Прединициационный комплекс 43С

Преинициативный комплекс 43S ( 43S PIC ) представляет собой рибонуклеопротеиновый комплекс , который существует на ранней стадии инициации трансляции эукариот . PIC 43S содержит малую субъединицу рибосомы (40S), связанную факторами инициации eIF1 , eIF1A , eIF3 и eIF2 -Met- tRNA _i.^Из-тройной комплекс GTP (eIF2-TC). ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

Функция

43S является важным промежуточным комплексом во время кэп-зависимой инициации трансляции. В канонической модели инициации трансляции 43S PIC предварительно формируется в виде стабильного комплекса и рекрутируется на 5'-кэп эукариотических информационных РНК (мРНК) с помощью комплекса eIF4F . ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 5 ]} Затем 43S PIC «сканирует» в направлении 5' -> 3' вдоль мРНК АТФ-зависимым образом (через eIF4A и/или другие РНК- хеликазы, такие как Ded1/DDX3 и DHX29 ), чтобы найти стартовый кодон. Распознавание стартовых кодонов происходит посредством спаривания оснований между Met-тРНК _i.^Из рибосомы и AUG в P-сайте и ряд связанных с этим изменений, за которым следует объединение большой 60S рибосомной субъединицы с образованием 80S рибосомы .

Структура

Из-за своего размера и сложности PIC 43S ускользнул от структурной характеристики высокого разрешения. Однако комбинированные подходы, включая крио-ЭМ , сшивку и структурную характеристику отдельных компонентов, привели к созданию моделей сложной организации. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

См. также

Ссылки

^ Зоненберг, Наум; Хиннебуш, Алан Г. (2009). «Регуляция инициации трансляции у эукариот: механизмы и биологические мишени» . Клетка . 136 (4). Эльзевир Б.В.: 731–745. дои : 10.1016/j.cell.2009.01.042 . ISSN 0092-8674 . ПМК 3610329 . ПМИД 19239892 .
^ Jump up to: ^а ^б Эйткен, Колин Э.; Лорш, Джон Р. (2012). «Механистический обзор инициации трансляции у эукариот». Нат. Структура. Мол. Биол . 19 (6): 568–576. дои : 10.1038/nsmb.2303 . ПМИД 22664984 . S2CID 9201095 .
^ Jump up to: ^а ^б Фрейзер, Кристофер С. (2015). «Количественные исследования рекрутирования мРНК в рибосому эукариот» . Биохимия . 114 . Эльзевир Б.В.: 58–71. дои : 10.1016/j.biochi.2015.02.017 . ISSN 0300-9084 . ПМЦ 4458453 . ПМИД 25742741 .
^ Хиннебуш, Алан Г. (2017). «Структурное понимание механизма сканирования и распознавания стартовых кодонов при инициации эукариотической трансляции». Тенденции биохимических наук . 42 (8). Эльзевир Б.В.: 589–611. дои : 10.1016/j.tibs.2017.03.004 . ISSN 0968-0004 . ПМИД 28442192 .
^ Сокабе, Масааки; Фрейзер, Кристофер С. (22 сентября 2014 г.). «Комплекс фактора инициации эукариот человека 2 (eIF2)-GTP-Met-tRNAiTernary и eIF3 стабилизируют комплекс преинициации 43 S» . Журнал биологической химии . 289 (46). Американское общество биохимии и молекулярной биологии (ASBMB): 31827–31836. дои : 10.1074/jbc.m114.602870 . ISSN 0021-9258 . ПМК 4231660 . ПМИД 25246524 .
^ Хашем, Ясер; де Жорж, Амеди; Дхоте, Видья; Ланглуа, Роберт; Ляо, Хстау Ю.; Грассуччи, Роберт А.; Хеллен, Кристофер ЮТ; Пестова Татьяна Владимировна; Франк, Иоахим (2013). «Структура преинициативного комплекса 43S рибосом млекопитающих, связанного со сканирующим фактором DHX29» . Клетка . 153 (5). Эльзевир Б.В.: 1108–1119. дои : 10.1016/j.cell.2013.04.036 . ISSN 0092-8674 . ПМЦ 3730827 . ПМИД 23706745 .
^ Эрцбергер, Ян П.; Стенгель, Флориан; Пелларин, Риккардо; Чжан, Суян; Шефер, Таня; Эйлетт, Кристофер Х.С.; Цимерманчич, Петр; Берингер, Дэниел; Сали, Андрей; Эберсольд, Руди; Бан, Ненад (2014). «Молекулярная архитектура комплекса инициации трансляции 40S⋅eIF1⋅eIF3» . Клетка . 158 (5). Эльзевир Б.В.: 1123–1135. дои : 10.1016/j.cell.2014.07.044 . ISSN 0092-8674 . ПМК 4151992 . ПМИД 25171412 .
^ де Жорж, Амеди; Дхоте, Видья; Кун, Лориан; Хеллен, Кристофер ЮТ; Пестова Татьяна Владимировна; Франк, Иоахим; Хашем, Ясер (07 сентября 2015 г.). «Структура eIF3 млекопитающих в контексте преинициаторного комплекса 43S» . Природа . 525 (7570). Спрингер Природа: 491–495. Бибкод : 2015Natur.525..491D . дои : 10.1038/nature14891 . ISSN 0028-0836 . ПМЦ 4719162 . ПМИД 26344199 .

[Sonenberg_Hinnebusch_2009_pp._731–745-1] Зоненберг, Наум; Хиннебуш, Алан Г. (2009). «Регуляция инициации трансляции у эукариот: механизмы и биологические мишени» . Клетка . 136 (4). Эльзевир Б.В.: 731–745. дои : 10.1016/j.cell.2009.01.042 . ISSN 0092-8674 . ПМК 3610329 . ПМИД 19239892 .

[Aitken-2] Jump up to: ^а ^б Эйткен, Колин Э.; Лорш, Джон Р. (2012). «Механистический обзор инициации трансляции у эукариот». Нат. Структура. Мол. Биол . 19 (6): 568–576. дои : 10.1038/nsmb.2303 . ПМИД 22664984 . S2CID 9201095 .

[Fraser_2015_pp._58–71-3] Jump up to: ^а ^б Фрейзер, Кристофер С. (2015). «Количественные исследования рекрутирования мРНК в рибосому эукариот» . Биохимия . 114 . Эльзевир Б.В.: 58–71. дои : 10.1016/j.biochi.2015.02.017 . ISSN 0300-9084 . ПМЦ 4458453 . ПМИД 25742741 .

[Hinnebusch_2017_pp._589–611-4] Хиннебуш, Алан Г. (2017). «Структурное понимание механизма сканирования и распознавания стартовых кодонов при инициации эукариотической трансляции». Тенденции биохимических наук . 42 (8). Эльзевир Б.В.: 589–611. дои : 10.1016/j.tibs.2017.03.004 . ISSN 0968-0004 . ПМИД 28442192 .

[Sokabe_Fraser_pp._31827–31836-5] Сокабе, Масааки; Фрейзер, Кристофер С. (22 сентября 2014 г.). «Комплекс фактора инициации эукариот человека 2 (eIF2)-GTP-Met-tRNAiTernary и eIF3 стабилизируют комплекс преинициации 43 S» . Журнал биологической химии . 289 (46). Американское общество биохимии и молекулярной биологии (ASBMB): 31827–31836. дои : 10.1074/jbc.m114.602870 . ISSN 0021-9258 . ПМК 4231660 . ПМИД 25246524 .

[Hashem_des_Georges_Dhote_Langlois_2013_pp._1108–1119-6] Хашем, Ясер; де Жорж, Амеди; Дхоте, Видья; Ланглуа, Роберт; Ляо, Хстау Ю.; Грассуччи, Роберт А.; Хеллен, Кристофер ЮТ; Пестова Татьяна Владимировна; Франк, Иоахим (2013). «Структура преинициативного комплекса 43S рибосом млекопитающих, связанного со сканирующим фактором DHX29» . Клетка . 153 (5). Эльзевир Б.В.: 1108–1119. дои : 10.1016/j.cell.2013.04.036 . ISSN 0092-8674 . ПМЦ 3730827 . ПМИД 23706745 .

[Erzberger_Stengel_Pellarin_Zhang_2014_pp._1123–1135-7] Эрцбергер, Ян П.; Стенгель, Флориан; Пелларин, Риккардо; Чжан, Суян; Шефер, Таня; Эйлетт, Кристофер Х.С.; Цимерманчич, Петр; Берингер, Дэниел; Сали, Андрей; Эберсольд, Руди; Бан, Ненад (2014). «Молекулярная архитектура комплекса инициации трансляции 40S⋅eIF1⋅eIF3» . Клетка . 158 (5). Эльзевир Б.В.: 1123–1135. дои : 10.1016/j.cell.2014.07.044 . ISSN 0092-8674 . ПМК 4151992 . ПМИД 25171412 .

[des_Georges_Dhote_Kuhn_Hellen_pp._491–495-8] де Жорж, Амеди; Дхоте, Видья; Кун, Лориан; Хеллен, Кристофер ЮТ; Пестова Татьяна Владимировна; Франк, Иоахим; Хашем, Ясер (07 сентября 2015 г.). «Структура eIF3 млекопитающих в контексте преинициаторного комплекса 43S» . Природа . 525 (7570). Спрингер Природа: 491–495. Бибкод : 2015Natur.525..491D . дои : 10.1038/nature14891 . ISSN 0028-0836 . ПМЦ 4719162 . ПМИД 26344199 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]