Jump to content

Микробная генетика

(Перенаправлено с «Микробной генетики »)

Генетика микробов — предметная область микробиологии и генной инженерии . Микробная генетика изучает микроорганизмы для различных целей. Наблюдаемые микроорганизмы представляют собой бактерии и археи. Некоторые грибы и простейшие также являются объектами изучения в этой области. Исследования микроорганизмов включают изучение генотипа и системы экспрессии. Генотипы — это унаследованный состав организма. (Остин, «Генотип», без даты) Генная инженерия — это область работы и исследований в области микробной генетики. [ 1 ] Процессом этой работы является использование технологии рекомбинантной ДНК. [ 1 ] Этот процесс включает создание рекомбинантных молекул ДНК путем манипулирования последовательностью ДНК. [ 1 ] Созданная ДНК затем контактирует с организмом-хозяином. Клонирование также является примером генной инженерии. [ 1 ]

Со времени открытия микроорганизмов Робертом Гуком и Антони ван Левенгуком в период 1665-1885 гг. [ 2 ] они использовались для изучения многих процессов и нашли применение в различных областях генетики. Например: быстрые темпы роста микроорганизмов и короткое время их образования используются учеными для изучения эволюции. Открытия Роберта Гука и Антони ван Левенгука включали изображения, наблюдения и описания микроорганизмов. [ 3 ] Мукор — это микрогриб, который представил и описал Гук. [ 4 ] Его вклад в том, что Мукор стал первым проиллюстрированным микроорганизмом. Вклад Антони ван Левенгука в изучение микроскопических простейших и микроскопических бактерий уступил место научным наблюдениям и описаниям. [ 4 ] Этот вклад был достигнут с помощью простого микроскопа, который привел к сегодняшнему пониманию микробов и продолжает прогрессировать в понимании ученых. [ 5 ] Микробная генетика также находит применение в изучении процессов и путей, сходных с теми, которые наблюдаются у людей, например, метаболизма лекарств . [ 6 ]

Роль в понимании эволюции

[ редактировать ]

В генетике микробов можно сосредоточиться на работах Чарльза Дарвина, и ученые продолжают изучать его работы и теории, используя микробы. [ 7 ] В частности, в качестве источника используется теория естественного отбора Дарвина. Изучение эволюции с помощью микробной генетики требует от ученых изучения эволюционного баланса. [ 1 ] Примером того, как они могут этого добиться, является изучение естественного отбора или дрейфа микробов. [ 7 ] Применение этих знаний основано на поиске присутствия или отсутствия различными способами. [ 7 ] Способы включают выявление определенных путей, генов и функций. После наблюдения за объектом ученый может сравнить его с последовательностью консервативного гена. [ 1 ] Процесс изучения микробной эволюции таким способом не позволяет определить временную шкалу того, когда происходила эволюция. [ 7 ] Однако, проверяя эволюцию таким образом, учёные могут узнать темпы и результаты эволюции. Изучение взаимоотношений между микробами и окружающей средой является ключевым компонентом эволюции генетики микробов. [ 8 ]

Микроорганизмы, изучение которых охватывает микробная генетика.

[ редактировать ]

Бактерии

[ редактировать ]
Бактерии классифицируются по форме.

Бактерии существуют на этой планете примерно 3,5 миллиарда лет и классифицируются по форме. [ 9 ] Генетика бактерий изучает механизмы передачи их наследственной информации, их хромосом , плазмид , транспозонов и фагов . [ 10 ]

Системы переноса генов, которые широко изучались у бактерий, включают генетическую трансформацию , конъюгацию и трансдукцию . Естественная трансформация — это бактериальная адаптация для переноса ДНК между двумя клетками через промежуточную среду. Поглощение донорской ДНК и ее рекомбинационное включение в хромосому-реципиент зависит от экспрессии многочисленных бактериальных генов, продукты которых направляют этот процесс. [ 11 ] [ 12 ] В целом трансформация — это сложный, энергозатратный процесс развития, который, по-видимому, представляет собой адаптацию для восстановления повреждений ДНК. [ 13 ]

Бактериальная конъюгация – это передача генетического материала между бактериальными клетками путем прямого контакта между клетками или посредством мостообразной связи между двумя клетками. Бактериальная конъюгация широко изучалась у Escherichia coli , но также встречается и у других бактерий, таких как Mycobacterium smegmatis . Конъюгация требует стабильного и продолжительного контакта между донором и штаммом-реципиентом, устойчива к ДНКазе , а перенесенная ДНК включается в хромосому реципиента путем гомологичной рекомбинации . Конъюгация E. coli опосредована экспрессией плазмидных генов, тогда как микобактериальная конъюгация опосредована генами бактериальной хромосомы. [ 14 ]

Трансдукция — это процесс, посредством которого чужеродная ДНК вводится в клетку вирусом или вирусным вектором . Трансдукция — это распространенный инструмент, используемый молекулярными биологами для стабильного введения чужеродного гена в геном клетки-хозяина .

Археи — это область прокариотических одноклеточных организмов, которые, как полагают, развились 4 миллиарда лет назад. «У них нет клеточного ядра или каких-либо других органелл внутри клеток». Археи размножаются бесполым путем в процессе, известном как бинарное деление. Цикл клеточного деления включает в себя репликацию хромосом дочерних клеток. Поскольку археи имеют особую структуру хромосомы, две дочерние клетки разделяются, и клетка делится. Подвижность архей включает жгутики , которые представляют собой хвостообразную структуру. Хромосомы архей реплицируются из разных источников репликации, образуя две гаплоидные дочерние клетки. [ 15 ] " [ 16 ] Они имеют общего предка с бактериями , но более тесно связаны с эукариотами, чем с бактериями. [ 17 ] Некоторые археи способны выживать в экстремальных условиях, что позволяет найти множество применений в области генетики. Одним из таких применений является использование ферментов архей, которые смогут лучше выживать в суровых условиях in vitro . [ 18 ]

Перенос генов и генетический обмен изучались у галофильных архей Halobacterium volcanii и гипертермофильных архей Sulfolobus solfataricus и Sulfolobus acidocaldarius . H. volcani образует цитоплазматические мостики между клетками, которые, по-видимому, используются для переноса ДНК из одной клетки в другую в любом направлении. [ 19 ] Когда S. solfataricus и S. acidocaldarius подвергаются воздействию агентов, повреждающих ДНК, индуцируется видоспецифичная агрегация клеток. Клеточная агрегация с высокой частотой опосредует обмен хромосомными маркерами и генетическую рекомбинацию. Считается, что клеточная агрегация усиливает видоспецифичный перенос ДНК между клетками Sulfolobus , чтобы обеспечить усиленное восстановление поврежденной ДНК посредством гомологичной рекомбинации . [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] Археи делятся на 3 подгруппы — галофилы , метаногены и термоацидофилы . Первая группа — метаногены — представляют собой археабактерии, обитающие в болотах и ​​топях, а также в кишечнике человека. Они также играют важную роль в гниении и разложении мертвых организмов. Метаногены – это анаэробные организмы, которые погибают под воздействием кислорода. Вторая подгруппа архейбактерий, галофилы, — это организмы, которые присутствуют в районах с высокой концентрацией соли, таких как Большое Соленое озеро и Мертвое море. Третья подгруппа термоацидофилов, также называемая термофилами, представляет собой организмы, обитающие в кислых средах. Они присутствуют в районах с низким уровнем pH, таких как горячие источники и гейеры. Больше всего термофилов обитает в Йеллоустонском национальном парке. [ 23 ]

Архейная генетика — это изучение генов, состоящих из одиночных безъядерных клеток. [ 24 ] Археи имеют одиночные кольцевые хромосомы, которые содержат несколько точек начала репликации для инициации синтеза ДНК. [ 25 ] Репликация ДНК архей включает в себя аналогичные процессы, включая инициацию, элонгацию и терминацию. Примаза, используемая для синтеза праймера РНК, различается по сравнению с эукариотами. Примаза архей представляет собой высокопроизводную версию мотива узнавания РНК (RRM). [ 25 ] Археи происходят от грамположительных бактерий, которые имеют один липидный бислой и устойчивы к антибиотикам. Археи похожи на митохондрии эукариот в том, что они выделяют энергию в виде аденозинтрифосфата (АТФ) посредством химической реакции, называемой метаболизмом. [ 25 ] Некоторые археи, известные как фототрофные археи, используют солнечную энергию для производства АТФ. АТФ-синтаза используется в качестве фотофосфорилирования для преобразования химических веществ в АТФ. [ 15 ]

Археи и бактерии структурно схожи, хотя на древе жизни они не тесно связаны. Формы как бактерий, так и клеток архей варьируются от сферической формы, известной как кокк, до палочковидной формы, известной как бацилла. Они также не имеют внутренней мембраны и имеют клеточную стенку, которая помогает клетке сохранять свою форму. Несмотря на то, что клетки архей имеют клеточные стенки, они не содержат пептидогликана, а это означает, что археи не производят целлюлозу или хитин. Археи наиболее тесно связаны с эукариотами из-за того, что тРНК присутствует у архей, но не у бактерий. Археи имеют те же рибосомы, что и эукариоты, которые синтезируют белки. [ 26 ] Помимо морфологии архей и бактерий, между этими доменами есть и другие различия. Археи, обитающие в экстремальных и суровых условиях с низким уровнем pH, таких как соленые озера, океаны, а также в кишечнике жвачных животных и человека, также известны как экстремофилы. Напротив, бактерии встречаются в различных областях, таких как растения, животные, почва и камни. [ 27 ]

Грибы могут быть как многоклеточными, так и одноклеточными организмами и отличаются от других микробов способом получения питательных веществ. Грибы выделяют в окружающую среду ферменты , расщепляющие органические вещества. [ 9 ] используются В генетике грибов дрожжи и нитчатые грибы клеточного цикла в качестве модельных организмов для генетических исследований эукариот, включая регуляцию , структуру хроматина и регуляцию генов . [ 28 ]

Исследования гриба Neurospora crassa внесли существенный вклад в понимание того, как работают гены . N. crassa — это разновидность плесени красного хлеба из типа Ascomycota . Его используют в качестве модельного организма , поскольку его легко выращивать и он имеет гаплоидный жизненный цикл, что упрощает генетический анализ, поскольку у потомства проявятся рецессивные признаки. Анализ генетической рекомбинации облегчается упорядоченным расположением продуктов мейоза в аскоспорах . В естественной среде N. crassa обитает преимущественно в тропических и субтропических регионах. Его часто можно встретить растущим на отмерших растениях после пожаров.

Neurospora использовалась Эдвардом Татумом и Джорджем Бидлом в своих экспериментах. [ 29 ] за что они получили Нобелевскую премию по физиологии и медицине в 1958 году. Результаты этих экспериментов привели непосредственно к гипотезе «один ген — один фермент» , согласно которой определенные гены кодируют определенные белки . Эта концепция оказалась отправной точкой в ​​том, что стало молекулярной генетикой и всеми последующими разработками. [ 30 ]

cerevisiae дрожжи типа Ascomycota Saccharomyces . Во время вегетативного роста, который обычно происходит при избытке питательных веществ, S. cerevisiae размножается митозом в виде диплоидных клеток. Однако при голодании эти клетки подвергаются мейозу с образованием гаплоидных спор . [ 31 ] гаплоидных клеток противоположных типов спаривания Спаривание происходит при контакте MATa и MATα. Рудерфер и др. [ 32 ] отметил, что в природе такие контакты часто встречаются между близкородственными дрожжевыми клетками по двум причинам. Во-первых, клетки противоположного типа спаривания присутствуют вместе в одном и том же мешочке , содержащем клетки, непосредственно образующиеся в результате одного мейоза , и эти клетки могут спариваться друг с другом. Вторая причина заключается в том, что гаплоидные клетки одного типа спаривания при делении клеток часто производят клетки противоположного типа спаривания. Анализ происхождения природных штаммов S. cerevisiae пришел к выводу, что ауткроссинг происходит очень редко (только примерно один раз на каждые 50 000 клеточных делений). [ 32 ] Относительная редкость мейотических событий, возникающих в результате ауткроссинга, предполагает, что возможные долгосрочные выгоды от ауткроссинга (например, создание разнообразия) вряд ли будут достаточными для общего сохранения пола от одного поколения к другому. Скорее, это краткосрочная польза, такая как мейотическая рекомбинационная репарация повреждений ДНК, вызванных стрессовыми условиями (например, голоданием). [ 33 ] может быть ключом к поддержанию пола у S. cerevisiae .

Candida albicans — диплоидный гриб, который растет как в виде дрожжей, так и в виде нитей . C. albicans является наиболее распространенным грибковым патогеном у человека. Он вызывает как изнурительные инфекции слизистых оболочек, так и потенциально опасные для жизни системные инфекции. C. albicans сохранил сложный, но в значительной степени скрытый брачный аппарат. [ 34 ] Джонсон [ 34 ] предположили, что стратегии спаривания могут позволить C. albicans выжить во враждебной среде хозяина-млекопитающего.

Среди 250 известных видов аспергилл около 33% имеют идентифицированный половой статус. [ 35 ] Среди тех видов Aspergillus , которые обладают половым циклом, подавляющее большинство в природе являются гомоталличными (самооплодотворяющимися). [ 35 ] Самоопыление у гомоталлического гриба Aspergillus nidulans включает активацию тех же путей спаривания, которые характерны для пола у ауткроссирующих видов, т.е. самооплодотворение не обходит необходимые пути для ауткроссирования пола, а вместо этого требует активации этих путей внутри одной особи. [ 36 ] Слияние гаплоидных ядер происходит в репродуктивных структурах, называемых клейстотециями , в которых диплоидная зигота подвергается мейотическим делениям с образованием гаплоидных аскоспор .

Простейшие

[ редактировать ]

Простейшие — это одноклеточные организмы, имеющие ядра и ультрамикроскопические клеточные тела в цитоплазме. [ 9 ] Одним из конкретных аспектов простейших, представляющих интерес для генетиков человека, являются их жгутики , которые очень похожи на жгутики сперматозоидов человека .

Исследования Paramecium способствовали нашему пониманию функции мейоза. Как и все инфузории , Paramecium имеет полиплоидный макронуклеус и одно или несколько диплоидных микроядер . Макронуклеус . контролирует нерепродуктивные функции клеток, экспрессируя гены, необходимые для повседневного функционирования Микроядро это генеративное или зародышевое ядро, содержащее генетический материал, который передается от одного поколения к другому. [ 37 ]

В фазе бесполого деления роста, во время которой деление клеток происходит путем митоза, а не мейоза , происходит клональное старение, приводящее к постепенной потере жизнеспособности. У некоторых видов, таких как хорошо изученный Paramecium Tetraurelia , бесполая линия клонально стареющих парамеций теряет жизнеспособность и погибает примерно после 200 делений, если клетки не подвергаются мейозу с последующей автогамией (самооплодотворением) или конъюгацией (ауткроссингом) (см. старение в Paramecium ). Повреждения ДНК резко возрастают во время последовательных делений клональных клеток и являются вероятной причиной клонального старения P. Tetraurelia . [ 38 ] [ 39 ] [ 40 ]

Когда клонально состаренная P. Tetraurelia стимулируется к мейозу в сочетании с автогамией или конъюгацией , потомство омолаживается и может иметь гораздо больше митотических бинарных делений. Во время любого из этих процессов микроядра клетки (клеток) подвергаются мейозу, старый макронуклеус распадается, и новый макронуклеус образуется в результате репликации микроядерной ДНК, которая недавно подверглась мейозу. По-видимому, в новом макронуклеусе повреждений ДНК мало, если они вообще имеются, что позволяет предположить, что омоложение связано с восстановлением этих повреждений в микроядре во время мейоза. [ нужна ссылка ]

Вирусы представляют собой организмы, кодирующие капсид, состоящие из белков и нуклеиновых кислот, которые могут самособираться после репликации в клетке-хозяине с использованием механизма репликации хозяина. [ 41 ] В науке существуют разногласия по поводу того, ли вирусы живут из-за отсутствия у них рибосом . [ 41 ] Понимание генома вирусов важно не только для исследований в области генетики, но и для понимания их патогенных свойств. [ 42 ]

Многие типы вирусов способны к генетической рекомбинации. Когда два или более отдельных вируса одного типа заражают клетку, их геномы могут рекомбинировать друг с другом с образованием рекомбинантного вирусного потомства. И ДНК-, и РНК-вирусы могут подвергаться рекомбинации. Когда два или более вируса, каждый из которых содержит летальные геномные повреждения, заражают одну и ту же клетку-хозяина, геномы вируса часто могут спариваться друг с другом и подвергаться гомологичной рекомбинационной репарации с образованием жизнеспособного потомства. [ 43 ] [ 44 ] Этот процесс известен как реактивация множественности. [ 43 ] [ 45 ] Ферменты, используемые в реактивации множественности, функционально гомологичны ферментам, используемым в бактериальной и эукариотической рекомбинационной репарации. Было обнаружено, что реактивация множественности происходит с патогенными вирусами, включая вирус гриппа, ВИЧ-1, аденовирус обезьяньего вируса 40, вирус коровьей оспы, реовирус, полиовирус и вирус простого герпеса, а также многочисленные бактериофаги. [ 45 ]

Любой живой организм может заразиться вирусом, давая паразитам возможность расти. Паразиты питаются питательными веществами другого организма, что позволяет вирусу процветать. Как только организм человека обнаруживает вирус, он создает клетки-истребители, которые атакуют паразита/вирус; буквально, вызывая войну внутри тела. [ 46 ] Вирус может поразить любую часть тела, вызывая широкий спектр заболеваний, таких как грипп, простуда и заболевания, передающиеся половым путем. [ 46 ] Грипп — это вирус, передающийся воздушно-капельным путем, который передается через мельчайшие капли и официально известен как грипп. Паразиты перемещаются по воздуху и поражают дыхательную систему человека. Люди, первоначально инфицированные этим вирусом, передают инфекцию при обычной повседневной деятельности, такой как разговор и чихание. Когда человек вступает в контакт с вирусом, в отличие от простуды, вирус гриппа поражает людей практически сразу. Симптомы этого вируса очень похожи на обычную простуду, но гораздо хуже. Боли в теле, боль в горле, головная боль, холодный пот, мышечные боли и усталость — одни из многих симптомов, сопровождающих вирус. [ 47 ] Вирусная инфекция верхних дыхательных путей приводит к простуде. [ 48 ] Простуда с такими симптомами, как боль в горле, чихание, небольшая температура и кашель, обычно безвредна и проходит в течение недели или около того. Простуда также является вирусом, который распространяется воздушно-капельным путем, но также может передаваться и при прямом контакте. Симптомы этой инфекции появляются через несколько дней; в отличие от гриппа, это постепенный процесс. [ 48 ]

Применение микробной генетики

[ редактировать ]
Taq-полимераза, которая используется в полимеразной цепной реакции (ПЦР).

Микробы идеально подходят для биохимических и генетических исследований и внесли огромный вклад в эти области науки, например, продемонстрировав, что ДНК является генетическим материалом. [ 49 ] [ 50 ] что ген имеет простую линейную структуру, [ 51 ] что генетический код представляет собой триплетный код, [ 52 ] и что экспрессия генов регулируется специфическими генетическими процессами. [ 53 ] Жак Моно и Франсуа Жакоб использовали Escherichia coli , тип бактерий, для разработки оперонной модели экспрессии генов , которая закладывает основу экспрессии и регуляции генов. [ 54 ] Более того, наследственные процессы одноклеточных эукариотических микроорганизмов аналогичны процессам у многоклеточных организмов, что позволяет исследователям также собирать информацию об этом процессе. [ 55 ] Еще одна бактерия, внесшая большой вклад в область генетики, это Thermus aquaticus , бактерия, переносящая высокие температуры. Из этого микроба ученые выделили фермент Taq-полимеразу , который сейчас используется в мощном экспериментальном методе — полимеразной цепной реакции (ПЦР). [ 56 ] Кроме того, развитие технологии рекомбинантной ДНК с использованием бактерий привело к рождению современной генной инженерии и биотехнологии . [ 9 ]

С использованием микробов были разработаны протоколы для вставки генов в бактериальные плазмиды , используя их быстрое размножение, чтобы создать биофабрики для интересующего гена. Такие генетически модифицированные бактерии могут производить фармацевтические препараты, такие как инсулин , гормон роста человека , интерфероны и факторы свертывания крови . [ 9 ] Эти биофабрики обычно намного дешевле эксплуатировать и обслуживать, чем альтернативные методы производства фармацевтических препаратов. Они подобны миллионам крошечных фармацевтических машин, которым для производства большого количества продукта требуется только основное сырье и подходящая среда. Использование одного лишь гена человеческого инсулина оказало глубокое влияние на медицинскую промышленность. Считается, что биофабрики могут стать решающим фактором в снижении цен на дорогие фармацевтические соединения, спасающие жизни.

Микробы синтезируют различные ферменты для промышленного применения, такие как ферментированные продукты, реагенты для лабораторных испытаний, молочные продукты (например, ренин ) и даже в одежде (например, грибок Trichoderma, фермент которого используется для придания джинсам вида, выстиранного как камень). [ 9 ]

В настоящее время существует возможность использования микробов в качестве альтернативы поверхностно-активным веществам на нефтяной основе. Микробные поверхностно-активные вещества по-прежнему будут иметь те же гидрофильные и гидрофобные функциональные группы, что и их аналоги на основе нефти, но у них есть множество преимуществ перед конкурентами. Для сравнения, микробные амфифильные соединения имеют устойчивую тенденцию оставаться функциональными в экстремальных условиях, таких как районы с высокой температурой или экстремальным уровнем pH. при этом он биоразлагаем и менее токсичен для окружающей среды. Этот эффективный и дешевый метод производства может стать решением проблемы постоянно растущего мирового потребления поверхностно-активных веществ. По иронии судьбы, наибольшим спросом на поверхностно-активные вещества биологического происхождения пользуется нефтяная промышленность, которая использует поверхностно-активные вещества в общем производстве, а также при разработке конкретных масляных композиций. [ 57 ]

Микробы являются богатым источником липаз , которые находят широкое применение в промышленности и быту. Ферменты выполняют самые разнообразные функции внутри клеток живых существ, поэтому имеет смысл использовать их для аналогичных целей в более крупных масштабах. Микробные ферменты обычно предпочтительнее для массового производства из-за широкого разнообразия доступных функций и их способности производиться массово. Растительные и животные ферменты обычно слишком дороги для массового производства, однако это не всегда так. Особенно у растений. Промышленное применение липаз обычно включает фермент в качестве более эффективного и экономически выгодного катализатора при производстве коммерчески ценных химических веществ из жиров и масел, поскольку они способны сохранять свои специфические свойства в мягких, простых в обслуживании условиях и работать с повышенной скоростью. . Другие уже успешные применения липолитических ферментов включают производство биотоплива, полимеров, нестереоизомерных фармацевтических препаратов, сельскохозяйственных соединений и соединений, улучшающих вкус. [ 58 ]

Что касается промышленной оптимизации, преимуществом биофабричного метода производства является возможность прямой оптимизации посредством направленной эволюции. Эффективность и специфичность производства со временем будут возрастать за счет введения искусственного отбора. Этот метод повышения эффективности не является чем-то новым в сельском хозяйстве, но это относительно новая концепция в промышленном производстве. Считается, что этот метод будет намного превосходить традиционные промышленные методы, поскольку оптимизация осуществляется по нескольким направлениям. Первый фронт заключается в том, что микроорганизмы, из которых состоят биофабрики, могут быть адаптированы к нашим потребностям. Второй фронт — это традиционный метод оптимизации, вызванный интеграцией передовых технологий. Эта комбинация традиционных и биологических достижений только сейчас начинает использоваться и обеспечивает практически безграничное количество применений. [ 59 ]

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б с д и ж «Микробы и инструменты генной инженерии | Микробиология» . Courses.lumenlearning.com . Проверено 17 ноября 2018 г.
  2. ^ Гест, Хау (22 мая 2004 г.). «Открытие микроорганизмов Робертом Гуком и Антони ван Левенгуком, членами Королевского общества». Заметки и отчеты Лондонского королевского общества . 58 (2): 137–201. дои : 10.1098/rsnr.2004.0055 . ПМИД   15209075 . S2CID   8297229 .
  3. ^ «BBC - История - Исторические деятели: Антони ван Левенгук (1632–1723)» . Проверено 17 ноября 2018 г.
  4. ^ Jump up to: а б «Антони ван Левенгук: Темы от Science.gov» . www.science.gov . Проверено 17 ноября 2018 г.
  5. ^ Мортлок, Роберт (2013). Микроорганизмы как модельные системы для изучения эволюции . Спрингер Верлаг. п. 2. ISBN  978-1-4684-4846-7 .
  6. ^ Мерфи, Кормак Д. (2 сентября 2014 г.). «Метаболизм лекарств у микроорганизмов». Биотехнологические письма . 37 (1): 19–28. дои : 10.1007/s10529-014-1653-8 . hdl : 10197/7674 . ПМИД   25179825 . S2CID   16636885 .
  7. ^ Jump up to: а б с д Бакли, Мерри; Рид, Энн (2011). Микробная эволюция .
  8. ^ Чакраборти, Ранаджит; Будоул, Брюс (2011). «Аспекты популяционной генетики при статистической интерпретации данных микробной судебно-медицинской экспертизы в сравнении со стандартами судебно-медицинской экспертизы ДНК человека». Микробная криминалистика . стр. 561–580. дои : 10.1016/B978-0-12-382006-8.00033-5 . ISBN  978-0-12-382006-8 .
  9. ^ Jump up to: а б с д и ж Уикс, Бенджамин С. (2012). Микробы и общество Алькамо (3-е изд.). Садбери, Массачусетс: Jones & Bartlett Learning. ISBN  978-0-7637-9064-6 .
  10. ^ «Бактериальная генетика» . Природа . Макмиллан Паблишерс Лимитед . Проверено 8 ноября 2015 г.
  11. ^ Чен И, Дубнау Д (2004). «Поглощение ДНК во время бактериальной трансформации». Обзоры природы Микробиология . 2 (3): 241–9. дои : 10.1038/nrmicro844 . ПМИД   15083159 . S2CID   205499369 .
  12. ^ Джонсборг О., Элдхольм В., Ховарштайн Л.С. (2007). «Естественная генетическая трансформация: распространенность, механизмы и функции» . Исследования в области микробиологии . 158 (10): 767–78. дои : 10.1016/j.resmic.2007.09.004 . ПМИД   17997281 .
  13. ^ Мишод Р.Э., Бернштейн Х., Недельку А.М. (2008). «Адаптационное значение пола у микробных патогенов». Инфекция, генетика и эволюция . 8 (3): 267–85. дои : 10.1016/j.meegid.2008.01.002 . ПМИД   18295550 .
  14. ^ Грей Т.А., Кривой Дж.А., Гарольд Дж., Палумбо М.Дж., Дербишир К.М. (2013). «Дистрибутивный супружеский перенос у микобактерий приводит к образованию потомства с мейотоподобным мозаицизмом по всему геному, что позволяет картировать локус идентичности спаривания» . ПЛОС Биология . 11 (7): e1001602. дои : 10.1371/journal.pbio.1001602 . ПМК   3706393 . ПМИД   23874149 .
  15. ^ Jump up to: а б Хоган, Майкл. «Что такое археи? — Энциклопедия жизни» . Энциклопедия жизни .
  16. ^ «Энциклопедия жизни» .
  17. ^ «Архея» . Мир микробов . Архивировано из оригинала 23 ноября 2015 года . Проверено 8 ноября 2015 г.
  18. ^ Чемберс, Сесилия Р.; Патрик, Уэйн М. (2015). «Архейные лигазы нуклеиновых кислот и их потенциал в биотехнологии» . Архея . 2015 : 170571. дои : 10.1155/2015/170571 . ПМК   4606414 . ПМИД   26494982 .
  19. ^ Розеншин И., Челет Р., Меварех М. (1989). «Механизм переноса ДНК в системе спаривания архебактерий». Наука . 245 (4924): 1387–9. Бибкод : 1989Sci...245.1387R . дои : 10.1126/science.2818746 . ПМИД   2818746 .
  20. ^ Фролс С., Айон М., Вагнер М., Тейхманн Д., Золгадр Б., Фолеа М., Букема Э.Дж., Дриссен А.Ю., Шлепер С., Альберс С.В. (2008). «Индуцируемая УФ-излучением клеточная агрегация гипертермофильных архей Sulfolobus solfataricus опосредована образованием пилей» (PDF) . Молекулярная микробиология . 70 (4): 938–52. дои : 10.1111/j.1365-2958.2008.06459.x . ПМИД   18990182 . S2CID   12797510 .
  21. ^ Фрёльс С., Уайт М.Ф., Шлепер С. (2009). «Реакция на повреждение УФ-излучением у модельного архея Sulfolobus solfataricus». Труды Биохимического общества . 37 (Часть 1): 36–41. дои : 10.1042/BST0370036 . ПМИД   19143598 .
  22. ^ Айон М., Фролс С., ван Вольферен М., Стокер К., Тайхманн Д., Дриссен А.Дж., Гроган Д.В., Альберс С.В., Шлепер С. (2011). «Обмен ДНК, индуцируемый УФ-излучением, у гипертермофильных архей, опосредованный пилями IV типа» (PDF) . Молекулярная микробиология . 82 (4): 807–17. дои : 10.1111/j.1365-2958.2011.07861.x . ПМИД   21999488 . S2CID   42880145 .
  23. ^ «Примеры архебактерий» . BiologyWise . 3 сентября 2010 г.
  24. ^ «Архейная генетика - Последние исследования и новости | Природа» . www.nature.com .
  25. ^ Jump up to: а б с «Архейная генетика | Безграничная микробиология» . Courses.lumenlearning.com .
  26. ^ «Морфология архей» . www.ucmp.berkeley.edu .
  27. ^ «Археи против бактерий – разница и сравнение | Отличия» .
  28. ^ «Грибная генетика» . Nature.com . Макмиллан Паблишерс Лимитед . Проверено 9 ноября 2015 г.
  29. ^ Бидл Г.В., Татум Э.Л. (1941). «Генетический контроль биохимических реакций нейроспоры» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 27 (11): 499–506. Бибкод : 1941ПНАС...27..499Б . дои : 10.1073/pnas.27.11.499 . ПМЦ   1078370 . ПМИД   16588492 .
  30. ^ Горовиц Н.Х., Берг П., Сингер М., Ледерберг Дж., Сусман М., Добли Дж., Кроу Дж.Ф. (2004). «Столетие: Джордж Бидл, 1903–1989» . Генетика . 166 (1): 1–10. дои : 10.1534/генетика.166.1.1 . ПМК   1470705 . ПМИД   15020400 .
  31. ^ Герсковиц I (1988). «Жизненный цикл почкующихся дрожжей Saccharomyces cerevisiae» . Микробиологические обзоры . 52 (4): 536–53. дои : 10.1128/MMBR.52.4.536-553.1988 . ПМЦ   373162 . ПМИД   3070323 .
  32. ^ Jump up to: а б Рудерфер Д.М., Пратт С.С., Зайдель Х.С., Кругляк Л. (2006). «Популяционно-геномный анализ ауткроссинга и рекомбинации у дрожжей». Природная генетика . 38 (9): 1077–81. дои : 10.1038/ng1859 . ПМИД   16892060 . S2CID   783720 .
  33. ^ Бердселл, Джон А.; Уиллс, Кристофер (2003). «Эволюционное происхождение и поддержание половой рекомбинации: обзор современных моделей». Эволюционная биология . стр. 27–138. дои : 10.1007/978-1-4757-5190-1_2 . ISBN  978-1-4419-3385-0 .
  34. ^ Jump up to: а б Джонсон А. (2003). «Биология спаривания Candida albicans». Обзоры природы Микробиология . 1 (2): 106–16. дои : 10.1038/nrmicro752 . ПМИД   15035040 . S2CID   1826178 .
  35. ^ Jump up to: а б Дайер П.С., О'Горман СМ (2012). «Половое развитие и загадочная сексуальность грибов: идеи видов Aspergillus» . Обзоры микробиологии FEMS . 36 (1): 165–92. дои : 10.1111/j.1574-6976.2011.00308.x . ПМИД   22091779 .
  36. ^ Паолетти М., Сеймур Ф.А., Алкосер М.Дж., Каур Н., Кальво А.М., Арчер Д.Б., Дайер П.С. (2007). «Тип спаривания и генетическая основа самоплодности модельного гриба Aspergillus nidulans» . Современная биология . 17 (16): 1384–9. дои : 10.1016/j.cub.2007.07.012 . ПМИД   17669651 . S2CID   17068935 .
  37. ^ Прескотт Д.М. (1994). «ДНК мерцательных простейших» . Микробиологические обзоры . 58 (2): 233–67. дои : 10.1128/MMBR.58.2.233-267.1994 . ПМК   372963 . ПМИД   8078435 .
  38. ^ Смит-Соннеборн Дж (1979). «Репарация ДНК и обеспечение долголетия Paramecium тетраурелия». Наука . 203 (4385): 1115–7. Бибкод : 1979Sci...203.1115S . дои : 10.1126/science.424739 . ПМИД   424739 .
  39. ^ Холмс Дж.Э., Холмс Н.Р. (1986). «Накопление повреждений ДНК при старении Paramecium Tetraurelia». Молекулярная и общая генетика . 204 (1): 108–14. дои : 10.1007/bf00330196 . ПМИД   3091993 . S2CID   11992591 .
  40. ^ Гилли Д., Блэкберн Э.Х. (1994). «Отсутствие укорочения теломер во время старения у Paramecium» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (5): 1955–8. Бибкод : 1994ПНАС...91.1955Г . дои : 10.1073/пнас.91.5.1955 . ПМЦ   43283 . ПМИД   8127914 .
  41. ^ Jump up to: а б Рауль, Дидье; Фортерре, Патрик (3 марта 2008 г.). «Переопределение вирусов: уроки Мимивируса». Обзоры природы Микробиология . 6 (4): 315–319. дои : 10.1038/nrmicro1858 . ПМИД   18311164 . S2CID   24447407 .
  42. ^ Сето, Дональд (30 ноября 2010 г.). «Вирусная геномика и биоинформатика» . Вирусы . 2 (12): 2587–2593. дои : 10.3390/v2122587 . ПМК   3185590 . ПМИД   21994632 .
  43. ^ Jump up to: а б Бернштейн С (1981). «Репарация дезоксирибонуклеиновой кислоты в бактериофаге» . Микробиологические обзоры . 45 (1): 72–98. дои : 10.1128/ММБР.45.1.72-98.1981 . ПМК   281499 . ПМИД   6261109 .
  44. ^ Чен Д., Бернштейн С. (1987). «Рекомбинационная репарация повреждений, вызванных перекисью водорода, в ДНК фага Т4». Мутационные исследования . 184 (2): 87–98. дои : 10.1016/0167-8817(87)90064-2 . ПМИД   3627145 .
  45. ^ Jump up to: а б Мишод Р.Э., Бернштейн Х., Недельку А.М. (май 2008 г.). «Адаптационное значение пола у микробных патогенов». Инфекция, генетика и эволюция . 8 (3): 267–85. дои : 10.1016/j.meegid.2008.01.002 . ПМИД   18295550 . http://www.hummingbirds.arizona.edu/Faculty/Michod/Downloads/IGE%20review%20sex.pdf
  46. ^ Jump up to: а б Теннант, Паула (12 марта 2018 г.). Вирусы: молекулярная биология, взаимодействие с хозяином и приложения к биотехнологии . Фермин, Густаво, Фостер, Джером Э. Сан-Диего, Калифорния. ISBN  9780128111949 . OCLC   1028979396 . {{cite book}}: CS1 maint: отсутствует местоположение издателя ( ссылка )
  47. ^ Куинн, Том (2008). Грипп: социальная история гриппа . Лондон: Новая Голландия. ISBN  9781845379414 . OCLC   232713128 .
  48. ^ Jump up to: а б Гринхау, Бет (6 января 2012 г.). «Там, где виды встречаются и смешиваются: эндемичные отношения между человеком и вирусом, воплощенное общение и нечто большее, чем человеческое влияние в отделении простуды 1946–90» . Культурная география . 19 (3): 281–301. дои : 10.1177/1474474011422029 . ISSN   1474-4740 .
  49. ^ Эйвери ОТ, Маклауд СМ, Маккарти М (1979). «Исследование химической природы вещества, индуцирующего трансформацию пневмококков типа. Индукция трансформации фракцией дезоксирибонуклеиновой кислоты, выделенной из пневмококка III типа» . Журнал экспериментальной медицины . 149 (2): 297–326. дои : 10.1084/jem.149.2.297 . ПМК   2184805 . ПМИД   33226 .
  50. ^ Херши А.Д., Чейз М. (1952). «Независимые функции вирусного белка и нуклеиновой кислоты в росте бактериофага» . Журнал общей физиологии . 36 (1): 39–56. дои : 10.1085/jgp.36.1.39 . ПМК   2147348 . ПМИД   12981234 .
  51. ^ Бензер С (1959). «К топологии тонкой генетической структуры» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 45 (11): 1607–20. Бибкод : 1959PNAS...45.1607B . дои : 10.1073/pnas.45.11.1607 . ПМК   222769 . ПМИД   16590553 .
  52. ^ Крик Ф.Х., Барнетт Л., Бреннер С., Уоттс-Тобин Р.Дж. (1961). «Общая природа генетического кода белков». Природа . 192 (4809): 1227–32. Бибкод : 1961Natur.192.1227C . дои : 10.1038/1921227a0 . ПМИД   13882203 . S2CID   4276146 .
  53. ^ Джейкоб Ф., Моно Дж. (1961). «Генетические регуляторные механизмы синтеза белков». Журнал молекулярной биологии . 3 (3): 318–56. дои : 10.1016/S0022-2836(61)80072-7 . ПМИД   13718526 . S2CID   19804795 .
  54. ^ «Микробная генетика» . Мир микробиологии и иммунологии . 2003 . Проверено 9 ноября 2015 г.
  55. ^ Бейнбридж, BW (1987). Генетика микробов (2-е изд.). Глазго: Блэки. ISBN  978-0-412-01281-5 .
  56. ^ Терпе, Кей (1 ноября 2013 г.). «Обзор термостабильных ДНК-полимераз для классических приложений ПЦР: от молекулярных и биохимических основ до коммерческих систем». Прикладная микробиология и биотехнология . 97 (24): 10243–10254. дои : 10.1007/s00253-013-5290-2 . ПМИД   24177730 . S2CID   13920919 .
  57. ^ Банат, ИМ; Маккар, РС; Камеотра, СС (15 мая 2000 г.). «Потенциальные коммерческие применения микробных поверхностно-активных веществ». Прикладная микробиология и биотехнология . 53 (5): 495–508. дои : 10.1007/s002530051648 . ISSN   0175-7598 . ПМИД   10855707 . S2CID   1706157 .
  58. ^ Хасан, Фариха; Шах, Аамер Али; Хамид, Абдул (26 июня 2006 г.). «Промышленное применение микробных липаз». Ферментные и микробные технологии . 39 (2): 235–251. doi : 10.1016/j.enzmictec.2005.10.016 . ISSN   0141-0229 .
  59. ^ Кондо, Акихико; Она, Джун; Хара, Киётака Ю.; Хасунума, Томохиса; Мацуда, Фумио (20 января 2013 г.). «Развитие фабрик микробных клеток для биопереработки посредством синтетической биоинженерии». Журнал биотехнологии . 163 (2): 204–216. doi : 10.1016/j.jbiotec.2012.05.021 . ISSN   0168-1656 . ПМИД   22728424 .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 54433e1b9ac01e432fde4030d74a5d89__1720285200
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/54/89/54433e1b9ac01e432fde4030d74a5d89.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Microbial genetics - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)