Eif1ax

Eif1ax
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
показывать Список кодов идентификаторов PDB
	1D7Q, 3ZJY, 4KZY, 4KZZ
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF1AX , EIF1A, EIF1AP1, EIF4C, EIF-1A, EIF-4C, Эукариотический фактор инициации трансляции 1a, X-связанный, эукариотический фактор инициации трансляции 1a x-связанный
Внешние идентификаторы	Омим : 300186 ; MGI : 95298 ; Гомологен : 20364 ; GeneCards : eif1ax ; OMA : eif1ax - ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	20,141,838 bp
показывать Местоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	46,749,523 bp
показывать РНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	endothelial cell; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; gonad; ; lateral nuclear group of thalamus; ; biceps brachii; ; pons; ; ganglionic eminence; ; pericardium; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; postcentral gyrus;
	Top expressed in
	seminal vesicula; ; otic placode; ; saccule; ; pineal gland; ; otic vesicle; ; decidua; ; corneal stroma; ; epiblast; ; tail of embryo; ; calvaria;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Джин Онтология
Molecular function	translation factor activity, RNA binding; protein binding; translation initiation factor activity; RNA binding;
Cellular component	cytosol;
Biological process	translational initiation; protein biosynthesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	1964
	13664
	ENSG00000173674
	Ensmusg00000057561
	P47813
	Q60872
	NM_001412
	NM_010120 ; NM_001374654
	NP_001403
	NP_034250
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Эукариотический фактор инициации трансляции 1а, x-хромосомный ( eif1a )-это белок , который у людей кодируется eif1ax геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Этот ген кодирует важный фактор инициации эукариотической трансляции. Белок является компонентом 43-х господствующего комплекса (PIC), который опосредует рекрутирование рибосомальной субъединицы 40S к 5-'матче RNAS Messenger RNA. ^{[ 7 ]}

Функция

EIF1A - это небольшой белок (17 кДа в почкующихся дрожжах) и компонент комплексов 43 -х годов (PIC). EIF1A связывается вблизи рибосомального A-сайта способом, аналогичным функционально связанным бактериальным аналогам IF1 . ^{[ 8 ]}

Клиническое значение

Мутации в этом геном повторялись, связанные с случаями увеальной меланомы с диссомией 3. ^{[ 9 ]} EIF1A мутирует при раке щитовидной железы . ^{[ 10 ]}

Взаимодействия

Было показано, что EIF1AX взаимодействует с IPO13 . ^{[ 11 ]}

Смотрите также

Эукариотические факторы инициации

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000173674 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000057561 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Dever Te, Wei CL, Benkowski LA, Browning K, Merrick WC, Hershey JW (февраль 1994 г.). «Определение аминокислотной последовательности кролика, человека и фактора синтеза зародышевого белка пшеницы EIF-4C путем клонирования и химического секвенирования» . Журнал биологической химии . 269 (5): 3212–8. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 41850-3 . PMID 8106356 .
^ Lahn Bt, Page DC (октябрь 1997 г.). «Функциональная когерентность человеческой хромосомы Y». Наука . 278 (5338): 675–80. Bibcode : 1997sci ... 278..675L . doi : 10.1126/science.278.5338.675 . PMID 9381176 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: EIF1AX Eukaryotic Translation Factor 1a, X-связанный» .
^ Фрейзер, Кристофер С. (2015). «Количественные исследования рекрутирования мРНК в эукариотическую рибосому» . Биохими . 114 : 58–71. doi : 10.1016/j.biochi.2015.02.017 . PMC 4458453 . PMID 25742741 .
^ Мартин М., Массер Л., Теммин П., Рахманн С., Мец С., Борнфельд Н., Ван де Нанс Дж., Кляйн-Хитпс Л., Хиннебуш А.Г., Хоршемке Б., Ломанн Д.Р., Зеснигк М (август 2013). «Секвенирование экзома идентифицирует рецидивирующие соматические мутации в EIF1AX и SF3B1 при увеальной меланоме с диссомией 3» . Природа генетика . 45 (8): 933–6. doi : 10.1038/ng.2674 . PMC 4307600 . PMID 23793026 .
^ Сюй, Йихен; Ruggero, Davide (2020-03-09). «Роль контроля трансляции в онкогенезе и его терапевтических последствиях» . Ежегодный обзор биологии рака . 4 (1): 437–457. doi : 10.1146/annurev-cancerbio-030419-033420 . ISSN 2472-3428 .
^ Mingot JM, Kostka S, Kraft R, Hartmann E, Görlich D (июль 2001). «Импорт 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . Embo Journal . 20 (14): 3685–94. doi : 10.1093/emboj/20.14.3685 . PMC 125545 . PMID 11447110 .

Дальнейшее чтение

Battiste JL, Pestova TV, Hellen Cu, Wagner G (январь 2000). «Структура раствора EIF1A выявляет большую РНК-связывающую поверхность, важную для функции сканирования» . Молекулярная клетка . 5 (1): 109–19. doi : 10.1016/s1097-2765 (00) 80407-4 . PMID 10678173 .
Choi SK, Olsen DS, Roll-Mecak A, Martung A, Remo KL, Burley SK, Hinnebusch AG, Dever TE (октябрь 2000). «Физическое и функциональное взаимодействие между эукариотическими ортологами прокариотических факторов начала трансляции IF1 и IF2» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (19): 7183–91. doi : 10.1128/mcb.20.19.7183-7191.2000 . PMC 86272 . PMID 10982835 .
Mingot JM, Kostka S, Kraft R, Hartmann E, Görlich D (июль 2001). «Импорт 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . Embo Journal . 20 (14): 3685–94. doi : 10.1093/emboj/20.14.3685 . PMC 125545 . PMID 11447110 .
Sørensen HP, Hedegaard J, Sperling-Petersen Hu, Mortensen KK (май 2001 г.). «Замечательное сохранение факторов инициации перевода: IF1/EIF1A и IF2/eIF5B являются универсально распределенными филогенетическими маркерами». Жизнь iubmb . 51 (5): 321–7. doi : 10.1080/152165401317190842 . PMID 11699879 . S2CID 45654480 .
Bohnsack MT, Regener K, Schwappach B, Saffrich R, Paraskeva E, Hartmann E, Görlich D (ноябрь 2002 г.). «Exp5 экспортирует EEF1A через тРНК из ядер и синергирует с другими транспортными путями, чтобы ограничить трансляцию в цитоплазму» . Embo Journal . 21 (22): 6205–15. doi : 10.1093/emboj/cdf613 . PMC 137205 . PMID 12426392 .
Олсен Д.С., Савнер Э.М., Мэтью А., Чжан Ф., Кришнамурти Т., Фан Л., Хиннебуш А.Г. (январь 2003 г.). «Домены eIF1A, которые опосредуют связывание с EIF2, EIF3 и EIF5B и способствуют рекрутированию тройного комплекса in vivo» . Embo Journal . 22 (2): 193–204. doi : 10.1093/emboj/cdg030 . PMC 140105 . PMID 12514125 .
Marintchev A, Kolupaeva VG, Pestova TV, Wagner G (февраль 2003 г.). «Сопоставление границы связывания между эукариотическими факторами эукариотических факторов 1A и 5B: новое взаимодействие между старыми партнерами» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (4): 1535–40. Bibcode : 2003pnas..100.1535m . doi : 10.1073/pnas.0437845100 . PMC 149867 . PMID 12569173 .
Agate RJ, Choe M, Arnold AP (февраль 2004 г.). «Половые различия в структуре и экспрессии генов половых хромосом CHD1Z и CHD1W в зябликах зебры» . Молекулярная биология и эволюция . 21 (2): 384–96. doi : 10.1093/molbev/msh027 . PMID 14660691 .
Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Ламошас Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х. , Смоляр А., Босак С., Процессов Р, поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid of FP Roth, Vidal M (октябрь 2005 г.). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .
Ким С., Ким Г.Дж., Миёси Х., Мун Ш.Х., Ан С.Е., Ли Дж.Х., Ли Х.Дж., Ча К.Ю., Чунг Хм (август 2007 г.). «Эффективность промотора фактора удлинения-1альфа в эмбриональных стволовых клетках млекопитающих с использованием систем доставки лентивирусных генов». Стволовые клетки и развитие . 16 (4): 537–45. doi : 10.1089/scd.2006.0088 . PMID 17784828 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : P47813 (эукариотический фактор инициации трансляции 1а, X-Chromosoma) в PDBE-KB .

Эта статья о гене человека на хромосоме и/или связанного с ним белка является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000173674 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000057561 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8106356-5] Dever Te, Wei CL, Benkowski LA, Browning K, Merrick WC, Hershey JW (февраль 1994 г.). «Определение аминокислотной последовательности кролика, человека и фактора синтеза зародышевого белка пшеницы EIF-4C путем клонирования и химического секвенирования» . Журнал биологической химии . 269 (5): 3212–8. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 41850-3 . PMID 8106356 .

[pmid9381176-6] Lahn Bt, Page DC (октябрь 1997 г.). «Функциональная когерентность человеческой хромосомы Y». Наука . 278 (5338): 675–80. Bibcode : 1997sci ... 278..675L . doi : 10.1126/science.278.5338.675 . PMID 9381176 .

[entrez-7] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: EIF1AX Eukaryotic Translation Factor 1a, X-связанный» .

[Fraser-8] Фрейзер, Кристофер С. (2015). «Количественные исследования рекрутирования мРНК в эукариотическую рибосому» . Биохими . 114 : 58–71. doi : 10.1016/j.biochi.2015.02.017 . PMC 4458453 . PMID 25742741 .

[9] Мартин М., Массер Л., Теммин П., Рахманн С., Мец С., Борнфельд Н., Ван де Нанс Дж., Кляйн-Хитпс Л., Хиннебуш А.Г., Хоршемке Б., Ломанн Д.Р., Зеснигк М (август 2013). «Секвенирование экзома идентифицирует рецидивирующие соматические мутации в EIF1AX и SF3B1 при увеальной меланоме с диссомией 3» . Природа генетика . 45 (8): 933–6. doi : 10.1038/ng.2674 . PMC 4307600 . PMID 23793026 .

[10] Сюй, Йихен; Ruggero, Davide (2020-03-09). «Роль контроля трансляции в онкогенезе и его терапевтических последствиях» . Ежегодный обзор биологии рака . 4 (1): 437–457. doi : 10.1146/annurev-cancerbio-030419-033420 . ISSN 2472-3428 .

[pmid11447110-11] Mingot JM, Kostka S, Kraft R, Hartmann E, Görlich D (июль 2001). «Импорт 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . Embo Journal . 20 (14): 3685–94. doi : 10.1093/emboj/20.14.3685 . PMC 125545 . PMID 11447110 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]