Рибонуклеаза Т 1
| Рибонуклеаза Т 1 | |||
|---|---|---|---|
 | |||
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 4.6.1.24 | ||
| Номер CAS. | 9026-12-4 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
| Рибонуклеаза Т 1 | |||
|---|---|---|---|
 Рибонуклеаза Т 1 из Aspergillus oryzae . [ 1 ] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | рнтА | ||
| ПДБ | 1YGW | ||
| ЮниПрот | P00651 | ||
| Другие данные | |||
| Номер ЕС | 4.6.1.24 | ||
| |||
Рибонуклеаза Т 1 ( EC 4.6.1.24 , гуанилорибонуклеаза , рибонуклеаза Aspergillus oryzae , РНКаза N1 , РНКаза N2 , рибонуклеаза N3 , рибонуклеаза U1 , рибонуклеаза F1 , рибонуклеаза Ch , рибонуклеаза PP1 , рибонуклеаза SA , РНКаза F1 , аренда C2 , биназа , РНКаза Sa , гуанил-специфическая РНКаза , РНКаза G , РНКаза Т 1 , рибонуклеаза гуаниннуклеотид-2'-трансфераза (циклизирующая) , рибонуклеаза N3 , рибонуклеаза N1 ) — грибковая эндонуклеаза , расщепляющая одноцепочечные РНК после остатков гуанина , т. е. на их 3'-конце ; наиболее часто изучаемой формой этого фермента является версия, обнаруженная в плесени Aspergillus oryzae . Благодаря своей специфичности в отношении гуанина РНКаза Т 1 часто используется для переваривания денатурированной РНК перед секвенированием. Подобно другим рибонуклеазам, таким как барназа и РНКаза А , рибонуклеаза Т 1 была популярна для исследований сворачивания. [ 2 ]
Структурно рибонуклеаза Т 1 представляет собой небольшой α+β-белок (104 аминокислоты ) с четырехцепочечным антипараллельным бета-листом , охватывающим длинную альфа-спираль (почти пять витков). РНКаза Т 1 имеет две дисульфидные связи, Cys2-Cys10 и Cys6-Cys103, из которых последняя вносит больший вклад в стабильность ее сворачивания; [ 3 ] полное восстановление обоих дисульфидов обычно разворачивает белок, хотя его сворачивание можно спасти с помощью высоких концентраций соли. [ 4 ]
РНКаза Т 1 также имеет четыре пролина , два из которых (Pro39 и Pro55) имеют цис- изомеры своих пептидных связей X-Pro . Ненативные изомеры этих пролинов могут резко замедлять конформационное сворачивание. [ 5 ] сворачивание в характерном временном масштабе 7000 секунд (почти два часа) при 10 °C и pH 5. [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ PDB : 1ygw ; Пфайффер С., Карими-Неджад Ю., Рутерьянс Х. (1997). «Пределы определения структуры ЯМР с использованием вычислений переменной целевой функции: рибонуклеаза Т 1 , тематическое исследование». Журнал молекулярной биологии . 266 (2): 400–423. дои : 10.1006/jmbi.1996.0784 . ПМИД 9047372 .
- ^ Пейс CN, Хайнеманн Ю, Хан У, Сенгер В (1991). «Рибонуклеаза Т 1 : структура, функция и стабильность». Ангеванде Хеми . 30 (4): 343–360. дои : 10.1002/anie.199103433 .
- ^ Пейс К.Н., Гримсли Г.Р., Томсон Дж.А., Барнетт Б.Дж. (1988). «Конформационная стабильность и активность рибонуклеазы Т 1 с нулевой, одной и двумя неповрежденными дисульфидными связями» . Журнал биологической химии . 263 (24): 11820–11825. дои : 10.1016/S0021-9258(18)37859-1 . ПМИД 2457027 .
- ^ Ообатаке М., Такахаши С., Оой Т. (1979). «Конформационная стабильность рибонуклеазы Т 1 . II. Ренатурация, индуцированная солью». Журнал биохимии . 86 : 65–70.
- ^ Майр Л.М., Одефей СО, Щутковски М., Шмид FX (1996). «Кинетический анализ разворачивания и рефолдинга рибонуклеазы Т 1 с помощью метода двойного смешивания с остановленным потоком». Биохимия . 35 (17): 5550–5561. дои : 10.1021/bi953035y . ПМИД 8611546 .
- ^ Маллинз Л.С., Пейс К.Н., Раушел Ф.М. (1997). «Конформационная стабильность рибонуклеазы Т 1, измеренная методом водородно-дейтериевого обмена» . Белковая наука . 6 (7): 1387–1395. дои : 10.1002/pro.5560060702 . ПМК 2143755 . ПМИД 9232639 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Рибонуклеаза + T1 в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
 | Эта ферментам статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |