Домен иммуноглобулина

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Домен иммуноглобулина
Домен иммуноглобулина
	Структура антигенсвязывающего фрагмента антитела.
Идентификаторы
Символ	ig
Пфам	PF00047
Пфам Клан	CL0159
ИнтерПро	ИПР013151
PROSITE	PDOC00262
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	8фаб / СКОПе / СУПФАМ
Суперсемейство OPM	193
белок OPM	5f71
CDD	cd00096
Мембраном	2
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Домен иммуноглобулина , также известный как складка иммуноглобулина, представляет собой тип белкового домена , который состоит из двухслойного сэндвича из 7-9 антипараллельных β-цепей, организованных в два β-листа с топологией греческого ключа . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} состоящий примерно из 125 аминокислот.

Основа . неоднократно переключается между двумя β-листами Обычно рисунок следующий: ( N-концевая β-шпилька в листе 1)-(β-шпилька в листе 2)-(β-цепь в листе 1)-( С-концевая β-шпилька в листе 2). Пересечения между листами образуют букву «X», так что шпильки N- и C-концевых концов обращены друг к другу.

Члены суперсемейства иммуноглобулинов встречаются в сотнях белков с различными функциями. Примеры включают антитела , гигантскую мышечную киназу титин и рецепторные тирозинкиназы . Иммуноглобулиноподобные домены могут участвовать в белок-белковых и белок- лигандных взаимодействиях. ^{[ 3 ]}

Примеры

Гены человека, кодирующие белки, содержащие домен иммуноглобулина, включают:

См. также

Суперсемейство иммуноглобулинов

Ссылки

^ Борк П., Холм Л., Сандер С. (сентябрь 1994 г.). «Складка иммуноглобулина. Структурная классификация, закономерности последовательности и общее ядро». Дж. Мол. Биол . 242 (4): 309–20. дои : 10.1006/jmbi.1994.1582 . ПМИД 7932691 .
^ Брюммендорф Т., Ратьен Ф.Г. (1995). «Молекулы клеточной адгезии 1: суперсемейство иммуноглобулинов». Белковый профиль . 2 (9): 963–1108. PMID 8574878 .
^ Уильямс А.Ф., Барклай А.Н. (1988). «Суперсемейство иммуноглобулинов - домены для распознавания клеточной поверхности». Анну. Преподобный Иммунол . 6 : 381–405. дои : 10.1146/annurev.iy.06.040188.002121 . ПМИД 3289571 .

Внешние ссылки

Список SCOP доменов иммуноглобулинов известной структуры

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR013151.

[pmid7932691-1] Борк П., Холм Л., Сандер С. (сентябрь 1994 г.). «Складка иммуноглобулина. Структурная классификация, закономерности последовательности и общее ядро». Дж. Мол. Биол . 242 (4): 309–20. дои : 10.1006/jmbi.1994.1582 . ПМИД 7932691 .

[pmid8574878-2] Брюммендорф Т., Ратьен Ф.Г. (1995). «Молекулы клеточной адгезии 1: суперсемейство иммуноглобулинов». Белковый профиль . 2 (9): 963–1108. PMID 8574878 .

[pmid3289571-3] Уильямс А.Ф., Барклай А.Н. (1988). «Суперсемейство иммуноглобулинов - домены для распознавания клеточной поверхности». Анну. Преподобный Иммунол . 6 : 381–405. дои : 10.1146/annurev.iy.06.040188.002121 . ПМИД 3289571 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

v т и Третичная структура белка
General	Structural domain Protein folding Structure determination methods
All-α folds:	Helix bundle Globin fold Homeodomain fold Alpha solenoid Death fold
All-β folds:	Immunoglobulin domain Beta barrel Beta-propeller Beta helix
α/β folds:	TIM barrel Leucine-rich repeat Flavodoxin fold Rossmann fold Thioredoxin fold Trefoil knot fold
α+β folds:	DNA clamp Ferredoxin fold Ribonuclease A SH2-like fold
Irregular folds:	Conotoxin