Ундекапренилдифосфатаза
| ундекапренилдифосфатаза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 3.6.1.27 | ||
| Номер CAS. | 9077-80-9 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| ЭксПАСи | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
| Белок устойчивости к бацитрацину | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | ? | ||
| Пфам | PF02673 | ||
| ИнтерПро | ИПР003824 | ||
| Суперсемейство OPM | 479 | ||
| белок OPM | 5 часов | ||
| |||
В энзимологии ундекапренилдифосфатаза , ( КФ 3.6.1.27 ) — фермент катализирующий реакцию химическую .
- ундекапренилдифосфат + H 2 O ундекапренилфосфат + фосфат
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются , тогда как ундекапренилдифосфат и H2O двумя его продуктами являются ундекапренилфосфат и фосфат . Ферментативную активность усиливают двухвалентные катионы, особенно Ca. 2+ .
У многих бактерий этот фермент представляет собой мембранный белок , участвующий в биосинтезе пептидогликана . Фермент участвует в придании устойчивости к антибиотику бацитрацину . [ 1 ]
Номенклатура
[ редактировать ]Этот фермент принадлежит к семейству гидролаз , особенно тех, которые действуют на ангидриды кислот в фосфорсодержащих ангидридах. Систематическое название этого класса ферментов — ундекапренилдифосфатфосфогидролаза. Другие широко используемые названия включают ундекапренилпирофосфатфосфатазу (Uppp), UPP фосфатазу, BacA, C55-изопренилдифосфатазу, C55-изопренилпирофосфатазу и изопренилпирофосфатазу. [ 2 ]
Примечание. Фермент Uppp/BacA (EC 3.6.1.27) иногда ошибочно называют « ундекапренолкиназой ». [ 3 ] Однако это название следует зарезервировать для отдельного фермента (EC 2.7.1.66), который катализирует присоединение фосфатной группы АТФ к ундекапренолу (C55-изопрениловый спирт).
Структура
[ редактировать ]Рентгенокристаллические структуры мембранной формы фермента E. coli. [ 4 ] [ 5 ] доступны (идентификаторы PDB: 5OON, [ 6 ] 6CB2 [ 7 ] ).
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Чалкер А.Ф., Ингрэм К.А., Лансфорд Р.Д., Брайант А.П., Брайант Дж., Уоллис Н.Г., Броски Дж.П., Пирсон СК, Холмс DJ (июль 2000 г.). «Ген bacA, который определяет чувствительность к бацитрацину у Streptococcus pneumoniae и Staphylococcus aureus, также необходим для вирулентности» . Микробиология . 146 (Часть 7): 1547–53. дои : 10.1099/00221287-146-7-1547 . ПМИД 10878119 .
- ^ «ундекапренилдифосфат (YMDB00637) - База данных метаболома дрожжей» . www.ymdb.ca. Проверено 7 сентября 2023 г.
- ^ Эль Гаши М., Бусс А., Блано Д., Менжен-Лекроль Д. (июль 2004 г.). «Ген bacA Escherichia coli кодирует активность ундекапренилпирофосфатфосфатазы» . Журнал биологической химии . 279 (29): 30106–13. дои : 10.1074/jbc.M401701200 . ПМИД 15138271 .
- ^ Эль Гачи М., Хоу Н., Хуанг С.И., Олиерик В., Варшаманадж Р., Тузе Т., Вейхерт Д., Стэнсфельд П.Дж., Ван М., Керфф Ф., Кэффри М. (март 2018 г.). «Кристаллическая структура ундекапренил-пирофосфатфосфатазы и ее роль в биосинтезе пептидогликана» . Природные коммуникации . 9 (1): 1078. doi : 10.1038/s41467-018-03477-5 . ПМК 5852022 . ПМИД 29540682 .
- ^ Уоркман С.Д., Уорралл Л.Дж., Стринадка, Северная Каролина (март 2018 г.). «Кристаллическая структура внутримембранной фосфатазы, играющей центральную роль в биосинтезе пептидогликана бактериальной клеточной стенки и рециркуляции липидов» . Природные коммуникации . 9 (1): 1159. doi : 10.1038/s41467-018-03547-8 . ПМК 5861054 . ПМИД 29559664 .
- ^ «5OON - Структура ундекапренил-пирофосфатфосфатазы, BacA» . Банк данных белков RCSB .
- ^ «6CB2 - Кристаллическая структура Escherichia coli UppP» . Банк данных белков RCSB .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]