Ретровирусный матричный белок
Белки ретровирусного матрикса являются компонентами с оболочкой связанных капсидов ретровирусов , . Эти белки выстилают внутреннюю поверхность вирусных оболочек и связаны с вирусными мембранами. [ 1 ]
Матричные белки производятся в виде N-концевых доменов Gag полипротеинов- предшественников . Полипротеин Gag управляет сборкой и высвобождением вирусных частиц из инфицированных клеток. Полипротеин Gag имеет три домена, необходимых для активности: N-концевой мембраносвязывающий (M) домен (который соответствует матриксному белку), который направляет Gag к плазматической мембране , домен взаимодействия (I), участвующий в агрегации Gag, и домен взаимодействия (I), участвующий в агрегации Gag. Домен поздней сборки (L), который опосредует процесс почкования . [ 2 ] Во время созревания вируса полипротеин Gag расщепляется ретровирусной протеазой на несколько соответствующих структурных белков, образуя белки матрикса (MA), капсида (CA) и нуклеокапсида (NC), а также некоторые более мелкие пептиды . Белки, полученные из Gag, управляют всей сборкой и высвобождением вирусных частиц, при этом матричные белки играют ключевую роль в стабильности Gag, сборке капсида, транспортировке и почковании.
Семейства белков ретровирусного матрикса
[ редактировать ]| Gag_MA | |||
|---|---|---|---|
 Структура матричного белка вируса мышиного лейкоза Молони | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Gag_MA | ||
| Пфам | PF01140 | ||
| Пфам Клан | CL0074 | ||
| ИнтерПро | ИПР000840 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1мн8 / СКОПе / СУПФАМ | ||
| Суперсемейство OPM | 42 | ||
| белок OPM | 1мин8 | ||
| |||
Хотя матриксные белки разных вирусов, по-видимому, выполняют сходные функции и могут иметь схожие структурные складки, их первичные последовательности могут сильно различаться. Типичные матричные белки ретровирусов образуют альфа-спирального пучка структуру . [ 3 ]
Одно семейство этих белков представляет собой матриксные белки гаммаретровирусов , таких как Молони вирус мышиного лейкоза (MoMLV), вирус лейкоза кошек (FLV) и вирус саркомы кошек (FESV). [ 4 ] [ 5 ] В это семейство также входят матриксные белки нескольких эукариотических эндогенных ретровирусов , которые возникают, когда одна или несколько копий ретровирусного генома интегрируются в геном хозяина. [ 6 ]
| Ретро_М | |||
|---|---|---|---|
 м-домен из gag-полипротеина вируса саркомы Рауса, ЯМР, 20 структур | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Ретро_М | ||
| Пфам | PF02813 | ||
| Пфам Клан | CL0074 | ||
| ИнтерПро | ИПР004028 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1а6с / СКОПе / СУПФАМ | ||
| Суперсемейство OPM | 42 | ||
| белок OPM | 1а6с | ||
| |||
Другое семейство представляет собой М-домен полипротеина Gag, обнаруженного в птичьих ретровирусах. Он включает полипротеины Gag из нескольких эндогенных ретровирусов птиц. [ 7 ]
| Кляп_p10 | |||
|---|---|---|---|
 структура раствора матричного белка m-pmv дикого типа (p10) | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Кляп_p10 | ||
| Пфам | PF02337 | ||
| Пфам Клан | CL0074 | ||
| ИнтерПро | ИПР003322 | ||
| Суперсемейство OPM | 44 | ||
| белок OPM | 2 липы в год | ||
| |||
Матричные белки также являются компонентами бета-ретровирусов, таких как вирус обезьяны Мейсона-Пфайзера (MPMV) и вирус опухоли молочной железы мышей (MMTV). [ 8 ] [ 9 ] Эта запись также идентифицирует матриксные белки нескольких эукариотических эндогенных ретровирусов. [ 6 ]
| Кляп_p15 | |||
|---|---|---|---|
 кристаллическая структура матричного антигена вируса инфекционной анемии лошадей (eiav ma) | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Кляп_p15 | ||
| Пфам | PF08723 | ||
| ИнтерПро | ИПР014834 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1хек / СКОПе / СУПФАМ | ||
| Суперсемейство OPM | 44 | ||
| белок OPM | 1 хек | ||
| |||
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Конте М.Р., Мэтьюз С. (июль 1998 г.). «Белки ретровирусного матрикса: структурная перспектива» . Вирусология . 246 (2): 191–8. дои : 10.1006/виро.1998.9206 . ПМИД 9657938 .
- ^ Родитель Л.Дж., Кэрнс Т.М., Альберт Дж.А., Уилсон С.Б., Уиллс Дж.В., Крейвен Р.К. (январь 2000 г.). «Дефект димеризации РНК у мутанта матрикса вируса саркомы Рауса» . Дж. Вирол . 74 (1): 164–72. дои : 10.1128/jvi.74.1.164-172.2000 . ПМЦ 111525 . ПМИД 10590103 .
- ^ Макдоннелл Дж.М., Фашман Д., Кэхилл С.М., Чжоу В., Вулвен А., Уилсон С.Б., Нелл Т.Д., Реш М.Д., Уиллс Дж., Коуберн Д. (июнь 1998 г.). «Структура раствора и динамика биоактивного ретровирусного М-домена вируса саркомы Рауса». Дж. Мол. Биол . 279 (4): 921–8. дои : 10.1006/jmbi.1998.1788 . ПМИД 9642071 .
- ^ Риффель Н., Харлос К., Юрин О., Рао З., Кингсман А., Стюарт Д., Фрай Э. (декабрь 2002 г.). «Структура атомного разрешения матричного белка вируса мышиного лейкоза Молони и ее связь с другими белками ретровирусного матрикса» . Структура . 10 (12): 1627–36. дои : 10.1016/S0969-2126(02)00896-1 . ПМИД 12467570 .
- ^ Бейкер С.Дж., Козенца СК, Редди EP (сентябрь 1998 г.). «Роль миристоилирования v-Fgr и домена Gag в мембранном связывании и клеточной трансформации» . Вирусология . 249 (1): 1–11. дои : 10.1006/viro.1998.9323 . ПМИД 9740771 .
- ^ Перейти обратно: а б Гиффорд Р., Тристем М. (май 2003 г.). «Эволюция, распространение и разнообразие эндогенных ретровирусов». Гены вирусов . 26 (3): 291–315. дои : 10.1023/A:1024455415443 . ПМИД 12876457 . S2CID 34639116 .
- ^ Борисенко Л (2003). «Птичьи эндогенные ретровирусы». Фолиа Биол. (Прага) . 49 (5): 177–82. ПМИД 14680291 .
- ^ Стэнселл Э., Титлер Э., Уолтер М.Р., Хантер Э. (май 2004 г.). «Ранняя стадия почкования обезьяньего вируса Mason-Pfizer регулируется гидрофобностью ядра домена матрицы Gag» . Дж. Вирол . 78 (10): 5023–31. doi : 10.1128/jvi.78.10.5023-5031.2004 . ПМК 400380 . ПМИД 15113883 .
- ^ Пун Д.Т., Ли Г., Альдовини А. (март 1998 г.). «Вклад нуклеокапсида и матричного белка в селективную упаковку геномной РНК вируса иммунодефицита человека типа 1» . Дж. Вирол . 72 (3): 1983–93. doi : 10.1128/JVI.72.3.1983-1993.1998 . ПМК 109491 . ПМИД 9499052 .