Электронная кристаллография
Электронная кристаллография - это подмножество методов дифракции электронов, ориентированное только на детальное определение положения атомов в твердых телах с помощью просвечивающего электронного микроскопа (ПЭМ). Это может включать использование изображений просвечивающей электронной микроскопии высокого разрешения , картин электронной дифракции , включая дифракцию электронов сходящимся пучком или их комбинации. Ему удалось определить некоторые объемные структуры, а также поверхностные структуры. [1] [2] Двумя родственными методами являются дифракция низкоэнергетических электронов, которая позволила расшифровать структуру многих поверхностей, и дифракция отраженных электронов высокой энергии , которая часто используется для контроля поверхностей во время роста.
Этот метод появился вскоре после открытия дифракции электронов в 1927–28 годах и использовался во многих ранних работах. Однако в течение многих лет количественная электронная кристаллография не использовалась, вместо этого информация о дифракции качественно сочеталась с результатами визуализации. Ряд достижений 1950-х годов, в частности, заложил основу для более количественной работы, начиная от точных методов выполнения прямых расчетов и заканчивая методами обращения к картам атомной структуры. С улучшением возможностей визуализации электронных микроскопов кристаллографические данные теперь обычно получают путем объединения изображений с информацией о дифракции электронов или, в некоторых случаях, путем сбора трехмерных данных дифракции электронов с помощью ряда различных подходов.
История
[ редактировать ]Общий подход восходит к работе Луи де Бройля в 1924 году над его докторской диссертацией « Исследование квантовой теории». [3] где он ввел понятие электронов как волн материи . Волновая природа электронных пучков была экспериментально подтверждена в работах двух групп: первая — эксперимент Дэвиссона–Гермера , [4] [5] [6] [7] другой - Джордж Пэджет Томсон и Александр Рид. [8] Александр Рид, аспирант Томсона, провел первые эксперименты. [9] но вскоре он погиб в аварии на мотоцикле. [10] За этими экспериментами вскоре последовала первая нерелятивистская модель дифракции электронов Ганса Бете. [11] на основе уравнения Шрёдингера, [12] что очень близко к тому, как сейчас описывается дифракция электронов. Примечательно, что Клинтон Дэвиссон и Лестер Гермер заметили [6] [7] что их результаты нельзя интерпретировать с использованием подхода закона Брэгга , поскольку позиции систематически различаются; подход Ганса Бете [11] который включает в себя как многократное рассеяние, так и преломление за счет среднего потенциала, дало более точные результаты. Очень быстро появилось множество достижений, например, наблюдения Сейши Кикучи линий, которые можно использовать для кристаллографического индексирования благодаря комбинированному упругому и неупругому рассеянию. [13] газовая электронография, разработанная Германом Марком и Раймондом Вейлем, [14] [15] дифракция в жидкостях Луи Максвелла, [16] и первые электронные микроскопы, разработанные Максом Ноллом и Эрнстом Руской . [17] [18]
Несмотря на ранние успехи, такие как определение положения атомов водорода в кристаллах NH 4 Cl В. Е. Лашкаревым и И. Д. Усыкиным в 1933 г., [19] борная кислота Джона М. Коули в 1953 году. [20] и ортоборная кислота Уильяма Хоулдера Захарисена в 1954 году, [21] Дифракция электронов на протяжении многих лет была качественным методом, используемым для проверки образцов в электронных микроскопах. Джон М. Коули объясняет в статье 1968 года: [22]
Так было основано убеждение, в некоторых случаях почти догматическое и сохраняющееся даже по сей день, что невозможно интерпретировать интенсивность картин дифракции электронов для получения структурной информации.
Ситуация постепенно изменилась. Одним из ключевых шагов стала разработка в 1936 году Вальтером Косселем и Готфридом Мёлленстедтом метода дифракции электронов сходящимся пучком (CBED). [23] Этот подход был расширен Питером Гудманом и Гюнтером Лемпфулем. [24] затем в основном группами Джона Стидса [25] [26] [27] и Митиёси Танака [28] [29] который показал, как использовать шаблоны CBED для определения групп точек и пространственных групп . Это сочеталось с другими подходами трансмиссионной электронной микроскопии , обычно там, где как локальная микроструктура важны , так и атомная структура.
Вторым ключевым этапом работы была группа Бориса Вайнштейна , которая продемонстрировала решение структуры многих различных материалов, таких как глины и слюды, с использованием порошковых дифракционных картин. Успех объясняется относительной толщиной образцов. [30] (С момента появления прецессионной дифракции электронов [31] стало ясно, что усреднение по множеству различных направлений и толщин электронного пучка значительно снижает эффекты динамической дифракции, [32] [33] это, наверное, тоже важно.)
Более полный кристаллографический анализ данных об интенсивности развивался медленно. Одним из ключевых шагов стала демонстрация в 1976 году Дугласом Л. Дорсетом и Гербертом А. Хауптманом того, что традиционные прямые методы можно использовать с осторожностью. [34] Другим примером была демонстрация в 1986 году Кунио Таканаяги того, что функция Паттерсона может быть мощной в исходном решении реконструированной поверхности кремния (111) 7x7 с использованием в сверхвысоком вакууме дифракции электронов . [35] [36] Более полный анализ был продемонстрирован тем, что классические методы инверсии могут быть использованы для поверхностей в 1997 году Дорсетом и Лоуренсом Д. Марксом , а также в 1998 году Джоном Гьённесом, которые объединили трехмерную дифракцию электронов с прецессионной дифракцией электронов и прямыми методами для решения интерметаллических соединений. также используя динамические уточнения. [37]
В то же время, когда были разработаны подходы к обращению данных дифракции с использованием электронов, разрешение электронных микроскопов стало достаточно хорошим, чтобы изображения можно было комбинировать с информацией о дифракции. Поначалу разрешение было плохим, и в 1956 году Джеймс Ментер опубликовал первые изображения, полученные с помощью электронного микроскопа, показывающие решетчатую структуру материала с разрешением 1,2 нм. [38] В 1968 году Аарон Клаг и Дэвид ДеРозье использовали электронную микроскопию для визуализации структуры хвоста бактериофага Т4, распространенного вируса, что стало ключевым шагом в использовании электронов для определения структуры макромолекул. [39] Первое количественное сопоставление изображений атомного масштаба и динамического моделирования было опубликовано в 1972 году Дж. Г. Олпресс, Э. А. Хьюэтом, А. Ф. Муди и Дж. В. Сандерсом. [40] В начале 1980-х годов разрешение электронных микроскопов было уже достаточным для определения атомной структуры материалов, например, с помощью прибора на 600 кВ под руководством Вернона Косслетта. [41] поэтому сочетание просвечивающей электронной микроскопии высокого разрешения и дифракции стало стандартом во многих областях науки. [42] Большая часть исследований, опубликованных с использованием этих подходов, описывается как электронная микроскопия без добавления термина «электронная кристаллография».
Сравнение с рентгеновской кристаллографией
[ редактировать ]Он может дополнять рентгеновскую кристаллографию для изучения очень маленьких кристаллов (<0,1 микрометра), как неорганических, так и органических, а также белков , таких как мембранные белки , которые не могут легко образовать большие трехмерные кристаллы, необходимые для этого процесса. Белковые структуры обычно определяются либо из двумерных кристаллов (листов или спиралей ), многогранников, таких как вирусные капсиды , либо из диспергированных отдельных белков. В этих ситуациях можно использовать электроны, а рентгеновские лучи — нет, поскольку электроны сильнее взаимодействуют с атомами, чем рентгеновские лучи. Таким образом, рентгеновские лучи будут проходить через тонкий двумерный кристалл без существенной дифракции, тогда как электроны можно использовать для формирования изображения. И наоборот, сильное взаимодействие между электронами и протонами делает толстые (например, трехмерные > 1 микрометра) кристаллы непроницаемыми для электронов, которые проникают только на короткие расстояния.
Одной из основных трудностей рентгеновской кристаллографии является определение фаз на дифракционной картине . Из-за сложности рентгеновских линз трудно сформировать изображение дифрагированного кристалла, и, следовательно, информация о фазе теряется. кристаллографической К счастью, электронные микроскопы могут определить атомную структуру в реальном пространстве, а информацию о фазовом коэффициенте структуры можно экспериментально определить на основе преобразования Фурье изображения. Преобразование Фурье изображения с атомным разрешением похоже, но отличается от картины дифракции - с пятнами обратной решетки, отражающими симметрию и расстояние между кристаллами. [43] Аарон Клуг был первым, кто понял, что фазовая информация может быть считана непосредственно из преобразования Фурье изображения электронной микроскопии, которое было отсканировано в компьютер, еще в 1968 году. Для этого и его исследования вирусных структур и транспортной РНК Клуг получил Нобелевскую премию по химии в 1982 году.
Радиационное повреждение
[ редактировать ]Общей проблемой рентгеновской кристаллографии и электронной кристаллографии является радиационное повреждение , в результате которого особенно повреждаются органические молекулы и белки во время их визуализации, что ограничивает получаемое разрешение. Это особенно проблематично в условиях электронной кристаллографии, где радиационное повреждение сосредоточено на гораздо меньшем количестве атомов. Одним из методов, используемых для ограничения радиационного повреждения, является электронная криомикроскопия , при которой образцы подвергаются криофиксации , а визуализация происходит при температурах жидкого азота или даже жидкого гелия . Из-за этой проблемы рентгеновская кристаллография оказалась гораздо более успешной в определении структуры белков, особенно уязвимых к радиационному повреждению. Радиационные повреждения недавно были исследованы с помощью MicroED. [44] [45] тонких 3D-кристаллов в замороженном гидратированном состоянии.
Структуры белков, определенные методом электронной кристаллографии
[ редактировать ]Первой электронно-кристаллографической белковой структурой, достигшей атомного разрешения, был бактериородопсин , определенный Ричардом Хендерсоном и его коллегами из Совета медицинских исследований Лаборатории молекулярной биологии в 1990 году. [46] Однако уже в 1975 году Анвин и Хендерсон определили первую структуру мембранного белка с промежуточным разрешением (7 ангстрем), впервые показав внутреннюю структуру мембранного белка, при которой его альфа-спирали расположены перпендикулярно плоскости мембраны. С тех пор с помощью электронной кристаллографии было определено несколько других структур высокого разрешения, в том числе светособирающий комплекс , [47] никотиновый ацетилхолиновый рецептор , [48] и бактериальный жгутик . [49] Структура белка с самым высоким разрешением, полученная с помощью электронной кристаллографии 2D-кристаллов, - это структура аквапорина -0 с водными каналами. [50] В 2012 году Ян Питер Абрахамс и его коллеги расширили электронную кристаллографию до трехмерных белковых нанокристаллов. [51] методом вращательной дифракции электронов (RED). [52]
Применение к неорганическим материалам
[ редактировать ]Электронно-кристаллографические исследования неорганических кристаллов с использованием изображений электронной микроскопии высокого разрешения (HREM) были впервые выполнены Аароном Клугом в 1978 году. [53] и Свеном Ховмёллером и его коллегами в 1984 году. [54] Изображения HREM использовались потому, что они позволяют выбирать (с помощью компьютерного программного обеспечения) только очень тонкие области, близкие к краю кристалла, для анализа структуры (см. Также кристаллографическую обработку изображений ). Это имеет решающее значение, поскольку в более толстых частях кристалла функция выходной волны (которая несет информацию об интенсивности и положении столбцов проецируемых атомов) больше не связана линейно с проецируемой кристаллической структурой. Более того, изображения HREM не только меняют свой внешний вид с увеличением толщины кристалла, но и очень чувствительны к выбранной настройке дефокусировки Δf объектива изображения HREM GaN (см ., например, ). Чтобы справиться с этой сложностью, используют методы, основанные на Коули - Муди. многосрезовом алгоритме [55] [56] и теория нелинейных изображений [57] были разработаны для моделирования изображений; это стало возможным только [58] после того, как был разработан метод БПФ. [59]
Помимо изображений электронной микроскопии, для определения кристаллической структуры также можно использовать картины электронной дифракции (ED). [60] [61] Необходимо проявлять максимальную осторожность при регистрации таких картин ЭД из самых тонких областей, чтобы сохранить большую часть структурных различий в интенсивности между отражениями (квазикинематические условия дифракции). Как и в случае с рентгенограммами, важные фазы кристаллографических структурных факторов теряются в электронограммах и должны быть обнаружены с помощью специальных кристаллографических методов, таких как прямые методы , методы максимального правдоподобия или (в последнее время) метод переворота заряда. С другой стороны, картины ЭД неорганических кристаллов часто имеют высокое разрешение (= межплоскостные расстояния с высокими индексами Миллера ) намного ниже 1 Ангстрема. Это сравнимо с точечным разрешением лучших электронных микроскопов. При благоприятных условиях можно использовать картины ЭД одной ориентации для определения полной кристаллической структуры. [62] В качестве альтернативы можно использовать гибридный подход, который использует изображения HRTEM для решения и интенсивности из ED для уточнения кристаллической структуры. [63] [64]
Недавний прогресс в структурном анализе ED был достигнут благодаря внедрению метода Винсента-Мидгли. [65] прецессионный метод регистрации электронограмм. [66] Полученные таким образом интенсивности обычно гораздо ближе к кинематическим интенсивностям, [67] [68] так что можно определить даже структуры, которые выходят за пределы диапазона при обработке обычных (выбранной области) данных электронной дифракции. [69] [70]
Кристаллические структуры, определенные с помощью электронной кристаллографии, можно проверить на их качество с помощью расчетов из первых принципов в рамках теории функционала плотности (DFT). Этот подход использовался для решения поверхностных структур. [71] и для проверки нескольких богатых металлами структур, которые были доступны только с помощью HRTEM и ED соответственно. [72] [73]
Недавно цеолита . с помощью электронной кристаллографии в сочетании с порошковой рентгеновской дифракцией были определены две очень сложные структуры [74] [75] Они более сложны, чем самые сложные структуры цеолита, определенные методом рентгеновской кристаллографии.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Такаянаги, К.; Танисиро, Ю.; Такахаши, М.; Такахаши, С. (1 мая 1985 г.). «Структурный анализ Si(111)-7×7 методами СВВ-трансмиссионной электронной дифракции и микроскопии» . Журнал вакуумной науки и технологий А. 3 (3): 1502–1506. Бибкод : 1985JVSTA...3.1502T . дои : 10.1116/1.573160 . ISSN 0734-2101 .
- ^ Эрдман, Наташа; Поппельмайер, Кеннет Р .; Аста, Марк; Варшкоу, Оливер; Эллис, Дональд Э.; Маркс, Лоуренс Д. (2002). «Структура и химия богатой TiO2 поверхности SrTiO3 (001)» . Природа . 419 (6902): 55–58. Бибкод : 2002Natur.419...55E . дои : 10.1038/nature01010 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 12214229 . S2CID 4384784 .
- ^ де Бройль, Луи Виктор. «К теории квантов» (PDF) . Основание Луи де Бройля (английский перевод А.Ф. Краклауэра, ред. 2004 г.) . Проверено 25 февраля 2023 г.
- ^ Дэвиссон, К.; Гермер, Л.Х. (1927). «Рассеяние электронов монокристаллом никеля» . Природа . 119 (2998): 558–560. Бибкод : 1927Natur.119..558D . дои : 10.1038/119558a0 . ISSN 0028-0836 . S2CID 4104602 .
- ^ Дэвиссон, К.; Гермер, Л.Х. (1927). «Дифракция электронов на кристалле никеля» . Физический обзор . 30 (6): 705–740. Бибкод : 1927PhRv...30..705D . дои : 10.1103/physrev.30.705 . ISSN 0031-899X .
- ^ Jump up to: а б Дэвиссон, CJ; Гермер, Л.Х. (1928). «Отражение электронов кристаллом никеля» . Труды Национальной академии наук . 14 (4): 317–322. Бибкод : 1928PNAS...14..317D . дои : 10.1073/pnas.14.4.317 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 1085484 . ПМИД 16587341 .
- ^ Jump up to: а б Дэвиссон, CJ; Гермер, Л.Х. (1928). «Отражение и преломление электронов кристаллом никеля» . Труды Национальной академии наук . 14 (8): 619–627. Бибкод : 1928PNAS...14..619D . дои : 10.1073/pnas.14.8.619 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 1085652 . ПМИД 16587378 .
- ^ Томсон, врач общей практики; Рид, А. (1927). «Дифракция катодных лучей на тонкой пленке» . Природа . 119 (3007): 890. Бибкод : 1927Natur.119Q.890T . дои : 10.1038/119890a0 . ISSN 0028-0836 . S2CID 4122313 .
- ^ Рид, Александр (1928). «Дифракция катодных лучей на тонких целлулоидных пленках» . Труды Лондонского королевского общества. Серия А, содержащая статьи математического и физического характера . 119 (783): 663–667. Бибкод : 1928RSPSA.119..663R . дои : 10.1098/rspa.1928.0121 . ISSN 0950-1207 . S2CID 98311959 .
- ^ Наварро, Хауме (2010). «Дифракция электронов через Томсона: ранние ответы на квантовую физику в Великобритании» . Британский журнал истории науки . 43 (2): 245–275. дои : 10.1017/S0007087410000026 . ISSN 0007-0874 . S2CID 171025814 .
- ^ Jump up to: а б Бете, Х. (1928). «Теория дифракции электронов на кристаллах» . Анналы физики (на немецком языке). 392 (17): 55–129. Нагрудный код : 1928АнП...392...55Б . дои : 10.1002/andp.19283921704 .
- ^ Шрёдингер, Э. (1926). «Волновая теория механики атомов и молекул» . Физический обзор . 28 (6): 1049–1070. Бибкод : 1926PhRv...28.1049S . дои : 10.1103/PhysRev.28.1049 . ISSN 0031-899X .
- ^ Кикучи, Сейши (1928). «Дифракция катодных лучей на слюде» . Известия Императорской Академии . 4 (6): 271–274. дои : 10.2183/pjab1912.4.271 . S2CID 4121059 – через Google Scholar.
- ^ Марк, Герман; Вирл, Раймонд (1930). «Последние результаты электронографии» . Естественные науки . 18 (36): 778–786. Бибкод : 1930NW.....18..778M . дои : 10.1007/bf01497860 . ISSN 0028-1042 . S2CID 9815364 .
- ^ Марк, Герман; Виль, Раймонд (1930). «Определение молекулярной структуры методом дифракции электронов на струе пара». Журнал электрохимии и прикладной физической химии . 36 (9): 675–676. дои : 10.1002/bbpc.19300360921 . S2CID 178706417 .
- ^ Максвелл, Луи Р. (1933). «Дифракция электронов на жидкостях» . Физический обзор . 44 (2): 73–76. Бибкод : 1933PhRv...44...73M . дои : 10.1103/PhysRev.44.73 . ISSN 0031-899X .
- ^ Нолл, М.; Руска, Э. (1932). «Вклад в геометрическую электронную оптику. I» . Анналы физики . 404 (5): 607–640. Бибкод : 1932АнП...404..607К . дои : 10.1002/andp.19324040506 . ISSN 0003-3804 .
- ^ Нолл, М.; Руска, Э. (1932). «Электронный микроскоп» . Журнал физики (на немецком языке). 78 (5–6): 318–339. Бибкод : 1932ZPhy...78..318K . дои : 10.1007/BF01342199 . ISSN 1434-6001 . S2CID 186239132 .
- ^ Лашкарев, М.Е.; Усыскин И.Д. (1933). «Определение положения ионов водорода в кристаллической решетке NH4Cl методом электронной дифракции» . Журнал физики (на немецком языке). 85 (9–10): 618–630. Бибкод : 1933ZPhy...85..618L . дои : 10.1007/BF01331003 . ISSN 1434-6001 . S2CID 123199621 .
- ^ Коули, Дж. М. (1953). «Анализ структуры монокристаллов методом электронной дифракции. II. Неупорядоченная структура борной кислоты» . Акта Кристаллографика . 6 (6): 522–529. Бибкод : 1953AcCry...6..522C . дои : 10.1107/S0365110X53001423 . ISSN 0365-110X . S2CID 94391285 .
- ^ Захариасен, WH (1954). «Точная структура ортоборной кислоты» . Акта Кристаллографика . 7 (4): 305–310. Бибкод : 1954AcCry...7..305Z . дои : 10.1107/S0365110X54000886 . ISSN 0365-110X .
- ^ Коули, Дж. М. (1968). «Определение кристаллической структуры методом дифракции электронов» . Прогресс в материаловедении . 13 : 267–321. дои : 10.1016/0079-6425(68)90023-6 .
- ^ Коссель, В.; Мёлленштедт, Г. (1939). «Интерференция электронов в сходящемся расслоении» . Анналы физики . 428 (2): 113–140. Бибкод : 1939АнП...428..113К . дои : 10.1002/andp.19394280204 . ISSN 0003-3804 .
- ^ Гудман, П.; Лемпфуль, Г. (1968). «Наблюдение нарушения закона Фриделя в дифракции электронов и определение симметрии по взаимодействиям нулевого слоя». Acta Crystallographica Раздел А. 24 (3): 339–347. Бибкод : 1968AcCrA..24..339G . дои : 10.1107/S0567739468000677 .
- ^ Бакстон, БФ; Идс, Дж.А.; Стидс, Джон Уикхэм; Рэкхэм, генеральный менеджер; Франк, Фредерик Чарльз (1976). «Симметрия осей зон дифракции электронов» . Философские труды Лондонского королевского общества. Серия А, Математические и физические науки . 281 (1301): 171–194. Бибкод : 1976RSPTA.281..171B . дои : 10.1098/rsta.1976.0024 . S2CID 122890943 .
- ^ Стидс, Дж.В.; Винсент, Р. (1983). «Использование осей зон высокой симметрии в дифракции электронов для определения кристаллических точечных и пространственных групп» . Журнал прикладной кристаллографии . 16 (3): 317–324. Бибкод : 1983JApCr..16..317S . дои : 10.1107/S002188988301050X . ISSN 0021-8898 .
- ^ Берд, DM (1989). «Теория зонно-осевой электронографии» . Журнал техники электронной микроскопии . 13 (2): 77–97. дои : 10.1002/jemt.1060130202 . ISSN 0741-0581 . ПМИД 2681572 .
- ^ Танака, М.; Сайто, Р.; Секий, Х. (1983). «Определение группы точек методом дифракции сходящегося пучка электронов» . Acta Crystallographica Раздел А. 39 (3): 357–368. Бибкод : 1983AcCrA..39..357T . дои : 10.1107/S010876738300080X . ISSN 0108-7673 .
- ^ Танака, М.; Сайто, Р.; Ватанабэ, Д. (1980). «Определение симметрии формы LnNbO 4 (Ln = La,Nd) при комнатной температуре методом дифракции электронов сходящимся пучком» . Acta Crystallographica Раздел А. 36 (3): 350–352. Бибкод : 1980AcCrA..36..350T . дои : 10.1107/S0567739480000800 . ISSN 0567-7394 . S2CID 98184340 .
- ^ Вайнштейн, Б.К. (1964). Анализ структуры методом электронной дифракции . Оксфорд: Пергамон Пресс. ISBN 978-0-08-010241-2 . OCLC 681437461 .
- ^ Винсент, Р.; Мидгли, Пенсильвания (1994). «Двойная коническая балочная система-качалка для измерения интегральных интенсивностей дифракции электронов» . Ультрамикроскопия . 53 (3): 271–282. дои : 10.1016/0304-3991(94)90039-6 . ISSN 0304-3991 .
- ^ Собственный, CS: докторская диссертация, Проектирование системы и проверка метода прецессионной дифракции электронов, Северо-Западный университет, 2005, http://www.numis.northwestern.edu/Research/Current/precession.shtml
- ^ Собственный, КС; Маркс, Л.Д.; Синклер, В. (2006). «Прецессионная дифракция электронов 1: многосрезовое моделирование» . Acta Crystallographica Раздел А. 62 (6): 434–443. дои : 10.1107/S0108767306032892 . ISSN 0108-7673 . ПМИД 17057352 .
- ^ Дорсет, Дуглас Л.; Хауптман, Герберт А. (1976). «Прямое определение фазы по квазикинематическим данным интенсивности дифракции электронов от органических микрокристаллов» . Ультрамикроскопия . 1 (3–4): 195–201. дои : 10.1016/0304-3991(76)90034-6 . ISSN 0304-3991 . ПМИД 1028188 .
- ^ Такаянаги, К.; Танисиро, Ю.; Такахаши, М.; Такахаши, С. (1985). «Структурный анализ Si(111)-7×7 методами СВВ-трансмиссионной электронной дифракции и микроскопии» . Журнал вакуумной науки и технологий A: Вакуум, поверхности и пленки . 3 (3): 1502–1506. Бибкод : 1985JVSTA...3.1502T . дои : 10.1116/1.573160 . ISSN 0734-2101 .
- ^ Такаянаги, Кунио; Танисиро, Ясумаса; Такахаси, Сигэки; Такахаши, Масаэцу (1985). «Анализ структуры восстановленной поверхности Si(111)-7 × 7 методом дифракции электронов на просвечивание» . Поверхностная наука . 164 (2–3): 367–392. Бибкод : 1985SurSc.164..367T . дои : 10.1016/0039-6028(85)90753-8 . ISSN 0039-6028 .
- ^ Гьоннес, Дж.; Хансен, В.; Берг, бакалавр наук; Рунде, П.; Ченг, Ю.Ф.; Гьеннес, К.; Дорсет, ДЛ; Гилмор, CJ (1 мая 1998 г.). «Модель структуры фазы AlmFe, полученная на основе данных интенсивности трехмерной дифракции электронов, собранных с помощью метода прецессии. Сравнение с дифракцией сходящегося пучка» . Acta Crystallographica Раздел А. 54 (3): 306–319. Бибкод : 1998AcCrA..54..306G . дои : 10.1107/S0108767397017030 .
- ^ Ментер, JW (1956). «Непосредственное исследование методом электронной микроскопии кристаллических решеток и их несовершенств» . Труды Лондонского королевского общества. Серия А. Математические и физические науки . 236 (1204): 119–135. Бибкод : 1956РСПСА.236..119М . дои : 10.1098/rspa.1956.0117 . ISSN 0080-4630 .
- ^ Де Розье, диджей; Клюг, А. (1968). «Реконструкция трехмерных структур по электронным микрофотографиям». Природа . 217 (5124): 130–134. Бибкод : 1968Natur.217..130D . дои : 10.1038/217130a0 . ПМИД 23610788 .
- ^ Олпресс, Дж.Г.; Хьюат, Э.А; Муди, А. Ф.; Сандерс, СП (1972). «Изображения n-лучевой решетки. I. Экспериментальные и расчетные изображения из W 4 Nb 26 O 77» . Acta Crystallographica Раздел А. 28 (6): 528–536. Бибкод : 1972AcCrA..28..528A . дои : 10.1107/S0567739472001433 . ISSN 0567-7394 .
- ^ Косслетт, Вирджиния (12 марта 1980 г.). «Принципы и работа электронного микроскопа высокого разрешения на напряжение 600 кВ» . Труды Лондонского королевского общества. А. Математические и физические науки . 370 (1740): 1–16. Бибкод : 1980RSPSA.370....1C . дои : 10.1098/rspa.1980.0018 . ISSN 0080-4630 .
- ^ Бусек, Питер; Коули, Джон М; Айринг, Лейрой (1992). Просвечивающая электронная микроскопия высокого разрешения и связанные с ней методы . Издательство Оксфордского университета.
- ^ Р. Ховден; И Цзян; Х.Л. Синь; Л. Ф. Куркутис (2015). «Периодическое уменьшение артефактов при преобразовании Фурье изображений с полным полем атомного разрешения». Микроскопия и микроанализ . 21 (2): 436–441. arXiv : 2210.09024 . Бибкод : 2015MiMic..21..436H . дои : 10.1017/S1431927614014639 . ПМИД 25597865 . S2CID 22435248 .
- ^ Нанненга, Брент Л; Ши, Дэн; Лесли, Эндрю Г.В.; Гонен, Тамир (3 августа 2014 г.). «Определение структуры высокого разрешения путем сбора данных непрерывного вращения в MicroED» . Природные методы . 11 (9): 927–930. дои : 10.1038/nmeth.3043 . ISSN 1548-7091 . ПМК 4149488 . ПМИД 25086503 .
- ^ Хаттне, Йохан; Ши, Дэн; Глинн, Калина; Зи, Чи-Те; Галлахер-Джонс, Маркус; Мартынович, Майкл В.; Родригес, Хосе А.; Гонен, Тамир (2018). «Анализ глобальных и локальных радиационных повреждений в крио-ЭМ» . Структура . 26 (5): 759–766.е4. дои : 10.1016/j.str.2018.03.021 . ISSN 0969-2126 . ПМК 6333475 . ПМИД 29706530 .
- ^ Хендерсон, Р.; Болдуин, Дж. М.; Ческа, штат Калифорния; Землян, Ф; Бекманн, Э.; Даунинг, К.Х. (июнь 1990 г.). «Модель структуры бактериородопсина на основе электронной криомикроскопии высокого разрешения». Дж Мол Биол . 213 (4): 899–929. дои : 10.1016/S0022-2836(05)80271-2 . ПМИД 2359127 .
- ^ Кюльбрандт, Вернер; Ван, Да Ненг; Фудзиёси, Ёсинори (февраль 1994 г.). «Атомная модель светособирающего комплекса растений методом электронной кристаллографии». Природа . 367 (6464): 614–21. Бибкод : 1994Natur.367..614K . дои : 10.1038/367614a0 . ПМИД 8107845 . S2CID 4357116 .
- ^ Миядзава, Ацуо; Фудзиёси, Ёсинори; Анвин, Найджел (июнь 2003 г.). «Структура и механизм открытия поры рецептора ацетилхолина». Природа . 423 (6943): 949–55. Бибкод : 2003Natur.423..949M . дои : 10.1038/nature01748 . ПМИД 12827192 . S2CID 205209809 .
- ^ Ёнекура, Кодзи; Маки-Ёнекура, Саори; Намба, Кейичи (август 2003 г.). «Полная атомная модель бактериальной жгутиковой нити, полученная методом электронной криомикроскопии». Природа . 424 (6949): 643–50. Бибкод : 2003Natur.424..643Y . дои : 10.1038/nature01830 . ПМИД 12904785 . S2CID 4301660 .
- ^ Гонен, Тамир; Ченг, Ифань; Слиз, Петр; Хироаки, Йоко; Фудзиёси, Ёсинори; Харрисон, Стивен С.; Уолц, Томас (2005). «Липид-белковые взаимодействия в двухслойных двумерных кристаллах AQP0» . Природа . 438 (7068): 633–638. Бибкод : 2005Natur.438..633G . дои : 10.1038/nature04321 . ISSN 0028-0836 . ПМК 1350984 . ПМИД 16319884 .
- ^ Недерлов, И.; ван Гендерен, Э.; Ли, Ю.-В.; Абрахамс, JP (01 июля 2013 г.). «Квантово-площадной детектор Medipix позволяет собирать данные дифракции вращательных электронов от субмикрометровых трехмерных белковых кристаллов» . Acta Crystallographica Раздел D. 69 (7): 1223–1230. Бибкод : 2013AcCrD..69.1223N . дои : 10.1107/S0907444913009700 . ISSN 0907-4449 . ПМЦ 3689525 . ПМИД 23793148 .
- ^ Чжан, Далянь; Олейников, Петр; Ховмеллер, Свен; Цзоу, Сяодун (март 2010 г.). «Сбор данных 3D-электронографии методом вращения» . Журнал кристаллографии . 225 (2–3): 94–102. Бибкод : 2010ZK....225...94Z . дои : 10.1524/zkri.2010.1202 . ISSN 0044-2968 . S2CID 55751260 .
- ^ Клуг, А. (1978/79) Анализ изображений и реконструкция в электронной микроскопии биологических макромолекул Chemica Scripta vol 14, p. 245-256.
- ^ Ховмеллер, Свен; Шегрен, Агнета; Фаррантс, Джордж; Сундберг, Маргарета; Мариндер, Бенгт-Олов (1984). «Точные положения атомов по данным электронной микроскопии». Природа . 311 (5983): 238. Бибкод : 1984Nature.311..238H . дои : 10.1038/311238a0 .
- ^ Коули, Дж. М.; Муди, А. Ф. (1 октября 1957 г.). «Рассеяние электронов атомами и кристаллами. I. Новый теоретический подход» . Акта Кристаллографика . 10 (10): 609–619. Бибкод : 1957AcCry..10..609C . дои : 10.1107/S0365110X57002194 . ISSN 0365-110X .
- ^ Исидзука, Кадзуо (2004). «Мультисрезовый метод БПФ — серебряная годовщина» . Микроскопия и микроанализ . 10 (1): 34–40. Бибкод : 2004MiMic..10...34I . дои : 10.1017/S1431927604040292 . ISSN 1431-9276 . ПМИД 15306065 . S2CID 8016041 .
- ^ Исидзука, Кадзуо (1980). «Контрастная передача изображений кристаллов в ПЭМ» . Ультрамикроскопия . 5 (1–3): 55–65. дои : 10.1016/0304-3991(80)90011-X .
- ^ Гудман, П.; Муди, А.Ф. (1 марта 1974 г.). «Численные оценки волновых функций N-пучков при рассеянии электронов многосрезовым методом» . Акта Кристаллографика А. 30 (2): 280–290. Бибкод : 1974AcCrA..30..280G . дои : 10.1107/S056773947400057X . ISSN 0567-7394 .
- ^ Кули, Джеймс В.; Тьюки, Джон В. (1965). «Алгоритм машинного вычисления комплексных рядов Фурье» . Математика вычислений . 19 (90): 297–301. дои : 10.1090/S0025-5718-1965-0178586-1 . ISSN 0025-5718 .
- ^ Б.К. Вайнштейн (1964), Анализ структуры методом дифракции электронов , Pergamon Press Oxford
- ^ DL Дорсет (1995), Структурная электронная кристаллография , Plenum Publishing Corporation ISBN 0-306-45049-6
- ^ Вейрих, Т.Э.; Цзоу, Х; Рамлау, Р; Саймон, А; Каскарано, GL; Джаковаццо, К; Ховмеллер, С (2000). «Структура кристаллов нанометрового размера, определенная по данным электронной дифракции выбранной области». Акта Кристаллографика А. 56 (Часть 1): 29–35. дои : 10.1107/S0108767399009605 . ПМИД 10874414 .
- ^ Зандберген, HW (1997). «Определение структуры частиц Mg5Si6 в Al методами динамической электронографии». Наука . 277 (5330): 1221–1225. дои : 10.1126/science.277.5330.1221 .
- ^ Вейрих, Томас Э.; Рамлау, Райнер; Саймон, Арндт; Ховмеллер, Свен; Цзоу, Сяодун (1996). «Кристаллическая структура, определенная с точностью до 0,02 Å методом электронной микроскопии». Природа . 382 (6587): 144. Бибкод : 1996Natur.382..144W . дои : 10.1038/382144a0 . S2CID 4327149 .
- ^ Винсент, Р.; Миджли, Пенсильвания (1 марта 1994 г.). «Двойная коническая балочная система-качалка для измерения интегральных интенсивностей дифракции электронов» . Ультрамикроскопия . 53 (3): 271–282. дои : 10.1016/0304-3991(94)90039-6 . ISSN 0304-3991 .
- ^ Прецессионная дифракция электронов
- ^ Маркс, Л.Д.; Синклер, В. (2003). «Достаточные условия для прямых методов со быстрыми электронами» . Микроскопия и микроанализ . 9 (5): 399–410. Бибкод : 2003MiMic...9..399M . дои : 10.1017/S1431927603030332 . ISSN 1431-9276 . ПМИД 19771696 . S2CID 20112743 .
- ^ Собственный, КС; Маркс, Л.Д.; Синклер, В. (1 ноября 2006 г.). «Прецессионная дифракция электронов 1: многосрезовое моделирование» . Акта Кристаллографика А. 62 (6): 434–443. дои : 10.1107/S0108767306032892 . ISSN 0108-7673 . ПМИД 17057352 .
- ^ Джемми, М; Цзоу, Х; Ховмёллер, С; Мильори, А; Веннстрем, М; Андерссон, Ю (2003). «Структура Ti2P решена на основе данных трехмерной электронографии, собранных с помощью метода прецессии и электронной микроскопии высокого разрешения». Акта Кристаллографика . 59 (Часть 2): 117–26. дои : 10.1107/S0108767302022559 . ПМИД 12604849 .
- ^ Вейрих, Т; Портильо, Дж; Кокс, Дж; Хибст, Х; Николопулос, С (2006). «Ab initio определение каркасной структуры оксида тяжелого металла CsxNb2.54W2.46O14 по данным прецессионной электронной дифракции при 100 кВ». Ультрамикроскопия . 106 (3): 164–75. дои : 10.1016/j.ultramic.2005.07.002 . ПМИД 16137828 .
- ^ Эрдман, Наташа; Поппельмайер, Кеннет Р.; Аста, Марк; Варшкоу, Оливер; Эллис, Дональд Э.; Маркс, Лоуренс Д. (2002). «Структура и химия богатой TiO2 поверхности SrTiO3 (001)» . Природа . 419 (6902): 55–58. Бибкод : 2002Natur.419...55E . дои : 10.1038/nature01010 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 12214229 . S2CID 4384784 .
- ^ Альбе, К; Вейрих, Т.Э. (2003). «Структура и стабильность альфа- и бета-Ti2Se. Расчеты электронной дифракции и теории функционала плотности». Акта Кристаллографика А. 59 (Часть 1): 18–21. Бибкод : 2003AcCrA..59...18A . дои : 10.1107/S0108767302018275 . ПМИД 12496457 .
- ^ Вейрих, Т.Э. (2004). «Расчеты из первых принципов как инструмент проверки структуры в электронной кристаллографии». Акта Кристаллографика А. 60 (Часть 1): 75–81. Бибкод : 2004AcCrA..60...75W . дои : 10.1107/S0108767303025042 . ПМИД 14691330 .
- ^ Грамм, Фабиан; Баерлохер, Кристиан; Маккаскер, Линн Б.; Уоррендер, Стюарт Дж.; Райт, Пол А.; Хан, Бада; Хонг, Сук Бонг; Лю, Чжэн; и др. (2006). «Сложная структура цеолита, решенная путем сочетания порошковой дифракции и электронной микроскопии». Природа . 444 (7115): 79–81. Бибкод : 2006Natur.444...79G . дои : 10.1038/nature05200 . ПМИД 17080087 . S2CID 4396820 .
- ^ Баерлохер, К.; Грамм, Ф.; Массугер, Л.; Маккаскер, LB; Он, З.; Ховмоллер, С.; Цзоу, X. (2007). «Структура поликристаллического цеолитного катализатора IM-5, решенная методом усиленного переворота заряда». Наука . 315 (5815): 1113–6. Бибкод : 2007Sci...315.1113B . дои : 10.1126/science.1137920 . ПМИД 17322057 . S2CID 19509220 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Зоу XD, Ховмёллер С. и Олейников П. «Электронная кристаллография - электронная микроскопия и дифракция электронов». Тексты IUCr по кристаллографии 16, Издательство Оксфордского университета, 2011. http://ukcatalogue.oup.com/product/9780199580200.do ISBN 978-0-19-958020-0
- Даунинг, К.Х.; Мэйшэн, Х.; Венк, Х.-Р.; О'Киф, Массачусетс (1990). «Разрешение атомов кислорода в ставролите методом трехмерной просвечивающей электронной микроскопии». Природа . 348 (6301): 525–528. Бибкод : 1990Natur.348..525D . дои : 10.1038/348525a0 . S2CID 4340756 .
- Цзоу, XD; Ховмеллер, С. (2008). «Электронная кристаллография: визуализация и дифракция монокристаллов на порошках» . Акта Кристаллографика А. 64 (Часть 1): 149–160. Бибкод : 2008AcCrA..64..149Z . дои : 10.1107/S0108767307060084 . ПМИД 18156680 .
- Т. Э. Вейрих, XD Зоу и Дж. Л. Лабар (2006). Электронная кристаллография: новые подходы к определению структуры наноразмерных материалов . Спрингер Нидерланды, ISBN 978-1-4020-3919-5
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Интервью с Аароном Клугом, лауреатом Нобелевской премии за работу в области кристаллографической электронной микроскопии . Видео Freeview от Vega Science Trust.
- Раунсер, С; Уолц, Т (2009). «Электронная кристаллография как метод изучения структуры мембранных белков в липидной среде». Ежегодный обзор биофизики . 38 (1): 89–105. doi : 10.1146/annurev.biophys.050708.133649 . ПМИД 19416061 .