Рибосомный белок 40 -х годов S19

RPS19
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 5FLX, 3J7R, 4D61, 4D5L, 4UJD, 3J7P, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS19 , DBA, DBA1, S19, рибосомный белок S19, ES19, LOH19CR1
Внешние идентификаторы	Омим : 603474 ; MGI : 1333780 ; Гомологен : 37416 ; Genesis : RPS19 ; OMA : RPS19 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	41,872,925 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	24,889,806 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	skin of thigh; ; skin of hip; ; right uterine tube; ; granulocyte; ; human penis; ; gingival epithelium; ; embryo; ; vulva; ; nipple; ; skin of abdomen;
	Top expressed in
	blastocyst; ; ventricular zone; ; embryo; ; embryo; ; ganglionic eminence; ; uterus; ; morula; ; lip; ; bone marrow; ; neural tube;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	protein kinase binding; protein homodimerization activity; fibroblast growth factor binding; structural constituent of ribosome; protein binding; RNA binding;
Cellular component	extracellular exosome; ribosome; nucleolus; cytoplasm; nucleus; membrane; focal adhesion; intracellular anatomical structure; cytosolic small ribosomal subunit; cytosol; extracellular matrix; nucleoplasm; postsynaptic density; synapse;
Biological process	Notch signaling pathway; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; negative regulation of respiratory burst involved in inflammatory response; viral transcription; monocyte chemotaxis; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; ribosomal small subunit assembly; response to extracellular stimulus; positive regulation of respiratory burst involved in inflammatory response; nucleolus organization; protein tetramerization; maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); translational initiation; erythrocyte differentiation; maturation of SSU-rRNA; ribosomal small subunit biogenesis; protein biosynthesis; rRNA processing; antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6223
	20085
	ENSG00000105372
	Ensmusg00000040952
	P39019
	Q9CZX8
	NM_001022 ; NM_001321483 ; NM_001321484 ; NM_001321485
	NM_023133
	NP_001013 ; NP_001308412 ; NP_001308413 ; NP_001308414
showNP_075622 ; NP_001347044 ; NP_001347045 ; NP_001347047 ; NP_001347048 ;
	NP_001347054; NP_001347057
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Рибосомный белок 40S S19 - это белок , который у людей кодируется RPS19 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Рибосомы , органеллы , которые катализируют синтез белка , состоят из небольших субъединиц 40 -х годов и субъединицы больших 60 -х годов . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и приблизительно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомный белок , который является компонентом субъединицы 40 -х годов. Белок принадлежит к семейству рибосомных белков S19E. Он расположен в цитоплазме . Как типично для генов, кодирующих рибосомные белки, существует множественные обработанные псевдогены этого гена, диспергированные через геном. ^{[ 6 ]}

Клиническое значение

Мутации в этом гене вызывают анемию алмаза -блакфана (DBA), конституционную эритробластопению, характеризующуюся отсутствующими или сниженными предшественниками эритроида , у подмножества пациентов. Это предполагает возможную вне рибосомную функцию для этого гена в эритропоэтической дифференцировке и пролиферации , в дополнение к его рибосомной функции. более высокие уровни экспрессии этого гена в некоторых первичных карциномах толстой кишки по сравнению с соответствующими нормальными тканями толстой кишки. Наблюдались ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что рибосомный белок S19 взаимодействует с основным фактором роста фибробластов . ^{[ 7 ]} RPS19 также секретируется внеклеточно, и также известно, что его внеклеточные олигомеры (сшитые трансглутаминазы фактором коагуляции ) связываются и, вероятно, ингибируют ингибирующий фактор миграции макрофагов ; Хотя сами олигомеры S19 выполняют функцию MCIP как еще один очень сильный макрофаг хемоаттрактант и связываются с рецептором анафилотоксина С5 ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000105372 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000040952 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Е., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж Д.К. (август 1998). «Карта 75 человеческих рибосомных генов белка» . Геном Res . 8 (5): 509–23. doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Ген Entrez: RPS19 рибосомный белок S19» .
^ Soulet F, Al Saati T, Roga S, Amalric F, Bouche G (ноябрь 2001 г.). «Фактор роста фибробластов-2 взаимодействует со свободным рибосомным белком S19». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 289 (2): 591–6. doi : 10.1006/bbrc.2001.5960 . PMID 11716516 .
^ Молекулярная основа биологии клеток и развития: Ана-Мария Филип, Йорг Клуг, Севил Кайли, Суада Фрёлих, Тамара Хенке, Филипп Лахер, Регина Эйкхофф, Патрик Булау, Моника Линдер, Кристина Карлссон-Сквирут, Лин Ленг, Ричард Букала, Сандра, Сандра, Кристина Карлссон-Сквирут, Лин Ленг, Ричард Букала, Сандра, Кристина Карлссон-Сквирут, Лин Ленг, Ричард Букала, Сандра, Кристина Карлссон-Сквирут, Лин Ленг, Ричард Букала, Сандра, Кристина Карлссон-Сквир Крамер, Юрген Бернхаген и Андреас Мейнхардт. «Рибосомный белок S19 взаимодействует с ингибирующим фактором миграции макрофагов и ослабляет его провоспалительную функцию» « J. Biol. Химический 2009 284: 7977–7985. Впервые опубликовано 20 января 2009 г., DOI: 10.1074/jbc.m808620200

Дальнейшее чтение

Wool Ig, Chan YL, Glück A (1996). «Структура и эволюция рибосомных белков млекопитающих». Биохимия. Клеточная биол . 73 (11–12): 933–47. doi : 10.1139/O95-101 . PMID 8722009 .
Morimoto K, Lin S, Sakamoto K (2007). «Функции RPS19 и их связь с бриллиантовой анемией: обзор». Мол Генет. Метаб . 90 (4): 358–62. doi : 10.1016/j.ymgme.2006.11.004 . PMID 17178250 .
Ямамото Т. (2007). «Роли димера рибосомного белка S19 и рецептора C5A в патофизиологических функциях фагоцитарных лейкоцитов». Патоль Инт . 57 (1): 1–11. doi : 10.1111/j.1440-1827.2007.02049.x . PMID 17199736 . S2CID 22946804 .
Kondoh N, Schweinfest CW, Henderson KW, Papas TS (1992). «Дифференциальная экспрессия рибосомного белка S19, ламинин-связывающего белка и мессенджеров-ламинин-белка и лимфоцитов, связанных с прогрессированием карциномы толстой кишки и дифференцировкой». Рак . 52 (4): 791–6. PMID 1339304 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г., Мусулиамов А.К., Эгоров Т.А., Тиде Б., Виттманн-Либолд Б., Отто А. (1996). «Характеристика белков с малой рибосом-субъединицей человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования и масс-спектрометрии» . Евро. J. Biochem . 239 (1): 144–9. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . PMID 8706699 .
DraptChinskaia N, Gustvsson P, Andersson B, Pettersson M, Willig TN, Dianzani I, Ball S, Cchernia G, Klar J, Matsson H, Tentler D, Mohandas N, Carlsson B, Dahl N (1999). «Ген, кодирующий рибосомный белок S19, мутируется в алмазной черной анемии». НАТ Генет . 21 (2): 169–75. doi : 10.1038/5951 . PMID 9988267 . S2CID 26664929 .
Виллиг Т.Н., Драпчинская Н., Диеняни I, Болл С., Нимейер С., Раменги У, Орфали К., Густавссон П., Гарелли Е., Бруско А., Тиманн С., Приньян Дж.Л., Бушер С., Чильо Л, Дахл Н., Мохандас Н., Трхерния (2000). «Мутации в гене рибосомного белка S19 и алмазной черной анемии: широкие изменения в феноттипической экспрессии». Кровь . 94 (12): 4294–306. PMID 10590074 .
Matsson H, Klar J, Draptchinskaia N, Gustavsson P, Carlsson B, Bowers D, De Bont E, Dahl N (2000). «Усеивающий рибосомный белок мутации S19 и вариабельная клиническая экспрессия при бриллиантовой анемии». Гул Генет . 105 (5): 496–500. doi : 10.1007/s004390051136 . PMID 10598818 .
Tentler D, Gustavsson P, Elinder G, Eklöf O, Gordon L, Mandel A, Dahl N (2000). «Микроделеция в 19Q13.2, связанная с умственной отсталостью, пороками развития скелетов и алмазом-черно-черно-анемией, предполагает новый смежный генный синдром» . J. Med. Генет . 37 (2): 128–31. doi : 10.1136/jmg.37.2.128 . PMC 1734524 . PMID 10662814 .
Используя U, MF Campoli, Garelli E, Carand, Bruscus A, GP Bank, P, GC Izzi, GC Izzi, Brandalise S, Redly I (2001). «Diamond-Blackffan: Отчет о пота ипотеке в RPS19 и ипотеке Sheteroginity в мониторе населения Италии». Клетки крови мол. Вы говорите . 26 (5): 417–22. два : 10,1006/bcmd.2000 0324 . PMID 11112378 .
Nishimura T, Horino K, Nishiura H, Shibuya Y, Hiraoka T, Tanase S, Yamamoto T (2001). «Апоптотические клетки эпителиальной клеточной линии, ASPC-1, высвобождают моноциты хемотаксический димер рибосомного белка S19». J. Biochem . 129 (3): 445–54. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a002876 . PMID 11226885 .
Soulet F, Al Saati T, Roga S, Amalric F, Bouche G (2002). «Фактор роста фибробластов-2 взаимодействует со свободным рибосомным белком S19». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 289 (2): 591–6. doi : 10.1006/bbrc.2001.5960 . PMID 11716516 .
Shibuya Y, Shiokawa M, Nishiura H, Nishimura T, Nishino N, Okabe H, Takagi K, Yamamoto T (2001). «Идентификация рецептор-связывающих сайтов моноцитового хемотаксического димера рибосомного белка S19» . Являюсь. J. Pathol . 159 (6): 2293–301. doi : 10.1016/s0002-9440 (10) 63079-9 . PMC 1850605 . PMID 11733378 .
Li B, Sun M, He B, Yu J, Zhang YD, Zhang YL (2004). «Идентификация дифференциально экспрессируемых генов в лейомиомах матки человека с использованием дифференциального дисплея» . Ячейка . 12 (1): 39–45. doi : 10.1038/sj.cr.7290108 . PMID 11942409 .
Da Costa L, Tchernia G, Gascard P, Lo A, Meerpohl J, Niemeyer C, Chasis JA, Fixller J, Mohandas N (2004). «Нуклеолярная локализация белка RPS19 в нормальных клетках и неправильная локализация из-за мутаций в сигналах нуклеолярной локализации у 2 пациентов с алмазом-чернокожим анемией: потенциальное понимание патофизиологии» . Кровь . 101 (12): 5039–45. doi : 10.1182/blood-2002-12-3878 . PMID 12586610 .
Shresta A, Shiokawa M, Nishimura T, Nishiura H, Tanaka Y, Nishino N, Shibuya Y, Yamamoto T (2003). «Переключение фрагмента у агониста/антагониста двойного влияния димера рибосомного белка S19 на хемотаксический рецептор C5A лейкоцитов» . Являюсь. J. Pathol . 162 (4): 1381–8. doi : 10.1016/s0002-9440 (10) 63934-x . PMC 1851224 . PMID 12651630 .
Пруст А., Да Коста Л., Райн П., Ландоа А., Тамари Х, Зайзов Р., Черния Г., Делонай Дж. (2003). «Десять новых мутаций с бриллиантовой анемией и три полиморфизма с геном RPS19» Гематол. Дж 4 (2): 132–6 Doi : 10.1038/ sj.thj.6 PMID 12750732

Внешние ссылки

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000105372 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000040952 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9582194-5] Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Е., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж Д.К. (август 1998). «Карта 75 человеческих рибосомных генов белка» . Геном Res . 8 (5): 509–23. doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Ген Entrez: RPS19 рибосомный белок S19» .

[pmid11716516-7] Soulet F, Al Saati T, Roga S, Amalric F, Bouche G (ноябрь 2001 г.). «Фактор роста фибробластов-2 взаимодействует со свободным рибосомным белком S19». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 289 (2): 591–6. doi : 10.1006/bbrc.2001.5960 . PMID 11716516 .

[8] Молекулярная основа биологии клеток и развития: Ана-Мария Филип, Йорг Клуг, Севил Кайли, Суада Фрёлих, Тамара Хенке, Филипп Лахер, Регина Эйкхофф, Патрик Булау, Моника Линдер, Кристина Карлссон-Сквирут, Лин Ленг, Ричард Букала, Сандра, Сандра, Кристина Карлссон-Сквирут, Лин Ленг, Ричард Букала, Сандра, Кристина Карлссон-Сквирут, Лин Ленг, Ричард Букала, Сандра, Кристина Карлссон-Сквирут, Лин Ленг, Ричард Букала, Сандра, Кристина Карлссон-Сквир Крамер, Юрген Бернхаген и Андреас Мейнхардт. «Рибосомный белок S19 взаимодействует с ингибирующим фактором миграции макрофагов и ослабляет его провоспалительную функцию» « J. Biol. Химический 2009 284: 7977–7985. Впервые опубликовано 20 января 2009 г., DOI: 10.1074/jbc.m808620200

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]