Цистовирус

Цистовирус
	Pseudomonas phage phi6 частиц, реконструкция и геном
Классификация вирусов
(не вмешательство):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Orthornavirae
Филум:	Дублировать
Сорт:	Vidaverchiricetes
Заказ:	Mindivirales
Семья:	Cystoviridae
Род:	Цистовирус
Разновидность
	Смотрите текст

Цистовирус является родом двухцепочечных РНК-вирусов , которые заражают бактерии . Это единственный род в семействе Cystoviridae . Название группы C Ysto происходит от греческого kystis , что означает мочевой пузырь или мешок. В этом роде семь видов. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Открытие

Вирус Pseudomonas Phi6 был первым вирусом в этом семействе, который был обнаружен и первоначально был охарактеризован в 1973 году Энн Видавером в Университете Небраски . Она обнаружила, что, когда она культивирует бактериальную штамм Pseudomonas phaseologola hb1oy с гало -гнилом, инфицированной соломой фасоли, цитопатические эффекты были обнаружены в культивируемых газонах, что указывает на то, что присутствовал литический микроб или бактериофаг . ^{[ 4 ]}

В 1999 году PHI7–14 была идентифицирована лабораторией Леонарда Минчича в Научно -исследовательском институте общественного здравоохранения, связанного с Нью -Йоркским университетом . Они сделали это, культивируя различные листья в лизогенном бульоне , а затем покрывая бульон на газонах Pseudomonas syringae pv phaseolola . Они смогли идентифицировать вирусные бляшки из этого, а затем впоследствии последовали свои геномы. ^{[ 5 ]}

Микробиология

Структура

Частицы цистовируса охватываются икосаэдрической и сферической геометрией, а T = 13 , T = 2 симметрия. Диаметр вириона составляет около 85 нм. Цистовирусы отличаются их внешним белком и липидной оболочкой. Ни один другой бактериофаг не имеет никаких липидов во внешнем пальто, хотя Tectiviridae и Corticoviridae имеют липиды в их капсидах . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Геном

Цистовирусы имеют трехсторонний двухцепочечный геном РНК, который составляет приблизительно 14 кбитч в общую длину. Геном является линейным и сегментированным, и помечен как большие (L) 6,4 кбит, среду (M) 4 кбит -кин и небольшие (S) 2,9 т.п.н. длиной. Геном кодирует двенадцать белков. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Жизненный цикл

Цитовирусы попадают в бактерии путем адсорбции на ее пилусе , а затем мембранное слияние. Вирусная репликация является цитоплазматической. Репликация следует за двухцепочечной моделью репликации вируса РНК. Двойной транскрипцию вируса РНК является методом транскрипции. Вирусы потомства высвобождаются из клетки путем лизиса . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Наиболее идентифицированные цистовирусы заражают виды Pseudomonas , но это, вероятно, смещено из -за метода скрининга и обогащения. ^{[ 6 ]} Есть много предлагаемых членов этой семьи. Вирусы Pseudomonas φ7, φ8, φ9, φ10, φ11, φ12 и φ13 были идентифицированы и названы, ^{[ 5 ]} Но другие цистовирусные вирусы также были выделены. ^{[ 6 ]} Эти семь предполагаемых родственников классифицируются как близкие (φ7, φ9, φ10, φ11), либо отдаленные (φ8, φ12, φ13) родственники к φ6, ^{[ 5 ]} с отдаленными родственниками, которые, как полагают, заражают через LPS , а не в PILI. ^{[ 7 ]}

Однако цистовирусы не только заражают псевдомоны . Но также и бактерии родов Streptomyces , ^{[ 8 ]} Microvirgula , ^{[ 9 ]} Acinetobacter , ^{[ 10 ]} Lactococcus , Pectobacterium , ^{[ 11 ]} и, возможно, другие бактериальные роды.

Таксономия

Члены Cystoviridae , по -видимому, наиболее тесно связаны с Reoviridae , ^{[ 12 ]} но также делятся гомологией с Totiviridae . В частности, структурные гены цистовирусов высокопоставлены с генами, используемыми рядом вирусов дцРНК, которые заражают эукариоты. ^{[ 13 ]} Род цистовирус имеет семь видов: ^{[ 1 ]}

Другие незнашиваемые фаги:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и «ICTV сообщает Cystoviridae» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} «Вирусная зона» . Расширение . Получено 15 июня 2015 года .
^ "NCBI таксономия браузер: Cystoviridae" . NCBI . Получено 19 июня 2016 года .
^ Vidaver AK, Koski RK, Van Etten JL (май 1973). «Бактериофаг φ6 липидсодержащий вирус Pseudomonas phaseolicola» . Журнал вирусологии . 11 (15): 799–805. doi : 10.1128/jvi.11.5.799-805.1973 . PMC 355178 . PMID 16789137 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Mindich L, Qiao X, Qiao J, Onodera S, Romantschuk M, Hoogstraten D (август 1999 г.). «Выделение дополнительных бактериофагов с геномами сегментированной двухцепочечной РНК» . J. Bacteriol . 181 (15): 4505–8. doi : 10.1128/jb.181.15.4505-4508.1999 . PMC 103579 . PMID 10419946 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Сайландером ОК, Вайнрайх Д.М., Райт К.М. и соавт. (Декабрь 2005 г.). «Широко распространенный генетический обмен среди наземных бактериофагов» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 102 (52): 19009–14. Bibcode : 2005pnas..10219009S . doi : 10.1073/pnas.0503074102 . PMC 1323146 . PMID 16365305 .
^ Gottlieb P, Potgieter C, Wei H и Toporovsky I (2002). «Характеристика φ12, бактериофаг, связанный с φ6: нуклеотидная последовательность большой двухцепочечной РНК» . Вирусология . 295 (2): 266–271. doi : 10.1006/viro.2002.1436 . PMID 12033785 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Сиддхарт Р. Кришнамурти, Эндрю Б. Джановски, Гуян Чжао, Дэн Баруш, Дэвид Ван (2016). Гиперксансия РНК -бактериофага разнообразия . Плозон.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Xiaoyao Cai, Fengjuan Tian, Li Teng, Hongmei Liu, Yigang Tong, Shuai Le, Tingting Zhang (2021). Культивирование литического двухцепочечного РНК-бактериофага, инфицирующего микровиргулу аэродитрионов, выявляет взаимный паразитный образ жизни . Американское общество по микробиологии.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Клэй С. Криппен, Биби Чжоу и Кристина М. Шимански (2021). РНК и сахара, уникальные свойства бактериофагов, заражающих многосудийную ацинетобактерскую штамм Acinetobacter, LH6 . NCBI.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Cystoviridae . Таксономия NCBI.
^ Мясник С.Дж., Докланд Т., Оджала П.М., Бэмфорд Д.Х., Фуллер С.Д. (июль 1997 г.). «Промежуточные соединения в пути сборки двухцепочечного РНК-вируса Phi6» . Embo j . 16 (14): 4477–87. doi : 10.1093/emboj/16.14.4477 . PMC 1170074 . PMID 9250692 .
^ Кунин, Юджин В.; Dolja, Valerian v.; Крупович, Март (2015). «Происхождение и эволюция вирусов эукариот: конечная модульность» . Вирусология . 479–480: 2–25. doi : 10.1016/j.virol.2015.02.039 . PMC 5898234 . PMID 25771806 .

Внешние ссылки

[ICTVReport-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и «ICTV сообщает Cystoviridae» .

[ViralZone-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} «Вирусная зона» . Расширение . Получено 15 июня 2015 года .

[NCBI-3] "NCBI таксономия браузер: Cystoviridae" . NCBI . Получено 19 июня 2016 года .

[Vidaver_1973-4] Vidaver AK, Koski RK, Van Etten JL (май 1973). «Бактериофаг φ6 липидсодержащий вирус Pseudomonas phaseolicola» . Журнал вирусологии . 11 (15): 799–805. doi : 10.1128/jvi.11.5.799-805.1973 . PMC 355178 . PMID 16789137 .

[Mindich_1999-5] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Mindich L, Qiao X, Qiao J, Onodera S, Romantschuk M, Hoogstraten D (август 1999 г.). «Выделение дополнительных бактериофагов с геномами сегментированной двухцепочечной РНК» . J. Bacteriol . 181 (15): 4505–8. doi : 10.1128/jb.181.15.4505-4508.1999 . PMC 103579 . PMID 10419946 .

[Silander_2005-6] Jump up to: ^а ^{беременный} Сайландером ОК, Вайнрайх Д.М., Райт К.М. и соавт. (Декабрь 2005 г.). «Широко распространенный генетический обмен среди наземных бактериофагов» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 102 (52): 19009–14. Bibcode : 2005pnas..10219009S . doi : 10.1073/pnas.0503074102 . PMC 1323146 . PMID 16365305 .

[Gottleib_2002-7] Gottlieb P, Potgieter C, Wei H и Toporovsky I (2002). «Характеристика φ12, бактериофаг, связанный с φ6: нуклеотидная последовательность большой двухцепочечной РНК» . Вирусология . 295 (2): 266–271. doi : 10.1006/viro.2002.1436 . PMID 12033785 .

[Siddhart-8] Jump up to: ^а ^{беременный} Сиддхарт Р. Кришнамурти, Эндрю Б. Джановски, Гуян Чжао, Дэн Баруш, Дэвид Ван (2016). Гиперксансия РНК -бактериофага разнообразия . Плозон.

[Cai-9] Jump up to: ^а ^{беременный} Xiaoyao Cai, Fengjuan Tian, Li Teng, Hongmei Liu, Yigang Tong, Shuai Le, Tingting Zhang (2021). Культивирование литического двухцепочечного РНК-бактериофага, инфицирующего микровиргулу аэродитрионов, выявляет взаимный паразитный образ жизни . Американское общество по микробиологии.

[crippen-10] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Клэй С. Криппен, Биби Чжоу и Кристина М. Шимански (2021). РНК и сахара, уникальные свойства бактериофагов, заражающих многосудийную ацинетобактерскую штамм Acinetobacter, LH6 . NCBI.

[ncbi-11] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Cystoviridae . Таксономия NCBI.

[Butcher_1997-12] Мясник С.Дж., Докланд Т., Оджала П.М., Бэмфорд Д.Х., Фуллер С.Д. (июль 1997 г.). «Промежуточные соединения в пути сборки двухцепочечного РНК-вируса Phi6» . Embo j . 16 (14): 4477–87. doi : 10.1093/emboj/16.14.4477 . PMC 1170074 . PMID 9250692 .

[13] Кунин, Юджин В.; Dolja, Valerian v.; Крупович, Март (2015). «Происхождение и эволюция вирусов эукариот: конечная модульность» . Вирусология . 479–480: 2–25. doi : 10.1016/j.virol.2015.02.039 . PMC 5898234 . PMID 25771806 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]