N-концевой домен терпенсинтазы
| Терпен_синт | |||
|---|---|---|---|
 (+)-борнилдифосфатсинтаза: комплекс с мг и продуктом | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Терпен_синт | ||
| Пфам | PF01397 | ||
| ИнтерПро | ИПР001906 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 5eau / SCOPe / СУПФАМ | ||
| |||
В молекулярной биологии этот белковый домен принадлежит к семейству терпенсинтаз (TPS). Его роль заключается в синтезе терпенов , которые являются частью первичного метаболизма , таких как стерины и каротин , а также участник вторичного метаболизма. Эта статья будет посвящена N-концевому домену белка TPS.
Функция
[ редактировать ]Терпенсинтазы играют роль в производстве важных молекул в метаболизме. Эти молекулы являются частью большой группы, называемой терпеноидами . В частности, N-концевой домен имеет особенность активного центра копалилдифосфатсинтазы (CPS). [1]
Структура
[ редактировать ]N-концевой домен образует альфа-цилиндр, аналогичный таковому у сесквитерпенциклазы эпиаристолохенсинтазы. [2]
Сохранение
[ редактировать ]Последовательности, содержащие этот белковый домен, принадлежат к семейству терпенсинтаз . Было предложено обозначить это семейство генов tps (терпенсинтаза). Сравнение последовательностей выявляет сходство между монотерпеновыми (C 10 ) синтазами, сесквитерпеновыми (C 15 ) синтазами и дитерпеновыми (C 20 ) синтазами. Он был разделен на шесть подгрупп на основе филогении, названных Tpsa-Tpsf. [3]
- Tpsa включает ветиспиридиенсинтазу . [4]
- Tpsb включает (-)-лимоненсинтазу . [5]
- Tpsc включает копалилдифосфатсинтазу ( кауренсинтазу А ). [6]
- Tpsd включает таксадиенсинтазу , [7] пиненсинтаза , [8] и мирценсинтаза . [9]
- Tpse включает энт-кауренсинтазу B. [10]
- Tpsf включает S-линалоолсинтазу . [11] У гриба Phaeosphaeria sp. (штамм L487) синтезу энт-каурена из геранилгеранилдофосфата способствует единственный бифункциональный белок . [12]
См. также
[ редактировать ]Концевой домен терпенсинтазы C
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Чен Ф., Толл Д., Больманн Дж., Пичерский Э. (2011). «Семейство терпенсинтаз растений: среднее семейство генов специализированного метаболизма, широко распространенное по всему королевству» . Плант Дж . 66 (1): 212–29. дои : 10.1111/j.1365-313X.2011.04520.x . ПМИД 21443633 .
- ^ Уиттингтон Д.А., Уайз М.Л., Урбански М., Коутс Р.М., Крото Р.Б., Кристиансон Д.В. (2002). «Борнилдифосфатсинтаза: структура и стратегия манипулирования карбокатионами с помощью терпеноидциклазы» . Proc Natl Acad Sci США . 99 (24): 15375–80. Бибкод : 2002PNAS...9915375W . дои : 10.1073/pnas.232591099 . ПМЦ 137724 . ПМИД 12432096 .
- ^ Больманн Дж., Стил К.Л., Крото Р. (август 1997 г.). «Монотерпенсинтазы пихты большой (Abies grandis). Выделение кДНК, характеристика и функциональное выражение мирценсинтазы, (-)-(4S)-лимоненсинтазы и (-)-(1S,5S)-пиненсинтазы» . Ж. Биол. Хим . 272 (35): 21784–92. дои : 10.1074/jbc.272.35.21784 . ПМИД 9268308 .
- ^ [1] , 5-эпиаристолохенсинтаза, [2] и (+)-дельта-кадиненсинтаза SWISSPROT
- ^ Хаятт, округ Колумбия; Юн, Б.; Чжао, Ю.; Сантамма, Б.; Коутс, Р.М.; Крото, РБ; Канг, К. (2007). «Предшественник 4S-лимоненсинтазы - Mentha spicata (Мята колосистая)» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (13). Uniprot.org: 5360–5. дои : 10.1073/pnas.0700915104 . ПМЦ 1838495 . ПМИД 17372193 . Проверено 2 августа 2012 г.
- ^ Айт-Али, Т.; Суэйн, С.М.; Рид, Дж. Б.; Сан, Т.; Камия, Ю. (1997). «Энт-копалилдифосфатсинтаза, предшественник хлоропласта - Pisum sativum (Горох садовый)» . Журнал растений: для клеточной и молекулярной биологии . 11 (3). Uniprot.org: 443–54. дои : 10.1046/j.1365-313X.1997.11030443.x . ПМИД 9107034 . Проверено 2 августа 2012 г.
- ^ Вильдунг, MR; Крото, Р. (1996). «Таксадиенсинтаза — Taxus brevifolia (Тис тихоокеанский)» . Журнал биологической химии . 271 (16). Uniprot.org: 9201–4. дои : 10.1074/jbc.271.16.9201 . ПМИД 8621577 . S2CID 3191132 . Проверено 2 августа 2012 г.
- ^ «Пиненсинтаза, предшественник хлоропласта - Abies grandis (Пихта большая)» . Uniprot.org . Проверено 2 августа 2012 г.
- ^ «Мирценсинтаза, предшественник хлоропласта - Abies grandis (Пихта большая)» . Uniprot.org . Проверено 2 августа 2012 г.
- ^ Ямагучи, С.; Сайто, Т.; Абэ, Х.; Ямане, Х.; Мурофуши, Н.; Камия, Ю. (1996). «Энт-каур-16-енсинтаза, предшественник хлоропласта — Cucurbita maxima (Тыква)» . Журнал растений: для клеточной и молекулярной биологии . 10 (2). Uniprot.org: 203–13. дои : 10.1046/j.1365-313X.1996.10020203.x . ПМИД 8771778 . Проверено 2 августа 2012 г.
- ^ «Линалоолсинтаза — Clarkia concinna (Красные ленты)» . Uniprot.org . Проверено 2 августа 2012 г.
- ^ Кавайде Х., Имаи Р., Сасса Т., Камия Ю. (август 1997 г.). «Энт-кауренсинтаза из гриба Phaeosphaeria sp. L487. Выделение кДНК, характеристика и бактериальная экспрессия бифункциональной дитерпенциклазы в биосинтезе грибкового гиббереллина» . Ж. Биол. Хим . 272 (35): 21706–12. дои : 10.1074/jbc.272.35.21706 . ПМИД 9268298 .