Гепарин Кофактор II

Разбрызгивает1
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB показывать Список кодов идентификаторов PDB 1JMO, 1JMJ, 2NAT
Идентификаторы
Псевдонимы	Serpind1 , D22S673, HC2, HCF2, HCII, HLS2, LS2, THPH10, Serpin Family Mem.
Внешние идентификаторы	Омим : 142360 ; MGI : 96051 ; Гомологен : 36018 ; GeneCards : Serpind1 ; OMA : Serpind1 - ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 22 (human) Band 22q11.21 Start 20,774,113 bp End 20,787,720 bp
показывать Местоположение гена ( мышь ) Chr. Chromosome 16 (mouse) Band 16 A3|16 10.74 cM Start 17,149,235 bp End 17,161,439 bp
показывать РНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in liver right lobe of liver Epithelium of choroid plexus testicle trigeminal ganglion nucleus accumbens islet of Langerhans right auricle left ovary canal of the cervix Top expressed in liver left lobe of liver fetal liver hematopoietic progenitor cell optic nerve sciatic nerve gallbladder human fetus yolk sac lens sexually immature organism More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Джин Онтология Molecular function peptidase inhibitor activity endopeptidase inhibitor activity heparin binding serine-type endopeptidase inhibitor activity Cellular component extracellular exosome extracellular space endoplasmic reticulum lumen extracellular region Biological process negative regulation of peptidase activity bioluminescence hemostasis chemotaxis blood coagulation negative regulation of endopeptidase activity post-translational protein modification Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 3053 15160 Набор ENSG0000000099937 Ensmusg00000022766 Uniprot P05546 P49182 Refseq (мРНК) NM_000185 NM_008223 NM_001331047 Refseq (белок) NP_000176 NP_001317976 NP_032249 Расположение (UCSC) Chr 22: 20,77 - 20,79 МБ Chr 16: 17.15 - 17,16 МБ PubMed Search
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Гепарин -кофактор II ( HCII ), белок, кодируемый Serpind1 геном , является фактором коагуляции , который ингибирует IIA, и является кофактором гепарина и дерматана сульфата («второстепенный антитробин»).

Продукт, кодируемый этим геном, представляет собой ингибитор сериновой протеазы , который быстро ингибирует тромбин в присутствии дерматана сульфата или гепарина. Ген содержит пять экзонов и четыре интрона . Этот белок разделяет гомологию с антитробином III и другими членами антитрипсина альфа-1 суперсемейства . Мутации в этом гене связаны с дефицитом гепарина кофактора II. Дефицит гепарина кофактора II может привести к увеличению генерации тромбина и гиперкоагуляемому состоянию .

Эксперимент по очистке гепарина кофактора II был проведен в 1981 году, в котором было обнаружено, что очищенная версия белка состоит из одной полипептидной цепи. Дальнейшие эксперименты продемонстрировали, что присутствие β-меркаптоэтанола не влияет на активность HCII в гелевом электрофорезе . β-меркаптоэтанол обычно используется для восстановления дисульфидных связей в молекуле, но гель-электрофорез показал, что HCII не имеет никаких из этих связей. Структура аналогична антитромбину III (ATIII), которая, как было известно, эффективно ингибирует тромбин, а также фактор коагуляции x _a . Этот эксперимент предположил, что HCII имеет сильное ингибирование тромбина, но в то же время слабое ингибирование фактора коагуляции x _a .

Гепарин -кофактор II может играть роль в иммунном ответе , так как он был связан с лейкоцитами , опосредованной деградацией белка , которая высвобождает цитокины в воспалительном ответе с нейтрофилами и моноцитами . Его роль была поставлена ​​под сомнение, потому что, хотя он является ингибитором тромбина , отсутствие HCII не приводит к значительно более высоким уровням тромбоза . Это не отрицает результатов исследования 1981 года, но новые открытия создают больше вопросов биологического механизма и функции белка. Тем не менее, этот кофактор демонстрирует более высокую способность ингибировать тромбин у беременных, защищая их от тромбоза. Беременные женщины показали повышенный уровень гепаринового кофактора II, а также сульфат дерматана, который представляет собой полисахарид , который, как ожидается, будет участвовать в восстановлении раны, коагуляции и общем поддержании всего организма. Беременные женщины с тромбозом, вероятно, также будут иметь низкий уровень кофактора гепарина II, но является ли это причинностью, до сих пор неизвестна.

Дальнейшее чтение

• Гриффит М.Дж., Каррауэй Т., Белый Г.С., Домброз Ф.А. (1983). «Рецептор Serpin 1: кофактор гепарина в семье с наследственным дефицитом антитробина III: доказательства второго кофактора гепарина в плазме человека» . Кровь . 61 (1): 111–118. doi : 10.1182/blood.v61.1.111.111 .
• Пиццо С.В. (1989). «Рецептор Serpin 1: печеночный рецептор, который опосредует клиренс комплексов антитробин III-белковой». Являюсь. J. Med . 87 (3B): 10S - 14 с. doi : 10.1016/0002-9343 (89) 80524-8 . PMID   2552799 .
• Uszyński M (1992). «Антикоагулянты ткани в плаценте человека: предварительное исследование с гепарин-подобным антикоагулянтом и обзор литературы». Гинекол. Акушер. Инвестировать ​ 32 (3): 129–33. doi : 10.1159/000293013 . PMID   1836773 .
• Сазерленд Дж.С., Бхакта В., Филион М.Л., Шеффилд В.П. (2006). «Передачаемое хвост: слияние N-концевого кислотного расширения гепаринового кофактора II с ингибитором альфа1-белковой протеиназы M358R специфически увеличивает скорость ингибирования тромбина». Биохимия . 45 (38): 11444–52. doi : 10.1021/bi0609624 . PMID   16981704 .
• Giri TK, Tollefsen DM (2006). «Плацентарный дерматансульфат: изоляция, антикоагулянтная активность и связь с кофактором гепарина II» . Кровь . 107 (7): 2753–8. doi : 10.1182/blood-2005-09-3755 . PMC   1895383 . PMID   16339402 .
• Лю Т., Цянь В.Дж., Гритсенко М.А. и др. (2006). «Анализ N-гликопротеома человека с помощью вычитания иммуноаффинности, химии гидразида и масс-спектрометрии» . J. Proteome Res . 4 (6): 2070–80. doi : 10.1021/pr0502065 . PMC   1850943 . PMID   16335952 .
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). «На пути к масштабе протеома карты взаимодействия белкового белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005natur.437.1173r . doi : 10.1038/nature04209 . PMID   16189514 . S2CID   4427026 .
• Schillinger M, Exner M, Sabeti S, et al. (2005). «Активность высокого уровня гепарина в плазме II защищает от рестеноза после бедренного стента». Тромб. Кровотечение . 92 (5): 1108–13. doi : 10.1160/th04-05-0311 . PMID   15543340 . S2CID   13806207 .
• Коллинз JE, Wright CL, Edwards CA, et al. (2005). «Подход, основанный на аннотациях генома к клонированию человека Orfeome» . Геном биол . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC   545604 . PMID   15461802 .
• Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, et al. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях» . Геном Res . 14 (9): 1711–8. doi : 10.1101/gr.2435604 . PMC   515316 . PMID   15342556 .
• Коррал Дж., Азнар Дж., Гонсалес-Конеро Р. и др. (2006). «Гомозиготный дефицит гепарина кофактора II: актуальность остатка глутамата р17 у серпинов, взаимосвязь с конформационными заболеваниями и роль в тромбозе» . Циркуляция . 110 (10): 1303–7. doi : 10.1161/01.cir.0000140763.51679.d9 . PMID   15337701 .
• Fortenberry YM, Whinna HC, Gentry HR, et al. (2004). «Молекулярное картирование комплекса тромбин-гепарина II» . Дж. Биол. Химический ​ 279 (41): 43237–44. doi : 10.1074/jbc.m406716200 . PMID   15292227 .
• Zhang F, Wu Y, Ma Q, et al. (2004). «Исследования о влиянии кальция на взаимодействие между гепарином и гепарином кофактором II с использованием поверхностного плазмонного резонанса». Клин Приложение Тромб. Гемост . 10 (3): 249–57. doi : 10.1177/107602960401000307 . PMID   15247982 . S2CID   21405427 .
• Андерсон Н.Л., Полански М., Пипер Р. и др. (2004). «Протеом плазмы человека: нередактирующий список, разработанный комбинацией четырех отдельных источников» . Мол Клетка. Протеомика . 3 (4): 311–26. doi : 10.1074/mcp.m300127-mcp200 . PMID   14718574 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC   139241 . PMID   12477932 .
• Noda A, Wada H, Kusiya F, et al. (2003). «Уровни в плазме гепарина кофактора II (HCII) и комплекса тромбин-HCII у пациентов с диссеминированной внутрисосудистой коагуляцией» . Клин Приложение Тромб. Гемост . 8 (3): 265–71. doi : 10.1177/107602960200800311 . PMID   12361205 .
• Baglin TP, Carrell RW, Church FC, et al. (2002). «Кристаллические структуры нативного и тромбин-комплексного гепаринового кофактора II выявляют многоэтапный аллостерический механизм» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (17): 11079–84. Bibcode : 2002pnas ... 9911079b . doi : 10.1073/pnas.162232399 . PMC   123213 . PMID   12169660 .
• Каннингем М.А., Бхакта В., Шеффилд В.П. (2003). «Изменение кофактора гепарина II в Val439 (P6) либо ухудшает ингибирование тромбина, либо дает устойчивость к эластазе». Тромб. Кровотечение . 88 (1): 89–97. doi : 10.1055/s-0037-1613159 . PMID   12152684 . S2CID   1467230 .
• Haya Kayawa Y, Sixhimama Y, Curious M, et al. (2002). Змей Фебс Летт 522 (1–3): 147–50. doi : s 10.1016 / PMID   12095635 . S2CID   12634527 .
• Митчелл Дж.В., Черч ФК (2002). «Остатки аспарагиновой кислоты 72 и 75 и тирозин-сульфат 73 гепаринового кофактора II способствуют внутримолекулярным взаимодействиям во время связывания гликозаминогликана и ингибирования тромбина» . Дж. Биол. Химический ​ 277 (22): 19823–30. doi : 10.1074/jbc.m200630200 . PMID   11856753 .
• Böhme C, Nimtz M, Grabenhorst E, et al. (2002). «Тирозин сульфатирование и N-гликозилирование кофактора гепарина человека II человека из клеток яичника в плазме и рекомбинантном китайском хомяке и их влияние на связывание гепарина». Евро. J. Biochem . 269 ​​(3): 977–88. doi : 10.1046/j.0014-2956.2001.02732.x . PMID   11846800 .

Внешние ссылки

• Онлайн-база данных Merops A04.019 для пептидаз и их ингибиторов: Archived 2017-03-31 на машине Wayback
• Гепарин+кофактор+II в Национальной медицинской библиотеке Медицинской библиотеки США (Mesh)
• Он Л, Висенте С., Уэстрик Р., Эцман Д., Толлефсен Д. (2002). «Кофактор гепарина II ингибирует артериальный тромбоз после повреждения эндотелиального» . J Clin Invest . 109 (2): 213–9. doi : 10.1172/jci13432 . PMC   150836 . PMID   11805133 .