Холо-(ацил-белок-носитель)синтаза
| фосфопантетеинилтрансфераза | |||
|---|---|---|---|
 тример голо-[ацил-белка-носителя] синтазы, Helicobacter pylori | |||
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 2.7.8.7 | ||
| Номер CAS. | 37278-30-1 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
| ACPS | |||
|---|---|---|---|
 кристаллическая структура комплекса 4'-фосфопантетеинилтрансфераза sfp-кофермент а | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ACPS | ||
| Пфам | PF01648 | ||
| ИнтерПро | ИПР008278 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1qr0 / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
В энзимологии и молекулярной биологии голо- [ацил-белок-носитель]синтаза (ACPS, EC 2.7.8.7 ) представляет собой фермент , катализирующий химическую реакцию:
- КоА-[4'-фосфопантетеин] + апоациловый белок-носитель аденозин-3',5'-бисфосфат + холоациловый белок-переносчик
Этот фермент принадлежит к семейству трансфераз , в частности тех, которые переносят нестандартные замещенные фосфатные группы. Она также известна как 4'-фосфопантетеинилтрансфераза по названию группы, которую она переносит.
Функция
[ редактировать ]Все известные до сих пор ферменты ACPS эволюционно связаны друг с другом в одном суперсемействе белков . Он переносит 4'- фосфопантетеиновую (4'-PP) часть от кофермента А (КоА) к инвариантному серину в белке-переносчике ацила (ACP), небольшом белке, ответственном за активацию ацильной группы в биосинтезе жирных кислот . Эта посттрансляционная модификация делает голо-АПБ способным активировать ацильную группу посредством тиоэтерификации цистеамина тиола 4'-PP. [ 1 ] Это суперсемейство состоит из двух подтипов: тримерного типа ACPS, такого как ACPS E. coli , и мономерного типа Sfp (PCP-синтезирующего), такого как B. subtilis SFP . Структуры обоих семейств теперь известны. В активном центре находится магния ион . Наиболее консервативные участки белка участвуют связывании иона магния в . [ 2 ] [ 3 ]
Номенклатура
[ редактировать ]Систематическое название этого класса ферментов — КоА-[4'-фосфопантетеин]:апо-[ацил-белок-носитель] 4'-пантетеинфосфотрансфераза . Другие широко используемые названия, независимо от разницы в написании синтетазы/синтазы, включают ацил-носитель белка-голопротеин-синтетазу, голо-ACP-синтетазу, кофермент А: синтетаза жирных кислот, апофермент 4'-фосфопантетеин, протеин-синтетазу ацил-переносчика (ACPS), PPTase, ацил-носитель. протеинсинтаза, P-панттрансфераза и КоА: апо-[ацил-белок-носитель] пантетеинфосфотрансфераза.
Структурные исследования
[ редактировать ]По состоянию на конец 2007 года 8 структур для этого класса ферментов было решено PDB с кодами доступа 1F7L , 1F7T , 1F80 , 1FTE , 1FTF , 1FTH , 2JBZ и 2JCA .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ламбалот Р.Х., Уолш, Коннектикут (октябрь 1995 г.). «Клонирование, перепроизводство и характеристика голоацил-протеин-синтазы-переносчика Escherichia coli» . Журнал биологической химии . 270 (42): 24658–61. дои : 10.1074/jbc.270.42.24658 . ПМИД 7559576 .
- ^ Рейтер К., Мофид М.Р., Марахил М.А., Фикнер Р. (декабрь 1999 г.). «Кристаллическая структура фермента sfp, активирующего сурфактинсинтетазу: прототип суперсемейства 4'-фосфопантетеинилтрансферазы» . Журнал ЭМБО . 18 (23): 6823–31. дои : 10.1093/emboj/18.23.6823 . ПМЦ 1171745 . ПМИД 10581256 .
- ^ Марселла А.М., Калбертсон С.Дж., Шогрен-Кнаак М.А., Барб А.В. (24 ноября 2017 г.). «Структура, высокое сродство и отрицательная кооперативность голо-(ацил-белка-носителя): голо-(ацил-белка-носителя) синтазного комплекса Escherichia coli» . Журнал молекулярной биологии . 429 (23): 3763–3775. дои : 10.1016/j.jmb.2017.10.015 . ПМИД 29054754 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Эловсон Дж., Вагелос П.Р. (июль 1968 г.). «Белок-носитель ацила. X. Синтетаза белка-переносчика ацила» . Журнал биологической химии . 243 (13): 3603–11. дои : 10.1016/S0021-9258(19)34183-3 . ПМИД 4872726 .
- Прескотт DJ, Vagelos PR (1972). «Ацильный белок-носитель». Достижения энзимологии и смежных областей молекулярной биологии . Достижения в энзимологии и смежных областях молекулярной биологии. Том. 36. С. 269–311. дои : 10.1002/9780470122815.ch8 . ISBN 9780470122815 . ПМИД 4561013 .
- Ламбалот Р.Х., Геринг А.М., Флюгель Р.С., Зубер П., Ласелль М., Марахил М.А., Рид Р., Хосла К., Уолш К.Т. (ноябрь 1996 г.). «Новое суперсемейство ферментов — фосфопантетеинилтрансферазы» . Химия и биология . 3 (11): 923–36. дои : 10.1016/S1074-5521(96)90181-7 . ПМИД 8939709 .
- Уолш К.Т., Геринг А.М., Вейнреб П.Х., Квадри Л.Е., Флюгель Р.С. (октябрь 1997 г.). «Посттрансляционная модификация поликетидных и нерибосомальных пептидсинтаз». Современное мнение в области химической биологии . 1 (3): 309–15. дои : 10.1016/S1367-5931(97)80067-1 . ПМИД 9667867 .
- Mootz HD, Финкинг Р., Марахил М.А. (октябрь 2001 г.). «Перенос 4'-фосфопантетеина при первичном и вторичном метаболизме Bacillus subtilis» . Журнал биологической химии . 276 (40): 37289–98. дои : 10.1074/jbc.M103556200 . ПМИД 11489886 .
- Джоши А.К., Чжан Л., Ранган В.С., Смит С. (август 2003 г.). «Клонирование, экспрессия и характеристика человеческой 4'-фосфопантетеинилтрансферазы с широкой субстратной специфичностью» . Журнал биологической химии . 278 (35): 33142–9. дои : 10.1074/jbc.M305459200 . ПМИД 12815048 .
