Фосфоенолпируваткарбоксикиназа

фосфоенолпируваткарбоксикиназа 1 (растворимая)
фосфоенолпируваткарбоксикиназа 1 (растворимая)
	Мономер фосфоенолпируваткарбоксикиназы (GTP, цитозольный), человек
Идентификаторы
Символ	ПКК1
Альт. символы	ПЕПК-С
ген NCBI	5105
HGNC	8724
МОЙ БОГ	261680
RefSeq	НМ_002591
Другие данные
Номер ЕС	4.1.1.32
Локус	до нашей эры 20 q13.31

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary
PDB	1khb, 1khe, 1khf, 1khg, 1m51, 1nhx, 2gmv

Фосфоенолпируваткарбоксикиназа
Фосфоенолпируваткарбоксикиназа
	Рендеринг PDB на основе 1хб.
Идентификаторы
Символ	ПЕПКК
Пфам	PF00821
ИнтерПро	ИПР008209
PROSITE	PDOC00421
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	1хф / СКОПе / СУПФАМ
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary
PDB	1khb, 1khe, 1khf, 1khg, 1m51, 1nhx, 2gmv

фосфоенолпируваткарбоксикиназа 2 (митохондриальная)
Идентификаторы
Символ	ПКК2
Альт. символы	ПЭПК-М, ПЭПК2
ген NCBI	5106
HGNC	8725
МОЙ БОГ	261650
RefSeq	НМ_001018073
Другие данные
Номер ЕС	4.1.1.32
Локус	Хр. 14 q12

Фосфоенолпируваткарбоксикиназа ( EC 4.1.1.32 , PEPCK ) представляет собой фермент семейства лиаз , используемый в метаболическом пути глюконеогенеза . Он превращает оксалоацетат в фосфоенолпируват и углекислый газ . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Он встречается в двух формах: цитозольной и митохондриальной .

Структура

У человека существуют две изоформы PEPCK; цитозольная форма (SwissProt P35558) и митохондриальная изоформа (SwissProt Q16822), которые имеют 63,4% идентичности последовательностей. Цитозольная форма важна в глюконеогенезе. Однако существует известный транспортный механизм перемещения PEP из митохондрий в цитозоль с использованием специфических мембранных транспортных белков. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Транспорт PEP через внутреннюю митохондриальную мембрану включает митохондриальный транспортный белок трикарбоксилата и, в меньшей степени, переносчик адениновых нуклеотидов . Также была предложена возможность создания переносчика ПЭП/пирувата. ^{[ 9 ]}

Рентгеновские структуры PEPCK дают представление о структуре и механизме ферментативной активности PEPCK. Митохондриальная изоформа куриной печени PEPCK в комплексе с Mn ²⁺, Mn 2+ - фосфоенолпируват (ПЭП) и Mn ²⁺-ВВП предоставляет информацию о его структуре и о том, как этот фермент катализирует реакции. ^{[ 10 ]} Дельбаре и др. (2004) определили PEPCK в E. coli и обнаружили активный сайт, расположенный между C-концевым доменом и N-концевым доменом . Было обнаружено, что активный центр закрывается при вращении этих доменов. ^{[ 11 ]}

Фосфорильные группы передаются при действии PEPCK, чему, вероятно, способствует затменная конформация фосфорильных групп, когда АТФ связывается с PEPCK. ^{[ 11 ]}

Поскольку затменное образование имеет высокую энергию, передача фосфорильной группы имеет пониженную энергию активации , а это означает, что группы будут переноситься с большей легкостью. Этот перенос, вероятно, происходит по механизму, аналогичному смещению SN2 . ^{[ 11 ]}

У разных видов

гена PEPCK Транскрипция происходит у многих видов, и аминокислотная последовательность PEPCK различна для каждого вида.

Например, его структура и специфичность различаются у человека, Escherichia coli ( E. coli ) и паразита Trypanosoma cruzi . ^{[ 12 ]}

Механизм

PEPCKase превращает оксалоацетат в фосфоенолпируват и углекислый газ .

Поскольку PEPCK действует на стыке гликолиза и цикла Кребса, он вызывает декарбоксилирование молекулы C ₄ , создавая молекулу C ₃ . В качестве первого обязательного этапа глюконеогенеза PEPCK декарбоксилирует и фосфорилирует оксалоацетат (ОАА) для его преобразования в PEP, когда присутствует GTP. При переносе фосфата в результате реакции образуется молекула GDP. ^{[ 10 ]} Когда пируваткиназа — фермент, который обычно катализирует реакцию, превращающую PEP в пируват, — выводится из строя у мутантов Bacillus subtilis , PEPCK участвует в одной из анаплеротических реакций замещения , действуя в направлении, обратном своей нормальной функции, превращая PEP в OAA. . ^{[ 13 ]} Хотя эта реакция и возможна, кинетика настолько неблагоприятна, что мутанты растут очень медленно или вообще не растут. ^{[ 13 ]}

Функция

глюконеогенез

PEPCK-C катализирует необратимый этап глюконеогенеза — процесса синтеза глюкозы. Таким образом, считается, что этот фермент играет важную роль в гомеостазе глюкозы, о чем свидетельствуют лабораторные мыши, заболевшие сахарным диабетом 2 типа в результате сверхэкспрессии PEPCK-C. ^{[ 14 ]}

Роль, которую PEPCK-C играет в глюконеогенезе, может быть опосредована циклом лимонной кислоты , активность которого, как было обнаружено, напрямую связана с численностью PEPCK-C. ^{[ 15 ]}

Уровни PEPCK-C сами по себе не сильно коррелировали с глюконеогенезом в печени мышей, как предполагали предыдущие исследования. ^{[ 15 ]} В то время как печень мыши почти исключительно экспрессирует PEPCK-C, у людей в равной степени присутствует митохондриальный изофермент (PEPCK-M). PEPCK-M сам по себе обладает глюконеогенным потенциалом. ^{[ 2 ]} Следовательно, роль PEPCK-C и PEPCK-M в глюконеогенезе может быть более сложной и включать больше факторов, чем считалось ранее.

Животные

У животных это регулирующий скорость этап глюконеогенеза — процесса, посредством которого клетки синтезируют глюкозу из метаболических предшественников. Уровень глюкозы в крови поддерживается в четко определенных пределах, отчасти благодаря точной регуляции экспрессии гена PEPCK. Чтобы подчеркнуть важность PEPCK в гомеостазе глюкозы , чрезмерная экспрессия этого фермента у мышей приводит к симптомам сахарного диабета II типа , безусловно, наиболее распространенной формы диабета у людей. Из-за важности гомеостаза глюкозы в крови ряд гормонов регулируют набор генов (включая PEPCK) в печени , которые модулируют скорость синтеза глюкозы.

PEPCK-C контролируется двумя разными гормональными механизмами. Активность PEPCK-C увеличивается при секреции кортизола корой надпочечников и глюкагона альфа-клетками поджелудочной железы. Глюкагон косвенно повышает экспрессию PEPCK-C за счет увеличения уровней цАМФ (посредством активации аденилатциклазы) в печени, что, следовательно, приводит к фосфорилированию S133 на бета-листе белка CREB . Затем CREB связывается выше гена PEPCK-C с CRE (элемент ответа цАМФ) и индуцирует транскрипцию PEPCK-C. С другой стороны, кортизол, высвобождаемый корой надпочечников, проходит через липидную мембрану клеток печени (из-за своей гидрофобной природы он может проходить непосредственно через клеточные мембраны), а затем связывается с глюкокортикоидным рецептором (ГР). Этот рецептор димеризуется, и комплекс кортизол/GR проходит в ядро, где он затем связывается с областью элемента ответа глюкокортикоида (GRE) аналогично CREB и дает аналогичные результаты (синтез большего количества PEPCK-C).

Вместе кортизол и глюкагон могут дать огромные синергические результаты, активируя ген PEPCK-C до уровней, которых ни кортизол, ни глюкагон не могли достичь сами по себе. PEPCK-C наиболее распространен в печени, почках и жировой ткани. ^{[ 3 ]}

Совместное исследование Агентства по охране окружающей среды США (EPA) и Университета Нью-Гемпшира изучило влияние DE-71, коммерческой смеси ПБДЭ , на кинетику фермента PEPCK и установило, что обработка загрязнителя окружающей среды in vivo снижает уровень глюкозы и липидов в печени. метаболизм, возможно, за счет активации ксенобиотического рецептора прегнана ( PXR ) и может влиять на чувствительность всего организма к инсулину. ^{[ 16 ]}

Исследователи из Университета Кейс Вестерн Резерв обнаружили, что сверхэкспрессия цитозольного PEPCK в скелетных мышцах мышей приводит к тому, что они становятся более активными, более агрессивными и живут дольше, чем нормальные мыши; см. метаболические супермыши .

Растения

PEPCK ( EC 4.1.1.49 ) представляет собой один из трех ферментов декарбоксилирования, используемых в механизмах концентрации неорганического углерода C ₄ и CAM- растений. Остальные — НАДФ-яблочный фермент и НАД-яблочный фермент . ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]} При _{С 4} фиксации углерода углекислый газ сначала фиксируется путем соединения с фосфоенолпируватом с образованием оксалоацетата в мезофилле . PEPCK-типа C ₄ В растениях оксалоацетат затем превращается в аспартат , который поступает в оболочку пучка . В пучка клетках оболочки аспартат снова превращается в оксалоацетат . PEPCK декарбоксилирует оболочки пучка оксалоацетат , выделяя углекислый газ , который затем фиксируется ферментом Рубиско . молекула АТФ На каждую молекулу углекислого газа, вырабатываемого PEPCK, расходуется .

PEPCK действует в растениях, которые подвергаются C ₄ фиксации углерода , где его действие локализовано в цитозоле , в отличие от млекопитающих, у которых было обнаружено, что PEPCK действует в митохондриях . ^{[ 19 ]}

Хотя он обнаружен во многих частях растений, его можно обнаружить только в определенных типах клеток, включая участки флоэмы . ^{[ 20 ]}

Также было обнаружено, что в огурце ( Cucumis sativus L .) уровни PEPCK повышаются за счет множества эффектов, которые, как известно, снижают клеточный pH растения, хотя эти эффекты специфичны для части растения. ^{[ 20 ]}

Уровни PEPCK повышались в корнях и стеблях, когда растения поливали хлоридом аммония при низком pH (но не при высоком pH ) или масляной кислотой . Однако уровни PEPCK в листьях в этих условиях не увеличивались.

В листьях 5%-ное содержание CO ₂ в атмосфере приводит к более высокой численности PEPCK. ^{[ 20 ]}

Бактерии

Пытаясь изучить роль PEPCK, исследователи вызвали сверхэкспрессию PEPCK в E. coli бактериях с помощью рекомбинантной ДНК . ^{[ 21 ]}

PEPCK Mycobacterium Tuberculosis Было показано, что запускает иммунную систему у мышей за счет повышения активности цитокинов . ^{[ 22 ]}

В результате было обнаружено, что PEPCK может быть подходящим ингредиентом при разработке эффективной субъединичной вакцинации против туберкулеза . ^{[ 22 ]}

Клиническое значение

Активность при раке

PEPCK до недавнего времени не рассматривался в исследованиях рака. Было показано, что в образцах опухолей человека и линиях раковых клеток человека (клетках рака молочной железы, толстой кишки и легких) PEPCK-M, а не PEPCK-C, экспрессировался на достаточных уровнях, чтобы играть соответствующую метаболическую роль. ^{[ 1 ]}^{[ 23 ]} Следовательно, PEPCK-M может играть роль в раковых клетках, особенно при ограничении питательных веществ или других стрессовых условиях.

Регулирование

У людей

PEPCK-C усиливается как с точки зрения его производства, так и с точки зрения активации многими факторами. Транскрипция гена PEPCK-C стимулируется глюкагоном , глюкокортикоидами , ретиноевой кислотой и аденозин-3',5'-монофосфатом ( цАМФ ), в то время как она ингибируется инсулином . ^{[ 24 ]} Из этих факторов доминирующим считается инсулин — гормон, дефицитный при сахарном диабете 1 типа, поскольку он ингибирует транскрипцию многих стимулирующих элементов. ^{[ 24 ]} Активность PEPCK также ингибируется сульфатом гидразина , и, следовательно, это ингибирование снижает скорость глюконеогенеза. ^{[ 25 ]}

При длительном ацидозе уровень PEPCK-C активируется в клетках щеточной границы проксимальных канальцев почек , что приводит к секреции большего количества и _NH3 , таким образом, к выработке большего количества HCO3 _.⁻. ^{[ 26 ]}

ГТФ-специфическая активность PEPCK наиболее высока, когда Mn ²⁺ и мг ²⁺ доступны. ^{[ 21 ]} Кроме того, гиперреактивный цистеин (С307) участвует в связывании Mn. ²⁺ на активный сайт. ^{[ 10 ]}

Растения

Как обсуждалось ранее, численность PEPCK увеличивалась, когда растения поливали хлоридом аммония с низким pH, хотя высокий pH не имел такого эффекта. ^{[ 20 ]}

Классификация

Он классифицируется под номером ЕС 4.1.1. Существует три основных типа, различающихся источником энергии, вызывающей реакцию:

4.1.1.32 – ГТП ( ПК1 , ПКК2 )
4.1.1.38 – дифосфат
4.1.1.49 — СПС

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Мендес-Лукас А., Хирошшова П., Новелласдемунт Л., Виньялс Ф., Пералес Х.К. (август 2014 г.). «Митохондриальная фосфоенолпируваткарбоксикиназа (PEPCK-M) представляет собой ген реакции на стресс эндоплазматического ретикулума (ER), способствующий выживанию, участвующий в адаптации опухолевых клеток к доступности питательных веществ» . Журнал биологической химии . 289 (32): 22090–102. дои : 10.1074/jbc.M114.566927 . ПМК 4139223 . ПМИД 24973213 .
^ Jump up to: ^а ^б Мендес-Лукас А., Дуарте Х.А., Санни Н.Э., Сатапати С., Хе Т., Фу Х и др. (июль 2013 г.). «Экспрессия PEPCK-M в печени мышей усиливает, а не заменяет глюконеогенез, опосредованный PEPCK-C» . Журнал гепатологии . 59 (1): 105–13. дои : 10.1016/j.jhep.2013.02.020 . ПМК 3910155 . ПМИД 23466304 .
^ Jump up to: ^а ^б Чакраварти К., Кассуто Х., Решеф Л., Хэнсон Р.В. (2005). «Факторы, которые контролируют тканеспецифическую транскрипцию гена фосфоенолпируваткарбоксикиназы-С». Критические обзоры по биохимии и молекулярной биологии . 40 (3): 129–54. дои : 10.1080/10409230590935479 . ПМИД 15917397 . S2CID 633399 .
^ Робинсон Б.Х. (май 1971 г.). «Транспорт фосфоенолпирувата системой транспорта трикарбоксилатов в митохондриях млекопитающих» . Письма ФЭБС . 14 (5): 309–312. дои : 10.1016/0014-5793(71)80287-9 . ПМИД 11945784 . S2CID 9617975 .
^ Зелинг Х.Д., Уолтер У., Зауэр Х., Кляйнеке Дж. (декабрь 1971 г.). «Влияние синтетических аналогов фосфоенолпирувата на пируваткиназу мышц и печени, мышечную енолазу, фосфоенолпируваткарбоксикиназу печени и на внутри-/экстрамитохондриальную систему транспорта переносчиков трикарбоновых кислот». Письма ФЭБС . 19 (2): 139–143. дои : 10.1016/0014-5793(71)80498-2 . ПМИД 11946196 . S2CID 40637963 .
^ Кляйнеке Дж., Зауэр Х., Зелинг Х.Д. (январь 1973 г.). «О специфичности трикарбоксилатной транспортной системы в митохондриях печени крыс» . Письма ФЭБС . 29 (2): 82–6. дои : 10.1016/0014-5793(73)80531-9 . ПМИД 4719206 . S2CID 30730789 .
^ Шуг А.Л., Шраго Э. (июль 1973 г.). «Ингибирование транспорта фосфоенолпирувата через системы переносчиков трикарбоксилата и адениновых нуклеотидов митохондрий печени крысы». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 53 (2): 659–65. дои : 10.1016/0006-291X(73)90712-2 . ПМИД 4716993 .
^ Сул Х.С., Шраго Э., Шуг А.Л. (январь 1976 г.). «Взаимосвязь транспорта фосфоенолпирувата, ингибирования ацил-коэнзима А адениннуклеотид-транслоказы и оттока ионов кальция в митохондрии сердца морской свинки». Архив биохимии и биофизики . 172 (1): 230–7. дои : 10.1016/0003-9861(76)90071-0 . ПМИД 1252077 .
^ Сатрустеги Х, Пардо Б, Дель Арко А (январь 2007 г.). «Митохондриальные транспортеры как новые мишени для внутриклеточной передачи сигналов кальция». Физиологические обзоры . 87 (1): 29–67. doi : 10.1152/physrev.00005.2006 . ПМИД 17237342 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Холиок Т., Салливан С.М., Новак Т. (июль 2006 г.). «Структурное понимание механизма катализа PEPCK». Биохимия . 45 (27): 8254–63. дои : 10.1021/bi060269g . ПМИД 16819824 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Дельбаер Л.Т., Судом А.М., Прасад Л., Ледюк Ю., Голди Х. (март 2004 г.). «Исследование структуры/функции переноса фосфорила фосфоенолпируваткарбоксикиназой». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1697 (1–2): 271–8. дои : 10.1016/j.bbapap.2003.11.030 . ПМИД 15023367 .
^ Трапани С., Линсс Дж., Гольденберг С., Фишер Х., Крайевич А.Ф., Олива Г. (ноябрь 2001 г.). «Кристаллическая структура димерной фосфоенолпируваткарбоксикиназы (PEPCK) из Trypanosoma cruzi при разрешении 2 А». Журнал молекулярной биологии . 313 (5): 1059–72. дои : 10.1006/jmbi.2001.5093 . ПМИД 11700062 .
^ Jump up to: ^а ^б Замбони Н., Маахеймо Х., Шиперски Т., Хохманн Х.П., Зауэр У. (октябрь 2004 г.). «Фосфоенолпируваткарбоксикиназа также катализирует карбоксилирование C ₃ на границе гликолиза и цикла ТСА Bacillus subtilis». Метаболическая инженерия . 6 (4): 277–84. дои : 10.1016/j.ymben.2004.03.001 . ПМИД 15491857 .
^ Медицинский центр Вандербильта. «Лаборатория Граннера, PEPCK Research». 2001. Онлайн. Интернет. Доступ осуществлен в 22:46, 13 апреля 2007 г. www.mc.vanderbilt.edu/root/vumc.php?site=granner&doc=119
^ Jump up to: ^а ^б Берджесс С.К., Хе Т., Ян З., Линднер Дж., Шерри А.Д., Маллой С.Р. и др. (апрель 2007 г.). «Цитозольная фосфоенолпируваткарбоксикиназа не только контролирует скорость печеночного глюконеогенеза в интактной печени мышей» . Клеточный метаболизм . 5 (4): 313–20. дои : 10.1016/j.cmet.2007.03.004 . ПМК 2680089 . ПМИД 17403375 .
^ Нэш Дж.Т., Сабо Д.Т., Кэри ГБ (2012). «Полибромированные дифениловые эфиры изменяют кинетику фермента фосфоенолпируваткарбоксикиназы печени у самцов крыс Вистар: последствия для метаболизма липидов и глюкозы». Журнал токсикологии и гигиены окружающей среды. Часть А. 76 (2): 142–56. дои : 10.1080/15287394.2012.738457 . ПМИД 23294302 . S2CID 24458236 .
^ Канаи Р., Эдвардс, GE (1998). «Биохимия фотосинтеза C ₄ » . В Sage RF, Monson RK (ред.). C ₄ Биология растений . Эльзевир. стр. 49–87. ISBN 978-0-08-052839-7 . {{cite book}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ Кристофер Дж. Т., Холтум Дж. (сентябрь 1996 г.). «Закономерности распределения углерода в листьях видов толстянковых кислотного метаболизма во время нейтрализации кислотности» . Физиология растений . 112 (1): 393–399. дои : 10.1104/стр.112.1.393 . ПМК 157961 . ПМИД 12226397 .
^ Вознесенская Е.В., Франчески В.Р., Чуонг С.Д., Эдвардс Г.Е. (июль 2006 г.). «Функциональная характеристика анатомии листьев фосфоенолпируваткарбоксикиназы типа C ₄ : иммуно-, цитохимический и ультраструктурный анализ» . Анналы ботаники . 98 (1): 77–91. дои : 10.1093/aob/mcl096 . ПМК 2803547 . ПМИД 16704997 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Чен Ч., Уокер Р.П., Текси Л.И., Леа П.Дж., Лигуд Р.К. (май 2004 г.). «Фосфоенолпируваткарбоксикиназа в растениях огурца увеличивается как под действием аммония, так и подкисления, и присутствует во флоэме». Планта . 219 (1): 48–58. Бибкод : 2004Завод.219...48С . дои : 10.1007/s00425-004-1220-y . ПМИД 14991407 . S2CID 23800457 .
^ Jump up to: ^а ^б Айх С., Имабаяши Ф., Дельбаре Л.Т. (октябрь 2003 г.). «Экспрессия, очистка и характеристика бактериальной GTP-зависимой PEP-карбоксикиназы». Экспрессия и очистка белков . 31 (2): 298–304. дои : 10.1016/S1046-5928(03)00189-X . ПМИД 14550651 .
^ Jump up to: ^а ^б Лю К., Ба Х, Ю Дж., Ли Дж., Вэй Ц., Хан Г. и др. (август 2006 г.). «Фосфоенолпируваткарбоксикиназа микобактерии туберкулеза индуцирует сильные клеточно-опосредованные иммунные реакции у мышей». Молекулярная и клеточная биохимия . 288 (1–2): 65–71. дои : 10.1007/s11010-006-9119-5 . ПМИД 16691317 . S2CID 36284611 .
^ Лейтнер К., Хрзеньяк А., Троцмюллер М., Мустафа Т., Кёфелер Х.К., Волькениг С. и др. (февраль 2015 г.). «Активация PCK2 опосредует адаптивный ответ на истощение глюкозы при раке легких» . Онкоген . 34 (8): 1044–50. дои : 10.1038/onc.2014.47 . ПМИД 24632615 . S2CID 11902696 .
^ Jump up to: ^а ^б О'Брайен Р.М., Лукас ПК, Форест КД, Магнусон М.А., Граннер Д.К. (август 1990 г.). «Идентификация последовательности гена PEPCK, которая опосредует негативное влияние инсулина на транскрипцию». Наука . 249 (4968): 533–7. Бибкод : 1990Sci...249..533O . дои : 10.1126/science.2166335 . ПМИД 2166335 .
^ Маццио Э., Солиман К.Ф. (январь 2003 г.). «Роль гликолиза и глюконеогенеза в цитозащите клеток нейробластомы от токсичности ионов 1-метил-4-фенилпиридиния». Нейротоксикология . 24 (1): 137–47. дои : 10.1016/S0161-813X(02)00110-9 . ПМИД 12564389 .
^ Уолтер Ф. Борон (2005). Медицинская физиология: клеточный и молекулярный подход . Эльзевир/Сондерс. п. 858. ИСБН 978-1-4160-2328-9 .

Внешние ссылки

Фосфоенолпируват + карбоксикиназа + (АТФ) в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Фосфоенолпируват + карбоксикиназа + (GTP) в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
«могучие мыши» (мыши PEPCK-Cmus) https://web.archive.org/web/20071107175951/http://blog.case.edu/case-news/2007/11/02/mightymouse

[Mendez-Lucas_2-1] Jump up to: ^а ^б Мендес-Лукас А., Хирошшова П., Новелласдемунт Л., Виньялс Ф., Пералес Х.К. (август 2014 г.). «Митохондриальная фосфоенолпируваткарбоксикиназа (PEPCK-M) представляет собой ген реакции на стресс эндоплазматического ретикулума (ER), способствующий выживанию, участвующий в адаптации опухолевых клеток к доступности питательных веществ» . Журнал биологической химии . 289 (32): 22090–102. дои : 10.1074/jbc.M114.566927 . ПМК 4139223 . ПМИД 24973213 .

[Mendez-Lucas-2] Jump up to: ^а ^б Мендес-Лукас А., Дуарте Х.А., Санни Н.Э., Сатапати С., Хе Т., Фу Х и др. (июль 2013 г.). «Экспрессия PEPCK-M в печени мышей усиливает, а не заменяет глюконеогенез, опосредованный PEPCK-C» . Журнал гепатологии . 59 (1): 105–13. дои : 10.1016/j.jhep.2013.02.020 . ПМК 3910155 . ПМИД 23466304 .

[pmid15917397-3] Jump up to: ^а ^б Чакраварти К., Кассуто Х., Решеф Л., Хэнсон Р.В. (2005). «Факторы, которые контролируют тканеспецифическую транскрипцию гена фосфоенолпируваткарбоксикиназы-С». Критические обзоры по биохимии и молекулярной биологии . 40 (3): 129–54. дои : 10.1080/10409230590935479 . ПМИД 15917397 . S2CID 633399 .

[4] Робинсон Б.Х. (май 1971 г.). «Транспорт фосфоенолпирувата системой транспорта трикарбоксилатов в митохондриях млекопитающих» . Письма ФЭБС . 14 (5): 309–312. дои : 10.1016/0014-5793(71)80287-9 . ПМИД 11945784 . S2CID 9617975 .

[5] Зелинг Х.Д., Уолтер У., Зауэр Х., Кляйнеке Дж. (декабрь 1971 г.). «Влияние синтетических аналогов фосфоенолпирувата на пируваткиназу мышц и печени, мышечную енолазу, фосфоенолпируваткарбоксикиназу печени и на внутри-/экстрамитохондриальную систему транспорта переносчиков трикарбоновых кислот». Письма ФЭБС . 19 (2): 139–143. дои : 10.1016/0014-5793(71)80498-2 . ПМИД 11946196 . S2CID 40637963 .

[6] Кляйнеке Дж., Зауэр Х., Зелинг Х.Д. (январь 1973 г.). «О специфичности трикарбоксилатной транспортной системы в митохондриях печени крыс» . Письма ФЭБС . 29 (2): 82–6. дои : 10.1016/0014-5793(73)80531-9 . ПМИД 4719206 . S2CID 30730789 .

[7] Шуг А.Л., Шраго Э. (июль 1973 г.). «Ингибирование транспорта фосфоенолпирувата через системы переносчиков трикарбоксилата и адениновых нуклеотидов митохондрий печени крысы». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 53 (2): 659–65. дои : 10.1016/0006-291X(73)90712-2 . ПМИД 4716993 .

[8] Сул Х.С., Шраго Э., Шуг А.Л. (январь 1976 г.). «Взаимосвязь транспорта фосфоенолпирувата, ингибирования ацил-коэнзима А адениннуклеотид-транслоказы и оттока ионов кальция в митохондрии сердца морской свинки». Архив биохимии и биофизики . 172 (1): 230–7. дои : 10.1016/0003-9861(76)90071-0 . ПМИД 1252077 .

[9] Сатрустеги Х, Пардо Б, Дель Арко А (январь 2007 г.). «Митохондриальные транспортеры как новые мишени для внутриклеточной передачи сигналов кальция». Физиологические обзоры . 87 (1): 29–67. doi : 10.1152/physrev.00005.2006 . ПМИД 17237342 .

[Holyoak-10] Jump up to: ^а ^б ^с Холиок Т., Салливан С.М., Новак Т. (июль 2006 г.). «Структурное понимание механизма катализа PEPCK». Биохимия . 45 (27): 8254–63. дои : 10.1021/bi060269g . ПМИД 16819824 .

[Delbaere-11] Jump up to: ^а ^б ^с Дельбаер Л.Т., Судом А.М., Прасад Л., Ледюк Ю., Голди Х. (март 2004 г.). «Исследование структуры/функции переноса фосфорила фосфоенолпируваткарбоксикиназой». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1697 (1–2): 271–8. дои : 10.1016/j.bbapap.2003.11.030 . ПМИД 15023367 .

[pmid11700062-12] Трапани С., Линсс Дж., Гольденберг С., Фишер Х., Крайевич А.Ф., Олива Г. (ноябрь 2001 г.). «Кристаллическая структура димерной фосфоенолпируваткарбоксикиназы (PEPCK) из Trypanosoma cruzi при разрешении 2 А». Журнал молекулярной биологии . 313 (5): 1059–72. дои : 10.1006/jmbi.2001.5093 . ПМИД 11700062 .

[Zamboni-13] Jump up to: ^а ^б Замбони Н., Маахеймо Х., Шиперски Т., Хохманн Х.П., Зауэр У. (октябрь 2004 г.). «Фосфоенолпируваткарбоксикиназа также катализирует карбоксилирование C ₃ на границе гликолиза и цикла ТСА Bacillus subtilis». Метаболическая инженерия . 6 (4): 277–84. дои : 10.1016/j.ymben.2004.03.001 . ПМИД 15491857 .

[Vanderbilt-14] Медицинский центр Вандербильта. «Лаборатория Граннера, PEPCK Research». 2001. Онлайн. Интернет. Доступ осуществлен в 22:46, 13 апреля 2007 г. www.mc.vanderbilt.edu/root/vumc.php?site=granner&doc=119

[Burgess-15] Jump up to: ^а ^б Берджесс С.К., Хе Т., Ян З., Линднер Дж., Шерри А.Д., Маллой С.Р. и др. (апрель 2007 г.). «Цитозольная фосфоенолпируваткарбоксикиназа не только контролирует скорость печеночного глюконеогенеза в интактной печени мышей» . Клеточный метаболизм . 5 (4): 313–20. дои : 10.1016/j.cmet.2007.03.004 . ПМК 2680089 . ПМИД 17403375 .

[16] Нэш Дж.Т., Сабо Д.Т., Кэри ГБ (2012). «Полибромированные дифениловые эфиры изменяют кинетику фермента фосфоенолпируваткарбоксикиназы печени у самцов крыс Вистар: последствия для метаболизма липидов и глюкозы». Журнал токсикологии и гигиены окружающей среды. Часть А. 76 (2): 142–56. дои : 10.1080/15287394.2012.738457 . ПМИД 23294302 . S2CID 24458236 .

[Sage99-17] Канаи Р., Эдвардс, GE (1998). «Биохимия фотосинтеза C ₄ » . В Sage RF, Monson RK (ред.). C ₄ Биология растений . Эльзевир. стр. 49–87. ISBN 978-0-08-052839-7 . {{cite book}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

[Christopher96-18] Кристофер Дж. Т., Холтум Дж. (сентябрь 1996 г.). «Закономерности распределения углерода в листьях видов толстянковых кислотного метаболизма во время нейтрализации кислотности» . Физиология растений . 112 (1): 393–399. дои : 10.1104/стр.112.1.393 . ПМК 157961 . ПМИД 12226397 .

[Voznesenskaya-19] Вознесенская Е.В., Франчески В.Р., Чуонг С.Д., Эдвардс Г.Е. (июль 2006 г.). «Функциональная характеристика анатомии листьев фосфоенолпируваткарбоксикиназы типа C ₄ : иммуно-, цитохимический и ультраструктурный анализ» . Анналы ботаники . 98 (1): 77–91. дои : 10.1093/aob/mcl096 . ПМК 2803547 . ПМИД 16704997 .

[Chen-20] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Чен Ч., Уокер Р.П., Текси Л.И., Леа П.Дж., Лигуд Р.К. (май 2004 г.). «Фосфоенолпируваткарбоксикиназа в растениях огурца увеличивается как под действием аммония, так и подкисления, и присутствует во флоэме». Планта . 219 (1): 48–58. Бибкод : 2004Завод.219...48С . дои : 10.1007/s00425-004-1220-y . ПМИД 14991407 . S2CID 23800457 .

[Aich-21] Jump up to: ^а ^б Айх С., Имабаяши Ф., Дельбаре Л.Т. (октябрь 2003 г.). «Экспрессия, очистка и характеристика бактериальной GTP-зависимой PEP-карбоксикиназы». Экспрессия и очистка белков . 31 (2): 298–304. дои : 10.1016/S1046-5928(03)00189-X . ПМИД 14550651 .

[Liu-22] Jump up to: ^а ^б Лю К., Ба Х, Ю Дж., Ли Дж., Вэй Ц., Хан Г. и др. (август 2006 г.). «Фосфоенолпируваткарбоксикиназа микобактерии туберкулеза индуцирует сильные клеточно-опосредованные иммунные реакции у мышей». Молекулярная и клеточная биохимия . 288 (1–2): 65–71. дои : 10.1007/s11010-006-9119-5 . ПМИД 16691317 . S2CID 36284611 .

[Leithner-23] Лейтнер К., Хрзеньяк А., Троцмюллер М., Мустафа Т., Кёфелер Х.К., Волькениг С. и др. (февраль 2015 г.). «Активация PCK2 опосредует адаптивный ответ на истощение глюкозы при раке легких» . Онкоген . 34 (8): 1044–50. дои : 10.1038/onc.2014.47 . ПМИД 24632615 . S2CID 11902696 .

[Obrien-24] Jump up to: ^а ^б О'Брайен Р.М., Лукас ПК, Форест КД, Магнусон М.А., Граннер Д.К. (август 1990 г.). «Идентификация последовательности гена PEPCK, которая опосредует негативное влияние инсулина на транскрипцию». Наука . 249 (4968): 533–7. Бибкод : 1990Sci...249..533O . дои : 10.1126/science.2166335 . ПМИД 2166335 .

[Mazzio-25] Маццио Э., Солиман К.Ф. (январь 2003 г.). «Роль гликолиза и глюконеогенеза в цитозащите клеток нейробластомы от токсичности ионов 1-метил-4-фенилпиридиния». Нейротоксикология . 24 (1): 137–47. дои : 10.1016/S0161-813X(02)00110-9 . ПМИД 12564389 .

[boron858-26] Уолтер Ф. Борон (2005). Медицинская физиология: клеточный и молекулярный подход . Эльзевир/Сондерс. п. 858. ИСБН 978-1-4160-2328-9 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

v т и Углерод-углеродные лиазы ( КФ 4.1)
4.1.1: Carboxy-lyases	Acetoacetate decarboxylase Adenosylmethionine decarboxylase Arginine decarboxylase Aromatic L-amino acid decarboxylase Glutamate decarboxylase Histidine decarboxylase Lysine decarboxylase Malonyl-CoA decarboxylase Ornithine decarboxylase Oxaloacetate decarboxylase Phosphoenolpyruvate carboxykinase Phosphoenolpyruvate carboxylase Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase Pyrophosphomevalonate decarboxylase Pyruvate decarboxylase RuBisCO Uridine monophosphate synthetase/Orotidine 5'-phosphate decarboxylase Uroporphyrinogen III decarboxylase
4.1.2: Aldehyde-lyases	Fructose-bisphosphate aldolase Aldolase A Aldolase B Aldolase C 2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase Threonine aldolase
4.1.3: Oxo-acid-lyases	Isocitrate lyase 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase
4.1.99: Other	Tryptophanase Photolyase CPD lyase Spore photoproduct lyase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)