Jump to content

Эукариотическая большая рибосомальная субъединица (60 -е годы)

Рибосомные частицы обозначаются в соответствии с их коэффициентами седиментации в единицах Сведберга . Субъединица 60 -х годов представляет собой большую субъединицу эукариотических рибосом 80 -х годов , причем другим основным компонентом является эукариотическая маленькая рибосомальная субъединица (40 -е годы) . Он структурно и функционально связан с субъединицей 50 -х годов годов прокариотических рибосомов 70 -х . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] Тем не менее, субъединица 60 -х годов намного больше, чем субъединица прокариотических 50 -х годов, и содержит много дополнительных сегментов белка, а также сегменты расширения рибосомальной РНК .

Общая структура

[ редактировать ]

Характерные особенности большой субъединицы, показанной ниже в «Вид короны», включают в себя центральное выступление (CP) и два стебля, которые названы в соответствии с их компонентами бактериального белка (L1 Слева слева, как видно из раздела субъединицы и L7/L12 справа). Существует три сайта связывания для тРНК , A-сайт, P-сайт и E-сайт ( см. В статье о трансляции белка подробности ). Ядро субъединицы 60 -х годов образуется рибосомальной РНК 28S (сокращенно 28S рРНК), которая гомологична прокариотической рРНК , которая также способствует активному сайту ( пептидилтрансфераза , PTC) рибосомы. [ 2 ] [ 4 ] Ядро рРНК украшено десятками белков. На рисунке «кристаллическая структура рибосомальной субъединицы эукариотической 60S из T. thermophila » рибосомальное ядро ​​РНК представлено в виде серой трубки, а сегменты расширения показаны красным. Белки, которые имеют гомологи у эукариот, археи и бактерий, показаны в виде синих лент. Белки, разделяемые только между эукариотами и археей, показаны в виде оранжевых лент, а белки, специфичные для эукариот, показаны в виде красных лент.

Рибосомные белки 60S

[ редактировать ]

В таблице «Рибосомные белки 60 -х годов» показаны отдельные белковые складки субъединиц 60 -х годов, окрашенных в сохранение, как указано выше. Экспрессии эукариота, начиная от нескольких остатков или петлей до очень длинных альфа-спиралей и дополнительных доменов, выделены красным. [ 2 ]

Исторически, различные номенклатуры использовались для рибосомных белков. Например, белки были пронумерованы в соответствии с их миграционными свойствами в экспериментах с гель -электрофорезом . Следовательно, различные названия могут относиться к гомологичным белкам из разных организмов, в то время как идентичные имена не обязательно обозначают гомологичные белки. Таблица «Рибосомальные белки 60-х годов» пересекает упоминания человеческих рибосомных белков с дрожжами, бактериальными и архиальными гомологами. [ 7 ] Дополнительную информацию можно найти в базе данных генов рибосомного белка (RPG) . [ 7 ]

Рибосомные белки 60S
Структура (эукариотическая) [ 8 ] H. Sapiens [ 7 ] [ 9 ] Универсальное имя [ 10 ] Аминокислоты [ 11 ] Сохранение [ 12 ] S. cerevisiae [ 13 ] Бактериальный гомолог ( E. coli ) Архаальный гомолог
RPLP0 Ультрафиолетовый 318 Eab П. L10 L10
Rpl3 Уль3 404 Eab L3 L3 L3
Rpl4 Ультрагистрация 428 Eab L4 L4 L4
Rpl5 UL18 298 Eab L5 L18 L18p
Rpl6 el6 289 И 16 -й n/a n/a
Rpl7 ультрагрированный 254 Eab 19 -й L30 L30
Rpl7a el8 267 Из 18 n/a L7ae
Rpl8 уль2 258 Eab L2 L2 L2
Rpl9 Уль6 193 Eab L9 16 -й 16 -й
RPL10 UL16 215 Eab L10 L16 L10E
Rpl11 UL5 Eab L11 L5 L5
RPL13 EL13 Из L13 n/a L13E
RPL13A UL13 204 Eab L16 L13 L13
RPL14 EL14 221 Из L14 n/a L14A
RPL15 EL15 205 Из L15 n/a L15E
RPL17 UL22 185 Eab L17 L22 L22
RPL18 EL18 189 Из L18 n/a L18E
RPL18A EL20 177 Из L20 n/a LX
RPL19 EL19 197 Из L19 n/a L19
RPL21 EL21 161 Из L21 n/a L21E
RPL22 , RPL22L1 EL22 129 И L22 n/a n/a
RPL23 UL14 141 Eab L23 L14 L14p
RPL23A UL23 157 Eab L25 L23 L23
RPL24 EL24 158 Из L24 n/a L24E
RPL26 UL24 146 Eab L26 L24 L24
RPL27 EL27 137 И L27 n/a n/a
Rpl27a UL15 149 Eab L28 L15 L15
RPL28 EL28 И n/a [ 2 ] [ 3 ] [ 14 ] n/a n/a
RPL29 EL29 И L29 n/a n/a
RPL30 Эль 116 Из L30 n/a L30E
RPL31 EL31 126 Из L31 n/a L31E
RPL32 EL32 136 Из L32 n/a L32E
RPL34 EL34 118 Из L3 n/a L33E
RPL35 UL29 124 Eab L35 L29 L29
Rpl35a EL33 Из L33 n/a L35ae
RPL36 EL36 106 И L36 n/a n/a
Rpl36a EL42 107 Из L42 n/a L44E
RPL37 EL37 98 Из L37 n/a L37E
Rpl37a EL43 Из L43 n/a L37ae
RPL38 EL38 Из L38 n/a L38E
RPL39 EL39 52 Из L39 n/a L37ae
RPL40 EL40 129 Из L40 n/a L40E

Смотрите также

[ редактировать ]
  1. ^ 60S+Рибосома+субъединицы в Национальной библиотеке Медицинской библиотеки Медицинской библиотеки (сетка)
  2. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Klinge, S; Voigts-Hoffmann, F; Лейбундгут, м; Arpagaus, S; Бан, N (2011). «Кристаллическая структура рибосомной субъединицы эукариотической 60S в комплексе с фактором инициации 6». Наука . 334 (6058): 941–948. Bibcode : 2011sci ... 334..941K . doi : 10.1126/science.1211204 . PMID   22052974 . S2CID   206536444 .
  3. ^ Jump up to: а беременный Бен-Шем, а; Гарро; de Loubresse, n; Мельников, S; Дженнер, L; Юсупова, G; Юсупов, М (декабрь 2011 г.). «Структура эукариотической рибосомы при разрешении 3,0 Å» . Наука . 334 (6062): 1524–1529. Bibcode : 2011sci ... 334.1524b . doi : 10.1126/science.1212642 . PMID   22096102 . S2CID   9099683 .
  4. ^ Jump up to: а беременный Запрет, n; Nissen, P; Хансен, J; Мур, PB; Steitz, TA (август 2000). «Полная атомная структура большой рибосомальной субъединицы при 2,4 в разрешении». Наука . 289 (5481): 905–920. Bibcode : 2000sci ... 289..905b . doi : 10.1126/science.289.5481.905 . PMID   10937989 .
  5. ^ Кейт, JH; Юсупов, мм; Юсупова, Гз; Earnest, Tn; Ноллер, HF (сентябрь 1999). «Рентгеновские кристаллические структуры 70-х годов функциональных комплексов». Наука . 285 (5436): 2095–2104. doi : 10.1126/science.285.5436.2095 . PMID   10497122 .
  6. ^ Юсупов, мм; Юсупова, Гз; Baucom, A; Либерман, K; Earnest, Tn; Кейт, JH; Ноллер, HF (май 2001 г.). «Кристаллическая структура рибосомы при 5,5 разрешении» . Наука . 292 (5518): 883–896. Bibcode : 2001sci ... 292..883y . doi : 10.1126/science.1060089 . PMID   11283358 . S2CID   39505192 .
  7. ^ Jump up to: а беременный в Накао, а; Йошихама, м; Kenmochi, N (2004). «RPG: база данных гена рибосомного белка» . Нуклеиновые кислоты Res . 32 (90001): D168–70. doi : 10.1093/nar/gkh004 . PMC   308739 . PMID   14681386 .
  8. ^ Структура T. Термофила, белки из структур большой субъединицы PDBS 417, 4A19
  9. ^ Номенклатура в соответствии с базой данных генов рибосомного белка, применима к H. sapiens и T. thermophila
  10. ^ Бан, Ненад; Бекманн, Роланд; Кейт, Джейми HD; Динман, Джонатан Д; Дракон, Франсуа; Эллис, Стивен Р; LaFontaine, Denis LJ; Линдаль, Лассе; Лилджас, Андерс; Липтон, Джеффри М; McAlear, Michael A; Мур, Петр Б; Ноллер, Гарри Ф; Ортега, Хоакин; Пансе, Викрам Говинд; Рамакришнан, V; Спан, Кристиан Мт; Штейц, Томас А; Чорзевский, Марек; Tollervey, Дэвид; Уоррен, Алан Дж; Уильямсон, Джеймс Р; Уилсон, Даниэль; Йонат, Ада; Юсупов, Марат (2014). «Новая система для названия рибосомных белков» . Современное мнение в структурной биологии . 24 ​Elsevier BV: 165–169. doi : 10.1016/j.sbi.2014.01.002 . ISSN   0959-440x . PMC   4358319 . PMID   24524803 .
  11. ^ Йошихама, Маки; Уэхи, дорогой; Выше, Шуичи; Муж, Кросс (2002). Секвенирование . Исследование генома . 12 (3): 379–3 doi : 10.1101/g . PMC   155282 . PMID   11875025 .
  12. ^ Eab означает консервативные у эукариот, археи и бактерии, EA означает консервативный у эукариот и археи, а E означает эукариоте-специфический белок
  13. ^ Традиционно рибосомные белки были названы в соответствии с их кажущейся молекулярной массой в гелевом электрофорезе, что приводит к различным именам для гомологичных белков из разных организмов. RPG предлагает унифицированную номенклатуру для генов рибосомных белков на основе гомологии.
  14. ^ Rpl28 не имеет обнаруживаемого гомолога в дрожжах
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 75598300190d07f3f689713bda14fc76__1713651120
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/75/76/75598300190d07f3f689713bda14fc76.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Eukaryotic large ribosomal subunit (60S) - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)