фонрейн С., Отт В., Циглер С. (2009). «Молекулярные основы транспорта и регуляции симпортера Na + / бетаина BetP» (PDF) . Природа . 458 (7234): 47–52. Бибкод : 2009Natur.458...47R . дои : 10.1038/nature07819 . ПМИД 19262666 . S2CID 205216142 .

[18] Эйхер Т., Сигер М.А., Ансельми С., Чжоу В., Брандштеттер Л., Веррей Ф., Дидерихс К., Фаральдо-Гомес Дж.Д., Пос К.М. (2014). «Сочетание механизмов дистанционного транспорта попеременного доступа для протонов и субстратов в эффлюксном насосе с несколькими лекарствами AcrB» . электронная жизнь . 3 : e03145. дои : 10.7554/eLife.03145.001 . ПМЦ 4359379 . ПМИД 25248080 .

[19] Эйхер Т., Ча Х.Дж., Сигер М.А., Брандстаттер Л., Эль-Делик Дж., Бонерт Дж.А., Керн В.В., Веррей Ф., Груттер М.Г., Дидерихс К., Пос К.М. (2012). «Транспортировка лекарств с помощью мультилекарственного транспортера AcrB включает доступ и глубокий связывающий карман, которые разделены переключающей петлей» . Proc Natl Acad Sci США . 109 (15): 5687–92. Бибкод : 2012PNAS..109.5687E . дои : 10.1073/pnas.1114944109 . ПМК 3326505 . ПМИД 22451937 .

[20] Томас С., Тампе Р. (2017). «Структура комплекса TAPBPR-MHC I определяет механизм загрузки и редактирования пептидов» . Наука . 358 (6366): 1060–1064. Бибкод : 2017Sci...358.1060T . дои : 10.1126/science.aao6001 . ПМИД 29025996 .

[21] Блис А., Джанулиен Д., Хофманн Т., Коллер Н., Шмидт С., Тровитч С., Мёллер А., Тампе Р. (2017). «Структура человеческого комплекса загрузки пептида MHC-I». Природа . 551 (7681): 525–528. Бибкод : 2017Natur.551..525B . дои : 10.1038/nature24627 . ПМИД 29107940 . S2CID 4447406 .

[22] Ленерт Э., Мао Дж., Мехдипур А.Р., Хаммер Г., Абеле Р., Глаубиц С., Тампе Р. (2016). «Распознавание антигенного пептида на человеческом транспортере ABC TAP, определенное с помощью твердотельной ЯМР-спектроскопии с усилением DNP». J Am Chem Soc . 138 (42): 13967–13974. дои : 10.1021/jacs.6b07426 . ПМИД 27659210 .

[23] Барт К., Хэнк С., Спиндлер П.Е., Приснер Т.Ф., Тампе Р., Джозеф Б. (2018). «Конформационное сопряжение и транс-ингибирование в ортологе переносчика антигенов человека TmrAB, выявленное с помощью диполярной ЭПР-спектроскопии». J Am Chem Soc . 140 (13): 4527–4533. дои : 10.1021/jacs.7b12409 . ПМИД 29308886 .

[24] Каур Х, Лакатос-Кароли А, Фогель Р, Нёлль А, Тампе Р, Глаубиц С (2016). «Связанная АТФаза-аденилаткиназная активность в транспортерах ABC» . Нат Коммун . 7 : 13864. Бибкод : 2016NatCo...713864K . дои : 10.1038/ncomms13864 . ПМК 5192220 . ПМИД 28004795 .

[25] Хеллмих У.А., Любенова С., Кальтенборн Е., Доши Р., ван Вин Х.В., Приснер Т.Ф., Глаубиц С. (2012). «Изучение цикла гидролиза АТФ мультилекарственного переносчика ABC LmrA с помощью импульсной ЭПР-спектроскопии». J Am Chem Soc . 134 (13): 5857–62. дои : 10.1021/ja211007t . ПМИД 22397466 .

[26] Онг Ю.С., Лакатос А., Беккер-Бальдус Дж., Пос К.М., Глаубиц С. (2013). «Обнаружение субстратов, связанных со вторичным насосом оттока нескольких лекарств EmrE, с помощью твердотельного ЯМР с усилением DNP». J Am Chem Soc . 135 (42): 15754–62. дои : 10.1021/Ja402605s . ПМИД 24047229 .

[27] Хемпельманн Ф., Хельпер С., Верхуфен М.К., Вернер А.С., Келер Т., Фидлер С.А., Пфлегер Н., Вахтвейтль Дж., Глаубиц К. (2011). «Кластер His75-Asp97 в зеленом протеородопсине». J Am Chem Soc . 133 (12): 4645–4654. дои : 10.1021/ja111116a . ПМИД 21366243 .

[28] Рекель С., Готтштейн Д., Штеле Дж., Лёр Ф., Верхуфен М.К., Такеда М., Сильверс Р., Кайношо М., Глаубиц К., Вахтвейтль Дж., Бернхард Ф., Швальбе Х., Гюнтерт П., Дётч В. (2011). «Структура ЯМР раствора протеородопсина» . Angewandte Chemie, международное издание . 50 (50): 11942–11946. дои : 10.1002/anie.201105648 . ПМК 4234116 . ПМИД 22034093 .

[29] Мачейко Дж., Каур Дж., Беккер-Бальдус Дж., Глаубиц С. (2019). «Фотоциклозависимые конформационные изменения в кросс-протомерной триаде протеородопсина Asp-His-Trp, выявленные с помощью MAS-ЯМР с усилением DNP» . Proc Natl Acad Sci США . 116 (17): 8342–8349. Бибкод : 2019PNAS..116.8342M . дои : 10.1073/pnas.1817665116 . ПМК 6486740 . ПМИД 30948633 .

[30] Моргнер Н., Кляйншрот Т., Барт Х.Д., Людвиг Б., Брутши Б. (2007). «Новый подход к анализу мембранных белков с помощью лазерной масс-спектрометрии: от белковых субъединиц к целостному комплексу» . J Am Soc Масс-спектр . 18 (8): 1429–1438. дои : 10.1016/j.jasms.2007.04.013 . ПМИД 17544294 .

[31] Джодике Л., Мао Дж., Куэнце Г., Рейнхарт С., Калавакерла Т., Йонкер Х.Р., Рихтер С., Швальбе Х., Мейлер Дж., Преу Дж., Мишель Х., Глаубиц К. (2018). «Молекулярные основы селективности подтипов человеческих кининовых G-белковых рецепторов» . Nat Chem Biol . 14 (3): 284–290. дои : 10.1038/nchembio.2551 . ПМЦ 7992120 . ПМИД 29334381 .

[32] Дикич И, Элазар З (2018). «Механизм и медицинские последствия аутофагии млекопитающих». Nat Rev Mol Cell Biol . 19 (6): 349–364. дои : 10.1038/s41580-018-0003-4 . ПМИД 29618831 . S2CID 4594197 .

[33] Генау Х.М., Хубер Дж., Баскьери Ф., Акуцу М., Дётч В., Фархан Х., Рогов В., Берендс С. (2015). «Убиквитинлигаза CUL3-KBTBD6/KBTBD7 взаимодействует с белками GABARAP, пространственно ограничивая передачу сигналов TIAM1-RAC1» . Мол Клетка . 57 (6): 995–1010. дои : 10.1016/j.molcel.2014.12.040 . ПМИД 25684205 .

[34] Уайлд П., Фархан Х., Макьюэн Д.Г., Вагнер С., Рогов В.В., Брейди Н.Р., Рихтер Б., Корач Дж., Вайдманн О., Чоудхари С., Дётч В., Буманн Д., Дикич И. (2011). «Фосфорилирование рецептора аутофагии оптиневрина ограничивает рост сальмонеллы» . Наука . 333 (6039): 228–33. Бибкод : 2011Sci...333..228W . дои : 10.1126/science.1205405 . ПМЦ 3714538 . ПМИД 21617041 .

[35] Фискин Э., Бионда Т., Дикич И., Берендс С. (2016). «Глобальный анализ убиквитинома хозяина и бактерий в ответ на инфекцию Salmonella Typhimurium» . Мол Клетка . 62 (6): 967–981. doi : 10.1016/j.molcel.2016.04.015 . ПМИД 27211868 .

[36] Бхогараджу С., Калайил С., Лю Й., Бонн Ф., Колби Т., Матич И., Дикич И. (2016). «Фосфорибозилирование убиквитина способствует убиквитинированию серина и ухудшает обычное убиквитинирование» . Клетка . 167 (6): 1636–1649.e13. дои : 10.1016/j.cell.2016.11.019 . ПМИД 27912065 .

[37] Калайил С., Бхогараджу С., Бонн Ф., Шин Д., Лю Ю., Ган Н., Басквин Дж., Грумати П., Луо ЗК, Дикич И. (2018). «Понимание катализа и функции убиквитинирования серина, связанного фосфорибозилом» . Природа 557 (7707): 734–738. Бибкод : 2018Nature.557..734K дои : 10.1038/ s41586-018-0145-8 ПМЦ 5980784 . ПМИД 29795347 .

[38] Бхогараджу С., Бонн Ф., Мукерджи Р., Адамс М., Пфлайдерер М.М., Галей В.П., Маткович В., Лопес-Москеда Дж., Калайил С., Шин Д., Дикич И. (2019). «Ингибирование бактериальных убиквитинлигаз глутамилированием, катализируемым SidJ-кальмодулином» . Природа . 572 (7769): 382–386. Бибкод : 2019Natur.572..382B . дои : 10.1038/s41586-019-1440-8 . ПМК 6715450 . ПМИД 31330532 .

[39] Хаминец А, Генрих Т, Мари М, Грумати П, Хюбнер А.К., Акуцу М, Либманн Л, Штольц А, Ницше С, Кох Н, Маут М, Катона И, Квалманн Б, Вейс Дж, Реджиори Ф, Курт И, Хюбнер К.А. , Дикич I (2015). «Регуляция оборота эндоплазматической сети путем селективной аутофагии». Природа . 522 (7556): 354–8. Бибкод : 2015Natur.522..354K . дои : 10.1038/nature14498 . ПМИД 26040720 . S2CID 4449106 .

[40] Бхаскара Р.М., Грумати П., Гарсия-Пардо Дж., Калайил С., Коваррубиас-Пинто А., Чен В., Кудряшев М., Дикич И., Хаммер Г. (2019). «Индукция кривизны и ремоделирование мембраны с помощью домена гомологии ретикулона FAM134B способствует селективной ER-фагии» . Нат Коммун . 10 (1): 2370. Бибкод : 2019NatCo..10.2370B . дои : 10.1038/s41467-019-10345-3 . ПМК 6542808 . ПМИД 31147549 .

[41] Хусняк К., Эльзассер С., Чжан Н.С., Чен Х., Рэндлс Л., Ши Ю., Хофманн К., Уолтерс К.Дж., Финли Д., Дикич И. (2008). «Протеасомная субъединица Rpn13 представляет собой новый рецептор убиквитина» . Природа . 453 (7194): 481–488. Бибкод : 2008Natur.453..481H . дои : 10.1038/nature06926 . ПМЦ 2839886 . ПМИД 18497817 .

[42] Рахиги С., Икеда Ф., Кавасаки М., Акуцу М., Сузуки Н., Като Р., Кенше Т., Уэджима Т., Блур С., Коммандер Д., Рандоу Ф., Вакацуки С., Дикич И. (2009). «Специфическое распознавание линейных цепей убиквитина с помощью NEMO важно для активации NF-κB» . Ячейка 136 (6): 1098–1109. дои : 10.1016/j.cell.2009.03.007 . ПМИД 19303852 . S2CID 3683855 .

[43] Икеда Ф, Дерибе Ю.Л., Сконеланд С.С., Штиглиц Б., Граббе С., Франц-Вахтель М., ван Вейк С.Дж., Госвами П., Надь В., Терзич Дж., Токунага Ф., Андроулидаки А., Накагава Т., Паспаракис М., Иваи К., Сундберг Дж.П. , Шефер Л , Риттингер К , Мачек Б , Дикич И (2011). «SHARPIN образует линейный комплекс убиквитинлигазы, регулирующий активность NF-каппа B и апоптоз» . Природа 471 (7340): 637–641. Бибкод : 2011Nature.471..637I . дои : 10.1038/nature09814 . ПМК 3085511 . ПМИД 21455181 .

[44] фон Дельбрюк М, Книсс А, Рогов ВВ, Плюска Л, Багола К, Лёр Ф, Гюнтерт П, Зоммер Т, Дётч В (2016). «Домен CUE Cue1 выравнивает растущие цепи убиквитина с Ubc7 для быстрого удлинения» . Мол Клетка . 62 (6): 918–928. doi : 10.1016/j.molcel.2016.04.031 . ПМИД 27264873 .

[45] ван Вейк С.Дж., Фрике Ф., Херхаус Л., Гупта Дж., Хётте К., Пампалони Ф., Грумати П., Каулич М., Соу Ю.С., Комацу М., Гретен Ф.Р., Фульда С., Хайлеманн М., Дикич И. (2017). «Линейное убиквитинирование цитозольной Salmonella Typhimurium активирует NF-κB и ограничивает пролиферацию бактерий». Нат Микробиол . 2 (7):17066.doi : 10.1038 /nmicrobiol.2017.66 . ПМИД 28481361 . S2CID 1329736 .

[46] Книсс А, Шуец Д, Каземи С, Плюска Л, Шпиндлер П.Е., Рогов В.В., Хусняк К., Дикич И., Гюнтерт П., Зоммер Т., Приснер Т.Ф., Дётч В. (2018). «Процессы сборки и разборки цепей по-разному влияют на конформационное пространство цепей убиквитина» . Структура . 26 (2): 249–258.е4. дои : 10.1016/j.str.2017.12.011 . ПМИД 29358025 .

[47] Дойч ГБ, Зелонка Э.М., Кутандин Д., Вебер Т.А., Шефер Б., Ханневальд Дж., Лух Л.М., Дерст Ф.Г., Ибрагим М., Хоффманн Дж., Низен Ф.Х., Сентюрк А., Кункель Х., Брутши Б., Шляйфф Е., Кнапп С., Акер- Палмер А., Грез М., МакКеон Ф., Дётч В. (2011). «Повреждение ДНК в ооцитах вызывает переключение фактора контроля качества TAp63a с димера на тетрамер» . Клетка . 144 (4): 566–576. дои : 10.1016/j.cell.2011.01.013 . ПМК 3087504 . ПМИД 21335238 .

[48] Кутанден Д., Остербург С., Шривастав Р.К., Сумик М., Керлёссер С., Гебель Дж., Туппи М., Ханневальд Дж., Шафер Б., Салах Е., Матеа С., Мюллер-Куллер У., Даутч Дж., Грез М., Кнапп С., Дётч В. ( 2016). «Контроль качества ооцитов с помощью р63 основан на подпружиненном механизме активации на молекулярном и клеточном уровне» . электронная жизнь . 5 : е13909. doi : 10.7554/eLife.13909 . ПМЦ 4876613 . ПМИД 27021569 .

[49] Туппи М, Керлёссер С, Кутанден Д.В., Росси В., Лух Л.М., Штрубель А., Хётте К., Хоффмайстер М., Шефер Б., Де Оливейра Т., Гретен Ф., Стельцер Э.Х., Кнапп С., Де Феличи М., Берендс С., Клингер Ф.Г., Дётч В. (2018). «Контроль качества повреждения ДНК ооцитов требует последовательного взаимодействия CHK2 и CK1 для активации p63». Nat Struct Мол Биол . 25 (3): 261–269. дои : 10.1038/s41594-018-0035-7 . ПМИД 29483652 . S2CID 3685994 .

[50] Руссо С., Остербург С., Сирико А., Антонини Д., Амбросио Р., Вюрц Дж.М., Ринненталь Дж., Ферниани М., Керлёссер С., Шефер Б., Гюнтерт П., Синха С., Дётч В., Миссеро (2018). «Агрегация белка фактора транскрипции p63 лежит в основе тяжелой хрупкости кожи при синдроме AEC» . Proc Natl Acad Sci США . 115 (5): Е906–Е915. Бибкод : 2018PNAS..115E.906R . дои : 10.1073/pnas.1713773115 . ПМЦ 5798343 . ПМИД 29339502 .

[51] Бенедикт А., Балтрушат С., Шольц Б., Бурсен А., Арри Т.Н., Мейер Б., Вараньоло Л., Мюллер А.М., Карас М., Дингерманн Т., Маршалек Р. (2011). «Лейкемогенный слитый белок AF4-MLL вызывает активацию киназы P-TEFb и изменение эпигенетических признаков» . Лейкемия . 25 (1): 135–44. дои : 10.1038/leu.2010.249 . ПМИД 21030982 .

[52] Шмидт Н., Ковальд Л., Вейк С., Фульда С. (2019). «Дифференциальное участие передачи сигналов TAK1, RIPK1 и NF-kappaB в гибели клеток, индуцированной миметиком Smac, в клетках рака молочной железы». Биол хим . 400 (2): 171–180. дои : 10.1515/hsz-2018-0324 . ПМИД 30391931 . S2CID 53241442 .

[53] Белц К., Шенебергер Х., Венер С., Вейгерт А., Бониг Х., Клингебиль Т., Фихтнер И., Фульда С. (2014). «Миметик Smac и глюкокортикоиды действуют совместно, вызывая апоптоз при ОЛЛ у детей, способствуя сборке рипоптосом» . Кровь . 124 (2): 240–50. doi : 10.1182/blood-2013-05-500918 . ПМИД 24855207 .

[54] Мюллер С; Эклу С; Эроусмит CH; Баузер М; Барыза Ж.Л.; Блэгг Дж; Бетчер Дж; Боунтра С; Браун Пи Джей; Баннаж МЕНЯ; Картер Эй Джей; Дамерелл Д; Дётч В; Дрюри Д.Х.; Эдвардс AM; Эдвардс Дж; Элкинс Дж.М.; Фишер С; Фрай С.В.; Голлнер А; Гримшоу CE; Эйзерман А; Ханке Т; Хартунг IV; Хичкок С; Хау Т; Хьюз ТВ; Лауфер С; Ли ВМЖ; Лирас С; Марсден Б.Д.; Мацуи Х; Матиас Дж; О'Хаган RC; Оуэн Д.Р.; Панде V; Раух Д; Розенберг С.Х.; Рот Б.Л .; Шнайдер Н.С.; Схолтен С; Сингх Сайкатенду К.; Симеонов А; Такидзава М; Це С; Томпсон PR; Трайбер Д.К.; Виана АЙИ; Уэллс К.И.; Уилсон ТМ; Цурхер В.Дж.; Кнапп С; Мюллер-Фарнов А (2018). «Пожертвованные химические зонды для открытой науки» . электронная жизнь . 7 : е34311. дои : 10.7554/eLife.34311 . ПМК 5910019 . ПМИД 29676732 .

[55] Ву Ц, Хайденрайх Д., Чжоу С., Аклу С., Кремер А., Накка К., Лима-Фернандес Е., Деблуа Г., Дуан С., Велланки Р.Н., Ли Ф., Ведади М., Дилворт Дж., Лупиен М., Бреннан П.Е., Эрроусмит CH, Мюллер С., Федоров О., Филиппакопулос П., Кнапп С. (2019). «Химический набор инструментов для изучения бромодоменов и эпигенетической передачи сигналов» . Нат Коммун 10 ): 1915. Бибкод : 2019NatCo..10.1915W. (10: 1915 дои : 10.1038/ s41467-019-09672-2 ПМЦ 6478789 . ПМИД 31015424 .

[56] Савамипхак С., Зайдель С., Эссманн К.Л., Уилкинсон Г.А., Питулеску М.Е., Акер Т., Акер-Палмер А. (2010). «Эфрин-B2 регулирует функцию VEGFR2 в процессе развития и опухолевого ангиогенеза». Природа . 465 (7297): 487–91. Бибкод : 2010Natur.465..487S . дои : 10.1038/nature08995 . ПМИД 20445540 . S2CID 4423684 .

[57] Эссманн К.Л., Мартинес Э., Гейгер Дж.К., Циммер М., Траут М.Х., Штейн В., Кляйн Р., Акер-Палмер А. (2008). «Сериновое фосфорилирование эфрина B2 регулирует перемещение синаптических рецепторов AMPA». Нат Нейроски . 11 (9): 1035–1043. дои : 10.1038/nn.2171 . ПМИД 19160501 . S2CID 698572 .

[58] Стефер С., Райц С., Ван Ф., Вильд К., Панг Й.Ю., Шварц Д., Бомке Дж., Хайн С., Лёр Ф., Бернхард Ф., Деник В., Дётч В., Синнинг И. (2011). «Структурная основа биогенеза мембранных белков, закрепленных на хвосте, с помощью комплекса Get3-рецептор» . Наука . 333 (6043): 758–62. Бибкод : 2011Sci...333..758S . дои : 10.1126/science.1207125 . ПМК 3601824 . ПМИД 21719644 .

[59] Черепанов А.В., Глаубиц С., Швальбе Х (2010). «Исследование с высоким разрешением равномерно меченной 13C,15N РНК методом твердотельной ЯМР-спектроскопии». Angewandte Chemie, международное издание . 49 (28): 4747–50. дои : 10.1002/anie.200906885 . ПМИД 20533472 .

[60] Шнидерс Р., Вольтер А.С., Рихтер С., Вёнерт Дж., Швальбе Х., Фюртиг Б. (2019). «Новые (13) эксперименты ЯМР с обнаружением C для точного определения структуры РНК» . Angewandte Chemie, международное издание . 58 (27): 9140–9144. дои : 10.1002/anie.201904057 . ПМК 6617721 . ПМИД 31131949 .

[61] Бак Дж., Фюртиг Б., Ноеске Дж., Вёнерт Дж., Швальбе Х. (2007). «Методы ЯМР с временным разрешением, разрешающие сворачивание РНК, индуцированное лигандом, с атомным разрешением» . Proc Natl Acad Sci США . 104 (40): 15699–704. Бибкод : 2007PNAS..10415699B . дои : 10.1073/pnas.0703182104 . ПМК 2000436 . ПМИД 17895388 .

[62] Крстич И., Фролов О., Сезер Д., Эндевард Б., Вейганд Дж.Э., Зюсс Б., Энгельс Дж.В., Приснер Т.Ф. (2010). «PELDOR-спектроскопия выявляет предварительную организацию третичной структуры рибопереключателя, реагирующего на неомицин». J Am Chem Soc . 132 (5): 1454–5. дои : 10.1021/ja9077914 . ПМИД 20078041 .

[63] Шиман О., Питон Н., Плакмейер Дж., Боде Б.Е., Приснер Т.Ф., Энгельс Дж.В. (2007). «Спиновое мечение олигонуклеотидов нитроксидом ТРА и использование PELDOR, метода импульсной ЭПР, для измерения внутримолекулярных расстояний». Нат Проток . 2 (4): 904–23. дои : 10.1038/нпрот.2007.97 . ПМИД 17446891 . S2CID 6442268 .

[64] Вайнрих Т., Яуманн Э.А., Шеффер У., Приснер Т.Ф., Гёбель М.В. (2018). «Цитидинфосфорамидит с защищенной нитроксидной спиновой меткой: синтез полноразмерной РНК TAR и исследование с помощью линейного зондирования и ЭПР-спектроскопии». Химия: Европейский журнал . 24 (23): 6202–6207. дои : 10.1002/chem.201800167 . ПМИД 29485736 .

[65] Фёрстер У, Грюневальд С, Энгельс ЙВ, Вахтвейтль Й (2010). «Сверхбыстрая динамика 1-этинилпирен-модифицированной РНК: фотофизический зонд интеркаляции». J Phys Chem B. 114 (35): 11638–45. дои : 10.1021/jp103176q . ПМИД 20707369 .

[66] Густманн Х, Сеглер А.Дж., Гофан Д.Б., Ройсс А.Дж., Грюневальд С., Браун М., Вейганд Дж.Е., Сигурдссон С.Т., Вахтвейтль Дж. (2019). «Структурно-ориентированная флуоресцентная маркировка раскрывает двухэтапный механизм связывания неомицина с его РНК-аптамером» . Нуклеиновые кислоты Рез . 47 (1): 15–28. дои : 10.1093/nar/gky1110 . ПМК 6326822 . ПМИД 30462266 .

[67] Рейнинг А, Нозинович С, Шлепков К, Бур Ф, Фюртиг Б, Швальбе Х (2013). «Трехуровневый механизм связывает лиганд и измерение температуры в рибопереключателях». Природа . 499 (7458): 355–9. Бибкод : 2013Natur.499..355R . дои : 10.1038/Nature12378 . ПМИД 23842498 . S2CID 4414719 .

[68] Фернер Дж., Сухартоно М., Брейтунг С., Йонкер Х.Р., Хенниг М., Вёнерт Дж., Гобель М., Швальбе Х. (2009). «Структуры комплексов РНК-лиганд TAR ВИЧ обнаруживают более высокую стехиометрию связывания». ХимБиоХим . 10 (9): 1490–1494. дои : 10.1002/cbic.200900220 . ПМИД 19444830 . S2CID 44300779 .

[69] Моргнер Н., Барт Х.Д., Брутши Б., Шеффер У., Брейтунг С., Гобель М. (2008). «Сайты связывания элемента вирусной РНК TAR и мутантов TAR для различных пептидных лигандов, исследованные с помощью LILBID: новая лазерная масс-спектрометрия» . J Am Soc Масс-спектр . 19 (11): 1600–1611. дои : 10.1016/j.jasms.2008.07.001 . ПМИД 18693035 .

[70] Манохаран В., Фюртиг Б., Яшке А., Швальбе Х. (2009). «Индуцированное металлом сворачивание рибозимов диель-альдеразы, изученное с помощью статической ЯМР-спектроскопии с временным разрешением». J Am Chem Soc . 131 (17): 6261–6270. дои : 10.1021/ja900244x . ПМИД 19354210 .

[71] Кортманн Дж, Шодрок С, Ринненталь Дж, Швальбе Х, Нарберхаус Ф (2011). «Перевод по требованию простым термосенсором на основе РНК» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (7): 2855–2868. дои : 10.1093/нар/gkq1252 . ПМК 3074152 . ПМИД 21131278 .

[72] Дюхардт-Фернер Э., Вейганд Дж.Э., Оленшлагер О., Штнидтке С.Р., Зюсс Б., Вёнерт Дж. (2010). «Высокомодульная структура и связывание лигандов путем конформационного захвата в минималистическом рибопереключателе». Angewandte Chemie, международное издание . 49 (35): 6216–6219. дои : 10.1002/anie.201001339 . ПМИД 20632338 .

[73] Штайнерт Х, Сохор Ф, Вакер А, Бак Дж, Хелмлинг С, Хиллер Ф, Кейхани С, Ноэске Дж, Гримм СК, Рудольф ММ, Келлер Х, Муни Р.А., Ландик Р, Зюсс Б, Фюртиг Б, Вёнерт Дж, Швальбе Х (2017). «Пауза направляет сворачивание РНК для заполнения временно стабильных структур РНК для регуляции транскрипции на основе рибопереключателя» . электронная жизнь . 6 : е21297. doi : 10.7554/eLife.21297 . ПМЦ 5459577 . ПМИД 28541183 .

[74] Нейер С., Кунц М., Гейсс С., Ханче М., Ходирнау В.В., Зейберт А., Энгель С., Шеффер М.П., Крамер П., Франгакис А.С. (2016). «Структура РНК-полимеразы I, транскрибирующей гены рибосомальной ДНК». Природа . 540 (7634): 607–610. Бибкод : 2016Natur.540..607N . дои : 10.1038/nature20561 . ПМИД 27842382 . S2CID 205252425 .

[75] Мейер Б., Вурм Дж.П., Коттер П., Лейзеганг М.С., Шиллинг В., Буххаупт М., Хелд М., Бахр У., Карас М., Хекель А., Бонсак М.Т., Вёнерт Дж., Энтиан К.Д. (2011). «Белок Nep1 синдрома Боуэна-Конради (Emg1) играет двойную роль в биогенезе эукариотических рибосом: в качестве важного фактора сборки и в метилировании Psi 1191 в 18S рРНК дрожжей» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (4): 1526–37. дои : 10.1093/нар/gkq931 . ПМК 3045603 . ПМИД 20972225 .

[76] Вурм Дж.П., Мейер Б., Бахр У., Хелд М., Фролов О., Коттер П., Энгельс Дж.В., Хекель А., Карас М., Энтиан К.Д., Вёнерт Дж. (2010). «Фактор сборки рибосомы Nep1, ответственный за синдром Боуэна-Конради, представляет собой псевдоуридин-N1-специфическую метилтрансферазу» . Нуклеиновые кислоты Рез . 38 (7): 2387–98. дои : 10.1093/nar/gkp1189 . ПМЦ 2853112 . ПМИД 20047967 .

[77] Бонсак М.Т., Мартин Р., Граннеман С., Рупрехт М., Шляйфф Э., Толлерви Д. (2009). «Prp43, связанный с разными сайтами пре-рРНК, выполняет разные функции в синтезе рибосом» . Мол Клетка . 36 (4): 583–92. doi : 10.1016/j.molcel.2009.09.039 . ПМК 2806949 . ПМИД 19941819 .

[78] Палм Д., Стрейт Д., Шанмугам Т., Вейс Б.Л., Рупрехт М., Симм С., Шляйфф Э. (2019). «Растительно-специфические факторы биогенеза рибосом у Arabidopsis thaliana, обладающие важной функцией в процессинге рРНК» . Нуклеиновые кислоты Рез . 47 (4): 1880–1895. дои : 10.1093/nar/gky1261 . ПМК 6393314 . ПМИД 30576513 .

[79] Вайс Б.Л., Миссбах С., Марци Дж., Бонсак М.Т., Шляйфф Э. (2014). «Фактор биогенеза рибосом LSG1-2, ассоциированный с 60S, необходим для созревания 40S у Arabidopsis thaliana » . Плант Дж . 80 (6): 1043–56. дои : 10.1111/tpj.12703 . ПМИД 25319368 .

[80] Эндесфельдер У, Финан К, Холден С.Дж., Кук П.Р., Капанидис А.Н., Хайлеманн М. (2013). «Многомасштабная пространственная организация РНК-полимеразы в Escherichia coli» . Биофиз Дж . 105 (1): 172–181. Бибкод : 2013BpJ...105..172E . дои : 10.1016/j.bpj.2013.05.048 . ПМЦ 3699759 . ПМИД 23823236 .

[81] Стеллос К, Гациу А, Стамателопулос К, Перишич Матич Л, Джон Д, Лунелла ФФ, Джэ Н, Россбах О, Амрайн К, Сигала Ф, Бун Р.А., Фуртиг Б, Манавски Ю, Ю Х, Учида С, Келлер Т, Бёкель ЙН, Франко-Сереседа А, Мегдефессель Л, Чен В, Швальбе Х, Биндерейф А, Эрикссон П, Хедин У, Зейхер А.М., Диммелер С. (2016). «Редактирование РНК аденозин-инозин контролирует экспрессию катепсина S при атеросклерозе, обеспечивая HuR-опосредованную посттранскрипционную регуляцию». НатМед . 22 (10): 1140–1150. дои : 10.1038/nm.4172 . ПМИД 27595325 . S2CID 3397638 .

[82] Мюллер-МакНиколл М., Ботти В., Домингес А.М., Брандл Х., Швич О.Д., Штайнер М.С., Курк Т., Позер I, Зарнак К., Нойгебауэр К.М. (2016). «Белки SR представляют собой адаптеры NXF1, которые связывают альтернативный процессинг РНК с экспортом мРНК» . Генс Дев . 30 (5): 553–66. дои : 10.1101/gad.276477.115 . ПМЦ 4782049 . ПМИД 26944680 .

[83] Браун С., Энкулеску М., Сетти С.Т., Кортес-Лопес М., де Алмейда Б.П., Сутанди Ф.С., Шульц Л., Буш А., Зайлер М., Эберсбергер С., Барбоза-Морайс Н.Л., Легеви С., Кениг Дж., Зарнак К. (2018). «Расшифровка решения о сплайсинге, связанном с раком, в протоонкогене RON с использованием высокопроизводительного мутагенеза» . Нат Коммун . 9 (1): 3315. Бибкод : 2018NatCo...9.3315B . дои : 10.1038/s41467-018-05748-7 . ПМК 6098099 . ПМИД 30120239 .

[84] Самбандан С., Акбалик Г., Кохен Л., Ринне Дж., Кальстат Дж., Глок С., Тушев Г., Альварес-Кастелао Б., Хекель А., Шуман Э.М. (2017). «Зависимое от активности пространственно локализованное созревание микроРНК в дендритах нейронов». Наука . 355 (6325): 634–637. Бибкод : 2017Sci...355..634S . doi : 10.1126/science.aaf8995 . ПМИД 28183980 . S2CID 17159252 .

[85] Бун Р.А., Хофманн П., Михалик К.М., Лозано-Видал Н., Бергхаузер Д., Фишер А., Кнау А., Джае Н., Шурманн С., Диммелер С. (2016). «Длинная некодирующая РНК Meg3 контролирует старение эндотелиальных клеток и влияет на функции регенеративного ангиогенеза» . Дж Ам Колл Кардиол . 68 (23): 2589–2591. дои : 10.1016/j.jacc.2016.09.949 . ПМИД 27931619 .

[86] Михалик К.М., Ю Х, Манавски Ю., Доддабаллапур А., Цорниг М., Браун Т., Джон Д., Пономарева Ю., Чен В., Учида С., Бун Р.А., Диммелер С. (2014). «Длинная некодирующая РНК MALAT1 регулирует функцию эндотелиальных клеток и рост сосудов» . Цир Рес . 114 (9): 1389–1397. дои : 10.1161/circresaha.114.303265 . ПМИД 24602777 .

[87] Кремер С., Михалик К.М., Фишер А., Пфистерер Л., Хаэ Н., Винтер С., Бун Р.А., Мухли-Рейнхольц М., Джон Д., Учида С., Вебер С., Поллер В., Гюнтер С., Браун Т., Ли Д.И., Мегдефессель Л., Матич Перишич Л., Хедин У., Зенляйн О., Зейхер А., Диммелер С. (2019). «Гематопоэтический дефицит длинной некодирующей РНК MALAT1 способствует атеросклерозу и воспалению бляшек» . Тираж . 139 (10): 1320–1334. дои : 10.1161/circulationaha.117.029015 . ПМИД 30586743 . S2CID 58561771 .

[88] Нагель Г., Селлас Т., Хун В., Катерия С., Адеишвили Н., Бертольд П., Оллиг Д., Хегеманн П., Бамберг Э. (2003). «Канал родопсин-2, катион-селективный мембранный канал с прямым светом» . Proc Natl Acad Sci США . 100 (24): 13940–5. Бибкод : 2003PNAS..10013940N . дои : 10.1073/pnas.1936192100 . ПМЦ 283525 . ПМИД 14615590 .

[89] Бойден Э.С., Чжан Ф., Бамберг Э., Нагель Г., Дейссерот К. (2005). «Генетически целенаправленный оптический контроль нейронной активности в миллисекундном масштабе». Нат Нейроски . 8 (9): 1263–1268. дои : 10.1038/nn1525 . ПМИД 16116447 . S2CID 6809511 .

[90] Фельдбауэр К., Циммерманн Д., Пинчовиус В., Шпиц Дж., Баманн С., Бамберг Э. (2009). «Каналродопсин-2 — это протонный насос с утечкой» . Proc Natl Acad Sci США . 106 (30): 12317–12322. Бибкод : 2009PNAS..10612317F . дои : 10.1073/pnas.0905852106 . ПМК 2718366 . ПМИД 19590013 .

[91] Лоренц-Фонфриа В.А., Реслер Т., Краузе Н., Нак М., Госсинг М., Фишер фон Моллард Г., Баманн С., Бамберг Е., Шлезингер Р., Хеберле Дж. (2013). «Транзиторные изменения протонирования в канальном родопсине-2 и их значение для открытия каналов» . Proc Natl Acad Sci США . 110 (14): E1273-81. Бибкод : 2013PNAS..110E1273L . дои : 10.1073/pnas.1219502110 . ПМЦ 3619329 . ПМИД 23509282 .

[92] Нойманн-Верхуфен М.К., Нойманн К., Баманн С., Раду И., Хеберле Дж., Бамберг Э., Вахтвейтль Дж. (2013). «Сверхбыстрая инфракрасная спектроскопия канального родопсина-2 обнаруживает эффективную передачу энергии от хромофора сетчатки к белку». J Am Chem Soc . 135 (18): 6968–6976. дои : 10.1021/Ja400554y . ПМИД 23537405 .

[93] Кляйнлогель С., Терпиц У., Легрум Б., Гокбугет Д., Бойден Э.С., Баманн С., Вуд П.Г., Бамберг Е. (2011). «Стратегия слияния генов для стехиометрической и колокализованной экспрессии светозависимых мембранных белков». Нат-методы . 8 (12): 1083–1088. дои : 10.1038/nmeth.1766 . ПМИД 22056675 . S2CID 11567708 .

[94] Чжан Ф., Ван Л.П., Браунер М., Ливальд Дж.Ф., Кей К., Вацке Н., Вуд П.Г., Бамберг Э., Нагель Г., Готшалк А., Дейссерот К. (2007). «Мультимодальный быстрый оптический опрос нейронных цепей». Природа . 446 (7136): 633–9. Бибкод : 2007Natur.446..633Z . дои : 10.1038/nature05744 . ПМИД 17410168 . S2CID 4415339 .

[95] Орант А, Шультейс С, Толстенков О, Эрбгут К, Нагпал Дж, Хайн Д, Браунер М, Вабниг С, Стойер Коста В, МакВиртер РД, Зелс С, Палумбос С, Миллер III DM, Битс I, Готшалк А (2018). «Ощущение еды модулирует локомоцию посредством передачи сигналов дофамина и нейропептидов в распределенной нейронной сети» . Нейрон . 100 (6): 1414–1428. дои : 10.1016/j.neuron.2018.10.024 . ПМИД 30392795 .

[96] Стирман Дж. Н., Крейн М. М., Хассон С. Дж., Вабниг С., Шультейс С., Готшалк А., Лу Х (2011). «Мультимодальный оптический контроль в реальном времени нейронов и мышц свободно ведущих себя Caenorhabditis elegans» . Нат-методы . 8 (2): 153–8. дои : 10.1038/nmeth.1555 . ПМК 3189501 . ПМИД 21240278 .

[97] Ливальд Дж. Ф., Браунер М., Стивенс Г. Дж., Бухур М., Шультайс С., Жен М., Готшалк А. (2008). «Оптогенетический анализ синаптической функции». Нат-методы . 5 (10): 895–902. дои : 10.1038/nmeth.1252 . ПМИД 18794862 . S2CID 17102550 .

[98] Киттельманн М, Ливальд Дж. Ф., Хегерманн Дж., Шультайс К., Браунер М., Стойер Коста В., Вабниг С., Элмер С., Готшалк А. (2013). «Восстановление синапсов in vivo после оптогенетической гиперстимуляции» . Proc Natl Acad Sci США . 110 (32): Е3007-16. Бибкод : 2013PNAS..110E3007K . дои : 10.1073/pnas.1305679110 . ПМЦ 3740886 . ПМИД 23878262 .

[99] Азими Хашеми Н, Бергс АС, Шулер С, Шейве АР, Стойер Коста В, Бах М, Ливальд Й.Ф., Готшалк А (2019). «Инструменты визуализации напряжения на основе родопсина для использования в мышцах и нейронах Caenorhabditis elegans» . Proc Natl Acad Sci США . 116 (34): 17051–17060. Бибкод : 2019PNAS..11617051A . дои : 10.1073/pnas.1902443116 . ПМК 6708366 . ПМИД 31371514 .

[100] Азими Хашеми Н., Эрбгут К., Фогт А., Рименспергер Т., Раух Э., Вудманси Д., Нагпал Дж., Браунер М., Шевес М., Фиала А., Каттнер Л., Траунер Д., Хегеманн П., Готшальк А., Ливальд Дж. Ф. (2014). «Синтетические аналоги сетчатки изменяют спектральные и кинетические характеристики микробных оптогенетических инструментов родопсина» . Нат Коммун . 5 : 5810. Бибкод : 2014NatCo...5.5810A . дои : 10.1038/Ncomms6810 . ПМИД 25503804 .

[101] Гао С.К., Нагпал Дж., Шнайдер М.В., Козьяк-Павлович В., Нагель Г., Готшалк А. (2015). «Оптогенетическое манипулирование цГМФ в клетках и животных с помощью жестко регулируемого светом гуанилилциклазного опсина CyclOp» . Нат Коммун . 6 : 8046. Бибкод : 2015NatCo...6.8046G . дои : 10.1038/ncomms9046 . ПМЦ 4569695 . ПМИД 26345128 .

[102] Верхуфен М.К., Баманн С., Блёхер Р., Фёрстер У., Бамберг Э., Вахтвейтль Дж. (2010). «Фотоцикл каналородопсина-2: динамика сверхбыстрой реакции и последующие этапы реакции». ХимияФизХим . 11 (14): 3113–22. дои : 10.1002/cphc.201000181 . ПМИД 20730849 .

[103] Volkov O, Kovalev K, Polovinkin V, Borshchevskiy V, Bamann C, Astashkin R, Marin E, Popov A, Balandin T, Willbold D, Buldt G, Bamberg E, Gordeliy V (2017). "Structural insights into ion conduction by channelrhodopsin 2" . Science . 358 (6366): eaan8862. doi : 10.1126/science.aan8862 . PMID 29170206 .

[104] Кляйнлогель С., Фельдбауэр К., Демпски Р.Э., Фотис Х., Вуд П.Г., Баманн С., Бамберг Э. (2011). «Сверхсветочувствительная и быстрая активация нейронов с помощью Ca(2+)-проницаемого канала родопсина CatCh» (PDF) . Нат Нейроски . 14 (4): 513–8. дои : 10.1038/nn.2776 . ПМИД 21399632 . S2CID 5907240 .

[105] Беккер-Бальдус Дж., Баманн С., Саксена К., Густманн Х., Браун Л.Дж., Браун Р.К., Райтер С., Бамберг Е., Вахтвейтль Дж., Швальбе Х., Глаубиц К. (2015). «Просветление фотоактивного сайта каналородопсина-2 с помощью твердотельной ЯМР-спектроскопии с усилением ДНП» . Proc Natl Acad Sci США . 112 (32): 9896–901. Бибкод : 2015PNAS..112.9896B . дои : 10.1073/pnas.1507713112 . ПМЦ 4538646 . ПМИД 26216996 .

[106] Баманн С., Бамберг Э., Вахтвейтль Дж., Глаубиц С. (2014). «Протеородопсин» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — Биоэнергетика . 1837 (5): 614–25. дои : 10.1016/j.bbabio.2013.09.010 . ПМИД 24060527 .

[107] Мао Дж. Ф., До Н. Н., Шольц Ф., Реджи Л., Мелер М., Лакатос А., Онг Ю. С., Ульрих С. Дж., Браун Л. Дж., Браун Р. К., Беккер-Бальдус Дж., Вахтвейтль Дж., Глаубиц С. (2014). «Структурная основа переключения зелено-синего цвета в протеородопсине, определенная методом ЯМР-спектроскопии». J Am Chem Soc . 136 (50): 17578–17590. дои : 10.1021/ja5097946 . ПМИД 25415762 .

[108] Мачейко Дж., Мелер М., Каур Дж., Либлейн Т., Моргнер Н., Уари О., Тордо П., Беккер-Бальдус Дж., Глаубиц С. (2015). «Визуализация специфических межпротомерных взаимодействий в гомоолигомерном мембранном белке протеородопсине с помощью твердотельного ЯМР с усилением динамической ядерной поляризации». J Am Chem Soc . 137 (28): 9032–9043. дои : 10.1021/jacs.5b03606 . ПМИД 26102160 .

[109] Мачейко Дж., Каур Дж., Беккер-Бальдус Дж., Глаубиц С. (2019). «Фотоциклозависимые конформационные изменения в кросс-протомерной триаде протеородопсина Asp-His-Trp, выявленные с помощью MAS-ЯМР с усилением DNP» . Proc Natl Acad Sci США . 116 (17): 8342–8349. Бибкод : 2019PNAS..116.8342M . дои : 10.1073/pnas.1817665116 . ПМК 6486740 . ПМИД 30948633 .

[110] Хемпельманн Ф., Хельпер С., Верхуфен М.К., Вернер А.С., Келер Т., Фидлер С.А., Пфлегер Н., Вахтвейтль Дж., Глаубиц К. (2011). «Кластер His75-Asp97 в зеленом протеородопсине». J Am Chem Soc . 133 (12): 4645–4654. дои : 10.1021/ja111116a . ПМИД 21366243 .

[111] Мелер М., Эккерт CE, Лидер А.Дж., Каур Дж., Фишер Т., Кубатова Н., Браун Л.Дж., Браун Р.К., Беккер-Бальдус Дж., Вахтвейтль Дж., Глаубиц С. (2017). «Хромофорные искажения в фотопромежуточных продуктах протеородопсина, визуализированные с помощью твердотельного ЯМР с усилением ядерной поляризации» (PDF) . J Am Chem Soc . 139 (45): 16143–16153. дои : 10.1021/jacs.7b05061 . ПМИД 29027800 .

[112] Азими Хашеми Н., Эрбгут К., Фогт А., Рименспергер Т., Раух Э., Вудманси Д., Нагпал Дж., Браунер М., Шевес М., Фиала А., Каттнер Л., Траунер Д., Хегеманн П., Готшальк А., Льевальд Дж. Ф. (2014). «Синтетические аналоги сетчатки изменяют спектральные и кинетические характеристики микробных оптогенетических инструментов родопсина» . Нат Коммун . 5 : 5810. Бибкод : 2014NatCo...5.5810A . дои : 10.1038/Ncomms6810 . ПМИД 25503804 .

[113] Гао С.К., Нагпал Дж., Шнайдер М.В., Козьяк-Павлович В., Нагель Г., Готшалк А. (2015). «Оптогенетическое манипулирование цГМФ в клетках и животных с помощью жестко регулируемого светом гуанилилциклазного опсина CyclOp» . Нат Коммун . 6 : 8046. Бибкод : 2015NatCo...6.8046G . дои : 10.1038/ncomms9046 . ПМЦ 4569695 . ПМИД 26345128 .

[114] Хассон С.Дж., Стойер Коста В., Вабниг С., Стирман Дж.Н., Уотсон Дж.Д., Спенсер В.К., Акербум Дж., Лугер Л.Л., Трейнин М., Миллер Д.М. 3-й, Лу Х., Готшалк А. (2012). «Оптогенетический анализ ноцицепторного нейрона и сети обнаруживает ионные каналы, действующие ниже первичных сенсоров» . Курр Биол . 22 (9): 743–52. дои : 10.1016/j.cub.2012.02.066 . ПМК 3350619 . ПМИД 22483941 .

[115] Орант А, Шультейс С, Толстенков О, Эрбгут К, Нагпал Дж, Хайн Д, Браунер М, Вабниг С, Стойер Коста В, МакВиртер РД, Зелс С, Палумбос С, Миллер III DM, Битс I, Готшалк А (2018). «Ощущение еды модулирует локомоцию посредством передачи сигналов дофамина и нейропептидов в распределенной нейронной сети» . Нейрон . 100 (6): 1414–1428.e10. дои : 10.1016/j.neuron.2018.10.024 . ПМИД 30392795 .

[116] Стойер Коста В, Ван дер Аувера П, Глок С, Ливальд Дж. Ф., Бах М, Шулер С, Вабниг С, Орант А, Масурат Ф, Брингманн Х, Шуфс Л, Стельцер Э., Фишер СК, Готшалк А (2019). «ГАМКергический и пептидергический нейрон сна как стоп-нейрон локомоции с разделенной динамикой Ca2+» . Нат Коммун . 10 (1): 4095. Бибкод : 2019NatCo..10.4095S . дои : 10.1038/s41467-019-12098-5 . ПМК 6736843 . ПМИД 31506439 .

[117] Бафф MC, Шефер Ф, Вульффен Б, Мюллер Дж, Петч Б, Хекель А, Майер Г (2010). «Зависимость активности аптамеров от противоположных концевых расширений: повышение эффективности светорегуляции» . Нуклеиновые кислоты Рез . 38 (6): 2111–8. дои : 10.1093/nar/gkp1148 . ПМЦ 2847219 . ПМИД 20007153 .

[118] Джоши К.Б., Влахос А., Микат В., Деллер Т., Хекель А. (2012). «Светоактивируемые молекулярные маяки с последовательностью замкнутой петли». Хим Коммун . 48 (22): 2746–8. дои : 10.1039/c2cc16654b . ПМИД 22159276 .

[119] Лотц Т.С., Халбриттер Т., Кайзер С., Рудольф М.М., Краус Л., Грохер Ф., Стейнванд С., Вахтвейтль Дж., Хекель А., Зюсс Б. (2019). «Светочувствительный РНК-аптамер производного азобензола» . Нуклеиновые кислоты Рез . 47 (4): 2029–2040. дои : 10.1093/nar/gky1225 . ПМК 6393235 . ПМИД 30517682 .

[120] Рорбах Ф., Шефер Ф., Фихте М.А., Пфайффер Ф., Мюллер Дж., Петч Б., Хекель А., Майер Г. (2013). «Клетка под управлением аптамера для селективной маскировки белковых доменов». Международное издание «Прикладная химия» . 52 (45): 11912–11915. дои : 10.1002/anie.201306686 . ПМИД 24127310 .

[121] Сейфрид П., Эйден Л., Гребеновский Н., Майер Г., Хекель А. (2017). «Фотопривязки для (мульти)циклического конформационного каркаса длинных олигонуклеотидов». Angewandte Chemie, международное издание . 56 (1): 359–363. дои : 10.1002/anie.201610025 . ПМИД 27897376 .

[122] Кейхани С., Голдау Т., Блюмлер А., Хекель А., Швальбе Х. (2018). «Хемо-ферментативный синтез РНК, модифицированной по положению, для биофизических исследований, включая контроль света и ЯМР-спектроскопию». Angewandte Chemie, международное издание . 57 (37): 12017–12021. дои : 10.1002/anie.201807125 . ПМИД 30007102 . S2CID 51629476 .

[123] Хелмлинг С., Клетцнер Д.П., Сохор Ф., Муни Р.А., Вакер А., Ландик Р., Фюртиг Б., Хекель А., Швальбе Х (2018). «Время жизни метастабильных состояний управляет регуляторной передачей сигналов в транскрипционных рибопереключателях» . Нат Коммун . 9 (1): 944. Бибкод : 2018NatCo...9..944H . дои : 10.1038/s41467-018-03375-w . ПМЦ 5838219 . ПМИД 29507289 .

[124] Штайнерт Х.С., Шефер Ф., Йонкер Х.Р., Хекель А., Швальбе Х. (2014). «Влияние абсолютной конфигурации цитозина, содержащего NPE, на стабильность одной пары оснований ДНК». Angewandte Chemie, международное издание . 53 (4): 1072–1075. дои : 10.1002/anie.201307852 . ПМИД 24339185 .

[125] Шефер Ф., Джоши К.Б., Фихте М.А., Мак Т., Вахтвейтль Дж., Хекель А. (2011). «Селективное по длине волны освобождение остатков dA и dC». Орг. письмо . 13 (6): 1450–3. дои : 10.1021/ol200141v . ПМИД 21341754 .

[126] Фихте М.А., Вейель Х.М., Юнек С., Шефер Ф., Хербиво С., Гольднер М., Шпехт А., Вахтвейтль Дж., Хекель А. (2016). «Трехмерный контроль гибридизации ДНК путем ортогонального двухцветного двухфотонного разблокирования». Angewandte Chemie, международное издание . 55 (31): 8948–8952. дои : 10.1002/anie.201603281 . ПМИД 27294300 .

[127] Беккер Ю, Унгер Э, Фихте М.А., Гацек Д.А., Дреу А., Вахтвейтль Дж., Уолла П.Дж., Хекель А. (2018). «Смещенная в красную сторону группа клеток, содержащая только два фотона, для трехмерного фотовысвобождения» . Химическая наука . 9 (10): 2797–2802. дои : 10.1039/c7sc05182d . ПМЦ 5914290 . ПМИД 29732066 .

[128] Теварпадам Дж., Бесси И., Бинас О., Гонсалвес Д.П., Славов С., Йонкер Х.Р., Рихтер С., Вахтвейтль Дж., Швальбе Х., Хекель А. (2016). «Фотореактивное образование межмолекулярного минимального мотива G-квадруплекса». Angewandte Chemie, международное издание . 55 (8): 2738–2742. дои : 10.1002/anie.201510269 . ПМИД 26805928 .

[129] Самбандан С., Акбалик Г., Кохен Л., Ринне Дж., Кальстат Дж., Глок С., Тушев Г., Альварес-Кастелао Б., Хекель А., Шуман Э.М. (2017). «Зависимое от активности пространственно локализованное созревание микроРНК в дендритах нейронов». Наука . 355 (6325): 634–637. Бибкод : 2017Sci...355..634S . doi : 10.1126/science.aaf8995 . ПМИД 28183980 . S2CID 17159252 .

[130] Лукас Т., Шефер Ф., Мюллер П., Эмиг С., Хекель А., Диммелер С. (2017). «Светоиндуцируемая антимиР-92а как терапевтическая стратегия, способствующая восстановлению кожи у мышей с диабетом, у которых нарушено заживление» . Нат Коммун . 8 : 15162. Бибкод : 2017NatCo...815162L . дои : 10.1038/ncomms15162 . ПМЦ 5418571 . ПМИД 28462946 .

[131] Акерманн Д., Шмидт Т.Л., Ханнам Дж.С., Пурохит К.С., Хекель А., Фамулок М. (2010). «Двухцепочечная ДНК ротаксан». Нат Нанотехнол . 5 (6): 436–42. Бибкод : 2010НатНа...5..436А . дои : 10.1038/nnano.2010.65 . ПМИД 20400967 .

[132] Гребеновский Н., Гольдау Т., Болте М., Хекель А. (2018). «Световая регуляция димеризации миникольца ДНК с помощью азобензольных С-нуклеозидов». Химия: Европейский журнал . 24 (14): 3425–3428. дои : 10.1002/chem.201706003 . ПМИД 29418024 .

[133] Шмидт Т.Л., Кеппель М.Б., Теварпадам Дж., Гонсалвес Д.П., Хекель А. (2011). «Световой триггер для нанотехнологий ДНК». Маленький . 7 (15): 2163–7. дои : 10.1002/smll.201100182 . ПМИД 21638782 .

[134] Рейнинг А, Нозинович С, Шлепков К, Бур Ф, Фюртиг Б, Швальбе Х (2013). «Трехуровневый механизм связывает лиганд и измерение температуры в рибопереключателях». Природа . 499 (7458): 355–9. Бибкод : 2013Natur.499..355R . дои : 10.1038/Nature12378 . ПМИД 23842498 . S2CID 4414719 .

[135] Дидерихс Т., Пью Г., Дори А., Син Ю., Бернс-младший, Хунг Нгуен К., Торнов М., Тампе Р., Ховорка С. (2019). «Синтетические белково-проводящие мембранные нанопоры, построенные из ДНК» . Нат Коммун . 10 (1): 5018. Бибкод : 2019NatCo..10.5018D . дои : 10.1038/s41467-019-12639-y . ПМК 6828756 . PMID 31685824 .

[136] Грюнвальд К., Шульце К., Райхель А., Вайс В.Ю., Блаас Д., Пилер Дж., Висмюллер К.Х., Тампе Р. (2010). «Сборка макромолекулярных комплексов in situ, запускаемая светом» . Proc Natl Acad Sci США . 107 (14): 6146–6151. Бибкод : 2010PNAS..107.6146G . дои : 10.1073/pnas.0912617107 . ПМК 2852015 . ПМИД 20200313 .

[137] Кляйн А., Хэнк С., Раульф А., Йост Э.Ф., Тиссен Ф., Хайлеманн М., Винеке Р., Тампе Р. (2018). «Метка эндогенных белков живыми клетками с нанометровой точностью трансдуцированными нанотелами» . Химическая наука . 9 (40): 7835–7842. дои : 10.1039/C8SC02910E . ПМК 6194584 . ПМИД 30429993 .

[138] Коллманнспергер А, Шарей А, Раульф А, Хайлеманн М, Лангер Р, Йенсен КФ, Винеке Р, Тампе Р (2016). «Маркировка белков живых клеток с нанометровой точностью путем сжатия клеток» . Нат Коммун . 7 : 10372. Бибкод : 2016NatCo...710372K . дои : 10.1038/ncomms10372 . ПМК 4740111 . ПМИД 26822409 .

[139] Винеке Р., Раульф А., Коллманнспергер А., Хайлеманн М., Тампе Р. (2015). «Маленькая пара меток для визуализации одиночных молекул со сверхвысоким разрешением». Angewandte Chemie, международное издание . 54 (35): 10216–9. дои : 10.1002/anie.201503215 . ПМИД 26201868 .

[140] Гаттердам В., Рамадасс Р., Штесс Т., Фихте М.А., Вахтвейтль Дж., Хекель А., Тампе Р. (2014). «Трехмерные белковые сети, собранные путем двухфотонной активации». Angewandte Chemie, международное издание . 53 (22): 5680–5684. дои : 10.1002/anie.201309930 . ПМИД 24729568 .

[141] Бранер М., Коллер Н., Кнауэр Дж., Хербринг В., Хэнк С., Винеке Р., Тампе Р. (2019). «Оптический контроль транслокации антигена с помощью синтетических фотоусловных вирусных ингибиторов» . Химическая наука . 10 (7): 2001–2005. дои : 10.1039/c8sc04863k . ПМК 6385481 . ПМИД 30881629 .

[142] Гаевски Дж., Бюэленс Ф., Сердюков С., Янсен М., Кортина Н., Грубмюллер Х., Гринингер М. (2017). «Инженерия синтаз жирных кислот для направленного производства поликетидов». Nat Chem Biol . 13 (4): 363–365. дои : 10.1038/nchembio.2314 . hdl : 11858/00-001M-0000-002C-8359-6 . ПМИД 28218912 .

[143] Гаевски Дж., Павлович Р., Фишер М., Болес Э., Гринингер М. (2017). «Инженерный синтез жирных кислот de novo грибами для производства короткоцепочечных жирных кислот» . Нат Коммун . 8 : 14650. Бибкод : 2017NatCo...814650G . дои : 10.1038/ncomms14650 . ПМЦ 5353594 . ПМИД 28281527 .

[144] Штаудт Х, Хёсл М.Г., Дреу А., Сердюков С., Остерхельт Д., Будиса Н., Вахтвейтль Дж., Гринингер М. (2013). «Направленное манипулирование фотоциклом флавопротеинов». Angewandte Chemie, международное издание . 52 (32): 8463–6. дои : 10.1002/anie.201302334 . ПМИД 23818044 .

[145] «Метод года 2015» . Природные методы . 13 (1): 1 января 2016 г. doi : 10.1038/nmeth.3730 . ПМИД 27110621 .

[146] «Нобелевская премия по химии 2017» . Проверено 9 марта 2020 г.

[147] Аллегретти М., Клюш Н., Миллс DJ, Вонк Дж., Кюльбрандт В., Дэвис К.М. (2015). «Горизонтальные мембранные альфа-спирали в статорной a-субъединице АТФ-синтазы F-типа». Природа . 521 (7551): 237–40. Бибкод : 2015Natur.521..237A . дои : 10.1038/nature14185 . ПМИД 25707805 . S2CID 205242498 .

[148] Ельцов М., Дубе Н., Ю З., Пасакарнис Л., Хазельманн-Вайс У., Бруннер Д., Франгакис А.С. (2015). «Количественный анализ реорганизации цитоскелета при уплотнении эпителиальной ткани методом крупнообъемной электронной томографии». Nat Cell Biol . 17 (5): 605–14. дои : 10.1038/ncb3159 . ПМИД 25893916 . S2CID 6543151 .

[149] Нейер С., Кунц М., Гейсс С., Ханче М., Ходирнау В.В., Зейберт А., Энгель С., Шеффер М.П., Крамер П., Франгакис А.С. (2016). «Структура РНК-полимеразы I, транскрибирующей гены рибосомальной ДНК». Природа . 540 (7634): 607–610. Бибкод : 2016Natur.540..607N . дои : 10.1038/nature20561 . ПМИД 27842382 . S2CID 205252425 .

[150] Хан А., Вонк Дж., Миллс DJ, Мейер Т., Кюльбрандт В. (2018). «Структура, механизм и регуляция АТФ-синтазы хлоропластов» . Наука . 360 (6389): 620. doi : 10.1126/science.aat4318 . ПМК 7116070 . ПМИД 29748256 .

[151] Хофманн С., Джанулиен Д., Мехдипур А.Р., Томас С., Стефан Э., Брюхерт С., Кун Б.Т., Гертсма Э.Р., Хаммер Г., Тампе Р., Мёллер А. (2019). «Конформационное пространство гетеродимерного ABC-экспортера в условиях оборота» . Природа . 571 (7766): 580–583. дои : 10.1038/s41586-019-1391-0 . ПМЦ 7612745 . ПМИД 31316210 . S2CID 197543295 .

[152] Фаруки А.Р., Хендерсон Р. (2007). «Электронные детекторы для электронной микроскопии». Курс. Мнение. Структура. Биол . 17 (5): 549–55. дои : 10.1016/j.sbi.2007.08.014 . ПМИД 17913494 .

[153] Кюльбрандт В (2014). «Революция разрешения». Наука . 343 (6178): 1443–1444. Бибкод : 2014Sci...343.1443K . дои : 10.1126/science.1251652 . ПМИД 24675944 . S2CID 35524447 .

[154] Ельцов М., Дубе Н., Ю З., Пасакарнис Л., Хазельманн-Вайс У., Бруннер Д., Франгакис А.С. (2015). «Количественный анализ реорганизации цитоскелета при уплотнении эпителиальной ткани методом крупнообъемной электронной томографии». Nat Cell Biol . 17 (5): 605–14. дои : 10.1038/ncb3159 . ПМИД 25893916 . S2CID 6543151 .

[155] Келлер П.Дж., Шмидт А.Д., Сантелла А., Хайри К., Бао З., Виттбродт Дж., Стельцер Э.Х. (2010). «Быстрая высококонтрастная визуализация развития животных с помощью сканирующей световой микроскопии со структурированным освещением» . Нат-методы . 7 (8): 637–642. дои : 10.1038/nmeth.1476 . ПМЦ 4418465 . ПМИД 20601950 .

[156] Стельцер Э.Х. (2015). «Световая флуоресцентная микроскопия для количественной биологии». Нат-методы . 12 (1): 23–26. дои : 10.1038/nmeth.3219 . ПМИД 25549266 . S2CID 34063754 .

[157] «Метод года 2014» . Природные методы . 12 (1): 1. 2015. doi : 10.1038/nmeth.3251 . ПМИД 25699311 .

[158] Штробль Ф., Шмитц А., Стельцер Э.Х. (2015). «Живое изображение эмбрионального развития Tribolium castaneum с использованием световой флуоресцентной микроскопии». Нат Проток . 10 (10): 1486–1507. дои : 10.1038/нпрот.2015.093 . ПМИД 26334868 . S2CID 24774566 .

[159] Штробль Ф., Шмитц А., Штельцер Э.Х. (2017). «Улучшение четырехмерного изображения: путешествие через десятилетие исследований флуоресцентной микроскопии на основе световых листов». Нат Проток . 12 (6): 1103–1109. дои : 10.1038/нпрот.2017.028 . ПМИД 28471459 . S2CID 38354456 .

[160] фон Вангенхайм Д., Фангерау Дж., Шмитц А., Смит Р.С., Лейтте Х., Стельцер Э.Х., Майзель А. (2016). «Правила и свойства самоорганизации постэмбриональных моделей деления клеток органов растений» . Курр Биол . 26 (4): 439–449. дои : 10.1016/j.cub.2015.12.047 . hdl : 11858/00-001M-0000-002B-1640-B . ПМИД 26832441 .

[161] Мэтью Б., Шмитц А., Муньос-Дескальсо С., Ансари Н., Пампалони Ф., Стельцер Э.Х., Фишер С.С. (2015). «Надежная и автоматизированная трехмерная сегментация плотно упакованных ядер клеток в различных биологических образцах с разложением по лучам видимости» . БМК Биоинформатика . 16 : 187. дои : 10.1186/s12859-015-0617-x . ПМЦ 4458345 . ПМИД 26049713 .

[162] Шмитц А., Фишер С.К., Маттейер С., Пампалони Ф., Стельцер Э.Х. (2017). «Многомасштабный анализ изображений выявляет структурную гетерогенность клеточного микроокружения в гомотипических сфероидах» . Научный представитель . 7 : 43693. Бибкод : 2017NatSR...743693S . дои : 10.1038/srep43693 . ПМК 5334646 . ПМИД 28255161 .

[163] Венкатарамани В., Хермансдорфер Ф., Хайлеманн М., Кунер Т. (2016). «SuReSim: моделирование экспериментов по локализационной микроскопии на основе реальных моделей». Нат-методы . 13 (4): 319–321. дои : 10.1038/Nmeth.3775 . ПМИД 26928761 . S2CID 3776898 .

[164] ван Вейк С.Дж., Фрике Ф., Херхаус Л., Гупта Дж., Хётте К., Пампалони Ф., Грумати П., Каулич М., Соу Ю.С., Комацу М., Гретен Ф.Р., Фульда С., Хайлеманн М., Дикич И. (2017). «Линейное убиквитинирование цитозольной Salmonella Typhimurium активирует NF-κB и ограничивает пролиферацию бактерий». Нат Микробиол . 2 (7):17066.doi : 10.1038 /nmicrobiol.2017.66 . ПМИД 28481361 . S2CID 1329736 .

[165] Грумати П., Мороцци Г., Холпер С., Мари М., Харвардт М.И., Ян Р., Мюллер С., Реджиори Ф., Хайлеманн М., Дикич И. (2017). «Полноразмерный RTN3 регулирует оборот канальцевой эндоплазматической сети посредством селективной аутофагии» . электронная жизнь . 6 : е25555. дои : 10.7554/eLife.25555 . ПМК 5517149 . ПМИД 28617241 .

[166] Винеке Р., Раульф А., Коллманнспергер А., Хайлеманн М., Тампе Р. (2015). «Маленькая пара меток для визуализации одиночных молекул со сверхвысоким разрешением». Angewandte Chemie, международное издание . 54 (35): 10216–9. дои : 10.1002/anie.201503215 . ПМИД 26201868 .

[167] Коллманнспергер А, Шарей А, Раульф А, Хайлеманн М, Лангер Р, Йенсен КФ, Винеке Р, Тампе Р (2016). «Маркировка белков живых клеток с нанометровой точностью путем сжатия клеток» . Нат Коммун . 7 : 10372. Бибкод : 2016NatCo...710372K . дои : 10.1038/ncomms10372 . ПМК 4740111 . ПМИД 26822409 .

[168] Прандолини М.Дж., Денисенков В.П., Гафуров М., Эндевард Б., Приснер Т.Ф. (2009). «Сильнополевая динамическая ядерная поляризация в водных растворах». J Am Chem Soc . 131 (17): 6090–2. дои : 10.1021/ja901496g . ПМИД 19361195 .

[169] Джодике Л., Мао Дж., Куэнце Г., Рейнхарт С., Калавакерла Т., Йонкер Х.Р., Рихтер С., Швальбе Х., Мейлер Дж., Преу Дж., Мишель Х., Глаубиц К. (2018). «Молекулярные основы селективности подтипов человеческих кининовых G-белковых рецепторов» . Nat Chem Biol . 14 (3): 284–290. дои : 10.1038/nchembio.2551 . ПМЦ 7992120 . ПМИД 29334381 .

[170] Ленерт Э., Мао Дж., Мехдипур А.Р., Хаммер Г., Абеле Р., Глаубиц С., Тампе Р. (2016). «Распознавание антигенного пептида на человеческом транспортере ABC TAP, определенное с помощью твердотельной ЯМР-спектроскопии с усилением DNP». J Am Chem Soc . 138 (42): 13967–13974. дои : 10.1021/jacs.6b07426 . ПМИД 27659210 .

[171] Мелер М., Эккерт CE, Лидер А.Дж., Каур Дж., Фишер Т., Кубатова Н., Браун Л.Дж., Браун Р.К., Беккер-Бальдус Дж., Вахтвейтль Дж., Глаубиц С. (2017). «Хромофорные искажения в фотопромежуточных продуктах протеородопсина, визуализированные с помощью твердотельного ЯМР с усилением ядерной поляризации» (PDF) . J Am Chem Soc . 139 (45): 16143–16153. дои : 10.1021/jacs.7b05061 . ПМИД 29027800 .

[172] Крстич И, Гензель Р, Ромаинчик О, Энгельс Й.В., Дётч В., Приснер Т.Ф. (2011). «Измерения нуклеиновых кислот в клетках на больших расстояниях методом импульсной ЭПР-спектроскопии». Angewandte Chemie, международное издание . 50 (22): 5070–5074. дои : 10.1002/anie.201100886 . ПМИД 21506223 .

[173] Барт К., Хэнк С., Спиндлер П.Е., Приснер Т.Ф., Тампе Р., Джозеф Б. (2018). «Конформационное сопряжение и транс-ингибирование в ортологе переносчика антигенов человека TmrAB, выявленное с помощью диполярной ЭПР-спектроскопии». J Am Chem Soc . 140 (13): 4527–4533. дои : 10.1021/jacs.7b12409 . ПМИД 29308886 .

[174] Моргнер Н., Хоффманн Дж., Барт Х.Д., Мейер Т., Брутши Б. (2008). «LILBID-масс-спектрометрия, применяемая для массового анализа РНК-полимеразы II и F1Fo-АТФ-синтазы». Int J Масс-спектр . 277 (1–3): 309–313. Бибкод : 2008IJMSp.277..309M . дои : 10.1016/j.ijms.2008.08.001 .

[175] Хеллвиг Н., Питц О., Ахдаш З., Таскон И., Бут П.Дж., Микусевич В., Дисковски М., Политис А., Хеллмих Ю., Ханельт И., Ридинг Э., Моргнер Н. (2018). «Ативная масс-спектрометрия становится более естественной: исследование мембранных белковых комплексов непосредственно из SMALP» . Хим Коммун . 54 (97): 13702–13705. дои : 10.1039/c8cc06284f . ПМК 6289172 . ПМИД 30452022 .

[176] Питц О, Хеллвиг Н, Хенрих Э, Межирова Й, Дётч В, Бернхард Ф, Моргнер Н (2019). «LILBID и nESI: различные методы местной масс-спектрометрии как инструменты структурной биологии» . J Am Soc Масс-спектр . 30 (1): 181–191. Бибкод : 2019JASMS..30..181P . дои : 10.1007/s13361-018-2061-4 . ПМК 6318263 . ПМИД 30225732 .

[177] Ангерер Х, Шенборн С, Горка Дж, Бахр У, Карас М, Виттиг И, Хайдлер Дж, Хоффманн Дж, Моргнер Н, Цикерманн В (2017). «Ацильная модификация и связывание митохондриальной ACP с мультибелковыми комплексами» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1864 (10): 1913–1920. дои : 10.1016/j.bbamcr.2017.08.006 . ПМИД 28802701 .

[178] Дисковски М., Мехдипур А.Р., Вуннике Д., Миллс Д.Д., Микусевич В., Берланд Н., Хоффманн Дж., Моргнер Н., Стейнхофф Х.Дж., Хаммер Г., Вонк Дж., Ханелт И. (2017). «Спиральные складные ножи управляют воротами двухпоровой системы поглощения K+ KtrAB» . электронная жизнь . 6 : е24303. doi : 10.7554/eLife.24303 . ПМК 5449183 . ПМИД 28504641 .

[179] Хоффманн Дж., Соколова Л., Прейсс Л., Хикс Д.Б., Крулвич Т.А., Моргнер Н., Виттиг И., Шеггер Х., Мейер Т., Брутши Б. (2010). «АТФ-синтазы: клеточные наномоторы, охарактеризованные с помощью масс-спектрометрии LILBID» . Физ хим хим физ . 12 (41): 13375–13382. Бибкод : 2010PCCP...1213375H . дои : 10.1039/c0cp00733a . ПМЦ 2955850 . ПМИД 20820587 .

[180] Мачейко Дж., Мелер М., Каур Дж., Либлейн Т., Моргнер Н., Уари О., Тордо П., Беккер-Бальдус Дж., Глаубиц С. (2015). «Визуализация специфических межпротомерных взаимодействий в гомоолигомерном мембранном белке протеородопсине с помощью твердотельного ЯМР с усилением динамической ядерной поляризации». J Am Chem Soc . 137 (28): 9032–9043. дои : 10.1021/jacs.5b03606 . ПМИД 26102160 .

[181] Коль-Ландграф Дж., Браун М., Озкобан С., Гонсалвес Д.П., Хекель А., Вахтвейтль Дж. (2012). «Сверхбыстрая динамика спиропирана в воде». J Am Chem Soc . 134 (34): 14070–14077. дои : 10.1021/ja304395k . ПМИД 22803805 .

[182] Стейнванд С., Ю З., Хехт С., Вахтвейтль Дж. (2016). «Сверхбыстрая динамика фотоизомеризации и последующего разворачивания олигоазобензольного фолдамера». J Am Chem Soc . 138 (39): 12997–13005. дои : 10.1021/jacs.6b07720 . ПМИД 27598007 .

[183] Фёрстер У., Вейганд Дж. Э., Трояновски П., Зюсс Б., Вахтвейтль Дж. (2012). «Конформационная динамика тетрациклинсвязывающего аптамера» . Нуклеиновые кислоты Рез . 40 (4): 1807–17. дои : 10.1093/nar/gkr835 . ПМК 3287181 . ПМИД 22053085 .

[184] Хэлбриттер Т., Кайзер С., Вахтвейтль Дж., Хекель А. (2017). «Производное пиридина-спиропирана как стойкая обратимая фотокислота в воде». J Орг. хим . 82 (15): 8040–8047. дои : 10.1021/acs.joc.7b01268 . ПМИД 28686024 .

[185] Густманн Х, Сеглер А.Дж., Гофан Д.Б., Ройсс А.Дж., Грюневальд С., Браун М., Вейганд Дж.Е., Сигурдссон С.Т., Вахтвейтль Дж. (2019). «Структурно-ориентированная флуоресцентная маркировка раскрывает двухэтапный механизм связывания неомицина с его РНК-аптамером» . Нуклеиновые кислоты Рез . 47 (1): 15–28. дои : 10.1093/nar/gky1110 . ПМК 6326822 . ПМИД 30462266 .

[186] Хофманн С., Джанулиен Д., Мехдипур А.Р., Томас С., Стефан Э., Брюхерт С., Кун Б.Т., Гертсма Э.Р., Хаммер Г., Тампе Р., Мёллер А. (2019). «Конформационное пространство гетеродимерного ABC-экспортера в условиях оборота» . Природа . 571 (7766): 580–583. дои : 10.1038/s41586-019-1391-0 . ПМЦ 7612745 . ПМИД 31316210 . S2CID 197543295 .

[187] Шин Д., Мукерджи Р., Лю Й., Гонсалес А., Бонн Ф., Лю Й., Рогов В.В., Хайнц М., Штольц А., Хаммер Г., Дётч В., Луо ЗК, Бхогараджу С., Дикич И. (2020). «Регуляция убиквитинирования фосфорибозильно-связанного серина деубиквитиназами DupA и DupB» . Мол Сотовый 77 (1): 164–179.e6. дои : 10.1016/j.molcel.2019.10.019 . ПМК 6941232 . ПМИД 31732457 .

[188] Оказаки К.И., Вёлерт Д., Варнау Дж., Юнг Х., Йилдиз О., Кюльбрандт В., Хаммер Г. (2019). «Механизм электронейтрального натрий / протонного антипортера PaNhaP от стрельбы по переходному пути» . Нат Коммун . 10 (1): 1742. Бибкод : 2019NatCo..10.1742O . дои : 10.1038/s41467-019-09739-0 . ПМК 6465308 . ПМИД 30988359 .

[189] Хальблейб К., Песек К., Ковино Р., Хофбауэр Х.Ф., Вуннике Д., Ханельт И., Хаммер Г., Эрнст Р. (2017). «Активация развернутого белкового ответа стрессом липидного бислоя» . Мол Клетка . 67 (4): 673–684.e8. doi : 10.1016/j.molcel.2017.06.012 . ПМИД 28689662 .

[190] Ленерт Э., Мао Дж., Мехдипур А.Р., Хаммер Г., Абеле Р., Глаубиц С., Тампе Р. (2016). «Распознавание антигенного пептида на человеческом транспортере ABC TAP, определенное с помощью твердотельной ЯМР-спектроскопии с усилением DNP». J Am Chem Soc . 138 (42): 13967–13974. дои : 10.1021/jacs.6b07426 . ПМИД 27659210 .

[191] Кох I ; Шефер Т. (2018). «Супервторичная структура белка и топология четвертичной структуры: теоретическое описание и применение». Современное мнение в области структурной биологии . 50 : 134–143. дои : 10.1016/j.sbi.2018.02.005 . ПМИД 29558676 . S2CID 3991944 .

[192] Буш А., Брюггеманн М., Эберсбергер С., Зарнак К. (2019). «Анализ данных iCLIP: полный конвейер от чтения секвенирования до сайтов связывания RBP» . Методы . 178 : 49–62. дои : 10.1016/j.ymeth.2019.11.008 . ПМИД 31751605 .

[193] Ди Лиддо А., де Оливейра Фрейтас Мачадо С., Фишер С., Эберсбергер С., Хоймюллер А.В., Вейганд Дж.Э., Мюллер-МакНиколл М., Зарнак К. (2019). «Комбинированный вычислительный конвейер для обнаружения кольцевых РНК в раковых клетках человека в условиях гипоксического стресса» . J Мол Клеточная Биол . 11 (10): 829–844. дои : 10.1093/jmcb/mjz094 . ПМК 6884703 . ПМИД 31560396 .

[194] Хаберман Н, Хупперц И, Аттиг Дж, Кениг Дж, Ван З, Хауэр С, Хентце М.В., Кулозик А.Е., Ле Хир Х., Курк Т., Сибли С.Р., Зарнак К., Уле Дж. (2017). «Взгляд на дизайн и интерпретацию экспериментов iCLIP» . Геном Биол . 18 (1): 7. дои : 10.1186/s13059-016-1130-x . ПМК 5240381 . ПМИД 28093074 .

[195] Эйнлофт Дж; Акерманн Дж; Нотен Дж; Кох I (2013). «МонаЛиза — визуализация и анализ функциональных модулей биохимических сетей» . Биоинформатика . 29 (11): 1469–70. doi : 10.1093/биоинформатика/btt165 . ПМИД 23564846 .

[196] Филипп О, Хаманн А, Осевач Х.Д., Кох И. (2017). «Сеть взаимодействия аутофагии модели старения Podospora anserina» . БМК Биоинформатика . 18 (1): 196. дои : 10.1186/s12859-017-1603-2 . ПМК 5369006 . ПМИД 28347269 .

[197] Кох И., Нётен Дж., Шляйфф Э. (2017). «Моделирование метаболизма Arabidopsis thaliana: применение сетевой декомпозиции и сокращения сети в контексте сетей Петри» . Фронт Генет . 8 : 85. дои : 10.3389/fgene.2017.00085 . ПМК 5491931 . ПМИД 28713420 .

[198] Амштайн Л., Акерманн Дж., Шайдель Дж., Фульда С., Дикич И., Кох И. (2017). «Инварианты ламантинов раскрывают функциональные пути в сигнальных сетях» . BMC Сист Биол . 11 (1): 72. дои : 10.1186/s12918-017-0448-7 . ПМЦ 5534052 . ПМИД 28754124 .

[199] Гизе Х., Акерманн Дж., Хайде Х., Блейер Л., Дрозе С., Виттиг И., Брандт У., Кох И. (2015). «NOVA: программное обеспечение для анализа данных профилирования комплексомов» . Биоинформатика . 31 (3): 440–1. doi : 10.1093/биоинформатика/btu623 . ПМИД 25301849 .

[200] Хайде Х., Блейер Л., Стегер М., Акерманн Дж., Дрёзе С., Швамб Б., Цёрниг М., Райхерт А.С., Кох И., Виттиг И., Брандт У. (2012). «Профилирование комплексома идентифицирует TMEM126B как компонент комплекса сборки митохондриального комплекса I» . Клеточные метаб . 16 (4): 538–549. дои : 10.1016/j.cmet.2012.08.009 . ПМИД 22982022 .

[201] «EXC 115: Макромолекулярные комплексы» . База данных GEPRIS Немецкого исследовательского фонда DFG . Проверено 13 марта 2020 г.

[202] «Кластер передовых макромолекулярных комплексов в действии» (PDF) . СЕФ . Проверено 13 марта 2020 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

[ 45 ]

[ 46 ]

[ 47 ]

[ 48 ]

[ 49 ]

[ 50 ]

[ 51 ]

[ 52 ]

[ 53 ]

[ 54 ]

[ 55 ]

[ 56 ]

[ 57 ]

[ 58 ]

[ 59 ]

[ 60 ]

[ 61 ]

[ 62 ]

[ 63 ]

[ 64 ]

[ 65 ]

[ 66 ]

[ 67 ]

[ 68 ]

[ 69 ]

[ 70 ]

[ 71 ]

[ 72 ]

[ 73 ]

[ 74 ]

[ 75 ]

[ 76 ]

[ 77 ]

[ 78 ]

[ 79 ]

[ 80 ]

[ 81 ]

[ 82 ]

[ 83 ]

[ 84 ]

[ 85 ]

[ 86 ]

[ 87 ]

[ 88 ]

[ 89 ]

[ 90 ]

[ 91 ]

[ 92 ]

[ 93 ]

[ 94 ]

[ 95 ]

[ 96 ]

[ 97 ]

[ 98 ]

[ 99 ]

[ 100 ]

v т и Университет Гете во Франкфурте
Colleges	Goethe Business School Graduate School of Economics, Finance, and Management Institute for Law and Finance Otto Stern School for Integrated Doctoral Education
Facilities	AfE-Turm (former) Frankfurt University Library
Related	Center for Financial Studies Frankfurt School Institute for Social Research