Растительный микробиом

, Растительный микробиом также известный как фитомикробиом , играет роль в здоровье и продуктивности растений, и в последние годы ему уделяется значительное внимание. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Микробиом . был определен как «характерное микробное сообщество, занимающее достаточно четко определенную среду обитания и обладающее отчетливыми физико-химическими свойствами. Таким образом, этот термин не только относится к вовлеченным микроорганизмам, но также охватывает и область их активности» ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

Растения живут в ассоциации с разнообразными микробными консорциумами . Эти микробы, называемые микробиотой растения , живут как внутри (эндосфера), так и снаружи (эписфера) тканей растения и играют важную роль в экологии и физиологии растений. ^{[ 5 ]} «Считается, что основной микробиом растения состоит из ключевых микробных таксонов, которые важны для приспособленности растений и созданы посредством эволюционных механизмов отбора и обогащения микробных таксонов, содержащих гены, важные функции для приспособленности растительного холобионта». ^{[ 6 ]}

Микробиомы растений формируются как факторами, связанными с самим растением, такими как генотип, орган, вид и состояние здоровья, так и факторами, связанными с окружающей средой растения, такими как управление, землепользование и климат. ^{[ 7 ]} В некоторых исследованиях сообщалось, что состояние здоровья растения отражается его микробиомом или связано с ним. ^{[ 8 ]}^{[ 1 ]}^{[ 9 ]}^{[ 2 ]}

Обзор

Изучение связи растений с микроорганизмами предшествует изучению микробиомов животных и человека, особенно роли микробов в поглощении азота и фосфора. Наиболее яркими примерами являются растений корненно - арбускулярная микоризная (АМ) и бобово-ризобиальный симбиозы , оба из которых сильно влияют на способность корней поглощать различные питательные вещества из почвы. Некоторые из этих микробов не могут выжить в отсутствие растения-хозяина ( к облигатным симбионтам относятся вирусы, а также некоторые бактерии и грибы), который обеспечивает микроорганизмы пространством, кислородом, белками и углеводами. Связь АМ-грибов с растениями известна с 1842 г., с ними связано более 80% наземных растений. ^{[ 11 ]} Считается, что AM-грибы помогли одомашнить растения. ^{[ 5 ]}

Традиционно исследования взаимодействия растений и микробов ограничивались культивируемыми микробами . Многочисленные микробы, которые невозможно было культивировать, остались неисследованными, поэтому знания об их роли в значительной степени неизвестны. ^{[ 5 ]} Возможности раскрытия типов и результатов этих взаимодействий растений и микробов вызвали значительный интерес среди экологов, биологов-эволюционистов, биологов-растений и агрономов. ^{[ 8 ]}^{[ 12 ]}^{[ 1 ]} Недавние разработки в области мультиомики и создание больших коллекций микроорганизмов резко расширили знания о составе и разнообразии микробиома растений. Секвенирование , маркерных генов целых микробных сообществ, называемое метагеномикой проливает свет на филогенетическое разнообразие микробиомов растений. Это также дополняет знания об основных биотических и абиотических факторах, микробиомов растений ответственных за формирование сообществ . ^{[ 12 ]}^{[ 5 ]}

Состав микробных сообществ, связанных с разными видами растений, коррелирует с филогенетической дистанцией между видами растений, то есть близкородственные виды растений имеют тенденцию иметь более сходные микробные сообщества, чем отдаленные виды. ^{[ 13 ]} Основное внимание в исследованиях микробиома растений было уделено модельным растениям, таким как Arabidopsis thaliana , а также важным экономическим видам культур, включая ячмень (Hordeum vulgare), кукурузу (Zea mays), рис (Oryza sativa), сою (Glycine max), пшеница (Triticum aestivum), тогда как фруктовым культурам и древесным породам уделяется меньше внимания. ^{[ 14 ]}^{[ 2 ]}

Микробиота растений

Цианобактерии являются примером микроорганизмов, которые широко симбиотически взаимодействуют с наземными растениями . ^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}^{[ 17 ]}^{[ 18 ]} Цианобактерии могут проникать в растение через устьица и колонизировать межклеточное пространство, образуя петли и внутриклеточные клубки. ^{[ 19 ]} Анабаена виды. колонизировать корни растений пшеницы и хлопчатника. ^{[ 20 ]}^{[ 21 ]}^{[ 22 ]} Калотрикс сп. также был обнаружен в корневой системе пшеницы. ^{[ 21 ]}^{[ 22 ]} Однодольные растения , такие как пшеница и рис, были заселены видами Nostoc . ^{[ 23 ]}^{[ 24 ]}^{[ 25 ]}^{[ 26 ]} В 1991 году Гантер и другие выделили из корней растений и почвы разнообразные гетероцистные азотфиксирующие цианобактерии, в том числе Nostoc , Anabaena и Cylindrospermum . Оценка корней проростков пшеницы выявила два типа паттернов ассоциации: свободную колонизацию корневых волосков Anabaena и плотную колонизацию поверхности корня в ограниченной зоне Nostoc . ^{[ 23 ]}^{[ 27 ]}

Ризосферный микробиом

Ризосфера корни включает зону почвы толщиной 1–10 мм, непосредственно окружающую , которая находится под влиянием растения за счет отложения корневых экссудатов , слизи и мертвых растительных клеток. ^{[ 30 ]} В ризосфере живут разнообразные организмы, включая бактерии , грибы , оомицеты , нематоды , водоросли , простейшие , вирусы и археи . ^{[ 31 ]}

«Экспериментальные данные подчеркивают важность корневого микробиома для здоровья растений, и становится все более очевидным, что растение способно контролировать состав своего микробиома. их репродуктивному успеху будет способствовать эволюционный отбор. Похоже, что такое давление отбора привело к множеству специфических взаимодействий между растениями и микробами, и накапливаются доказательства того, что растения требуют микробной помощи в случае необходимости».

– Берендсен и др., 2012 г. ^{[ 8 ]}

Микоризные грибы являются многочисленными представителями ризосферного сообщества, они были обнаружены у более чем 200 000 видов растений и, по оценкам, ассоциированы с более чем 80% всех растений. ^{[ 33 ]} Микориза-корневые ассоциации играют важную роль в наземных экосистемах, регулируя циклы питательных веществ и углерода . Микоризы являются неотъемлемой частью здоровья растений, поскольку они обеспечивают до 80% потребностей растений в азоте и фосфоре. Взамен грибы получают углеводы и липиды от растений-хозяев. ^{[ 34 ]} Недавние исследования арбускулярных микоризных грибов с использованием технологий секвенирования показывают большее межвидовое и внутривидовое разнообразие, чем было известно ранее. ^{[ 35 ]}^{[ 5 ]}

Наиболее часто изучаемыми полезными ризосферными организмами являются микоризы , бактерии-ризобии , ризобактерии, способствующие росту растений (PGPR), и микробы биоконтроля . Предполагалось, что один грамм почвы может содержать более миллиона различных бактериальных геномов. ^{[ 36 ]} и более 50 000 OTU ( оперативных таксономических единиц ) были обнаружены в ризосфере картофеля. ^{[ 37 ]} Среди прокариотов в ризосфере наиболее часто встречаются бактерии Acidobacteriota , Pseudomonadota , Planctomycetota , Actinomycetota , Bacteroidota и Bacillota . ^{[ 38 ]}^{[ 39 ]} В некоторых исследованиях не было обнаружено существенных различий в составе микробного сообщества между основной почвой (почвой, не прикрепленной к корню растения) и ризосферной почвой. ^{[ 40 ]}^{[ 41 ]} Определенные группы бактерий (например, Actinomycetota, Xanthomonadaceae ) менее распространены в ризосфере, чем в близлежащей основной массе почвы. ^{[ 38 ]}^{[ 5 ]}

Эндосферный микробиом

Некоторые микроорганизмы, например эндофиты , проникают и занимают внутренние ткани растений, образуя эндосферный микробиом . Арбускулярные микоризные и другие эндофитные грибы являются доминирующими колонизаторами эндосферы. ^{[ 42 ]} Бактерии и в некоторой степени археи являются важными членами сообществ эндосферы. Некоторые из этих эндофитных микробов взаимодействуют со своим хозяином и приносят очевидную пользу растениям. ^{[ 38 ]}^{[ 43 ]}^{[ 44 ]} В отличие от ризосферы и ризопланы, эндосферы содержат весьма специфические микробные сообщества. Корневое эндофитное сообщество может сильно отличаться от сообщества прилегающей почвы. В целом разнообразие эндофитного сообщества ниже разнообразия микробного сообщества вне растения. ^{[ 41 ]} Идентичность и разнообразие эндофитного микробиома надземных и подземных тканей также могут различаться внутри растения. ^{[ 45 ]}^{[ 42 ]}^{[ 5 ]}

Филлосферный микробиом

Воздушная поверхность растения (стебель, лист, цветок, плод) называется филлосферой и считается сравнительно бедной питательными веществами по сравнению с ризосферой и эндосферой. Среда филлосферы более динамична, чем среда ризосферы и эндосферы. Микробные колонизаторы подвержены суточным и сезонным колебаниям тепла, влаги и радиации. Кроме того, эти элементы окружающей среды влияют на физиологию растений (например, фотосинтез, дыхание, поглощение воды и т. д.) и косвенно влияют на состав микробиома. ^{[ 5 ]} Дождь и ветер также вызывают временные изменения микробиома филлосферы. ^{[ 47 ]}

Взаимодействия между растениями и связанными с ними микроорганизмами во многих из этих микробиомов могут играть ключевую роль в растений-хозяев . здоровье, функционировании и эволюции ^{[ 48 ]} Поверхность листа, или филлосфера , содержит микробиом, состоящий из разнообразных сообществ бактерий, грибов, водорослей, архей и вирусов. ^{[ 49 ]}^{[ 50 ]} Взаимодействия между растением-хозяином и филлосферными бактериями могут влиять на различные аспекты физиологии растения-хозяина. ^{[ 51 ]}^{[ 52 ]}^{[ 53 ]} Однако по состоянию на 2020 год знания об этих бактериальных ассоциациях в филлосфере остаются относительно скромными, и существует необходимость в расширении фундаментальных знаний о динамике микробиома филлосферы. ^{[ 54 ]}^{[ 55 ]}

В целом сохраняется высокое видовое богатство филлосферных сообществ. Грибные сообщества весьма изменчивы в филлосфере умеренных регионов и более разнообразны, чем в тропических регионах. ^{[ 56 ]} На поверхности листьев растений может присутствовать до 107 микробов на квадратный сантиметр, а бактериальная популяция филлосферы в глобальном масштабе оценивается в 10 ²⁶ клетки. ^{[ 57 ]} Размер популяции грибной филлосферы, вероятно, будет меньше. ^{[ 58 ]}

Микробы филлосферы разных растений кажутся в некоторой степени сходными у таксонов высоких уровней, но у таксонов более низких уровней сохраняются существенные различия. Это указывает на то, что микроорганизмам может потребоваться тонко настроенная метаболическая корректировка, чтобы выжить в среде филлосферы. ^{[ 56 ]} Pseudomonadota , по-видимому, являются доминирующими колонизаторами, при этом Bacteroidota и Actinomycetota также преобладают в филлосферах. ^{[ 59 ]} обнаружено очень мало сходства . Хотя между ризосферными и почвенными микробными сообществами существуют сходства, между филлосферными сообществами и микроорганизмами, плавающими на открытом воздухе ( аэропланктоном ), ^{[ 42 ]}^{[ 5 ]}

Сборка микробиома филлосферы, которую можно строго определить как эпифитные бактериальные сообщества на поверхности листьев, может формироваться микробными сообществами, присутствующими в окружающей среде (т. е. стохастическая колонизация ) и растении-хозяине (т. е. биотический отбор). ^{[ 49 ]}^{[ 57 ]}^{[ 55 ]} Однако, хотя поверхность листьев обычно считается дискретной средой обитания микробов, ^{[ 60 ]}^{[ 61 ]} нет единого мнения относительно доминирующего фактора формирования сообществ в микробиомах филлосферы. Например, в филлосфере одновременно встречающихся видов растений были зарегистрированы бактериальные сообщества, специфичные для хозяина, что указывает на доминирующую роль отбора хозяина. ^{[ 61 ]}^{[ 42 ]}^{[ 62 ]}^{[ 55 ]}

И наоборот, сообщается, что микробиомы окружающей среды являются основным определяющим фактором состава сообщества филлосферы. ^{[ 60 ]}^{[ 63 ]}^{[ 56 ]}^{[ 64 ]} В результате процессы, которые управляют сборкой филлосферных сообществ, недостаточно изучены, но вряд ли они будут универсальными для всех видов растений. Однако существующие данные указывают на то, что филлосферные микробиомы, демонстрирующие ассоциации с хозяином, с большей вероятностью будут взаимодействовать с хозяином, чем те, которые в первую очередь рекрутируются из окружающей среды. ^{[ 51 ]}^{[ 65 ]}^{[ 66 ]}^{[ 67 ]}^{[ 55 ]}

Поиск основного микробиома в микробных сообществах, связанных с хозяином, является полезным первым шагом в попытке понять взаимодействия, которые могут происходить между хозяином и его микробиомом. ^{[ 68 ]}^{[ 69 ]} Преобладающая концепция основного микробиома основана на представлении о том, что выживание таксона за пространственно-временными границами экологической ниши напрямую отражает его функциональную значимость в той нише, которую он занимает; следовательно, он обеспечивает основу для идентификации функционально важных микроорганизмов, которые постоянно ассоциируются с видом-хозяином. ^{[ 68 ]}^{[ 70 ]}^{[ 40 ]}^{[ 55 ]}

В научной литературе возникли различные определения «основного микробиома», при этом исследователи по-разному определяют «основные таксоны» как те, которые сохраняются в различных микросредах обитания хозяина. ^{[ 71 ]}^{[ 72 ]} и даже разные виды. ^{[ 62 ]}^{[ 65 ]} Учитывая функциональные различия микроорганизмов у разных видов хозяев. ^{[ 62 ]} и микросреды обитания, ^{[ 73 ]} определение основных таксонов в строгом смысле слова как таксонов, устойчивых на больших географических расстояниях в ткане- и видоспецифичных микробиомах хозяина, представляет собой наиболее биологически и экологически приемлемое применение этой концептуальной основы. ^{[ 74 ]}^{[ 55 ]} О ткане- и видоспецифичных основных микробиомах в популяциях хозяев, разделенных большими географическими расстояниями, в филлосфере не сообщалось широко, если использовать строгое определение, установленное Руиненом. ^{[ 52 ]}^{[ 55 ]}

Пример: филлосфера манука.

Цветущее чайное дерево, широко известное как манука , произрастает в Новой Зеландии. ^{[ 75 ]} Мед манука , получаемый из нектара цветов манука, известен своими неперекисными антибактериальными свойствами. ^{[ 76 ]}^{[ 77 ]} Микроорганизмы изучались в ризосфере и эндосфере манука. ^{[ 78 ]}^{[ 79 ]}^{[ 80 ]} Более ранние исследования в основном были сосредоточены на грибах, а исследование 2016 года представило первое исследование эндофитных бактериальных сообществ из трех географически и экологически различных популяций манука с использованием методов дактилоскопии и выявило тканеспецифичные основные эндомикробиомы. ^{[ 81 ]}^{[ 55 ]}

Исследование 2020 года выявило специфичный для среды обитания и относительно многочисленный основной микробиом в филлосфере манука, который сохранялся во всех образцах. Напротив, неосновные микроорганизмы филлосферы демонстрировали значительные различия между отдельными деревьями-хозяевами и популяциями, что в значительной степени было обусловлено экологическими и пространственными факторами. Результаты продемонстрировали существование доминирующего и повсеместного основного микробиома в филлосфере мануки. ^{[ 55 ]}

Относительная численность основных таксонов филлосферы мануки

Манука — цветущий кустарник. На диаграмме показано распределение численности и занятости с указанием основных таксонов филлосферы в неразреженных (зеленый) и разреженных (фиолетовый) наборах данных. Каждая точка представляет таксон, нанесенный на график его средней логарифмической относительной численности и занятости. Таксоны (розовые) с заполненностью 1 (т. е. обнаруженные во всех 89 образцах филлосферы) считались членами основного микробиома. ^{[ 55 ]}

Семенной микробиом

Семена растений могут служить естественными переносчиками вертикальной передачи полезных эндофитов, например тех, которые придают устойчивость к болезням. В исследовательской статье 2021 года объясняется: «Имеет смысл, что их наиболее важные симбионты будут передаваться вертикально через семена, а не делать ставку на то, что все правильные микробы, обитающие в почве, могут быть доступны в месте прорастания». ^{[ 82 ]}

Новая парадигма относительно мутуалистических грибов и передачи бактерий через семена растений-хозяев возникла в основном благодаря исследованиям, касающимся растений, имеющих сельскохозяйственное значение. ^{[ 82 ]}^{[ 83 ]} Было обнаружено, что семена риса характеризуются высоким микробным разнообразием, причем наибольшее разнообразие обитает в зародыше, а не в околоплоднике . ^{[ 84 ]} Было обнаружено, что грибы рода Fusarium, передающиеся через семена, являются доминирующими членами микробиома стеблей кукурузы . ^{[ 82 ]} Этот аспект микробиома растения стал известен как микробиом семян. ^{[ 85 ]}

Исследователи лесного хозяйства также начали выявлять членов микробиома семян, принадлежащих к ценным породам деревьев. Вертикальная передача грибковых и бактериальных мутуалистов подтверждена в 2021 году желудях дубов . на ^{[ 45 ]}^{[ 86 ]} Если окажется, что исследования дубов применимы и к другим породам деревьев, то станет ясно, что надпочвенные части растения ( филлосфера ) получают почти все свои полезные грибы из тех, которые содержатся в семенах. ^{[ 45 ]} Напротив, корни ( ризосфера ) приобретают из семени лишь небольшую часть своих мутуалистов. Большинство из них попадает через окружающую почву, включая их жизненно важные связи с арбускулярными микоризными грибами . ^{[ 83 ]}

Виды микробов, постоянно обнаруживаемые в семенах растений, известны как «основной микробиом». ^{[ 82 ]}^{[ 87 ]} Преимущества для растения-хозяина включают их способность способствовать выработке противомикробных соединений, детоксикации, поглощению питательных веществ и стимулированию роста. ^{[ 45 ]} Выявление функций симбиотических микробов в семенах отодвигает сельскохозяйственную парадигму от селекции и подготовки семян, которые традиционно стремились свести к минимуму присутствие грибковых и бактериальных размножений. Вероятность того, что микроб, обнаруженный в семени, является мутуалистическим, теперь является обычным предположением. Такие партнеры могут способствовать «покою и прорастанию семян, адаптации к окружающей среде, устойчивости и толерантности к болезням, а также стимулированию роста». ^{[ 87 ]}

Было предложено применить новое понимание полезных микробов, населяющих семена, не только в сельском хозяйстве, но и для сохранения биоразнообразия. ^{[ 83 ]} Группа граждан, выступающая за содействие миграции на север исчезающего дерева в США, указала на изменение парадигмы семенного микробиома как на причину, по которой официальные учреждения снимают запрет на передачу семян за пределы ex situ насаждений, предназначенных для сохранения в северной Джорджии. ^{[ 88 ]}

Растение холобионт

С момента колонизации земли предковыми линиями растений 450 миллионов лет назад растения и связанные с ними микробы взаимодействовали друг с другом, образуя совокупность видов, которую часто называют холобионтом . Селективное давление, действующее на компоненты холобионта, вероятно, сформировало микробные сообщества, связанные с растениями, и отобрало адаптированные к хозяину микроорганизмы, влияющие на приспособленность растений. Однако высокая плотность микробов, обнаруженная в тканях растений, вместе с быстрым временем образования микробов и их более древним происхождением по сравнению с их хозяином, позволяют предположить, что межмикробные взаимодействия также являются важными селективными силами, формирующими сложные микробные комплексы в филлосфере , ризосфере , и растительные отсеки эндосферы . ^{[ 32 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с Тернер, Томас Р.; Джеймс, Юан К.; Пул, Филип С. (2013). «Микробиом растений» . Геномная биология . 14 (6): 209. doi : 10.1186/gb-2013-14-6-209 . ПМК 3706808 . ПМИД 23805896 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Пурахонг, Витун; Орру, Луиджи; Донати, Ирен; Перпетуини, Джорджия; Челлини, Антонио; Ламонтанара, Антонелла; Микелотти, Ваня; Таккони, Джанни; Спинелли, Франческо (2018). «Микробиом растений и его связь со здоровьем растений: виды-хозяева, органы и Pseudomonas syringae pv. Инфекция Actinidiae, формирующая бактериальные филлосферные сообщества растений киви» . Границы в науке о растениях . 9 : 1563. doi : 10.3389/fpls.2018.01563 . ПМК 6234494 . ПМИД 30464766 . . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
^ Уиппс, Дж. М.; Льюис, Карен; Кук, Р.К. (1988). «Микопаразитизм и борьба с болезнями растений». В Бердже, Майкл Н. (ред.). Грибы в системах биологического контроля . Манчестер, Великобритания, Нью-Йорк: Издательство Манчестерского университета. стр. 161–187. ISBN 978-0-7190-1979-1 .
^ Берг, Габриэле ; Рыбакова Дарья; Фишер, Дорин; Чернава, Томислав; Верже, Мари-Кристин Шампомье; Чарльз, Тревор; Чен, Сяоюлун; Коколин, Лука; Эверсол, Келли; Коррал, Хема Эрреро; Казу, Мария; Кинкель, Линда; Ланге, Лене; Лима, Нельсон; Лой, Александр; и др. (декабрь 2020 г.). «Повторное рассмотрение определения микробиома: старые концепции и новые проблемы» . Микробиом . 8 (1). дои : 10.1186/s40168-020-00875-0 . hdl : 1822/65842 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж Дастогер, К.М., Тумпа, Ф.Х., Султана, А., Актер, М.А. и Чакраборти, А. (2020) «Микробиом растений – отчет о факторах, которые формируют состав и разнообразие сообщества». Текущая биология растений : 100161. дои : 10.1016/j.cpb.2020.100161 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
^ Компант, Стефан; Самад, Абдул; Фаист, Ханна; Сессич, Анжела (2019). «Обзор микробиома растений: экология, функции и новые тенденции в применении микробов» . Журнал перспективных исследований . 19 :29–37. дои : 10.1016/j.jare.2019.03.004 . ПМК 6630030 .
^ Брингель, Франсуаза; Куэ, Иван (2015). «Основная роль микроорганизмов филлосферы на стыке между функционированием растений и динамикой газовых примесей в атмосфере» . Границы микробиологии . 06 : 486. дои : 10.3389/fmicb.2015.00486 . ПМК 4440916 . ПМИД 26052316 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Берендсен, Роланд Л.; Питерс, Корне MJ; Баккер, Питер АХМ (2012). «Ризосферный микробиом и здоровье растений». Тенденции в науке о растениях . 17 (8): 478–486. doi : 10.1016/j.tplants.2012.04.001 . hdl : 1874/255269 . ПМИД 22564542 . S2CID 32900768 .
^ Берг, Габриэле; Грубе, М.; Шлотер, М.; Смолла, К. (2014). «Микробиом растений и его значение для здоровья растений и человека» . Границы микробиологии . 5 : 491. дои : 10.3389/fmicb.2014.00491 . ПМК 4166366 . ПМИД 25278934 .
^ Шелаке, Р.М., Праманик, Д. и Ким, Дж.Я. (2019) «Исследование взаимодействия растений и микробов для устойчивого сельского хозяйства в эпоху CRISPR». Микроорганизмы , 7 (8): 269. doi : 10.3390/microorganisms7080269 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
^ Койде, Роджер Т.; Мосс, Барбара (2004). «История исследований арбускулярной микоризы». Микориза . 14 (3): 145–163. Бибкод : 2004Mycor..14..145K . дои : 10.1007/s00572-004-0307-4 . ПМИД 15088135 . S2CID 1809402 .
^ Jump up to: ^а ^б Булгарелли, Давиде; Шлеппи, Клаус; Спепен, Стейн; Ван Темаат, Эмиэль Вер Лорен; Шульце-Леферт, Пол (2013). «Структура и функции бактериальной микробиоты растений». Ежегодный обзор биологии растений . 64 : 807–838. doi : 10.1146/annurev-arplant-050312-120106 . ПМИД 23373698 .
^ Абдельфаттах, Ахмед; Тэк, Эйко Дж. М.; Вассерман, Биргит; Лю, Цзя; Берг, Габриэле; Норелли, Джон; Дроби, Самир; Вишневский, Майкл (2021). «Доказательства коэволюции хозяина и микробиома яблока» . Новый фитолог . 234 (6): 2088–2100. дои : 10.1111/nph.17820 . ISSN 1469-8137 . ПМЦ 9299473 . ПМИД 34823272 . S2CID 244661193 .
^ Басби, Пози Э.; Соман, Чинмей; Вагнер, Мэгги Р.; Фризен, Марен Л.; Кремер, Джеймс; Беннетт, Элисон; Морси, Мустафа; Эйзен, Джонатан А.; Лич, Ян Э.; Дангл, Джеффри Л. (2017). «Приоритеты исследований по использованию растительных микробиомов в устойчивом сельском хозяйстве» . ПЛОС Биология . 15 (3): e2001793. дои : 10.1371/journal.pbio.2001793 . ПМК 5370116 . ПМИД 28350798 . S2CID 6434145 .
^ Гантар, М.; Эльхай, Дж. (1999). «Колонизация параклубеньков пшеницы N2-фиксирующей цианобактерией Nostocsp . Штамм 2S9B» . Новый фитолог . 141 (3): 373–379. дои : 10.1046/j.1469-8137.1999.00352.x .
^ Гантар, М. (2000). «Механическое повреждение корней обеспечивает усиленную колонизацию эндоризосферы пшеницы диазотфиксирующей цианобактерией Nostoc sp. Штамм 2S9B». Биология и плодородие почв . 32 (3): 250–255. Бибкод : 2000BioFS..32..250G . дои : 10.1007/s003740000243 . S2CID 7590731 .
^ Тревес, Хаим; Раанан, Аггей; Кедем, Исаак; Мюрик, Омер; Керен, Нир; Зер, Хаггит; Беркович, Саймон М.; Джордано, Марио; Норичи, Алессандра; Шотланд, Джорам; Охад, Ицхак; Каплан, Аарон (2016). «Механизмы, благодаря которым зеленая водоросль Chlorella ohadii, выделенная из корки пустынной почвы, демонстрирует беспрецедентную устойчивость к фотоповреждениям» . Новый фитолог . 210 (4): 1229–1243. дои : 10.1111/nph.13870 . ПМИД 26853530 .
^ Чжу, Хуан; Ли, Шуин; Ху, Чжэнъюй; Лю, Госян (2018). «Молекулярная характеристика эукариотических сообществ водорослей тропической филлосферы на основе секвенирования гена 18S рДНК в реальном времени» . Биология растений BMC . 18 (1): 365. дои : 10.1186/s12870-018-1588-7 . ПМК 6299628 . ПМИД 30563464 .
^ Крингс, Майкл; Хасс, Хаген; Керп, Ганс; Тейлор, Томас Н.; Агерер, Рейнхард; Доцлер, Нора (2009). «Эндофитные цианобактерии в наземном растении возрастом 400 миллионов лет: сценарий возникновения симбиоза?». Обзор палеоботаники и палинологии . 153 (1–2): 62–69. Бибкод : 2009RPaPa.153...62K . дои : 10.1016/j.revpalbo.2008.06.006 .
^ Картикеян Н.; Прасанна, Р.; Суд, А.; Джайсвал, П.; Наяк, С.; Кошик, Б.Д. (2009). «Физиологическая характеристика и электронно-микроскопическое исследование цианобактерий, связанных с ризосферой пшеницы». Фолиа микробиологическая . 54 (1): 43–51. дои : 10.1007/s12223-009-0007-8 . ПМИД 19330544 . S2CID 23420342 .
^ Jump up to: ^а ^б Бабу, Сантош; Прасанна, Радха; Бидьярани, Нгангом; Сингх, Раджендра (2015). «Анализ колонизации инокулированных цианобактерий в растениях пшеницы с использованием биохимических и молекулярных инструментов». Журнал прикладной психологии . 27 (1): 327–338. Бибкод : 2015JAPco..27..327B . дои : 10.1007/s10811-014-0322-6 . S2CID 17353123 .
^ Jump up to: ^а ^б Бидьярани, Нгангом; Прасанна, Радха; Чавла, Гаутама; Бабу, Сантош; Сингх, Раджендра (2015). «Расшифровка факторов, связанных с заселением растений риса цианобактериями». Журнал фундаментальной микробиологии . 55 (4): 407–419. дои : 10.1002/jobm.201400591 . ПМИД 25515189 . S2CID 5401526 .
^ Jump up to: ^а ^б Гантар, М.; Керби, Северо-Запад; Роуэлл, П. (1991). «Колонизация пшеницы (Triticum vulgare L.) N2-фиксирующими цианобактериями: II. Ультраструктурное исследование». Новый фитолог . 118 (3): 485–492. дои : 10.1111/j.1469-8137.1991.tb00031.x .
^ Ахмед, Мехбуб; Сталь, Лукас Дж.; Хаснайн, Шахида (2010). «Ассоциация негетероцистных цианобактерий с сельскохозяйственными растениями» . Растение и почва . 336 (1–2): 363–375. Бибкод : 2010ПлСой.336..363А . дои : 10.1007/s11104-010-0488-x . S2CID 21309970 .
^ Хусейн, Анвар; Хамаюн, Мухаммед; Шах, Сайед Тарик (2013). «Корневая колонизация и фитостимуляция фитогормонами, продуцирующими энтофитный Nostoc sp. AH-12». Современная микробиология . 67 (5): 624–630. дои : 10.1007/s00284-013-0408-4 . ПМИД 23794014 . S2CID 14704537 .
^ Хусейн, Анвар; Шах, Сайед Т.; Рахман, Хазир; Иршад, Мухаммед; Икбал, Амджад (2015). «Влияние IAA на рост in vitro и колонизацию Nostoc в корнях растений» . Границы в науке о растениях . 6 : 46. дои : 10.3389/fpls.2015.00046 . ПМЦ 4318279 . ПМИД 25699072 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ли, Сан-Му; Рю, Чунг Мин (4 февраля 2021 г.). «Водоросли как новенькие в полезном микробиоме растений» . Границы в науке о растениях . 12 . Frontiers Media SA: 599742. doi : 10.3389/fpls.2021.599742 . ISSN 1664-462X . ПМЦ 7889962 . ПМИД 33613596 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
^ Jump up to: ^а ^б Чаудри, Васви; Рунге, Пол; Сенгупта, Приямедха; Дёлеманн, Гюнтер; Паркер, Джейн Э; Кемен, Эрик (10 сентября 2020 г.). Коприва, Станислав (ред.). «Формирование микробиоты листа: взаимодействие растение-микроб-микроб» . Журнал экспериментальной ботаники . 72 (1). Издательство Оксфордского университета (OUP): 36–56. дои : 10.1093/jxb/eraa417 . ISSN 0022-0957 . ПМК 8210630 . ПМИД 32910810 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
^ Вишвакарма, Канчан; Кумар, Нитин; Шандилья, Читракши; Мохапатра, Свати; Бхайана, Сахил; Варма, Аджит (2020). «Возврат к взаимодействиям растений и микробов и использованию микробных консорциумов для улучшения устойчивого сельского хозяйства: обзор» . Границы микробиологии . 11 : 560406. doi : 10.3389/fmicb.2020.560406 . ПМЦ 7779480 . ПМИД 33408698 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
^ Хинсингер, Филипп; Бенго, А. Глин; Веттерлейн, Дорис; Янг, Иэн М. (2009). «Ризосфера: биофизика, биогеохимия и экологическая значимость». Растение и почва . 321 (1–2): 117–152. Бибкод : 2009PlSoi.321..117H . дои : 10.1007/s11104-008-9885-9 . S2CID 8997382 .
^ Бонковски, Майкл; Вильенав, Сесиль; Гриффитс, Брайан (2009). «Ризосферная фауна: функциональное и структурное разнообразие тесных взаимодействий почвенной фауны с корнями растений». Растение и почва . 321 (1–2): 213–233. Бибкод : 2009ПлСой.321..213Б . дои : 10.1007/s11104-009-0013-2 . S2CID 35701713 .
^ Jump up to: ^а ^б Хасани, М. Амин; Дуран, Палома; Хаккар, Стефан (март 2018 г.). «Микробные взаимодействия внутри холобионта растений» . Микробиом . 6 (1): 58. дои : 10.1186/s40168-018-0445-0 . ПМЦ 5870681 . ПМИД 29587885 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
^ Ван дер Хейден, Марсель Г.А.; Мартин, Фрэнсис М.; Селосс, Марк-Андре; Сандерс, Ян Р. (2015). «Микоризная экология и эволюция: прошлое, настоящее и будущее». Новый фитолог . 205 (4): 1406–1423. дои : 10.1111/nph.13288 . ПМИД 25639293 .
^ Рич, Мелани К.; Нури, Ева; Курти, Пьер-Эммануэль; Рейнхардт, Дидье (2017). «Диета арбускулярных микоризных грибов: хлеб с маслом?» (PDF) . Тенденции в науке о растениях . 22 (8): 652–660. doi : 10.1016/j.tplants.2017.05.008 . ПМИД 28622919 .
^ Ли, Ын-Хва; Эо, Джу-Кён; Ка, Кан Хён; Эом, Ан-Хым (2013). «Разнообразие арбускулярных микоризных грибов и их роль в экосистемах» . Микобиология . 41 (3): 121–125. дои : 10.5941/MYCO.2013.41.3.121 . ПМЦ 3817225 . ПМИД 24198665 .
^ Ганс, Дж.; Волински, М.; Данбар, Дж. (2005). «Усовершенствования вычислений показывают большое бактериальное разнообразие и высокую токсичность металлов в почве». Наука . 309 (5739): 1387–1390. Бибкод : 2005Sci...309.1387G . дои : 10.1126/science.1112665 . ПМИД 16123304 . S2CID 130269020 .
^ i̇Nceoğlu, Озгюль; Аль-Суд, Валид Абу; Саллес, Жоана Фалькао; Семенов Александр В.; Ван Эльзас, Ян Дирк (2011). «Сравнительный анализ бактериальных сообществ на картофельном поле, определенный методом пиросеквенирования» . ПЛОС ОДИН . 6 (8): e23321. Бибкод : 2011PLoSO...623321I . дои : 10.1371/journal.pone.0023321 . ПМК 3158761 . ПМИД 21886785 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Булгарелли, Давиде; Ротт, Матиас; Шлеппи, Клаус; Вер Лорен Ван Темаат, Эмиэль; Ахмадинежад, Нахаль; Ассенца, Федерика; Рауф, Филип; Хюттель, Бруно; Рейнхардт, Ричард; Шмельцер, Элмон; Пеплиес, Йорг; Глекнер, Фрэнк Оливер; Аманн, Рудольф; Эйкхорст, Тило; Шульце-Леферт, Пол (2012). «Выявление структуры и признаков сборки бактериальной микробиоты, обитающей в корнях арабидопсиса». Природа . 488 (7409): 91-95. Стартовый код : 2012Природа.488...91Б . дои : 10.1038/nature11336 . ПМИД 22859207 . S2CID 4393146 .
^ Уроз, Стефан; Буэ, Марк; Мюрат, Клод; Фрей-Клетт, Паскаль; Мартин, Фрэнсис (2010). «Пиросеквенирование выявляет контрастное бактериальное разнообразие между ризосферой дуба и окружающей почвой». Отчеты по экологической микробиологии . 2 (2): 281–288. Бибкод : 2010EnvMR...2..281U . дои : 10.1111/j.1758-2229.2009.00117.x . ПМИД 23766079 .
^ Jump up to: ^а ^б Лундберг, Дерек С.; Лебейс, Сара Л.; Стены, Южный Кузнец; Вашстон, Скотт; Геринг, Джейс; Малфатти, Стефани; Трамбле, Жюльен; Энгельбректсон, Анна; Сегодня, Виктор; Рио, Тихана Главина; Эдгар, Роберт С.; Эйкхорст, Вещи; Ло, Рут Э.; Гугенгольц, Филип; Тринге, Сюзанна Грин; Дангл, Джеффри Л. (2012). «Определение основного микробиома корня Arabidopsis thaliana» . Природа 488 (7409): 86–90. Бибкод : 2012Природа.488...86Л . дои : 10.1038/nature11237 . ПМК 4074413 . ПМИД 22859206 .
^ Jump up to: ^а ^б Шлеппи, К.; Домбровский, Н.; Отер, Р.Г.; Вер Лорен Ван Темаат, Э.; Шульце-Леферт, П. (2014). «Количественное расхождение бактериальной корневой микробиоты у родственников Arabidopsis thaliana» . Труды Национальной академии наук . 111 (2): 585–592. Бибкод : 2014PNAS..111..585S . дои : 10.1073/pnas.1321597111 . ПМК 3896156 . ПМИД 24379374 . S2CID 13806811 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Воку, Деспойна; Варели, Катерина; Зарали, Екатерини; Караманоли, Катерина; Константиниду, Хелен-Исида А.; Монокрусос, Николаос; Хэлли, Джон М.; Сайнис, Иоаннис (2012). «Изучение биоразнообразия бактериального сообщества средиземноморской филлосферы и его связи с бактериями, передающимися по воздуху». Микробная экология . 64 (3): 714–724. Бибкод : 2012MicEc..64..714V . дои : 10.1007/s00248-012-0053-7 . ПМИД 22544345 . S2CID 17291303 .
^ Дастогер, Хондокер М.Г.; Ли, Хуа; Сиваситхампарам, Кришнапиллай; Джонс, Майкл Г.К.; Ду, Синь; Рен, Юнлинь; Уайли, Стивен Дж. (2017). «Метаболические реакции эндофитных растений Nicotiana benthamiana, испытывающих водный стресс» . Экологическая и экспериментальная ботаника . 143 : 59–71. Бибкод : 2017EnvEB.143...59D . дои : 10.1016/j.envexpbot.2017.08.008 .
^ Родригес, Р.Дж.; Уайт-младший, Дж. Ф.; Арнольд, А.Е.; Редман, RS (2009). «Грибные эндофиты: разнообразие и функциональные роли» . Новый фитолог . 182 (2): 314–330. дои : 10.1111/j.1469-8137.2009.02773.x . ПМИД 19236579 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Абдельфаттах, Ахмед; Вишневский, Майкл; Шена, Леонардо; Тэк, Айко Дж. М. (2021). «Экспериментальные доказательства наследования микробов у растений и путей передачи от семян к филлосфере и корням» . Экологическая микробиология . 23 (4): 2199–2214. Бибкод : 2021EnvMi..23.2199A . дои : 10.1111/1462-2920.15392 . ISSN 1462-2920 . ПМИД 33427409 .
^ Хэ, Шэн-Ян (28 августа 2020 г.). «Когда растения и их микробы не синхронизированы, результаты могут быть катастрофическими» . Разговор .
^ Линдоу, Стивен Э. (1996). «Роль иммиграции и других процессов в определении популяций эпифитных бактерий». Воздушная поверхностная микробиология растений . стр. 155–168. дои : 10.1007/978-0-585-34164-4_10 . ISBN 978-0-306-45382-3 .
^ Фризен, Марен Л.; Портер, Стефани С.; Старк, Скотт С.; фон Веттберг, Эрик Дж.; Сакс, Джоэл Л.; Мартинес-Ромеро, Эсперанса (2011). «Микробно-опосредованные функциональные особенности растений». Ежегодный обзор экологии, эволюции и систематики . 42 : 23–46. doi : 10.1146/annurev-ecolsys-102710-145039 .
^ Jump up to: ^а ^б Лево, Йохан Х.Дж. (2019). «Краткое описание с листа: Последние исследования, способствующие нашему пониманию микробиома филлосферы». Современное мнение в микробиологии . 49 : 41–49. дои : 10.1016/j.mib.2019.10.002 . ПМИД 31707206 . S2CID 207946690 .
^ Руинен, Дж. (февраль 1956 г.). «Распространение видов Beijerinckia в« филлосфере » ». Природа . 177 (4501): 220–221. дои : 10.1038/177220a0 . ISSN 1476-4687 .
^ Jump up to: ^а ^б Фогель, Кристина ; Боденхаузен, Наташа; Грюиссем, Вильгельм; Ворхольт, Джулия А. (2016). «Транскриптом листьев арабидопсиса демонстрирует различные, но также перекрывающиеся реакции на колонизацию филлосферными комменсалами и патогенную инфекцию, оказывающую влияние на здоровье растений» (PDF) . Новый фитолог . 212 (1): 192–207. дои : 10.1111/nph.14036 . hdl : 20.500.11850/117578 . ПМИД 27306148 .
^ Jump up to: ^а ^б Сид, Фернанда П.; Маруяма, Фумито; Мурасе, Кадзунори; Гретер, Стивен П.; Ларама, Джованни; Браво, Леон А.; Хоркера, Милко А. (2018). «Проект последовательности генома бактерий, выделенных из филлосферы Deschampsia antarctica». Экстремофилы . 22 (3): 537–552. дои : 10.1007/s00792-018-1015-x . ПМИД 29492666 . S2CID 4320165 .
^ Кумаравел, Совья; Танкаппан, Сугита; Рагхупати, Шридар; Утанди, Сивакумар (2018). «Проект геномной последовательности стимулирующей рост растений и устойчивой к засухе Bacillus altitudinis FD48, выделенной из филлопланы риса» . Геномные объявления . 6 (9). doi : 10.1128/genomeA.00019-18 . ПМЦ 5834328 . ПМИД 29496824 .
^ Лафорест-Лапуант, Изабель; Уитакер, Бриана К. (2019). «Расшифровка микробиоты филлосферы: прогресс и проблемы» . Американский журнал ботаники . 106 (2): 171–173. дои : 10.1002/ajb2.1229 . ПМИД 30726571 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Благородная, Аня С.; Нет, Стиви; Клируотер, Майкл Дж.; Ли, Чарльз К. (2020). «Основной микробиом филлосферы существует в отдаленных популяциях видов деревьев, произрастающих в Новой Зеландии» . ПЛОС ОДИН . 15 (8): e0237079. Бибкод : 2020PLoSO..1537079N . дои : 10.1371/journal.pone.0237079 . ПМЦ 7425925 . ПМИД 32790769 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Финкель, Омри М.; Берч, Эдриан Ю.; Линдоу, Стивен Э.; Пост, Антон Ф.; Белкин, Шимшон (2011). «Географическое положение определяет популяционную структуру филлосферных микробных сообществ соляного пустынного дерева» . Прикладная и экологическая микробиология . 77 (21): 7647–7655. Бибкод : 2011ApEnM..77.7647F . дои : 10.1128/АЕМ.05565-11 . ПМК 3209174 . ПМИД 21926212 .
^ Jump up to: ^а ^б Ворхольт, Джулия А. (2012). «Микробная жизнь в филлосфере». Обзоры природы Микробиология . 10 (12): 828–840. дои : 10.1038/nrmicro2910 . hdl : 20.500.11850/59727 . ПМИД 23154261 . S2CID 10447146 .
^ Линдоу, Стивен Э.; Брандл, Мария Т. (2003). «Микробиология филлосферы» . Прикладная и экологическая микробиология . 69 (4): 1875–1883. Бибкод : 2003ApEnM..69.1875L . дои : 10.1128/АЕМ.69.4.1875-1883.2003 . ПМК 154815 . ПМИД 12676659 . S2CID 2304379 .
^ Боденхаузен, Наташа; Хортон, Мэтью В.; Бергельсон, Джой (2013). «Бактериальные сообщества, связанные с листьями и корнями Arabidopsis thaliana» . ПЛОС ОДИН . 8 (2): e56329. Бибкод : 2013PLoSO...856329B . дои : 10.1371/journal.pone.0056329 . ПМЦ 3574144 . ПМИД 23457551 .
^ Jump up to: ^а ^б Стоун, Брэм В.Г.; Джексон, Колин Р. (2016). «Биогеографические закономерности между бактериальными филлосферными сообществами южной магнолии (Magnolia grandiflora) в небольшом лесу». Микробная экология . 71 (4): 954–961. Бибкод : 2016MicEc..71..954S . дои : 10.1007/s00248-016-0738-4 . ПМИД 26883131 . S2CID 17292307 .
^ Jump up to: ^а ^б Редфорд, Аманда Дж.; Бауэрс, Роберт М.; Найт, Роб; Линхарт, Ян; Фирер, Ной (2010). «Экология филлосферы: Географическая и филогенетическая изменчивость распределения бактерий на листьях деревьев» . Экологическая микробиология . 12 (11): 2885–2893. Бибкод : 2010EnvMi..12.2885R . дои : 10.1111/j.1462-2920.2010.02258.x . ПМК 3156554 . ПМИД 20545741 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Лафорест-Лапуант, Изабель; Мессье, Кристиан; Кембель, Стивен В. (2016). «Идентичность вида-хозяина, место и время определяют структуру бактериального сообщества филлосферы деревьев умеренного климата» . Микробиом . 4 (1): 27. дои : 10.1186/s40168-016-0174-1 . ПМЦ 4912770 . ПМИД 27316353 .
^ Сарраонаиндия, Ираче; Оуэнс, Сара М.; Вайзенхорн, Памела; Уэст, Кристин; Хэмптон-Марселл, Джаррад; Лакс, Саймон; Бокулич, Николай Александрович; Миллс, Дэвид А.; Мартин, Жиль; Тагави, Сафий; Ван дер Лели, Дэниел; Гилберт, Джек А. (2015). «Микробиом почвы влияет на микробиоту, связанную с виноградной лозой» . мБио . 6 (2). дои : 10.1128/mBio.02527-14 . ПМЦ 4453523 . ПМИД 25805735 .
^ Финкель, Омри М.; Берч, Эдриан Ю.; Элад, Таль; Хьюз, Сьюзен М.; Линдоу, Стивен Э.; Пост, Антон Ф.; Белкин, Шимшон (2012). «Зависимость расстояния от распада частично определяет структуру разнообразия филлосферных бактерий на деревьях тамрикс в пустыне Сонора» . Прикладная и экологическая микробиология . 78 (17): 6187–6193. Бибкод : 2012ApEnM..78.6187F . дои : 10.1128/AEM.00888-12 . ПМЦ 3416633 . ПМИД 22752165 .
^ Jump up to: ^а ^б Кембель, Юго-Запад; О'Коннор, ТК; Арнольд, Гонконг; Хаббелл, СП; Райт, С.Дж.; Грин, Дж.Л. (2014). «Связь между бактериальными сообществами филлосферы и функциональными особенностями растений в неотропическом лесу» . Труды Национальной академии наук . 111 (38): 13715–13720. Бибкод : 2014PNAS..11113715K . дои : 10.1073/pnas.1216057111 . ПМК 4183302 . ПМИД 25225376 . S2CID 852584 .
^ Иннеребнер, Герд; Книф, Клаудия; Ворхольт, Джулия А. (2011). «Защита Arabidopsis thaliana от патогенных для листьев Pseudomonas syringae штаммами Sphingomonas в контролируемой модельной системе» . Прикладная и экологическая микробиология . 77 (10): 3202–3210. Бибкод : 2011ApEnM..77.3202I . дои : 10.1128/AEM.00133-11 . ПМК 3126462 . ПМИД 21421777 .
^ Лажуа, Женевьева; Мальоне, Реми; Кембель, Стивен В. (2020). «Адаптивное соответствие между филлосферными бактериями и их древесными хозяевами в неотропическом лесу» . Микробиом . 8 (1): 70. дои : 10.1186/s40168-020-00844-7 . ПМЦ 7243311 . ПМИД 32438916 .
^ Jump up to: ^а ^б Шейд, Эшли; Хандельсман, Джо (2012). «За пределами диаграммы Венна: охота за основным микробиомом» . Экологическая микробиология . 14 (1): 4–12. Бибкод : 2012EnvMi..14....4S . дои : 10.1111/j.1462-2920.2011.02585.x . ПМИД 22004523 .
^ Берг, Габриэле; Рыбакова Дарья; Фишер, Дорин; Чернава, Томислав; Верже, Мари-Кристин Шампомье; Чарльз, Тревор; Чен, Сяоюлун; Коколин, Лука; Эверсол, Келли; Коррал, Хема Эрреро; Казу, Мария; Кинкель, Линда; Ланге, Лене; Лима, Нельсон; Лой, Александр; и др. (2020). «Повторное рассмотрение определения микробиома: старые концепции и новые проблемы» . Микробиом . 8 (1): 103. дои : 10.1186/s40168-020-00875-0 . ПМЦ 7329523 . ПМИД 32605663 .
^ Тернбо, Питер Дж.; Хамади, Мика; Яцуненко Таня; Кантарел, Брэнди Л.; Дункан, Алексис; Лей, Рут Э.; Согин, Митчелл Л.; Джонс, Уильям Дж.; Роу, Брюс А.; Аффуртит, Джейсон П.; Эгхольм, Майкл; Анрисса, Бернар; Хит, Эндрю С.; Найт, Роб; Гордон, Джеффри И. (2009). «Основной микробиом кишечника у тучных и худых близнецов» . Природа . 457 (7228): 480–484. Бибкод : 2009Natur.457..480T . дои : 10.1038/nature07540 . ПМЦ 2677729 . ПМИД 19043404 .
^ Хамонтс, Келли; Триведи, Панкадж; Гарг, Аншу; Яниц, Кэролайн; Гринье, Жасмин; Холфорд, Пол; Бота, Фредерик К.; Андерсон, Ян К.; Сингх, Браджеш К. (2018). «Полевые исследования показывают основную микробиоту растений и относительную важность ее движущих сил». Экологическая микробиология . 20 (1): 124–140. Бибкод : 2018EnvMi..20..124H . дои : 10.1111/1462-2920.14031 . ПМИД 29266641 . S2CID 10650949 .
^ Чернава, Томислав; Эрлахер, Армин; Сох, Юнг; Сенсен, Кристоф В.; Грубе, Мартин; Берг, Габриэле (2019). «Энтеробактерии доминируют в основном микробиоме и вносят вклад в резистом рукколы (Eruca sativa Mill.)» . Микробиом . 7 (1): 13. дои : 10.1186/s40168-019-0624-7 . ПМК 6352427 . ПМИД 30696492 .
^ Лефф, Джонатан В.; Дель Тредичи, Питер; Фридман, Уильям Э.; Фирер, Ной (2015). «Пространственное структурирование бактериальных сообществ внутри отдельных двудольных деревьев гинкго ». Экологическая микробиология . 17 (7): 2352–2361. Бибкод : 2015EnvMi..17.2352L . дои : 10.1111/1462-2920.12695 . ПМИД 25367625 .
^ Эрнандес-Агреда, Алехандра; Гейтс, Рут Д.; Эйнсворт, Трейси Д. (2017). «Определение основного микробиома в микробном супе кораллов». Тенденции в микробиологии . 25 (2): 125–140. дои : 10.1016/j.tim.2016.11.003 . ПМИД 27919551 .
^ Стивенс, JMC; Молан, ПК; Кларксон, Б.Д. (2005). «Обзор Leptospermum scoparium (Myrtaceae) в Новой Зеландии» . Новозеландский журнал ботаники . 43 (2): 431–449. Бибкод : 2005NZJB...43..431S . дои : 10.1080/0028825X.2005.9512966 . S2CID 53515334 .
^ Купер, РА; Молан, ПК; Хардинг, КГ (2002). «Чувствительность к меду грамположительных кокков клинического значения, выделенных из ран». Журнал прикладной микробиологии . 93 (5): 857–863. дои : 10.1046/j.1365-2672.2002.01761.x . ПМИД 12392533 . S2CID 24517001 .
^ Раби, Эрика; Серем, Джун Чепту; Оберхольцер, Хестер Магдалена; Гаспар, Анабелла Регина Маркес; Бестер, Меган Джин (2016). «Как метилглиоксаль убивает бактерии: ультраструктурное исследование». Ультраструктурная патология . 40 (2): 107–111. дои : 10.3109/01913123.2016.1154914 . hdl : 2263/52156 . ПМИД 26986806 . S2CID 13372064 .
^ Джонстон, Питер Р. (1998). «Эндофиты листьев мануки (Leptospermum scoparium)». Микологические исследования . 102 (8): 1009–1016. дои : 10.1017/S0953756297005765 .
^ Маккензи, EHC; Джонстон, PR; Бьюкенен, ПК (2006). «Контрольный список грибов чайного дерева (виды Kunzea и Leptospermum ) в Новой Зеландии» . Новозеландский журнал ботаники . 44 (3): 293–335. Бибкод : 2006NZJB...44..293M . дои : 10.1080/0028825X.2006.9513025 . S2CID 84538904 .
^ Викаксоно, Вишну Ади; Сансом, Кэтрин Э.; Эйриан Джонс, Э.; Перри, Найджел Б.; Монк, Яна; Риджуэй, Хейли Дж. (2018). «Арбускулярные микоризные грибы, связанные с Leptospermum scoparium (Mānuka): влияние на рост растений и содержание эфирного масла». Симбиоз . 75 (1): 39–50. Бибкод : 2018Symbi..75...39W . дои : 10.1007/s13199-017-0506-3 . S2CID 4819178 .
^ Викаксоно, Вишну Ади; Джонс, Э. Эйриан ; Монк, Яна; Риджуэй, Хейли Дж. (2016). «Бактериальная подпись Leptospermum scoparium (Mānuka) выявляет основные и вспомогательные сообщества с биоактивными свойствами» . ПЛОС ОДИН . 11 (9): e0163717. Бибкод : 2016PLoSO..1163717W . дои : 10.1371/journal.pone.0163717 . ПМК 5038978 . ПМИД 27676607 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Джонстон-Монже, Дэвид; Гутьеррес, Джаннет П; Лопес-Лаваль, Луис АБ (2021). «Бактерии и грибы, передающиеся с семенами, доминируют в микробиомах юных растений» . Границы микробиологии . 12 . дои : 10.3389/fmicb.2021.737616 . ПМЦ 8569520 . ПМИД 34745040 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Война, Аадиль Фарук; Башир, Икра; Реши, Зафар А.; Кардол, Пол; Рашид, Ирфан (апрель 2023 г.). «Понимание микробиома семян и его экологического значения в жизни растений» . Микробиологические исследования . 269 . дои : 10.1016/j.micres.2023.127318 . ПМИД 36753851 . S2CID 256563377 .
^ Мацумото, Харуна; Ван, Кусстатчер, Цзе, Саньлин; Ван, Илин; Чжу, Хашидоко, Габриэле; Чернава, Томислав; Ван, Менгсен (4 января 2021 г.). «Бактериальный эндофит семян формирует устойчивость природных растений к болезням». .7 33398157. : 60–72. doi : 10.1038/s41477-020-00826-5 . PMID ) ( 1 S2CID 230508404 .
^ Нельсон, Эрик Б. (2018). «ОБЗОР: Микробиом семян: происхождение, взаимодействие и влияние». Растение и почва . 422 : 7–34. дои : 10.1007/s11104-017-3289-7 .
^ «Семена передают свои микробы следующему поколению» . ЭврекАлерт! АААС . Проверено 21 января 2021 г.
^ Jump up to: ^а ^б Абдельфаттах, Ахмед; Тэк, Эйко Дж. М.; Лобато, Каролина; Вассерманн, Биргит; Берг, Габриэле (апрель 2023 г.). «От семени к семени: роль микробной наследственности в формировании микробиома растения» . Тенденции в микробиологии . 31 (4): 346–355. дои : 10.1016/j.tim.2022.10.009 . ПМИД 36481186 .
^ Барлоу, Конни. «Опубликованные документы о причинах угрозы исчезновения Torreya Taxifolia во Флориде» . Стражи Торрея . Проверено 22 февраля 2024 г.

Справочники

Салим М. (2015) Экология микробиомного сообщества: основы и приложения Springer. ISBN 9783319116655 .
Кумар В., Прасад Р., Кумар М. и Чоудхари Д.К. (2019) Микробиом в здоровье и болезнях растений: проблемы и возможности Springer. ISBN 9789811384950 .
Кумар, Вивек; Прасад, Рам; Кумар, Манодж; Чоудхари, Девендра К. (10 августа 2019 г.). Микробиом в здоровье и болезнях растений: проблемы и возможности . Спрингер. ISBN 9789811384950 .
Грубе, Мартин; Шлотер, Майкл; Смолла, Корнелия; Берг, Габриэле (22 января 2015 г.). Микробиом растений и его значение для здоровья растений и человека . Том. 5. с. 491. дои : 10.3389/fmicb.2014.00491 . ISBN 9782889193783 . ПМК 4166366 . ПМИД 25278934 .
Эгамбердиева, Дилфуза; Ахмад, Парваиз (6 февраля 2018 г.). Микробиом растений: реакция на стресс . Спрингер. ISBN 9789811055140 .
Кастильоне, Стефано; Чикателли, Анджела; Феррол, Нурия; Розпадек, Петр (22 августа 2019 г.). Влияние взаимодействия растений и микробиома на способность к фито- и биовосстановлению . Фронтирс Медиа С.А. ISBN 9782889459322 .
Кастильоне, Стефано; Чикателли, Анджела; Феррол, Нурия; Розпадек, Петр (22 августа 2019 г.). Влияние взаимодействия растений и микробиома на способность к фито- и биовосстановлению . Фронтирс Медиа С.А. ISBN 9782889459322 .
КАРВАЛЬЯИС, Лилия К.; Деннис, Пол Г. (30 декабря 2020 г.). Растительный микробиом: методы и протоколы . Спрингер. ISBN 9781071610398 .
Кумар, Вивек; Прасад, Рам; Кумар, Манодж; Чоудхари, Девендра К. (10 августа 2019 г.). Микробиом в здоровье и болезнях растений: проблемы и возможности . Спрингер. ISBN 9789811384950 .
Соланки, Манодж Кумар; Кашьяп, Прем Лал; Ансари, Ризван Али; Кумари, Бэби (28 августа 2020 г.). Микробиомы и здоровье растений: Паноплия и их применение . Академическая пресса. ISBN 9780128226018 .
Ядав, Аджар (2020). Достижения в области микробиома растений и устойчивого сельского хозяйства, функциональная аннотация и будущие задачи . Сингапур: Спрингер. ISBN 978-981-15-3204-7 . OCLC 1193118045 .
Варма, Аджит (28 августа 2020 г.). Парадигма микробиома растений . Спрингер. ISBN 9783030503956 .
Доти, Шэрон Лафферти (21 сентября 2017 г.). Функциональное значение микробиома растений: значение для сельского хозяйства, лесного хозяйства и биоэнергетики . Спрингер. ISBN 9783319658971 .
Антвис, Рэйчел Э.; Харрисон, Ксавье А.; Кокс, Майкл Дж. (12 марта 2020 г.). Микробиомы почв, растений и животных: комплексный подход . Издательство Кембриджского университета. ISBN 9781108473712 .
Варма, Аджит; Трипати, Свати; Прасад, Рам (20 октября 2020 г.). Парадигма микробиома растений . Спрингер. ISBN 9783030503949 .
Розенберг, Юджин; Зильбер-Розенберг, Илана (31 января 2014 г.). Концепция гологенома: микробиота человека, животных и растений . Спрингер. ISBN 9783319042411 .
Ядав, Аджар Натх; Сингх, Джогиндер; Растегари, Али Асгар; Ядав, Нилам (6 марта 2020 г.). Растительные микробиомы для устойчивого сельского хозяйства . Спрингер. ISBN 9783030384531 .

[Turner2013-1] Jump up to: ^а ^б ^с Тернер, Томас Р.; Джеймс, Юан К.; Пул, Филип С. (2013). «Микробиом растений» . Геномная биология . 14 (6): 209. doi : 10.1186/gb-2013-14-6-209 . ПМК 3706808 . ПМИД 23805896 .

[Purahong2018-2] Jump up to: ^а ^б ^с Пурахонг, Витун; Орру, Луиджи; Донати, Ирен; Перпетуини, Джорджия; Челлини, Антонио; Ламонтанара, Антонелла; Микелотти, Ваня; Таккони, Джанни; Спинелли, Франческо (2018). «Микробиом растений и его связь со здоровьем растений: виды-хозяева, органы и Pseudomonas syringae pv. Инфекция Actinidiae, формирующая бактериальные филлосферные сообщества растений киви» . Границы в науке о растениях . 9 : 1563. doi : 10.3389/fpls.2018.01563 . ПМК 6234494 . ПМИД 30464766 . . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .

[Whipps1988-3] Уиппс, Дж. М.; Льюис, Карен; Кук, Р.К. (1988). «Микопаразитизм и борьба с болезнями растений». В Бердже, Майкл Н. (ред.). Грибы в системах биологического контроля . Манчестер, Великобритания, Нью-Йорк: Издательство Манчестерского университета. стр. 161–187. ISBN 978-0-7190-1979-1 .

[Berg2020-4] Берг, Габриэле ; Рыбакова Дарья; Фишер, Дорин; Чернава, Томислав; Верже, Мари-Кристин Шампомье; Чарльз, Тревор; Чен, Сяоюлун; Коколин, Лука; Эверсол, Келли; Коррал, Хема Эрреро; Казу, Мария; Кинкель, Линда; Ланге, Лене; Лима, Нельсон; Лой, Александр; и др. (декабрь 2020 г.). «Повторное рассмотрение определения микробиома: старые концепции и новые проблемы» . Микробиом . 8 (1). дои : 10.1186/s40168-020-00875-0 . hdl : 1822/65842 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .

[Dastogeer2020-5] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж Дастогер, К.М., Тумпа, Ф.Х., Султана, А., Актер, М.А. и Чакраборти, А. (2020) «Микробиом растений – отчет о факторах, которые формируют состав и разнообразие сообщества». Текущая биология растений : 100161. дои : 10.1016/j.cpb.2020.100161 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .

[Compant2019-6] Компант, Стефан; Самад, Абдул; Фаист, Ханна; Сессич, Анжела (2019). «Обзор микробиома растений: экология, функции и новые тенденции в применении микробов» . Журнал перспективных исследований . 19 :29–37. дои : 10.1016/j.jare.2019.03.004 . ПМК 6630030 .

[7] Брингель, Франсуаза; Куэ, Иван (2015). «Основная роль микроорганизмов филлосферы на стыке между функционированием растений и динамикой газовых примесей в атмосфере» . Границы микробиологии . 06 : 486. дои : 10.3389/fmicb.2015.00486 . ПМК 4440916 . ПМИД 26052316 .

[Berendsen2012-8] Jump up to: ^а ^б ^с Берендсен, Роланд Л.; Питерс, Корне MJ; Баккер, Питер АХМ (2012). «Ризосферный микробиом и здоровье растений». Тенденции в науке о растениях . 17 (8): 478–486. doi : 10.1016/j.tplants.2012.04.001 . hdl : 1874/255269 . ПМИД 22564542 . S2CID 32900768 .

[9] Берг, Габриэле; Грубе, М.; Шлотер, М.; Смолла, К. (2014). «Микробиом растений и его значение для здоровья растений и человека» . Границы микробиологии . 5 : 491. дои : 10.3389/fmicb.2014.00491 . ПМК 4166366 . ПМИД 25278934 .

[10] Шелаке, Р.М., Праманик, Д. и Ким, Дж.Я. (2019) «Исследование взаимодействия растений и микробов для устойчивого сельского хозяйства в эпоху CRISPR». Микроорганизмы , 7 (8): 269. doi : 10.3390/microorganisms7080269 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .

[11] Койде, Роджер Т.; Мосс, Барбара (2004). «История исследований арбускулярной микоризы». Микориза . 14 (3): 145–163. Бибкод : 2004Mycor..14..145K . дои : 10.1007/s00572-004-0307-4 . ПМИД 15088135 . S2CID 1809402 .

[Bulgarelli2013-12] Jump up to: ^а ^б Булгарелли, Давиде; Шлеппи, Клаус; Спепен, Стейн; Ван Темаат, Эмиэль Вер Лорен; Шульце-Леферт, Пол (2013). «Структура и функции бактериальной микробиоты растений». Ежегодный обзор биологии растений . 64 : 807–838. doi : 10.1146/annurev-arplant-050312-120106 . ПМИД 23373698 .

[Abdelfattah2021-13] Абдельфаттах, Ахмед; Тэк, Эйко Дж. М.; Вассерман, Биргит; Лю, Цзя; Берг, Габриэле; Норелли, Джон; Дроби, Самир; Вишневский, Майкл (2021). «Доказательства коэволюции хозяина и микробиома яблока» . Новый фитолог . 234 (6): 2088–2100. дои : 10.1111/nph.17820 . ISSN 1469-8137 . ПМЦ 9299473 . ПМИД 34823272 . S2CID 244661193 .

[14] Басби, Пози Э.; Соман, Чинмей; Вагнер, Мэгги Р.; Фризен, Марен Л.; Кремер, Джеймс; Беннетт, Элисон; Морси, Мустафа; Эйзен, Джонатан А.; Лич, Ян Э.; Дангл, Джеффри Л. (2017). «Приоритеты исследований по использованию растительных микробиомов в устойчивом сельском хозяйстве» . ПЛОС Биология . 15 (3): e2001793. дои : 10.1371/journal.pbio.2001793 . ПМК 5370116 . ПМИД 28350798 . S2CID 6434145 .

[15] Гантар, М.; Эльхай, Дж. (1999). «Колонизация параклубеньков пшеницы N2-фиксирующей цианобактерией Nostocsp . Штамм 2S9B» . Новый фитолог . 141 (3): 373–379. дои : 10.1046/j.1469-8137.1999.00352.x .

[16] Гантар, М. (2000). «Механическое повреждение корней обеспечивает усиленную колонизацию эндоризосферы пшеницы диазотфиксирующей цианобактерией Nostoc sp. Штамм 2S9B». Биология и плодородие почв . 32 (3): 250–255. Бибкод : 2000BioFS..32..250G . дои : 10.1007/s003740000243 . S2CID 7590731 .

[Treves2016-17] Тревес, Хаим; Раанан, Аггей; Кедем, Исаак; Мюрик, Омер; Керен, Нир; Зер, Хаггит; Беркович, Саймон М.; Джордано, Марио; Норичи, Алессандра; Шотланд, Джорам; Охад, Ицхак; Каплан, Аарон (2016). «Механизмы, благодаря которым зеленая водоросль Chlorella ohadii, выделенная из корки пустынной почвы, демонстрирует беспрецедентную устойчивость к фотоповреждениям» . Новый фитолог . 210 (4): 1229–1243. дои : 10.1111/nph.13870 . ПМИД 26853530 .

[18] Чжу, Хуан; Ли, Шуин; Ху, Чжэнъюй; Лю, Госян (2018). «Молекулярная характеристика эукариотических сообществ водорослей тропической филлосферы на основе секвенирования гена 18S рДНК в реальном времени» . Биология растений BMC . 18 (1): 365. дои : 10.1186/s12870-018-1588-7 . ПМК 6299628 . ПМИД 30563464 .

[19] Крингс, Майкл; Хасс, Хаген; Керп, Ганс; Тейлор, Томас Н.; Агерер, Рейнхард; Доцлер, Нора (2009). «Эндофитные цианобактерии в наземном растении возрастом 400 миллионов лет: сценарий возникновения симбиоза?». Обзор палеоботаники и палинологии . 153 (1–2): 62–69. Бибкод : 2009RPaPa.153...62K . дои : 10.1016/j.revpalbo.2008.06.006 .

[20] Картикеян Н.; Прасанна, Р.; Суд, А.; Джайсвал, П.; Наяк, С.; Кошик, Б.Д. (2009). «Физиологическая характеристика и электронно-микроскопическое исследование цианобактерий, связанных с ризосферой пшеницы». Фолиа микробиологическая . 54 (1): 43–51. дои : 10.1007/s12223-009-0007-8 . ПМИД 19330544 . S2CID 23420342 .

[Babu2015-21] Jump up to: ^а ^б Бабу, Сантош; Прасанна, Радха; Бидьярани, Нгангом; Сингх, Раджендра (2015). «Анализ колонизации инокулированных цианобактерий в растениях пшеницы с использованием биохимических и молекулярных инструментов». Журнал прикладной психологии . 27 (1): 327–338. Бибкод : 2015JAPco..27..327B . дои : 10.1007/s10811-014-0322-6 . S2CID 17353123 .

[Bidyarani2015-22] Jump up to: ^а ^б Бидьярани, Нгангом; Прасанна, Радха; Чавла, Гаутама; Бабу, Сантош; Сингх, Раджендра (2015). «Расшифровка факторов, связанных с заселением растений риса цианобактериями». Журнал фундаментальной микробиологии . 55 (4): 407–419. дои : 10.1002/jobm.201400591 . ПМИД 25515189 . S2CID 5401526 .

[Gantar1991-23] Jump up to: ^а ^б Гантар, М.; Керби, Северо-Запад; Роуэлл, П. (1991). «Колонизация пшеницы (Triticum vulgare L.) N2-фиксирующими цианобактериями: II. Ультраструктурное исследование». Новый фитолог . 118 (3): 485–492. дои : 10.1111/j.1469-8137.1991.tb00031.x .

[24] Ахмед, Мехбуб; Сталь, Лукас Дж.; Хаснайн, Шахида (2010). «Ассоциация негетероцистных цианобактерий с сельскохозяйственными растениями» . Растение и почва . 336 (1–2): 363–375. Бибкод : 2010ПлСой.336..363А . дои : 10.1007/s11104-010-0488-x . S2CID 21309970 .

[25] Хусейн, Анвар; Хамаюн, Мухаммед; Шах, Сайед Тарик (2013). «Корневая колонизация и фитостимуляция фитогормонами, продуцирующими энтофитный Nostoc sp. AH-12». Современная микробиология . 67 (5): 624–630. дои : 10.1007/s00284-013-0408-4 . ПМИД 23794014 . S2CID 14704537 .

[26] Хусейн, Анвар; Шах, Сайед Т.; Рахман, Хазир; Иршад, Мухаммед; Икбал, Амджад (2015). «Влияние IAA на рост in vitro и колонизацию Nostoc в корнях растений» . Границы в науке о растениях . 6 : 46. дои : 10.3389/fpls.2015.00046 . ПМЦ 4318279 . ПМИД 25699072 .

[Lee2021-27] Jump up to: ^а ^б ^с Ли, Сан-Му; Рю, Чунг Мин (4 февраля 2021 г.). «Водоросли как новенькие в полезном микробиоме растений» . Границы в науке о растениях . 12 . Frontiers Media SA: 599742. doi : 10.3389/fpls.2021.599742 . ISSN 1664-462X . ПМЦ 7889962 . ПМИД 33613596 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .

[Chaudhry2021-28] Jump up to: ^а ^б Чаудри, Васви; Рунге, Пол; Сенгупта, Приямедха; Дёлеманн, Гюнтер; Паркер, Джейн Э; Кемен, Эрик (10 сентября 2020 г.). Коприва, Станислав (ред.). «Формирование микробиоты листа: взаимодействие растение-микроб-микроб» . Журнал экспериментальной ботаники . 72 (1). Издательство Оксфордского университета (OUP): 36–56. дои : 10.1093/jxb/eraa417 . ISSN 0022-0957 . ПМК 8210630 . ПМИД 32910810 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .

[Vishwakarma2020-29] Вишвакарма, Канчан; Кумар, Нитин; Шандилья, Читракши; Мохапатра, Свати; Бхайана, Сахил; Варма, Аджит (2020). «Возврат к взаимодействиям растений и микробов и использованию микробных консорциумов для улучшения устойчивого сельского хозяйства: обзор» . Границы микробиологии . 11 : 560406. doi : 10.3389/fmicb.2020.560406 . ПМЦ 7779480 . ПМИД 33408698 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .

[30] Хинсингер, Филипп; Бенго, А. Глин; Веттерлейн, Дорис; Янг, Иэн М. (2009). «Ризосфера: биофизика, биогеохимия и экологическая значимость». Растение и почва . 321 (1–2): 117–152. Бибкод : 2009PlSoi.321..117H . дои : 10.1007/s11104-008-9885-9 . S2CID 8997382 .

[31] Бонковски, Майкл; Вильенав, Сесиль; Гриффитс, Брайан (2009). «Ризосферная фауна: функциональное и структурное разнообразие тесных взаимодействий почвенной фауны с корнями растений». Растение и почва . 321 (1–2): 213–233. Бибкод : 2009ПлСой.321..213Б . дои : 10.1007/s11104-009-0013-2 . S2CID 35701713 .

[Hassani2018-32] Jump up to: ^а ^б Хасани, М. Амин; Дуран, Палома; Хаккар, Стефан (март 2018 г.). «Микробные взаимодействия внутри холобионта растений» . Микробиом . 6 (1): 58. дои : 10.1186/s40168-018-0445-0 . ПМЦ 5870681 . ПМИД 29587885 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .

[33] Ван дер Хейден, Марсель Г.А.; Мартин, Фрэнсис М.; Селосс, Марк-Андре; Сандерс, Ян Р. (2015). «Микоризная экология и эволюция: прошлое, настоящее и будущее». Новый фитолог . 205 (4): 1406–1423. дои : 10.1111/nph.13288 . ПМИД 25639293 .

[34] Рич, Мелани К.; Нури, Ева; Курти, Пьер-Эммануэль; Рейнхардт, Дидье (2017). «Диета арбускулярных микоризных грибов: хлеб с маслом?» (PDF) . Тенденции в науке о растениях . 22 (8): 652–660. doi : 10.1016/j.tplants.2017.05.008 . ПМИД 28622919 .

[35] Ли, Ын-Хва; Эо, Джу-Кён; Ка, Кан Хён; Эом, Ан-Хым (2013). «Разнообразие арбускулярных микоризных грибов и их роль в экосистемах» . Микобиология . 41 (3): 121–125. дои : 10.5941/MYCO.2013.41.3.121 . ПМЦ 3817225 . ПМИД 24198665 .

[36] Ганс, Дж.; Волински, М.; Данбар, Дж. (2005). «Усовершенствования вычислений показывают большое бактериальное разнообразие и высокую токсичность металлов в почве». Наука . 309 (5739): 1387–1390. Бибкод : 2005Sci...309.1387G . дои : 10.1126/science.1112665 . ПМИД 16123304 . S2CID 130269020 .

[37] ̇Nceoğlu, Озгюль; Аль-Суд, Валид Абу; Саллес, Жоана Фалькао; Семенов Александр В.; Ван Эльзас, Ян Дирк (2011). «Сравнительный анализ бактериальных сообществ на картофельном поле, определенный методом пиросеквенирования» . ПЛОС ОДИН . 6 (8): e23321. Бибкод : 2011PLoSO...623321I . дои : 10.1371/journal.pone.0023321 . ПМК 3158761 . ПМИД 21886785 .

[Bulgarelli2012-38] Jump up to: ^а ^б ^с Булгарелли, Давиде; Ротт, Матиас; Шлеппи, Клаус; Вер Лорен Ван Темаат, Эмиэль; Ахмадинежад, Нахаль; Ассенца, Федерика; Рауф, Филип; Хюттель, Бруно; Рейнхардт, Ричард; Шмельцер, Элмон; Пеплиес, Йорг; Глекнер, Фрэнк Оливер; Аманн, Рудольф; Эйкхорст, Тило; Шульце-Леферт, Пол (2012). «Выявление структуры и признаков сборки бактериальной микробиоты, обитающей в корнях арабидопсиса». Природа . 488 (7409): 91-95. Стартовый код : 2012Природа.488...91Б . дои : 10.1038/nature11336 . ПМИД 22859207 . S2CID 4393146 .

[39] Уроз, Стефан; Буэ, Марк; Мюрат, Клод; Фрей-Клетт, Паскаль; Мартин, Фрэнсис (2010). «Пиросеквенирование выявляет контрастное бактериальное разнообразие между ризосферой дуба и окружающей почвой». Отчеты по экологической микробиологии . 2 (2): 281–288. Бибкод : 2010EnvMR...2..281U . дои : 10.1111/j.1758-2229.2009.00117.x . ПМИД 23766079 .

[Lundberg2012-40] Jump up to: ^а ^б Лундберг, Дерек С.; Лебейс, Сара Л.; Стены, Южный Кузнец; Вашстон, Скотт; Геринг, Джейс; Малфатти, Стефани; Трамбле, Жюльен; Энгельбректсон, Анна; Сегодня, Виктор; Рио, Тихана Главина; Эдгар, Роберт С.; Эйкхорст, Вещи; Ло, Рут Э.; Гугенгольц, Филип; Тринге, Сюзанна Грин; Дангл, Джеффри Л. (2012). «Определение основного микробиома корня Arabidopsis thaliana» . Природа 488 (7409): 86–90. Бибкод : 2012Природа.488...86Л . дои : 10.1038/nature11237 . ПМК 4074413 . ПМИД 22859206 .

[Schlaeppi2014-41] Jump up to: ^а ^б Шлеппи, К.; Домбровский, Н.; Отер, Р.Г.; Вер Лорен Ван Темаат, Э.; Шульце-Леферт, П. (2014). «Количественное расхождение бактериальной корневой микробиоты у родственников Arabidopsis thaliana» . Труды Национальной академии наук . 111 (2): 585–592. Бибкод : 2014PNAS..111..585S . дои : 10.1073/pnas.1321597111 . ПМК 3896156 . ПМИД 24379374 . S2CID 13806811 .

[Vokou2012-42] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Воку, Деспойна; Варели, Катерина; Зарали, Екатерини; Караманоли, Катерина; Константиниду, Хелен-Исида А.; Монокрусос, Николаос; Хэлли, Джон М.; Сайнис, Иоаннис (2012). «Изучение биоразнообразия бактериального сообщества средиземноморской филлосферы и его связи с бактериями, передающимися по воздуху». Микробная экология . 64 (3): 714–724. Бибкод : 2012MicEc..64..714V . дои : 10.1007/s00248-012-0053-7 . ПМИД 22544345 . S2CID 17291303 .

[Dastogeer2017-43] Дастогер, Хондокер М.Г.; Ли, Хуа; Сиваситхампарам, Кришнапиллай; Джонс, Майкл Г.К.; Ду, Синь; Рен, Юнлинь; Уайли, Стивен Дж. (2017). «Метаболические реакции эндофитных растений Nicotiana benthamiana, испытывающих водный стресс» . Экологическая и экспериментальная ботаника . 143 : 59–71. Бибкод : 2017EnvEB.143...59D . дои : 10.1016/j.envexpbot.2017.08.008 .

[44] Родригес, Р.Дж.; Уайт-младший, Дж. Ф.; Арнольд, А.Е.; Редман, RS (2009). «Грибные эндофиты: разнообразие и функциональные роли» . Новый фитолог . 182 (2): 314–330. дои : 10.1111/j.1469-8137.2009.02773.x . ПМИД 19236579 .

[Abdel-2021-45] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Абдельфаттах, Ахмед; Вишневский, Майкл; Шена, Леонардо; Тэк, Айко Дж. М. (2021). «Экспериментальные доказательства наследования микробов у растений и путей передачи от семян к филлосфере и корням» . Экологическая микробиология . 23 (4): 2199–2214. Бибкод : 2021EnvMi..23.2199A . дои : 10.1111/1462-2920.15392 . ISSN 1462-2920 . ПМИД 33427409 .

[He2020-46] Хэ, Шэн-Ян (28 августа 2020 г.). «Когда растения и их микробы не синхронизированы, результаты могут быть катастрофическими» . Разговор .

[47] Линдоу, Стивен Э. (1996). «Роль иммиграции и других процессов в определении популяций эпифитных бактерий». Воздушная поверхностная микробиология растений . стр. 155–168. дои : 10.1007/978-0-585-34164-4_10 . ISBN 978-0-306-45382-3 .

[48] Фризен, Марен Л.; Портер, Стефани С.; Старк, Скотт С.; фон Веттберг, Эрик Дж.; Сакс, Джоэл Л.; Мартинес-Ромеро, Эсперанса (2011). «Микробно-опосредованные функциональные особенности растений». Ежегодный обзор экологии, эволюции и систематики . 42 : 23–46. doi : 10.1146/annurev-ecolsys-102710-145039 .

[Leveau2019-49] Jump up to: ^а ^б Лево, Йохан Х.Дж. (2019). «Краткое описание с листа: Последние исследования, способствующие нашему пониманию микробиома филлосферы». Современное мнение в микробиологии . 49 : 41–49. дои : 10.1016/j.mib.2019.10.002 . ПМИД 31707206 . S2CID 207946690 .

[50] Руинен, Дж. (февраль 1956 г.). «Распространение видов Beijerinckia в« филлосфере » ». Природа . 177 (4501): 220–221. дои : 10.1038/177220a0 . ISSN 1476-4687 .

[Vogel2016-51] Jump up to: ^а ^б Фогель, Кристина ; Боденхаузен, Наташа; Грюиссем, Вильгельм; Ворхольт, Джулия А. (2016). «Транскриптом листьев арабидопсиса демонстрирует различные, но также перекрывающиеся реакции на колонизацию филлосферными комменсалами и патогенную инфекцию, оказывающую влияние на здоровье растений» (PDF) . Новый фитолог . 212 (1): 192–207. дои : 10.1111/nph.14036 . hdl : 20.500.11850/117578 . ПМИД 27306148 .

[Ruinen1956-52] Jump up to: ^а ^б Сид, Фернанда П.; Маруяма, Фумито; Мурасе, Кадзунори; Гретер, Стивен П.; Ларама, Джованни; Браво, Леон А.; Хоркера, Милко А. (2018). «Проект последовательности генома бактерий, выделенных из филлосферы Deschampsia antarctica». Экстремофилы . 22 (3): 537–552. дои : 10.1007/s00792-018-1015-x . ПМИД 29492666 . S2CID 4320165 .

[53] Кумаравел, Совья; Танкаппан, Сугита; Рагхупати, Шридар; Утанди, Сивакумар (2018). «Проект геномной последовательности стимулирующей рост растений и устойчивой к засухе Bacillus altitudinis FD48, выделенной из филлопланы риса» . Геномные объявления . 6 (9). doi : 10.1128/genomeA.00019-18 . ПМЦ 5834328 . ПМИД 29496824 .

[54] Лафорест-Лапуант, Изабель; Уитакер, Бриана К. (2019). «Расшифровка микробиоты филлосферы: прогресс и проблемы» . Американский журнал ботаники . 106 (2): 171–173. дои : 10.1002/ajb2.1229 . ПМИД 30726571 .

[Noble2020-55] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Благородная, Аня С.; Нет, Стиви; Клируотер, Майкл Дж.; Ли, Чарльз К. (2020). «Основной микробиом филлосферы существует в отдаленных популяциях видов деревьев, произрастающих в Новой Зеландии» . ПЛОС ОДИН . 15 (8): e0237079. Бибкод : 2020PLoSO..1537079N . дои : 10.1371/journal.pone.0237079 . ПМЦ 7425925 . ПМИД 32790769 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .

[Finkel2011-56] Jump up to: ^а ^б ^с Финкель, Омри М.; Берч, Эдриан Ю.; Линдоу, Стивен Э.; Пост, Антон Ф.; Белкин, Шимшон (2011). «Географическое положение определяет популяционную структуру филлосферных микробных сообществ соляного пустынного дерева» . Прикладная и экологическая микробиология . 77 (21): 7647–7655. Бибкод : 2011ApEnM..77.7647F . дои : 10.1128/АЕМ.05565-11 . ПМК 3209174 . ПМИД 21926212 .

[Vorholt2012-57] Jump up to: ^а ^б Ворхольт, Джулия А. (2012). «Микробная жизнь в филлосфере». Обзоры природы Микробиология . 10 (12): 828–840. дои : 10.1038/nrmicro2910 . hdl : 20.500.11850/59727 . ПМИД 23154261 . S2CID 10447146 .

[58] Линдоу, Стивен Э.; Брандл, Мария Т. (2003). «Микробиология филлосферы» . Прикладная и экологическая микробиология . 69 (4): 1875–1883. Бибкод : 2003ApEnM..69.1875L . дои : 10.1128/АЕМ.69.4.1875-1883.2003 . ПМК 154815 . ПМИД 12676659 . S2CID 2304379 .

[59] Боденхаузен, Наташа; Хортон, Мэтью В.; Бергельсон, Джой (2013). «Бактериальные сообщества, связанные с листьями и корнями Arabidopsis thaliana» . ПЛОС ОДИН . 8 (2): e56329. Бибкод : 2013PLoSO...856329B . дои : 10.1371/journal.pone.0056329 . ПМЦ 3574144 . ПМИД 23457551 .

[Stone2014-60] Jump up to: ^а ^б Стоун, Брэм В.Г.; Джексон, Колин Р. (2016). «Биогеографические закономерности между бактериальными филлосферными сообществами южной магнолии (Magnolia grandiflora) в небольшом лесу». Микробная экология . 71 (4): 954–961. Бибкод : 2016MicEc..71..954S . дои : 10.1007/s00248-016-0738-4 . ПМИД 26883131 . S2CID 17292307 .

[Redford2010-61] Jump up to: ^а ^б Редфорд, Аманда Дж.; Бауэрс, Роберт М.; Найт, Роб; Линхарт, Ян; Фирер, Ной (2010). «Экология филлосферы: Географическая и филогенетическая изменчивость распределения бактерий на листьях деревьев» . Экологическая микробиология . 12 (11): 2885–2893. Бибкод : 2010EnvMi..12.2885R . дои : 10.1111/j.1462-2920.2010.02258.x . ПМК 3156554 . ПМИД 20545741 .

[Laforest-Lapointe2016-62] Jump up to: ^а ^б ^с Лафорест-Лапуант, Изабель; Мессье, Кристиан; Кембель, Стивен В. (2016). «Идентичность вида-хозяина, место и время определяют структуру бактериального сообщества филлосферы деревьев умеренного климата» . Микробиом . 4 (1): 27. дои : 10.1186/s40168-016-0174-1 . ПМЦ 4912770 . ПМИД 27316353 .

[63] Сарраонаиндия, Ираче; Оуэнс, Сара М.; Вайзенхорн, Памела; Уэст, Кристин; Хэмптон-Марселл, Джаррад; Лакс, Саймон; Бокулич, Николай Александрович; Миллс, Дэвид А.; Мартин, Жиль; Тагави, Сафий; Ван дер Лели, Дэниел; Гилберт, Джек А. (2015). «Микробиом почвы влияет на микробиоту, связанную с виноградной лозой» . мБио . 6 (2). дои : 10.1128/mBio.02527-14 . ПМЦ 4453523 . ПМИД 25805735 .

[64] Финкель, Омри М.; Берч, Эдриан Ю.; Элад, Таль; Хьюз, Сьюзен М.; Линдоу, Стивен Э.; Пост, Антон Ф.; Белкин, Шимшон (2012). «Зависимость расстояния от распада частично определяет структуру разнообразия филлосферных бактерий на деревьях тамрикс в пустыне Сонора» . Прикладная и экологическая микробиология . 78 (17): 6187–6193. Бибкод : 2012ApEnM..78.6187F . дои : 10.1128/AEM.00888-12 . ПМЦ 3416633 . ПМИД 22752165 .

[Kembel2014-65] Jump up to: ^а ^б Кембель, Юго-Запад; О'Коннор, ТК; Арнольд, Гонконг; Хаббелл, СП; Райт, С.Дж.; Грин, Дж.Л. (2014). «Связь между бактериальными сообществами филлосферы и функциональными особенностями растений в неотропическом лесу» . Труды Национальной академии наук . 111 (38): 13715–13720. Бибкод : 2014PNAS..11113715K . дои : 10.1073/pnas.1216057111 . ПМК 4183302 . ПМИД 25225376 . S2CID 852584 .

[66] Иннеребнер, Герд; Книф, Клаудия; Ворхольт, Джулия А. (2011). «Защита Arabidopsis thaliana от патогенных для листьев Pseudomonas syringae штаммами Sphingomonas в контролируемой модельной системе» . Прикладная и экологическая микробиология . 77 (10): 3202–3210. Бибкод : 2011ApEnM..77.3202I . дои : 10.1128/AEM.00133-11 . ПМК 3126462 . ПМИД 21421777 .

[67] Лажуа, Женевьева; Мальоне, Реми; Кембель, Стивен В. (2020). «Адаптивное соответствие между филлосферными бактериями и их древесными хозяевами в неотропическом лесу» . Микробиом . 8 (1): 70. дои : 10.1186/s40168-020-00844-7 . ПМЦ 7243311 . ПМИД 32438916 .

[Shade2012-68] Jump up to: ^а ^б Шейд, Эшли; Хандельсман, Джо (2012). «За пределами диаграммы Венна: охота за основным микробиомом» . Экологическая микробиология . 14 (1): 4–12. Бибкод : 2012EnvMi..14....4S . дои : 10.1111/j.1462-2920.2011.02585.x . ПМИД 22004523 .

[69] Берг, Габриэле; Рыбакова Дарья; Фишер, Дорин; Чернава, Томислав; Верже, Мари-Кристин Шампомье; Чарльз, Тревор; Чен, Сяоюлун; Коколин, Лука; Эверсол, Келли; Коррал, Хема Эрреро; Казу, Мария; Кинкель, Линда; Ланге, Лене; Лима, Нельсон; Лой, Александр; и др. (2020). «Повторное рассмотрение определения микробиома: старые концепции и новые проблемы» . Микробиом . 8 (1): 103. дои : 10.1186/s40168-020-00875-0 . ПМЦ 7329523 . ПМИД 32605663 .

[70] Тернбо, Питер Дж.; Хамади, Мика; Яцуненко Таня; Кантарел, Брэнди Л.; Дункан, Алексис; Лей, Рут Э.; Согин, Митчелл Л.; Джонс, Уильям Дж.; Роу, Брюс А.; Аффуртит, Джейсон П.; Эгхольм, Майкл; Анрисса, Бернар; Хит, Эндрю С.; Найт, Роб; Гордон, Джеффри И. (2009). «Основной микробиом кишечника у тучных и худых близнецов» . Природа . 457 (7228): 480–484. Бибкод : 2009Natur.457..480T . дои : 10.1038/nature07540 . ПМЦ 2677729 . ПМИД 19043404 .

[71] Хамонтс, Келли; Триведи, Панкадж; Гарг, Аншу; Яниц, Кэролайн; Гринье, Жасмин; Холфорд, Пол; Бота, Фредерик К.; Андерсон, Ян К.; Сингх, Браджеш К. (2018). «Полевые исследования показывают основную микробиоту растений и относительную важность ее движущих сил». Экологическая микробиология . 20 (1): 124–140. Бибкод : 2018EnvMi..20..124H . дои : 10.1111/1462-2920.14031 . ПМИД 29266641 . S2CID 10650949 .

[72] Чернава, Томислав; Эрлахер, Армин; Сох, Юнг; Сенсен, Кристоф В.; Грубе, Мартин; Берг, Габриэле (2019). «Энтеробактерии доминируют в основном микробиоме и вносят вклад в резистом рукколы (Eruca sativa Mill.)» . Микробиом . 7 (1): 13. дои : 10.1186/s40168-019-0624-7 . ПМК 6352427 . ПМИД 30696492 .

[73] Лефф, Джонатан В.; Дель Тредичи, Питер; Фридман, Уильям Э.; Фирер, Ной (2015). «Пространственное структурирование бактериальных сообществ внутри отдельных двудольных деревьев гинкго ». Экологическая микробиология . 17 (7): 2352–2361. Бибкод : 2015EnvMi..17.2352L . дои : 10.1111/1462-2920.12695 . ПМИД 25367625 .

[74] Эрнандес-Агреда, Алехандра; Гейтс, Рут Д.; Эйнсворт, Трейси Д. (2017). «Определение основного микробиома в микробном супе кораллов». Тенденции в микробиологии . 25 (2): 125–140. дои : 10.1016/j.tim.2016.11.003 . ПМИД 27919551 .

[75] Стивенс, JMC; Молан, ПК; Кларксон, Б.Д. (2005). «Обзор Leptospermum scoparium (Myrtaceae) в Новой Зеландии» . Новозеландский журнал ботаники . 43 (2): 431–449. Бибкод : 2005NZJB...43..431S . дои : 10.1080/0028825X.2005.9512966 . S2CID 53515334 .

[76] Купер, РА; Молан, ПК; Хардинг, КГ (2002). «Чувствительность к меду грамположительных кокков клинического значения, выделенных из ран». Журнал прикладной микробиологии . 93 (5): 857–863. дои : 10.1046/j.1365-2672.2002.01761.x . ПМИД 12392533 . S2CID 24517001 .

[77] Раби, Эрика; Серем, Джун Чепту; Оберхольцер, Хестер Магдалена; Гаспар, Анабелла Регина Маркес; Бестер, Меган Джин (2016). «Как метилглиоксаль убивает бактерии: ультраструктурное исследование». Ультраструктурная патология . 40 (2): 107–111. дои : 10.3109/01913123.2016.1154914 . hdl : 2263/52156 . ПМИД 26986806 . S2CID 13372064 .

[78] Джонстон, Питер Р. (1998). «Эндофиты листьев мануки (Leptospermum scoparium)». Микологические исследования . 102 (8): 1009–1016. дои : 10.1017/S0953756297005765 .

[79] Маккензи, EHC; Джонстон, PR; Бьюкенен, ПК (2006). «Контрольный список грибов чайного дерева (виды Kunzea и Leptospermum ) в Новой Зеландии» . Новозеландский журнал ботаники . 44 (3): 293–335. Бибкод : 2006NZJB...44..293M . дои : 10.1080/0028825X.2006.9513025 . S2CID 84538904 .

[80] Викаксоно, Вишну Ади; Сансом, Кэтрин Э.; Эйриан Джонс, Э.; Перри, Найджел Б.; Монк, Яна; Риджуэй, Хейли Дж. (2018). «Арбускулярные микоризные грибы, связанные с Leptospermum scoparium (Mānuka): влияние на рост растений и содержание эфирного масла». Симбиоз . 75 (1): 39–50. Бибкод : 2018Symbi..75...39W . дои : 10.1007/s13199-017-0506-3 . S2CID 4819178 .

[81] Викаксоно, Вишну Ади; Джонс, Э. Эйриан ; Монк, Яна; Риджуэй, Хейли Дж. (2016). «Бактериальная подпись Leptospermum scoparium (Mānuka) выявляет основные и вспомогательные сообщества с биоактивными свойствами» . ПЛОС ОДИН . 11 (9): e0163717. Бибкод : 2016PLoSO..1163717W . дои : 10.1371/journal.pone.0163717 . ПМК 5038978 . ПМИД 27676607 .

[Frontiers-2021-82] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Джонстон-Монже, Дэвид; Гутьеррес, Джаннет П; Лопес-Лаваль, Луис АБ (2021). «Бактерии и грибы, передающиеся с семенами, доминируют в микробиомах юных растений» . Границы микробиологии . 12 . дои : 10.3389/fmicb.2021.737616 . ПМЦ 8569520 . ПМИД 34745040 .

[Aadil-2023-83] Jump up to: ^а ^б ^с Война, Аадиль Фарук; Башир, Икра; Реши, Зафар А.; Кардол, Пол; Рашид, Ирфан (апрель 2023 г.). «Понимание микробиома семян и его экологического значения в жизни растений» . Микробиологические исследования . 269 . дои : 10.1016/j.micres.2023.127318 . ПМИД 36753851 . S2CID 256563377 .

[84] Мацумото, Харуна; Ван, Кусстатчер, Цзе, Саньлин; Ван, Илин; Чжу, Хашидоко, Габриэле; Чернава, Томислав; Ван, Менгсен (4 января 2021 г.). «Бактериальный эндофит семян формирует устойчивость природных растений к болезням». .7 33398157. : 60–72. doi : 10.1038/s41477-020-00826-5 . PMID ) ( 1 S2CID 230508404 .

[Nelson-2018-85] Нельсон, Эрик Б. (2018). «ОБЗОР: Микробиом семян: происхождение, взаимодействие и влияние». Растение и почва . 422 : 7–34. дои : 10.1007/s11104-017-3289-7 .

[86] «Семена передают свои микробы следующему поколению» . ЭврекАлерт! АААС . Проверено 21 января 2021 г.

[Abdel-2023-87] Jump up to: ^а ^б Абдельфаттах, Ахмед; Тэк, Эйко Дж. М.; Лобато, Каролина; Вассерманн, Биргит; Берг, Габриэле (апрель 2023 г.). «От семени к семени: роль микробной наследственности в формировании микробиома растения» . Тенденции в микробиологии . 31 (4): 346–355. дои : 10.1016/j.tim.2022.10.009 . ПМИД 36481186 .

[torreya-2023-88] Барлоу, Конни. «Опубликованные документы о причинах угрозы исчезновения Torreya Taxifolia во Флориде» . Стражи Торрея . Проверено 22 февраля 2024 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

[ 45 ]

[ 46 ]

[ 47 ]

[ 48 ]

[ 49 ]

[ 50 ]

[ 51 ]

[ 52 ]

[ 53 ]

[ 54 ]

[ 55 ]

[ 56 ]

[ 57 ]

[ 58 ]

[ 59 ]

[ 60 ]

[ 61 ]

[ 62 ]

[ 63 ]

[ 64 ]

[ 65 ]

[ 66 ]

[ 67 ]

[ 68 ]

[ 69 ]

[ 70 ]

[ 71 ]

[ 72 ]

[ 73 ]

[ 74 ]

[ 75 ]

[ 76 ]

[ 77 ]

[ 78 ]

[ 79 ]

[ 80 ]

[ 81 ]

[ 82 ]

[ 83 ]

[ 84 ]

[ 85 ]

[ 86 ]

[ 87 ]

[ 88 ]

v т и Микроорганизмы
Groups	Archaea Bacteria Cyanobacteria Fungi Nanobacterium Prokaryote Protist Protozoa Virus
Microbiology	Microbial biogeography Microbial genetics Microbial intelligence Microbial metabolism Microbial phylogenetics Microbial population biology Mycology Virology
Motion	Bacterial motility run-and-tumble twitching gliding Protist locomotion amoeboids Bacteria collective motion
Ecology	Biofilm Biological pump Kill the Winner hypothesis Microbial consortium Microbial cooperation Microbial biodegradation Microbial ecology Microbial cyst Microbial food web microbial loop viral shunt Microbial mat Microbial synergy Microbiome microbiota holobiont Quorum sensing Host microbe interactions in Caenorhabditis elegans
Plants	Plant microbiome Root microbiome Seagrass microbiome Soil microbiology Spermosphere
Marine	Marine microorganisms Marine viruses Marine prokaryotes Marine protists Microalgae Antarctic microorganism Coral microbiome Hydrothermal vent microbial communities Marine microbial symbiosis Microbial oxidation of sulfur Phycosphere Picoeukaryote International Census of Marine Microbes
Human related	Microbes in human culture Microbiomes of the built environment Food microbiology Microbial oil Microbial symbiosis and immunity Nylon-eating Human microbiome asthma dysbiosis fecal gut lung mouth skin vagina in pregnancy placenta uterus Human Microbiome Project Protein production Synthetic microbial consortia
Techniques	Dark-field microscopy DNA sequencing Impedance microbiology Microbial cytology Microbial DNA barcoding Microbiological culture Staining
Other	Bioremediation Deep biosphere Microbial dark matter Microswimmer biohybrid Lines on the Antiquity of Microbes Microbially induced sedimentary structure Omics Physical factors affecting microbial life Siderophore
Category