Домен ПДЗ
 Молекулярная структура домена PDZ, включенного в человеческий белок GOPC (ассоциированный с аппаратом Гольджи PDZ и белок, содержащий мотив спиральной спирали) | |||
| Идентификаторы | |||
|---|---|---|---|
| Символ | ПДЗ | ||
| Пфам | PF00595 | ||
| ИнтерПро | ИПР001478 | ||
| УМНЫЙ | ПДЗ | ||
| PROSITE | PDOC50106 | ||
| СКОП2 | 1lcy / ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ / СУПФАМ | ||
| CDD | cd00136 | ||
| |||
Домен PDZ представляет собой общий структурный домен 80-90 аминокислот, обнаруженный в сигнальных белках бактерий из , дрожжей , растений , вирусов. [1] и животные . [2] Белки, содержащие домены PDZ, играют ключевую роль в прикреплении рецепторных белков в мембране к компонентам цитоскелета. Белки с этими доменами помогают удерживать вместе и организовывать сигнальные комплексы на клеточных мембранах. Эти домены играют ключевую роль в формировании и функционировании комплексов передачи сигнала. [3] Домены PDZ также играют весьма важную роль в прикреплении рецепторов клеточной поверхности (таких как Cftr и FZD7 ) к актиновому цитоскелету посредством медиаторов, таких как NHERF и ezrin . [4]
PDZ — это инициализм, объединяющий первые буквы первых трех белков, которые, как обнаружено, имеют общий домен — белок постсинаптической плотности (PSD95) , супрессор большой опухоли диска дрозофилы (Dlg1) и белок zonula occludens-1 (zo-1) . [5] Домены PDZ ранее назывались DHR (гомологичная область Dlg). [6] или GLGF ( глицин - лейцин -глицин- фенилаланин ) домены. [7]
Обычно домены PDZ связываются с коротким участком С-конца других специфических белков. Эти короткие области связываются с доменом PDZ путем увеличения бета-листа . Это означает, что бета-лист в домене PDZ удлиняется за счет добавления дополнительной бета-цепи из хвоста связывающего белка-партнера. [8] С-концевая карбоксилатная группа связана гнездом (структурным мотивом белка) в домене PDZ, т.е. PDZ-связывающим мотивом .
Истоки открытия
[ редактировать ]PDZ — это аббревиатура, полученная от названий первых белков, в которых был обнаружен этот домен. Белок постсинаптической плотности 95 (PSD-95) представляет собой синаптический белок, обнаруженный только в мозге. [7] Супрессор большой опухоли диска дрозофилы (Dlg1) и зона окклюденс 1 (ZO-1) играют важную роль в клеточных соединениях и в клеточных сигнальных комплексах. [9] С момента открытия доменов PDZ более 20 лет назад были идентифицированы сотни дополнительных доменов PDZ. Первое опубликованное использование фразы «домен PDZ» было не в статье, а в письме. В сентябре 1995 года доктор Мэри Б. Кеннеди из Калифорнийского технологического института написала исправленное письмо в журнал «Тенденции в биомедицинских науках». [10] Ранее в том же году другая группа ученых заявила, что открыла новый белковый домен, который они назвали доменом DHR. [6] Доктор Кеннеди опровергла то, что ее лаборатория ранее описала точно такой же домен как серию «повторов GLGF». [7] Она продолжила объяснять, что для того, чтобы «лучше отразить происхождение и распространение домена», новое название домена будет изменено. Таким образом, миру было представлено название «домен PDZ».
Структура
[ редактировать ]
Структура домена PDZ частично консервативна в различных белках, которые их содержат. Обычно они имеют 5-6 β-нитей и одну короткую и одну длинную α-спираль . Помимо этой консервативной складки, вторичная структура различается в разных доменах PDZ. [3] Этот домен имеет тенденцию иметь глобулярную форму с диаметром около 35 Å. [11]
При исследовании домены PDZ обычно выделяют в виде мономеров , однако некоторые белки PDZ образуют димеры . Функция димеров ПДЗ по сравнению с мономерами пока не известна. [3]
Общепринятая теория связывающего кармана домена PDZ состоит в том, что он состоит из нескольких гидрофобных аминокислот, помимо упомянутой ранее последовательности GLGF, атомы основной цепи которых образуют гнездо (структурный мотив белка), связывающее С-концевой карбоксилат. белка или пептидного лиганда. Большинство доменов PDZ имеют такой сайт связывания, расположенный между одной из β-цепей и длинной α-спиралью. [12]
Функции
[ редактировать ]Домены PDZ выполняют две основные функции: локализацию клеточных элементов и регулирование клеточных путей.
Первой обнаруженной функцией доменов PDZ было закрепление рецепторных белков в мембране к компонентам цитоскелета. Домены PDZ также выполняют регуляторные функции на различных сигнальных путях. [13] Любой белок может иметь один или несколько доменов PDZ, которые могут быть идентичными или уникальными (см. рисунок справа). Такое разнообразие позволяет этим белкам быть очень универсальными во взаимодействиях. Различные домены PDZ в одном и том же белке могут выполнять разные роли, каждый из которых связывает разные части целевого белка или вообще другой белок. [14]
Локализация
[ редактировать ]Домены PDZ играют жизненно важную роль в организации и поддержании сложных строительных лесов.
Домены PDZ встречаются в различных белках, но все они помогают локализовать клеточные элементы. Домены PDZ в первую очередь участвуют в закреплении рецепторных белков на цитоскелете . Для правильного функционирования клеток важно, чтобы компоненты — белки и другие молекулы — находились в нужном месте в нужное время. Белки с доменами PDZ связывают различные компоненты, обеспечивая правильное расположение. [13] В нейроне для понимания активности нейромедиатора необходимо, чтобы определенные рецепторы были расположены в липидной мембране синапса. Домены PDZ имеют решающее значение для этого процесса локализации рецептора. [15] Белки с доменами PDZ обычно связываются как с C-концом рецептора, так и с элементами цитоскелета, чтобы закрепить рецептор на цитоскелете и удержать его на месте. [14] [16] Без такого взаимодействия рецепторы диффундировали бы из синапса из-за жидкой природы липидной мембраны.
Домены PDZ также используются для локализации элементов, отличных от рецепторных белков. В человеческом мозге оксид азота часто действует в синапсе, изменяя уровни цГМФ в ответ на активацию рецептора NMDA . [17] Чтобы обеспечить благоприятное пространственное расположение, нейрональная синтаза оксида азота (nNOS) приближается к рецепторам NMDA посредством взаимодействия с доменами PDZ на PSD-95, которые одновременно связывают рецепторы nNOS и NMDA . [16] Поскольку nNOS расположен близко к NMDA-рецепторам, он активируется сразу после того, как ионы кальция начнут проникать в клетку.
Регулирование
[ редактировать ]Домены PDZ непосредственно участвуют в регуляции различных клеточных путей. Этот механизм этой регуляции варьируется, поскольку домены PDZ способны взаимодействовать с рядом клеточных компонентов. Эта регуляция обычно является результатом совместной локализации нескольких сигнальных молекул, как в примере с рецепторами nNos и NMDA. [16] Некоторые примеры регуляции сигнального пути, осуществляемой доменом PDZ, включают активность фермента фосфатазы , механосенсорную передачу сигналов и путь сортировки эндоцитозируемых рецепторных белков.
Сигнальный путь нерецептора протеинтирозинфосфатазы человека типа 4 (PTPN4) регулируется доменами PDZ. Этот белок участвует в регуляции гибели клеток . Обычно домен PDZ этого фермента несвязан. В этом несвязанном состоянии фермент активен и предотвращает передачу клетками сигналов об апоптозе . Связывание PDZ-домена этой фосфатазы приводит к потере активности фермента, что приводит к апоптозу. Нормальная регуляция этого фермента предотвращает преждевременный апоптоз клеток. возрастает, Когда регуляция фермента PTPN4 теряется, онкогенная активность поскольку клетки способны пролиферировать . [18]
Домены PDZ также играют регуляторную роль в механосенсорной передаче сигналов в проприорецепторах , вестибулярных и слуховых волосковых клетках . Белок Whirlin (WHRN) локализуется в постсинаптических нейронах волосковых клеток, которые преобразуют механическое движение в потенциалы действия , которые организм может интерпретировать. Белки WHRN содержат три домена PDZ. Домены, расположенные вблизи N-конца, связываются с белками-рецепторами и другими сигнальными компонентами. Когда один из этих доменов PDZ ингибируется, сигнальные пути нейронов нарушаются, что приводит к слуховым, зрительным и вестибулярным нарушениям. Считается, что эта регуляция основана на физическом расположении WHRN и селективности его домена PDZ. [19]
Регуляция рецепторных белков происходит, когда домен PDZ белка EBP50 связывается с С-концом бета-2-адренергического рецептора (β2-AR). EBP50 также связывается с комплексом, который соединяется с актином , служа тем самым связующим звеном между цитоскелетом и β2-AR. Рецептор β2-AR в конечном итоге подвергается эндоцитозу, где он либо отправляется в лизосому для деградации, либо возвращается обратно в клеточную мембрану. Ученые продемонстрировали, что когда остаток Ser-411 связывающего домена β2-AR PDZ, который напрямую взаимодействует с EBP50, фосфорилируется, рецептор разрушается. Если Ser-411 оставить немодифицированным, рецептор перерабатывается. [20] Роль, которую играют домены PDZ и их сайты связывания, указывает на регуляторную значимость, выходящую за рамки простой локализации рецепторного белка.
Домены PDZ изучаются дальше, чтобы лучше понять роль, которую они играют в различных сигнальных путях. Исследования расширились, поскольку эти области связаны с различными заболеваниями, включая рак, как обсуждалось выше. [21]
Регулирование активности домена PDZ
[ редактировать ]Функция домена PDZ может быть как ингибирована, так и активирована различными механизмами. Два из наиболее распространенных включают аллостерические взаимодействия и посттрансляционные модификации. [3]
Посттрансляционные модификации
[ редактировать ]Наиболее распространенной посттрансляционной модификацией доменов PDZ является фосфорилирование . [22] Эта модификация в первую очередь является ингибитором домена PDZ и активности лиганда . В некоторых примерах фосфорилирование боковых цепей аминокислот устраняет способность домена PDZ образовывать водородные связи , нарушая нормальный характер связывания. Конечным результатом является потеря функции домена PDZ и дальнейшей передачи сигналов. [23] Другой способ, которым фосфорилирование может нарушить регулярную функцию домена PDZ, заключается в изменении соотношения зарядов и дальнейшем воздействии на связывание и передачу сигналов. [24] В редких случаях исследователи наблюдали, как посттрансляционные модификации активируют активность домена PDZ. [25] но таких случаев немного.
Другой посттрансляционной модификацией, которая может регулировать домены PDZ, является образование дисульфидных мостиков . Многие домены PDZ содержат цистеины и чувствительны к образованию дисульфидных связей в окислительных условиях . Эта модификация действует прежде всего как ингибитор функции домена PDZ. [26]
Аллостерические взаимодействия
[ редактировать ]Было обнаружено, что белок-белковые взаимодействия изменяют эффективность связывания доменов PDZ с лигандами. Эти исследования показывают, что аллостерические эффекты некоторых белков могут влиять на аффинность связывания с различными субстратами . Различные домены PDZ могут даже оказывать такое аллостерическое влияние друг на друга. Это взаимодействие PDZ-PDZ действует только как ингибитор. [27] Другие эксперименты показали, что определенные ферменты могут усиливать связывание доменов PDZ. Исследователи обнаружили, что белок эзрин усиливает связывание белка PDZ NHERF1 . [4]
белки PDZ
[ редактировать ]Белки PDZ представляют собой семейство белков, содержащих домен PDZ. Эта последовательность аминокислот встречается во многих тысячах известных белков. Белки домена PDZ широко распространены у эукариот и эубактерий . [2] тогда как примеров белка у архей очень мало . Домены PDZ часто связаны с другими белковыми доменами , и эти комбинации позволяют им выполнять свои специфические функции. Тремя наиболее хорошо документированными белками PDZ являются PSD-95 , GRIP и HOMER .
PSD-95 представляет собой синаптический белок мозга с тремя доменами PDZ, каждый из которых обладает уникальными свойствами и структурами, которые позволяют PSD-95 функционировать разными способами. В общем, первые два домена PDZ взаимодействуют с рецепторами, а третий — с белками, связанными с цитоскелетом. Основными рецепторами, связанными с PSD-95, являются NMDA-рецепторы . Первые два домена PDZ PSD-95 связываются с С-концом рецепторов NMDA и закрепляют их на мембране в точке высвобождения нейромедиатора. [28] Первые два домена PDZ также могут аналогичным образом взаимодействовать с каналами K+ шейкерного типа . [28] Взаимодействие PDZ между PSD-95, nNOS и синтрофином опосредовано вторым доменом PDZ. Третий и последний домен PDZ связан с богатым цистеином PDZ-связывающим белком ( CRIPT ), который позволяет PSD-95 связываться с цитоскелетом . [28]
Белок, взаимодействующий с глутаматными рецепторами (GRIP), представляет собой постсинаптический белок, который взаимодействует с рецепторами AMPA аналогично взаимодействиям PSD-95 с рецепторами NMDA. Когда исследователи заметили очевидную структурную гомологию между C-концами рецепторов AMPA и рецепторами NMDA, они попытались определить, происходит ли подобное взаимодействие PDZ. [29] Двугибридная система дрожжей помогла им обнаружить, что из семи доменов GRIP PDZ два (домены четыре и пять) необходимы для связывания GRIP с субъединицей AMPA, называемой GluR2. [14] Это взаимодействие жизненно важно для правильной локализации рецепторов AMPA, которые играют большую роль в хранении памяти . Другие исследователи обнаружили, что шестой и седьмой домены GRIP отвечают за соединение GRIP с семейством рецепторов тирозинкиназ , называемых рецепторами эфрина , которые являются важными сигнальными белками. [30] Клиническое исследование пришло к выводу, что синдром Фрейзера , аутосомно-рецессивный синдром, который может вызывать тяжелые деформации, может быть вызван простой мутацией GRIP. [31]
HOMER существенно отличается от многих известных белков PDZ, включая GRIP и PSD-95. Вместо того, чтобы опосредовать рецепторы вблизи ионных каналов, как в случае с GRIP и PSD-95, HOMER участвует в метаботропной передаче сигналов глутамата. [32] Еще одним уникальным аспектом HOMER является то, что он содержит только один домен PDZ, который опосредует взаимодействие между HOMER и метаботропным глутаматным рецептором 5 типа ( mGluR5 ). [15] Одиночный повтор GLGF на HOMER связывает аминокислоты на С-конце mGluR5. Экспрессия HOMER измеряется на высоких уровнях на эмбриональных стадиях у крыс, что указывает на важную функцию развития. [15]
Белки PDZ человека
[ редактировать ]У человека существует около 260 доменов PDZ. Некоторые белки содержат несколько доменов PDZ, поэтому количество уникальных белков, содержащих PDZ, приближается к 180. В таблице ниже приведены некоторые из наиболее изученных членов этого семейства:
| Изучены белки PDZ | |||
|---|---|---|---|
| наследница | СХВАТИТЬ | Хтра1 | Хтра2 |
| Хтра3 | ПСД-95 | SAP97 | КАРТА10 |
| КАРТА11 | КАРТА14 | ПТП-БЛ [33] | |
В таблице ниже представлены все известные белки PDZ у человека (в алфавитном порядке):
В настоящее время известен один вирус, содержащий домены PDZ:
| Вирусы | |
|---|---|
| Налог1 |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Боксус М., Твизер Дж.К., Легрос С., Девульф Дж.Ф., Кеттманн Р., Виллемс Л. (август 2008 г.). «Налоговый интерактом HTLV-1» . Ретровирусология . 5:76 . дои : 10.1186/1742-4690-5-76 . ПМЦ 2533353 . ПМИД 18702816 .
- ^ Перейти обратно: а б Понтинг КП (февраль 1997 г.). «Доказательства существования доменов PDZ у бактерий, дрожжей и растений» . Белковая наука . 6 (2): 464–8. дои : 10.1002/pro.5560060225 . ПМК 2143646 . ПМИД 9041651 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Ли Х.Дж., Чжэн Дж.Дж. (май 2010 г.). «Домены PDZ и их партнеры по связыванию: структура, специфичность и модификация» . Сотовая связь и сигнализация . 8 :8. дои : 10.1186/1478-811X-8-8 . ПМК 2891790 . ПМИД 20509869 .
- ^ Перейти обратно: а б Ли Джей, Callaway DJ, Бу Зи (сентябрь 2009 г.). «Эзрин индуцирует междоменную аллостерию дальнего действия в каркасном белке NHERF1» . Журнал молекулярной биологии . 392 (1): 166–80. дои : 10.1016/j.jmb.2009.07.005 . ПМЦ 2756645 . ПМИД 19591839 .
- ^ Кеннеди МБ (сентябрь 1995 г.). «Происхождение доменов PDZ (DHR, GLGF)». Тенденции биохимических наук . 20 (9): 350. doi : 10.1016/S0968-0004(00)89074-X . ПМИД 7482701 .
- ^ Перейти обратно: а б Понтинг CP, Филлипс C (март 1995 г.). «Домены DHR в синтрофинах, нейрональных NO-синтазах и других внутриклеточных белках». Тенденции биохимических наук . 20 (3): 102–3. дои : 10.1016/S0968-0004(00)88973-2 . ПМИД 7535955 .
- ^ Перейти обратно: а б с Чо Нокаут, Хант Калифорния, Кеннеди МБ (ноябрь 1992 г.). «Фракция постсинаптической плотности мозга крысы содержит гомолог белка-супрессора больших опухолей дисков дрозофилы». Нейрон . 9 (5): 929–42. дои : 10.1016/0896-6273(92)90245-9 . ПМИД 1419001 . S2CID 28528759 .
- ^ Коуберн Д. (декабрь 1997 г.). «Распознавание пептидов доменами PTB и PDZ». Современное мнение в области структурной биологии . 7 (6): 835–8. дои : 10.1016/S0959-440X(97)80155-8 . ПМИД 9434904 .
- ^ Лю Дж, Ли Дж, Рен Ю, Лю П (01 января 2014 г.). «DLG5 в поддержании полярности клеток и развитии рака» . Международный журнал биологических наук . 10 (5): 543–9. дои : 10.7150/ijbs.8888 . ПМК 4046881 . ПМИД 24910533 .
- ^ Кеннеди МБ (сентябрь 1995 г.). «Происхождение доменов PDZ (DHR, GLGF)». Тенденции биохимических наук . 20 (9): 350. doi : 10.1016/s0968-0004(00)89074-x . ПМИД 7482701 .
- ^ Эрлендссон С., Мадсен К.Л. (октябрь 2015 г.). «Мембранное связывание и модуляция домена PDZ PICK1» . Мембраны . 5 (4): 597–615. дои : 10.3390/membranes5040597 . ПМК 4704001 . ПМИД 26501328 .
- ^ Мораиш Кабрал Дж.Х., Петоса С., Сатклифф М.Дж., Раза С., Байрон О., Пой Ф. и др. (август 1996 г.). «Кристаллическая структура домена PDZ». Природа . 382 (6592): 649–52. Бибкод : 1996Natur.382..649C . дои : 10.1038/382649a0 . ПМИД 8757139 . S2CID 4344406 .
- ^ Перейти обратно: а б Харрис Б.З., Лим В.А. (сентябрь 2001 г.). «Механизм и роль доменов PDZ в сборке сигнального комплекса». Журнал клеточной науки . 114 (Часть 18): 3219–31. дои : 10.1242/jcs.114.18.3219 . ПМИД 11591811 .
- ^ Перейти обратно: а б с Бристоль, Университет. «Бристольский университет | Центр синаптической пластичности | Интеракторы AMPAR» . www.bristol.ac.uk . Проверено 3 декабря 2015 г.
- ^ Перейти обратно: а б с Брейкман П.Р., Ланахан А.А., О'Брайен Р., Рош К., Барнс К.А., Хуганир Р.Л., Уорли П.Ф. (март 1997 г.). «Гомер: белок, который избирательно связывает метаботропные рецепторы глутамата». Природа . 386 (6622): 284–8. Бибкод : 1997Natur.386..284B . дои : 10.1038/386284a0 . ПМИД 9069287 . S2CID 4346579 .
- ^ Перейти обратно: а б с Дойл Д.А., Ли А., Льюис Дж., Ким Э. , Шэн М., Маккиннон Р. (июнь 1996 г.). «Кристаллические структуры сложного и свободного от пептидов мембранного белок-связывающего домена: молекулярные основы распознавания пептидов PDZ» . Клетка . 85 (7): 1067–76. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81307-0 . ПМИД 8674113 . S2CID 9739481 .
- ^ Хоппер Р., Ланкастер Б., Гартуэйт Дж. (апрель 2004 г.). «О регуляции NMDA-рецепторов оксидом азота». Европейский журнал неврологии . 19 (7): 1675–82. дои : 10.1111/j.1460-9568.2004.03306.x . ПМИД 15078541 . S2CID 23939649 .
- ^ Мезоннев П., Кайе-Саги С., Рейналь Б., Жилкин Б., Шаффот А., Перес Дж. и др. (ноябрь 2014 г.). «Регуляция каталитической активности фосфатазы человека PTPN4 с помощью ее домена PDZ». Журнал ФЭБС . 281 (21): 4852–65. дои : 10.1111/февраль 13024 . ПМИД 25158884 . S2CID 205135373 .
- ^ де Нуй Дж.К., Саймон СМ, Саймон А., Дубар С., Стил К.П., Бэнкс Р.В. и др. (февраль 2015 г.). «Белок Whirlin с PDZ-доменом облегчает механосенсорную передачу сигналов в проприорецепторах млекопитающих» . Журнал неврологии . 35 (7): 3073–84. doi : 10.1523/JNEUROSCI.3699-14.2015 . ПМЦ 4331628 . ПМИД 25698744 .
- ^ Цао Т.Т., Дьякон Х.В., Речек Д., Бретчер А., фон Застроу М. (сентябрь 1999 г.). «Взаимодействие PDZ-домена, регулируемое киназой, контролирует эндоцитарную сортировку бета2-адренергического рецептора». Природа . 401 (6750): 286–90. Бибкод : 1999Natur.401..286C . дои : 10.1038/45816 . ПМИД 10499588 . S2CID 4386883 .
- ^ Ван NX, Ли HJ, Чжэн JJ (апрель 2008 г.). «Терапевтическое применение антагонизма белок-белкового взаимодействия PDZ» . Новости и перспективы наркотиков . 21 (3): 137–41. дои : 10.1358/dnp.2008.21.3.1203409 . ПМК 4055467 . ПМИД 18560611 .
- ^ Чунг Х.Дж., Хуан Ю.Х., Лау Л.Ф., Хуганир Р.Л. (ноябрь 2004 г.). «Регуляция рецепторного комплекса NMDA и его транспортировка путем зависимого от активности фосфорилирования лиганда субъединицы NR2B PDZ» . Журнал неврологии . 24 (45): 10248–59. doi : 10.1523/JNEUROSCI.0546-04.2004 . ПМК 6730169 . ПМИД 15537897 .
- ^ Елен Ф, Олексий А, Сметана К, Отлевски Ю (01 января 2003 г.). «Домены PDZ — обычные игроки в клеточной сигнализации» . Акта Биохимика Полоника . 50 (4): 985–1017. дои : 10.18388/abp.2003_3628 . ПМИД 14739991 .
- ^ Чен Дж., Пан Л., Вэй Цз., Чжао Ю., Чжан М. (август 2008 г.). «Димеризация ZO-1 PDZ2 с заменой доменов создает специфические и регуляторные сайты связывания коннексина 43» . Журнал ЭМБО . 27 (15): 2113–23. дои : 10.1038/emboj.2008.138 . ПМК 2516886 . ПМИД 18636092 .
- ^ Чен Б.С., Брауд С., Бэджер Дж.Д., Исаак Дж.Т., Рош К.В. (июнь 2006 г.). «Регуляция рецепторов N-метил-D-аспартата (NMDA) NR1/NR2C путем фосфорилирования» . Журнал биологической химии . 281 (24): 16583–90. дои : 10.1074/jbc.M513029200 . ПМИД 16606616 .
- ^ Мишра П., Соколич М., Уолл М.А., Грейвс Дж., Ван З., Ранганатан Р. (октябрь 2007 г.). «Динамический каркас в сигнальной системе, связанной с G-белком» . Клетка . 131 (1): 80–92. дои : 10.1016/j.cell.2007.07.037 . ПМИД 17923089 . S2CID 14008319 .
- ^ ван ден Берк Л.К., Ланди Э., Валма Т., Вуистер Г.В., Денте Л., Хендрикс В.Дж. (ноябрь 2007 г.). «Аллостерическое внутримолекулярное взаимодействие PDZ-PDZ модулирует специфичность связывания PTP-BL PDZ2». Биохимия . 46 (47): 13629–37. дои : 10.1021/bi700954e . ПМИД 17979300 .
- ^ Перейти обратно: а б с Нитхаммер М., Вальшанов Дж.Г., Капур Т.М., Эллисон Д.В., Вайнберг Р.Дж., Крейг А.М., Шэн М. (апрель 1998 г.). «CRIPT, новый постсинаптический белок, который связывается с третьим доменом PDZ PSD-95/SAP90» . Нейрон . 20 (4): 693–707. дои : 10.1016/s0896-6273(00)81009-0 . ПМИД 9581762 . S2CID 16068361 .
- ^ Донг Х., О'Брайен Р.Дж., Фунг Э.Т., Ланахан А.А., Уорли П.Ф., Хуганир Р.Л. (март 1997 г.). «GRIP: белок, содержащий синаптический домен PDZ, который взаимодействует с рецепторами AMPA». Природа . 386 (6622): 279–84. Бибкод : 1997Natur.386..279D . дои : 10.1038/386279a0 . ПМИД 9069286 . S2CID 4361791 .
- ^ Торрес Р., Файрштейн Б.Л., Донг Х., Штаудингер Дж., Олсон Э.Н., Хуганир Р.Л. и др. (декабрь 1998 г.). «Белки PDZ связываются, группируются и синаптически колокализуются с рецепторами Eph и их эфриновыми лигандами» . Нейрон . 21 (6): 1453–63. дои : 10.1016/S0896-6273(00)80663-7 . ПМИД 9883737 . S2CID 15441813 .
- ^ Фогель М.Дж., ван Зон П., Брютон Л., Гийзен М., ван Туил М.К., Кокс П. и др. (май 2012 г.). «Мутации в GRIP1 вызывают синдром Фрейзера». Журнал медицинской генетики . 49 (5): 303–6. doi : 10.1136/jmedgenet-2011-100590 . ПМИД 22510445 . S2CID 7211700 .
- ^ Ранганатан Р., Росс Э.М. (декабрь 1997 г.). «Белки домена PDZ: каркасы для сигнальных комплексов» . Современная биология . 7 (12): Р770-3. дои : 10.1016/S0960-9822(06)00401-5 . ПМИД 9382826 . S2CID 13636955 .
- ^ Джемт П., Джанни С. (июль 2007 г.). «Домены PDZ: свертывание и привязка». Биохимия . 46 (30): 8701–8. дои : 10.1021/bi7008618 . ПМИД 17620015 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Понтинг С.П., Филлипс С., Дэвис К.Э., Блейк DJ (июнь 1997 г.). «Домены PDZ: нацеливание сигнальных молекул на субмембранные сайты». Биоэссе . 19 (6): 469–79. дои : 10.1002/bies.950190606 . ПМИД 9204764 . S2CID 12469779 .
- Дойл Д.А., Ли А., Льюис Дж., Ким Э., Шэн М., Маккиннон Р. (июнь 1996 г.). «Кристаллические структуры сложного и свободного от пептидов мембранного белок-связывающего домена: молекулярные основы распознавания пептидов PDZ» . Клетка . 85 (7): 1067–76. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81307-0 . ПМИД 8674113 . S2CID 9739481 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- ресурса Eukaryotic Linear Motif Класс мотива LIG_PDZ_Class_1
- ресурса Eukaryotic Linear Motif Класс мотива LIG_PDZ_Class_2
- ресурса Eukaryotic Linear Motif Класс мотива LIG_PDZ_Class_3
- Домен PDZ как сложная адаптивная система. Краткое техническое описание и изложение основных выводов и разветвлений домена PDZ как сложной адаптивной системы.
- Запись о сохраненных доменах NCBI
- https://www.pdznet.eu — проект ЕС, направленный на углубление нашего понимания клеточных сигнальных путей и терапевтического потенциала белков, включающих домены PDZ, в здоровых и патологических состояниях, таких как рак и неврологические заболевания.