Энтеробактерии

Энтеробактерии
	Enterobacter , типовой род отряда
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Псевдомонадота
Сорт:	Гаммапротеобактерии
Заказ:	Энтеробактерии ; Адеолу и др., 2016 г.
Семьи
	Будвичиевые ; Энтеробактерии ; Эрвиниевые ; Гафниевые ; Морганелловые ; Пектобактерии ; Иерсиниевые ; типы сидений Неопределенные Араникола ; Аверелла ; Гримонтелла ; Гухайинггелла ; Маргалефия ; Фитобактерия ; Плезиомонада ; Тиджея ; ;
Синонимы
	Энтеробактерии ;

Enterobacterales — отряд грамотрицательных , неспорообразующих, факультативно анаэробных палочковидных бактерий класса Gammaproteobacteria . ^{[ 1 ]} Типовой род этого отряда — Enterobacter . ^{[ 1 ]}

Название Enterobacterales происходит от латинского термина Enterobacter , обозначающего типовой род отряда, и суффикса «-ales», окончания, используемого для обозначения отряда. В совокупности Enterobacterales относятся к отряду, номенклатурным типом которого является род Enterobacter . ^{[ 1 ]}

Историческая идентификация и систематика

Enterobacterales были предложены в 2005 году под названием «Enterobacteriales». Однако название «Enterobacteriales» не было подтверждено правилами Международного кодекса номенклатуры прокариот , поэтому оно не имело статуса в номенклатуре, поэтому название было написано в скобках. «Enterobacteriales» представляли собой монотипический отряд , содержащий только семейство Enterobacteriaceae и разделявший типовой род Escherichia . ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Отряд содержал большую разнообразную группу видов, занимавших отдельные экологические ниши и обладающих разнообразными биохимическими характеристиками. ^{[ 5 ]} отряда оказывают значительное влияние на деятельность человека, например, патогенные виды Escherichia coli , Salmonella enterica и Многие роды Yersinia pestis , а также наносящие вред сельскому хозяйству фитопатогены, такие как представители родов Dickeya , Pectobacterium , Brenneria , Erwinia и Pantoea . Большое количество видов, а также диапазон различных биохимических характеристик чрезвычайно затрудняли описание отряда и его подгрупп. ^{[ 6 ]} Отнесение и классификация этого порядка в значительной степени были основаны на геномных последовательностях 16S рРНК, которые, как известно, обладают низкой дискриминационной способностью и дают разные результаты в зависимости от используемого алгоритма и штамма организма. ^{[ 7 ]} Кроме того, эти анализы показали, что Enterobacteriales демонстрируют полифилетическое ветвление с отдельными подгруппами.

В 2016 году «Enterobacteriales» было предложено переклассифицировать в Enterobacterales, а типовой род изменить на Enterobacter в соответствии с Международным кодексом номенклатуры прокариот. ^{[ 1 ]} Кроме того, было предложено несколько новых семейств внутри отряда Enterobacterales, состоящих из видов, которые ранее были членами семейства Enterobacteriaceae, на основе группировок, обнаруженных в филогенетических деревьях, построенных на основе консервативных геномов, последовательностей 16S рРНК и анализа последовательностей нескольких локусов, а также независимых молекулярные маркеры ( консервативные сигнатурные индексы ). ^{[ 1 ]}

По состоянию на 2021 год порядок Enterobacterales включает 7 официально опубликованных семейств ( Budviciaceae , Enterobacteriaceae , Erwiniaceae , Hafniaceae , Morganellaceae , Pectobacteriaceae и Yersiniaceae ). ^{[ 8 ]}

Молекулярные подписи

Анализ последовательностей генома видов Enterobacterales выявил пять консервативных сигнатурных инделей (CSI) для этого порядка в белках: пептиде ABC, транспортере пермеазе, факторе элонгации P-подобном белке YeiP, L-арабинозоизомеразе , пирофосфатазе и гипотетическом белке, который в большинстве случаев разделяются исключительно всеми или большинством членов этого ордена. ^{[ 1 ]} Эти CSI обеспечивают молекулярные средства отделения этого отряда от других гаммапротеобактерий и подтверждают монофилетическую природу отряда Enterobacterales.

Роды

Филогения энтеробактерий

Pasteurellales ( внешняя группа )

Энтеробактерии

	Эрвиниевые

	Энтеробактерии

Филогения Enterobacterales, предложенная в 2016 г. ^{[ 1 ]} Pasteurellales используется в качестве внешней группы.

Действительно опубликованные роды

Следующие роды были официально опубликованы, поэтому они имеют «Положение в номенклатуре». Год, когда был предложен род, указан в скобках после названия рода.

кандидатов Типы

Предложено, но не получило статуса в номенклатуре

Аквамонас (2009)
Араникола (1997)
Атлантибактер (2016)
Аверелла (2005)
Гримонтелла (2003)
Гухайинггелла (1995)
Маргалефия (2004)
Тиджея (2005)

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Адеолу, М; Альнаджар, С; Наушад, С; С. Гупта, Р. (декабрь 2016 г.). «Геномная филогения и таксономия Enterobacteriales: предложение Enterobacterales ord. nov., разделенное на семейства Enterobacteriaceae, Erwiniaceae семейства nov., Pectobacteriaceae семейства nov., Yersiniaceae семейства nov., Hafniaceae семейства nov., сем. Morganellaceae ноябрь и сем. Budviciaceae ноябрь» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 66 (12): 5575–5599. дои : 10.1099/ijsem.0.001485 . ПМИД 27620848 .
^ Сайт Zipcodezoo Enterobacteriales. Архивировано 27 апреля 2014 г. на Wayback Machine, доступ 9 марта 2013 г.
^ NCBI Enterobacterales, доступ 9 марта 2013 г.
^ Taxonomicon Enterobacteriales , доступ 9 марта 2013 г.
^ Бреннер, Дон Дж.; Криг, Ноэль Р.; Стейли, Джеймс Т.; Гаррити, Джордж М.; Бун, Дэвид Р.; Де Вос, Пол; Гудфеллоу, Майкл; Рейни, Фред А.; Шляйфер, Карл-Хайнц, ред. (2005). Руководство Берджи® по систематической бактериологии . дои : 10.1007/0-387-28022-7 . ISBN 978-0-387-24144-9 .
^ Октавия, Софи; Лан, Руитинг (2014), «Семейство Enterobacteriaceae» , Прокариоты , Берлин, Гейдельберг: Springer Berlin Heidelberg, стр. 225–286, doi : 10.1007/978-3-642-38922-1_167 , ISBN 978-3-642-38921-4 , получено 2 июня 2021 г.
^ Франсино, М. Пилар; Сантос, Скотт Р.; Охман, Ховард (2006), «Филогенетические отношения бактерий с особым упором на эндосимбионтов и кишечные виды» (PDF) , The Prokaryotes , Нью-Йорк, Нью-Йорк: Springer New York, стр. 41–59, doi : 10.1007/0-387 -30746-x_2 , ISBN 978-0-387-25496-8 , получено 2 июня 2021 г.
^ «Отряд: Энтеробактерии» . lpsn.dsmz.de. Проверено 02 июня 2021 г.

Эта об Enterobacterales статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[Adeolu20162-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Адеолу, М; Альнаджар, С; Наушад, С; С. Гупта, Р. (декабрь 2016 г.). «Геномная филогения и таксономия Enterobacteriales: предложение Enterobacterales ord. nov., разделенное на семейства Enterobacteriaceae, Erwiniaceae семейства nov., Pectobacteriaceae семейства nov., Yersiniaceae семейства nov., Hafniaceae семейства nov., сем. Morganellaceae ноябрь и сем. Budviciaceae ноябрь» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 66 (12): 5575–5599. дои : 10.1099/ijsem.0.001485 . ПМИД 27620848 .

[2] Сайт Zipcodezoo Enterobacteriales. Архивировано 27 апреля 2014 г. на Wayback Machine, доступ 9 марта 2013 г.

[:0-3] NCBI Enterobacterales, доступ 9 марта 2013 г.

[4] Taxonomicon Enterobacteriales , доступ 9 марта 2013 г.

[5] Бреннер, Дон Дж.; Криг, Ноэль Р.; Стейли, Джеймс Т.; Гаррити, Джордж М.; Бун, Дэвид Р.; Де Вос, Пол; Гудфеллоу, Майкл; Рейни, Фред А.; Шляйфер, Карл-Хайнц, ред. (2005). Руководство Берджи® по систематической бактериологии . дои : 10.1007/0-387-28022-7 . ISBN 978-0-387-24144-9 .

[6] Октавия, Софи; Лан, Руитинг (2014), «Семейство Enterobacteriaceae» , Прокариоты , Берлин, Гейдельберг: Springer Berlin Heidelberg, стр. 225–286, doi : 10.1007/978-3-642-38922-1_167 , ISBN 978-3-642-38921-4 , получено 2 июня 2021 г.

[7] Франсино, М. Пилар; Сантос, Скотт Р.; Охман, Ховард (2006), «Филогенетические отношения бактерий с особым упором на эндосимбионтов и кишечные виды» (PDF) , The Prokaryotes , Нью-Йорк, Нью-Йорк: Springer New York, стр. 41–59, doi : 10.1007/0-387 -30746-x_2 , ISBN 978-0-387-25496-8 , получено 2 июня 2021 г.

[8] «Отряд: Энтеробактерии» . lpsn.dsmz.de. Проверено 02 июня 2021 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]