Eif5a

Eif5a
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: i3l397 Pdbe i3l397 RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	3CPF, 5DLQ
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF5A , EIF-5A, EIF5A1, EIF5AI, эукариотический фактор инициации перевода 5A, EIF-4D, FABAS
Внешние идентификаторы	Омим : 600187 ; MGI : 106248 ; Гомологен : 133803 ; Genecards : eif5a ; OMA : eif5a - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	7,312,463 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	69,812,784 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	skin of abdomen; ; skin of leg; ; stromal cell of endometrium; ; mucosa of transverse colon; ; right testis; ; appendix; ; left testis; ; gastrocnemius muscle; ; islet of Langerhans; ; right adrenal gland;
	Top expressed in
	somite; ; primitive streak; ; hand; ; mandibular prominence; ; dermis; ; maxillary prominence; ; human fetus; ; abdominal wall; ; Gonadal ridge; ; migratory enteric neural crest cell;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein N-terminus binding; ribosome binding; translation elongation factor activity; protein binding; RNA binding; U6 snRNA binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; endoplasmic reticulum membrane; membrane; nuclear pore; lamellae anulatae; endoplasmic reticulum; extracellular exosome; nucleus; dendrite; neuronal cell body;
Biological process	mRNA transport; protein biosynthesis; positive regulation of translational elongation; translational elongation; mRNA export from nucleus; peptidyl-lysine modification to peptidyl-hypusine; nucleocytoplasmic transport; protein export from nucleus; positive regulation of cell population proliferation; protein transport; translational frameshifting; positive regulation of translational termination; apoptotic process; positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; human ageing; positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process; positive regulation of apoptotic process; negative regulation of apoptotic process; positive regulation of muscle cell differentiation; cellular response to thyroid hormone stimulus; positive regulation of reactive oxygen species metabolic process; transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1984
	276770
	ENSG00000132507 ; ENSG00000288145
	Ensmusg00000078812
	P63241
	P63242
showNM_001143760 ; NM_001143761 ; NM_001143762 ; NM_001970 ; NM_001370420 ;
	NM_001370421
showNM_001166589 ; NM_001166590 ; NM_001166591 ; NM_001166592 ; NM_001166593 ;
	NM_001166594; NM_001166595; NM_001166596; NM_181582
showNP_001137232 ; NP_001137233 ; NP_001137234 ; NP_001961 ; NP_001357349 ;
	NP_001357350
showNP_001160061 ; NP_001160062 ; NP_001160063 ; NP_001160064 ; NP_001160065 ;
	NP_001160066; NP_001160067; NP_001160068; NP_853613
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Эукариотический фактор инициации трансляции 5A-1 -это белок , который у людей кодируется eIF5A геном . ^{[ 5 ]}

Это единственный известный белок, содержащий необычный аминокислотный гипзин [ n ^эн-(4-амино-2-гидроксибутил) -лизин], который синтезируется на eif5a при определенном остатках лизина из полиаминового спермидина двумя каталитическими этапами. ^{[ 6 ]}

EF-P является бактериальным гомологом EIF5A, который модифицируется пост-трансляционно аналогичным, но отличным образом. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Считается, что оба белка катализируют образование пептидных связей и помогают разрешить рибосомные киоски, что делает их факторы удлинения « фактор инициации ». , несмотря на то, что первоначально назначенное название ^{[ 9 ]}

Фаулы-банка синдром

Зародоелегические EIF5A варианты вызывают синдром фаундес-банка . ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} Это редкое человеческое расстройство характеризуется переменными комбинациями задержки развития, микроцефалии , микрогнатии и дисморфических особенностей . Он был назван в честь Виктора Фаундеса и Сиддхарт Банка.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000288145 GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000132507, ENSG00000288145 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000078812 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Steinkasserer A, Jones T, Sheer D, Koettnitz K, Hauber J, Bevec D (февраль 1995 г.). «Эукариотический кофактор для вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) Rev-белок, EIF-5A, отображает хромосому 17P12-P13: три псевдогена EIF-5A карту до 10Q23.3, 17Q25 и 19Q13.2». Геномика . 25 (3): 749–752. doi : 10.1016/0888-7543 (95) 80025-H . PMID 7759117 .
^ Wolff EC, Kang KR, Kim YS, Park MH (август 2007 г.). «Посттрансляционный синтез гидриста: эволюционное прогрессирование и специфичность модификации Supusine» . Аминокислоты . 33 (2): 341–350. doi : 10.1007/s00726-007-0525-0 . PMC 2572820 . PMID 17476569 .
^ Park JH, Johansson HE, Aoki H, Huang BX, Kim HY, Ganoza MC, Park MH (январь 2012 г.). «Посттрансляционная модификация с помощью β-лисилирования необходима для активности фактора удлинения Escherichia coli P (EF-P)» . Журнал биологической химии . 287 (4): 2579–2590. doi : 10.1074/jbc.m111.309633 . PMC 3268417 . PMID 22128152 .
^ Peil L, Starosta AL, Virumäe K, Atkinson GC, Tenson T, Remme J, Wilson DN (август 2012 г.). «Лис34 фактора удлинения трансляции EF-P гидроксилируется YFCM». Природная химическая биология . 8 (8): 695–697. doi : 10.1038/nchembio.1001 . PMID 22706199 .
^ Росси Д., Курошу Р., Занелли С.Ф., Валентини С.Р. (2013). «EIF5A и EF-P: два уникальных фактора перевода в настоящее время движутся одной и той же дорогой». Wiley междисциплинарные обзоры. РНК . 5 (2): 209–222. doi : 10.1002/wrna.1211 . PMID 24402910 . S2CID 25447826 .
^ Faundes V, Jennings MD, Crilly S, Legraie S, Withers SE, Cuvertino S, Davies SJ, Douglas AG, Fry Ae, Harrison V, Amiel J, Lehalle D, Newmman WG, Newkirk P, Ranells J, Splitt M, Cross La , Saunders CJ, Sullivan BR, Granadillo JL, Gordon CT, Kasher PR, Pavitt GD, Banka S (февраль 2021 г.). «Функция EIF5A приводит к расстройству менделии, которое частично спасено в модельных системах спермидином» . Природная связь . 12 (1): 833. Bibcode : 2021Natco..12..833f . doi : 10.1038/s41467-021-21053-2 . PMC 7864902 . PMID 33547280 .
^ «Вход OMIM - # 619376 - Синдром Фаундес -Банка; Фабас» . Omim.org . Получено 2022-01-03 .

Дальнейшее чтение

Bevec D, Hauber J (1997). «Эукариотическое фактор инициации 5A активность и функция оборотов ВИЧ-1». Биологические сигналы . 6 (3): 124–133. doi : 10.1159/000109118 . PMID 9285095 .
Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao Ry (2006). «Роли вспомогательных белков ВИЧ-1 в вирусном патогенезе и взаимодействиях с хозяином-патогеном» . Клеточные исследования . 15 (11–12): 923–934. doi : 10.1038/sj.cr.7290370 . PMID 16354571 .
Расмуссен Х.Х., Ван Дамм Дж., Пуйп М., Гессер Б., Селис Дж., Вандекеркхоув Дж. (Декабрь 1992 г.). «Микроязывания из 145 белков, зарегистрированных в двумерной базе данных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез . 13 (12): 960–969. doi : 10.1002/elps.115013011199 . PMID 1286667 . S2CID 41855774 .
Chung Si, Park MH, Folk JE, Lewis MS (февраль 1991 г.). «Эукариотический фактор инициации 5A: молекулярная форма гидузинсодержащего белка из эритроцитов человека». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - структура белка и молекулярная ферма . 1076 (3): 448–451. doi : 10.1016/0167-4838 (91) 90490-q . PMID 1900436 .
Smit-McBride Z, Dever TE, Hershey JW, Merrick WC (январь 1989 г.). «Определение последовательности и клонирование кДНК эукариотического фактора инициации 4D, белка, содержащего гидрин» . Журнал биологической химии . 264 (3): 1578–1583. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 94226-2 . PMID 2492279 .
Park MH, Liu Ty, Neece SH, Swiggard WJ (ноябрь 1986). «Фактор эукариотической инициации 4d. Очистка из эритроцитов человека и последовательность аминокислот вокруг его единственного штукового остатка» . Журнал биологической химии . 261 (31): 14515–14519. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 66899-1 . PMID 3095320 .
Koettnitz K, Kappel B, Baumruker T, Hauber J, Bevec D (июль 1994 г.). «Геномная структура, кодирующая фактор инициации человека EIF-5A». Ген . 144 (2): 249–252. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90385-9 . PMID 7545941 .
Klier H, Csonga R, Joäo HC, Eckerskorn C, Auer M, Lottspeich F, Eder J (ноябрь 1995 г.). «Выделение и структурная характеристика различных изоформ гидринсодержащих белка EIF-5A из клеток HeLa». Биохимия . 34 (45): 14693–14702. doi : 10.1021/bi00045a010 . PMID 7578077 .
Koettnitz K, Wöhl T, Kappel B, Lottspeich F, Hauber J, Bevec D (июль 1995 г.). «Идентификация нового члена семейства генов Human EIF-5A». Ген . 159 (2): 283–284. doi : 10.1016/0378-1119 (95) 00136-t . PMID 7622067 .
Джо Я, Парк М.Х. (октябрь 1994). «Структурные особенности предшественника EIF-5A, необходимых для посттрансляционного синтеза дезоксигипузина» . Журнал биологической химии . 269 (41): 25916–25921. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 47333-4 . PMID 7929297 .
Bevec D, Klier H, Holter W, Tschachler E, Valent P, Lottspeich F, et al. (Ноябрь 1994). «Индуцированная экспрессия генов гидросодержащего белкового эукариотического фактора инициации 5а в активированных Т-лимфоцитах человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (23): 10829–10833. Bibcode : 1994pnas ... 9110829b . doi : 10.1073/pnas.91.23.10829 . PMC 45119 . PMID 7971969 .
Maruyama K, Sugano S (январь 1994 г.). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–174. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Ruhl M, Himmelspach M, Bahr GM, Hammerschmid F, Jaksche H, Wolff B, et al. (Декабрь 1993). «Эукариотический фактор инициации 5A является клеточной мишенью вируса иммунодефицита человека типа 1 домена активации активации типа 1, опосредующая транс-активацию» . Журнал клеточной биологии . 123 (6 Pt 1): 1309–1320. doi : 10.1083/jcb.123.6.1309 . PMC 2290910 . PMID 8253832 .
Лю Ип, Немерофф М., Ян Ю.П., Чен К.Ю. (1997). «Взаимодействие эукариотического фактора инициации 5а с вирусом иммунодефицита человека типа 1 РНК ответа РНК и SnRNA U6 требует модификации дезоксигипузина или гидюзина». Биологические сигналы . 6 (3): 166–174. doi : 10.1159/000109123 . PMID 9285100 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–156. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Singh US, Li Q, Cerione R (январь 1998 г.). «Идентификация эукариотического фактора инициации 5а в качестве стимулированного ретиноевой кислотой партнера по связыванию клеток для тканевой трансглутаминазы II» . Журнал биологической химии . 273 (4): 1946–1950. doi : 10.1074/jbc.273.4.1946 . PMID 9442029 .
Schatz O, Oft M, Dascher C, Schebesta M, Rosorius O, Jaksche H, et al. (Февраль 1998 г.). «Взаимодействие кофактора Eukaryotic Eukaryotic Eukaryotic Factor 5A с рибосомным белком L5» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (4): 1607–1612. Bibcode : 1998pnas ... 95.1607s . doi : 10.1073/pnas.95.4.1607 . PMC 19115 . PMID 9465063 .
Lee YB, Joe Ya, Wolff EC, Dimitriadis EK, Park MH (май 1999). «Комплексное образование между дезоксигипузинсинтазой и ее белковой субстрат, предшественник эукариотической инициации трансляции 5A (EIF5A)» . Биохимический журнал . 340 (1): 273–281. doi : 10.1042/0264-6021: 3400273 . PMC 1220246 . PMID 10229683 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 17 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000288145 GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000132507, ENSG00000288145 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000078812 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid7759117-5] Steinkasserer A, Jones T, Sheer D, Koettnitz K, Hauber J, Bevec D (февраль 1995 г.). «Эукариотический кофактор для вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) Rev-белок, EIF-5A, отображает хромосому 17P12-P13: три псевдогена EIF-5A карту до 10Q23.3, 17Q25 и 19Q13.2». Геномика . 25 (3): 749–752. doi : 10.1016/0888-7543 (95) 80025-H . PMID 7759117 .

[pmid17476569-6] Wolff EC, Kang KR, Kim YS, Park MH (август 2007 г.). «Посттрансляционный синтез гидриста: эволюционное прогрессирование и специфичность модификации Supusine» . Аминокислоты . 33 (2): 341–350. doi : 10.1007/s00726-007-0525-0 . PMC 2572820 . PMID 17476569 .

[pmid22128152-7] Park JH, Johansson HE, Aoki H, Huang BX, Kim HY, Ganoza MC, Park MH (январь 2012 г.). «Посттрансляционная модификация с помощью β-лисилирования необходима для активности фактора удлинения Escherichia coli P (EF-P)» . Журнал биологической химии . 287 (4): 2579–2590. doi : 10.1074/jbc.m111.309633 . PMC 3268417 . PMID 22128152 .

[pmid22706199-8] Peil L, Starosta AL, Virumäe K, Atkinson GC, Tenson T, Remme J, Wilson DN (август 2012 г.). «Лис34 фактора удлинения трансляции EF-P гидроксилируется YFCM». Природная химическая биология . 8 (8): 695–697. doi : 10.1038/nchembio.1001 . PMID 22706199 .

[pmid24402910-9] Росси Д., Курошу Р., Занелли С.Ф., Валентини С.Р. (2013). «EIF5A и EF-P: два уникальных фактора перевода в настоящее время движутся одной и той же дорогой». Wiley междисциплинарные обзоры. РНК . 5 (2): 209–222. doi : 10.1002/wrna.1211 . PMID 24402910 . S2CID 25447826 .

[10] Faundes V, Jennings MD, Crilly S, Legraie S, Withers SE, Cuvertino S, Davies SJ, Douglas AG, Fry Ae, Harrison V, Amiel J, Lehalle D, Newmman WG, Newkirk P, Ranells J, Splitt M, Cross La , Saunders CJ, Sullivan BR, Granadillo JL, Gordon CT, Kasher PR, Pavitt GD, Banka S (февраль 2021 г.). «Функция EIF5A приводит к расстройству менделии, которое частично спасено в модельных системах спермидином» . Природная связь . 12 (1): 833. Bibcode : 2021Natco..12..833f . doi : 10.1038/s41467-021-21053-2 . PMC 7864902 . PMID 33547280 .

[11] «Вход OMIM - # 619376 - Синдром Фаундес -Банка; Фабас» . Omim.org . Получено 2022-01-03 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]