Метилмалонил -эпимераза
| Метилмалонил -эпимераза | |||
|---|---|---|---|
 Ленточная диаграмма метилмалонил-КоА-эпимеразы из Propionibacterium shermanii . Из PDB : 1JC5 . | |||
| Идентификаторы | |||
| ЕС №. | 5.1.99.1 | ||
| Базы данных | |||
| Intenz | Intenz View | ||
| Бренда | Бренда вход | ||
| Расширение | Вид Nicezyme | ||
| Кегг | Кегг вход | ||
| Метатический | Метаболический путь | ||
| Напрямую | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBE PDBSUM | ||
| Джин Онтология | Друг / Quickgo | ||
| |||
| Метилмалонил -эпимераза | |||
|---|---|---|---|
 Mitochondrial), человеческий гомодимер эпимеразы (митохондриальный), человек. | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | MCEE | ||
| Ген NCBI | 84693 | ||
| HGNC | 16732 | ||
| Омим | 608419 | ||
| Refseq | NM_028626 | ||
| Uniprot | Q96PE7 | ||
| Другие данные | |||
| ЕС номер | 5.1.99.1 | ||
| Локус | Chr | ||
| |||
эпимераза ( EC 5.1.99.1 , ракема-метилмалонил-CoA , метилмалонил-кофермент A , DL-метилмалонил-коа-ракемаза , 2-метил-3-оксопропаноил-коа 2-ээпимераза [неверно ) . ] Метилмалонил-коа - это кодируется человеком "MCEE" Ген расположен на хромосоме 2 . Он обычно и неправильно обозначается как «метилмалонил-КоА-ракемаза». Это не ракемаз COA , потому что в соавой части есть 5 других стереоцентров .
Структура
[ редактировать ]«MCEE» Ген расположен в области 2P13 и содержит 4 экзона и кодирует для белка , который составляет приблизительно 18 кДа размера и расположено к митохондриальной матрице . [ 1 ] Существует несколько природных вариантов в аминокислотных последовательностях. Структура белка MCEE была разрешена с помощью рентгеновской кристаллографии [ 2 ] при разрешении 1,8-Ангстром.
Функция
[ редактировать ]Ген MCEE кодирует фермент, который взаимодействует D- и L-метилмалонил-COA во время разложения аминокислот с разветвленной цепью , нечетных жирных кислот длины цепи и других метаболитов. С точки зрения биохимии он катализирует реакцию, которая превращает ( ы )- метилмалонил-КоА в ( r ) форму. [ 3 ] [ 4 ] Этот фермент катализирует следующую химическую реакцию
- ( S ) -метилмалонил-COA ( R ) -метилмалонил-Коа
Метилмалонил-эпимераза играет важную роль в катаболизме жирных кислот с углеродными цепями нечетной длины. В катаболизме ровных насыщенных жирных кислот путь β-окисления разбивает жировые молекулы ацил-КоА в повторных последовательностях четырех реакций, чтобы получить один ацетил-коа на повторную последовательность. Это означает, что для каждого раунда β-окисления жирное ацил-ко-а-а сокращается двумя углеродами. Если жирная кислота началась с равномерного количества углеродов, этот процесс может разбить целую насыщенную жирную кислоту на ацетил-КоА. Однако, если жирная кислота началась со нечетного количества углеродов, β-окисление сломает жирную ацил-КоА до тех пор, пока не три углеродного пропионил-КоА будут образованы . Чтобы преобразовать это в метаболически полезный сукцинил-КоА , необходимы три реакции. Пропионил-КоА первой карбоксилируется до ( S ) -метилмалонил-CoA ферментом пропионил-коа-карбоксилазой . Метитилмалонил-эпимераза затем катализирует перегруппировку ( S ) -метилмалонил-КоА в ((S)-метилмалонил-CoA в ( R ) Форма в реакции, которая использует витамина B12 кофактор и резонансное стабилизированное Carbanion промежуточное соединение . [ Цитация необходима ] ( R ) -метилмалонил-КоА затем превращается в сукцинил-КоА в реакции, катализируемой метилмалонил-КоА-мутазой .
Выступая в качестве общего основания , фермент абстрагирует протон из β-углерода ( r ) -метилмалонил-КоА. Это приводит к образованию промежуточного звена карбаниона, в котором α-углерод стабилизируется резонансом. Затем фермент действует как общая кислота для протонирования β-углерода, что приводит к образованию ( S )-метилмалонил-CoA.
Клиническое значение
[ редактировать ]Мутации в гене MCEE вызывает дефицит метималонил-КоА-эпимеразы (MEDECT), [ 5 ] Редкая аутосомно-рецессивная врожденная ошибка метаболизма в метаболизме аминокислот, включающих аминокислоты с разветвленной цепью валин , , лейцин и изолейцин . Пациенты с MEDED могут иметь опасное для жизни метаболическое ацидоз новорожденных , гипераммонемия , трудности с кормлением и кому .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «MCEE - Метилмалонил -КоА -эпимераза, митохондриальный предшественник - Homo Sapiens (Human) - MCEE Gene & Protein» . www.uniprot.org .
- ^ . банк данных белка Европа , www.ebi.ac.uk.
- ^ Mazumder R, Sasakawa T, Kaziro Y, Ochoa S (октябрь 1962). «Метаболизм пропионовой кислоты в тканях животных. IX. Метилмалонил -коэнзимент acemase» . Журнал биологической химии . 237 (10): 3065–8. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 50121-6 . PMID 13934211 .
- ^ Overath P, Kellerman GM, Lynen F, Fritz HP, Keller HJ (1962). «[О механизме перестройки метилмалонил-Co A в сукцинил-Co A. ii. Эксперименты по механизму действия метилмалонил-Co a a a-изомеразы и метилмалонил-Co a-acmase]». Biochemische Zeitschrift . 335 : 500–18. PMID 14482843 .
- ^ Биккер Х., Баккер Х.Д., Абелинг Н.Г., Опрос-Б.Т., Клейджер В.Дж., Розенблатт Д.С., Уотерхэм Х.Р., Вондерс Р.Дж., Дюран М. (июль 2006 г.). «Гомозиготная бессмысленная мутация в гене метилмалонил-КоА-эпимеразы (MCEE) приводит к легкой метилмалоновой ацидурии» . Человеческая мутация . 27 (7): 640–3. doi : 10.1002/Humu.20373 . PMID 16752391 . S2CID 5821956 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Метилмалонил-CoA+эпимераза в Национальной медицинской библиотеке Медицинской библиотеки США (Mesh)
