Экзонуклеаза III
| Экзонуклеаза III | |||
|---|---|---|---|
 | |||
| Идентификаторы | |||
| Организм | |||
| Символ | xthA | ||
| Альт. символы | ЭкзоIII | ||
| Входить | 946254 | ||
| RefSeq (защита) | НП_416263 | ||
| ЮниПрот | P09030 | ||
| Другие данные | |||
| Номер ЕС | 3.1.11.2 | ||
| хромосома | геном: 1,83 - 1,83 Мб | ||
| |||
Экзонуклеаза III (ExoIII) представляет собой фермент , принадлежащий к семейству экзонуклеаз . ExoIII катализирует поэтапное удаление мононуклеотидов с 3'-гидроксильного конца двухцепочечной ДНК . [ 1 ] Ограниченное количество нуклеотидов удаляется во время каждого события связывания, что приводит к скоординированным прогрессивным делециям в популяции молекул ДНК . [ 2 ]
Функция
[ редактировать ]Предпочтительными субстратами являются тупые или утопленные 3'-концы, хотя ExoIII также действует на разрывы в дуплексной ДНК, создавая одноцепочечные разрывы. Фермент неактивен в отношении одноцепочечной ДНК, поэтому выступающие 3'-концы устойчивы к расщеплению. Степень сопротивления зависит от длины расширения: расширения на 4 основания и более по существу устойчивы к расщеплению. Это свойство используется для создания однонаправленных делеций из линейной молекулы с одним устойчивым (3'-выступающим) и одним чувствительным (тупым или 5'-выступающим) концом. [ 3 ]
Активность ExoIII частично зависит от спиральной структуры ДНК. [ 4 ] и отображает зависимость от последовательности (C>A=T>G). [ 5 ]
Сообщалось также, что ExoIII обладает активностью РНКазы H, 3'-фосфатазы и AP-эндонуклеазы. [ 1 ]
Текущие исследования
[ редактировать ]Существует много различных экзонуклеаз, и многие из них еще предстоит открыть у бактерий; текущие исследования проводятся на E. coli . Многие экзонуклеазы попадают в суперсемейства с разными областями жизни, что доказывает, что экзонуклеаза III является древней. Экзонуклеазы возникли на ранних этапах истории жизни и играют жизненно важную биологическую роль. [ 6 ]
Регулирование
[ редактировать ]Температура , соли концентрация и соотношение фермента и ДНК сильно влияют на активность фермента, требуя, чтобы условия реакции были адаптированы к конкретным применениям.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с PDB : 1ако ; Мол К.Д., Куо К.Ф., Тайер М.М., Каннингем Р.П., Тайнер Дж.А. (март 1995 г.). «Структура и функция многофункционального фермента репарации ДНК экзонуклеазы III». Природа . 374 (6520): 381–6. Бибкод : 1995Natur.374..381M . дои : 10.1038/374381a0 . ПМИД 7885481 . S2CID 4335526 .
- ^ Jump up to: а б Изображение получено в MacPyMOL©2006 DeLano Scientific
- ^ Роджерс С.Г., Вайс Б. (1980). «Экзонуклеаза III Escherichia coli K-12, эндонуклеаза AP» . Нуклеиновые кислоты Часть I. Методы энзимологии. Том. 65. С. 201–11 . дои : 10.1016/S0076-6879(80)65028-9 . ISBN 978-0-12-181965-1 . ПМИД 6246343 .
- ^ Маниатис Т., Сэмбрук Дж., Фрич Э.Ф. (1989). Молекулярное клонирование: лабораторное пособие (2-е изд.). Колд-Спринг-Харбор, Нью-Йорк: Лаборатория Колд-Спринг-Харбор. стр. 5.84–5 . ISBN 978-0-87969-309-1 .
- ^ Хеникофф С. (июнь 1984 г.). «Однонаправленное расщепление экзонуклеазой III создает целевые точки разрыва для секвенирования ДНК». Джин . 28 (3): 351–9. дои : 10.1016/0378-1119(84)90153-7 . ПМИД 6235151 .
- ^ Ловетт С.Т. (декабрь 2011 г.). «ДНК-экзонуклеазы Escherichia coli» . ЭкоСал Плюс . 4 (2). дои : 10.1128/ecosalplus.4.4.7 . ПМЦ 4238392 . ПМИД 26442508 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Ричардсон CC, Lehman IR, Корнберг А (январь 1964 г.). «Экзонуклеаза-фосфатаза дезоксирибонуклеиновой кислоты из Escherichia coli . II. Характеристика активности экзонуклеазы» (PDF) . Журнал биологической химии . 239 (1): 251–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)51775-0 . ПМИД 14114851 .
- Линксвайлер В., Хёрц В. (август 1982 г.). «Специфичность последовательности экзонуклеазы III из E. coli» . Исследования нуклеиновых кислот . 10 (16): 4845–59. дои : 10.1093/нар/10.16.4845 . ПМК 320823 . ПМИД 6752885 .
