Jump to content

Рибосомный белок в

(Перенаправлен из RPSA )
Rpsa
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы RPSA , 37LRP, 67LR, ICAS, LAMBR, LAMR1, LBP, LBP/P40, LRP, LRP/LR, NEM/1CHD4, SA, LAMR, P40, рибосомальный белок SA
Внешние идентификаторы Омим : 150370 ; MGI : 105381 ; Гомологен : 68249 ; GeneCards : RPSA ; OMA : rpsa - ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Набор
Uniprot
Refseq (мРНК)

NM_002295
NM_001304288

NM_011029

Refseq (белок)

NP_001291217
NP_002286

NP_035159

Расположение (UCSC) CHR 3: 39,41 - 39,41 МБ Chr 9: 119,96 - 119,96 МБ
PubMed Search [ 3 ] [ 4 ]
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Рибосомный белок 40S SA является рибосомным белком , который у людей кодируется RPSA геном . [ 5 ] [ 6 ] Он также действует как рецептор клеточной поверхности , в частности для ламинина , и участвует в нескольких патогенных процессах.

Ламинины , семейство внеклеточного матрикса гликопротеинов , являются основной неколлагеновой компонентом базальных мембран . Они были вовлечены в широкий спектр биологических процессов, включая клеточную адгезию , дифференцировку , миграцию , передачу сигналов , рост нейритов и метастазирование . Многие эффекты ламинина опосредованы взаимодействием с рецепторами клеточной поверхности . Эти рецепторы включают членов семейства интегринов , а также неинтегриновые ламинин-связывающие белки. Ген RPSA кодирует многофункциональный белок, который представляет собой как рибосомальный белок, так и рецептор ламинина с высоким аффином. Этот белок по -разному называют рибосомным белком SA; Rpsa; Ламр; LAMR1; 37 кДа предшественник рецептора ламинина; 37LRP; 67 кДа рецептор ламинина; 67lr; 37/67 кДа рецептор ламинина; LRP/LR; LBP/P40; и P40, связанный с рибосомой, белок. Рибосомный белок SA и RPSA являются утвержденным именем и символом. Аминокислотная , что последовательность RPSA высоко сохраняется благодаря эволюции предполагает ключ биологическая функция . Было отмечено, что уровень транскрипта RPSA выше в толстой кишки рака тканях и клеточных линиях рака легких, чем их нормальные аналоги. Кроме того, существует корреляция между активацией этого полипептида в раковых клетках и их инвазивным и метастатическим фенотипом . Существуют несколько копий гена RPSA; Тем не менее, большинство из них являются псевдогенами, которые, как считается, возникли из ретропозиционных событий. два альтернативных варианта сплайсированных транскриптов, кодирующих один и тот же белок. Для этого гена были обнаружены [ 7 ]

Структура и стабильность

[ редактировать ]

Комплементарная ДНК (кДНК) гена RPSA образуется с помощью сборки семи экзонов, шесть из которых соответствуют кодирующей последовательности. [ 6 ] Аминокислотная последовательность RPSA, выведенная из последовательности его кДНК, включает 295 остатков. RPSA может быть подразделен в двух основных доменах: N-домен (остатки 1–209), который соответствует экзонами 2-5 гена и C-домен (остатки 210–295), что соответствует экзонами 6 –7. N-домен RPSA является гомологичен рибосомным белкам S2 (RPS2) прокариот. Он содержит палиндромическую последовательность 173LMWWML178, которая сохраняется во всех метазоанах. Его C-домен высоко консервативен у позвоночных. Аминокислотная последовательность RPSA имеет 98% идентична во всех млекопитающих. RPSA - это рибосомный белок, который приобрел функцию рецептора ламинина во время эволюции. [ 8 ] [ 9 ] Структура N-домены RPSA аналогична структуре прокариотического RPS2. [ 10 ] С-домен по своей природе неупорядочен в растворе. N-домен является мономерным по раствору и разворачивается в соответствии с тремя государственными равновесием. Складное промежуточное соединение преобладает при 37 ° C. [ 11 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Несколько взаимодействий RPSA, которые первоначально были обнаружены методами клеточной биологии, впоследствии были подтверждены с использованием рекомбинантных производных и экспериментов in vitro. Последние показали, что сложенная N-домен и неупорядоченная C-домен RPSA выполняет как общие, так и специфические функции. [ 12 ]

  • RPSA связывается с белками, которые участвуют в трансляции генетического кода. (i) дрожжи двухгибридных экранов показали, что RPSA связывается с рибосомным белком S21 из малой рибосомальной субъединицы 40S. [ 13 ] [ 14 ] (ii) Серийные делеции RPSA показали, что сегмент остатков 236–262, включенный в C-домен, участвует в взаимодействии между RPSA и субъединицей 40S рибосомы. [ 15 ] (iii) исследования, которые были основаны на ядерной магнитно-резонансной спектроскопии (ЯМР), показали, что антикодон-связывающий домен лизил-тРНК-синтетазы связывается непосредственно с С-доменом RPSA. [ 16 ]
  • RPSA был первоначально идентифицирован как ламинин -связывающий белок. [ 17 ] [ 18 ] Как рекомбинантный N-домен, так и C-домен RPSA связывают ламинин in vitro, и они связываются с одинаковыми константами диссоциации (300 нм). [ 10 ] [ 12 ]
  • Как RPSA, так и ламинин принадлежат к гепарину/гепаран -сульфату. [ 19 ] Гепарин связывается in vitro с N-доменом RPSA, но не с его C-доменом. Более того, C-домен RPSA и гепарина конкурирует за связывание с ламинином, что показывает, что высоко кислый C-домен RPSA имитирует гепарин (и потенциально гепаран-сульфаты) для связывания с ламинином. [ 12 ]
  • RPSA является потенциальным клеточным рецептором для нескольких патогенных флавивирусов , включая вирус денге (DENV), [ 20 ] [ 21 ] и альфавирусы , в том числе вирус Синдбиса (SINV). [ 22 ] N-домен RPSA включает в себя сайт связывания для SINV in vitro. [ 10 ] N-домен также включает в себя слабые сайты связывания для рекомбинантного домена 3 (ED3, остатки 296–400) из белков оболочки двух флавивирусов , вируса Западного Нила и серотипа 2 DENV. C-домен включает в себя слабые сайты связывания для домена 3 вируса желтой лихорадки (YFV) и серотипов 1 и 2 DENV. Напротив, домен 3 от японского вируса энцефалита, по -видимому, не связывает RPSA in vitro. [ 12 ]
  • RPSA также является рецептором для небольших молекул. (i) RPSA связывает афлатоксин B1 как in vivo, так и in vitro. [ 23 ] (ii) RPSA является рецептором эпигаллокатехина-галлата (EGCG), который является основным компонентом зеленого чая и имеет много эффектов, связанных со здоровьем. [ 24 ] [ 25 ] EGCG связывается только с N-доменом RPSA in vitro, с константой диссоциации 100 нм, но не с его C-доменом. [ 12 ]
  1. ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000168028 - ENSEMBL , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000032518 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  4. ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  5. ^ Сато К, Наруми К., Сакай Т., Абэ Т., Кикучи Т., Мацусима К., Синдо С., Мотомия М (июль 1992). «Клонирование 67-кДа кДНК рецептора ламинина и экспрессии генов в нормальных и злокачественных клеточных линиях легкого человека». Рак Летт . 62 (3): 199–203. doi : 10.1016/0304-3835 (92) 90096-e . PMID   1534510 .
  6. ^ Jump up to: а беременный Джекерс П., Минолетти Ф., Белотти Д., Клаусс Н., Соцци Г., Собель М.Е., Кастроново В. (сентябрь 1996). «Выделение от многогенного семейства активного человека гена человека многофункционального белка, ассоциированного с метастазированием, 37LRP/P40 при хромосоме 3P21,3». Онкоген . 13 (3): 495–503. PMID   8760291 .
  7. ^ Digiacomo, Винсент; Меруэло, Даниэль (май 2016 г.). «Взгляд на рецептор ламинина: критическое обсуждение относительно неинтегрина 37/67-километрового рецептора ламинина/RPSA» . Биологические обзоры . 91 (2): 288–310. doi : 10.1111/brv.12170 . PMC   5249262 . PMID   25630983 .
  8. ^ Ardini E, Pesole G, Tagliable E, Magnifico A, Castronovo V, Sobel ME, Colnanghi Mi, Ménard S (август 1998). «Рецептор ламинина 67 кДа, возникший в результате рибосмального белка, который приобрел двойную функцию во время эволюции » Молекулярная биология и эволюция 15 (8): 1017–2 Doi : 10.1093/ oxfordjournals.molbev.a0 PMID   9718729
  9. ^ Нельсон Дж., Макферран Н.В., Пивато Г., Чемберс Э., Доэрти С., Стил Д., Тимсон DJ (февраль 2008 г.). «Рецептор ламинина 67 кДа: структура, функция и роль в болезнях». Отчеты о биологии . 28 (1): 33–48. doi : 10.1042/bsr20070004 . PMID   18269348 .
  10. ^ Jump up to: а беременный в Jamieson KV, Wu J, Hubbard Sr, Meruelo D (февраль 2008 г.). «Кристаллическая структура предшественника рецептора ламинина человека» . Журнал биологической химии . 283 (6): 3002–5. doi : 10.1074/jbc.c700206200 . PMID   18063583 .
  11. ^ Ould-abeih, mb; Petit-Topin, я; Зидан, n; Барон, б; Бедуэль, Хугес (июнь 2012 г.). «Множественные складные состояния и расстройство рибосомного белка SA, мембранный рецептор для ламинина, антиканциногенов и патогенов». Биохимия . 51 (24): 4807–4821. doi : 10.1021/bi300335r . PMID   22640394 .
  12. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и Зидан, n; Ould-abeih, mb; Petit-Topin, я; Bedouelle, H (2012). «Складываемые и неупорядоченные домены рибосомного белка человека SA выполняют как уникальные, так и общие функции в качестве мембранных рецепторов» . Biosci. Репутация 33 (1): 113–124. doi : 10.1042/bsr20120103 . PMC   4098866 . PMID   23137297 .
  13. ^ Sturl U, Worm U, Lalowski M, Hammeck FH, Goicer C, T, Shortz Flash A, Goldöz A, Goadös I Deep и Calbides Sa Corites Se B, Brice B, Wo, Brighter H, Wakermer One (сентябрь в 2005 году) Полем «Человеческий белок-белок взаимодействует сеть NetAcition: ресурс для аннотирования Protemome». Клетка . 122 (6): 957-968. Doi : 10.1016 / j.cell.2005.08.029 . HDL : 11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID   16169070 . S2CID   8235923 .
  14. ^ Сато М, Саеки Y, Танака К., Канеда Y (март 1999 г.). «Связанный с рибосомой белок LBP/P40 связывается с белком S21 рибосомы 40S: анализ с использованием двухгибридной системы дрожжей». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 256 (2): 385–390. doi : 10.1006/bbrc.1999.0343 . PMID   10079194 .
  15. ^ Малигин, Аа; Бабайлова, ES; Локтев, В.Б.; Карпова, GG (2011). «Область в С-концевом домене рибосомного белка SA, необходимая для связывания SA с рибосомной субъединицей человека 40-х». Биохими . 93 (3): 612–617. doi : 10.1016/j.biochi.2010.12.005 . PMID   21167900 .
  16. ^ Чо, Hy; Уль Муштак, а; Ли, JY; Ким, DG; SEOK, MS; Джанг, м; Хан, BW; Ким, с; Чон, YH (2014). «Характеристика взаимодействия между лизил-тРНК-синтетазой и рецептором ламинина с помощью ЯМР». Фебс Летт . 588 (17): 2851–2858. doi : 10.1016/j.febslet.2014.06.048 . PMID   24983501 . S2CID   36128866 .
  17. ^ Рао, Северная Каролина; Barsky, Sh; Терранова, вице -президент; Liotta, LA (1983). «Выделение рецептора ламинина опухолевой клетки». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 111 (3): 804–808. doi : 10.1016/0006-291x (83) 91370-0 . PMID   6301485 .
  18. ^ Лесо, ч; Kühl, u; Марк, К (1983). «Выделение ламинин-связывающего белка из мышечных клеточных мембран» . Embo j . 2 (6): 861–865. doi : 10.1002/j.1460-2075.1983.tb01514.x . PMC   555201 . PMID   16453457 .
  19. ^ Ори, а; Уилкинсон, MC; Ферниг, Д.Г. (2011). «Системный биологический подход для исследования интерактивного взаимодействия гепарина/гепаран сульфата» . Дж. Биол. Химический 286 (22): 19892–19904. doi : 10.1074/jbc.m111.228114 . PMC   3103365 . PMID   21454685 .
  20. ^ Thepparit, c; Смит, доктор (2004). «Серотип-специфический проникновение вируса денге в клетки печени: идентификация 37-килодальтона/67-килодальтона рецептора ламинина с высоким аффинностью в качестве рецептора 1-денгера серотипа 1 серотипа 1» . J. Virol . 78 (22): 12647–12656. doi : 10.1128/JVI.78.22.12647-12656.2004 . PMC   525075 . PMID   15507651 .
  21. ^ Tio, ph; Чон, WW; Cardosa, MJ (2005). «Двухмерная Vopba выявляет взаимодействие рецептора ламинина (LAMR1) с серотипами вируса денге 1, 2 и 3» . Вирол Дж . 2 : 25. doi : 10.1186/1743-422x-2-25 . PMC   1079963 . PMID   15790424 .
  22. ^ Ван, KS; Кун, RJ; Штраус, например; OU, S; Штраус, JH (1992). «Рецептор ламинина с высокой аффинностью является рецептором вируса Sindbis в клетках млекопитающих» . J. Virol . 66 (8): 4992–5001. doi : 10.1128/jvi.66.8.4992-5001.1992 . PMC   241351 . PMID   1385835 .
  23. ^ Чжуан, Z; Хуан, у; Ян, у; Wang, S (2016). «Идентификация белков-взаимодействующих AFB1 и взаимодействия между RPSA и AFB1». Дж. Хазард. Матер 301 : 297–303. doi : 10.1016/j.jhazmat.2015.08.053 . PMID   26372695 .
  24. ^ Тачибана, ч; Кога, К; Fujimura, y; Ямада, К. (2004). «Рецептор для зеленого чая полифенола EGCG». НАТ Структура Мол Биол . 11 (4): 380–381. doi : 10.1038/nsmb743 . PMID   15024383 . S2CID   27868813 .
  25. ^ Tachibana, H (2011). "Зеленое чайное полифенол зондирование" . Прокурор JPN. Академический Сервис B Phys. Биол. Наука 87 (3): 66–80. Bibcode : 2011pjab ... 87 ... 66t . doi : 10.2183/pjab.87.66 . PMC   3066547 . PMID   21422740 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 9db1b9a1399fac4c601c452f12f863b5__1702265280
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/9d/b5/9db1b9a1399fac4c601c452f12f863b5.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Ribosomal protein SA - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)