ДНК-полимераза IV
| DNA pol IV | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Организм | |||
| Символ | твой Б | ||
| Альт. символы | DINP | ||
| Входить | 944922 | ||
| RefSeq (защита) | НП_414766.1 | ||
| ЮниПрот | Q47155 | ||
| Другие данные | |||
| Номер ЕС | 2.7.7.7 | ||
| хромосома | геном: 0,25 - 0,25 Мб | ||
| |||
ДНК-полимераза IV — прокариотическая полимераза , участвующая в мутагенезе и кодируемая геном dinB . Он не проявляет 3'→5' экзонуклеазной (корректорской) активности и, следовательно, подвержен ошибкам. В E. coli ДНК-полимераза IV (Pol 4) участвует в ненаправленном мутагенезе. Pol IV представляет собой полимеразу семейства Y, экспрессируемую геном dinB , который включается посредством SOS-индукции, вызванной остановкой полимераз в репликационной вилке. Во время индукции SOS продукция Pol IV увеличивается в десять раз, и одной из функций в это время является вмешательство в процессивность голофермента Pol III. Это создает контрольную точку, останавливает репликацию и дает время на восстановление повреждений ДНК соответствующим путем восстановления. Другая функция Pol IV заключается в осуществлении синтеза трансфузии на остановленной репликационной вилке, например, в обход аддуктов N2-дезоксигуанина с более высокой скоростью, чем при пересечении неповрежденной ДНК. Клетки, лишенные гена dinB, имеют более высокую скорость мутагенеза, вызванного агентами, повреждающими ДНК. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]
Обход репликации 8-оксогуанина
[ редактировать ]Активные формы кислорода производятся постоянно во время нормального метаболизма и повреждают ДНК . ДНК-полимераза IV может катализировать трансформный синтез при различных повреждениях ДНК, включая 8-оксогуанин , серьезное окислительное повреждение с высоким мутагенным потенциалом . [ 6 ] При хромосом дупликации репликативными полимеразами невосстановленный 8-оксогуанин имеет тенденцию к неправильному спариванию с A, так что во время следующего раунда репликации трансверсионная возникает мутация G:C в T:A (G:C → 8-oxoG:C → 8- oxoG:A → Т:А). Однако когда ДНК-полимераза IV вмешивается, чтобы обойти повреждение, она с высокой эффективностью преимущественно включает правильный нуклеотид CTP напротив 8-оксогуанина, избегая тем самым потенциальных мутаций (G:C → 8-oxoG:C → 8-oxoG:C → GC). . [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ким С.Р., Маенхаут-Мишель Г., Ямада М., Ямамото Ю., Мацуи К., Софуни Т., Номи Т., Омори Х. (декабрь 1997 г.). «Множественные пути SOS-индуцированного мутагенеза в Escherichia coli: сверхэкспрессия dinB / dinP приводит к сильному усилению мутагенеза в отсутствие какой-либо экзогенной обработки, способной повредить ДНК» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (25): 13792–7. дои : 10.1073/pnas.94.25.13792 . ПМК 28386 . ПМИД 9391106 .
- ^ Наполитано Р., Джанель-Бинц Р., Вагнер Дж., Фукс Р.П. (ноябрь 2000 г.). «Все три SOS-индуцируемые ДНК-полимеразы (Pol II, Pol IV и Pol V) участвуют в индуцированном мутагенезе» . ЭМБО Дж . 19 (22): 6259–65. дои : 10.1093/emboj/19.22.6259 . ПМК 305832 . ПМИД 11080171 .
- ^ Маккензи Дж.Дж., Ли П.Л., Ломбардо М.Дж., Гастингс П.Дж., Розенберг С.М. (март 2001 г.). «Мутаторная ДНК-полимераза IV SOS функционирует в процессе адаптивной мутации, а не адаптивной амплификации» . Мол. Клетка . 7 (3): 571–9. дои : 10.1016/s1097-2765(01)00204-0 . ПМИД 11463382 .
- ^ Ленн-Самуэль Н., Вагнер Дж., Этьен Х., Фукс Р.П. (январь 2002 г.). «Фактор процессивности бета контролирует движение ДНК-полимеразы IV во время спонтанного мутагенеза и синтеза транслейкоза in vivo» . Представитель ЭМБО . 3 (1): 45–9. дои : 10.1093/embo-reports/kvf007 . ПМЦ 1083926 . ПМИД 11751576 .
- ^ Йейзер Б., Пеппер Э.Д., Гудман М.Ф., Финкель С.Е. (июнь 2002 г.). «ДНК-полимеразы, индуцированные SOS, повышают долгосрочную выживаемость и эволюционную приспособленность» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (13): 8737–41. дои : 10.1073/pnas.092269199 . ПМК 124368 . ПМИД 12060704 .
- ^ Jump up to: а б Рэпер А.Т., Гадкари В.В., Максвелл Б.А., Суо З. (2016). «Одномолекулярное исследование ответа на окислительное повреждение ДНК ДНК-полимеразой Y-семейства» . Биохимия . 55 (14): 2187–96. doi : 10.1021/acs.biochem.6b00166 . ПМК 5026495 . ПМИД 27002236 .
