Хордопоксвирины
| Хордопоксвирины | |
|---|---|
Классификация вирусов 
| |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Вариднавирия |
| Королевство: | Бэмфордвире |
| Тип: | Нуклеоцитовирикота |
| Сорт: | У поксвирусов |
| Заказ: | Хитовирусы |
| Семья: | поксвирусы |
| Подсемейство: | Хордопоксвирины |
| Роды | |
Chordopoxvirinae — подсемейство вирусов семейства Poxviridae . позвоночные и членистоногие Естественными хозяевами служат 52 вида . В настоящее время в это подсемейство отнесено , разделенных на 18 родов . К заболеваниям, связанным с этим подсемейством, относится оспа . [ 1 ] [ 2 ]
Четыре рода этого подсемейства содержат виды, поражающие человека: Molluscipoxvirus , Orthopoxvirus , Parapoxvirus и Yatapoxvirus .
Вирусология
[ редактировать ]Вирионы обычно окружены внутриклеточной зрелой вирионной формой вируса, которая содержит другую оболочку и также является инфекционной. Они различаются по своей форме в зависимости от вида, но обычно имеют форму кирпича или овальную форму, похожую на округлый кирпич, потому что они обернуты эндоплазматической сетью . Вирион исключительно велик, около 200 нм в диаметре и 300 нм в длину, и несет свой геном в одном двухцепочечном сегменте ДНК. [ 3 ] Геномы линейные, длиной около 130–375 т.п.н. [ 1 ]
| Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
|---|---|---|---|---|---|
| Ятапоксвирус | Кирпичный | обернутый | Линейный | Однодольный | |
| цервидопоксвирус | Кирпичный | обернутый | Линейный | Однодольный | |
| Лепорипоксвирус | Кирпичный | обернутый | Линейный | Однодольный | |
| Суипоксвирус | Кирпичный | обернутый | Линейный | Однодольный | |
| моллюскипоксвирус | Кирпичный | обернутый | Линейный | Однодольный | |
| Крокодилидпоксвирус | яйцевидный | обернутый | Линейный | Однодольный | |
| Каприпоксвирус | Кирпичный | обернутый | Линейный | Однодольный | |
| Ортопоксвирус | Кирпичный | обернутый | Линейный | Однодольный | |
| Авипоксвирус | Кирпичный | обернутый | Линейный | Однодольный | |
| Парапоксвирус | яйцевидный | обернутый | Линейный | Однодольный |
Жизненный цикл
[ редактировать ]Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем прикрепления вирусных белков к гликозаминогликанам хозяина (ГАГ), которые опосредуют эндоцитоз вируса в клетку-хозяина. Слияние с плазматической мембраной высвобождает ядро в цитоплазму хозяина. На ранней стадии ранние гены транскрибируются в цитоплазме вирусной РНК-полимеразой. Ранняя экспрессия начинается через 30 минут после заражения. Ядро полностью не покрыто, поскольку ранняя экспрессия заканчивается, и вирусный геном затем свободно находится в цитоплазме. В промежуточной фазе экспрессируются промежуточные гены, запускающие репликацию геномной ДНК примерно через 100 минут после заражения. На поздней фазе поздние гены экспрессируются в период от 140 минут до 48 часов после заражения, продуцируя все структурные белки. Сборка вирионов-потомков начинается в цитоплазматических вирусных фабриках, производя сферические незрелые частицы. Эта вирусная частица созревает во внутриклеточный зрелый вирион в форме кирпичика, который может высвобождаться при лизисе клеток или может приобретать вторую двойную мембрану из транс-Гольджи и отпочковываться в качестве внешних оболочек вирионных рецепторов хозяина, что опосредует эндоцитоз. Репликация следует модели смещения цепи ДНК. Транскрипция с помощью ДНК-матрицы - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина посредством микротрубчатого транспорта наружу, существует в окклюзионных тельцах после гибели клетки и остается заразным до тех пор, пока не найдет другого хозяина. Естественным хозяином служат люди, позвоночные и членистоногие. Путями передачи являются фомиты, контактные и воздушно-капельные частицы. [ 1 ]
| Род | Сведения о хосте | Тканевой тропизм | Детали входа | Подробности выпуска | Сайт репликации | Монтажный участок | Передача инфекции |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ятапоксвирус | Обезьяны; бабуины | Никто | Гликозаминогликаны | Лизис; зарождающийся | Цитоплазма | Цитоплазма | Контакт; насекомые |
| цервидопоксвирус | Олень | Никто | Гликозаминогликаны | Лизис; зарождающийся | Цитоплазма | Цитоплазма | Неизвестный |
| Лепорипоксвирус | зайцеобразный; белки | Никто | Гликозаминогликаны | Лизис; зарождающийся | Цитоплазма | Цитоплазма | Членистоногие; контакт |
| Суипоксвирус | Свинья | Никто | Гликозаминогликаны | Лизис; зарождающийся | Цитоплазма | Цитоплазма | Неизвестный |
| моллюскипоксвирус | Люди | Никто | Гликозаминогликаны | Лизис; зарождающийся | Цитоплазма | Цитоплазма | Секс; контакт |
| Крокодилидпоксвирус | Крокодилы | Никто | Гликозаминогликаны | Лизис; зарождающийся | Цитоплазма | Цитоплазма | Неизвестный |
| Каприпоксвирус | Овца; козел; крупный рогатый скот | Никто | Гликозаминогликаны | Лизис; зарождающийся | Цитоплазма | Цитоплазма | Членистоногие; контакт |
| Ортопоксвирус | Люди; млекопитающие | Никто | Гликозаминогликаны | Лизис; зарождающийся | Цитоплазма | Цитоплазма | вирус натуральной оспы; Дыхательная система; контакт; зооноз |
| Авипоксвирус | Птицы | Никто | Гликозаминогликаны | Лизис; зарождающийся | Цитоплазма | Цитоплазма | Членистоногие; аэрозоль |
| Парапоксвирус | Люди; млекопитающие | Никто | Гликозаминогликаны | Лизис; зарождающийся | Цитоплазма | Цитоплазма | Зооноз; контакт |
Таксономия
[ редактировать ]Классификация этого подсемейства основана на морфологии, типе нуклеиновой кислоты, способе репликации, организме-хозяине и типе вызванного заболевания.
Известны девять родов этого подсемейства; кроме того, ряд видов еще не отнесены к роду.
Виды рода Avipoxvirus заражают птиц ; представители родов Caiman poxvirus и Crocodylipoxvirus заражают крокодилов.
Остальные роды этого подсемейства поражают млекопитающих .
Выделяют следующие роды: [ 2 ]
Эволюция
[ редактировать ]Последний общий предок современных поксвирусов, поражающих позвоночных, существовал 0,5 миллиона лет назад . Род Avipoxvirus отделился от предка 249 ± 69 тысяч лет назад. Предок рода Orthopoxvirus отделился от других клад 0,3 миллиона лет назад . Вторая оценка времени этого расхождения предполагает, что это событие произошло 166 ± 43 000 лет назад. [ 4 ] Разделение ортопоксов на современные виды произошло около 14 000 лет назад. Род Leporipoxvirus разошелся около 137 ± 35 000 лет назад. За ним последовал предок рода Yatapoxvirus . Последний общий предок каприпоксвируса и суипоксвируса разошелся 111 ± 29 000 лет назад. [ нужна ссылка ]
Байесовское исследование геномов ортопоксов предполагает, что неклассифицированный поксвирус Йока отделился от линии, давшей начало ортопоксвирусам примерно 90 000 лет назад. [ 5 ] Вирусы ортопокса отделились от других вирусов оспы около 10 000 лет назад. Вирусы верблюжьей оспы, татерапоксы и натуральной оспы возникли 3500 лет назад, а вирус оспы лошадей — 3000 лет назад. Эти вирусы могли возникнуть на Африканском Роге. [ нужна ссылка ]
Другое байесовское исследование предполагает, что оспа возникла около 3500 лет назад. [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
- ^ Jump up to: а б «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.» . talk.ictvonline.org . Международный комитет по таксономии вирусов . Проверено 9 мая 2020 г.
- ^ Международный комитет по таксономии вирусов (15 июня 2004 г.). «Описания ICTVdb: 58. Poxviridae» . Архивировано из оригинала 3 июля 2007 года . Проверено 26 февраля 2005 г.
- ^ Бабкин И.В., Бабкина И.Н. (2011) Молекулярное датирование в эволюции поксвирусов позвоночных. Интервирусология 54(5):253-260. дои : 10.1159/000320964 .
- ^ Бабкин И.В., Бабкина И.Н. (2012) Ретроспективное исследование молекулярной эволюции ортопоксвируса. Заразить Генет Эвол
- ^ Babkin IV, Shelkunov SN (2008) Molecular evolution of poxviruses. Genetika 44(8):1029-1044
Внешние ссылки
[ редактировать ]
