Каспаза-9

КАСП9
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4RHW, 1JXQ, 1NW9, 2AR9, 3D9T, 3V3K, 3YGS
Идентификаторы
Псевдонимы	CASP9 , APAF-3, APAF3, ICE-LAP6, MCH6, PPP1R56, каспаза 9
Внешние идентификаторы	Опустить : 602234 ; МГИ : 1277950 ; Гомологен : 31024 ; Генные карты : CASP9 ; OMA : CASP9 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	15,526,534 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	141,543,287 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right uterine tube; ; left ovary; ; secondary oocyte; ; right ovary; ; pituitary gland; ; anterior pituitary; ; right testis; ; apex of heart; ; left testis; ; left lobe of thyroid gland;
	Top expressed in
	ureter; ; medullary collecting duct; ; cumulus cell; ; granulocyte; ; Region I of hippocampus proper; ; saccule; ; superior surface of tongue; ; gallbladder; ; pineal gland; ; lumbar spinal ganglion;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	cysteine-type peptidase activity; SH3 domain binding; peptidase activity; protein binding; enzyme activator activity; hydrolase activity; protein kinase binding; cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis; cysteine-type endopeptidase activity; identical protein binding; cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway; cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; mitochondrion; apoptosome; nucleus; protein-containing complex;
Biological process	regulation of apoptotic process; response to estradiol; response to organic cyclic compound; signal transduction in response to DNA damage; cellular response to UV; response to antibiotic; cellular response to organic cyclic compound; human ageing; platelet formation; glial cell apoptotic process; cellular response to dexamethasone stimulus; proteolysis; cellular response to DNA damage stimulus; response to lipopolysaccharide; positive regulation of neuron apoptotic process; activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c; intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; regulation of response to DNA damage stimulus; response to cobalt ion; activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; response to UV; execution phase of apoptosis; positive regulation of apoptotic process; apoptotic process; kidney development; response to ischemia; leukocyte apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	842
	12371
	ENSG00000132906
	ENSMUSG00000028914
	P55211
	Q8C3Q9
	НМ_001229 ; НМ_001278054 ; НМ_032996
	НМ_001277932 ; НМ_015733 ; НМ_001355176
	НП_001220 ; НП_001264983 ; НП_127463
	НП_001264861 ; НП_056548 ; НП_001342105
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Каспаза-9 — это фермент , который у человека кодируется CASP9 геном . Это инициаторная каспаза . ^{[ 5 ]} имеет решающее значение для пути апоптоза, обнаруженного во многих тканях. ^{[ 6 ]} Гомологи каспазы-9 были идентифицированы у всех млекопитающих, у которых они, как известно, существуют, таких как Mus musculus и Pan troglodytes . ^{[ 7 ]}

Каспаза-9 принадлежит к семейству каспаз, цистеин-аспарагиновых протеаз, участвующих в апоптозе и передаче сигналов цитокинов . ^{[ 8 ]} Апоптотические сигналы вызывают высвобождение цитохрома с из митохондрий и активацию apaf-1 ( апоптосомы ), которая затем расщепляет профермент каспазу-9 в активную димерную форму. ^{[ 6 ]} Регуляция этого фермента происходит посредством фосфорилирования , аллостерическим ингибитором ингибирующим димеризацию и вызывающим конформационные изменения . ^{[ 8 ]}

Правильная функция каспазы-9 необходима для апоптоза, что приводит к нормальному развитию центральной нервной системы . ^{[ 8 ]} Каспаза-9 имеет множество дополнительных клеточных функций, которые не зависят от ее роли в апоптозе. Неапоптотическая роль каспазы-9 включает регуляцию некроптоза , клеточную дифференцировку , врожденный иммунный ответ , созревание сенсорных нейронов, митохондриальный гомеостаз, организацию кортикоспинального контура и ишемическое повреждение сосудов. ^{[ 9 ]} Без правильной функции может произойти аномальное развитие тканей, что приведет к нарушению функции, заболеваниям и преждевременной смерти. ^{[ 8 ]} Мутации потери функции каспазы-9 были связаны с иммунодефицитом / лимфопролиферацией , дефектами нервной трубки и синдромом, подобным Ли-Фраумени . Повышенная активность каспазы-9 участвует в прогрессировании бокового амиотрофического склероза , отслойки сетчатки и синдрома медленных каналов, а также различных других неврологических , аутоиммунных и сердечно-сосудистых заболеваний . ^{[ 9 ]}

образуются различные изоформы белка каспазы-9 В результате альтернативного сплайсинга . ^{[ 10 ]}

Структура

Подобно другим каспазам, каспаза-9 имеет три домена: N-концевой продомен, большую субъединицу и малую субъединицу. ^{[ 8 ]} N-концевой продомен также называется длинным продоменом и содержит домена активации каспазы ( CARD ) мотив . ^{[ 11 ]} Продомен связан с каталитическим доменом линкерной петлей. ^{[ 12 ]}

каспазы-9 Мономер состоит из одной большой и одной малой субъединицы, каждая из которых содержит каталитический домен . ^{[ 13 ]} В отличие от обычно консервативного мотива активного сайта QACRG в других каспазах, каспаза-9 имеет мотив QACGG. ^{[ 14 ]}^{[ 12 ]}

При димеризации каспаза-9 имеет две разные конформации активного центра внутри каждого димера . ^{[ 13 ]} Один сайт очень похож на каталитический сайт других каспаз, тогда как второй не имеет «петли активации», что нарушает каталитический механизм в этом конкретном активном сайте. ^{[ 13 ]} Поверхностные петли вокруг активного сайта короткие, что приводит к широкой субстратной специфичности, поскольку субстрат-связывающая щель более открыта. ^{[ 15 ]} Для проявления каталитической активности в активном центре каспазы-9 в правильном положении должны находиться определенные аминокислоты. Аминокислота Asp в положении P1 является незаменимой, предпочтение отдается аминокислоте His в положении P2. ^{[ 16 ]}

Локализация

Внутри клетки каспаза-9 у человека обнаруживается в митохондриях, цитозоле и ядре. ^{[ 17 ]}

Экспрессия белка

Каспаза-9 у человека экспрессируется в тканях плода и взрослого человека. ^{[ 14 ]}^{[ 12 ]} Тканевая экспрессия каспазы-9 наблюдается повсеместно, причем ее наибольшая экспрессия наблюдается в мозге и сердце, особенно на стадии развития взрослого человека в мышечных клетках сердца. ^{[ 18 ]} Печень, поджелудочная железа и скелетные мышцы экспрессируют этот фермент на умеренном уровне, а все остальные ткани экспрессируют каспазу-9 на низком уровне. ^{[ 18 ]}

Механизм

Активная каспаза-9 действует как инициирующая каспаза путем расщепления, тем самым активируя нижестоящие каспазы-исполнители, инициируя апоптоз. ^{[ 19 ]} После активации каспаза-9 продолжает расщеплять каспазу-3, -6 и -7, запуская каскад каспаз, поскольку они расщепляют несколько других клеточных мишеней. ^{[ 8 ]}

Когда каспаза-9 неактивна, она существует в цитозоле в виде зимогена в мономерной форме. ^{[ 13 ]}^{[ 20 ]} Затем он рекрутируется и активируется CARD в apaf-1, распознавая CARD в каспазе-9. ^{[ 21 ]}

Обработка

Прежде чем может произойти активация, каспаза-9 должна быть обработана. ^{[ 22 ]} Первоначально каспаза-9 образуется в виде неактивного одноцепочечного зимогена. ^{[ 22 ]} Процессинг происходит, когда апоптосома связывается с прокаспазой-9, поскольку apaf-1 способствует аутопротеолитическому процессингу зимогена. ^{[ 22 ]} Процессированная каспаза-9 остается связанной с апоптосомным комплексом, образуя голофермент. ^{[ 23 ]}

Активация

Активация происходит, когда каспаза-9 димеризуется, и это может произойти двумя разными способами:

Каспаза-9 автоматически активируется, когда она связывается с apaf-1 ( апоптосомой ), поскольку apaf-1 олигомеризует молекулы-предшественники прокаспазы-9. ^{[ 17 ]}
Ранее активированные каспазы могут расщеплять каспазу-9, вызывая ее димеризацию. ^{[ 24 ]}

Каталитическая активность

Каспаза-9 имеет предпочтительную последовательность расщепления Leu-Gly-His-Asp-(cut)-X. ^{[ 16 ]}

Регулирование

Негативная регуляция каспазы-9 происходит посредством фосфорилирования . ^{[ 8 ]} Это осуществляется серин-треониновой киназой Akt на серине-196, которая ингибирует активацию и протеазную активность каспазы-9, подавляя каспазу-9 и дальнейшую активацию апоптоза. ^{[ 25 ]} Akt действует как аллостерический ингибитор каспазы-9, поскольку место фосфорилирования серина-196 находится далеко от каталитического сайта. ^{[ 25 ]} Ингибитор влияет на димеризацию каспазы-9 и вызывает конформационные изменения, которые влияют на субстратсвязывающую щель каспазы-9. ^{[ 25 ]}

Akt может действовать как на процессированную, так и на непроцессированную каспазу-9 in vitro, при этом фосфорилирование процессированной каспазы-9 происходит на большой субъединице. ^{[ 26 ]}

Недостатки и мутации

Дефицит каспазы-9 во многом влияет на мозг и его развитие. ^{[ 27 ]} Эффект мутации или дефицита этой каспазы по сравнению с другими пагубен. ^{[ 27 ]} Инициирующая роль каспазы-9 в апоптозе является причиной тяжелых эффектов, наблюдаемых у людей с атипичной каспазой-9.

Мыши с недостаточным количеством каспазы-9 имеют основной фенотип пораженного или аномального мозга. ^{[ 8 ]} Увеличение размера мозга из-за уменьшения апоптоза, что приводит к увеличению количества дополнительных нейронов, является примером фенотипа, наблюдаемого у мышей с дефицитом каспазы-9. ^{[ 28 ]} Гомозиготы по отсутствию каспазы-9 умирают перинатально в результате аномального развития головного мозга . ^{[ 8 ]}

У людей экспрессия каспазы-9 варьируется от ткани к ткани, и разные уровни играют физиологическую роль. ^{[ 28 ]} Низкое количество каспазы-9 приводит к раку и нейродегенеративным заболеваниям, таким как болезнь Альцгеймера . ^{[ 28 ]} Дальнейшие изменения на уровнях однонуклеотидного полиморфизма (SNP) и уровнях целого гена каспазы-9 могут вызвать мутации зародышевой линии, связанные с неходжкинской лимфомой . ^{[ 29 ]} Определенный полиморфизм промотора рака каспазы-9 увеличивает скорость экспрессии каспазы-9, и это может увеличить риск развития легких у человека . ^{[ 30 ]}

Клиническое значение

Эффекты аномальных уровней или функции каспазы-9 влияют на клинический мир. Влияние каспазы-9 на мозг может привести к будущей работе по ингибированию посредством таргетной терапии, особенно при заболеваниях, связанных с мозгом, поскольку этот фермент может принимать участие в путях развития нейрональных нарушений. ^{[ 8 ]}

Введение каспаз может также иметь медицинскую пользу. ^{[ 19 ]} В контексте реакции «трансплантат против хозяина » каспаза-9 может быть введена в качестве индуцируемого переключателя. ^{[ 31 ]} В присутствии небольшой молекулы она димеризуется и запускает апоптоз, уничтожая лимфоциты . ^{[ 31 ]}

iCasp9

iCasp9 (индуцибельная каспаза-9) представляет собой тип системы контроля Т-клеток химерного антигенного рецептора (CAR T-клеток). CAR Т-клетки представляют собой генетически модифицированные Т-клетки , которые проявляют цитотоксичность по отношению к опухолевым клеткам. Данные показывают, что CAR Т-клетки эффективны при лечении В-клеточных злокачественных новообразований . Однако, поскольку CAR Т-клетки привносят токсичность, контроль пользователя над клетками и их мишенями имеет решающее значение. ^{[ 32 ]} Одним из различных способов контроля над CAR Т-клетками является использование синтетических систем, контролируемых лекарствами. iCasp9 был создан путем модификации каспазы-9 и слияния ее со связывающим белком FK506 . ^{[ 32 ]} iCasp9 может быть добавлен к CAR Т-клеткам в качестве индуцируемого суицидного гена. ^{[ 33 ]}

Если терапия CAR Т-клетками приводит к серьезным побочным эффектам, iCasp9 можно использовать для прекращения лечения. Введение низкомолекулярного препарата, такого как рапамицин, приводит к его связыванию с доменом FK506. ^{[ 33 ]} Это, в свою очередь, индуцирует экспрессию каспазы-9, которая запускает гибель CAR-Т-клеток. ^{[ 33 ]}

Альтернативные расшифровки

Путем альтернативного сплайсинга получают четыре различных варианта каспазы-9.

Каспаза-9α (9L)

Этот вариант используется в качестве эталонной последовательности и обладает полной активностью цистеиновой протеазы. ^{[ 11 ]}^{[ 34 ]}

Каспаза-9β (9S)

Изоформа 2 не включает экзоны 3, 4, 5 и 6; отсутствуют аминокислоты 140-289. ^{[ 11 ]}^{[ 34 ]} Каспаза-9S не имеет центрального каталитического домена, поэтому она действует как ингибитор каспазы-9α, прикрепляясь к апоптосоме, подавляя каскад ферментов каспаз и апоптоз. ^{[ 11 ]}^{[ 35 ]} Каспазу-9β называют эндогенной доминантно-негативной изоформой.

Каспаза-9γ

В этом варианте отсутствуют аминокислоты 155–416, а для аминокислот 152–154 последовательность AYI изменена на TVL. ^{[ 34 ]}

Изоформа 4

По сравнению с эталонной последовательностью в ней отсутствуют аминокислоты 1-83. ^{[ 34 ]}

Взаимодействия

Было показано, что каспаза-9 взаимодействует с:

АПАФ1 ^{[ 36 ]}^{[ 37 ]}^{[ 6 ]}^{[ 38 ]}^{[ 39 ]}
БИРЦ2 , ^{[ 40 ]}
Бакуловирусный белок 3, содержащий повтор IAP , ^{[ 40 ]}
Каспаза 8 , ^{[ 41 ]}^{[ 42 ]}
НЛРП1 , ^{[ 36 ]}^{[ 43 ]} и
СИАП . ^{[ 40 ]}^{[ 44 ]}^{[ 45 ]}^{[ 46 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000132906 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000028914 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Каспаза 9
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ли П., Ниджхаван Д., Будихарджо И., Шринивасула С.М., Ахмад М., Алнемри Э.С., Ван Х (ноябрь 1997 г.). «Цитохром с и dATP-зависимое образование комплекса Apaf-1/каспаза-9 инициируют апоптотический протеазный каскад» . Клетка . 91 (4): 479–89. дои : 10.1016/s0092-8674(00)80434-1 . ПМИД 9390557 . S2CID 14321446 .
^ «ГомолоГен – NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 1 декабря 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж Куйда К. (2000). «Каспаза-9». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 32 (2): 121–4. дои : 10.1016/s1357-2725(99)00024-2 . ПМИД 10687948 .
^ Jump up to: ^а ^б Авруцкий М.И., Трой К.М. (2021). «Каспаза-9: мультимодальная терапевтическая мишень с разнообразной клеточной экспрессией при заболеваниях человека» . Границы в фармакологии . 12 : 701301. дои : 10.3389/fphar.2021.701301 . ПМК 8299054 . ПМИД 34305609 .
^ «Каспаза CASP9 9 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 30 ноября 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Ли П, Чжоу Л, Чжао Т, Лю X, Чжан П, Лю Ю, Чжэн X, Ли Q (апрель 2017 г.). «Каспаза-9: структура, механизмы и клиническое применение» . Онкотаргет . 8 (14): 23996–24008. дои : 10.18632/oncotarget.15098 . ПМЦ 5410359 . ПМИД 28177918 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Сринивасула С.М., Фернандес-Алнемри Т., Зангрилли Дж., Робертсон Н., Армстронг Р.К., Ван Л., Трапани Дж.А., Томаселли К.Дж., Литвак Г., Алнемри Э.С. (октябрь 1996 г.). «Ced-3/интерлейкин 1бета-превращающий фермент, подобный гомологу Mch6, и фермент, расщепляющий ламин, Mch2alpha, являются субстратами для апоптотического медиатора CPP32» . Журнал биологической химии . 271 (43): 27099–106. дои : 10.1074/jbc.271.43.27099 . ПМИД 8900201 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Ренатус М., Стеннике Х.Р., Скотт Ф.Л., Лиддингтон Р.К., Салвесен Г.С. (декабрь 2001 г.). «Образование димера приводит к активации протеазы клеточной смерти каспазы 9» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (25): 14250–5. Бибкод : 2001PNAS...9814250R . дои : 10.1073/pnas.231465798 . ПМК 64668 . ПМИД 11734640 .
^ Jump up to: ^а ^б Дуан Х., Орт К., Чиннайян А.М., Пуарье Г.Г., Фролих С.Дж., Хе В.В., Диксит В.М. (июль 1996 г.). «ICE-LAP6, новый член семейства генов ICE/Ced-3, активируется цитотоксической Т-клеточной протеазой гранзимом B» . Журнал биологической химии . 271 (28): 16720–4. дои : 10.1074/jbc.271.28.16720 . ПМИД 8663294 .
^ Торнберри Н.А., Рано Т.А., Петерсон Э.П., Распер Д.М., Тимки Т., Гарсия-Кальво М., Хаутзагер В.М., Нордстрем П.А., Рой С., Вайланкур Дж.П., Чепмен К.Т., Николсон Д.В. (июль 1997 г.). «Комбинаторный подход определяет особенности членов семейства каспаз и гранзима B. Установлены функциональные связи для ключевых медиаторов апоптоза» . Журнал биологической химии . 272 (29): 17907–11. дои : 10.1074/jbc.272.29.17907 . ПМИД 9218414 .
^ Jump up to: ^а ^б Блаше С., Мёртль М., Штойбер Х., Сислер Г., Ниса С., Шварц Ф., Лаврик И., Гроневолд Т.М., Маскос К., Донненберг М.С., Ульманн Д., Уец П., Кёгль М. (14 марта 2013 г.). «Эффекторный белок NleF E. coli является ингибитором каспаз» . ПЛОС ОДИН . 8 (3): e58937. Бибкод : 2013PLoSO...858937B . дои : 10.1371/journal.pone.0058937 . ПМЦ 3597564 . ПМИД 23516580 .
^ Jump up to: ^а ^б Животовский Б., Самали А., Гам А., Оррениус С. (июль 1999 г.). «Каспазы: их внутриклеточная локализация и транслокация при апоптозе» . Смерть клеток и дифференцировка . 6 (7): 644–51. дои : 10.1038/sj.cdd.4400536 . ПМИД 10453075 .
^ Jump up to: ^а ^б Хан Ю, Чен ЮС, Лю З, Бодяк Н, Ригор Д, Биспинг Э, Пу ВТ, Кан ПМ (август 2006 г.). «Сверхэкспрессия HAX-1 защищает сердечные миоциты от апоптоза посредством ингибирования каспазы-9» . Исследование кровообращения . 99 (4): 415–23. дои : 10.1161/01.RES.0000237387.05259.a5 . ПМИД 16857965 .
^ Jump up to: ^а ^б Макилвейн Д.Р., Бергер Т., Мак Т.В. (апрель 2013 г.). «Функции каспаз при гибели клеток и заболеваниях» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 5 (4): а008656. doi : 10.1101/cshperspect.a008656 . ПМЦ 3683896 . ПМИД 23545416 .
^ Макилвейн Д.Р., Бергер Т., Мак Т.В. (апрель 2013 г.). «Функции каспаз при гибели клеток и заболеваниях» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 5 (4): а008656. doi : 10.1101/cshperspect.a008656 . ПМЦ 3683896 . ПМИД 23545416 .
^ Ачехан Д., Цзян Х, Морган Д.Г., Хойзер Дж.Э., Ван Х, Эйки К.В. (2002). «Трехмерная структура апоптосомы: значение для сборки, связывания прокаспазы-9 и активации» . Молекулярная клетка . 9 (2): 423–32. дои : 10.1016/s1097-2765(02)00442-2 . ПМИД 11864614 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ху Ц, Ву Д, Чен В, Ян Цз, Ши Ю (май 2013 г.). «Для апоптосомо-опосредованной активации каспазы-9 необходим протеолитический процессинг зимогена каспазы-9» . Журнал биологической химии . 288 (21): 15142–7. дои : 10.1074/jbc.M112.441568 . ПМЦ 3663534 . ПМИД 23572523 .
^ Мейс П.Д., Ридл С.Дж. (декабрь 2010 г.). «Платформы и сборки молекулярной гибели клеток» . Современное мнение в области клеточной биологии . 22 (6): 828–36. дои : 10.1016/j.ceb.2010.08.004 . ПМЦ 2993832 . ПМИД 20817427 .
^ Друскович М., Супут Д., Милисав И. (декабрь 2006 г.). «Сверхэкспрессия каспазы-9 запускает ее активацию и апоптоз in vitro» . Хорватский медицинский журнал . 47 (6): 832–40. ПМК 2080483 . ПМИД 17167855 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Кардоне М.Х., Рой Н., Стеннике Х.Р., Салвесен Г.С., Франке Т.Ф., Стэнбридж Э., Фриш С., Рид Дж.К. (ноябрь 1998 г.). «Регуляция клеточной гибели протеазы каспазы-9 путем фосфорилирования». Наука . 282 (5392): 1318–21. Бибкод : 1998Sci...282.1318C . дои : 10.1126/science.282.5392.1318 . ПМИД 9812896 .
^ Кардоне М.Х., Рой Н., Стеннике Х.Р., Салвесен Г.С., Франке Т.Ф., Стэнбридж Э., Фриш С., Рид Дж.К. (ноябрь 1998 г.). «Регуляция клеточной гибели протеазы каспазы-9 путем фосфорилирования». Наука . 282 (5392): 1318–21. Бибкод : 1998Sci...282.1318C . дои : 10.1126/science.282.5392.1318 . ПМИД 9812896 .
^ Jump up to: ^а ^б Мэдден С.Д., Коттер Т.Г. (февраль 2008 г.). «Гибель клеток в развитии и дегенерации мозга: контроль экспрессии каспаз может иметь ключевое значение!». Молекулярная нейробиология . 37 (1): 1–6. дои : 10.1007/s12035-008-8021-4 . ПМИД 18449809 . S2CID 12980212 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Хакем Р., Хакем А., Дункан Г.С., Хендерсон Дж.Т., Ву М., Соенгас М.С., Элия А., де ла Помпа Дж.Л., Каги Д., Кху В., Поттер Дж., Йошида Р., Кауфман С.А., Лоу С.В., Пеннингер Дж.М., Мак Т.В. ( 1998). «Дифференциальная потребность в каспазе 9 в путях апоптоза in vivo» . Клетка . 94 (3): 339–52. дои : 10.1016/s0092-8674(00)81477-4 . ПМИД 9708736 . S2CID 14390544 .
^ Келли Дж.Л., Новак А.Дж., Фредериксен З.С., Либоу М., Анселл С.М., Доган А., Ван А.Х., Витциг Т.Е., Колл Т.Г., Кей Н.Е., Хаберманн Т.М., Слагер С.Л., Серхан Дж.Р. (ноябрь 2010 г.). «Зародышевые вариации генов пути апоптоза и риск неходжкинской лимфомы» . Эпидемиология рака, биомаркеры и профилактика . 19 (11): 2847–58. doi : 10.1158/1055-9965.EPI-10-0581 . ПМЦ 2976783 . ПМИД 20855536 .
^ Пак Дж.И., Пак Дж.М., Чан Дж.С., Чхве Дж.Е., Ким К.М., Ча СИ, Ким Ч.Н., Кан Ю.М., Ли В.К., Кам С., Пак Р.В., Ким И.С., Ли Дж.Т., Юнг Т.Х. (июнь 2006 г.). «Полиморфизмы промотора каспазы 9 и риск первичного рака легких» . Молекулярная генетика человека . 15 (12): 1963–71. дои : 10.1093/hmg/ddl119 . ПМИД 16687442 .
^ Jump up to: ^а ^б Страатхоф К.К., Пуле М.А., Йотнда П., Дотти Дж., Ванин Э.Ф., Бреннер М.К., Хеслоп Х.Э., Спенсер Д.М., Руни К.М. (июнь 2005 г.). «Индуцируемый предохранительный переключатель каспазы 9 для Т-клеточной терапии» . Кровь . 105 (11): 4247–54. дои : 10.1182/кровь-2004-11-4564 . ПМК 1895037 . ПМИД 15728125 .
^ Jump up to: ^а ^б Чой Дж. Х., Уильямс Дж. З., Лим Вашингтон (2020). «Инженерия Т-клеток для лечения рака: конвергенция иммуноонкологии и синтетической биологии» . Ежегодный обзор биологии рака . 4 : 121–139. doi : 10.1146/annurev-cancerbio-030419-033657 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Определение аутологичных Т-лимфоцитов, экспрессирующих iCASP9-CD19» . Национальный институт рака . Проверено 2 июля 2020 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д «CASP9 - предшественник каспазы-9 - Homo sapiens (человек) - ген и белок CASP9» . www.uniprot.org . Проверено 1 декабря 2017 г.
^ Ву НТ, Парк М.А., Шульц Дж.К., Гоэ Р.В., Хоферлин Л.А., Шульц М.Д., Смит С.А., Линч К.В., Чалфант К.Э. (март 2013 г.). «hnRNP U усиливает сплайсинг каспазы-9 и модулируется AKT-зависимым фосфорилированием hnRNP L» . Журнал биологической химии . 288 (12): 8575–84. дои : 10.1074/jbc.M112.443333 . ПМЦ 3605676 . ПМИД 23396972 .
^ Jump up to: ^а ^б Чу З.Л., Пио Ф., Се З., Уэлш К., Краевска М., Краевски С., Годзик А., Рид Дж.К. (март 2001 г.). «Новый усилитель апоптосомы Apaf1, участвующий в активации и апоптозе цитохрома с-зависимой каспазы» . Журнал биологической химии . 276 (12): 9239–45. дои : 10.1074/jbc.M006309200 . ПМИД 11113115 .
^ Чо Д.Х., Хонг Ю.М., Ли Х.Дж., Ву Х.Н., Пё Дж.О., Мак Т.В., Юнг Ю.К. (сентябрь 2004 г.). «Индуцированное ингибирование ишемического/гипоксического повреждения с помощью APIP, нового белка, взаимодействующего с Apaf-1» . Журнал биологической химии . 279 (38): 39942–50. дои : 10.1074/jbc.M405747200 . ПМИД 15262985 .
^ Ху Ю, Бенедикт М.А., Ву Д, Инохара Н, Нуньес Г (апрель 1998 г.). «Bcl-XL взаимодействует с Apaf-1 и ингибирует Apaf-1-зависимую активацию каспазы-9» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (8): 4386–91. Бибкод : 1998PNAS...95.4386H . дои : 10.1073/pnas.95.8.4386 . ПМК 22498 . ПМИД 9539746 .
^ Пан Дж., О'Рурк К., Диксит В.М. (март 1998 г.). «Каспаза-9, Bcl-XL и Apaf-1 образуют тройной комплекс» . Журнал биологической химии . 273 (10): 5841–5. дои : 10.1074/jbc.273.10.5841 . ПМИД 9488720 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Деверо К.Л., Рой Н., Стеннике Х.Р., Ван Арсдейл Т., Чжоу К., Шринивасула С.М., Алнемри Э.С., Салвесен Г.С., Рид Дж.К. (апрель 1998 г.). «IAP блокируют апоптотические события, индуцированные каспазой-8 и цитохромом с, путем прямого ингибирования отдельных каспаз» . Журнал ЭМБО . 17 (8): 2215–23. дои : 10.1093/emboj/17.8.2215 . ПМК 1170566 . ПМИД 9545235 .
^ Го Ю, Шринивасула С.М., Друилхе А., Фернандес-Алнемри Т., Алнемри Э.С. (апрель 2002 г.). «Каспаза-2 индуцирует апоптоз, высвобождая проапоптотические белки из митохондрий» . Журнал биологической химии . 277 (16): 13430–7. дои : 10.1074/jbc.M108029200 . ПМИД 11832478 .
^ Шринивасула С.М., Ахмад М., Фернандес-Алнемри Т., Литвак Г., Алнемри Э.С. (декабрь 1996 г.). «Молекулярное упорядочение пути Fas-апоптоза: протеаза Fas/APO-1 Mch5 представляет собой CrmA-ингибируемую протеазу, которая активирует несколько Ced-3/ICE-подобных цистеиновых протеаз» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (25): 14486–91. Бибкод : 1996PNAS...9314486S . дои : 10.1073/pnas.93.25.14486 . ПМК 26159 . ПМИД 8962078 .
^ Хлаинг Т., Го Р.Ф., Дилли К.А., Лусия Дж.М., Морриш Т.А., Ши М.М., Винченц С., Уорд П.А. (март 2001 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика DEFCAP-L и -S, двух изоформ нового члена семейства белков апоптоза Ced-4 млекопитающих» . Журнал биологической химии . 276 (12): 9230–8. дои : 10.1074/jbc.M009853200 . ПМИД 11076957 .
^ Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
^ Давуди Дж., Лин Л., Келли Дж., Листон П., Маккензи А.Е. (сентябрь 2004 г.). «Белок, ингибирующий апоптоз нейронов, не взаимодействует с Smac и требует АТФ для связывания каспазы-9» . Журнал биологической химии . 279 (39): 40622–8. дои : 10.1074/jbc.M405963200 . ПМИД 15280366 .
^ Рихтер Б.В., Мир С.С., Эйбен Л.Дж., Льюис Дж., Реффи С.Б., Фраттини А., Тиан Л., Фрэнк С., Юл Р.Дж., Нельсон Д.Л., Нотаранжело Л.Д., Веццони П., Фернхед Х.О., Дакетт К.С. (июль 2001 г.). «Молекулярное клонирование ILP-2, нового члена семейства белков-ингибиторов апоптоза» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (13): 4292–301. дои : 10.1128/MCB.21.13.4292-4301.2001 . ПМК 87089 . ПМИД 11390657 .

Дальнейшее чтение

Коэн GM (август 1997 г.). «Каспазы: палачи апоптоза» . Биохимический журнал . 326 (Часть 1): 1–16. дои : 10.1042/bj3260001 . ПМЦ 1218630 . ПМИД 9337844 .
Деверо, К.Л., Рид Дж.К. (февраль 1999 г.). «Белки семейства IAP — супрессоры апоптоза» . Гены и развитие . 13 (3): 239–52. дои : 10.1101/gad.13.3.239 . ПМИД 9990849 .
Чжао LJ, Чжу Х (декабрь 2004 г.). «Структура и функция вспомогательного регуляторного белка ВИЧ-1 Vpr: новые ключи к разработке лекарств». Текущие цели по борьбе с наркотиками. Иммунные, эндокринные и метаболические нарушения . 4 (4): 265–75. дои : 10.2174/1568008043339668 . ПМИД 15578977 .
Ле Рузик Э., Бенишу С. (февраль 2005 г.). «Белок Vpr ВИЧ-1: различные роли в жизненном цикле вируса» . Ретровирусология . 2:11 . дои : 10.1186/1742-4690-2-11 . ПМК 554975 . ПМИД 15725353 .
Мун Х.С., Ян Дж.С. (февраль 2006 г.). «Роль ВИЧ Vpr как регулятора апоптоза и эффектора на клетках-свидетелях» . Молекулы и клетки . 21 (1): 7–20. дои : 10.1016/s1016-8478(23)12897-4 . ПМИД 16511342 .
Копп С. (сентябрь 1976 г.). «Воспроизводимость ответов на анкету о симптомах жевательной дисфункции». Общественная стоматология и оральная эпидемиология . 4 (5): 205–9. дои : 10.1111/j.1600-0528.1976.tb00985.x . ПМИД 1067155 .
Фернандес-Алнемри Т., Литвак Г., Алнемри Э.С. (декабрь 1994 г.). «CPP32, новый апоптозный белок человека, гомологичен белку гибели клеток Caenorhabditis elegans Ced-3 и бета-превращающему ферменту интерлейкина-1 млекопитающих» . Журнал биологической химии . 269 (49): 30761–4. дои : 10.1016/S0021-9258(18)47344-9 . ПМИД 7983002 .
Дуан Х., Орт К., Чиннайян А.М., Пуарье Г.Г., Фролих С.Дж., Хе В.В., Диксит В.М. (июль 1996 г.). «ICE-LAP6, новый член семейства генов ICE/Ced-3, активируется цитотоксической Т-клеточной протеазой гранзимом B» . Журнал биологической химии . 271 (28): 16720–4. дои : 10.1074/jbc.271.28.16720 . ПМИД 8663294 .
Сринивасула С.М., Фернандес-Алнемри Т., Зангрилли Дж., Робертсон Н., Армстронг Р.К., Ван Л., Трапани Дж.А., Томаселли К.Дж., Литвак Г., Алнемри Э.С. (октябрь 1996 г.). «Ced-3/интерлейкин 1бета-превращающий фермент, подобный гомологу Mch6, и фермент, расщепляющий ламин, Mch2alpha, являются субстратами для апоптотического медиатора CPP32» . Журнал биологической химии . 271 (43): 27099–106. дои : 10.1074/jbc.271.43.27099 . ПМИД 8900201 .
Шринивасула С.М., Ахмад М., Фернандес-Алнемри Т., Литвак Г., Алнемри Э.С. (декабрь 1996 г.). «Молекулярное упорядочение пути Fas-апоптоза: протеаза Fas/APO-1 Mch5 представляет собой CrmA-ингибируемую протеазу, которая активирует несколько Ced-3/ICE-подобных цистеиновых протеаз» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (25): 14486–91. Бибкод : 1996PNAS...9314486S . дои : 10.1073/pnas.93.25.14486 . ПМК 26159 . ПМИД 8962078 .
Котакота С., Азума Т., Рейнхард С., Клиппель А., Тан Дж., Чу К., МакГарри Т.Дж., Киршнер М.В., Котс К., Квятковски Д.Д., Уильямс Л.Т. (октябрь 1997 г.). «Фрагмент гельзолина, генерируемый каспазой-3: эффектор морфологических изменений при апоптозе». Наука . 278 (5336): 294–8. дои : 10.1126/science.278.5336.294 . ПМИД 9323209 .
Ли П., Ниджхаван Д., Будихарджо И., Шринивасула С.М., Ахмад М., Алнемри Э.С., Ван Х (ноябрь 1997 г.). «Цитохром с и dATP-зависимое образование комплекса Apaf-1/каспаза-9 инициируют апоптотический протеазный каскад» . Клетка . 91 (4): 479–89. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80434-1 . ПМИД 9390557 . S2CID 14321446 .
Пан Дж., О'Рурк К., Диксит В.М. (март 1998 г.). «Каспаза-9, Bcl-XL и Apaf-1 образуют тройной комплекс» . Журнал биологической химии . 273 (10): 5841–5. дои : 10.1074/jbc.273.10.5841 . ПМИД 9488720 .
Ху Ю, Бенедикт М.А., Ву Д, Инохара Н, Нуньес Г (апрель 1998 г.). «Bcl-XL взаимодействует с Apaf-1 и ингибирует Apaf-1-зависимую активацию каспазы-9» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (8): 4386–91. Бибкод : 1998PNAS...95.4386H . дои : 10.1073/pnas.95.8.4386 . ПМК 22498 . ПМИД 9539746 .
Деверо К.Л., Рой Н., Стеннике Х.Р., Ван Арсдейл Т., Чжоу К., Шринивасула С.М., Алнемри Э.С., Салвесен Г.С., Рид Дж.К. (апрель 1998 г.). «IAP блокируют апоптотические события, индуцированные каспазой-8 и цитохромом с, путем прямого ингибирования отдельных каспаз» . Журнал ЭМБО . 17 (8): 2215–23. дои : 10.1093/emboj/17.8.2215 . ПМК 1170566 . ПМИД 9545235 .
Сринивасула С.М., Ахмад М., Фернандес-Алнемри Т., Алнемри Э.С. (июнь 1998 г.). «Аутоактивация прокаспазы-9 путем олигомеризации, опосредованной Apaf-1» . Молекулярная клетка . 1 (7): 949–57. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80095-7 . ПМИД 9651578 .
Камада С., Кусано Х., Фудзита Х., Оцу М., Коя Р.К., Кузумаки Н., Цудзимото Ю. (июль 1998 г.). «Метод клонирования субстратов каспаз, использующий двугибридную систему дрожжей: клонирование антиапоптотического гена гельзолина» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (15): 8532–7. Бибкод : 1998PNAS...95.8532K . дои : 10.1073/pnas.95.15.8532 . ПМК 21110 . ПМИД 9671712 .
Кардоне М.Х., Рой Н., Стеннике Х.Р., Салвесен Г.С., Франке Т.Ф., Стэнбридж Э., Фриш С., Рид Дж.К. (ноябрь 1998 г.). «Регуляция клеточной гибели протеазы каспазы-9 путем фосфорилирования». Наука . 282 (5392): 1318–21. Бибкод : 1998Sci...282.1318C . дои : 10.1126/science.282.5392.1318 . ПМИД 9812896 .
Ху Ю, Дин Л, Спенсер ДМ, Нуньес Г (декабрь 1998 г.). «Область повторов WD-40 регулирует самоассоциацию Apaf-1 и активацию прокаспазы-9» . Журнал биологической химии . 273 (50): 33489–94. дои : 10.1074/jbc.273.50.33489 . ПМИД 9837928 .
Лей К., Нимнуал А., Зонг WX, Кеннеди, Нью-Джерси, Флавелл Р.А., Томпсон CB, Бар-Саги Д., Дэвис Р.Дж. (июль 2002 г.). «Подсемейство Bax белков, родственных Bcl2, необходимо для передачи апоптотического сигнала с помощью NH(2)-концевой киназы c-Jun» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (13): 4929–42. дои : 10.1128/MCB.22.13.4929-4942.2002 . ПМЦ 133923 . ПМИД 12052897 .
Эрншоу В.К., Мартинс Л.М., Кауфманн С.Х. (1999). «Каспазы млекопитающих: структура, активация, субстраты и функции во время апоптоза». Ежегодный обзор биохимии . 68 : 383–424. doi : 10.1146/annurev.biochem.68.1.383 . ПМИД 10872455 .

Внешние ссылки

Онлайн-база данных MEROPS . по пептидазам и их ингибиторам: C14.010 ^{[ постоянная мертвая ссылка ]}

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000132906 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000028914 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] Каспаза 9

[pmid9390557-6] Jump up to: ^а ^б ^с Ли П., Ниджхаван Д., Будихарджо И., Шринивасула С.М., Ахмад М., Алнемри Э.С., Ван Х (ноябрь 1997 г.). «Цитохром с и dATP-зависимое образование комплекса Apaf-1/каспаза-9 инициируют апоптотический протеазный каскад» . Клетка . 91 (4): 479–89. дои : 10.1016/s0092-8674(00)80434-1 . ПМИД 9390557 . S2CID 14321446 .

[7] «ГомолоГен – NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 1 декабря 2017 г.

[Kuida_2000-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж Куйда К. (2000). «Каспаза-9». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 32 (2): 121–4. дои : 10.1016/s1357-2725(99)00024-2 . ПМИД 10687948 .

[Avrutsky_2021-9] Jump up to: ^а ^б Авруцкий М.И., Трой К.М. (2021). «Каспаза-9: мультимодальная терапевтическая мишень с разнообразной клеточной экспрессией при заболеваниях человека» . Границы в фармакологии . 12 : 701301. дои : 10.3389/fphar.2021.701301 . ПМК 8299054 . ПМИД 34305609 .

[10] «Каспаза CASP9 9 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 30 ноября 2017 г.

[Li_2017-11] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Ли П, Чжоу Л, Чжао Т, Лю X, Чжан П, Лю Ю, Чжэн X, Ли Q (апрель 2017 г.). «Каспаза-9: структура, механизмы и клиническое применение» . Онкотаргет . 8 (14): 23996–24008. дои : 10.18632/oncotarget.15098 . ПМЦ 5410359 . ПМИД 28177918 .

[pmid8900201-12] Jump up to: ^а ^б ^с Сринивасула С.М., Фернандес-Алнемри Т., Зангрилли Дж., Робертсон Н., Армстронг Р.К., Ван Л., Трапани Дж.А., Томаселли К.Дж., Литвак Г., Алнемри Э.С. (октябрь 1996 г.). «Ced-3/интерлейкин 1бета-превращающий фермент, подобный гомологу Mch6, и фермент, расщепляющий ламин, Mch2alpha, являются субстратами для апоптотического медиатора CPP32» . Журнал биологической химии . 271 (43): 27099–106. дои : 10.1074/jbc.271.43.27099 . ПМИД 8900201 .

[Renatus_2001-13] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Ренатус М., Стеннике Х.Р., Скотт Ф.Л., Лиддингтон Р.К., Салвесен Г.С. (декабрь 2001 г.). «Образование димера приводит к активации протеазы клеточной смерти каспазы 9» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (25): 14250–5. Бибкод : 2001PNAS...9814250R . дои : 10.1073/pnas.231465798 . ПМК 64668 . ПМИД 11734640 .

[pmid8663294-14] Jump up to: ^а ^б Дуан Х., Орт К., Чиннайян А.М., Пуарье Г.Г., Фролих С.Дж., Хе В.В., Диксит В.М. (июль 1996 г.). «ICE-LAP6, новый член семейства генов ICE/Ced-3, активируется цитотоксической Т-клеточной протеазой гранзимом B» . Журнал биологической химии . 271 (28): 16720–4. дои : 10.1074/jbc.271.28.16720 . ПМИД 8663294 .

[15] Торнберри Н.А., Рано Т.А., Петерсон Э.П., Распер Д.М., Тимки Т., Гарсия-Кальво М., Хаутзагер В.М., Нордстрем П.А., Рой С., Вайланкур Дж.П., Чепмен К.Т., Николсон Д.В. (июль 1997 г.). «Комбинаторный подход определяет особенности членов семейства каспаз и гранзима B. Установлены функциональные связи для ключевых медиаторов апоптоза» . Журнал биологической химии . 272 (29): 17907–11. дои : 10.1074/jbc.272.29.17907 . ПМИД 9218414 .

[Blasche_2013-16] Jump up to: ^а ^б Блаше С., Мёртль М., Штойбер Х., Сислер Г., Ниса С., Шварц Ф., Лаврик И., Гроневолд Т.М., Маскос К., Донненберг М.С., Ульманн Д., Уец П., Кёгль М. (14 марта 2013 г.). «Эффекторный белок NleF E. coli является ингибитором каспаз» . ПЛОС ОДИН . 8 (3): e58937. Бибкод : 2013PLoSO...858937B . дои : 10.1371/journal.pone.0058937 . ПМЦ 3597564 . ПМИД 23516580 .

[ReferenceA-17] Jump up to: ^а ^б Животовский Б., Самали А., Гам А., Оррениус С. (июль 1999 г.). «Каспазы: их внутриклеточная локализация и транслокация при апоптозе» . Смерть клеток и дифференцировка . 6 (7): 644–51. дои : 10.1038/sj.cdd.4400536 . ПМИД 10453075 .

[Han_2006-18] Jump up to: ^а ^б Хан Ю, Чен ЮС, Лю З, Бодяк Н, Ригор Д, Биспинг Э, Пу ВТ, Кан ПМ (август 2006 г.). «Сверхэкспрессия HAX-1 защищает сердечные миоциты от апоптоза посредством ингибирования каспазы-9» . Исследование кровообращения . 99 (4): 415–23. дои : 10.1161/01.RES.0000237387.05259.a5 . ПМИД 16857965 .

[McIlwain_2013-19] Jump up to: ^а ^б Макилвейн Д.Р., Бергер Т., Мак Т.В. (апрель 2013 г.). «Функции каспаз при гибели клеток и заболеваниях» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 5 (4): а008656. doi : 10.1101/cshperspect.a008656 . ПМЦ 3683896 . ПМИД 23545416 .

[20] Макилвейн Д.Р., Бергер Т., Мак Т.В. (апрель 2013 г.). «Функции каспаз при гибели клеток и заболеваниях» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 5 (4): а008656. doi : 10.1101/cshperspect.a008656 . ПМЦ 3683896 . ПМИД 23545416 .

[pmid11864614-21] Ачехан Д., Цзян Х, Морган Д.Г., Хойзер Дж.Э., Ван Х, Эйки К.В. (2002). «Трехмерная структура апоптосомы: значение для сборки, связывания прокаспазы-9 и активации» . Молекулярная клетка . 9 (2): 423–32. дои : 10.1016/s1097-2765(02)00442-2 . ПМИД 11864614 .

[Hu_2013-22] Jump up to: ^а ^б ^с Ху Ц, Ву Д, Чен В, Ян Цз, Ши Ю (май 2013 г.). «Для апоптосомо-опосредованной активации каспазы-9 необходим протеолитический процессинг зимогена каспазы-9» . Журнал биологической химии . 288 (21): 15142–7. дои : 10.1074/jbc.M112.441568 . ПМЦ 3663534 . ПМИД 23572523 .

[23] Мейс П.Д., Ридл С.Дж. (декабрь 2010 г.). «Платформы и сборки молекулярной гибели клеток» . Современное мнение в области клеточной биологии . 22 (6): 828–36. дои : 10.1016/j.ceb.2010.08.004 . ПМЦ 2993832 . ПМИД 20817427 .

[24] Друскович М., Супут Д., Милисав И. (декабрь 2006 г.). «Сверхэкспрессия каспазы-9 запускает ее активацию и апоптоз in vitro» . Хорватский медицинский журнал . 47 (6): 832–40. ПМК 2080483 . ПМИД 17167855 .

[Cardone_1998-25] Jump up to: ^а ^б ^с Кардоне М.Х., Рой Н., Стеннике Х.Р., Салвесен Г.С., Франке Т.Ф., Стэнбридж Э., Фриш С., Рид Дж.К. (ноябрь 1998 г.). «Регуляция клеточной гибели протеазы каспазы-9 путем фосфорилирования». Наука . 282 (5392): 1318–21. Бибкод : 1998Sci...282.1318C . дои : 10.1126/science.282.5392.1318 . ПМИД 9812896 .

[26] Кардоне М.Х., Рой Н., Стеннике Х.Р., Салвесен Г.С., Франке Т.Ф., Стэнбридж Э., Фриш С., Рид Дж.К. (ноябрь 1998 г.). «Регуляция клеточной гибели протеазы каспазы-9 путем фосфорилирования». Наука . 282 (5392): 1318–21. Бибкод : 1998Sci...282.1318C . дои : 10.1126/science.282.5392.1318 . ПМИД 9812896 .

[Madden_2008-27] Jump up to: ^а ^б Мэдден С.Д., Коттер Т.Г. (февраль 2008 г.). «Гибель клеток в развитии и дегенерации мозга: контроль экспрессии каспаз может иметь ключевое значение!». Молекулярная нейробиология . 37 (1): 1–6. дои : 10.1007/s12035-008-8021-4 . ПМИД 18449809 . S2CID 12980212 .

[Hakem_1998-28] Jump up to: ^а ^б ^с Хакем Р., Хакем А., Дункан Г.С., Хендерсон Дж.Т., Ву М., Соенгас М.С., Элия А., де ла Помпа Дж.Л., Каги Д., Кху В., Поттер Дж., Йошида Р., Кауфман С.А., Лоу С.В., Пеннингер Дж.М., Мак Т.В. ( 1998). «Дифференциальная потребность в каспазе 9 в путях апоптоза in vivo» . Клетка . 94 (3): 339–52. дои : 10.1016/s0092-8674(00)81477-4 . ПМИД 9708736 . S2CID 14390544 .

[29] Келли Дж.Л., Новак А.Дж., Фредериксен З.С., Либоу М., Анселл С.М., Доган А., Ван А.Х., Витциг Т.Е., Колл Т.Г., Кей Н.Е., Хаберманн Т.М., Слагер С.Л., Серхан Дж.Р. (ноябрь 2010 г.). «Зародышевые вариации генов пути апоптоза и риск неходжкинской лимфомы» . Эпидемиология рака, биомаркеры и профилактика . 19 (11): 2847–58. doi : 10.1158/1055-9965.EPI-10-0581 . ПМЦ 2976783 . ПМИД 20855536 .

[30] Пак Дж.И., Пак Дж.М., Чан Дж.С., Чхве Дж.Е., Ким К.М., Ча СИ, Ким Ч.Н., Кан Ю.М., Ли В.К., Кам С., Пак Р.В., Ким И.С., Ли Дж.Т., Юнг Т.Х. (июнь 2006 г.). «Полиморфизмы промотора каспазы 9 и риск первичного рака легких» . Молекулярная генетика человека . 15 (12): 1963–71. дои : 10.1093/hmg/ddl119 . ПМИД 16687442 .

[Straathof_2005-31] Jump up to: ^а ^б Страатхоф К.К., Пуле М.А., Йотнда П., Дотти Дж., Ванин Э.Ф., Бреннер М.К., Хеслоп Х.Э., Спенсер Д.М., Руни К.М. (июнь 2005 г.). «Индуцируемый предохранительный переключатель каспазы 9 для Т-клеточной терапии» . Кровь . 105 (11): 4247–54. дои : 10.1182/кровь-2004-11-4564 . ПМК 1895037 . ПМИД 15728125 .

[Choe-32] Jump up to: ^а ^б Чой Дж. Х., Уильямс Дж. З., Лим Вашингтон (2020). «Инженерия Т-клеток для лечения рака: конвергенция иммуноонкологии и синтетической биологии» . Ежегодный обзор биологии рака . 4 : 121–139. doi : 10.1146/annurev-cancerbio-030419-033657 .

[NCI-33] Jump up to: ^а ^б ^с «Определение аутологичных Т-лимфоцитов, экспрессирующих iCASP9-CD19» . Национальный институт рака . Проверено 2 июля 2020 г.

[uniprot_P55211-34] Jump up to: ^а ^б ^с ^д «CASP9 - предшественник каспазы-9 - Homo sapiens (человек) - ген и белок CASP9» . www.uniprot.org . Проверено 1 декабря 2017 г.

[35] Ву НТ, Парк М.А., Шульц Дж.К., Гоэ Р.В., Хоферлин Л.А., Шульц М.Д., Смит С.А., Линч К.В., Чалфант К.Э. (март 2013 г.). «hnRNP U усиливает сплайсинг каспазы-9 и модулируется AKT-зависимым фосфорилированием hnRNP L» . Журнал биологической химии . 288 (12): 8575–84. дои : 10.1074/jbc.M112.443333 . ПМЦ 3605676 . ПМИД 23396972 .

[pmid11113115-36] Jump up to: ^а ^б Чу З.Л., Пио Ф., Се З., Уэлш К., Краевска М., Краевски С., Годзик А., Рид Дж.К. (март 2001 г.). «Новый усилитель апоптосомы Apaf1, участвующий в активации и апоптозе цитохрома с-зависимой каспазы» . Журнал биологической химии . 276 (12): 9239–45. дои : 10.1074/jbc.M006309200 . ПМИД 11113115 .

[pmid15262985-37] Чо Д.Х., Хонг Ю.М., Ли Х.Дж., Ву Х.Н., Пё Дж.О., Мак Т.В., Юнг Ю.К. (сентябрь 2004 г.). «Индуцированное ингибирование ишемического/гипоксического повреждения с помощью APIP, нового белка, взаимодействующего с Apaf-1» . Журнал биологической химии . 279 (38): 39942–50. дои : 10.1074/jbc.M405747200 . ПМИД 15262985 .

[pmid9539746-38] Ху Ю, Бенедикт М.А., Ву Д, Инохара Н, Нуньес Г (апрель 1998 г.). «Bcl-XL взаимодействует с Apaf-1 и ингибирует Apaf-1-зависимую активацию каспазы-9» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (8): 4386–91. Бибкод : 1998PNAS...95.4386H . дои : 10.1073/pnas.95.8.4386 . ПМК 22498 . ПМИД 9539746 .

[pmid9488720-39] Пан Дж., О'Рурк К., Диксит В.М. (март 1998 г.). «Каспаза-9, Bcl-XL и Apaf-1 образуют тройной комплекс» . Журнал биологической химии . 273 (10): 5841–5. дои : 10.1074/jbc.273.10.5841 . ПМИД 9488720 .

[pmid9545235-40] Jump up to: ^а ^б ^с Деверо К.Л., Рой Н., Стеннике Х.Р., Ван Арсдейл Т., Чжоу К., Шринивасула С.М., Алнемри Э.С., Салвесен Г.С., Рид Дж.К. (апрель 1998 г.). «IAP блокируют апоптотические события, индуцированные каспазой-8 и цитохромом с, путем прямого ингибирования отдельных каспаз» . Журнал ЭМБО . 17 (8): 2215–23. дои : 10.1093/emboj/17.8.2215 . ПМК 1170566 . ПМИД 9545235 .

[pmid11832478-41] Го Ю, Шринивасула С.М., Друилхе А., Фернандес-Алнемри Т., Алнемри Э.С. (апрель 2002 г.). «Каспаза-2 индуцирует апоптоз, высвобождая проапоптотические белки из митохондрий» . Журнал биологической химии . 277 (16): 13430–7. дои : 10.1074/jbc.M108029200 . ПМИД 11832478 .

[pmid8962078-42] Шринивасула С.М., Ахмад М., Фернандес-Алнемри Т., Литвак Г., Алнемри Э.С. (декабрь 1996 г.). «Молекулярное упорядочение пути Fas-апоптоза: протеаза Fas/APO-1 Mch5 представляет собой CrmA-ингибируемую протеазу, которая активирует несколько Ced-3/ICE-подобных цистеиновых протеаз» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (25): 14486–91. Бибкод : 1996PNAS...9314486S . дои : 10.1073/pnas.93.25.14486 . ПМК 26159 . ПМИД 8962078 .

[pmid11076957-43] Хлаинг Т., Го Р.Ф., Дилли К.А., Лусия Дж.М., Морриш Т.А., Ши М.М., Винченц С., Уорд П.А. (март 2001 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика DEFCAP-L и -S, двух изоформ нового члена семейства белков апоптоза Ced-4 млекопитающих» . Журнал биологической химии . 276 (12): 9230–8. дои : 10.1074/jbc.M009853200 . ПМИД 11076957 .

[pmid16189514-44] Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

[pmid15280366-45] Давуди Дж., Лин Л., Келли Дж., Листон П., Маккензи А.Е. (сентябрь 2004 г.). «Белок, ингибирующий апоптоз нейронов, не взаимодействует с Smac и требует АТФ для связывания каспазы-9» . Журнал биологической химии . 279 (39): 40622–8. дои : 10.1074/jbc.M405963200 . ПМИД 15280366 .

[pmid11390657-46] Рихтер Б.В., Мир С.С., Эйбен Л.Дж., Льюис Дж., Реффи С.Б., Фраттини А., Тиан Л., Фрэнк С., Юл Р.Дж., Нельсон Д.Л., Нотаранжело Л.Д., Веццони П., Фернхед Х.О., Дакетт К.С. (июль 2001 г.). «Молекулярное клонирование ILP-2, нового члена семейства белков-ингибиторов апоптоза» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (13): 4292–301. дои : 10.1128/MCB.21.13.4292-4301.2001 . ПМК 87089 . ПМИД 11390657 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

[ 45 ]

[ 46 ]

v т и Протеазы : цистеиновые протеазы ( EC 3.4.22 ).
Caspase	Caspase 1 Caspase 2 Caspase 3 Caspase 4 Caspase 5 Caspase 6 Caspase 7 Caspase 8 Caspase 9 Caspase 10 Caspase 12 Caspase 13 Caspase 14
Fruit-derived	Papain Ficain Bromelain Actinidain
Calpain	CAPN1 CAPN2 CAPN3 CAPN5 CAPN6 CAPN7 CAPN8 CAPN9 CAPN10 CAPN11 CAPN12 CAPN13 CAPN14 CAPNS1 CAPNS2
Cathepsin	B C F H K L1/L2 O S W Z
Other	Clostripain Cancer procoagulant Separase Autophagin Cruzipain 3C-like protease Gingipain R Gingipain K

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)