Кофактор гепарина II

СЕРПИНД1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 1JMO, 1JMJ, 2NAT
Идентификаторы
Псевдонимы	SERPIND1 , D22S673, HC2, HCF2, HCII, HLS2, LS2, THPH10, член 1 семейства серпинов D
Внешние идентификаторы	Опустить : 142360 ; МГИ : 96051 ; Гомологен : 36018 ; GeneCards : SERPIND1 ; OMA : SERPIND1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 22 (human) Band 22q11.21 Start 20,774,113 bp End 20,787,720 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 16 (mouse) Band 16 A3|16 10.74 cM Start 17,149,235 bp End 17,161,439 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in liver right lobe of liver Epithelium of choroid plexus testicle trigeminal ganglion nucleus accumbens islet of Langerhans right auricle left ovary canal of the cervix Top expressed in liver left lobe of liver fetal liver hematopoietic progenitor cell optic nerve sciatic nerve gallbladder human fetus yolk sac lens sexually immature organism More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function peptidase inhibitor activity endopeptidase inhibitor activity heparin binding serine-type endopeptidase inhibitor activity Cellular component extracellular exosome extracellular space endoplasmic reticulum lumen extracellular region Biological process negative regulation of peptidase activity bioluminescence hemostasis chemotaxis blood coagulation negative regulation of endopeptidase activity post-translational protein modification Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 3053 15160 Вместе ENSG00000099937 ENSMUSG00000022766 ЮниПрот P05546 P49182 RefSeq (мРНК) НМ_000185 НМ_008223 НМ_001331047 RefSeq (белок) НП_000176 НП_001317976 НП_032249 Местоположение (UCSC) Чр 22: 20,77 – 20,79 Мб Чр 16: 17.15 – 17.16 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Кофактор гепарина II ( HCII ), белок, кодируемый SERPIND1 геном , является фактором свертывания крови , ингибирующим IIa, и является кофактором гепарина и дерматансульфата («минорный антитромбин»).

Продукт, кодируемый этим геном, представляет собой ингибитор сериновой протеазы , который быстро ингибирует тромбин в присутствии дерматансульфата или гепарина. Ген содержит пять экзонов и четыре интрона . Этот белок имеет гомологию с антитромбином III и другими членами альфа-1-антитрипсина суперсемейства . Мутации в этом гене связаны с дефицитом кофактора гепарина II. Дефицит кофактора гепарина II может привести к повышенному образованию тромбина и состоянию гиперкоагуляции .

В 1981 году был проведен эксперимент по очистке кофактора гепарина II, в ходе которого было обнаружено, что очищенная версия белка состоит из одной полипептидной цепи. Дальнейшие эксперименты показали, что присутствие β-меркаптоэтанола не влияет на активность HCII при гель-электрофорезе . β-меркаптоэтанол обычно используется для восстановления дисульфидных связей внутри молекулы, но гель-электрофорез показал, что HCII не имеет ни одной из этих связей. Структура аналогична антитромбину III (ATIII), который, как известно, эффективно ингибирует тромбин, а также фактор свертывания крови _Xa . Этот эксперимент показал, что HCII оказывает сильное ингибирование тромбина, но слабое ингибирование фактора свертывания крови _Xa .

Кофактор гепарина II может играть роль в иммунном ответе , поскольку он связан с лейкоцитами опосредованной деградацией белка , которая высвобождает цитокины в воспалительной реакции нейтрофилов и моноцитов . Его роль подвергается сомнению, поскольку, хотя он и является ингибитором тромбина , отсутствие HCII не приводит к значительно более высокому уровню тромбоза . Это не отменяет результатов исследования 1981 года, но новые открытия создают больше вопросов о биологическом механизме и функции белка. Однако этот кофактор демонстрирует более сильную способность ингибировать тромбин у беременных женщин, защищая их от тромбоза. У беременных женщин наблюдаются повышенные уровни кофактора гепарина II, а также дерматансульфата, который представляет собой полисахарид , который, как ожидается, будет участвовать в заживлении ран, коагуляции и общем поддержании организма во всем организме. Беременные женщины, перенесшие тромбоз, вероятно, также будут иметь низкий уровень кофактора гепарина II, но является ли это причиной, пока неизвестно.

Дальнейшее чтение

• Гриффит М.Дж., Каррауэй Т., Уайт Г.К., Домброуз Ф.А. (1983). «Рецептор серпина 1: активность кофактора гепарина в семье с наследственным дефицитом антитромбина III: доказательства наличия второго кофактора гепарина в плазме человека» . Кровь . 61 (1): 111–118. дои : 10.1182/blood.V61.1.111.111 .
• Пиццо С.В. (1989). «Рецептор серпина 1: печеночный рецептор, который опосредует клиренс комплексов антитромбин III-протеиназа». Являюсь. Дж. Мед . 87 (3Б): 10С–14С. дои : 10.1016/0002-9343(89)80524-8 . ПМИД   2552799 .
• Ушинский М (1992). «Тканевые антикоагулянты в плаценте человека: предварительное исследование гепариноподобного антикоагулянта и обзор литературы». Гинекол. Обстет. Инвестируйте . 32 (3): 129–33. дои : 10.1159/000293013 . ПМИД   1836773 .
• Сазерленд Дж.С., Бхакта В., Филион М.Л., Шеффилд В.П. (2006). «Переносной хвост: слияние N-концевого кислого продолжения кофактора гепарина II с ингибитором альфа1-протеиназы M358R специфически увеличивает скорость ингибирования тромбина». Биохимия . 45 (38): 11444–52. дои : 10.1021/bi0609624 . ПМИД   16981704 .
• Гири Т.К., Толлефсен Д.М. (2006). «Плацентарный дерматансульфат: выделение, антикоагулянтная активность и связь с кофактором гепарина II» . Кровь . 107 (7): 2753–8. дои : 10.1182/blood-2005-09-3755 . ЧВК   1895383 . ПМИД   16339402 .
• Лю Т, Цянь В.Дж., Гриценко М.А. и др. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии» . J. Протеом Рез . 4 (6): 2070–80. дои : 10.1021/pr0502065 . ПМК   1850943 . ПМИД   16335952 .
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .
• Шиллингер М., Экснер М., Сабети С. и др. (2005). «Высокая активность кофактора II гепарина в плазме защищает от рестеноза после бедренно-подколенного стентирования». Тромб. Гемост . 92 (5): 1108–13. дои : 10.1160/TH04-05-0311 . ПМИД   15543340 . S2CID   13806207 .
• Коллинз Дж.Э., Райт К.Л., Эдвардс К.А. и др. (2005). «Подход к клонированию ORFeome человека на основе аннотаций генома» . Геном Биол . 5 (10): Р84. дои : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . ПМК   545604 . ПМИД   15461802 .
• Сузуки Ю., Ямашита Р., Широта М. и др. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши обнаруживает гомологичную блочную структуру в областях промотора» . Геном Рез . 14 (9): 1711–8. дои : 10.1101/гр.2435604 . ПМК   515316 . ПМИД   15342556 .
• Коррал Дж., Аснар Дж., Гонсалес-Конехеро Р. и др. (2006). «Гомозиготный дефицит кофактора гепарина II: значимость остатка глутамата P17 в серпинах, связь с конформационными заболеваниями и роль в тромбозе» . Тираж . 110 (10): 1303–7. дои : 10.1161/01.CIR.0000140763.51679.D9 . ПМИД   15337701 .
• Фортенберри Ю.М., Уинна Х.К., Джентри Х.Р. и др. (2004). «Молекулярное картирование комплекса тромбин-гепарин-кофактор II» . Ж. Биол. Хим . 279 (41): 43237–44. дои : 10.1074/jbc.M406716200 . ПМИД   15292227 .
• Чжан Ф., Ву Ю, Ма Ц и др. (2004). «Исследование влияния кальция на взаимодействие гепарина и кофактора гепарина II с использованием поверхностного плазмонного резонанса». Клин. Прил. Тромб. Гемост . 10 (3): 249–57. дои : 10.1177/107602960401000307 . ПМИД   15247982 . S2CID   21405427 .
• Андерсон Н.Л., Полански М., Пипер Р. и др. (2004). «Протеом плазмы человека: неизбыточный список, разработанный путем объединения четырех отдельных источников» . Мол. Клетка. Протеомика . 3 (4): 311–26. дои : 10.1074/mcp.M300127-MCP200 . ПМИД   14718574 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Нода А., Вада Х., Кусия Ф. и др. (2003). «Уровни кофактора гепарина II (HCII) и комплекса тромбин-HCII в плазме у пациентов с диссеминированным внутрисосудистым свертыванием крови» . Клин. Прил. Тромб. Гемост . 8 (3): 265–71. дои : 10.1177/107602960200800311 . ПМИД   12361205 .
• Бэглин Т.П., Каррелл Р.В., Черч ФК и др. (2002). «Кристаллические структуры нативного и тромбинового кофактора гепарина II обнаруживают многоступенчатый аллостерический механизм» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (17): 11079–84. Бибкод : 2002PNAS...9911079B . дои : 10.1073/pnas.162232399 . ПМЦ   123213 . ПМИД   12169660 .
• Каннингем М.А., Бхакта В., Шеффилд В.П. (2003). «Изменение кофактора гепарина II в VAL439 (P6) либо ухудшает ингибирование тромбина, либо придает резистентность к эластазе». Тромб. Гемост . 88 (1): 89–97. дои : 10.1055/s-0037-1613159 . ПМИД   12152684 . S2CID   1467230 .
• Хаякава Ю., Хирасима Ю., Куримото М. и др. (2002). «Вклад основных остатков спирали А кофактора гепарина II в ингибирование тромбина, опосредованное гепарином или дерматансульфатом». ФЭБС Летт . 522 (1–3): 147–50. дои : 10.1016/S0014-5793(02)02930-7 . ПМИД   12095635 . S2CID   12634527 .
• Митчелл Дж.В., Черч ФК (2002). «Остатки аспарагиновой кислоты 72 и 75 и тирозин-сульфат 73 кофактора гепарина II способствуют внутримолекулярным взаимодействиям во время связывания гликозаминогликанов и ингибирования тромбина» . Ж. Биол. Хим . 277 (22): 19823–30. дои : 10.1074/jbc.M200630200 . ПМИД   11856753 .
• Бёме С., Нимц М., Грабенхорст Е. и др. (2002). «Сульфатирование тирозина и N-гликозилирование кофактора II человеческого гепарина из плазмы и рекомбинантных клеток яичника китайского хомячка и их влияние на связывание гепарина». Евро. Дж. Биохим . 269 ​​(3): 977–88. дои : 10.1046/j.0014-2956.2001.02732.x . ПМИД   11846800 .

Внешние ссылки

• Онлайн-база данных MEROPS 31 марта 2017 по пептидазам и их ингибиторам: I04.019. Архивировано г. на Wayback Machine.
• Гепарин + кофактор + II в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
• Хе Л., Висенте С., Вестрик Р., Эйцман Д., Толлефсен Д. (2002). «Кофактор гепарина II ингибирует артериальный тромбоз после повреждения эндотелия» . Джей Клин Инвест . 109 (2): 213–9. дои : 10.1172/JCI13432 . ПМК   150836 . ПМИД   11805133 .