Рибосомный белок 60 -х годов L10

RPL10
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB showСписок кодов идентификаторов PDB 2PA2, 5AJ0, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPL10 , Autsx5, DXS648, DXS648E, L10, NOV, QM, рибосомный белок L10, MRXS35
Внешние идентификаторы	Омим : 312173 ; MGI : 105943 ; Гомологен : 130545 ; GeneCards : RPL10 ; OMA : RPL10 - ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. X chromosome (human) Band Xq28 Start 154,389,955 bp End 154,409,168 bp
showМестоположение гена ( мышь ) Chr. X chromosome (mouse) Band X A7.3|X 37.94 cM Start 73,314,418 bp End 73,316,741 bp
showРНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in left ovary ganglionic eminence right ovary canal of the cervix body of uterus ventricular zone right uterine tube granulocyte left uterine tube ectocervix Top expressed in epiblast lens embryo embryo esophagus ileum ganglionic eminence ventricular zone jejunum quadriceps femoris muscle More reference expression data BioGPS n/a
showДжин Онтология Molecular function protein binding RNA binding structural constituent of ribosome translation regulator activity Cellular component cytosol ribosome membrane intracellular anatomical structure endoplasmic reticulum cytosolic large ribosomal subunit nucleus smooth endoplasmic reticulum protein-containing complex Biological process viral transcription SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane ribosomal large subunit assembly translational initiation nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay protein biosynthesis rRNA processing negative regulation of transcription by RNA polymerase II negative regulation of apoptotic process regulation of translation embryonic brain development multicellular organism development Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 6134 110954 Ensembl ENSG00000147403 ENSMUSG00000008682 UniProt P27635 Q6ZWV3 RefSeq (mRNA) showNM_006013 NM_001256577 NM_001256580 NM_001303624 NM_001303625 NM_001303626 NM_052835 RefSeq (protein) showNP_001243506 NP_001243509 NP_001290553 NP_001290554 NP_001290555 NP_006004 NP_443067 Location (UCSC) Chr X: 154.39 – 154.41 Mb Chr X: 73.31 – 73.32 Mb PubMed search
Wikidata
View/Edit Human View/Edit Mouse

Рибосомный белок 60S L10 - это белок , который у людей кодируется RPL10 геном .

Функция

Рибосомы , органеллы , которые катализируют синтез белка , состоят из небольших субъединиц 40 -х годов и субъединицы больших 60 -х годов . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и приблизительно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомный белок , который является компонентом субъединицы 60 -х годов. Белок принадлежит к семейству рибосомных белков L10E. Он расположен в цитоплазме . In vitro, исследования показали, что куриный белок может связываться с C-Jun и может подавлять C-Jun-опосредованную активацию транскрипции, но эти активности не были продемонстрированы in vivo. Этот ген был первоначально идентифицирован как кандидат в опухоли Вильмса ген -супрессор , но более поздние исследования определили, что этот ген не участвует в подавлении опухоли Вильмса. Этот ген назывался « гомологом рецептора ламинина », потому что химерный транскрипт, состоящий из последовательности из этого гена и последовательности из гена рецептора ламинина; Однако не считается, что этот ген кодирует рецептор ламинина. Варианты транскрипта с использованием альтернативы polyA signals exist. The variant with the longest 3' UTR overlaps the deoxyribonuclease I-like 1 gene on the opposite strand. This gene is co-transcribed with the small nucleolar RNA gene U70, which is located in its fifth intron. As is typical for genes encoding ribosomal proteins, there are multiple processed pseudogenes of this gene dispersed through the genome.

Interactions

RPL10 has been shown to interact with YES1.

Further reading

• Wool IG, Chan YL, Glück A (1996). "Structure and evolution of mammalian ribosomal proteins". Biochem. Cell Biol. 73 (11–12): 933–47. doi:10.1139/o95-101. PMID 8722009.
• van den Ouweland AM, Kioschis P, Verdijk M, Tamanini F, Toniolo D, Poustka A, van Oost BA (1993). "Identification and characterization of a new gene in the human Xq28 region". Hum. Mol. Genet. 1 (4): 269–73. doi:10.1093/hmg/1.4.269. PMID 1303197.
• van den Ouweland AM, Verdijk M, Mannens MM, van Oost BA (1992). "The QM gene is X-linked and therefore not involved in suppression of tumorigenesis in Wilms' tumor". Hum. Genet. 90 (1–2): 144–6. doi:10.1007/bf00210759. PMID 1330878. S2CID 30349506.
• Kaneko K, Kobayashi H, Onodera O, Miyatake T, Tsuji S (1993). "Genomic organization of a cDNA (QM) demonstrating an altered mRNA level in nontumorigenic Wilms' microcell hybrid cells and its localization to Xq28". Hum. Mol. Genet. 1 (7): 529–33. doi:10.1093/hmg/1.7.529. PMID 1339145.
• Bignon C, Roux-Dosseto M, Zeigler ME, Wicha MS, Martin PM (1992). "cDNA cloning and genomic analysis of a new multigene family sharing common phylogenetic and expression profiles with the laminin receptor gene". Biochem. Biophys. Res. Commun. 184 (3): 1165–72. doi:10.1016/S0006-291X(05)80005-1. PMID 1534224.
• Dowdy SF, Lai KM, Weissman BE, Matsui Y, Hogan BL, Stanbridge EJ (1991). "The isolation and characterization of a novel cDNA demonstrating an altered mRNA level in nontumorigenic Wilms' microcell hybrid cells". Nucleic Acids Res. 19 (20): 5763–9. doi:10.1093/nar/19.20.5763. PMC 328988. PMID 1658743.
• Kato S, Sekine S, Oh SW, Kim NS, Umezawa Y, Abe N, Yokoyama-Kobayashi M, Aoki T (1995). "Construction of a human full-length cDNA bank". Gene. 150 (2): 243–50. doi:10.1016/0378-1119(94)90433-2. PMID 7821789.
• Matoba R, Okubo K, Hori N, Fukushima A, Matsubara K (1994). «Добавление 5'-кодирующей информации в 3'-направленную библиотеку кДНК улучшает анализ экспрессии генов». Ген . 146 (2): 199–207. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90293-3 . PMID   8076819 .
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID   8125298 .
• Фермер А.А., Джонсен Джи, Лофтус Т.М., Смит К.П., Стэнбридж Э.Дж. (1996). «Выделение и характеристика промотора QM» . Нуклеиновые кислоты Res . 24 (11): 2158–65. doi : 10.1093/nar/24.11.2158 . PMC   145915 . PMID   8668549 .
• Чен Эй, Золло М., Маззарелла Р., Чиккодикола А., Чен С.Н., Зуо Л, Хейнер С., Буро Ф., Репетто М., Шлессингер Д., Д'Урсо М. (1997). «Анализ дальних последовательностей в XQ28: тринадцать известных и шесть кандидатов в 219,4 КБ ДНК высокой GC между RCP/GCP и локусами G6PD» . Гул Мол Генет . 5 (5): 659–68. doi : 10.1093/hmg/5.5.659 . PMID   8733135 .
• Chan YL, Diaz JJ, Denoroy L, Madjar JJ, Wool IG (1996). «Основная структура рибосомного белка крысы L10: связь с Jun-связывающим белком и предполагаемого опухолевого супрессора Вильмса». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение ​ 225 (3): 952–6. doi : 10.1006/bbrc.1996.1277 . PMID   8780716 .
• Инада Х., Мукай Дж, Мацусима С., Танака Т. (1997). «QM-это новый цинк-связывающий регуляторный белок транскрипции: его связывание с C-Jun регулируется ионами цинка и фосфорилированием протеинкиназой C». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение ​ 230 (2): 331–4. doi : 10.1006/bbrc.1996.5955 . PMID   9016777 .
• Лофтус Т.М., Нгуен Й.Х., Стэнбридж Э.Дж. (1997). «Белок QM ассоциируется с рибосомами в грубой эндоплазматической ретикулуме». Биохимия . 36 (27): 8224–30. doi : 10.1021/bi970288d . PMID   9204867 .
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID   9373149 .
• Нгуен YH, Mills AA, Stanbridge EJ (1998). «Сборка белка QM на рибосомную субъединицу 60S происходит в цитоплазме». J. Cell. Биохимия . 68 (2): 281–5. doi : 10.1002/(SICI) 1097-4644 (19980201) 68: 2 <281 :: AID-JCB14> 3.0.CO; 2-I . PMID   9443083 . S2CID   45083826 .
• Хартли Дж. Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием специфической для сайта рекомбинации in vitro» . Геном Res . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC   310948 . PMID   11076863 .
• Симпсон JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных крупномасштабным секвенированием кДНК» . Embo Rep . 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC   1083732 . PMID   11256614 .