Коллаген типа XV, альфа 1

COL15A1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	3N3F
Идентификаторы
Псевдонимы	COL15A1 , альфа-1-цепь коллагена типа XV
Внешние идентификаторы	Опустить : 120325 ; МГИ : 88449 ; Гомологен : 1396 ; Генные карты : COL15A1 ; OMA : COL15A1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	99,070,792 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	47,313,167 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	skin of hip; ; placenta; ; synovial joint; ; cardia; ; cartilage tissue; ; right ventricle; ; pericardium; ; superficial temporal artery; ; saphenous vein; ; cardiac muscle tissue of right atrium;
	Top expressed in
	ascending aorta; ; aortic valve; ; lactiferous gland; ; cardiac muscle tissue of left ventricle; ; sciatic nerve; ; white adipose tissue; ; extraocular muscle; ; uterus; ; subcutaneous adipose tissue; ; thoracic diaphragm;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	extracellular matrix structural constituent; structural molecule activity; extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength;
Cellular component	integral component of membrane; basement membrane; collagen; endoplasmic reticulum lumen; extracellular exosome; collagen type XV trimer; extracellular region; extracellular matrix; extracellular space; collagen-containing extracellular matrix;
Biological process	collagen catabolic process; multicellular organism development; cell differentiation; angiogenesis; signal transduction; cell adhesion; extracellular matrix organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	1306
	12819
	ENSG00000204291
	ENSMUSG00000028339
	P39059
	О35206
	НМ_001855
	НМ_009928
	НП_001846
	НП_034058
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Цепь коллагена альфа-1(XV) представляет собой белок , который у человека кодируется COL15A1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Этот ген кодирует альфа-цепь коллагена типа XV, члена семейства коллагенов FACIT (коллагены, связанные с фибриллами, с прерывистыми спиралью). Коллаген типа XV широко распространен в тканях, но наиболее сильная экспрессия локализована в зонах базальной мембраны, поэтому он может прикреплять базальные мембраны к подлежащей строме соединительной ткани. Исследования на мышах показали, что дефицит коллагена XV связан с ухудшением состояния мышц и микрососудов. ^{[ 6 ]}

Коллаген типа XV известен как супрессор опухоли , который можно использовать для изучения среды опухолевых клеток. Коллаген типа XV обеспечивает мембране поддержку и фиксацию клеток, но обычно не имеет плотной структурной сети. ^{[ 7 ]}

Известно, что изменения коллагена XV приводят к раковому поведению в тканях. Потеря коллагена XV больше не обеспечивает структурную поддержку мембраны, что может привести к проникновению опухолевых клеток в базальную мембрану; провоцируя возможное метастазирование. Известно, что чрезмерная экспрессия коллагена XV наблюдается при раке шейки матки. ^{[ 8 ]}

Для возможных будущих медицинских целей отсутствие коллагена XV в тканях может быть признаком инвазивной опухоли. ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000204291 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028339 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хюбнер К., Канниццаро Л.А., Джабс Э.В., Кивирикко С., Манцоне Х., Пихлажаниеми Т., Майерс Дж.К. (октябрь 1992 г.). «Хромосомное присвоение гена, кодирующего новый тип коллагена (COL15A1), к 9q21 → q22» . Геномика . 14 (2): 220–4. дои : 10.1016/S0888-7543(05)80209-5 . ПМИД 1427836 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: коллаген COL15A1, тип XV, альфа 1» .
^ Брето, Сандрин; Гийон, Эмили; Карппинен, Санна-Мария; Пихлажаниеми, Тайна; Руджеро, Флоренция (01 мая 2020 г.). «Коллаген XV, многогранный мультиплексин, присутствующий в тканях и видах» . Матрикс Биология Плюс . 6–7 : 100023. doi : 10.1016/j.mbplus.2020.100023 . ISSN 2590-0285 . ПМЦ 7852327 . ПМИД 33543021 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Клементц АГ, Харрис А. (декабрь 2013 г.). «Коллаген XV: изучение его структуры и роли в микроокружении опухоли» . Молекулярные исследования рака . 11 (12): 1481–6. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-12-0662 . ПМК 4159701 . ПМИД 24043668 .

Дальнейшее чтение

Майерс Дж.К., Кивирикко С., Гордон М.К., Дион А.С., Пихлажаниеми Т. (ноябрь 1992 г.). «Идентификация ранее неизвестной цепи человеческого коллагена альфа 1(XV), характеризующейся обширными разрывами в тройной спиральной области» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (21): 10144–8. Бибкод : 1992PNAS...8910144M . дои : 10.1073/pnas.89.21.10144 . ПМК 50294 . ПМИД 1279671 .
Кивирикко С., Хейнямяки П., Рен М., Хонканен Н., Майерс Дж.К., Пихлаяниеми Т. (февраль 1994 г.). «Первичная структура альфа-1-цепи коллагена XV типа человека и экзон-интронная организация в 3'-области соответствующего гена» . Журнал биологической химии . 269 (7): 4773–9. дои : 10.1016/S0021-9258(17)37611-1 . ПМИД 8106446 .
Мурагаки Ю., Абэ Н., Ниномия Ю., Олсен Б.Р., Оошима А. (февраль 1994 г.). «Цепь коллагена альфа-1(XV) человека содержит большой аминоконцевой нетройной спиральный домен с тандемной повторяющейся структурой и гомологией с коллагеном альфа-1(XVIII)» . Журнал биологической химии . 269 (6): 4042–6. дои : 10.1016/S0021-9258(17)41739-X . ПМИД 8307960 .
Майерс Дж.К., Дион А.С., Абрахам В., Амента П.С. (декабрь 1996 г.). «Коллаген типа XV широко распространен в тканях человека, но четко выражен в зонах базальной мембраны». Исследования клеток и тканей . 286 (3): 493–505. дои : 10.1007/s004410050719 . ПМИД 8929352 . S2CID 37769206 .
Хэгг П.М., Хэгг П.О., Пелтонен С., Аутио-Хармайнен Х., Пихлаяниеми Т. (июнь 1997 г.). «Расположение коллагена XV типа в тканях человека и его накопление в интерстициальном матриксе фиброзированной почки» . Американский журнал патологии . 150 (6): 2075–86. ПМЦ 1858337 . ПМИД 9176399 .
Хэгг П.М., Муона А., Литард Дж., Кивирикко С., Пихлажаниеми Т. (июль 1998 г.). «Полная экзон-интронная организация человеческого гена альфа1-цепи коллагена типа XV (COL15A1) и сравнение с гомологичным геном COL18A1» . Журнал биологической химии . 273 (28): 17824–31. дои : 10.1074/jbc.273.28.17824 . ПМИД 9651385 .
Рамчандран Р., Дханабал М., Волк Р., Уотерман М.Дж., Сигал М., Лу Х. и др. (февраль 1999 г.). «Антиангиогенная активность рестина, домена NC10 человеческого коллагена XV: сравнение с эндостатином». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 255 (3): 735–9. дои : 10.1006/bbrc.1999.0248 . ПМИД 10049780 .
Ли Д., Кларк К.С., Майерс Дж.К. (июль 2000 г.). «Коллаген зоны базальной мембраны типа XV представляет собой протеогликан хондроитинсульфата с дисульфидными связями в тканях и культивируемых клетках человека» . Журнал биологической химии . 275 (29): 22339–47. дои : 10.1074/jbc.M000519200 . ПМИД 10791950 .
Ниси М., Мизушима А., Накагавара К., Такэсима Х. (июль 2000 г.). «Характеристика генов подтипа юнктофилина человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 273 (3): 920–7. дои : 10.1006/bbrc.2000.3011 . ПМИД 10891348 .
Эклунд Л., Муона А., Лиетард Дж., Пихлажаниеми Т. (ноябрь 2000 г.). «Структура гена коллагена XV типа мыши, Col15a1, сравнение с человеческим геном COL15A1 и функциональный анализ промоторов обоих генов». Матричная биология . 19 (6): 489–500. дои : 10.1016/S0945-053X(00)00090-1 . ПМИД 11068203 .
Томоно Ю., Наито И., Андо К., Ёнезава Т., Садо Ю., Хиракава С. и др. (февраль 2002 г.). «Моноклональные антитела с определенным эпитопом против мультиплексиновых коллагенов демонстрируют, что коллагены типов XV и XVIII экспрессируются в специализированных базальных мембранах» . Структура и функции клеток . 27 (1): 9–20. дои : 10.1247/csf.27.9 . ПМИД 11937714 .
Майерс Дж.К., Амента П.С., Дион А.С., Шианкалепор Дж.П., Нагасвами С., Вайзель Дж.В., Юрченко П.Д. (июнь 2007 г.). «Молекулярная структура ткани человека XV типа представляет собой уникальную конформацию среди коллагенов» . Биохимический журнал . 404 (3): 535–44. дои : 10.1042/BJ20070201 . ПМК 1896284 . ПМИД 17355226 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 9 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000204291 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028339 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1427836-5] Хюбнер К., Канниццаро Л.А., Джабс Э.В., Кивирикко С., Манцоне Х., Пихлажаниеми Т., Майерс Дж.К. (октябрь 1992 г.). «Хромосомное присвоение гена, кодирующего новый тип коллагена (COL15A1), к 9q21 → q22» . Геномика . 14 (2): 220–4. дои : 10.1016/S0888-7543(05)80209-5 . ПМИД 1427836 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: коллаген COL15A1, тип XV, альфа 1» .

[7] Брето, Сандрин; Гийон, Эмили; Карппинен, Санна-Мария; Пихлажаниеми, Тайна; Руджеро, Флоренция (01 мая 2020 г.). «Коллаген XV, многогранный мультиплексин, присутствующий в тканях и видах» . Матрикс Биология Плюс . 6–7 : 100023. doi : 10.1016/j.mbplus.2020.100023 . ISSN 2590-0285 . ПМЦ 7852327 . ПМИД 33543021 .

[:0-8] Перейти обратно: ^а ^б Клементц АГ, Харрис А. (декабрь 2013 г.). «Коллаген XV: изучение его структуры и роли в микроокружении опухоли» . Молекулярные исследования рака . 11 (12): 1481–6. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-12-0662 . ПМК 4159701 . ПМИД 24043668 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]