Список секвенированных бактериальных геномов

Этот список секвенированных эубактериальных геномов содержит большинство эубактерий , которые, как известно, имеют общедоступные полные последовательности генома . Большинство этих последовательностей были помещены в Международную базу данных нуклеотидных последовательностей , общедоступную базу данных, в которой можно осуществлять поиск. ^{[ 1 ]} в сети . Некоторые из перечисленных геномов могут находиться не в базе данных INSDC , а в других общедоступных базах данных. ^{[ нужна проверка ]}.

Геномы, отмеченные как «Неопубликованные», находятся в базе данных, но не в рецензируемой научной литературе.

Геномы архей см. в списке секвенированных геномов архей .

Абдитибактериота

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка	Идентификатор генбанка
Абдитибактерия utsteinense	ЛМГ 29911	Абдитибактериота	3,606,330	3,240	2018 ^{[ 2 ]}	НЗ_НИГФ00000000.1

Актиномицетота

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка	Идентификатор генбанка
Коринебактерия дифтерии	C7 (бета)	актинобактериды	2,499,189		Неопубликовано	CP003210
Коринебактерия дифтерии	PW8	актинобактериды	2,530,683		Неопубликовано	CP003216
Бифидобактерия длинная	НКЦ2705	Актинобактерии	2,256,640	1,727	2002 ^{[ 3 ]}
Коринебактерия дифтерии	NCTC13129	Актинобактерии	2,488,635	2,320	2003 ^{[ 4 ]}
Коринебактерии эффективные	YS314	Актинобактерии	3,147,090	2,942	2003 ^{[ 5 ]}
Коринебактерия глютамикум	АТСС13032	Актинобактерии	3,309,401	3,099	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Коринебактерия jeikeium	К411	Актинобактерии	2,462,499	2,104	2005 ^{[ 6 ]}
Франкия виды	CcI3	Актинобактерии	5,433,628	4,499	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Микобактерия авиам	к10	Актинобактерии	4,829,781	4,350	2005 ^{[ 7 ]}
Микобактерия bovis	AF212297	Актинобактерии	4,345,492	3,953	2003 ^{[ 8 ]}
Микобактерия лепры	ТН	Актинобактерии	3,268,203	2,720	2001 ^{[ 9 ]}
Микобактерия туберкулеза	CDC1551	Актинобактерии	4,403,837	4,189	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Микобактерия туберкулеза	H37Rv	Актинобактерии	4,411,532	3,999	1998 ^{[ 10 ]}
Нокардия фарциника	IFM10152	Актинобактерии	6,021,225	5,683	2004 ^{[ 11 ]}
Стрептомицеты авермитилис	МА4680	Актинобактерии	9,025,608	7,577	2001 ^{[ 12 ]}
Streptomyces coelicolor	А3	Актинобактерии	8,667,507	7,825	1996 ^{[ 13 ]}
Симбиобактерия термофилум	Напряжение	Актинобактерии	3,566,135	3,337	2004 ^{[ 14 ]}
Термобифида фуска	YX	Актинобактерии	3,642,249	3,110	Неопубликовано ^{[ 1 ]}

Аквификота

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка	Идентификатор генбанка
Аквифекс эоликус	ВФ5	Водный	1,551,335	1,522	1998 ^{[ 15 ]}	Хромосома NC_000918 Плазмида ece1 NC_001880

Арматимонадота

Бактероидота / хлоробиот группа

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка	Идентификатор генбанка
Бактероид ломкий	NCTC9343	Бактероидота	5,205,140	4,260	2005 ^{[ 16 ]}	Хромосома CR626927 Плазмида pBF9343 CR626928
Бактероид ломкий	YCH46	Бактероидота	5,277,274	4,578	2004 ^{[ 17 ]}	Хромосома AP006841 Плазмида pBFY46 AP006842
Бактероиды тетайотаомикрон	ВПИ-5482	Бактероидота	6,260,361	4,778	2003 ^{[ 18 ]}	Хромосома AE015928 Плазмида p5482 AY171301
Кандида Амебофилус азиатская	5а2	Бактероидота	1,884,364		2010 ^{[ 19 ]}	CP001102
Хлоробакулум парвум	НЦИБ 8327	Хлоробиота	2,289,249		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	CP001099
Хлоробий хлорхроматий	КаД3	Хлоробиота	2,572,079	2,002	Объединенный институт генома Министерства энергетики США	CP000108
Хлоробий феррооксиданс	ДСМ 13031	Хлоробиота			Объединенный институт генома Министерства энергетики США	ААСЭ00000000
Хлоробий лимикола	ДСМ 245	Хлоробиота	2,763,181		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	NC_010803
Хлоробий феобактериоидный	БС1	Хлоробиота	2,736,403		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	NC_010831
Хлоробий феобактериоидный	ДСМ 266	Хлоробиота	3,133,902		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	NC_008639
Хлоробий феовибриоидес	ДСМ 265	Хлоробиота	1,966,858		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	NC_009337
Хлоробий тепидум	ТЛС	Хлоробиота	2,154,946	2,255	2002 ^{[ 20 ]}	AE006470
Хлорогерпетон таласий	АТСС 35110	Хлоробиота	3,293,456		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	CP001100
Цитофага хутчинсонии	АТСС 33406	Хлоробиота	4,433,218		2007 ^{[ 21 ]}	CP000383
Халискоменобактер гидроссис	ДСМ 1100	Бактероидота	8,371,686		2011 ^{[ 22 ]}	Хромосома CP002691 Плазмида pHALHY01 CP002692 Плазмида pHALHY02 CP002693 Плазмида pHALHY03 CP002694
игнавибактерий Альбом	ДЦМ 16511	Игнавибактериота	3,658,997		Копенгагенский университет	CP003418
Пелодикцион лютеолум ( Chlorobium luteolum )	ДСМ 273	Хлоробиота	2,364,842	2,083	Объединенный институт генома Министерства энергетики США	CP000096
Пелодиктион феоклатратиформный	БУ-1	Хлоробиота	3,018,238		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	CP001110
Порфиромонада десневая	АТСС 33277	Бактероидота	2,354,886		2008 ^{[ 23 ]}	NC_010729
Порфиромонада десневая	W83	Бактероидота	2,343,476	1,909	2003 ^{[ 24 ]}	NC_002950
Простекохлорис эстуарии	ДСМ 271	Хлоробиота	2,512,923		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	Хромосома CP001108 Плазмида pPAES01 CP001109
Салинибактер рубер	ДСМ 13855	Бактероидота	3,551,823	2,801	^{[ 25 ]}	NC_007677
Салинибактер рубер	М8	Бактероидота	3,619,447		^{[ 26 ]}	Хромосома FP565814 Плазмида pSR11 FP565810 Плазмида pSR56 FP565811 Плазмида pSR61 FP565812 Плазмида pSR84 NC_014157
Сапроспира Грандис	ул. Левин	Бактероидота	4,345,237		Гавайский университет в Маноа	Хромосома CP002831 Плазмида CP002832

Кальдисерикота

хламидиот / веррукомикробиоты Группа

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Аккермансия муцинифила	АТСС БАА-835	Веррукомикробиота	2,664,102	2,176	^{[ 27 ]}
Аккермансия муцинифила	Урмит	Веррукомикробиота	2,664,714	2,192	^{[ 28 ]}
Хламидия мюридарум	Ниг	Хламидиота	1,072,950	904	^{[ 29 ]}
Хламидия трахоматис	АХАР13	Хламидиота	1,044,459	911	^{[ 30 ]}
Хламидия трахоматис	БОГ	Хламидиота	1,042,519	894	^{[ 31 ]}
Хламидофила абортус	С26-3	Хламидиота	1,144,377	961	^{[ 32 ]}
Хламидофила икра	ГПИК	Хламидиота	1,173,390	998	^{[ 33 ]}
Хламидофила кошачья	FeC56	Хламидиота	1,166,239	1,005	^{[ 34 ]}
Хламидофила пневмонии	AR39	Хламидиота	1,229,853	1,110	^{[ 29 ]}
Хламидофила пневмонии	CWL029	Хламидиота	1,230,230	1,052	^{[ 35 ]}
Хламидофила пневмонии	J138	Хламидиота	1,226,565	1,069	^{[ 36 ]}
Хламидофила пневмонии	ТВ183	Хламидиота	1,225,935	1,113	АЛЬТАНА Фарма
парахламии Диавиды	УМЭ25	Хламидиота	2,414,465	2,031	^{[ 37 ]}

Хлорофлексота

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Дехалококкоидес маккарти	195	Дегалококкоидеты	1,469,720	1,580	^{[ 38 ]}
Дехалококкоидес маккарти	CBDB1	Дегалококкоидеты	1,395,502	1,458	^{[ 39 ]}
Дехалококкоидес маккарти	DCMB5	Дегалококкоидеты	1,431,902	1,526	^{[ 40 ]}
Дехалококкоидес маккарти	БТФ08	Дегалококкоидеты	1,452,335	1,580	^{[ 40 ]}

Хризиогенота

Цианобактерии

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Анабаена носток	PCC7120	Ностокалес	6,413,771	5,368	^{[ 41 ]}
Анабаена переменная	АТСС29413	Ностокалес	6,365,727	5,039	Объединенный институт генома Министерства энергетики США
Цианобактерия бактерия	ЙеллоустоунА	Хроококки	2,932,766	2,760	^{[ 42 ]}
Цианобактерия бактерия	ЙеллоустоунБ	Хроококки	3,046,682	2,862	^{[ 42 ]}
Глоеобактер фиолетовый	PCC7421	Глеобактерии	4,659,019	4,430	^{[ 43 ]}
Прохлорококк морской	МЕД4	Prochlorales	1,657,990	1,716	^{[ 44 ]}
Прохлорококк морской	МИТ9312	Prochlorales	1,709,204	1,809	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Прохлорококк морской	МИТ9313	Prochlorales	2,410,873	2,273	^{[ 44 ]}
Прохлорококк морской	НАТЛ2А	Prochlorales	1,842,899	1,890	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Прохлорококк морской	СС120	Prochlorales	1,751,080	1,882	^{[ 45 ]}
Синехококк удлиненный	PCC6301	Хроококки	2,696,255	2,525	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Синехококк удлиненный	PCC7942	Хроококки	2,695,903	2,611	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
синехококков Виды	WH8102	Хроококки	2,434,428	2,526	^{[ 46 ]}
синехококков Виды	СС9605	Хроококки	2,510,659	2,638	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
синехококков Виды	СС9902	Хроококки	2,234,828	2,304	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
синехоцистиса Виды	PCC6803	Хроококки	3,573,470	3,167	^{[ 47 ]}
Термосинехококк удлиненный	бп1	Хроококки	2,593,857	2,475	Неопубликовано ^{[ 1 ]}

Деферрибактериота

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Геовибрио сп.		Деферрибактериота	2,971,658	2,415	Объединенный институт генома Министерства энергетики США
Муциспириллум Шедлери	АСФ457	Деферрибактериота	2,319,180	2,144	Броуд Институт
Денитровибрио ацетифилус	ДСМ 12809	Деферрибактериота	3,222,077	3,068	^{[ 48 ]}
Кальдитерривибрио нитроредуценс	ДСМ 19672	Деферрибактериота	2,157,835	2,117	^{[ 49 ]}
Деферрибактерии десульфуриканы	ССМ1	Деферрибактериота	2,234,389	2,184	^{[ 50 ]}
Резинки носят вместе	ДСМ 4947	Деферрибактериота	2,526,590	2,397	^{[ 51 ]}

Дейнококкота

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка	Идентификатор генбанка
Дейнококк пустынный	ВКД115	Деинококки	2,819,842		^{[ 52 ]}	Хромосома NC_012526 Плазмида 1 NC_012528 Плазмида 2 NC_012529 Плазмида 3 NC_012528
Дейнококк геотермалис	ДСМ 11300	Деинококки	2,467,205	2,335	Объединенный институт генома Министерства энергетики США	Хромосома CP000359 Плазмида pDGEO01 CP000358 Плазмида pDGEO02 CP000856
Дейнококк гобиенсис	Я-0	Деинококки	3,137,147		^{[ 53 ]}	Хромосома CP002191 Плазмида P1 CP002192 Плазмида P2 CP002193 Плазмида P3 CP002194 Плазмида P4 CP002195 Плазмида P5 CP002196 Плазмида P6 CP002197
Дейнококк марикопензис	ДСМ 21211	Деинококки	3,498,530		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	CP002454
Дейнококк протеолитический	ППМ	Деинококки	2,147,060		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	Хромосома CP002536 Плазмида pDEIPR01 CP002537 Плазмида pDEIPR02 CP002538 Плазмида pDEIPR03 CP002539 Плазмида pDEIPR04 CP002540
Дейнококк радиодуранс	Р1	Деинококки	Хромосома 1: 2 648 638 Хромосома 2: 412 348	Хромосома 1: 2579 Хромосома 2: 357	^{[ 54 ]}	Хромосома 1 NC_001263 Хромосома 2 NC_001264 Плазмида CP1 NC_000959 Плазмида MP1 NC_000958
Маринитермус гидротермалис	ДСМ 14884	Термальный	2,269,167		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	CP002630
Мейотермус рубер	ДСМ 1279	Термальный	3,097,457		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	CP001743
Мейотермус силванус	ДСМ 9946	Термальный	3,249,394		^{[ 55 ]}	Хромосома CP002042 Плазмида pMESIL01 CP002043 Плазмида pMESIL02 CP002044
Океанитермус глубокий	ДСМ 14977	Термальный	2,303,940		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	Хромосома CP002361 Плазмида pOCCEPR01
Термус скотодуктус	СА-01	Термальный	2,346,803		^{[ 56 ]}	Хромосома CP001962 Плазмида pTSC8 CP001963
термусов Виды	CCB_US3_UF1	Термальный	2,243,772		Университет науки Малайзии	Хромосома CP003126 Плазмида pTCCB09 CP003127
Термус термофилус	HB27	Термальный	1,894,877	1,982	^{[ 57 ]}	Хромосома AE017221 Плазмида pTT27 AE017222
Термус термофилус	HB8	Термальный	1,849,742	1,973	Нарский институт науки и технологий	Хромосома NC_006461 Плазмида pTT27 NC_006462 Плазмида pTT8 NC_006463
Термус термофилус	JL-18	Термальный	1,902,595		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	Хромосома CP003252 Плазмида pTTJL1801 CP003253 Плазмида pTTJL1802 CP003254
Термус термофилус	SG0.5JP17-16	Термальный	1,863,201		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	Хромосома CP002777 Плазмида pTHTHE1601 CP002778
Трупера радиовиктрикс	ДСМ 17093	Деинококки	3,260,398		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	CP002049

Диктиогломота

Элюзимикробиота

фибробактерий / ацидобактериот Группа

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Ацидобактерия бактерия	Эллен345	Ацидобактериота	5,650,368	4,777	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Лейфсония ксили	CTCB07	Ацидобактериота	2,584,158	2,030	^{[ 58 ]}
Пропионибактерии угрей	КПА171202	Ацидобактериота	2,560,265	2,297	^{[ 59 ]}
Рубробактер ксиланофильный	ДСМ9941	Ацидобактериота	3,225,748	3,140	Объединенный институт генома Министерства энергетики США
Троферима уиппелия	ТВ08/27	Ацидобактериота	925,938	784	^{[ 60 ]}
Троферима уиппелия	Крутить	Ацидобактериота	927,303	808	^{[ 61 ]}

Бациллота

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Бацилла сибирской язвы	Эймс	Бациллы	5,227,293	5,311	^{[ 62 ]}
Бацилла сибирской язвы	Звезды	Бациллы	5,228,663	5,287	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Бацилла цереус	АТСС10987	Бациллы	5,224,283	5,603	^{[ 63 ]}
Бацилла цереус	АТСС14579	Бациллы	5,411,809	5,234	^{[ 64 ]}
Бацилла цереус	ЗК	Бациллы	5,300,915	5,134	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Бацилла Клаузии	КСМК16	Бациллы	4,303,871	4,108	^{[ 65 ]}
Бацилла галодуранс	С125	Бациллы	4,202,352	4,066	^{[ 66 ]}
Бацилла лихениформис	АТСС14580	Бациллы	4,222,334	4,152	^{[ 67 ]}
Бацилла лихениформис	Не указано	Бациллы	4,222,645	4,196	^{[ 68 ]}
Бацилла лихениформис	ДСМ13	Бациллы	4,222,645	4,196	^{[ 68 ]}
Бацилла субтилис	168	Бациллы	4,214,630	4,106	^{[ 69 ]}
Бацилла Тюрингская	9727	Бациллы	5,237,682	5,117	^{[ 70 ]}
Карбоксидотермус гидрогеноформанс	Z2901	Клостридии	2,401,520	2,620	^{[ 71 ]}
Клостридия ацетобутиликум	АТСС824	Клостридии	3,940,880	3,672	^{[ 72 ]}
Клостридия трудная	КЦД-32г58	Клостридии	3,840,681		Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Клостридия перфрингенс	13	Клостридии	3,031,430	2,660	^{[ 73 ]}
Клостридия столбняка	Е88	Клостридии	2,799,251	2,373	^{[ 74 ]}
Десульфитобактерия hafniense	Y51	Клостридии	5,727,534	5,060	^{[ 75 ]}
Энтерококк фекалис	В583	Бациллы	3,218,031	3,113	^{[ 76 ]}
Геобацилла каустофилус	ХТА426	Бациллы	3,544,776	3,498	^{[ 77 ]}
Лактобактерии ацетотолеранс	НКФР	Бациллы
Лактобактерии ацидофильные	НКФР	Бациллы	1,993,564	1,864	^{[ 78 ]}
Лактобактерии дельбрюки	болгарский	Бациллы	1,864,998	2,096	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Лактобактерии Джонсона	НКЦ533	Бациллы	1,992,676	1,821	^{[ 79 ]}
Лактобактерии растения	ВКФС1	Бациллы	3,308,274	3,051	^{[ 79 ]}
Лактобактерии, ты сказал	23 тыс.	Бациллы	1,884,661	1,885	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Лактобактерии, ты сказал	сакэ23K	Бациллы	1,884,661	1,885	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Лактобактерии слюны	UCC118	Бациллы	1,827,111	1,717	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Лактококк лактис	IL1403	Бациллы	2,365,589	2,266	^{[ 80 ]}
Безобидная листерия	Клип11262	Бациллы	3,011,208	2,981	^{[ 81 ]}
Листерия моноцитогенная	ЭГДС	Бациллы	2,944,528	2,855	^{[ 81 ]}
Листерия моноцитогенная	4б	Бациллы	2,905,187	2,821	^{[ 82 ]}
Мурелла термоацетическая	АТСС39073	Клостридии	2,628,784	2,465	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Океанобацилла iheyensis	HTE831	Бациллы	3,630,528	3,496	^{[ 83 ]}
Золотистый стафилококк	КОЛЛЕКЦИЯ	Бациллы	2,809,422	2,673	^{[ 84 ]}
Золотистый стафилококк	MRSA252	Бациллы	2,902,619	2,744	^{[ 85 ]}
Золотистый стафилококк	MSSA476	Бациллы	2,799,802	2,619	^{[ 85 ]}
Золотистый стафилококк	In50	Бациллы	2,878,529	2,699	^{[ 86 ]}
Золотистый стафилококк	МВ2	Бациллы	2,820,462	2,632	^{[ 87 ]}
Золотистый стафилококк	N315	Бациллы	2,814,816	2,593	^{[ 86 ]}
Золотистый стафилококк	NCTC8325	Бациллы	2,821,361	2,892	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Золотистый стафилококк	РФ122	Бациллы	2,742,531	2,589	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Золотистый стафилококк	США300	Бациллы	2,872,769	2,560	^{[ 88 ]}
Стафилококк эпидермидис	АТСС12228	Бациллы	2,499,279	2,419	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Стафилококк эпидермидис	РП62А	Бациллы	2,616,530	2,494	^{[ 84 ]}
Стафилококк гемолитический	JCSC1435	Бациллы	2,685,015	2,678	^{[ 89 ]}
Стафилококк сапрофитный	сапрофитный	Бациллы	2,516,575	2,446	^{[ 90 ]}
Стрептококк агалактиае	А909	Бациллы	2,127,839	1,996	^{[ 91 ]}
Стрептококк агалактиае	НЕМ316	Бациллы	2,211,485	2,134	^{[ 92 ]}
Стрептококк агалактиае	2603 V/R	Бациллы	2,160,267	2,124	^{[ 93 ]}
Стрептококк мутанс	UAB159	Бациллы	2,030,921	1,960	^{[ 94 ]}
Стрептококк пневмонии	Р6	Бациллы	2,038,615	2,043	^{[ 95 ]}
Стрептококк пневмонии	ТИГР4	Бациллы	2,160,842	2,125	^{[ 96 ]}
Стрептококк пиогенный	M5 Манфредо	Бациллы	1,841,271		Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Стрептококк пиогенный	МГАС10270	Бациллы	1,928,252	1,987	^{[ 97 ]}
Стрептококк пиогенный	МГАС10394	Бациллы	1,899,877	1,886	^{[ 98 ]}
Стрептококк пиогенный	МГАС10750	Бациллы	1,937,111	1,979	^{[ 97 ]}
Стрептококк пиогенный	МГАС2096	Бациллы	1,860,355	1,898	^{[ 97 ]}
Стрептококк пиогенный	МГАС315	Бациллы	1,900,521	1,865	^{[ 99 ]}
Стрептококк пиогенный	МГАС5005	Бациллы	1,838,554	1,865	^{[ 100 ]}
Стрептококк пиогенный	МГАС6180	Бациллы	1,897,573	1,894	^{[ 101 ]}
Стрептококк пиогенный	МГАС8232	Бациллы	1,895,017	1,845	^{[ 102 ]}
Стрептококк пиогенный	МГАС9429	Бациллы	1,836,467	1,877	^{[ 97 ]}
Стрептококк пиогенный	SF370	Бациллы	1,852,441	1,696	^{[ 103 ]}
Стрептококк пиогенный	ССИ1	Бациллы	1,894,275	1,861	^{[ 104 ]}
Стрептококк термофильный	CNRZ1066	Бациллы	1,796,226	1,915	^{[ 105 ]}
Стрептококк термофильный	ЛМГ18311	Бациллы	1,796,846	1,889	^{[ 105 ]}
Термоанаэробактер тенгконгенсис	МБ4Т	Клостридии	2,689,445	2,588	Неопубликовано ^{[ 1 ]}

Фузобактериота

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка	Идентификатор генбанка
Фузобактерия нуклеатум	АТСС25586	Фузобактерии	2,174,500	2,067	^{[ 106 ]}
Фузобактерии сп.	11_3_2	Фузобактерии			Неопубликовано	АКУО00000000
Фузобактерии сп.	21_1А	Фузобактерии			Неопубликовано	ADEE00000000

Одаренный драгоценными камнями

Нитроспирота

Планктомицетата

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Родопиреллула балтика	штамм1	Планктомицеты	7,145,576	7,325	Неопубликовано ^{[ 1 ]}

Псевдомонадота

Альфапротеобактерии

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Агробактерия тумефациенс	С58	Альфапротеобактерии	2,841,581	2,722	^{[ 107 ]}
Анаплазма маргинальная	Сент-Мариес	Альфапротеобактерии	1,197,687	949	^{[ 108 ]}
Анаплазма фагоцитофилум	ХЗ	Альфапротеобактерии	1,471,282	1,264	^{[ 109 ]}
Бартонелла Хенселае	Хьюстон-1	Альфапротеобактерии	1,931,047	1,612	^{[ 110 ]}
Бартонелла кинтана	Тулуза	Альфапротеобактерии	1,581,384	1,308	^{[ 110 ]}
Брадирризобиум японский	USDA110	Альфапротеобактерии	9,105,828	8,317	^{[ 111 ]}
Бруцелла абортус	2308 (хромосома I)	Альфапротеобактерии	1,156,948	1,164	^{[ 112 ]}
	2308 (хромосома II)	Альфапротеобактерии	2,121,359	2,186	^{[ 112 ]}
Бруцелла абортус	9-941 (хромосома I)	Альфапротеобактерии	2,124,241	2,030	^{[ 113 ]}
	9-941 (хромосома II)	Альфапротеобактерии	1,162,204	1,055	^{[ 113 ]}
Бруцелла мелитенсис	16M (хромосома I)	Альфапротеобактерии	2,117,144	2,059	^{[ 114 ]}
	16М (хромосома II)	Альфапротеобактерии	1,177,787	1,139	^{[ 114 ]}
Бруцелла suis	1330 (хромосома I)	Альфапротеобактерии	2,107,794	2,123	^{[ 115 ]}
	1330 (хромосома II)	Альфапротеобактерии	1,207,381	1,150	^{[ 115 ]}
Каулобактер крецентус	CB15	Альфапротеобактерии	4,016,947	3,737	^{[ 116 ]}
Эрлихия собачья	Джейк	Альфапротеобактерии	1,315,030	925	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Эрлихия чаффеенсис	Арканзас	Альфапротеобактерии	1,176,248	1,105	^{[ 109 ]}
Эрлихии жвачных животных	Гардель	Альфапротеобактерии	1,499,920	950	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Эрлихии жвачных животных	Хорошо принят	Альфапротеобактерии	1,512,977	958	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Не указано	Не указано	Альфапротеобактерии	1,516,355	920	^{[ 117 ]}
Эритробактер литоралис	HTCC2594	Альфапротеобактерии	3,052,398	3,011	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Глюконобактер оксиданс	621H	Альфапротеобактерии	2,702,173	2,432	^{[ 118 ]}
Яннаскии Виды	CCS1	Альфапротеобактерии	4,317,977	4,212	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
магнитоспирилла Магнитная	АМБ1	Альфапротеобактерии	4,967,148	4,559	^{[ 119 ]}
Мезоризобиум лоти	МАФФ303099	Альфапротеобактерии	7,036,071	6,752	^{[ 120 ]}
Неориккетсия сеннецу	Мияяма	Альфапротеобактерии	859,006	932	^{[ 109 ]}
Нитробактер гамбургский	х14	Альфапротеобактерии	4,406,967	3,804	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Нитробактер Виноградский	№ 255	Альфапротеобактерии	3,402,093	3,122	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Новосфингобиум аромативоранс	ДСМ12444	Альфапротеобактерии	3,561,584	3,324	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Пелагибактер повсюду	HTCC1062	Альфапротеобактерии	1,308,759	1,354	^{[ 121 ]}
ризобий сочный	CFN42	Альфапротеобактерии	4,381,608	4,067	^{[ 122 ]}
Ризобиум легуминозарум	viciae3841	Альфапротеобактерии	7,751,309	4,746	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Родобактер сфероидес	2.4.1	Альфапротеобактерии	3,188,609	3,022	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Не указано	Не указано	Альфапротеобактерии	943,016	835	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Родопсевдомонас болотный	АвтобусB18	Альфапротеобактерии	5,513,844	4,886	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Родопсевдомонас болотный	До В5	Альфапротеобактерии	4,892,717	4,397	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Родопсевдомонас болотный	CGA009	Альфапротеобактерии	5,459,213	4,833	^{[ 123 ]}
Родопсевдомонас болотный	ХаА2	Альфапротеобактерии	5,331,656	4,683	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Родоспириллы красные	АТСС11170	Альфапротеобактерии	4,352,825	3,791	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Риккетсия беллии	РМЛ369-С	Альфапротеобактерии	1,522,076	1,429	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Риккетсия конорий	Малиш7	Альфапротеобактерии	1,268,755	1,374	^{[ 124 ]}
Риккетсия кошачья	URRWXCal2	Альфапротеобактерии	1,485,148	1,400	^{[ 125 ]}
Риккетсия провазекии	Мадрид-Э	Альфапротеобактерии	1,111,523	834	^{[ 126 ]}
Риккетсия брюшного тифа	Уилмингтон	Альфапротеобактерии	1,111,496	838	^{[ 127 ]}
Силицибактер померойи	ДСС3	Альфапротеобактерии	4,109,442	3,810	^{[ 128 ]}
силицибактерий Виды	ТМ1040	Альфапротеобактерии	3,200,938	3,030	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Синоризобиум медицинский	WSM419	Альфапротеобактерии	3,781,904	3,635	^{[ 129 ]}
Синоризобиум мелилоти	1021 ринггит	Альфапротеобактерии	3,654,135	3,341	^{[ 130 ]}
Сфингопиксис аляскинский	РБ2256	Альфапротеобактерии	3,345,170	3,165	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
вольбахии Эндосимбионт	ТРС	Альфапротеобактерии	1,080,084	805	^{[ 131 ]}
Вольбахия пипиентис	wМел	Альфапротеобактерии	1,267,782	1,195	^{[ 132 ]}
Зимомонада мобилизис	ЗМ4	Альфапротеобактерии	2,056,416	1,998	^{[ 133 ]}

Бетапротеобактерии

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Азоаркус сп.	ЭбН1	Бетапротеобактерии	4,296,230	4,128	2002 ^{[ 134 ]}
Бордетелла бронхисептическая	РБ50	Бетапротеобактерии	5,339,179	5,006	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Бордетелла паракоклюсис	12822	Бетапротеобактерии	4,773,551	4,402	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Бордетелла коклюш	Тохама	Бетапротеобактерии	4,086,189	3,806	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Буркхолдерия ценоцепакия	AU1054	Бетапротеобактерии	3,294,563	2,965	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Не указано	Не указано	Бетапротеобактерии	2,788,459	2,472	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Не указано	Не указано	Бетапротеобактерии	1,196,094	1,040	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Буркхолдерия Маллей	АТСС23344	Бетапротеобактерии	3,510,148	2,996	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Не указано	Не указано	Бетапротеобактерии	2,325,379	2,029	2004 ^{[ 135 ]}
Буркхолдерия псевдомаллеи	1710б	Бетапротеобактерии	4,126,292	3,736	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Не указано	Не указано	Бетапротеобактерии	3,181,762	2,611	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Буркхолдерия псевдомаллеи	К96243	Бетапротеобактерии	4074542 (хромосома I) 3 173 005 (хромосома II)	3460 (хромосома I) 2395 (хромосома II)	2004 ^{[ 85 ]}
буркхолдерии Виды	383	Бетапротеобактерии	3,694,126	3,334	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Не указано	Не указано	Бетапротеобактерии	3,587,082	3,174	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Не указано	Не указано	Бетапротеобактерии	1,395,069	1,209	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Буркхолдерия Таиландская	Е264	Бетапротеобактерии	3,809,201	3,276	2005 ^{[ 136 ]}
Не указано	Не указано	Бетапротеобактерии	2,914,771	2,358	2005 ^{[ 136 ]}
Буркхолдерия ксеноворанс	ЛБ400	Бетапротеобактерии	4,895,836	4,430	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Не указано	Не указано	Бетапротеобактерии	3,363,523	2,960	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Не указано	Не указано	Бетапротеобактерии	1,471,779	1,312	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Хромобактерия фиолетовая	АТСС12472	Бетапротеобактерии	4,751,080	4,407	2003 ^{[ 137 ]}
Дехлормонас ароматический	РЦБ	Бетапротеобактерии	4,501,104	4,171	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Метилобацилла жгутиковая	КТ	Бетапротеобактерии	2,971,517	2,753	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Нейссерия гонорея	FA1090	Бетапротеобактерии	2,153,922	2,002	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Нейссерийный менингит	штамм серогруппы А Z2491	Бетапротеобактерии	2,184,406	2,121	2000 ^{[ 138 ]}
Нейссерийный менингит	штамм серогруппы B MC58	Бетапротеобактерии	2,272,360	2,063	2000 ^{[ 139 ]}
Нитросомонас европейский	Шмидт	Бетапротеобактерии	2,812,094	2,574	2003 ^{[ 140 ]}
Нитрозоспира мультиформис	АТСС25196	Бетапротеобактерии	3,184,243	2,757	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
поляромонас Виды	JS666	Бетапротеобактерии	5,200,264	4,817	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Ральстония эвтрофа	JMP134	Бетапротеобактерии	3,806,533	3,439	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Не указано	Не указано	Бетапротеобактерии	2,726,152	2,407	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Ральстония металлидуранс	CH34	Бетапротеобактерии	3,928,089	3,601	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Не указано	Не указано	Бетапротеобактерии	2,580,084	2,313	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Ральстония пасленовая	ГМИ1000	Бетапротеобактерии	3,716,413	3,441	2002 ^{[ 141 ]}
Не указано	Не указано	Бетапротеобактерии	2,094,509	1,679	^{[ 141 ]}
Родоферакс ферриредуценс	ДСМ15236	Бетапротеобактерии	4,712,337	4,170	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Тиобациллы денитрифицанс	АТСС25259	Бетапротеобактерии	2,909,809	2,827	Неопубликовано ^{[ 1 ]}

Гаммапротеобактерии

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Ацинетобактер sp.	АДП1	Гаммапротеобактерии	3,598,621	3,325	2004 ^{[ 142 ]}
Баумания цикаделлиникола	Хк	Гаммапротеобактерии	686,194	595	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Блохмания Флориданус	Напряжение	Гаммапротеобактерии	705,557	589	2003 ^{[ 143 ]}
Блохмания пенсильванская	bpEN	Гаммапротеобактерии	791,654	610	2005 ^{[ 144 ]}
Бухнера афидикола	АПС	Гаммапротеобактерии	640,681	564	2000 ^{[ 145 ]}
Бухнера афидикола	Б	Гаммапротеобактерии	615,980	504	2003 ^{[ 146 ]}
Бухнера афидикола	Сг	Гаммапротеобактерии	641,454	545	2002 ^{[ 147 ]}
Карсонелла рудди	PV	Гаммапротеобактерии	159,662	182	2006 ^{[ 148 ]}
Хромогалобактерии салексигенс	ДСМ3043	Гаммапротеобактерии	3,696,649	3,298	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Колвеллия психреритрея	34 часа	Гаммапротеобактерии	5,373,180	4,910	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Коксиелла Бернетии	RSA493	Гаммапротеобактерии	1,995,281	2,016	2003 ^{[ 149 ]}
Эрвиния каротовора	НАПИСАТЬ1043	Гаммапротеобактерии	5,064,019	4,492	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
кишечная палочка	536	Гаммапротеобактерии	4,938,920	4,685	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
кишечная палочка	CFT073	Гаммапротеобактерии	5,231,428	5,379	2002 ^{[ 150 ]}
кишечная палочка	К-12	Гаммапротеобактерии	4,639,675 (4,646,332)	4,331 (4,337)	1997, ^{[ 151 ]} 2005 ^{[ 152 ]}
кишечная палочка	О157:H7	Гаммапротеобактерии	5,528,445 (5,498,450)	5,349 (5,361)	2001, ^{[ 153 ]} 1999 ^{[ 154 ]}
кишечная палочка	УТИ89	Гаммапротеобактерии	5,065,741	5,066	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Франциселла Туляренсис	ЛВС	Гаммапротеобактерии	1,895,994	1,967	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Франциселла Туляренсис	ВЫСТРЕЛ4	Гаммапротеобактерии	1,892,819	1,804	2005 ^{[ 155 ]}
Гемофилус дукрейи	3500 л.с.	Гаммапротеобактерии	1,698,955	1,717	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Гемофильная инфекция	86-028НП	Гаммапротеобактерии	1,913,428	1,792	2005 ^{[ 156 ]}
Гемофильная инфекция	Роуд	Гаммапротеобактерии	1,830,138	1,709	1995 ^{[ 157 ]}
Сборка чехуенсиса	КСТС2396	Гаммапротеобактерии	7,215,267	6,782	2005 ^{[ 158 ]}
Идиомарина loihiensis	Л2ТР	Гаммапротеобактерии	2,839,318	2,628	2004 ^{[ 159 ]}
Легионелла пневмофила	Объектив	Гаммапротеобактерии	3,345,687	2,947	2004 ^{[ 160 ]}
Легионелла пневмофила	Париж	Гаммапротеобактерии	3,503,610	3,082	2004 ^{[ 160 ]}
Легионелла пневмофила	Филадельфия1	Гаммапротеобактерии	3,397,754	2,942	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Mannheimia succiniciproducens	МБЕЛ55Е	Гаммапротеобактерии	2,314,078	2,384	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Метилококк капсульный	Ванна	Гаммапротеобактерии	3,304,561	2,960	2004 ^{[ 161 ]}
Нитросококк океанический	АТСС19707	Гаммапротеобактерии	3,481,691	2,976	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Пастерелла мультоцида	ПМ70	Гаммапротеобактерии	2,257,487	2,014	2001 ^{[ 162 ]}
Фотобактерия глубина	СС9	Гаммапротеобактерии	4,085,304	3,416	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Не указано	Не указано	Гаммапротеобактерии	2,237,943	1,997	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Фоторабдус люминесценс	laumondiiTTO1	Гаммапротеобактерии	5,688,987	4,905	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Псевдоальтеромонас галопланктис	ТАС125	Гаммапротеобактерии	3,214,944	2,941	2005 ^{[ 163 ]}
Не указано	Не указано	Гаммапротеобактерии	635,328	546	^{[ 163 ]}
синегнойная палочка	ВРФПА04	Гаммапротеобактерии	6,818,030	5,939	2016 ^{[ 164 ]}
Псевдомонас энтомофила	Л48	Гаммапротеобактерии	5,888,780	5,168	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Псевдомонада флюоресценс	Пф-5	Гаммапротеобактерии	7,074,893	6,137	2005 ^{[ 165 ]}
Псевдомонада флюоресценс	ПфО-1	Гаммапротеобактерии	6,438,405	5,736	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Псевдомонас путида	КТ2440	Гаммапротеобактерии	6,181,863	5,350	2002 ^{[ 166 ]}
Псевдомонас сиринге	Б728а	Гаммапротеобактерии	6,093,698	5,136	2005 ^{[ 167 ]}
Псевдомонас сиринге	DC3000	Гаммапротеобактерии	6,397,126	5,470	2003 ^{[ 168 ]}
Псевдомонас сиринге	фазеоликола1448A	Гаммапротеобактерии	5,928,787	4,983	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Психробактер Арктикум	273-4	Гаммапротеобактерии	2,650,701	2,147	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Психробактер криогалолентис	К5	Гаммапротеобактерии	~3,1 МБ	2,575	^{[ 169 ]}
Не указано	Не указано	Гаммапротеобактерии	3,059,876	2,467	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Сахарофаг деграданс	40 февраля	Гаммапротеобактерии	5,057,531	4,008	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Сальмонелла энтерика	АТСС9150	Гаммапротеобактерии	4,585,229	4,093	2004 ^{[ 170 ]}
Сальмонелла энтерика	SCB67	Гаммапротеобактерии	4,755,700	4,445	2005 ^{[ 171 ]}
Сальмонелла энтерика	Тай2	Гаммапротеобактерии	4,791,961	4,323	2003 ^{[ 172 ]}
Сальмонелла энтерика	тифиCT18	Гаммапротеобактерии	4,809,037	4,600	2001 ^{[ 173 ]}
Сальмонелла тифимуриум	ЛТ2	Гаммапротеобактерии	4,857,432	4,452	2001 ^{[ 174 ]}
Шеванелла денитрифицирующая	ОС217	Гаммапротеобактерии	4,545,906	3,754	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Шеванелла онейденсис	МР1	Гаммапротеобактерии	4,969,803	4,630	2002 ^{[ 175 ]}
Шигелла бойдии	Сб227	Гаммапротеобактерии	4,519,823	4,142	2005 ^{[ 176 ]}
Шигелла дизентерия	Сд197	Гаммапротеобактерии	4,369,232	4,277	2005 ^{[ 176 ]}
Шигелла флекснери	2457Т	Гаммапротеобактерии	4,599,354	4,073	2003 ^{[ 177 ]}
Шигелла флекснери	2а301	Гаммапротеобактерии	4,607,203	4,436	2002 ^{[ 178 ]}
Шигелла сонней	сс046	Гаммапротеобактерии	4,825,265	4,224	2005 ^{[ 176 ]}
Член Глоссиния	морситанцы	Гаммапротеобактерии	4,171,146	2,432	2006 ^{[ 179 ]}
Тиомикроспира круногена	XCL2	Гаммапротеобактерии	2,427,734	2,192	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Холерный вибрион	N16961	Гаммапротеобактерии	2961149 (хромосома I) 1 072 315 (хромосома II)	2736 (хромосома I) 1092 (хромосома II)	2000 ^{[ 180 ]}
Вибрион фишери	ES114	Гаммапротеобактерии	2906179 (хромосома I) 1 332 022 (хромосома II)	2575 (хромосома I) 1172 (хромосома II)	2005 ^{[ 181 ]}
Вибрион парагемолитический	RIMD2210633	Гаммапротеобактерии	3 288 558 (хромосома I) 1 877 212 (хромосома II)	3080 (хромосома I) 1752 (хромосома II)	2000 ^{[ 182 ]}
Вибрион vulnificus	CMCP6	Гаммапротеобактерии	3 281 944 (хромосома I) 1 844 853 (хромосома II)	2973 (хромосома I) 1565 (хромосома II)	2003 ^{[ 183 ]}
Вибрион vulnificus	YJ016	Гаммапротеобактерии	3354505 (хромосома I) 1 857 073 (хромосома II)	3262 (хромосома I) 1697 (хромосома II)	2003 ^{[ 184 ]}
Вигглсвортия глянцевидия	Напряжение	Гаммапротеобактерии	697,724	611	2002 ^{[ 185 ]}
Ксантомонада аксоноподис	citri306	Гаммапротеобактерии	5,175,554	4,312	2002 ^{[ 186 ]}
Ксантомонас кампестрис	8004	Гаммапротеобактерии	5,148,708	4,273	2005 ^{[ 187 ]}
Ксантомонас кампестрис	8510	Гаммапротеобактерии	5,178,466	4,487	2005 ^{[ 188 ]}
Ксантомонас кампестрис	АТСС33913	Гаммапротеобактерии	5,076,188	4,181	2002 ^{[ 186 ]}
Ксантомонада oryzae	KACC10331	Гаммапротеобактерии	4,941,439	4,637	2005 ^{[ 189 ]}
Ксантомонада oryzae	MAFF311018	Гаммапротеобактерии	4,940,217	4,372	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Ксилелла фастидиоза	9а5с	Гаммапротеобактерии	2,679,306	2,766	2000 ^{[ 190 ]}
Ксилелла фастидиоза	Темекула1	Гаммапротеобактерии	2,519,802	2,034	2003 ^{[ 191 ]}
Иерсиния пестис	Древний	Гаммапротеобактерии	4,702,289	4,167	2006 ^{[ 192 ]}
Иерсиния пестис	CO-92Биовар Восточный	Гаммапротеобактерии	4,653,728	4,008	2001 ^{[ 193 ]}
Иерсиния пестис	КИМ	Гаммапротеобактерии	4,600,755	4,090	2002 ^{[ 194 ]}
Иерсиния пестис	Средневековый	Гаммапротеобактерии	4,595,065	3,895	2004 ^{[ 195 ]}
Иерсиния псевдотуберкулезная	IP32953	Гаммапротеобактерии	4,744,671	3,974	2004 ^{[ 196 ]}

Зетапротеобактерии

Миксококкота – Кампилобактерия

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Анаэромиксобактер дегалогенанс	2CP-С	дельта-эпсилон	5,013,479	4,346	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Бделловибрио бактериоворус	HD100	дельта-эпсилон	3,782,950	3,583	2004 ^{[ 197 ]}
Кампилобактер жеюни	NCTC11168	дельта-эпсилон	1,641,481	1,643	2000 ^{[ 198 ]}
Кампилобактер жеюни	1221 ринггит	дельта-эпсилон	1,777,831	1,838	2005 ^{[ 199 ]}
Десульфоталя психрофила	ЛСв54	дельта-эпсилон	3,523,383	3,118	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Десульфовибрио десульфуриканс	G20	дельта-эпсилон	3,730,232	3,775	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Десульфовибрио обыкновенный	Хилденборо	дельта-эпсилон	3,570,858	3,379	2004 ^{[ 200 ]}
Геобактер металлоредуценс	ГС15	дельта-эпсилон	3,997,420	3,519	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Геобактер серыредуценс	СПС	дельта-эпсилон	3,814,139	3,447	2003 ^{[ 201 ]}
Хеликобактер печени	АТСС51449	дельта-эпсилон	1,799,146	1,875	2003 ^{[ 202 ]}
Хеликобактер пилори	26695	дельта-эпсилон	1,667,867	1,566	1997 ^{[ 203 ]}
Хеликобактер пилори	HPAG1	дельта-эпсилон	1,596,366	1,536	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Хеликобактер пилори	J99	дельта-эпсилон	1,643,831	1,491	1999 ^{[ 204 ]}
Лавсония внутриклеточная	ФЕМН1-00	дельта-эпсилон	1,719,014	1,344	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Лавсония внутриклеточная	ПТО/МН1-00	дельта-эпсилон	1 457 619 (хромосома) 27048 (плазмида А) 39794 (плазмида B) 194553 (плазмида С)	1,187 29 (плазмида А) 24 (плазмида В) 104 (плазмида С)	2013 ^{[ 205 ]}
Миксококк ксантус	ДК1622	дельта-эпсилон	9,139,763	7,331	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Пелобактер карбиноликус	ДСМ2380	дельта-эпсилон	3,665,893	3,119	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Сорангиум клеточный	Итак, ce56	дельта-эпсилон	13,033,779	9,367	2007 ^{[ 206 ]}
Sulfurimonas denitrificans	ДСМ1251	дельта-эпсилон	2,201,561	2,104	2007 ^{[ 207 ]}
Синтрофус ацидитрофический	СБ	дельта-эпсилон	3,179,300	3,168	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Тиомикроспира денитрифицанс	АТСС33889	дельта-эпсилон	2,201,561	2,097	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Волинелла сукчино	ДСМЗ1740	дельта-эпсилон	2,110,355	2,044	2003 ^{[ 208 ]}

Спирохетата

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Боррелия бургдорфери	Б31	Спирохетата	910,724	850	^{[ 209 ]}
Боррелия гариния	ПБи	Спирохетата	904,246	832	^{[ 210 ]}
Лептоспира допрос	56601	Спирохетата	4,332,241	4,358	^{[ 211 ]}
Не указано	Не указано	Спирохетата	358,943	367	^{[ 211 ]}
Лептоспира допрос	ФиокрусL1130	Спирохетата	4,277,185	3,394	^{[ 212 ]}
Не указано	Не указано	Спирохетата	350,181	264	^{[ 212 ]}
Трепонема зубчатая	АТСС35405	Спирохетата	2,843,201	2,767	^{[ 213 ]}
Трепонема бледная	Николс	Спирохетата	1,138,011	1,031	^{[ 214 ]}

Синергистота

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка	Идентификатор генбанка
Термовирга лиении	Кас60314, ДСМ 17291	синергия	1,967,774		Объединенный институт генома Министерства энергетики США	CP003096

Микоплазматота

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка	Идентификатор генбанка
Мезоплазма цветов	Л1	Молликуты	793,224	683	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Микоплазма анатис	1340, АТСС 25524	Молликуты			^{[ 215 ]}	AFVJ00000000
Микоплазма каприколум	АТСС273	Молликуты	1,010,023	812	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Микоплазма галлисептикум	Р	Молликуты	996,422	726	^{[ 216 ]}
Микоплазма гениталиум	G37	Молликуты	580,076	476	^{[ 217 ]}
Микоплазма гемоканис	Иллинойс	Молликуты	919,992		Неопубликовано	CP003199
Микоплазма гиопневмонии	232	Молликуты	892,758	691	^{[ 218 ]}
Микоплазма гиопневмонии	7448	Молликуты	920,079	663	^{[ 219 ]}
Микоплазма гиопневмонии	Дж	Молликуты	897,405	665	^{[ 219 ]}
Микоплазма гиоринис	ГДЛ-1	Молликуты	837,480		Неопубликовано	CP003231
Микоплазма лечии	99/014/6	Молликуты	1,017,232		Неопубликовано	FR668087
Микоплазма мобильная	163 тыс.	Молликуты	777,079	635	^{[ 220 ]}
Микоплазма микоидес	СК	Молликуты	1,211,703	1,016	^{[ 221 ]}
Микоплазма проникающая	HF2	Молликуты	1,358,633	1,037	^{[ 222 ]}
Микоплазма пневмонии	М129	Молликуты	816,394	688	^{[ 223 ]}
Микоплазма пневмонии	ЗАО	Молликуты	963,879	782	^{[ 224 ]}
Микоплазма синовиальная	53	Молликуты	799,476	672	^{[ 219 ]}
Фитоплас маастерис	AYWB	Молликуты	706,569	671	Неопубликовано ^{[ 1 ]}
Фитоплас маастерис	ООО	Молликуты	860,631	754	^{[ 225 ]}
Уреаплазма уреалитикум	серовар3	Молликуты	751,719	611	^{[ 226 ]}

Термодесульфобактерии

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Термодесульфататор Индикус	CIR29812(Т)	Термодесульфобактерии	2,322,224	2,291	2012 ^{[ 227 ]}
Термодесульфобактерия геофонтис	ОПФ15(Т)	Термодесульфобактерии	1,634,377	1,635	2013 ^{[ 228 ]}

Термотогота

Разновидность	Напряжение	Тип	Базовые пары	Гены	Ссылка
Фервидобактерия узловатая	Рт17-Б1	Термотогота	1,950,000	1,750	2009 ^{[ 229 ]}
Космотога олеария	ТБФ 19.5.1	Термотогота	2,302,126	2,118	2011 ^{[ 230 ]}
Месотога прима	MesG1.Ag.4.2	Термотогота	2974229 хромосом 1724 плазмиды	2,736	2012 ^{[ 231 ]}
Термосифо африканский	TCF52B	Термотогота	2,016,657	2,000	2009 ^{[ 232 ]}
Термосифо меланезийский	BI429	Термотогота	1,920,000	1,879	2009 ^{[ 229 ]}
Термотога летающая	ТМО	Термотогота	2,140,000	2,040	2009 ^{[ 229 ]}
Термотога приморская	MSB8	Термотогота	1,860,725	1,846	1999, ^{[ 233 ]} 2013 ^{[ 234 ]}
Thermotoga petrophila	РКУ-1	Термотогота	1,820,000	1,785	2009 ^{[ 229 ]}

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль ^{являюсь} ^а ^к ^ап ^ак ^с ^как ^в ^В ^из ^хорошо ^топор ^{является} ^тот ^нет ^бб ^{до нашей эры} ^др. ^быть ^парень ^бг ^чб ^с ^минет ^БК ^с ^бм ^млрд ^быть ^б.п. ^БК ^бр ^бс ^БТ ^этот ^бв ^б ^бх ^к ^бз ^что ^CB ^копия ^{компакт-диск} ^Этот ^см. ^cg ^ч ^Там ^СиДжей ^ск ^кл ^см ^CN ^со ^КП ^cq ^кр ^CS ^КТ ^с ^резюме ^cw ^сх ^сай ^{чешский} ^и ^БД ^{округ Колумбия} «Поиск в базе данных генома Энтреза» . Национальный центр биотехнологической информации. Найдите подробную информацию о конкретных геномах по названию организма и штамму.
^ Тахон Дж. и др. (2018). «Abditibacterium utsteinense sp. nov., первый культивируемый представитель кандидатного типа FBP, выделенный из образцов незамерзающей антарктической почвы». Сист. Прил. Микробиол . 41 (4): 279–290. Бибкод : 2018СиАпМ..41..279Т . дои : 10.1016/j.syapm.2018.01.009 . ПМИД 29475572 . S2CID 3515091 .
^ Шелл М.А. и др. (2002). «Последовательность генома Bifidobacterium longum отражает ее адаптацию к желудочно-кишечному тракту человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (22): 14422–7. Бибкод : 2002PNAS...9914422S . дои : 10.1073/pnas.212527599 . ПМЦ 137899 . ПМИД 12381787 .
^ Серденьо-Таррага А.М. и др. (2003). «Полная последовательность генома и анализ Corynebacterium diphtheriae NCTC13129» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (22): 6516–23. дои : 10.1093/nar/gkg874 . ПМК 275568 . ПМИД 14602910 .
^ Нишио И. и др. (2003). «Сравнительный полный анализ последовательности генома аминокислотных замен, ответственных за термостабильность Corynebacterium efficiens » . Геном Рез . 13 (7): 1572–9. дои : 10.1101/гр.1285603 . ПМК 403753 . ПМИД 12840036 .
^ Тауч А. и др. (2005). «Полное секвенирование генома и анализ мультирезистентного внутрибольничного патогена Corynebacterium jeikeium K411, липид-требующей бактерии флоры кожи человека» . J Бактериол . 187 (13): 4671–82. дои : 10.1128/JB.187.13.4671-4682.2005 . ПМЦ 1151758 . ПМИД 15968079 .
^ Ли Л и др. (2005). «Полная последовательность генома Mycobacterium avium подвида paratuberculosis » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (35): 12344–9. Бибкод : 2005PNAS..10212344L . дои : 10.1073/pnas.0505662102 . ПМК 1194940 . ПМИД 16116077 .
^ Гарнье Т. и др. (2003). «Полная последовательность генома Mycobacterium bovis » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (13): 7877–82. Бибкод : 2003PNAS..100.7877G . дои : 10.1073/pnas.1130426100 . ПМК 164681 . ПМИД 12788972 .
^ Коул С.Т. и др. (2001). «Массовый распад генов бациллы проказы». Природа . 409 (6823): 1007–11. Бибкод : 2001Natur.409.1007C . дои : 10.1038/35059006 . ПМИД 11234002 . S2CID 4307207 .
^ Коул С.Т. и др. (1998). «Расшифровка биологии микобактерии туберкулеза по полной последовательности генома» . Природа . 393 (6685): 537–44. Бибкод : 1998Natur.393..537C . дои : 10.1038/31159 . ПМИД 9634230 .
^ Исикава Дж. и др. (2004). «Полная геномная последовательность Nocardia Farcinica IFM 10152» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (41): 14925–30. Бибкод : 2004PNAS..10114925I . дои : 10.1073/pnas.0406410101 . ПМК 522048 . PMID 15466710 .
^ Омура С. и др. (2001). «Последовательность генома промышленного микроорганизма Streptomyces avermitilis : выявление способности производить вторичные метаболиты» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (21): 12215–20. Бибкод : 2001PNAS...9812215O . дои : 10.1073/pnas.211433198 . ПМК 59794 . ПМИД 11572948 .
^ Реденбах М. и др. (1996). «Набор упорядоченных космид и подробная генетическая и физическая карта хромосомы Streptomyces coelicolor A3 (2) размером 8 Мб». Мол Микробиол . 21 (1): 77–96. дои : 10.1046/j.1365-2958.1996.6191336.x . ПМИД 8843436 . S2CID 30241692 .
^ Уэда К. и др. (2004). «Последовательность генома Symbiobacterium thermophilum , некультивируемой бактерии, зависящей от микробного комменсализма» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (16): 4937–44. дои : 10.1093/nar/gkh830 . ПМК 519118 . ПМИД 15383646 .
^ Декерт Г. и др. (1998). «Полный геном гипертермофильной бактерии Aquifex aeolicus » . Природа . 392 (6674): 353–8. Бибкод : 1998Natur.392..353D . дои : 10.1038/32831 . ПМИД 9537320 .
^ Серденьо-Таррага А.М. и др. (2005). «Обширные инверсии ДНК в геноме B. fragilis контролируют экспрессию переменных генов» (PDF) . Наука . 307 (5714): 1463–5. Бибкод : 2005Sci...307.1463C . дои : 10.1126/science.1107008 . ПМИД 15746427 . S2CID 43623586 .
^ Кувахара, Т; и др. (2004). «Геномный анализ Bacteroides fragilis выявил обширные инверсии ДНК, регулирующие адаптацию клеточной поверхности» . ПНАС . 101 (41): 14919–14924. Бибкод : 2004PNAS..10114919K . дои : 10.1073/pnas.0404172101 . ПМК 522005 . ПМИД 15466707 .
^ Сюй Дж и др. (2003). «Геномный взгляд на симбиоз человека и Bacteroides thetaiotaomicron ». Наука . 299 (5615): 2074–6. Бибкод : 2003Sci...299.2074X . дои : 10.1126/science.1080029 . ПМИД 12663928 . S2CID 34071235 .
^ Шмитц-Эссер, С.; и др. (2010). «Геном симбионта амебы Candidatus Amoebophilus asiaticus обнаруживает общие механизмы взаимодействия клеток-хозяев среди бактерий, связанных с амебами» . Дж. Бактериол . 192 (4): 1045–1057. дои : 10.1128/JB.01379-09 . ПМК 2812958 . ПМИД 20023027 .
^ Эйзен Дж.А. и др. (2002). «Полная последовательность генома Chlorobium tepidum TLS, фотосинтезирующей анаэробной зелено-серной бактерии» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (14): 9509–14. Бибкод : 2002PNAS...99.9509E . дои : 10.1073/pnas.132181499 . ПМЦ 123171 . ПМИД 12093901 .
^ Се, Г; и др. (июнь 2007 г.). «Последовательность генома целлюлолитической скользящей бактерии Cytophaga hutchinsonii » . Appl Environ Microbiol . 73 (11): 3536–3546. Бибкод : 2007ApEnM..73.3536X . дои : 10.1128/АЕМ.00225-07 . ЧВК 1932680 . ПМИД 17400776 .
^ Далиго, Х.; и др. (2011). «Полная последовательность генома штамма типа Haliscomenobacter Hydrossis (O)» . Стенд Genomic Sci . 4 (3): 352–360. дои : 10.4056/sigs.1964579 . ПМК 3156403 . ПМИД 21886862 .
^ Найто, М; и др. (2008). «Определение последовательности генома штамма Porphyromonas gingivalis ATCC 33277 и сравнение генома со штаммом W83 выявили обширные перестройки генома P. gingivalis » . ДНК Рез . 15 (4): 215–225. дои : 10.1093/dnares/dsn013 . ПМК 2575886 . ПМИД 18524787 .
^ Нельсон К.Е. и др. (2003). «Полная последовательность генома патогенного для полости рта штамма Bacterium porphyromonas gingivalis W83» . J Бактериол . 185 (18): 5591–601. дои : 10.1128/JB.185.18.5591-5601.2003 . ЧВК 193775 . ПМИД 12949112 .
^ Монгодин Э.Ф. и др. (2005). «Геном Salinibacter Ruber : конвергенция и обмен генами среди гипергалофильных бактерий и архей» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (50): 18147–52. Бибкод : 2005PNAS..10218147M . дои : 10.1073/pnas.0509073102 . ПМК 1312414 . ПМИД 16330755 .
^ Пена, А; и др. (2010). «Мелкомасштабная эволюция: геномная, фенотипическая и экологическая дифференциация двух сосуществующих штаммов Salinibacter Ruber » . ИСМЕ Дж . 4 (7): 882–895. Бибкод : 2010ISMEJ...4..882P . дои : 10.1038/ismej.2010.6 . ПМИД 20164864 .
^ ван Пассел, Марк У.Дж.; Кант, Рави; Зотендаль, Эрвин Г.; Плагг, Кэролайн М.; Дерриен, Мюриэл; Малфатти, Стефани А.; Чейн, Патрик С.Г.; Войке, Таня; Палва, Эйр (01 января 2011 г.). «Геном Akkermansia muciniphila, специального деградатора кишечного муцина, и его использование в изучении кишечных метагеномов» . ПЛОС ОДИН 6 (3): e16876. Бибкод : 2011PLoSO...616876V . дои : 10.1371/journal.pone.0016876 . ISSN 1932-6203 . ПМК 3048395 . ПМИД 21390229 .
^ Капуто, Аурелия; Дюбур, Грегори; Кроче, Оливье; Гупта, Сушим; Роберт, Кэтрин; Папазян, Лоран; Ролен, Жан-Марк; Рауль, Дидье (19 февраля 2015 г.). «Полногеномная сборка Akkermansia muciniphila, секвенированная непосредственно из стула человека» . Биология Директ . 10 :5. дои : 10.1186/s13062-015-0041-1 . ISSN 1745-6150 . ПМЦ 4333879 . ПМИД 25888298 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Прочтите TD и др. (2000). «Последовательности генома Chlamydia trachomatis MoPn и Chlamydia pneumoniae AR39» . Нуклеиновые кислоты Рез . 28 (6): 1397–406. дои : 10.1093/нар/28.6.1397 . ПМК 111046 . ПМИД 10684935 .
^ Карлсон Дж. Х. и др. (2005). «Сравнительный геномный анализ Chlamydia trachomatis окулотропных и генитотропных штаммов » . Инфекция и иммунитет . 73 (10): 6407–18. дои : 10.1128/IAI.73.10.6407-6418.2005 . ПМЦ 1230933 . ПМИД 16177312 .
^ Стивенс Р.С. и др. (1998). «Последовательность генома облигатного внутриклеточного возбудителя человека: Chlamydia trachomatis ». Наука . 282 (5389): 754–9. Бибкод : 1998Sci...282..754S . дои : 10.1126/science.282.5389.754 . ПМИД 9784136 .
^ Томсон Н.Р. и др. (2005). « Последовательность генома Chlamydophila abortus обнаруживает ряд вариабельных белков, которые способствуют межвидовой изменчивости» . Геном Рез . 15 (5): 629–40. дои : 10.1101/гр.3684805 . ПМЦ 1088291 . ПМИД 15837807 .
^ Прочтите TD и др. (2003). «Последовательность генома Chlamydophila caviae ( Chlamydia psittaci GPIC): изучение роли генов, специфичных для ниши, в эволюции Chlamydiaceae» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (8): 2134–47. дои : 10.1093/нар/gkg321 . ПМЦ 153749 . ПМИД 12682364 .
^ Азума, Ю.; Хиракава, Х.; Ямасита, А.; Кай, Ю.; Рахман, Массачусетс; Сузуки, Х.; Митаку, С.; Тох, Х.; и др. (февраль 2006 г.). «Последовательность генома возбудителя кошек Chlamydophila felis » . ДНК Рез . 13 (1): 15–2 дои : 10.1093/dnares/dsi027 . ПМИД 16766509 .
^ Калман С. и др. (1999). «Сравнительные геномы Chlamydia pneumoniae и C. trachomatis ». Нат Жене . 21 (4): 385–9. дои : 10.1038/7716 . ПМИД 10192388 . S2CID 24629065 .
^ Шираи, М; Хиракава, Х; Оучи, К; Табучи, М; Киши, Ф; Кимото, М; Такеучи, Х; Нисида, Дж; Шибата, К; Фудзинага, Р; Йонеда, Х; Мацусима, Х; Танака, К; Фурукава, С; Миура, К; Наказава, А; Исии, К; Шиба, Т; Хаттори, М; Кухара, С; Наказава, Т. (июнь 2000 г.). «Сравнение генов белков внешней мембраны omp и pmp в полногеномных последовательностях изолятов Chlamydia pneumoniae из Японии и США» . J Заразить Дис . 181 (Приложение 3): S524–7. дои : 10.1086/315616 . ПМИД 10839753 .
^ Хорн М. и др. (2004). «Освещение эволюционной истории хламидий» . Наука . 304 (5671): 728–30. Бибкод : 2004Sci...304..728H . дои : 10.1126/science.1096330 . ПМИД 15073324 . S2CID 39036549 .
^ Сешадри Р. и др. (2005). «Последовательность генома дехлорирующей PCE бактерии Dehalococcoides ethenogenes » . Наука . 307 (5706): 105–8. Бибкод : 2005Sci...307..105S . дои : 10.1126/science.1102226 . ПМИД 15637277 . S2CID 15601443 .
^ Кубе М. и др. (2005). дышащего хлорированными соединениями, бактерии Dehalococcoides «Последовательность генома штамма CBDB1, » . Нат Биотехнология . 23 (10): 1269–73. дои : 10.1038/nbt1131 . ПМИД 16116419 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Пёриц, М.; Горис, Т.; Вубет, Т.; Таркка, Монтана; Бускот, Ф.; Ниенхейс, И.; Лехнер, У.; Адриан, Л. (июнь 2013 г.). «Последовательности генома двух специалистов по дегалогенированию - штаммов Dehalococcoides mccartyi BTF08 и DCMB5, обогащенных из сильно загрязненного региона Биттерфельд» . FEMS Microbiol Lett . 343 (2): 101–4. дои : 10.1111/1574-6968.12160 . ПМИД 23600617 .
^ ДНК Рез. 31 октября 2001 г.; 8(5): 205-13, 8(5): 205-13; 227-53
^ Перейти обратно: ^а ^б Аллевальт Дж.П. и др. (2006). «Влияние температуры и света на рост и фотосинтез изолятов Synechococcus, типичных для тех, которые преобладают в сообществе весенних микробных матов осьминогов Йеллоустонского национального парка» . Appl Environ Microbiol . 72 (1): 544–50. Бибкод : 2006ApEnM..72..544A . дои : 10.1128/АЕМ.72.1.544-550.2006 . ПМЦ 1352173 . ПМИД 16391090 .
^ Накамура Ю. и др. (2003). «Полная структура генома Gloeobacter violaceus PCC 7421, цианобактерии, лишенной тилакоидов» . ДНК Рез . 10 (4): 137–45. дои : 10.1093/dnares/10.4.137 . ПМИД 14621292 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Рокап Г и др. (2003). «Дивергенция генома двух экотипов Prochromococcus отражает дифференциацию океанических ниш» . Природа . 424 (6952): 1042–7. Бибкод : 2003Natur.424.1042R . дои : 10.1038/nature01947 . ПМИД 12917642 . S2CID 4344597 .
^ Дюфрен А. и др. (2003). «Последовательность генома цианобактерии Prochromococcus marinus SS120, почти минимального оксифототрофного генома» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (17): 10020–5. Бибкод : 2003PNAS..10010020D . дои : 10.1073/pnas.1733211100 . ЧВК 187748 . ПМИД 12917486 .
^ Паленик Б и др. (2003). «Геном подвижного морского синехококка » . Природа . 424 (6952): 1037–42. Бибкод : 2003Natur.424.1037P . дои : 10.1038/nature01943 . ПМИД 12917641 .
^ Канеко, Т.; и др. (1995). «Анализ последовательностей генома одноклеточного штамма Cyanobacterium Synechocystis sp. PCC6803. I. Особенности последовательностей в области размером 1 МБ из позиций на карте от 64% до 92% генома» . ДНК Рез . 2 (4): 153–66. дои : 10.1093/dnares/2.4.153 . ПМИД 8590279 .
^ Поцелуй, Х; Ланг, Э; Лапидус, А; Коупленд, А; Нолан, М; Главина Дель Рио, Т; Чен, Ф; Лукас, С; Тайс, Х; Ченг, Дж. Ф.; Хан, С; Гудвин, Л; Питлак, С; Лиолиос, К; Пати, А; Иванова Н; Мавроматис, К; Чен, А; Паланиаппан, К; Земля, М; Хаузер, Л; Чанг, YJ; Джеффрис, компакт-диск; Деттер, Дж.К.; Бреттин, Т; Весна, С; Роде, М; Гёкер, М; Войк, Т; и др. (2010). «Полная последовательность генома штамма типа Denitrovibrio acetiphilus (N2460)» . Стандарты в геномных науках . 2 (3): 270–9. doi : 10.4056/sig.892105 . ПМК 3035293 . ПМИД 21304711 .
^ Питлак, С; Сикорски, Дж.; Оливия, А; Лапидус, А; Нолан, М; Лукас, С; Хэммон, Н.; Дешпанде, С; Ченг, JF; Тапиа, Р; Хан, С; Гудвин, Л; Лиолиос, К; Пагани, я; Иванова Н; Мавроматис, К; Пати, А; Чен, А; Паланиаппан, К.; Хаузер, Л; Чанг, YJ; Джеффрис, компакт-диск; Деттер, Джей Си; Брамбилла, Э; Джао, О.Д.; Роде, М; Весна, С; Гёкер, М; Войк, Т; и др. (2011). «Полная последовательность генома штамма типа Calditerrivibrio nitroreducens (Yu37-1)» . Стандарты в геномных науках . 4 (1): 54–6 дои : 10.4056/sig.1523807 . ПМК 3072091 . ПМИД 21475587 .
^ Такаки, Ю; Шимамура, С; Накагава, С; Фукухара, Ю; Хорикава, Х; Анкай, А; Харада, Т; Хосояма, А; Огучи, А; Фукуи, С; Фудзита, Н.; Таками, Х; Такай, К. (2010). «Образ жизни бактерий в трубе глубоководных гидротермальных источников, выявленный с помощью последовательности генома термофильной бактерии Deferribacter desulfuricans SSM1» . Исследование ДНК . 17 (3): 123–37. дои : 10.1093/dnares/dsq005 . ПМЦ 2885270 . ПМИД 20189949 .
^ Лапидус, А; Чертков О.; Нолан, М; Лукас, С; Хэммон, Н.; Дешпанде, С; Ченг, Дж. Ф.; Тапиа, Р; Хан, С; Гудвин, Л; Питлак, С; Лиолиос, К; Пагани, я; Иванова Н; Хантеманн, М; Мавроматис, К; Михайлова Н; Пати, А; Чен, А; Паланиаппан, К; Земля, М; Хаузер, Л; Брамбилла, EM; Роде, М; Абт, Б; Весна, С; Гёкер, М; Бристоу, Дж; Эйзен, Дж. А.; и др. (2011). «Последовательность генома умеренно термофильного галофильного штамма Flexistipes sinusarabici (MAS10)» . Стандарты в геномных науках . 5 (1): 86–96. дои : 10.4056/sigs.2235024 . ПМК 3236037 . ПМИД 22180813 .
^ Де Гроот, Арьян; и др. (2009). «Альянс протеомики и геномики для раскрытия особенностей сахарской бактерии Deinococcus Deserti » . ПЛОС Генет . 5 (3): e1000434. дои : 10.1371/journal.pgen.1000434 . ПМК 2669436 . ПМИД 19370165 .
^ Юань, М; и др. (2012). «Последовательность генома и анализ транскриптома радиорезистентной бактерии Deinococcus gobiensis : понимание экстремальной адаптации к окружающей среде» . ПЛОС ОДИН . 7 (3): e34458. Бибкод : 2012PLoSO...734458Y . дои : 10.1371/journal.pone.0034458 . ПМК 3314630 . ПМИД 22470573 .
^ Уайт О и др. (1999). «Последовательность генома радиорезистентной бактерии Deinococcus radiodurans R1» . Наука . 286 (5444): 1571–7. дои : 10.1126/science.286.5444.1571 . ПМК 4147723 . ПМИД 10567266 .
^ Сикорски, Дж; и др. (2010). «Полная последовательность генома штамма типа Meiothermus silvanus (VI-R2)» . Стенд Genomic Sci . 3 (1): 37–46. дои : 10.4056/sig.1042812 . ПМК 3035272 . ПМИД 21304690 .
^ Гундер, Камини; и др. (2011). «Последовательность гиперпластического генома естественно компетентного Thermus scotoductus SA-01» . БМК Геномика . 12 :577. дои : 10.1186/1471-2164-12-577 . ПМЦ 3235269 . ПМИД 22115438 .
^ Хенне А. и др. (2004). «Последовательность генома крайнего термофила Thermus thermophilus » . Нат Биотехнология . 22 (5): 547–53. дои : 10.1038/nbt956 . ПМИД 15064768 . S2CID 25469576 .
^ Монтейро-Виторелло, CB.; КАМАРГО, LE.; Ван Слейс, Массачусетс; Китадзима, Япония; Трюффи, Д.; до Амарал, AM .; Харакава, Р.; де Оливейра, JC; и др. (август 2004 г.). «Последовательность генома грамположительного возбудителя сахарного тростника Leifsonia xyli subsp. xyli » . Мол Растительный Микроб Взаимодействие . 17 (8): 827–36. дои : 10.1094/MPMI.2004.17.8.827 . hdl : 11449/67815 . ПМИД 15305603 .
^ Лю, Дж.; Ченг, А.; Бангаян, Нью-Джерси; Барнард, Э.; Курд, Э.; Крафт, Н.; Ли, Х. (2014). «Проект геномных последовательностей штамма Propionibacterium Acnes типа ATCC6919 и устойчивого к антибиотикам штамма HL411PA1» . Анонс генома . 2 (4): e00740–14. doi : 10.1128/genomeA.00740-14 . ПМК 4132614 . ПМИД 25125638 .
^ Бентли, Южная Дакота; Майвальд, М.; Мерфи, доктор медицинских наук; Паллен, МЮ; Йейтс, Калифорния; Дувр, LG.; Норбертчак, ХТ; Бесра, ГС; и др. (февраль 2003 г.). «Секвенирование и анализ генома бактерии болезни Уиппла Tropheryma whipplei ». Ланцет . 361 (9358): 637–44. дои : 10.1016/S0140-6736(03)12597-4 . ПМИД 12606174 . S2CID 8743326 .
^ Рауль Д. и др. (2003). « Троферима Уипплей Твист: патогенная для человека актинобактерия с редуцированным геномом» . Геном Рез . 13 (8): 1800–9. дои : 10.1101/гр.1474603 . ПМК 403771 . ПМИД 12902375 . Проверено 21 июня 2016 г.
^ Прочтите TD и др. (2003). «Последовательность генома Bacillus anthracis Ames и сравнение с близкородственными бактериями» (PDF) . Природа . 423 (6935): 81–6. Бибкод : 2003Natur.423...81R . дои : 10.1038/nature01586 . ПМИД 12721629 . S2CID 504400 .
^ Раско Д.А. и др. (2004). «Последовательность генома Bacillus cereus ATCC 10987 обнаруживает метаболические адаптации и большую плазмиду, родственную Bacillus anthracis pXO1» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (3): 977–88. дои : 10.1093/nar/gkh258 . ПМЦ 373394 . ПМИД 14960714 .
^ Иванова Н и др. (2003). «Последовательность генома Bacillus cereus и сравнительный анализ с Bacillus anthracis » . Природа . 423 (6935): 87–91. Бибкод : 2003Natur.423...87I . дои : 10.1038/nature01582 . ПМИД 12721630 .
^ Кобаяши Т. и др. (1995). «Очистка и свойства щелочной протеазы из алкалофильной Bacillus sp. KSM-K16». Appl Microbiol Biotechnol . 43 (3): 473–81. дои : 10.1007/BF00218452 . ПМИД 7632397 . S2CID 6077293 .
^ Таками Х. и др. (1999). «Улучшенная физическая и генетическая карта генома алкалофильной Bacillus sp. C-125». Экстремофилы . 3 (1): 21–8. дои : 10.1007/s007920050095 . ПМИД 10086841 . S2CID 1180141 .
^ Рей М.В. и др. (2004). «Полная последовательность генома промышленной бактерии Bacillus licheniformis и сравнение с близкородственными видами Bacillus » . Геном Биол . 5 (10): Р77. дои : 10.1186/gb-2004-5-10-r77 . ПМЦ 545597 . ПМИД 15461803 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Вейт Б. и др. (2004). «Полная последовательность генома Bacillus licheniformis DSM13, организма с большим промышленным потенциалом» . J Мол Микробиол Биотехнология . 7 (4): 204–11. дои : 10.1159/000079829 . ПМИД 15383718 .
^ Кунст Ф. и др. (1997). «Полная последовательность генома грамположительной бактерии Bacillus subtilis » . Природа . 390 (6657): 249–56. Бибкод : 1997Natur.390..249K . дои : 10.1038/36786 . ПМИД 9384377 .
^ Хан, CS.; Се, Г.; Чаллакомб, Дж. Ф.; Альтерр, г-н; Бхотика, СС.; Браун, Н.; Брюс, Д.; Кэмпбелл, CS; и др. (май 2006 г.). «Анализ патогеномной последовательности изолятов Bacillus cereus и Bacillus thuringiensis, тесно связанных с Bacillus anthracis » . J Бактериол . 188 (9): 3382–90. дои : 10.1128/JB.188.9.3382-3390.2006 . ПМЦ 1447445 . ПМИД 16621833 .
^ Ву, М.; Рен, К.; Дуркин, А.С.; Догерти, Южная Каролина; Бринкач, LM.; Додсон, Р.Дж.; Мадупу, Р.; Салливан, ЮАР; и др. (ноябрь 2005 г.). «Жизнь в горячем угарном газе: полная последовательность генома Carboxydothermus Hydrogenoformans Z-2901» . ПЛОС Генет . 1 (5): е65. дои : 10.1371/journal.pgen.0010065 . ПМК 1287953 . ПМИД 16311624 .
^ Нёллинг Дж. и др. (2001). «Последовательность генома и сравнительный анализ бактерии-продуцента растворителя Clostridium acetobutylicum » . J Бактериол . 183 (16): 4823–38. дои : 10.1128/JB.183.16.4823-4838.2001 . ПМК 99537 . PMID 11466286 .
^ Симидзу Т. и др. (2002). «Полная последовательность генома Clostridium perfringens , анаэробного плотоядного» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (2): 996–1001. Бибкод : 2002PNAS...99..996S . дои : 10.1073/pnas.022493799 . ПМЦ 117419 . ПМИД 11792842 .
^ Брюггеманн Х. и др. (2003). «Последовательность генома Clostridium tetani , возбудителя столбняка» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (3): 1316–21. Бибкод : 2003PNAS..100.1316B . дои : 10.1073/pnas.0335853100 . ПМК 298770 . ПМИД 12552129 .
^ Нонака Х. и др. (2006). «Полная последовательность генома дегалореспирирующей бактерии Desulfitobacterium hafniense Y51 и сравнение с Dehalococcoides ethenogenes 195» . J Бактериол . 188 (6): 2262–74. дои : 10.1128/JB.188.6.2262-2274.2006 . ПМЦ 1428132 . ПМИД 16513756 .
^ Полсен И.Т. и др. (2003). «Роль мобильной ДНК в эволюции устойчивого к ванкомицину Enterococcus faecalis ». Наука . 299 (5615): 2071–4. Бибкод : 2003Sci...299.2071P . дои : 10.1126/science.1080613 . ПМИД 12663927 . S2CID 45480495 .
^ Таками Х. и др. (2004). «Признак термоадаптации, выявленный по последовательности генома термофильной Geobacillus kaustophilus » . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (21): 6292–303. дои : 10.1093/nar/gkh970 . ПМК 535678 . ПМИД 15576355 .
^ Альтерманн Э и др. (2005). «Полная последовательность генома пробиотической молочнокислой бактерии Lactobacillus acidophilus NCFM» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (11): 3906–12. Бибкод : 2005PNAS..102.3906A . дои : 10.1073/pnas.0409188102 . ПМК 554803 . ПМИД 15671160 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Придмор Р.Д. и др. (2004). «Последовательность генома пробиотической кишечной бактерии Lactobacillus johnsonii NCC 533» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (8): 2512–7. Бибкод : 2004PNAS..101.2512P . дои : 10.1073/pnas.0307327101 . ПМК 356981 . ПМИД 14983040 .
^ Болотин А и др. (2001). «Полная последовательность генома молочнокислой бактерии Lactococcus Lactis ssp. Lactis IL1403» . Геном Рез . 11 (5): 731–53. дои : 10.1101/gr.gr-1697r . ПМК 311110 . ПМИД 11337471 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Глейзер П. и др. (2001). «Сравнительная геномика видов Listeria ». Наука . 294 (5543): 849–52. Бибкод : 1976Sci...192..801S . дои : 10.1126/science.1063447 . ПМИД 11679669 . S2CID 40718381 .
^ Нельсон К.Е. и др. (2004). «Сравнение всего генома штаммов серотипа 4b и 1/2a пищевого патогена Listeria monocytogenes позволяет по-новому взглянуть на основные компоненты генома этого вида» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (8): 2386–95. дои : 10.1093/nar/gkh562 . ПМК 419451 . ПМИД 15115801 .
^ Лу, Дж; Ноги, Ю; Таками, Х (2001). « Oceanobacillus iheyensis gen. nov., sp. nov., глубоководный чрезвычайно галотолерантный и алкалофильный вид, выделенный с глубины 1050 м на хребте Ихейя» . FEMS Microbiol Lett . 205 (2): 291–7. дои : 10.1111/j.1574-6968.2001.tb10963.x . ПМИД 11750818 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Гилл С.Р. и др. (2005). «Понимание эволюции вирулентности и устойчивости на основе полного анализа генома раннего метициллин-резистентного штамма Staphylococcus aureus и продуцирующего биопленку метициллин-резистентного штамма Staphylococcus epidermidis » . J Бактериол . 187 (7): 2426–38. дои : 10.1128/JB.187.7.2426-2438.2005 . ПМЦ 1065214 . ПМИД 15774886 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Холден М.Т. и др. (2004). «Полные геномы двух клинических штаммов золотистого стафилококка : свидетельства быстрой эволюции вирулентности и лекарственной устойчивости» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (26): 9786–91. Бибкод : 2004PNAS..101.9786H . дои : 10.1073/pnas.0402521101 . ПМК 470752 . ПМИД 15213324 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Курода М. и др. (2001). «Полногеномное секвенирование метициллин-резистентного золотистого стафилококка ». Ланцет . 357 (9264): 1225–40. дои : 10.1016/S0140-6736(00)04403-2 . ПМИД 11418146 . S2CID 25076109 .
^ Баба Т. и др. (2002). «Геном и детерминанты вирулентности внебольничного MRSA с высокой вирулентностью». Ланцет . 359 (9320): 1819–27. дои : 10.1016/S0140-6736(02)08713-5 . ПМИД 12044378 . S2CID 4657920 .
^ Дип Б.А. и др. (2006). «Полная последовательность генома USA300, эпидемического клона внебольничного метициллин-резистентного золотистого стафилококка ». Ланцет . 367 (9512): 731–9. дои : 10.1016/S0140-6736(06)68231-7 . ПМИД 16517273 . S2CID 30038673 .
^ Такеучи Ф и др. (2005). «Полногеномное секвенирование Staphylococcus haemolyticus раскрывает чрезвычайную пластичность его генома и эволюцию видов стафилококков, колонизирующих человека» . J Бактериол . 187 (21): 7292–308. дои : 10.1128/JB.187.21.7292-7308.2005 . ПМК 1272970 . ПМИД 16237012 .
^ Курода М. и др. (2005). «Полная последовательность генома Staphylococcus saprophyticus раскрывает патогенез неосложненной инфекции мочевыводящих путей» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (37): 13272–7. Бибкод : 2005PNAS..10213272K . дои : 10.1073/pnas.0502950102 . ПМК 1201578 . ПМИД 16135568 .
^ Теттелин Х. и др. (2005). «Анализ генома нескольких патогенных изолятов Streptococcus agalactiae : значение для микробного «пангенома» » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (39): 13950–5. Бибкод : 2005PNAS..10213950T . дои : 10.1073/pnas.0506758102 . ПМК 1216834 . ПМИД 16172379 .
^ Глейзер П. и др. (2002). «Последовательность генома Streptococcus agalactiae , возбудителя, вызывающего инвазивное неонатальное заболевание» . Мол Микробиол . 45 (6): 1499–513. дои : 10.1046/j.1365-2958.2002.03126.x . ПМИД 12354221 . S2CID 25189736 .
^ Теттелин Х. и др. (2002). «Полная последовательность генома и сравнительный геномный анализ нового человеческого патогена серотипа V Streptococcus agalactiae » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (19): 12391–6. Бибкод : 2002PNAS...9912391T . дои : 10.1073/pnas.182380799 . ПМК 129455 . ПМИД 12200547 .
^ Айдич Д. и др. (2002). «Последовательность генома Streptococcus mutans UA159, кариесогенного стоматологического патогена» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (22): 14434–9. Бибкод : 2002PNAS...9914434A . дои : 10.1073/pnas.172501299 . ПМЦ 137901 . ПМИД 12397186 .
^ Хоскинс Дж. и др. (2001). «Геном бактерии Streptococcus pneumoniae, штамм R6» . J Бактериол . 183 (19): 5709–17. дои : 10.1128/JB.183.19.5709-5717.2001 . ПМК 95463 . ПМИД 11544234 .
^ Теттелин Х. и др. (2001). «Полная последовательность генома вирулентного изолята Streptococcus pneumoniae ». Наука . 293 (5529): 498–506. CiteSeerX 10.1.1.318.395 . дои : 10.1126/science.1061217 . ПМИД 11463916 . S2CID 714948 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Берес С.Б. и др. (2006). «Молекулярно-генетическая анатомия меж- и внутрисеротипической изменчивости бактериального возбудителя группы А стрептококка человека » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 103 (18): 7059–64. Бибкод : 2006PNAS..103.7059B . дои : 10.1073/pnas.0510279103 . ПМК 1459018 . ПМИД 16636287 .
^ Бэнкс DJ и др. (2004). группы А «Прогресс в характеристике метагенома стрептококка : полная последовательность генома штамма серотипа М6, устойчивого к макролидам» . J Заразить Дис . 190 (4): 727–38. дои : 10.1086/422697 . ПМИД 15272401 .
^ Берес С.Б. и др. (2002). «Последовательность генома штамма серотипа М3 стрептококка группы А : фаговые токсины, фенотип высокой вирулентности и появление клонов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (15): 10078–83. Бибкод : 2002PNAS...9910078B . дои : 10.1073/pnas.152298499 . ПМК 126627 . ПМИД 12122206 .
^ Сумби П. и др. (2005). «Эволюционное происхождение и появление весьма успешного клона стрептококка серотипа М1 группы А включало множественные события горизонтального переноса генов» . J Заразить Дис . 192 (5): 771–82. дои : 10.1086/432514 . ПМИД 16088826 .
^ Грин Н.М. и др. (2005). «Последовательность генома штамма серотипа M28 стрептококка группы А : потенциально новое понимание послеродового сепсиса и специфичности бактериальных заболеваний» . J Заразить Дис . 192 (5): 760–70. дои : 10.1086/430618 . ПМИД 16088825 .
^ Смут Дж.С. и др. (2002). «Последовательность генома и сравнительный микрочиповый анализ штаммов стрептококка группы А серотипа М18, связанных со вспышками острой ревматической лихорадки» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (7): 4668–73. Бибкод : 2002PNAS...99.4668S . дои : 10.1073/pnas.062526099 . ПМЦ 123705 . ПМИД 11917108 .
^ Ферретти Дж. Дж. и др. (2001). «Полная последовательность генома штамма M1 Streptococcus pyogenes » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (8): 4658–63. Бибкод : 2001PNAS...98.4658F . дои : 10.1073/pnas.071559398 . ПМК 31890 . ПМИД 11296296 .
^ Накагава I и др. (2003). «Последовательность генома штамма M3 Streptococcus pyogenes раскрывает крупномасштабную геномную перестройку инвазивных штаммов и новое понимание эволюции фагов» . Геном Рез . 13 (6А): 1042–55. дои : 10.1101/гр.1096703 . ПМК 403657 . ПМИД 12799345 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Болотин А и др. (2004). «Полная последовательность и сравнительный анализ генома молочной бактерии Streptococcus thermophilus » . Нат Биотехнология . 22 (12): 1554–8. дои : 10.1038/nbt1034 . ПМЦ 7416660 . ПМИД 15543133 .
^ Капатрал В. и др. (2002). «Последовательность генома и анализ штамма ATCC 25586 бактерии полости рта Fusobacterium nucleatum » . J Бактериол . 184 (7): 2005–18. дои : 10.1128/JB.184.7.2005-2018.2002 . ПМК 134920 . ПМИД 11889109 .
^ Гуднер Б. и др. (2001). «Геномная последовательность патогена растений и биотехнологического агента Agrobacterium tumefaciens C58». Наука . 294 (5550): 2323–8. Бибкод : 2001Sci...294.2323G . дои : 10.1126/science.1066803 . ПМИД 11743194 . S2CID 86255214 .
^ Брайтон К.А. и др. (2005). «Полное секвенирование генома Anaplasma Marginale показывает, что поверхность смещена в сторону двух суперсемейств белков внешней мембраны» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (3): 844–9. Бибкод : 2005PNAS..102..844B . дои : 10.1073/pnas.0406656102 . ПМК 545514 . ПМИД 15618402 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Даннинг Хотопп Дж.К. и др. (2006). «Сравнительная геномика новых возбудителей эрлихиоза человека» . ПЛОС Генет . 2 (2): е21. дои : 10.1371/journal.pgen.0020021 . ПМЦ 1366493 . ПМИД 16482227 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Алсмарк CM и др. (2004). «Переносимый вшами патоген человека Bartonella quintana является геномным производным зоонозного агента Bartonella henselae » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (26): 9716–21. Бибкод : 2004PNAS..101.9716A . дои : 10.1073/pnas.0305659101 . ПМК 470741 . ПМИД 15210978 .
^ Канеко Т. и др. (2002). «Полная геномная последовательность азотфиксирующей симбиотической бактерии Bradyrhizobium japonicum USDA110» . ДНК Рез . 9 (6): 189–97. дои : 10.1093/dnares/9.6.189 . ПМИД 12597275 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Чейн П.С. и др. (2005). «Полногеномный анализ событий видообразования патогенных бруцелл» . Инфекция и иммунитет . 73 (12): 8353–61. дои : 10.1128/IAI.73.12.8353-8361.2005 . ПМК 1307078 . ПМИД 16299333 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Холлинг С.М. и др. (2005). «Завершение последовательности генома Brucella abortus и сравнение с очень похожими геномами Brucella melitensis и Brucella suis » . J Бактериол . 187 (8): 2715–26. дои : 10.1128/JB.187.8.2715-2726.2005 . ПМЦ 1070361 . ПМИД 15805518 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ДельВеккио В.Г. и др. (2002). «Последовательность генома факультативного внутриклеточного возбудителя Brucella melitensis » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (1): 443–8. Бибкод : 2002PNAS...99..443D . дои : 10.1073/pnas.221575398 . ПМЦ 117579 . ПМИД 11756688 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Полсен И.Т. и др. (2002). « Геном Brucella suis обнаруживает фундаментальное сходство между патогенами животных и растений и симбионтами» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (20): 13148–53. Бибкод : 2002PNAS...9913148P . дои : 10.1073/pnas.192319099 . ПМК 130601 . ПМИД 12271122 .
^ Нирман В.К. и др. (2001). «Полная последовательность генома Caulobacter crescentus » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (7): 4136–41. Бибкод : 2001PNAS...98.4136N . дои : 10.1073/pnas.061029298 . ПМК 31192 . ПМИД 11259647 .
^ Коллинз Н.Э. и др. (2005). «Геном возбудителя сердечной недостаточности Ehrlichia ruminantium содержит множественные тандемные повторы с активно вариабельным числом копий» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (3): 838–43. Бибкод : 2005PNAS..102..838C . дои : 10.1073/pnas.0406633102 . ПМК 545511 . ПМИД 15637156 .
^ Пруст С. и др. (2005). «Полная последовательность генома уксуснокислой бактерии Gluconobacter oxydans » . Нат Биотехнология . 23 (2): 195–200. дои : 10.1038/nbt1062 . PMID 15665824 .
^ Мацунага Т. и др. (2005). «Полная последовательность генома факультативно-анаэробной магнитотактической бактерии Magnetospirillum sp. Штамм AMB-1» . ДНК Рез . 12 (3): 157–66. дои : 10.1093/dnares/dsi002 . ПМИД 16303747 .
^ Канеко Т. и др. (2000). «Полная структура генома азотфиксирующей симбиотической бактерии Mesorhizobium loti » . ДНК Рез . 7 (6): 331–8. дои : 10.1093/dnares/7.6.331 . ПМИД 11214968 .
^ Джованнони С.Дж. и др. (2005). «Оптимизация генома космополитической океанической бактерии». Наука . 309 (5738): 1242–5. Бибкод : 2005Sci...309.1242G . дои : 10.1126/science.1114057 . ПМИД 16109880 . S2CID 16221415 .
^ Гонсалес В. и др. (2006). «Разделенный геном Rhizobium etli : генетическая и метаболическая избыточность в семи взаимодействующих репликонах» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 103 (10): 3834–9. Бибкод : 2006PNAS..103.3834G . дои : 10.1073/pnas.0508502103 . ПМЦ 1383491 . ПМИД 16505379 .
^ Лаример Ф.В. и др. (2004). «Полная последовательность генома метаболически универсальной фотосинтетической бактерии Rhodopseudomonas palustris » . Нат Биотехнология . 22 (1): 55–61. дои : 10.1038/nbt923 . ПМИД 14704707 .
^ Огата Х и др. (2000). «Эгоистичная ДНК в белок-кодирующих генах риккетсий ». Наука . 290 (5490): 347–50. Бибкод : 2000Sci...290..347O . дои : 10.1126/science.290.5490.347 . ПМИД 11030655 .
^ Огата Х и др. (2005). «Последовательность генома Rickettsia felis идентифицирует первую предполагаемую конъюгатную плазмиду облигатного внутриклеточного паразита» . ПЛОС Биол . 3 (8): е248. дои : 10.1371/journal.pbio.0030248 . ПМЦ 1166351 . ПМИД 15984913 .
^ Андерссон С.Г. и др. (1998). «Последовательность генома Rickettsia prowazekii и происхождение митохондрий» . Природа . 396 (6707): 133–40. Бибкод : 1998Natur.396..133A . дои : 10.1038/24094 . ПМИД 9823893 .
^ Маклеод, член парламента и др. (2004). «Полная последовательность генома Rickettsia typhi и сравнение с последовательностями других риккетсий» . J Бактериол . 186 (17): 5842–55. дои : 10.1128/JB.186.17.5842-5855.2004 . ПМК 516817 . ПМИД 15317790 .
^ Моран М.А. и др. (2004). «Последовательность генома Silicibacter pomeroyi демонстрирует адаптацию к морской среде» . Природа . 432 (7019): 910–3. Бибкод : 2004Natur.432..910M . дои : 10.1038/nature03170 . ПМИД 15602564 .
^ «Домашний — Sinorhizobium medicae WSM419» .
^ Капела Д. и др. (2001). «Анализ хромосомной последовательности бобового симбионта Sinorhizobium meliloti штамма 1021» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (17): 9877–82. Бибкод : 2001PNAS...98.9877C . дои : 10.1073/pnas.161294398 . ПМК 55546 . ПМИД 11481430 .
^ Фостер Дж. и др. (2005). « Wolbachia Геном Brugia malayi : эволюция эндосимбионта внутри патогенной нематоды человека» . ПЛОС Биол . 3 (4): е121. дои : 10.1371/journal.pbio.0030121 . ПМК 1069646 . ПМИД 15780005 .
^ Ву М и др. (2004). «Филогеномика репродуктивного паразита Wolbachia pipientis wMel: оптимизированный геном, наводненный мобильными генетическими элементами» . ПЛОС Биол . 2 (3): Е69. дои : 10.1371/journal.pbio.0020069 . ПМК 368164 . ПМИД 15024419 .
^ Со Дж.С. и др. (2005). «Последовательность генома этанологенной бактерии Zymomonas mobilis ZM4» . Нат Биотехнология . 23 (1): 63–8. дои : 10.1038/nbt1045 . ПМК 6870993 . ПМИД 15592456 .
^ Рабус Р. и др. (2002). «Гены, участвующие в анаэробном разложении этилбензола в денитрифицирующей бактерии, штамм EbN1». Арка Микробиол . 178 (6): 506–16. Бибкод : 2002ArMic.178..506R . дои : 10.1007/s00203-002-0487-2 . ПМИД 12420173 . S2CID 34316083 .
^ Нирман В.К. и др. (2004). «Структурная гибкость генома Burkholderia mallei» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (39): 14246–51. Бибкод : 2004PNAS..10114246N . дои : 10.1073/pnas.0403306101 . ПМК 521142 . ПМИД 15377793 .
^ Перейти обратно: ^а ^б БМК Геномика. 2005 7 декабря
^ Бразильский национальный консорциум геномного проекта. (2003). «Полная последовательность генома Chromobacterium violaceum демонстрирует замечательную и полезную бактериальную адаптивность» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (20): 11660–5. Бибкод : 2003PNAS..10011660. . дои : 10.1073/pnas.1832124100 . ПМК 208814 . ПМИД 14500782 .
^ Паркхилл Дж. и др. (2000). Z2491 серогруппы А «Полная последовательность ДНК штамма Neisseria meningitidis ». Природа . 404 (6777): 502–6. Бибкод : 2000Natur.404..502P . дои : 10.1038/35006655 . ПМИД 10761919 . S2CID 4430718 .
^ Теттелин Х. и др. (2000). «Полная последовательность генома штамма MC58 Neisseria meningitidis серогруппы B». Наука . 287 (5459): 1809–15. Бибкод : 2000Sci...287.1809. . дои : 10.1126/science.287.5459.1809 . ПМИД 10710307 .
^ Чейн П и др. (2003). «Полная последовательность генома аммиакокисляющей бактерии и облигатного хемолитоавтотрофа Nitrosomonas europaea » . J Бактериол . 185 (9): 2759–73. дои : 10.1128/JB.185.9.2759-2773.2003 . ПМК 154410 . ПМИД 12700255 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Саланоубат М. и др. (2002). «Последовательность генома возбудителя растений Ralstonia solanacearum » . Природа . 415 (6871): 497–502. дои : 10.1038/415497a . ПМИД 11823852 .
^ Барбе В. и др. (2004). «Уникальные особенности, выявленные последовательностью генома Acinetobacter sp. ADP1, универсальной и естественно способной к трансформации бактерии» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (19): 5766–79. дои : 10.1093/nar/gkh910 . ПМК 528795 . ПМИД 15514110 .
^ Гил Р. и др. (2003). «Последовательность генома Blochmannia floridanus : сравнительный анализ редуцированных геномов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (16): 9388–93. Бибкод : 2003PNAS..100.9388G . дои : 10.1073/pnas.1533499100 . ПМК 170928 . ПМИД 12886019 .
^ Дегнан PH и др. (2005). «Последовательность генома Blochmannia pennsylvanicus указывает на параллельные эволюционные тенденции среди бактериальных мутуалистов насекомых» . Геном Рез . 15 (8): 1023–33. дои : 10.1101/гр.3771305 . ПМЦ 1182215 . ПМИД 16077009 .
^ Сигенобу С. и др. (2000). «Последовательность генома внутриклеточного бактериального симбионта тли Buchnera sp. APS» . Природа . 407 (6800): 81–6. Бибкод : 2000Natur.407...81S . дои : 10.1038/35024074 . ПМИД 10993077 .
^ ван Хэм Р.Ц. и др. (2003). «Редуктивная эволюция генома Buchnera aphidicola » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (2): 581–6. Бибкод : 2003PNAS..100..581V . дои : 10.1073/pnas.0235981100 . ПМК 141039 . ПМИД 12522265 .
^ Тамаш I и др. (2002). «50 миллионов лет геномного застоя эндосимбиотических бактерий». Наука . 296 (5577): 2376–9. Бибкод : 2002Sci...296.2376T . дои : 10.1126/science.1071278 . ПМИД 12089438 . S2CID 19226473 .
^ Накабачи А. и др. (2006). «Геном бактериального эндосимбионта Carsonella длиной 160 тысяч оснований ». Наука . 314 (5797): 267. doi : 10.1126/science.1134196 . ПМИД 17038615 . S2CID 44570539 .
^ Сешадри Р. и др. (2003). «Полная последовательность генома возбудителя Q-лихорадки Coxiella burnetii » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (9): 5455–60. Бибкод : 2003PNAS..100.5455S . дои : 10.1073/pnas.0931379100 . ПМК 154366 . ПМИД 12704232 .
^ Уэлч Р.А. и др. (2002). «Обширная мозаичная структура, выявленная по полной последовательности генома уропатогенной Escherichia coli » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 17020–4. Бибкод : 2002PNAS...9917020W . дои : 10.1073/pnas.252529799 . ПМК 139262 . ПМИД 12471157 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
^ Блаттнер Ф.Р. и др. (1997). «Полная последовательность генома Escherichia coli K-12» . Наука . 277 (5331): 1453–74. дои : 10.1126/science.277.5331.1453 . ПМИД 9278503 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
^ Райли М. и др. (2006). « Escherichia coli K-12: снимок аннотации, разработанный совместно — 2005 г.» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (1): 1–9. дои : 10.1093/нар/gkj405 . ПМЦ 1325200 . ПМИД 16397293 .
^ Перна НТ и др. (2001). «Последовательность генома энтерогеморрагической Escherichia coli O157:H7» . природе По своей 409 (6819): 529–33. Бибкод : 2001Natur.409..529P . дои : 10.1038/35054089 . ПМИД 11206551 .
^ Макино, К.; и др. (1999). «Полная нуклеотидная последовательность профага VT2-Сакаи, несущего гены веротоксина 2 энтерогеморрагической Escherichia coli O157:H7, полученной в результате вспышки Сакаи» . Гены и генетические системы . 74 (5): 227–39. дои : 10.1266/ggs.74.227 . ПМИД 10734605 .
^ Ларссон П. и др. (2005). «Полная последовательность генома Francesella tularensis , возбудителя туляремии» . Нат Жене . 37 (2): 153–9. дои : 10.1038/ng1499 . ПМИД 15640799 .
^ Харрисон А. и др. (2005). «Геномная последовательность изолята среднего отита нетипируемой Haemophilus influenzae : сравнительное исследование с серотипом d H. influenzae, штамм KW20» . J Бактериол . 187 (13): 4627–36. дои : 10.1128/JB.187.13.4627-4636.2005 . ПМЦ 1151754 . ПМИД 15968074 .
^ Флейшманн Р.Д. и др. (1995). «Полногеномное случайное секвенирование и сборка Haemophilus influenzae Rd». Наука . 269 (5223): 496–512. Бибкод : 1995Sci...269..496F . дои : 10.1126/science.7542800 . ПМИД 7542800 .
^ Чон Х. и др. (2005). «Геномная схема Hahella chejuensis , морского микроба, производящего альгицидное средство» . Нуклеиновые кислоты Рез . 33 (22): 7066–73. дои : 10.1093/nar/gki1016 . ПМЦ 1312362 . ПМИД 16352867 .
^ Хоу С. и др. (2004). «Последовательность генома глубоководной гамма-протеобактерии Idiomarina loihiensis показывает, что ферментация аминокислот является источником углерода и энергии» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (52): 18036–41. Бибкод : 2004PNAS..10118036H . дои : 10.1073/pnas.0407638102 . ПМК 539801 . ПМИД 15596722 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Казалет С. и др. (2004). «Доказательства Legionella pneumophila использования функций клетки-хозяина и высокой пластичности генома » . Нат Жене . 36 (11): 1165–73. дои : 10.1038/ng1447 . ПМИД 15467720 .
^ Уорд Н. и др. (2004). «Геномный взгляд на метанотрофию: полная последовательность генома Mmethylococcus capsulatus (Bath)» . ПЛОС Биол . 2 (10): е303. дои : 10.1371/journal.pbio.0020303 . ПМК 517821 . ПМИД 15383840 .
^ Мэй Б.Дж. и др. (2001). «Полная геномная последовательность Pasteurella multocida , Pm70» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (6): 3460–5. Бибкод : 2001PNAS...98.3460M . дои : 10.1073/pnas.051634598 . ПМК 30675 . ПМИД 11248100 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Медиг С и др. (2005). «Как справиться с холодом: геном универсальной морской антарктической бактерии Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125» . Геном Рез . 15 (10): 1325–35. дои : 10.1101/гр.4126905 . ПМК 1240074 . ПМИД 16169927 .
^ Муруган Н. (2016). VRFPA04 с множественной лекарственной устойчивостью (MDR), «Раскрытие геномной и фенотипической природы Pseudomonas aeruginosa выделенной от пациента с кератитом» . Микробиологические исследования . 193 : 959–64. дои : 10.1016/j.micres.2016.10.002 . ПМИД 27825482 .
^ Полсен И.Т. и др. (2005). «Полная последовательность генома комменсального растения Pseudomonas fluorescens Pf-5» . Нат Биотехнология . 23 (7): 873–8. дои : 10.1038/nbt1110 . ПМЦ 7416659 . ПМИД 15980861 .
^ Нельсон К.Е. и др. (2002). «Полная последовательность генома и сравнительный анализ метаболически универсальной Pseudomonas putida KT2440». Энвайрон Микробиол . 4 (12): 799–808. Бибкод : 2002EnvMi...4..799N . дои : 10.1046/j.1462-2920.2002.00366.x . ПМИД 12534463 .
^ Фейл Х. и др. (2005). «Сравнение полных последовательностей генома Pseudomonas syringae pv. syringae B728a и pv. tomato DC3000» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (31): 11064–9. Бибкод : 2005PNAS..10211064F . дои : 10.1073/pnas.0504930102 . ПМЦ 1182459 . ПМИД 16043691 .
^ Бьюэлл CR и др. (2003). «Полная последовательность генома Arabidopsis и патогена томатов Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (18): 10181–6. Бибкод : 2003PNAS..10010181B . дои : 10.1073/pnas.1731982100 . ЧВК 193536 . ПМИД 12928499 .
^ «Психробактер криогалолентис — микробевики» .
^ Макклелланд М. и др. (2004). «Сравнение деградации генома Paratyphi A и Typhi, ограниченных для человека сероваров Salmonella enterica, вызывающих брюшной тиф». Нат Жене . 36 (12): 1268–74. дои : 10.1038/ng1470 . ПМИД 15531882 . S2CID 25129295 .
^ Чиу Ч. и др. (2005). «Последовательность генома Salmonella enterica серовара Choleraesuis , высокоинвазивного и устойчивого зоонозного патогена» . Нуклеиновые кислоты Рез . 33 (5): 1690–8. дои : 10.1093/nar/gki297 . ПМК 1069006 . ПМИД 15781495 .
^ Дэн В. и др. (2003). «Сравнительная геномика серовара enterica Salmonella Typhi, штаммы Ty2 и CT18» . J Бактериол . 185 (7): 2330–7. дои : 10.1128/JB.185.7.2330-2337.2003 . ПМК 151493 . ПМИД 12644504 .
^ Паркхилл Дж. и др. (2001). «Полная последовательность генома серовара enterica Salmonella Typhi CT18 с множественной лекарственной устойчивостью» . Природа . 413 (6858): 848–52. Бибкод : 2001Natur.413..848P . дои : 10.1038/35101607 . ПМИД 11677608 .
^ Макклелланд М. и др. (2001). «Полная последовательность генома Salmonella enterica серовара Typhimurium LT2» . Природа . 413 (6858): 852–6. Бибкод : 2001Natur.413..852M . дои : 10.1038/35101614 . ПМИД 11677609 .
^ Гейдельберг Дж. Ф. и др. (2002). «Последовательность генома диссимиляционной бактерии, восстанавливающей ионы металлов Shewanella oneidensis » . Нат Биотехнология . 20 (11): 1118–23. дои : 10.1038/nbt749 . ПМИД 12368813 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Ян Ф. и др. (2005). «Динамика генома и разнообразие видов шигелл , этиологических агентов бактериальной дизентерии» . Нуклеиновые кислоты Рез . 33 (19): 6445–58. дои : 10.1093/nar/gki954 . ПМЦ 1278947 . ПМИД 16275786 .
^ Вэй Дж. и др. (2003). «Полная последовательность генома и сравнительная геномика штамма 2457T Shigella flexneri серотипа 2а» . Инфекция и иммунитет . 71 (5): 2775–86. дои : 10.1128/IAI.71.5.2775-2786.2003 . ПМК 153260 . ПМИД 12704152 .
^ Джин Кью и др. (2002). «Последовательность генома Shigella flexneri 2a: понимание патогенности путем сравнения с геномами Escherichia coli K12 и O157» . Нуклеиновые кислоты Рез . 30 (20): 4432–41. дои : 10.1093/nar/gkf566 . ПМЦ 137130 . ПМИД 12384590 .
^ Тох Х и др. (2006). «Массивная эрозия генома и функциональные адаптации позволяют лучше понять симбиотический образ жизни Sodalislossinidius с хозяином цеце» . Геном Рез . 16 (2): 149–56. дои : 10.1101/гр.4106106 . ПМЦ 1361709 . ПМИД 16365377 .
^ Гейдельберг Дж. Ф. и др. (2000). «Последовательность ДНК обеих хромосом возбудителя холеры Vibrio cholerae » . Природа . 406 (6795): 477–83. Бибкод : 2000Natur.406..477H . дои : 10.1038/35020000 . ПМК 8288016 . ПМИД 10952301 .
^ Руби Э.Г. и др. (2005). «Полная последовательность генома Vibrio fischeri : симбиотическая бактерия с патогенными родственниками» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (8): 3004–9. Бибкод : 2005PNAS..102.3004R . дои : 10.1073/pnas.0409900102 . ПМК 549501 . ПМИД 15703294 .
^ Насу Х и др. (1 июня 2000 г.). «Нитчатый фаг, связанный с недавними пандемическими штаммами Vibrio parahaemolyticus O3:K6» . J Clin Микробиол . 38 (6): 2156–61. doi : 10.1128/JCM.38.6.2156-2161.2000 . ПМЦ 86752 . ПМИД 10834969 .
^ Ким Ю.Р. и др. (2003). «Характеристика и патогенное значение антигенов Vibrio vulnificus, преимущественно экспрессируемых у пациентов с сепсисом» . Инфекция и иммунитет . 71 (10): 5461–71. дои : 10.1128/IAI.71.10.5461-5471.2003 . ПМК 201039 . ПМИД 14500463 .
^ Чен С.И. и др. (2003). «Сравнительный анализ генома Vibrio vulnificus морского патогена » . Геном Рез . 13 (12): 2577–87. дои : 10.1101/гр.1295503 . ПМК 403799 . ПМИД 14656965 .
^ Акман Л. и др. (2002). «Последовательность генома внутриклеточного облигатного симбионта мухи цеце Wigglesworthialossinidia » . Нат Жене . 32 (3): 402–7. дои : 10.1038/ng986 . ПМИД 12219091 . S2CID 20604183 .
^ Перейти обратно: ^а ^б да Силва AC и др. (2002). «Сравнение геномов двух возбудителей Xanthomonas с различной специфичностью хозяина». Природа . 417 (6887): 459–63. Бибкод : 2002Natur.417..459D . дои : 10.1038/417459а . ПМИД 12024217 . S2CID 4302762 .
^ Цянь В. и др. (2005). «Сравнительный и функциональный геномный анализ патогенности фитопатогена Xanthomonas Campestris pv. Campestris » . Геном Рез . 15 (6): 757–67. дои : 10.1101/гр.3378705 . ПМЦ 1142466 . ПМИД 15899963 .
^ Тиме Ф. и др. (2005). «Изучение пластичности генома и патогенности фитопатогенной бактерии Xanthomonas Campestris pv. vesicatoria , выявленной с помощью полной последовательности генома» . J Бактериол . 187 (21): 7254–66. дои : 10.1128/JB.187.21.7254-7266.2005 . ПМЦ 1272972 . ПМИД 16237009 .
^ Ли Б.М. и др. (2005). «Последовательность генома Xanthomonas oryzae pathovar oryzae KACC10331, возбудителя бактериального ожога риса» . Нуклеиновые кислоты Рез . 33 (2): 577–86. дои : 10.1093/nar/gki206 . ПМК 548351 . ПМИД 15673718 .
^ Симпсон, AJC; и др. (2000). «Последовательность генома возбудителя растений Xylella fastidiosa » . Природа . 406 (6792): 151–7. Бибкод : 2000Natur.406..151S . дои : 10.1038/35018003 . ПМИД 10910347 .
^ Ван Слейс М.А. и др. (2003). «Сравнительный анализ полных последовательностей генома штаммов болезни Пирса и цитрусового пестролистного хлороза Xylella fastidiosa » . J Бактериол . 185 (3): 1018–26. дои : 10.1128/JB.185.3.1018-1026.2003 . ПМК 142809 . ПМИД 12533478 .
^ Чейн П.С. и др. (2006). «Полная последовательность генома Yersinia pestis штаммов Antiqua и Nepal516: свидетельства редукции генов в новом патогене» . J Бактериол . 188 (12): 4453–63. дои : 10.1128/JB.00124-06 . ПМК 1482938 . ПМИД 16740952 .
^ Паркхилл Дж. и др. (2001). «Последовательность генома Yersinia pestis , возбудителя чумы» . Природа . 413 (6855): 523–7. Бибкод : 2001Natur.413..523P . дои : 10.1038/35097083 . ПМИД 11586360 .
^ Дэн В. и др. (2002). «Последовательность генома Yersinia pestis KIM» . J Бактериол . 184 (16): 4601–11. дои : 10.1128/JB.184.16.4601-4611.2002 . ПМЦ 135232 . ПМИД 12142430 .
^ Сонг Ю и др. (2004). «Полная последовательность генома штамма Yersinia pestis 91001, изолята, авирулентного для человека» . ДНК Рез . 11 (3): 179–97. дои : 10.1093/dnares/11.3.179 . ПМИД 15368893 .
^ Чейн П.С. и др. (2004). «Понимание эволюции Yersinia pestis посредством сравнения всего генома с Yersinia pseudotuberculosis » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (38): 13826–31. Бибкод : 2004PNAS..10113826C . дои : 10.1073/pnas.0404012101 . ПМК 518763 . ПМИД 15358858 .
^ Рендулич С. и др. (2004). «Хищник без маски: жизненный цикл Bdellovibrio бактериоворуса с точки зрения генома». Наука . 303 (5658): 689–92. Бибкод : 2004Sci...303..689R . дои : 10.1126/science.1093027 . ПМИД 14752164 . S2CID 38154836 .
^ Паркхилл Дж. и др. (2000). «Последовательность генома пищевого патогена Campylobacter jejuni обнаруживает гипервариабельные последовательности» . Природа . 403 (6770): 665–8. Бибкод : 2000Natur.403..665P . дои : 10.1038/35001088 . ПМИД 10688204 .
^ Фаутс Д.Е. и др. (2005). «Основные структурные различия и новые потенциальные механизмы вирулентности геномов нескольких видов Campylobacter » . ПЛОС Биол . 3 (1): е15. doi : 10.1371/journal.pbio.0030015 . ПМК 539331 . ПМИД 15660156 .
^ Гейдельберг Дж. Ф. и др. (2004). «Последовательность генома анаэробной сульфатредуцирующей бактерии Desulfovibrio vulgaris Hildenborough » . Нат Биотехнология . 22 (5): 554–9. дои : 10.1038/nbt959 . ПМИД 15077118 .
^ Мете Б.А. и др. (2003). «Геном Geobacterulferreducens : восстановление металлов в подземных средах». Наука . 302 (5652): 1967–9. Бибкод : 2003Sci...302.1967M . CiteSeerX 10.1.1.186.3786 . дои : 10.1126/science.1088727 . ПМИД 14671304 . S2CID 38404097 .
^ Суербаум С. и др. (2003). «Полная последовательность генома канцерогенной бактерии Helicobacter hepaticus » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (13): 7901–6. Бибкод : 2003PNAS..100.7901S . дои : 10.1073/pnas.1332093100 . ПМК 164685 . ПМИД 12810954 .
^ Могила Дж.Ф. и др. (1997). «Полная последовательность генома желудочного возбудителя Helicobacter pylori » . Природа . 388 (6642): 539–47. Бибкод : 1997Natur.388..539T . дои : 10.1038/41483 . ПМИД 9252185 .
^ Альм Р.А. и др. (1999). «Сравнение геномных последовательностей двух неродственных изолятов человеческого желудочного патогена Helicobacter pylori ». Природа . 397 (6715): 176–80. Бибкод : 1999Natur.397..176A . дои : 10.1038/16495 . ПМИД 9923682 . S2CID 4317442 .
^ Ваннуччи, Фабио Аугусто (2013). Пролиферативная энтеропатия: патогенез и адаптация хозяина (кандидатская диссертация). Университет Миннесоты.
^ Шнайкер; и др. (2007). «Полная последовательность генома миксобактерии Sorangium cellulosum» . Природная биотехнология . 25 (11): 1281–1289. дои : 10.1038/nbt1354 . ПМИД 17965706 .
^ Зиверт, С.М.; К.М. Скотт; М.Г. Клоц; Сеть «ПСЖ»; Л. Дж. Хаузер; Дж. Хэмп; М. Хуглер; М. Лэнд; А. Лапид; Ф.В. Лаример; С. Лукас; С.А. Малфатти; Ф. Мейер; И.Т. Паульсен; В. Рен; Дж. Саймон; класс геномики USF (декабрь 2007 г.). «Геном эпсилонпротеобактериального хемолитоавтотрофа Sulfurimonas denitrificans » . Прикладная и экологическая микробиология . 74 (4): 1145–1156. дои : 10.1128/АЕМ.01844-07 . ISSN 0099-2240 . ПМК 2258580 . ПМИД 18065616 .
^ Баар С. и др. (2003). «Полное секвенирование генома и анализ Wolinella succinogenes » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (20): 11690–5. Бибкод : 2003PNAS..10011690B . дои : 10.1073/pnas.1932838100 . ПМК 208819 . ПМИД 14500908 .
^ Фрейзер CM и др. (1997). «Геномная последовательность спирохеты болезни Лайма, Borrelia burgdorferi » . Природа . 390 (6660): 580–6. Бибкод : 1997Natur.390..580F . дои : 10.1038/37551 . ПМИД 9403685 . S2CID 4388492 .
^ Глёкнер Г. и др. (2004). «Сравнительный анализ генома Borrelia garinii » . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (20): 6038–46. дои : 10.1093/nar/gkh953 . ПМК 534632 . ПМИД 15547252 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Рен С.С. и др. (2003). «Уникальные физиологические и патогенетические особенности Leptospira interrogans, выявленные методом полногеномного секвенирования» . Природа . 422 (6934): 888–93. Бибкод : 2003Natur.422..888R . дои : 10.1038/nature01597 . ПМИД 12712204 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Насименто А.Л. и др. (2004). «Сравнительная геномика двух сероваров Leptospira interrogans открывает новое понимание физиологии и патогенеза» . J Бактериол . 186 (7): 2164–72. дои : 10.1128/JB.186.7.2164-2172.2004 . ПМК 374407 . ПМИД 15028702 .
^ Сешадри Р. и др. (2004). «Сравнение генома орального возбудителя Treponema denticola с геномами других спирохет» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (15): 5646–51. Бибкод : 2004PNAS..101.5646S . дои : 10.1073/pnas.0307639101 . ПМЦ 397461 . ПМИД 15064399 .
^ Фрейзер CM и др. (1998). «Полная последовательность генома бледной трепонемы , спирохеты сифилиса». Наука . 281 (5375): 375–88. Бибкод : 1998Sci...281..375F . дои : 10.1126/science.281.5375.375 . ПМИД 9665876 .
^ Го, З; и др. (октябрь 2011 г.). «Последовательность генома штамма 1340 возбудителя уток Mycoplasma anatis » . Дж. Бактериол . 193 (20): 5883–5884. дои : 10.1128/jb.05891-11 . ПМК 3187216 . ПМИД 21952548 .
^ Папазиси Л. и др. (2003). «Полная последовательность генома птичьего патогена Mycoplasma Gallisepticum, штамм R (низкий)» . Микробиология . 149 (Часть 9): 2307–16. дои : 10.1099/mic.0.26427-0 . ПМИД 12949158 .
^ Фрейзер CM и др. (1995). «Минимальный набор генов Mycoplasmagentium ». Наука . 270 (5235): 397–403. Бибкод : 1995Sci...270..397F . дои : 10.1126/science.270.5235.397 . ПМИД 7569993 . S2CID 29825758 .
^ Миньон ФК и др. (2004). «Последовательность генома штамма Mycoplasma hyopneumoniae 232, возбудителя микоплазмоза свиней» . J Бактериол . 186 (21): 7123–33. дои : 10.1128/JB.186.21.7123-7133.2004 . ПМК 523201 . ПМИД 15489423 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Васконселос А.Т. и др. (2005). «Патогены свиней и домашней птицы: полные последовательности генома двух штаммов Mycoplasma hyopneumoniae и штамма Mycoplasma synoviae » . J Бактериол . 187 (16): 5568–77. дои : 10.1128/JB.187.16.5568-5577.2005 . ПМК 1196056 . ПМИД 16077101 .
^ Яффе Дж.Д. и др. (2004). «Полный геном и протеом Mycoplasma mobile » . Геном Рез . 14 (8): 1447–61. дои : 10.1101/гр.2674004 . ПМК 509254 . ПМИД 15289470 .
^ Вестберг Дж. и др. (2004). «Последовательность генома Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC, штамм типа PG1T, возбудителя контагиозной плевропневмонии крупного рогатого скота (CBPP)» . Геном Рез . 14 (2): 221–7. дои : 10.1101/гр.1673304 . ПМК 327097 . ПМИД 14762060 .
^ Сасаки Й. и др. (2002). «Полная геномная последовательность Mycoplasma penetrans , внутриклеточного бактериального патогена человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 30 (23): 5293–300. дои : 10.1093/нар/gkf667 . ПМК 137978 . ПМИД 12466555 .
^ Химмельрайх Р. и др. (1996). «Полный анализ последовательности генома бактерии Mycoplasma pneumoniae » . Нуклеиновые кислоты Рез . 24 (22): 4420–49. дои : 10.1093/нар/24.22.4420 . ПМК 146264 . ПМИД 8948633 .
^ Шамбо I и др. (2001). «Полная последовательность генома мышиного респираторного патогена Mycoplasma pulmonis » . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (10): 2145–53. дои : 10.1093/нар/29.10.2145 . ПМК 55444 . ПМИД 11353084 .
^ Осима К. и др. (2004). «Редуктивная эволюция, предложенная на основе полной последовательности генома фитоплазмы, патогенной для растений» . Нат Жене . 36 (1): 27–9. дои : 10.1038/ng1277 . ПМИД 14661021 .
^ Гласс Дж.И. и др. (2000). «Полная последовательность возбудителя слизистой оболочки Ureaplasma urealyticum ». Природа . 407 (6805): 757–62. Бибкод : 2000Natur.407..757G . дои : 10.1038/35037619 . ПМИД 11048724 . S2CID 205009765 .
^ Андерсон, я; и др. (2012). «Полная последовательность генома термофильной сульфатредуцирующей океанской бактерии Thermodesulfatator indicus штамма типа (CIR29812 (T))» . Стоять. Геномная наука . 6 (2): 155–64. дои : 10.4056/sigs.2665915 . ПМЦ 3387792 . ПМИД 22768359 .
^ Элкинс, Дж. Г.; и др. (2013). «Полная последовательность генома гипертермофильной сульфатредуцирующей бактерии Thermodesulfobacterium geofontis OPF15T» . Анонс генома . 1 (2): e00162–13. doi : 10.1128/genomeA.00162-13 . ПМЦ 3624685 . ПМИД 23580711 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Жахыбаеваа О.; и др. (2009). «О химерной природе, термофильном происхождении и филогенетическом размещении Thermotogales» . ПНАС . 106 (14): 5865–5870. Бибкод : 2009PNAS..106.5865Z . дои : 10.1073/pnas.0901260106 . ПМК 2667022 . ПМИД 19307556 .
^ Суитерс, Канзас; и др. (2011). «Последовательность генома штамма Kosmotoga olearia TBF 19.5.1, термофильной бактерии с широким диапазоном температур роста, выделенной с нефтяной платформы Тролль B в Северном море» . Дж. Бактериол . 193 (19): 5566–5567. дои : 10.1128/JB.05828-11 . ПМК 3187421 . ПМИД 21914881 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
^ Жахыбаева О.; и др. (2012). «Последовательность генома мезофильной бактерии Thermotogales Bacterium Mesotoga prima MesG1.Ag.4.2 обнаруживает самый большой на сегодняшний день геном Thermotogales» . Геном Биол Эвол . 4 (8): 700–708. дои : 10.1093/gbe/evs059 . ПМЦ 3516359 . ПМИД 22798451 .
^ Несбё, КЛ; и др. (2009). «Геном Thermosipho africanus TCF52B: латеральные генетические связи с фирмикутами и архей» . Дж. Бактериол . 191 (6): 1974–1978. дои : 10.1128/JB.01448-08 . ПМЦ 2648366 . ПМИД 19124572 .
^ Нельсон К.Е. и др. (1999). «Доказательства латерального переноса генов между архей и бактериями из последовательности генома Thermotoga maritima ». Природа . 399 (6734): 323–9. Бибкод : 1999Natur.399..323N . дои : 10.1038/20601 . ПМИД 10360571 . S2CID 4420157 .
^ Латиф, Хайтем; и др. (2013). «Организация генома Thermotoga maritima отражает ее образ жизни» . ПЛОС Генетика . 9 (4): e1003485. дои : 10.1371/journal.pgen.1003485 . ПМЦ 3636130 . ПМИД 23637642 .

Внешние ссылки

BacMap — современный электронный атлас аннотированных геномов бактерий.
База данных сравнительной геномики SUPERFAMILY Включает геномы полностью секвенированных прокариот, а также сложные средства сбора данных и инструменты визуализации для анализа.

[EntrezG-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль ^{являюсь} ^а ^к ^ап ^ак ^с ^как ^в ^В ^из ^хорошо ^топор ^{является} ^тот ^нет ^бб ^{до нашей эры} ^др. ^быть ^парень ^бг ^чб ^с ^минет ^БК ^с ^бм ^млрд ^быть ^б.п. ^БК ^бр ^бс ^БТ ^этот ^бв ^б ^бх ^к ^бз ^что ^CB ^копия ^{компакт-диск} ^Этот ^см. ^cg ^ч ^Там ^СиДжей ^ск ^кл ^см ^CN ^со ^КП ^cq ^кр ^CS ^КТ ^с ^резюме ^cw ^сх ^сай ^{чешский} ^и ^БД ^{округ Колумбия} «Поиск в базе данных генома Энтреза» . Национальный центр биотехнологической информации. Найдите подробную информацию о конкретных геномах по названию организма и штамму.

[2] Тахон Дж. и др. (2018). «Abditibacterium utsteinense sp. nov., первый культивируемый представитель кандидатного типа FBP, выделенный из образцов незамерзающей антарктической почвы». Сист. Прил. Микробиол . 41 (4): 279–290. Бибкод : 2018СиАпМ..41..279Т . дои : 10.1016/j.syapm.2018.01.009 . ПМИД 29475572 . S2CID 3515091 .

[3] Шелл М.А. и др. (2002). «Последовательность генома Bifidobacterium longum отражает ее адаптацию к желудочно-кишечному тракту человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (22): 14422–7. Бибкод : 2002PNAS...9914422S . дои : 10.1073/pnas.212527599 . ПМЦ 137899 . ПМИД 12381787 .

[4] Серденьо-Таррага А.М. и др. (2003). «Полная последовательность генома и анализ Corynebacterium diphtheriae NCTC13129» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (22): 6516–23. дои : 10.1093/nar/gkg874 . ПМК 275568 . ПМИД 14602910 .

[5] Нишио И. и др. (2003). «Сравнительный полный анализ последовательности генома аминокислотных замен, ответственных за термостабильность Corynebacterium efficiens » . Геном Рез . 13 (7): 1572–9. дои : 10.1101/гр.1285603 . ПМК 403753 . ПМИД 12840036 .

[6] Тауч А. и др. (2005). «Полное секвенирование генома и анализ мультирезистентного внутрибольничного патогена Corynebacterium jeikeium K411, липид-требующей бактерии флоры кожи человека» . J Бактериол . 187 (13): 4671–82. дои : 10.1128/JB.187.13.4671-4682.2005 . ПМЦ 1151758 . ПМИД 15968079 .

[7] Ли Л и др. (2005). «Полная последовательность генома Mycobacterium avium подвида paratuberculosis » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (35): 12344–9. Бибкод : 2005PNAS..10212344L . дои : 10.1073/pnas.0505662102 . ПМК 1194940 . ПМИД 16116077 .

[8] Гарнье Т. и др. (2003). «Полная последовательность генома Mycobacterium bovis » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (13): 7877–82. Бибкод : 2003PNAS..100.7877G . дои : 10.1073/pnas.1130426100 . ПМК 164681 . ПМИД 12788972 .

[9] Коул С.Т. и др. (2001). «Массовый распад генов бациллы проказы». Природа . 409 (6823): 1007–11. Бибкод : 2001Natur.409.1007C . дои : 10.1038/35059006 . ПМИД 11234002 . S2CID 4307207 .

[10] Коул С.Т. и др. (1998). «Расшифровка биологии микобактерии туберкулеза по полной последовательности генома» . Природа . 393 (6685): 537–44. Бибкод : 1998Natur.393..537C . дои : 10.1038/31159 . ПМИД 9634230 .

[11] Исикава Дж. и др. (2004). «Полная геномная последовательность Nocardia Farcinica IFM 10152» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (41): 14925–30. Бибкод : 2004PNAS..10114925I . дои : 10.1073/pnas.0406410101 . ПМК 522048 . PMID 15466710 .

[12] Омура С. и др. (2001). «Последовательность генома промышленного микроорганизма Streptomyces avermitilis : выявление способности производить вторичные метаболиты» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (21): 12215–20. Бибкод : 2001PNAS...9812215O . дои : 10.1073/pnas.211433198 . ПМК 59794 . ПМИД 11572948 .

[13] Реденбах М. и др. (1996). «Набор упорядоченных космид и подробная генетическая и физическая карта хромосомы Streptomyces coelicolor A3 (2) размером 8 Мб». Мол Микробиол . 21 (1): 77–96. дои : 10.1046/j.1365-2958.1996.6191336.x . ПМИД 8843436 . S2CID 30241692 .

[14] Уэда К. и др. (2004). «Последовательность генома Symbiobacterium thermophilum , некультивируемой бактерии, зависящей от микробного комменсализма» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (16): 4937–44. дои : 10.1093/nar/gkh830 . ПМК 519118 . ПМИД 15383646 .

[15] Декерт Г. и др. (1998). «Полный геном гипертермофильной бактерии Aquifex aeolicus » . Природа . 392 (6674): 353–8. Бибкод : 1998Natur.392..353D . дои : 10.1038/32831 . ПМИД 9537320 .

[16] Серденьо-Таррага А.М. и др. (2005). «Обширные инверсии ДНК в геноме B. fragilis контролируют экспрессию переменных генов» (PDF) . Наука . 307 (5714): 1463–5. Бибкод : 2005Sci...307.1463C . дои : 10.1126/science.1107008 . ПМИД 15746427 . S2CID 43623586 .

[17] Кувахара, Т; и др. (2004). «Геномный анализ Bacteroides fragilis выявил обширные инверсии ДНК, регулирующие адаптацию клеточной поверхности» . ПНАС . 101 (41): 14919–14924. Бибкод : 2004PNAS..10114919K . дои : 10.1073/pnas.0404172101 . ПМК 522005 . ПМИД 15466707 .

[18] Сюй Дж и др. (2003). «Геномный взгляд на симбиоз человека и Bacteroides thetaiotaomicron ». Наука . 299 (5615): 2074–6. Бибкод : 2003Sci...299.2074X . дои : 10.1126/science.1080029 . ПМИД 12663928 . S2CID 34071235 .

[19] Шмитц-Эссер, С.; и др. (2010). «Геном симбионта амебы Candidatus Amoebophilus asiaticus обнаруживает общие механизмы взаимодействия клеток-хозяев среди бактерий, связанных с амебами» . Дж. Бактериол . 192 (4): 1045–1057. дои : 10.1128/JB.01379-09 . ПМК 2812958 . ПМИД 20023027 .

[20] Эйзен Дж.А. и др. (2002). «Полная последовательность генома Chlorobium tepidum TLS, фотосинтезирующей анаэробной зелено-серной бактерии» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (14): 9509–14. Бибкод : 2002PNAS...99.9509E . дои : 10.1073/pnas.132181499 . ПМЦ 123171 . ПМИД 12093901 .

[21] Се, Г; и др. (июнь 2007 г.). «Последовательность генома целлюлолитической скользящей бактерии Cytophaga hutchinsonii » . Appl Environ Microbiol . 73 (11): 3536–3546. Бибкод : 2007ApEnM..73.3536X . дои : 10.1128/АЕМ.00225-07 . ЧВК 1932680 . ПМИД 17400776 .

[22] Далиго, Х.; и др. (2011). «Полная последовательность генома штамма типа Haliscomenobacter Hydrossis (O)» . Стенд Genomic Sci . 4 (3): 352–360. дои : 10.4056/sigs.1964579 . ПМК 3156403 . ПМИД 21886862 .

[23] Найто, М; и др. (2008). «Определение последовательности генома штамма Porphyromonas gingivalis ATCC 33277 и сравнение генома со штаммом W83 выявили обширные перестройки генома P. gingivalis » . ДНК Рез . 15 (4): 215–225. дои : 10.1093/dnares/dsn013 . ПМК 2575886 . ПМИД 18524787 .

[24] Нельсон К.Е. и др. (2003). «Полная последовательность генома патогенного для полости рта штамма Bacterium porphyromonas gingivalis W83» . J Бактериол . 185 (18): 5591–601. дои : 10.1128/JB.185.18.5591-5601.2003 . ЧВК 193775 . ПМИД 12949112 .

[25] Монгодин Э.Ф. и др. (2005). «Геном Salinibacter Ruber : конвергенция и обмен генами среди гипергалофильных бактерий и архей» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (50): 18147–52. Бибкод : 2005PNAS..10218147M . дои : 10.1073/pnas.0509073102 . ПМК 1312414 . ПМИД 16330755 .

[26] Пена, А; и др. (2010). «Мелкомасштабная эволюция: геномная, фенотипическая и экологическая дифференциация двух сосуществующих штаммов Salinibacter Ruber » . ИСМЕ Дж . 4 (7): 882–895. Бибкод : 2010ISMEJ...4..882P . дои : 10.1038/ismej.2010.6 . ПМИД 20164864 .

[27] ван Пассел, Марк У.Дж.; Кант, Рави; Зотендаль, Эрвин Г.; Плагг, Кэролайн М.; Дерриен, Мюриэл; Малфатти, Стефани А.; Чейн, Патрик С.Г.; Войке, Таня; Палва, Эйр (01 января 2011 г.). «Геном Akkermansia muciniphila, специального деградатора кишечного муцина, и его использование в изучении кишечных метагеномов» . ПЛОС ОДИН 6 (3): e16876. Бибкод : 2011PLoSO...616876V . дои : 10.1371/journal.pone.0016876 . ISSN 1932-6203 . ПМК 3048395 . ПМИД 21390229 .

[28] Капуто, Аурелия; Дюбур, Грегори; Кроче, Оливье; Гупта, Сушим; Роберт, Кэтрин; Папазян, Лоран; Ролен, Жан-Марк; Рауль, Дидье (19 февраля 2015 г.). «Полногеномная сборка Akkermansia muciniphila, секвенированная непосредственно из стула человека» . Биология Директ . 10 :5. дои : 10.1186/s13062-015-0041-1 . ISSN 1745-6150 . ПМЦ 4333879 . ПМИД 25888298 .

[nar.oxfordjournals.org-29] Перейти обратно: ^а ^б Прочтите TD и др. (2000). «Последовательности генома Chlamydia trachomatis MoPn и Chlamydia pneumoniae AR39» . Нуклеиновые кислоты Рез . 28 (6): 1397–406. дои : 10.1093/нар/28.6.1397 . ПМК 111046 . ПМИД 10684935 .

[30] Карлсон Дж. Х. и др. (2005). «Сравнительный геномный анализ Chlamydia trachomatis окулотропных и генитотропных штаммов » . Инфекция и иммунитет . 73 (10): 6407–18. дои : 10.1128/IAI.73.10.6407-6418.2005 . ПМЦ 1230933 . ПМИД 16177312 .

[31] Стивенс Р.С. и др. (1998). «Последовательность генома облигатного внутриклеточного возбудителя человека: Chlamydia trachomatis ». Наука . 282 (5389): 754–9. Бибкод : 1998Sci...282..754S . дои : 10.1126/science.282.5389.754 . ПМИД 9784136 .

[32] Томсон Н.Р. и др. (2005). « Последовательность генома Chlamydophila abortus обнаруживает ряд вариабельных белков, которые способствуют межвидовой изменчивости» . Геном Рез . 15 (5): 629–40. дои : 10.1101/гр.3684805 . ПМЦ 1088291 . ПМИД 15837807 .

[33] Прочтите TD и др. (2003). «Последовательность генома Chlamydophila caviae ( Chlamydia psittaci GPIC): изучение роли генов, специфичных для ниши, в эволюции Chlamydiaceae» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (8): 2134–47. дои : 10.1093/нар/gkg321 . ПМЦ 153749 . ПМИД 12682364 .

[34] Азума, Ю.; Хиракава, Х.; Ямасита, А.; Кай, Ю.; Рахман, Массачусетс; Сузуки, Х.; Митаку, С.; Тох, Х.; и др. (февраль 2006 г.). «Последовательность генома возбудителя кошек Chlamydophila felis » . ДНК Рез . 13 (1): 15–2 дои : 10.1093/dnares/dsi027 . ПМИД 16766509 .

[35] Калман С. и др. (1999). «Сравнительные геномы Chlamydia pneumoniae и C. trachomatis ». Нат Жене . 21 (4): 385–9. дои : 10.1038/7716 . ПМИД 10192388 . S2CID 24629065 .

[36] Шираи, М; Хиракава, Х; Оучи, К; Табучи, М; Киши, Ф; Кимото, М; Такеучи, Х; Нисида, Дж; Шибата, К; Фудзинага, Р; Йонеда, Х; Мацусима, Х; Танака, К; Фурукава, С; Миура, К; Наказава, А; Исии, К; Шиба, Т; Хаттори, М; Кухара, С; Наказава, Т. (июнь 2000 г.). «Сравнение генов белков внешней мембраны omp и pmp в полногеномных последовательностях изолятов Chlamydia pneumoniae из Японии и США» . J Заразить Дис . 181 (Приложение 3): S524–7. дои : 10.1086/315616 . ПМИД 10839753 .

[37] Хорн М. и др. (2004). «Освещение эволюционной истории хламидий» . Наука . 304 (5671): 728–30. Бибкод : 2004Sci...304..728H . дои : 10.1126/science.1096330 . ПМИД 15073324 . S2CID 39036549 .

[38] Сешадри Р. и др. (2005). «Последовательность генома дехлорирующей PCE бактерии Dehalococcoides ethenogenes » . Наука . 307 (5706): 105–8. Бибкод : 2005Sci...307..105S . дои : 10.1126/science.1102226 . ПМИД 15637277 . S2CID 15601443 .

[39] Кубе М. и др. (2005). дышащего хлорированными соединениями, бактерии Dehalococcoides «Последовательность генома штамма CBDB1, » . Нат Биотехнология . 23 (10): 1269–73. дои : 10.1038/nbt1131 . ПМИД 16116419 .

[ReferenceA-40] Перейти обратно: ^а ^б Пёриц, М.; Горис, Т.; Вубет, Т.; Таркка, Монтана; Бускот, Ф.; Ниенхейс, И.; Лехнер, У.; Адриан, Л. (июнь 2013 г.). «Последовательности генома двух специалистов по дегалогенированию - штаммов Dehalococcoides mccartyi BTF08 и DCMB5, обогащенных из сильно загрязненного региона Биттерфельд» . FEMS Microbiol Lett . 343 (2): 101–4. дои : 10.1111/1574-6968.12160 . ПМИД 23600617 .

[41] ДНК Рез. 31 октября 2001 г.; 8(5): 205-13, 8(5): 205-13; 227-53

[aem.asm.org-42] Перейти обратно: ^а ^б Аллевальт Дж.П. и др. (2006). «Влияние температуры и света на рост и фотосинтез изолятов Synechococcus, типичных для тех, которые преобладают в сообществе весенних микробных матов осьминогов Йеллоустонского национального парка» . Appl Environ Microbiol . 72 (1): 544–50. Бибкод : 2006ApEnM..72..544A . дои : 10.1128/АЕМ.72.1.544-550.2006 . ПМЦ 1352173 . ПМИД 16391090 .

[43] Накамура Ю. и др. (2003). «Полная структура генома Gloeobacter violaceus PCC 7421, цианобактерии, лишенной тилакоидов» . ДНК Рез . 10 (4): 137–45. дои : 10.1093/dnares/10.4.137 . ПМИД 14621292 .

[Rocap-44] Перейти обратно: ^а ^б Рокап Г и др. (2003). «Дивергенция генома двух экотипов Prochromococcus отражает дифференциацию океанических ниш» . Природа . 424 (6952): 1042–7. Бибкод : 2003Natur.424.1042R . дои : 10.1038/nature01947 . ПМИД 12917642 . S2CID 4344597 .

[45] Дюфрен А. и др. (2003). «Последовательность генома цианобактерии Prochromococcus marinus SS120, почти минимального оксифототрофного генома» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (17): 10020–5. Бибкод : 2003PNAS..10010020D . дои : 10.1073/pnas.1733211100 . ЧВК 187748 . ПМИД 12917486 .

[46] Паленик Б и др. (2003). «Геном подвижного морского синехококка » . Природа . 424 (6952): 1037–42. Бибкод : 2003Natur.424.1037P . дои : 10.1038/nature01943 . ПМИД 12917641 .

[47] Канеко, Т.; и др. (1995). «Анализ последовательностей генома одноклеточного штамма Cyanobacterium Synechocystis sp. PCC6803. I. Особенности последовательностей в области размером 1 МБ из позиций на карте от 64% до 92% генома» . ДНК Рез . 2 (4): 153–66. дои : 10.1093/dnares/2.4.153 . ПМИД 8590279 .

[48] Поцелуй, Х; Ланг, Э; Лапидус, А; Коупленд, А; Нолан, М; Главина Дель Рио, Т; Чен, Ф; Лукас, С; Тайс, Х; Ченг, Дж. Ф.; Хан, С; Гудвин, Л; Питлак, С; Лиолиос, К; Пати, А; Иванова Н; Мавроматис, К; Чен, А; Паланиаппан, К; Земля, М; Хаузер, Л; Чанг, YJ; Джеффрис, компакт-диск; Деттер, Дж.К.; Бреттин, Т; Весна, С; Роде, М; Гёкер, М; Войк, Т; и др. (2010). «Полная последовательность генома штамма типа Denitrovibrio acetiphilus (N2460)» . Стандарты в геномных науках . 2 (3): 270–9. doi : 10.4056/sig.892105 . ПМК 3035293 . ПМИД 21304711 .

[49] Питлак, С; Сикорски, Дж.; Оливия, А; Лапидус, А; Нолан, М; Лукас, С; Хэммон, Н.; Дешпанде, С; Ченг, JF; Тапиа, Р; Хан, С; Гудвин, Л; Лиолиос, К; Пагани, я; Иванова Н; Мавроматис, К; Пати, А; Чен, А; Паланиаппан, К.; Хаузер, Л; Чанг, YJ; Джеффрис, компакт-диск; Деттер, Джей Си; Брамбилла, Э; Джао, О.Д.; Роде, М; Весна, С; Гёкер, М; Войк, Т; и др. (2011). «Полная последовательность генома штамма типа Calditerrivibrio nitroreducens (Yu37-1)» . Стандарты в геномных науках . 4 (1): 54–6 дои : 10.4056/sig.1523807 . ПМК 3072091 . ПМИД 21475587 .

[50] Такаки, Ю; Шимамура, С; Накагава, С; Фукухара, Ю; Хорикава, Х; Анкай, А; Харада, Т; Хосояма, А; Огучи, А; Фукуи, С; Фудзита, Н.; Таками, Х; Такай, К. (2010). «Образ жизни бактерий в трубе глубоководных гидротермальных источников, выявленный с помощью последовательности генома термофильной бактерии Deferribacter desulfuricans SSM1» . Исследование ДНК . 17 (3): 123–37. дои : 10.1093/dnares/dsq005 . ПМЦ 2885270 . ПМИД 20189949 .

[51] Лапидус, А; Чертков О.; Нолан, М; Лукас, С; Хэммон, Н.; Дешпанде, С; Ченг, Дж. Ф.; Тапиа, Р; Хан, С; Гудвин, Л; Питлак, С; Лиолиос, К; Пагани, я; Иванова Н; Хантеманн, М; Мавроматис, К; Михайлова Н; Пати, А; Чен, А; Паланиаппан, К; Земля, М; Хаузер, Л; Брамбилла, EM; Роде, М; Абт, Б; Весна, С; Гёкер, М; Бристоу, Дж; Эйзен, Дж. А.; и др. (2011). «Последовательность генома умеренно термофильного галофильного штамма Flexistipes sinusarabici (MAS10)» . Стандарты в геномных науках . 5 (1): 86–96. дои : 10.4056/sigs.2235024 . ПМК 3236037 . ПМИД 22180813 .

[52] Де Гроот, Арьян; и др. (2009). «Альянс протеомики и геномики для раскрытия особенностей сахарской бактерии Deinococcus Deserti » . ПЛОС Генет . 5 (3): e1000434. дои : 10.1371/journal.pgen.1000434 . ПМК 2669436 . ПМИД 19370165 .

[53] Юань, М; и др. (2012). «Последовательность генома и анализ транскриптома радиорезистентной бактерии Deinococcus gobiensis : понимание экстремальной адаптации к окружающей среде» . ПЛОС ОДИН . 7 (3): e34458. Бибкод : 2012PLoSO...734458Y . дои : 10.1371/journal.pone.0034458 . ПМК 3314630 . ПМИД 22470573 .

[54] Уайт О и др. (1999). «Последовательность генома радиорезистентной бактерии Deinococcus radiodurans R1» . Наука . 286 (5444): 1571–7. дои : 10.1126/science.286.5444.1571 . ПМК 4147723 . ПМИД 10567266 .

[55] Сикорски, Дж; и др. (2010). «Полная последовательность генома штамма типа Meiothermus silvanus (VI-R2)» . Стенд Genomic Sci . 3 (1): 37–46. дои : 10.4056/sig.1042812 . ПМК 3035272 . ПМИД 21304690 .

[56] Гундер, Камини; и др. (2011). «Последовательность гиперпластического генома естественно компетентного Thermus scotoductus SA-01» . БМК Геномика . 12 :577. дои : 10.1186/1471-2164-12-577 . ПМЦ 3235269 . ПМИД 22115438 .

[57] Хенне А. и др. (2004). «Последовательность генома крайнего термофила Thermus thermophilus » . Нат Биотехнология . 22 (5): 547–53. дои : 10.1038/nbt956 . ПМИД 15064768 . S2CID 25469576 .

[58] Монтейро-Виторелло, CB.; КАМАРГО, LE.; Ван Слейс, Массачусетс; Китадзима, Япония; Трюффи, Д.; до Амарал, AM .; Харакава, Р.; де Оливейра, JC; и др. (август 2004 г.). «Последовательность генома грамположительного возбудителя сахарного тростника Leifsonia xyli subsp. xyli » . Мол Растительный Микроб Взаимодействие . 17 (8): 827–36. дои : 10.1094/MPMI.2004.17.8.827 . hdl : 11449/67815 . ПМИД 15305603 .

[59] Лю, Дж.; Ченг, А.; Бангаян, Нью-Джерси; Барнард, Э.; Курд, Э.; Крафт, Н.; Ли, Х. (2014). «Проект геномных последовательностей штамма Propionibacterium Acnes типа ATCC6919 и устойчивого к антибиотикам штамма HL411PA1» . Анонс генома . 2 (4): e00740–14. doi : 10.1128/genomeA.00740-14 . ПМК 4132614 . ПМИД 25125638 .

[60] Бентли, Южная Дакота; Майвальд, М.; Мерфи, доктор медицинских наук; Паллен, МЮ; Йейтс, Калифорния; Дувр, LG.; Норбертчак, ХТ; Бесра, ГС; и др. (февраль 2003 г.). «Секвенирование и анализ генома бактерии болезни Уиппла Tropheryma whipplei ». Ланцет . 361 (9358): 637–44. дои : 10.1016/S0140-6736(03)12597-4 . ПМИД 12606174 . S2CID 8743326 .

[61] Рауль Д. и др. (2003). « Троферима Уипплей Твист: патогенная для человека актинобактерия с редуцированным геномом» . Геном Рез . 13 (8): 1800–9. дои : 10.1101/гр.1474603 . ПМК 403771 . ПМИД 12902375 . Проверено 21 июня 2016 г.

[62] Прочтите TD и др. (2003). «Последовательность генома Bacillus anthracis Ames и сравнение с близкородственными бактериями» (PDF) . Природа . 423 (6935): 81–6. Бибкод : 2003Natur.423...81R . дои : 10.1038/nature01586 . ПМИД 12721629 . S2CID 504400 .

[63] Раско Д.А. и др. (2004). «Последовательность генома Bacillus cereus ATCC 10987 обнаруживает метаболические адаптации и большую плазмиду, родственную Bacillus anthracis pXO1» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (3): 977–88. дои : 10.1093/nar/gkh258 . ПМЦ 373394 . ПМИД 14960714 .

[64] Иванова Н и др. (2003). «Последовательность генома Bacillus cereus и сравнительный анализ с Bacillus anthracis » . Природа . 423 (6935): 87–91. Бибкод : 2003Natur.423...87I . дои : 10.1038/nature01582 . ПМИД 12721630 .

[65] Кобаяши Т. и др. (1995). «Очистка и свойства щелочной протеазы из алкалофильной Bacillus sp. KSM-K16». Appl Microbiol Biotechnol . 43 (3): 473–81. дои : 10.1007/BF00218452 . ПМИД 7632397 . S2CID 6077293 .

[66] Таками Х. и др. (1999). «Улучшенная физическая и генетическая карта генома алкалофильной Bacillus sp. C-125». Экстремофилы . 3 (1): 21–8. дои : 10.1007/s007920050095 . ПМИД 10086841 . S2CID 1180141 .

[67] Рей М.В. и др. (2004). «Полная последовательность генома промышленной бактерии Bacillus licheniformis и сравнение с близкородственными видами Bacillus » . Геном Биол . 5 (10): Р77. дои : 10.1186/gb-2004-5-10-r77 . ПМЦ 545597 . ПМИД 15461803 .

[Veith-68] Перейти обратно: ^а ^б Вейт Б. и др. (2004). «Полная последовательность генома Bacillus licheniformis DSM13, организма с большим промышленным потенциалом» . J Мол Микробиол Биотехнология . 7 (4): 204–11. дои : 10.1159/000079829 . ПМИД 15383718 .

[69] Кунст Ф. и др. (1997). «Полная последовательность генома грамположительной бактерии Bacillus subtilis » . Природа . 390 (6657): 249–56. Бибкод : 1997Natur.390..249K . дои : 10.1038/36786 . ПМИД 9384377 .

[70] Хан, CS.; Се, Г.; Чаллакомб, Дж. Ф.; Альтерр, г-н; Бхотика, СС.; Браун, Н.; Брюс, Д.; Кэмпбелл, CS; и др. (май 2006 г.). «Анализ патогеномной последовательности изолятов Bacillus cereus и Bacillus thuringiensis, тесно связанных с Bacillus anthracis » . J Бактериол . 188 (9): 3382–90. дои : 10.1128/JB.188.9.3382-3390.2006 . ПМЦ 1447445 . ПМИД 16621833 .

[71] Ву, М.; Рен, К.; Дуркин, А.С.; Догерти, Южная Каролина; Бринкач, LM.; Додсон, Р.Дж.; Мадупу, Р.; Салливан, ЮАР; и др. (ноябрь 2005 г.). «Жизнь в горячем угарном газе: полная последовательность генома Carboxydothermus Hydrogenoformans Z-2901» . ПЛОС Генет . 1 (5): е65. дои : 10.1371/journal.pgen.0010065 . ПМК 1287953 . ПМИД 16311624 .

[72] Нёллинг Дж. и др. (2001). «Последовательность генома и сравнительный анализ бактерии-продуцента растворителя Clostridium acetobutylicum » . J Бактериол . 183 (16): 4823–38. дои : 10.1128/JB.183.16.4823-4838.2001 . ПМК 99537 . PMID 11466286 .

[73] Симидзу Т. и др. (2002). «Полная последовательность генома Clostridium perfringens , анаэробного плотоядного» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (2): 996–1001. Бибкод : 2002PNAS...99..996S . дои : 10.1073/pnas.022493799 . ПМЦ 117419 . ПМИД 11792842 .

[74] Брюггеманн Х. и др. (2003). «Последовательность генома Clostridium tetani , возбудителя столбняка» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (3): 1316–21. Бибкод : 2003PNAS..100.1316B . дои : 10.1073/pnas.0335853100 . ПМК 298770 . ПМИД 12552129 .

[75] Нонака Х. и др. (2006). «Полная последовательность генома дегалореспирирующей бактерии Desulfitobacterium hafniense Y51 и сравнение с Dehalococcoides ethenogenes 195» . J Бактериол . 188 (6): 2262–74. дои : 10.1128/JB.188.6.2262-2274.2006 . ПМЦ 1428132 . ПМИД 16513756 .

[76] Полсен И.Т. и др. (2003). «Роль мобильной ДНК в эволюции устойчивого к ванкомицину Enterococcus faecalis ». Наука . 299 (5615): 2071–4. Бибкод : 2003Sci...299.2071P . дои : 10.1126/science.1080613 . ПМИД 12663927 . S2CID 45480495 .

[77] Таками Х. и др. (2004). «Признак термоадаптации, выявленный по последовательности генома термофильной Geobacillus kaustophilus » . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (21): 6292–303. дои : 10.1093/nar/gkh970 . ПМК 535678 . ПМИД 15576355 .

[78] Альтерманн Э и др. (2005). «Полная последовательность генома пробиотической молочнокислой бактерии Lactobacillus acidophilus NCFM» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (11): 3906–12. Бибкод : 2005PNAS..102.3906A . дои : 10.1073/pnas.0409188102 . ПМК 554803 . ПМИД 15671160 .

[Pridmore-79] Перейти обратно: ^а ^б Придмор Р.Д. и др. (2004). «Последовательность генома пробиотической кишечной бактерии Lactobacillus johnsonii NCC 533» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (8): 2512–7. Бибкод : 2004PNAS..101.2512P . дои : 10.1073/pnas.0307327101 . ПМК 356981 . ПМИД 14983040 .

[80] Болотин А и др. (2001). «Полная последовательность генома молочнокислой бактерии Lactococcus Lactis ssp. Lactis IL1403» . Геном Рез . 11 (5): 731–53. дои : 10.1101/gr.gr-1697r . ПМК 311110 . ПМИД 11337471 .

[Glaser-81] Перейти обратно: ^а ^б Глейзер П. и др. (2001). «Сравнительная геномика видов Listeria ». Наука . 294 (5543): 849–52. Бибкод : 1976Sci...192..801S . дои : 10.1126/science.1063447 . ПМИД 11679669 . S2CID 40718381 .

[82] Нельсон К.Е. и др. (2004). «Сравнение всего генома штаммов серотипа 4b и 1/2a пищевого патогена Listeria monocytogenes позволяет по-новому взглянуть на основные компоненты генома этого вида» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (8): 2386–95. дои : 10.1093/nar/gkh562 . ПМК 419451 . ПМИД 15115801 .

[83] Лу, Дж; Ноги, Ю; Таками, Х (2001). « Oceanobacillus iheyensis gen. nov., sp. nov., глубоководный чрезвычайно галотолерантный и алкалофильный вид, выделенный с глубины 1050 м на хребте Ихейя» . FEMS Microbiol Lett . 205 (2): 291–7. дои : 10.1111/j.1574-6968.2001.tb10963.x . ПМИД 11750818 .

[jb.asm.org-84] Перейти обратно: ^а ^б Гилл С.Р. и др. (2005). «Понимание эволюции вирулентности и устойчивости на основе полного анализа генома раннего метициллин-резистентного штамма Staphylococcus aureus и продуцирующего биопленку метициллин-резистентного штамма Staphylococcus epidermidis » . J Бактериол . 187 (7): 2426–38. дои : 10.1128/JB.187.7.2426-2438.2005 . ПМЦ 1065214 . ПМИД 15774886 .

[Holden2004-85] Перейти обратно: ^а ^б ^с Холден М.Т. и др. (2004). «Полные геномы двух клинических штаммов золотистого стафилококка : свидетельства быстрой эволюции вирулентности и лекарственной устойчивости» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (26): 9786–91. Бибкод : 2004PNAS..101.9786H . дои : 10.1073/pnas.0402521101 . ПМК 470752 . ПМИД 15213324 .

[Kuroda-86] Перейти обратно: ^а ^б Курода М. и др. (2001). «Полногеномное секвенирование метициллин-резистентного золотистого стафилококка ». Ланцет . 357 (9264): 1225–40. дои : 10.1016/S0140-6736(00)04403-2 . ПМИД 11418146 . S2CID 25076109 .

[87] Баба Т. и др. (2002). «Геном и детерминанты вирулентности внебольничного MRSA с высокой вирулентностью». Ланцет . 359 (9320): 1819–27. дои : 10.1016/S0140-6736(02)08713-5 . ПМИД 12044378 . S2CID 4657920 .

[88] Дип Б.А. и др. (2006). «Полная последовательность генома USA300, эпидемического клона внебольничного метициллин-резистентного золотистого стафилококка ». Ланцет . 367 (9512): 731–9. дои : 10.1016/S0140-6736(06)68231-7 . ПМИД 16517273 . S2CID 30038673 .

[89] Такеучи Ф и др. (2005). «Полногеномное секвенирование Staphylococcus haemolyticus раскрывает чрезвычайную пластичность его генома и эволюцию видов стафилококков, колонизирующих человека» . J Бактериол . 187 (21): 7292–308. дои : 10.1128/JB.187.21.7292-7308.2005 . ПМК 1272970 . ПМИД 16237012 .

[90] Курода М. и др. (2005). «Полная последовательность генома Staphylococcus saprophyticus раскрывает патогенез неосложненной инфекции мочевыводящих путей» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (37): 13272–7. Бибкод : 2005PNAS..10213272K . дои : 10.1073/pnas.0502950102 . ПМК 1201578 . ПМИД 16135568 .

[91] Теттелин Х. и др. (2005). «Анализ генома нескольких патогенных изолятов Streptococcus agalactiae : значение для микробного «пангенома» » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (39): 13950–5. Бибкод : 2005PNAS..10213950T . дои : 10.1073/pnas.0506758102 . ПМК 1216834 . ПМИД 16172379 .

[92] Глейзер П. и др. (2002). «Последовательность генома Streptococcus agalactiae , возбудителя, вызывающего инвазивное неонатальное заболевание» . Мол Микробиол . 45 (6): 1499–513. дои : 10.1046/j.1365-2958.2002.03126.x . ПМИД 12354221 . S2CID 25189736 .

[93] Теттелин Х. и др. (2002). «Полная последовательность генома и сравнительный геномный анализ нового человеческого патогена серотипа V Streptococcus agalactiae » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (19): 12391–6. Бибкод : 2002PNAS...9912391T . дои : 10.1073/pnas.182380799 . ПМК 129455 . ПМИД 12200547 .

[94] Айдич Д. и др. (2002). «Последовательность генома Streptococcus mutans UA159, кариесогенного стоматологического патогена» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (22): 14434–9. Бибкод : 2002PNAS...9914434A . дои : 10.1073/pnas.172501299 . ПМЦ 137901 . ПМИД 12397186 .

[95] Хоскинс Дж. и др. (2001). «Геном бактерии Streptococcus pneumoniae, штамм R6» . J Бактериол . 183 (19): 5709–17. дои : 10.1128/JB.183.19.5709-5717.2001 . ПМК 95463 . ПМИД 11544234 .

[96] Теттелин Х. и др. (2001). «Полная последовательность генома вирулентного изолята Streptococcus pneumoniae ». Наука . 293 (5529): 498–506. CiteSeerX 10.1.1.318.395 . дои : 10.1126/science.1061217 . ПМИД 11463916 . S2CID 714948 .

[pnas.org-97] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Берес С.Б. и др. (2006). «Молекулярно-генетическая анатомия меж- и внутрисеротипической изменчивости бактериального возбудителя группы А стрептококка человека » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 103 (18): 7059–64. Бибкод : 2006PNAS..103.7059B . дои : 10.1073/pnas.0510279103 . ПМК 1459018 . ПМИД 16636287 .

[98] Бэнкс DJ и др. (2004). группы А «Прогресс в характеристике метагенома стрептококка : полная последовательность генома штамма серотипа М6, устойчивого к макролидам» . J Заразить Дис . 190 (4): 727–38. дои : 10.1086/422697 . ПМИД 15272401 .

[99] Берес С.Б. и др. (2002). «Последовательность генома штамма серотипа М3 стрептококка группы А : фаговые токсины, фенотип высокой вирулентности и появление клонов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (15): 10078–83. Бибкод : 2002PNAS...9910078B . дои : 10.1073/pnas.152298499 . ПМК 126627 . ПМИД 12122206 .

[100] Сумби П. и др. (2005). «Эволюционное происхождение и появление весьма успешного клона стрептококка серотипа М1 группы А включало множественные события горизонтального переноса генов» . J Заразить Дис . 192 (5): 771–82. дои : 10.1086/432514 . ПМИД 16088826 .

[101] Грин Н.М. и др. (2005). «Последовательность генома штамма серотипа M28 стрептококка группы А : потенциально новое понимание послеродового сепсиса и специфичности бактериальных заболеваний» . J Заразить Дис . 192 (5): 760–70. дои : 10.1086/430618 . ПМИД 16088825 .

[102] Смут Дж.С. и др. (2002). «Последовательность генома и сравнительный микрочиповый анализ штаммов стрептококка группы А серотипа М18, связанных со вспышками острой ревматической лихорадки» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (7): 4668–73. Бибкод : 2002PNAS...99.4668S . дои : 10.1073/pnas.062526099 . ПМЦ 123705 . ПМИД 11917108 .

[103] Ферретти Дж. Дж. и др. (2001). «Полная последовательность генома штамма M1 Streptococcus pyogenes » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (8): 4658–63. Бибкод : 2001PNAS...98.4658F . дои : 10.1073/pnas.071559398 . ПМК 31890 . ПМИД 11296296 .

[104] Накагава I и др. (2003). «Последовательность генома штамма M3 Streptococcus pyogenes раскрывает крупномасштабную геномную перестройку инвазивных штаммов и новое понимание эволюции фагов» . Геном Рез . 13 (6А): 1042–55. дои : 10.1101/гр.1096703 . ПМК 403657 . ПМИД 12799345 .

[Bolotin-105] Перейти обратно: ^а ^б Болотин А и др. (2004). «Полная последовательность и сравнительный анализ генома молочной бактерии Streptococcus thermophilus » . Нат Биотехнология . 22 (12): 1554–8. дои : 10.1038/nbt1034 . ПМЦ 7416660 . ПМИД 15543133 .

[106] Капатрал В. и др. (2002). «Последовательность генома и анализ штамма ATCC 25586 бактерии полости рта Fusobacterium nucleatum » . J Бактериол . 184 (7): 2005–18. дои : 10.1128/JB.184.7.2005-2018.2002 . ПМК 134920 . ПМИД 11889109 .

[107] Гуднер Б. и др. (2001). «Геномная последовательность патогена растений и биотехнологического агента Agrobacterium tumefaciens C58». Наука . 294 (5550): 2323–8. Бибкод : 2001Sci...294.2323G . дои : 10.1126/science.1066803 . ПМИД 11743194 . S2CID 86255214 .

[108] Брайтон К.А. и др. (2005). «Полное секвенирование генома Anaplasma Marginale показывает, что поверхность смещена в сторону двух суперсемейств белков внешней мембраны» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (3): 844–9. Бибкод : 2005PNAS..102..844B . дои : 10.1073/pnas.0406656102 . ПМК 545514 . ПМИД 15618402 .

[plosgenetics.org-109] Перейти обратно: ^а ^б ^с Даннинг Хотопп Дж.К. и др. (2006). «Сравнительная геномика новых возбудителей эрлихиоза человека» . ПЛОС Генет . 2 (2): е21. дои : 10.1371/journal.pgen.0020021 . ПМЦ 1366493 . ПМИД 16482227 .

[Alsmark-110] Перейти обратно: ^а ^б Алсмарк CM и др. (2004). «Переносимый вшами патоген человека Bartonella quintana является геномным производным зоонозного агента Bartonella henselae » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (26): 9716–21. Бибкод : 2004PNAS..101.9716A . дои : 10.1073/pnas.0305659101 . ПМК 470741 . ПМИД 15210978 .

[111] Канеко Т. и др. (2002). «Полная геномная последовательность азотфиксирующей симбиотической бактерии Bradyrhizobium japonicum USDA110» . ДНК Рез . 9 (6): 189–97. дои : 10.1093/dnares/9.6.189 . ПМИД 12597275 .

[Chain-112] Перейти обратно: ^а ^б Чейн П.С. и др. (2005). «Полногеномный анализ событий видообразования патогенных бруцелл» . Инфекция и иммунитет . 73 (12): 8353–61. дои : 10.1128/IAI.73.12.8353-8361.2005 . ПМК 1307078 . ПМИД 16299333 .

[Halling-113] Перейти обратно: ^а ^б Холлинг С.М. и др. (2005). «Завершение последовательности генома Brucella abortus и сравнение с очень похожими геномами Brucella melitensis и Brucella suis » . J Бактериол . 187 (8): 2715–26. дои : 10.1128/JB.187.8.2715-2726.2005 . ПМЦ 1070361 . ПМИД 15805518 .

[DelVecchio-114] Перейти обратно: ^а ^б ДельВеккио В.Г. и др. (2002). «Последовательность генома факультативного внутриклеточного возбудителя Brucella melitensis » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (1): 443–8. Бибкод : 2002PNAS...99..443D . дои : 10.1073/pnas.221575398 . ПМЦ 117579 . ПМИД 11756688 .

[Paulsen-115] Перейти обратно: ^а ^б Полсен И.Т. и др. (2002). « Геном Brucella suis обнаруживает фундаментальное сходство между патогенами животных и растений и симбионтами» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (20): 13148–53. Бибкод : 2002PNAS...9913148P . дои : 10.1073/pnas.192319099 . ПМК 130601 . ПМИД 12271122 .

[116] Нирман В.К. и др. (2001). «Полная последовательность генома Caulobacter crescentus » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (7): 4136–41. Бибкод : 2001PNAS...98.4136N . дои : 10.1073/pnas.061029298 . ПМК 31192 . ПМИД 11259647 .

[117] Коллинз Н.Э. и др. (2005). «Геном возбудителя сердечной недостаточности Ehrlichia ruminantium содержит множественные тандемные повторы с активно вариабельным числом копий» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (3): 838–43. Бибкод : 2005PNAS..102..838C . дои : 10.1073/pnas.0406633102 . ПМК 545511 . ПМИД 15637156 .

[118] Пруст С. и др. (2005). «Полная последовательность генома уксуснокислой бактерии Gluconobacter oxydans » . Нат Биотехнология . 23 (2): 195–200. дои : 10.1038/nbt1062 . PMID 15665824 .

[119] Мацунага Т. и др. (2005). «Полная последовательность генома факультативно-анаэробной магнитотактической бактерии Magnetospirillum sp. Штамм AMB-1» . ДНК Рез . 12 (3): 157–66. дои : 10.1093/dnares/dsi002 . ПМИД 16303747 .

[120] Канеко Т. и др. (2000). «Полная структура генома азотфиксирующей симбиотической бактерии Mesorhizobium loti » . ДНК Рез . 7 (6): 331–8. дои : 10.1093/dnares/7.6.331 . ПМИД 11214968 .

[121] Джованнони С.Дж. и др. (2005). «Оптимизация генома космополитической океанической бактерии». Наука . 309 (5738): 1242–5. Бибкод : 2005Sci...309.1242G . дои : 10.1126/science.1114057 . ПМИД 16109880 . S2CID 16221415 .

[122] Гонсалес В. и др. (2006). «Разделенный геном Rhizobium etli : генетическая и метаболическая избыточность в семи взаимодействующих репликонах» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 103 (10): 3834–9. Бибкод : 2006PNAS..103.3834G . дои : 10.1073/pnas.0508502103 . ПМЦ 1383491 . ПМИД 16505379 .

[123] Лаример Ф.В. и др. (2004). «Полная последовательность генома метаболически универсальной фотосинтетической бактерии Rhodopseudomonas palustris » . Нат Биотехнология . 22 (1): 55–61. дои : 10.1038/nbt923 . ПМИД 14704707 .

[124] Огата Х и др. (2000). «Эгоистичная ДНК в белок-кодирующих генах риккетсий ». Наука . 290 (5490): 347–50. Бибкод : 2000Sci...290..347O . дои : 10.1126/science.290.5490.347 . ПМИД 11030655 .

[125] Огата Х и др. (2005). «Последовательность генома Rickettsia felis идентифицирует первую предполагаемую конъюгатную плазмиду облигатного внутриклеточного паразита» . ПЛОС Биол . 3 (8): е248. дои : 10.1371/journal.pbio.0030248 . ПМЦ 1166351 . ПМИД 15984913 .

[126] Андерссон С.Г. и др. (1998). «Последовательность генома Rickettsia prowazekii и происхождение митохондрий» . Природа . 396 (6707): 133–40. Бибкод : 1998Natur.396..133A . дои : 10.1038/24094 . ПМИД 9823893 .

[127] Маклеод, член парламента и др. (2004). «Полная последовательность генома Rickettsia typhi и сравнение с последовательностями других риккетсий» . J Бактериол . 186 (17): 5842–55. дои : 10.1128/JB.186.17.5842-5855.2004 . ПМК 516817 . ПМИД 15317790 .

[128] Моран М.А. и др. (2004). «Последовательность генома Silicibacter pomeroyi демонстрирует адаптацию к морской среде» . Природа . 432 (7019): 910–3. Бибкод : 2004Natur.432..910M . дои : 10.1038/nature03170 . ПМИД 15602564 .

[129] «Домашний — Sinorhizobium medicae WSM419» .

[130] Капела Д. и др. (2001). «Анализ хромосомной последовательности бобового симбионта Sinorhizobium meliloti штамма 1021» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (17): 9877–82. Бибкод : 2001PNAS...98.9877C . дои : 10.1073/pnas.161294398 . ПМК 55546 . ПМИД 11481430 .

[131] Фостер Дж. и др. (2005). « Wolbachia Геном Brugia malayi : эволюция эндосимбионта внутри патогенной нематоды человека» . ПЛОС Биол . 3 (4): е121. дои : 10.1371/journal.pbio.0030121 . ПМК 1069646 . ПМИД 15780005 .

[132] Ву М и др. (2004). «Филогеномика репродуктивного паразита Wolbachia pipientis wMel: оптимизированный геном, наводненный мобильными генетическими элементами» . ПЛОС Биол . 2 (3): Е69. дои : 10.1371/journal.pbio.0020069 . ПМК 368164 . ПМИД 15024419 .

[133] Со Дж.С. и др. (2005). «Последовательность генома этанологенной бактерии Zymomonas mobilis ZM4» . Нат Биотехнология . 23 (1): 63–8. дои : 10.1038/nbt1045 . ПМК 6870993 . ПМИД 15592456 .

[134] Рабус Р. и др. (2002). «Гены, участвующие в анаэробном разложении этилбензола в денитрифицирующей бактерии, штамм EbN1». Арка Микробиол . 178 (6): 506–16. Бибкод : 2002ArMic.178..506R . дои : 10.1007/s00203-002-0487-2 . ПМИД 12420173 . S2CID 34316083 .

[135] Нирман В.К. и др. (2004). «Структурная гибкость генома Burkholderia mallei» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (39): 14246–51. Бибкод : 2004PNAS..10114246N . дои : 10.1073/pnas.0403306101 . ПМК 521142 . ПМИД 15377793 .

[BMC_Genomics._2005_Dec_7,_Dec-136] Перейти обратно: ^а ^б БМК Геномика. 2005 7 декабря

[137] Бразильский национальный консорциум геномного проекта. (2003). «Полная последовательность генома Chromobacterium violaceum демонстрирует замечательную и полезную бактериальную адаптивность» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (20): 11660–5. Бибкод : 2003PNAS..10011660. . дои : 10.1073/pnas.1832124100 . ПМК 208814 . ПМИД 14500782 .

[138] Паркхилл Дж. и др. (2000). Z2491 серогруппы А «Полная последовательность ДНК штамма Neisseria meningitidis ». Природа . 404 (6777): 502–6. Бибкод : 2000Natur.404..502P . дои : 10.1038/35006655 . ПМИД 10761919 . S2CID 4430718 .

[139] Теттелин Х. и др. (2000). «Полная последовательность генома штамма MC58 Neisseria meningitidis серогруппы B». Наука . 287 (5459): 1809–15. Бибкод : 2000Sci...287.1809. . дои : 10.1126/science.287.5459.1809 . ПМИД 10710307 .

[140] Чейн П и др. (2003). «Полная последовательность генома аммиакокисляющей бактерии и облигатного хемолитоавтотрофа Nitrosomonas europaea » . J Бактериол . 185 (9): 2759–73. дои : 10.1128/JB.185.9.2759-2773.2003 . ПМК 154410 . ПМИД 12700255 .

[Salanoubat-141] Перейти обратно: ^а ^б Саланоубат М. и др. (2002). «Последовательность генома возбудителя растений Ralstonia solanacearum » . Природа . 415 (6871): 497–502. дои : 10.1038/415497a . ПМИД 11823852 .

[142] Барбе В. и др. (2004). «Уникальные особенности, выявленные последовательностью генома Acinetobacter sp. ADP1, универсальной и естественно способной к трансформации бактерии» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (19): 5766–79. дои : 10.1093/nar/gkh910 . ПМК 528795 . ПМИД 15514110 .

[143] Гил Р. и др. (2003). «Последовательность генома Blochmannia floridanus : сравнительный анализ редуцированных геномов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (16): 9388–93. Бибкод : 2003PNAS..100.9388G . дои : 10.1073/pnas.1533499100 . ПМК 170928 . ПМИД 12886019 .

[144] Дегнан PH и др. (2005). «Последовательность генома Blochmannia pennsylvanicus указывает на параллельные эволюционные тенденции среди бактериальных мутуалистов насекомых» . Геном Рез . 15 (8): 1023–33. дои : 10.1101/гр.3771305 . ПМЦ 1182215 . ПМИД 16077009 .

[145] Сигенобу С. и др. (2000). «Последовательность генома внутриклеточного бактериального симбионта тли Buchnera sp. APS» . Природа . 407 (6800): 81–6. Бибкод : 2000Natur.407...81S . дои : 10.1038/35024074 . ПМИД 10993077 .

[146] ван Хэм Р.Ц. и др. (2003). «Редуктивная эволюция генома Buchnera aphidicola » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (2): 581–6. Бибкод : 2003PNAS..100..581V . дои : 10.1073/pnas.0235981100 . ПМК 141039 . ПМИД 12522265 .

[147] Тамаш I и др. (2002). «50 миллионов лет геномного застоя эндосимбиотических бактерий». Наука . 296 (5577): 2376–9. Бибкод : 2002Sci...296.2376T . дои : 10.1126/science.1071278 . ПМИД 12089438 . S2CID 19226473 .

[148] Накабачи А. и др. (2006). «Геном бактериального эндосимбионта Carsonella длиной 160 тысяч оснований ». Наука . 314 (5797): 267. doi : 10.1126/science.1134196 . ПМИД 17038615 . S2CID 44570539 .

[149] Сешадри Р. и др. (2003). «Полная последовательность генома возбудителя Q-лихорадки Coxiella burnetii » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (9): 5455–60. Бибкод : 2003PNAS..100.5455S . дои : 10.1073/pnas.0931379100 . ПМК 154366 . ПМИД 12704232 .

[150] Уэлч Р.А. и др. (2002). «Обширная мозаичная структура, выявленная по полной последовательности генома уропатогенной Escherichia coli » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 17020–4. Бибкод : 2002PNAS...9917020W . дои : 10.1073/pnas.252529799 . ПМК 139262 . ПМИД 12471157 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )

[151] Блаттнер Ф.Р. и др. (1997). «Полная последовательность генома Escherichia coli K-12» . Наука . 277 (5331): 1453–74. дои : 10.1126/science.277.5331.1453 . ПМИД 9278503 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )

[152] Райли М. и др. (2006). « Escherichia coli K-12: снимок аннотации, разработанный совместно — 2005 г.» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (1): 1–9. дои : 10.1093/нар/gkj405 . ПМЦ 1325200 . ПМИД 16397293 .

[153] Перна НТ и др. (2001). «Последовательность генома энтерогеморрагической Escherichia coli O157:H7» . природе По своей 409 (6819): 529–33. Бибкод : 2001Natur.409..529P . дои : 10.1038/35054089 . ПМИД 11206551 .

[154] Макино, К.; и др. (1999). «Полная нуклеотидная последовательность профага VT2-Сакаи, несущего гены веротоксина 2 энтерогеморрагической Escherichia coli O157:H7, полученной в результате вспышки Сакаи» . Гены и генетические системы . 74 (5): 227–39. дои : 10.1266/ggs.74.227 . ПМИД 10734605 .

[155] Ларссон П. и др. (2005). «Полная последовательность генома Francesella tularensis , возбудителя туляремии» . Нат Жене . 37 (2): 153–9. дои : 10.1038/ng1499 . ПМИД 15640799 .

[156] Харрисон А. и др. (2005). «Геномная последовательность изолята среднего отита нетипируемой Haemophilus influenzae : сравнительное исследование с серотипом d H. influenzae, штамм KW20» . J Бактериол . 187 (13): 4627–36. дои : 10.1128/JB.187.13.4627-4636.2005 . ПМЦ 1151754 . ПМИД 15968074 .

[157] Флейшманн Р.Д. и др. (1995). «Полногеномное случайное секвенирование и сборка Haemophilus influenzae Rd». Наука . 269 (5223): 496–512. Бибкод : 1995Sci...269..496F . дои : 10.1126/science.7542800 . ПМИД 7542800 .

[158] Чон Х. и др. (2005). «Геномная схема Hahella chejuensis , морского микроба, производящего альгицидное средство» . Нуклеиновые кислоты Рез . 33 (22): 7066–73. дои : 10.1093/nar/gki1016 . ПМЦ 1312362 . ПМИД 16352867 .

[159] Хоу С. и др. (2004). «Последовательность генома глубоководной гамма-протеобактерии Idiomarina loihiensis показывает, что ферментация аминокислот является источником углерода и энергии» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (52): 18036–41. Бибкод : 2004PNAS..10118036H . дои : 10.1073/pnas.0407638102 . ПМК 539801 . ПМИД 15596722 .

[Cazalet-160] Перейти обратно: ^а ^б Казалет С. и др. (2004). «Доказательства Legionella pneumophila использования функций клетки-хозяина и высокой пластичности генома » . Нат Жене . 36 (11): 1165–73. дои : 10.1038/ng1447 . ПМИД 15467720 .

[161] Уорд Н. и др. (2004). «Геномный взгляд на метанотрофию: полная последовательность генома Mmethylococcus capsulatus (Bath)» . ПЛОС Биол . 2 (10): е303. дои : 10.1371/journal.pbio.0020303 . ПМК 517821 . ПМИД 15383840 .

[162] Мэй Б.Дж. и др. (2001). «Полная геномная последовательность Pasteurella multocida , Pm70» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (6): 3460–5. Бибкод : 2001PNAS...98.3460M . дои : 10.1073/pnas.051634598 . ПМК 30675 . ПМИД 11248100 .

[Medigue-163] Перейти обратно: ^а ^б Медиг С и др. (2005). «Как справиться с холодом: геном универсальной морской антарктической бактерии Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125» . Геном Рез . 15 (10): 1325–35. дои : 10.1101/гр.4126905 . ПМК 1240074 . ПМИД 16169927 .

[164] Муруган Н. (2016). VRFPA04 с множественной лекарственной устойчивостью (MDR), «Раскрытие геномной и фенотипической природы Pseudomonas aeruginosa выделенной от пациента с кератитом» . Микробиологические исследования . 193 : 959–64. дои : 10.1016/j.micres.2016.10.002 . ПМИД 27825482 .

[165] Полсен И.Т. и др. (2005). «Полная последовательность генома комменсального растения Pseudomonas fluorescens Pf-5» . Нат Биотехнология . 23 (7): 873–8. дои : 10.1038/nbt1110 . ПМЦ 7416659 . ПМИД 15980861 .

[166] Нельсон К.Е. и др. (2002). «Полная последовательность генома и сравнительный анализ метаболически универсальной Pseudomonas putida KT2440». Энвайрон Микробиол . 4 (12): 799–808. Бибкод : 2002EnvMi...4..799N . дои : 10.1046/j.1462-2920.2002.00366.x . ПМИД 12534463 .

[167] Фейл Х. и др. (2005). «Сравнение полных последовательностей генома Pseudomonas syringae pv. syringae B728a и pv. tomato DC3000» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (31): 11064–9. Бибкод : 2005PNAS..10211064F . дои : 10.1073/pnas.0504930102 . ПМЦ 1182459 . ПМИД 16043691 .

[168] Бьюэлл CR и др. (2003). «Полная последовательность генома Arabidopsis и патогена томатов Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (18): 10181–6. Бибкод : 2003PNAS..10010181B . дои : 10.1073/pnas.1731982100 . ЧВК 193536 . ПМИД 12928499 .

[169] «Психробактер криогалолентис — микробевики» .

[170] Макклелланд М. и др. (2004). «Сравнение деградации генома Paratyphi A и Typhi, ограниченных для человека сероваров Salmonella enterica, вызывающих брюшной тиф». Нат Жене . 36 (12): 1268–74. дои : 10.1038/ng1470 . ПМИД 15531882 . S2CID 25129295 .

[171] Чиу Ч. и др. (2005). «Последовательность генома Salmonella enterica серовара Choleraesuis , высокоинвазивного и устойчивого зоонозного патогена» . Нуклеиновые кислоты Рез . 33 (5): 1690–8. дои : 10.1093/nar/gki297 . ПМК 1069006 . ПМИД 15781495 .

[172] Дэн В. и др. (2003). «Сравнительная геномика серовара enterica Salmonella Typhi, штаммы Ty2 и CT18» . J Бактериол . 185 (7): 2330–7. дои : 10.1128/JB.185.7.2330-2337.2003 . ПМК 151493 . ПМИД 12644504 .

[173] Паркхилл Дж. и др. (2001). «Полная последовательность генома серовара enterica Salmonella Typhi CT18 с множественной лекарственной устойчивостью» . Природа . 413 (6858): 848–52. Бибкод : 2001Natur.413..848P . дои : 10.1038/35101607 . ПМИД 11677608 .

[174] Макклелланд М. и др. (2001). «Полная последовательность генома Salmonella enterica серовара Typhimurium LT2» . Природа . 413 (6858): 852–6. Бибкод : 2001Natur.413..852M . дои : 10.1038/35101614 . ПМИД 11677609 .

[175] Гейдельберг Дж. Ф. и др. (2002). «Последовательность генома диссимиляционной бактерии, восстанавливающей ионы металлов Shewanella oneidensis » . Нат Биотехнология . 20 (11): 1118–23. дои : 10.1038/nbt749 . ПМИД 12368813 .

[Yang2005-176] Перейти обратно: ^а ^б ^с Ян Ф. и др. (2005). «Динамика генома и разнообразие видов шигелл , этиологических агентов бактериальной дизентерии» . Нуклеиновые кислоты Рез . 33 (19): 6445–58. дои : 10.1093/nar/gki954 . ПМЦ 1278947 . ПМИД 16275786 .

[177] Вэй Дж. и др. (2003). «Полная последовательность генома и сравнительная геномика штамма 2457T Shigella flexneri серотипа 2а» . Инфекция и иммунитет . 71 (5): 2775–86. дои : 10.1128/IAI.71.5.2775-2786.2003 . ПМК 153260 . ПМИД 12704152 .

[178] Джин Кью и др. (2002). «Последовательность генома Shigella flexneri 2a: понимание патогенности путем сравнения с геномами Escherichia coli K12 и O157» . Нуклеиновые кислоты Рез . 30 (20): 4432–41. дои : 10.1093/nar/gkf566 . ПМЦ 137130 . ПМИД 12384590 .

[179] Тох Х и др. (2006). «Массивная эрозия генома и функциональные адаптации позволяют лучше понять симбиотический образ жизни Sodalislossinidius с хозяином цеце» . Геном Рез . 16 (2): 149–56. дои : 10.1101/гр.4106106 . ПМЦ 1361709 . ПМИД 16365377 .

[180] Гейдельберг Дж. Ф. и др. (2000). «Последовательность ДНК обеих хромосом возбудителя холеры Vibrio cholerae » . Природа . 406 (6795): 477–83. Бибкод : 2000Natur.406..477H . дои : 10.1038/35020000 . ПМК 8288016 . ПМИД 10952301 .

[181] Руби Э.Г. и др. (2005). «Полная последовательность генома Vibrio fischeri : симбиотическая бактерия с патогенными родственниками» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (8): 3004–9. Бибкод : 2005PNAS..102.3004R . дои : 10.1073/pnas.0409900102 . ПМК 549501 . ПМИД 15703294 .

[182] Насу Х и др. (1 июня 2000 г.). «Нитчатый фаг, связанный с недавними пандемическими штаммами Vibrio parahaemolyticus O3:K6» . J Clin Микробиол . 38 (6): 2156–61. doi : 10.1128/JCM.38.6.2156-2161.2000 . ПМЦ 86752 . ПМИД 10834969 .

[Kim-183] Ким Ю.Р. и др. (2003). «Характеристика и патогенное значение антигенов Vibrio vulnificus, преимущественно экспрессируемых у пациентов с сепсисом» . Инфекция и иммунитет . 71 (10): 5461–71. дои : 10.1128/IAI.71.10.5461-5471.2003 . ПМК 201039 . ПМИД 14500463 .

[Chen-184] Чен С.И. и др. (2003). «Сравнительный анализ генома Vibrio vulnificus морского патогена » . Геном Рез . 13 (12): 2577–87. дои : 10.1101/гр.1295503 . ПМК 403799 . ПМИД 14656965 .

[185] Акман Л. и др. (2002). «Последовательность генома внутриклеточного облигатного симбионта мухи цеце Wigglesworthialossinidia » . Нат Жене . 32 (3): 402–7. дои : 10.1038/ng986 . ПМИД 12219091 . S2CID 20604183 .

[daSilva-186] Перейти обратно: ^а ^б да Силва AC и др. (2002). «Сравнение геномов двух возбудителей Xanthomonas с различной специфичностью хозяина». Природа . 417 (6887): 459–63. Бибкод : 2002Natur.417..459D . дои : 10.1038/417459а . ПМИД 12024217 . S2CID 4302762 .

[187] Цянь В. и др. (2005). «Сравнительный и функциональный геномный анализ патогенности фитопатогена Xanthomonas Campestris pv. Campestris » . Геном Рез . 15 (6): 757–67. дои : 10.1101/гр.3378705 . ПМЦ 1142466 . ПМИД 15899963 .

[188] Тиме Ф. и др. (2005). «Изучение пластичности генома и патогенности фитопатогенной бактерии Xanthomonas Campestris pv. vesicatoria , выявленной с помощью полной последовательности генома» . J Бактериол . 187 (21): 7254–66. дои : 10.1128/JB.187.21.7254-7266.2005 . ПМЦ 1272972 . ПМИД 16237009 .

[189] Ли Б.М. и др. (2005). «Последовательность генома Xanthomonas oryzae pathovar oryzae KACC10331, возбудителя бактериального ожога риса» . Нуклеиновые кислоты Рез . 33 (2): 577–86. дои : 10.1093/nar/gki206 . ПМК 548351 . ПМИД 15673718 .

[190] Симпсон, AJC; и др. (2000). «Последовательность генома возбудителя растений Xylella fastidiosa » . Природа . 406 (6792): 151–7. Бибкод : 2000Natur.406..151S . дои : 10.1038/35018003 . ПМИД 10910347 .

[191] Ван Слейс М.А. и др. (2003). «Сравнительный анализ полных последовательностей генома штаммов болезни Пирса и цитрусового пестролистного хлороза Xylella fastidiosa » . J Бактериол . 185 (3): 1018–26. дои : 10.1128/JB.185.3.1018-1026.2003 . ПМК 142809 . ПМИД 12533478 .

[192] Чейн П.С. и др. (2006). «Полная последовательность генома Yersinia pestis штаммов Antiqua и Nepal516: свидетельства редукции генов в новом патогене» . J Бактериол . 188 (12): 4453–63. дои : 10.1128/JB.00124-06 . ПМК 1482938 . ПМИД 16740952 .

[193] Паркхилл Дж. и др. (2001). «Последовательность генома Yersinia pestis , возбудителя чумы» . Природа . 413 (6855): 523–7. Бибкод : 2001Natur.413..523P . дои : 10.1038/35097083 . ПМИД 11586360 .

[194] Дэн В. и др. (2002). «Последовательность генома Yersinia pestis KIM» . J Бактериол . 184 (16): 4601–11. дои : 10.1128/JB.184.16.4601-4611.2002 . ПМЦ 135232 . ПМИД 12142430 .

[195] Сонг Ю и др. (2004). «Полная последовательность генома штамма Yersinia pestis 91001, изолята, авирулентного для человека» . ДНК Рез . 11 (3): 179–97. дои : 10.1093/dnares/11.3.179 . ПМИД 15368893 .

[196] Чейн П.С. и др. (2004). «Понимание эволюции Yersinia pestis посредством сравнения всего генома с Yersinia pseudotuberculosis » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (38): 13826–31. Бибкод : 2004PNAS..10113826C . дои : 10.1073/pnas.0404012101 . ПМК 518763 . ПМИД 15358858 .

[197] Рендулич С. и др. (2004). «Хищник без маски: жизненный цикл Bdellovibrio бактериоворуса с точки зрения генома». Наука . 303 (5658): 689–92. Бибкод : 2004Sci...303..689R . дои : 10.1126/science.1093027 . ПМИД 14752164 . S2CID 38154836 .

[198] Паркхилл Дж. и др. (2000). «Последовательность генома пищевого патогена Campylobacter jejuni обнаруживает гипервариабельные последовательности» . Природа . 403 (6770): 665–8. Бибкод : 2000Natur.403..665P . дои : 10.1038/35001088 . ПМИД 10688204 .

[199] Фаутс Д.Е. и др. (2005). «Основные структурные различия и новые потенциальные механизмы вирулентности геномов нескольких видов Campylobacter » . ПЛОС Биол . 3 (1): е15. doi : 10.1371/journal.pbio.0030015 . ПМК 539331 . ПМИД 15660156 .

[200] Гейдельберг Дж. Ф. и др. (2004). «Последовательность генома анаэробной сульфатредуцирующей бактерии Desulfovibrio vulgaris Hildenborough » . Нат Биотехнология . 22 (5): 554–9. дои : 10.1038/nbt959 . ПМИД 15077118 .

[201] Мете Б.А. и др. (2003). «Геном Geobacterulferreducens : восстановление металлов в подземных средах». Наука . 302 (5652): 1967–9. Бибкод : 2003Sci...302.1967M . CiteSeerX 10.1.1.186.3786 . дои : 10.1126/science.1088727 . ПМИД 14671304 . S2CID 38404097 .

[202] Суербаум С. и др. (2003). «Полная последовательность генома канцерогенной бактерии Helicobacter hepaticus » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (13): 7901–6. Бибкод : 2003PNAS..100.7901S . дои : 10.1073/pnas.1332093100 . ПМК 164685 . ПМИД 12810954 .

[203] Могила Дж.Ф. и др. (1997). «Полная последовательность генома желудочного возбудителя Helicobacter pylori » . Природа . 388 (6642): 539–47. Бибкод : 1997Natur.388..539T . дои : 10.1038/41483 . ПМИД 9252185 .

[204] Альм Р.А. и др. (1999). «Сравнение геномных последовательностей двух неродственных изолятов человеческого желудочного патогена Helicobacter pylori ». Природа . 397 (6715): 176–80. Бибкод : 1999Natur.397..176A . дои : 10.1038/16495 . ПМИД 9923682 . S2CID 4317442 .

[205] Ваннуччи, Фабио Аугусто (2013). Пролиферативная энтеропатия: патогенез и адаптация хозяина (кандидатская диссертация). Университет Миннесоты.

[206] Шнайкер; и др. (2007). «Полная последовательность генома миксобактерии Sorangium cellulosum» . Природная биотехнология . 25 (11): 1281–1289. дои : 10.1038/nbt1354 . ПМИД 17965706 .

[207] Зиверт, С.М.; К.М. Скотт; М.Г. Клоц; Сеть «ПСЖ»; Л. Дж. Хаузер; Дж. Хэмп; М. Хуглер; М. Лэнд; А. Лапид; Ф.В. Лаример; С. Лукас; С.А. Малфатти; Ф. Мейер; И.Т. Паульсен; В. Рен; Дж. Саймон; класс геномики USF (декабрь 2007 г.). «Геном эпсилонпротеобактериального хемолитоавтотрофа Sulfurimonas denitrificans » . Прикладная и экологическая микробиология . 74 (4): 1145–1156. дои : 10.1128/АЕМ.01844-07 . ISSN 0099-2240 . ПМК 2258580 . ПМИД 18065616 .

[208] Баар С. и др. (2003). «Полное секвенирование генома и анализ Wolinella succinogenes » . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (20): 11690–5. Бибкод : 2003PNAS..10011690B . дои : 10.1073/pnas.1932838100 . ПМК 208819 . ПМИД 14500908 .

[209] Фрейзер CM и др. (1997). «Геномная последовательность спирохеты болезни Лайма, Borrelia burgdorferi » . Природа . 390 (6660): 580–6. Бибкод : 1997Natur.390..580F . дои : 10.1038/37551 . ПМИД 9403685 . S2CID 4388492 .

[210] Глёкнер Г. и др. (2004). «Сравнительный анализ генома Borrelia garinii » . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (20): 6038–46. дои : 10.1093/nar/gkh953 . ПМК 534632 . ПМИД 15547252 .

[Ren_SX_et_al._2003_888–93-211] Перейти обратно: ^а ^б Рен С.С. и др. (2003). «Уникальные физиологические и патогенетические особенности Leptospira interrogans, выявленные методом полногеномного секвенирования» . Природа . 422 (6934): 888–93. Бибкод : 2003Natur.422..888R . дои : 10.1038/nature01597 . ПМИД 12712204 .

[Nascimento-212] Перейти обратно: ^а ^б Насименто А.Л. и др. (2004). «Сравнительная геномика двух сероваров Leptospira interrogans открывает новое понимание физиологии и патогенеза» . J Бактериол . 186 (7): 2164–72. дои : 10.1128/JB.186.7.2164-2172.2004 . ПМК 374407 . ПМИД 15028702 .

[213] Сешадри Р. и др. (2004). «Сравнение генома орального возбудителя Treponema denticola с геномами других спирохет» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (15): 5646–51. Бибкод : 2004PNAS..101.5646S . дои : 10.1073/pnas.0307639101 . ПМЦ 397461 . ПМИД 15064399 .

[214] Фрейзер CM и др. (1998). «Полная последовательность генома бледной трепонемы , спирохеты сифилиса». Наука . 281 (5375): 375–88. Бибкод : 1998Sci...281..375F . дои : 10.1126/science.281.5375.375 . ПМИД 9665876 .

[215] Го, З; и др. (октябрь 2011 г.). «Последовательность генома штамма 1340 возбудителя уток Mycoplasma anatis » . Дж. Бактериол . 193 (20): 5883–5884. дои : 10.1128/jb.05891-11 . ПМК 3187216 . ПМИД 21952548 .

[216] Папазиси Л. и др. (2003). «Полная последовательность генома птичьего патогена Mycoplasma Gallisepticum, штамм R (низкий)» . Микробиология . 149 (Часть 9): 2307–16. дои : 10.1099/mic.0.26427-0 . ПМИД 12949158 .

[217] Фрейзер CM и др. (1995). «Минимальный набор генов Mycoplasmagentium ». Наука . 270 (5235): 397–403. Бибкод : 1995Sci...270..397F . дои : 10.1126/science.270.5235.397 . ПМИД 7569993 . S2CID 29825758 .

[218] Миньон ФК и др. (2004). «Последовательность генома штамма Mycoplasma hyopneumoniae 232, возбудителя микоплазмоза свиней» . J Бактериол . 186 (21): 7123–33. дои : 10.1128/JB.186.21.7123-7133.2004 . ПМК 523201 . ПМИД 15489423 .

[Vasconcelos-219] Перейти обратно: ^а ^б ^с Васконселос А.Т. и др. (2005). «Патогены свиней и домашней птицы: полные последовательности генома двух штаммов Mycoplasma hyopneumoniae и штамма Mycoplasma synoviae » . J Бактериол . 187 (16): 5568–77. дои : 10.1128/JB.187.16.5568-5577.2005 . ПМК 1196056 . ПМИД 16077101 .

[220] Яффе Дж.Д. и др. (2004). «Полный геном и протеом Mycoplasma mobile » . Геном Рез . 14 (8): 1447–61. дои : 10.1101/гр.2674004 . ПМК 509254 . ПМИД 15289470 .

[221] Вестберг Дж. и др. (2004). «Последовательность генома Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC, штамм типа PG1T, возбудителя контагиозной плевропневмонии крупного рогатого скота (CBPP)» . Геном Рез . 14 (2): 221–7. дои : 10.1101/гр.1673304 . ПМК 327097 . ПМИД 14762060 .

[222] Сасаки Й. и др. (2002). «Полная геномная последовательность Mycoplasma penetrans , внутриклеточного бактериального патогена человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 30 (23): 5293–300. дои : 10.1093/нар/gkf667 . ПМК 137978 . ПМИД 12466555 .

[223] Химмельрайх Р. и др. (1996). «Полный анализ последовательности генома бактерии Mycoplasma pneumoniae » . Нуклеиновые кислоты Рез . 24 (22): 4420–49. дои : 10.1093/нар/24.22.4420 . ПМК 146264 . ПМИД 8948633 .

[224] Шамбо I и др. (2001). «Полная последовательность генома мышиного респираторного патогена Mycoplasma pulmonis » . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (10): 2145–53. дои : 10.1093/нар/29.10.2145 . ПМК 55444 . ПМИД 11353084 .

[225] Осима К. и др. (2004). «Редуктивная эволюция, предложенная на основе полной последовательности генома фитоплазмы, патогенной для растений» . Нат Жене . 36 (1): 27–9. дои : 10.1038/ng1277 . ПМИД 14661021 .

[226] Гласс Дж.И. и др. (2000). «Полная последовательность возбудителя слизистой оболочки Ureaplasma urealyticum ». Природа . 407 (6805): 757–62. Бибкод : 2000Natur.407..757G . дои : 10.1038/35037619 . ПМИД 11048724 . S2CID 205009765 .

[227] Андерсон, я; и др. (2012). «Полная последовательность генома термофильной сульфатредуцирующей океанской бактерии Thermodesulfatator indicus штамма типа (CIR29812 (T))» . Стоять. Геномная наука . 6 (2): 155–64. дои : 10.4056/sigs.2665915 . ПМЦ 3387792 . ПМИД 22768359 .

[228] Элкинс, Дж. Г.; и др. (2013). «Полная последовательность генома гипертермофильной сульфатредуцирующей бактерии Thermodesulfobacterium geofontis OPF15T» . Анонс генома . 1 (2): e00162–13. doi : 10.1128/genomeA.00162-13 . ПМЦ 3624685 . ПМИД 23580711 .

[Zhaxybayeva2009-229] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Жахыбаеваа О.; и др. (2009). «О химерной природе, термофильном происхождении и филогенетическом размещении Thermotogales» . ПНАС . 106 (14): 5865–5870. Бибкод : 2009PNAS..106.5865Z . дои : 10.1073/pnas.0901260106 . ПМК 2667022 . ПМИД 19307556 .

[230] Суитерс, Канзас; и др. (2011). «Последовательность генома штамма Kosmotoga olearia TBF 19.5.1, термофильной бактерии с широким диапазоном температур роста, выделенной с нефтяной платформы Тролль B в Северном море» . Дж. Бактериол . 193 (19): 5566–5567. дои : 10.1128/JB.05828-11 . ПМК 3187421 . ПМИД 21914881 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )

[231] Жахыбаева О.; и др. (2012). «Последовательность генома мезофильной бактерии Thermotogales Bacterium Mesotoga prima MesG1.Ag.4.2 обнаруживает самый большой на сегодняшний день геном Thermotogales» . Геном Биол Эвол . 4 (8): 700–708. дои : 10.1093/gbe/evs059 . ПМЦ 3516359 . ПМИД 22798451 .

[232] Несбё, КЛ; и др. (2009). «Геном Thermosipho africanus TCF52B: латеральные генетические связи с фирмикутами и архей» . Дж. Бактериол . 191 (6): 1974–1978. дои : 10.1128/JB.01448-08 . ПМЦ 2648366 . ПМИД 19124572 .

[233] Нельсон К.Е. и др. (1999). «Доказательства латерального переноса генов между архей и бактериями из последовательности генома Thermotoga maritima ». Природа . 399 (6734): 323–9. Бибкод : 1999Natur.399..323N . дои : 10.1038/20601 . ПМИД 10360571 . S2CID 4420157 .

[234] Латиф, Хайтем; и др. (2013). «Организация генома Thermotoga maritima отражает ее образ жизни» . ПЛОС Генетика . 9 (4): e1003485. дои : 10.1371/journal.pgen.1003485 . ПМЦ 3636130 . ПМИД 23637642 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

[ 45 ]

[ 46 ]

[ 47 ]

[ 48 ]

[ 49 ]

[ 50 ]

[ 51 ]

[ 52 ]

[ 53 ]

[ 54 ]

[ 55 ]

[ 56 ]

[ 57 ]

[ 58 ]

[ 59 ]

[ 60 ]

[ 61 ]

[ 62 ]

[ 63 ]

[ 64 ]

[ 65 ]

[ 66 ]

[ 67 ]

[ 68 ]

[ 69 ]

[ 70 ]

[ 71 ]

[ 72 ]

[ 73 ]

[ 74 ]

[ 75 ]

[ 76 ]

[ 77 ]

[ 78 ]

[ 79 ]

[ 80 ]

[ 81 ]

[ 82 ]

[ 83 ]

[ 84 ]

[ 85 ]

[ 86 ]

[ 87 ]

[ 88 ]

[ 89 ]

[ 90 ]

[ 91 ]

[ 92 ]

[ 93 ]

[ 94 ]

[ 95 ]

[ 96 ]

[ 97 ]

[ 98 ]

[ 99 ]

[ 100 ]