✖


Jump to content

данио

(Перенаправлено с рыбы-зебры )
Чтобы узнать о других значениях, см. Рыба данио (значения) .

Дания рерио
Взрослая самка данио
Научная классификация Изменить эту классификацию
Домен: Эукариоты
Королевство: животное
Тип: Хордовые
Сорт: Актиноптеригии
Заказ: Карпообразные
Семья: Карповые
Подсемейство: Данионины
Род: Дания
Разновидность:
г-н Рерио
Биномиальное имя
Дания рерио
Синонимы
  • Я вернусь в бочку
  • Брахиданиус Франке
  • Брахиданио рерио
  • Кипринский чапалио
  • Кипринус рерио
  • Данио Франкей
  • Данио линейный
  • Нурия радио
  • Периламопус полосатый

Данио -рерио ( Danio rerio ) — пресноводная рыба, принадлежащая к семейству гольянов ( Cyprinidae ) отряда Cypriniformes . Родом из Индии [2] и Южной Азии, это популярная аквариумная рыбка , часто продаваемая под торговым названием зебра данио. [3] (и поэтому ее часто называют « тропической рыбой », хотя она бывает и тропической, и субтропической ).

Рыбка данио является важным и широко используемым позвоночных модельным организмом в научных исследованиях, особенно в биологии развития , а также в функциях генов, онкологии , тератологии и разработке лекарств , в частности в доклинических разработках . [4] Он также известен своими регенеративными способностями. [5] и был модифицирован исследователями для получения множества трансгенных штаммов. [6] [7] [8]

Таксономия

[ редактировать ]

Рыбка данио — производный член рода Brachydanio семейства Cyprinidae . Он имеет родственные отношения с Danio aesculapii . [9] Рыбки данио также тесно связаны с родом Devario , о чем свидетельствует филогенетическое древо близких видов. [10]

Распределение

[ редактировать ]

Диапазон

[ редактировать ]

Рыбка данио обитает в пресноводных местах обитания в Южной Азии, где она встречается в Индии, Пакистане, Бангладеш, Непале и Бутане. [1] [11] [12] [13] Северная граница проходит в Южных Гималаях , от бассейна реки Сатледж в приграничном районе Пакистана и Индии до штата Аруначал-Прадеш на северо-востоке Индии. [1] [12] Его ареал сосредоточен в бассейнах рек Ганг и Брахмапутра , а впервые вид был описан из реки Коси (нижний бассейн Ганга) в Индии. Его ареал дальше на юг более локальный, с разрозненными находками из регионов Западных и Восточных Гат . [13] [14] Часто говорят, что он встречается в Мьянме (Бирма), но это полностью основано на записях до 1930 года и, вероятно, относится к близким родственникам, описанным только позже, особенно к Данио кьятиту . [13] [15] [16] [17] Аналогично, старый [ нужны разъяснения ] записи из Шри-Ланки весьма сомнительны и остаются неподтвержденными. [15]

Рыбы данио были завезены в Калифорнию, Коннектикут, Флориду и Нью-Мексико в Соединенных Штатах, предположительно, в результате преднамеренного выпуска аквариумистами или побега с рыбных ферм . Популяция Нью-Мексико была истреблена к 2003 году, и неясно, выживут ли остальные, поскольку последние опубликованные записи были опубликованы несколько десятилетий назад. [18] Из других мест этот вид был завезен в Колумбию и Малайзию. [12] [19]

Места обитания

[ редактировать ]

Рыбы данио обычно обитают в умеренно проточной или стоячей чистой воде на довольно небольшой глубине в ручьях, каналах, канавах, старицах , прудах и рисовых полях . [13] [19] [20] Обычно имеется некоторая растительность, либо подводная, либо нависающая с берегов, а дно песчаное, илистое или илистое, часто с примесью гальки или гравия. При обследовании мест обитания рыб данио на большей части территории их распространения в Бангладеш и Индии выяснилось, что вода имела pH от почти нейтрального до несколько основного , а температура в основном колебалась от 16,5 до 34 ° C (61,7–93,2 ° F). [13] [21] В одном необычно холодном месте температура составляла всего 12,3 °C (54,1 °F), а в другом необычно теплом месте — 38,6 °C (101,5 °F), но рыбки данио по-прежнему выглядели здоровыми. Необычно низкая температура наблюдалась в одном из самых высоких известных мест обитания рыб данио на высоте 1576 м (5171 фут) над уровнем моря, хотя этот вид был зарегистрирован на высоте 1795 м (5889 футов). [13]

Описание

[ редактировать ]

Рыбка данио названа в честь пяти однородных пигментированных горизонтальных синих полос по бокам тела, которые напоминают полосы зебры и доходят до конца хвостового плавника . Форма его веретеновидная , сжатая с боков, рот направлен вверх. Самец торпедообразной формы, с золотыми полосами между синими полосами; у самки более крупный беловатый живот и серебряные полосы вместо золотых. имеется небольшой генитальный сосочек У взрослых самок перед началом анального плавника . Рыбка данио может достигать 4–5 см (1,6–2,0 дюйма) в длину. [16] хотя в дикой природе они обычно составляют 1,8–3,7 см (0,7–1,5 дюйма) с некоторыми вариациями в зависимости от местоположения. [ нужна ссылка ] Продолжительность его жизни в неволе составляет около двух-трех лет, хотя в идеальных условиях она может быть продлена до более чем пяти лет. [20] [22] В дикой природе это обычно однолетний вид. [1]

Психология

[ редактировать ]

В 2015 году было опубликовано исследование о способности рыбок данио к эпизодической памяти . Люди продемонстрировали способность запоминать контекст в отношении объектов, мест и событий (что, когда, где). Эпизодическая память — это способность эксплицитных систем памяти, обычно связанная с сознательным опытом . [23]

Клетки Маутнера интегрируют широкий спектр сенсорных стимулов для выработки рефлекса бегства . обнаружили, что эти стимулы включают сигналы боковой линии McHenry et al. . 2009 г. и визуальные сигналы , соответствующие надвигающимся объектам, Temizer et al. 2015, Данн и др. 2016 г., и Яо и др. 2016. [24]

Воспроизведение

[ редактировать ]
Стадии развития рыбок данио. Фотографии в масштабе, за исключением взрослого человека, длина которого составляет около 2,5 см (1 дюйм).

Примерное время генерации Danio rerio составляет три месяца. , должен присутствовать самец овуляция и нерест Для того чтобы произошла . Рыбки данио — асинхронные производители. [25] и при оптимальных условиях (таких как наличие пищи и благоприятные параметры воды) могут успешно нереститься часто, даже ежедневно. [26] Самки способны нереститься с интервалом в два-три дня, откладывая в каждую кладку сотни яиц . После выпуска начинается эмбриональное развитие; при отсутствии сперматозоидов рост прекращается после первых нескольких делений клеток. Оплодотворенные яйца почти сразу становятся прозрачными, что делает D. rerio удобным модельным видом для исследований . [20] Было показано, что определение пола распространенных лабораторных штаммов является сложным генетическим признаком, а не подчиняется простой системе ZW или XY. [27]

Эмбрион рыбки данио развивается быстро, предшественники всех основных органов появляются в течение 36 часов после оплодотворения. Эмбрион начинается с желтка с одной огромной клеткой наверху (см. изображение, панель 0,75 часа), которая делится на две (панель 0,75 часа) и продолжает делиться, пока не появятся тысячи маленьких клеток (панель 3,25 часа). Затем клетки мигрируют вниз по бокам желтка (8-часовая панель) и начинают формировать головку и хвост (16-часовая панель). Затем хвост растет и отделяется от тела (24-часовая панель). Желток со временем сжимается, поскольку рыба использует его в пищу по мере созревания в течение первых нескольких дней (панель 72 ч). Через несколько месяцев взрослая рыба достигает репродуктивной зрелости (нижняя панель).

Чтобы стимулировать рыбу к нересту, некоторые исследователи используют аквариум с выдвижной нижней вставкой, которая уменьшает глубину бассейна и имитирует берег реки. Рыбки данио лучше всего нерестятся утром из-за их циркадных ритмов . Используя этот метод, исследователям удалось собрать 10 000 эмбрионов за 10 минут. [28] В частности, одна пара взрослых рыб способна за одно утро отложить 200–300 икринок примерно по 5–10 штук за раз. [29] Кроме того, известно, что самцы рыбок данио реагируют на более выраженные отметины на самках, то есть на «хорошие полосы», но в группе самцы спариваются с любой самкой, которую они могут найти. Что привлекает самок, в настоящее время непонятно. Присутствие растений, даже пластиковых, также, очевидно, способствует нересту. [28]

Воздействие экологически значимых концентраций диизононилфталата (DINP), обычно используемого в большом количестве пластиковых изделий, разрушает эндоканнабиноидную систему и тем самым влияет на репродуктивную функцию в зависимости от пола. [30]

Кормление

[ редактировать ]

Рыбки данио всеядны , в основном питаются зоопланктоном , фитопланктоном , насекомыми и личинками насекомых , хотя они могут есть и множество других продуктов, таких как черви и мелкие ракообразные , если их предпочтительные источники пищи недоступны. [20]

В исследованиях взрослых рыбок данио часто кормили артемией или парамецией . [31]

В аквариуме

[ редактировать ]

Рыбки данио — выносливые рыбы и считаются хорошими для начинающих аквариумистов. Их непреходящую популярность можно объяснить их игривым нравом. [32] а также их быстрое размножение, эстетичность, дешевизна и широкая доступность. Они также хорошо себя чувствуют в стаях или косяках по шесть и более человек и хорошо взаимодействуют с другими видами рыб в аквариуме. Однако они восприимчивы к оодиниуму или бархатной болезни, микроспоридиям ( Pseudoloma нейрофилия ) и Mycobacterium видам . Если есть возможность, взрослые особи поедают птенцов, которых можно защитить, разделив две группы сеткой, ящиком для размножения или отдельным резервуаром.В неволе данио живут примерно сорок два месяца. У некоторых рыбок данио в неволе может развиться изогнутый позвоночник. [33]

Их размер может варьироваться от нескольких сантиметров до нескольких дюймов и обеспечивать движение в аквариуме с пресноводной рыбой. [34]

Зебра-данио также использовалась для производства генетически модифицированной рыбы и была первым видом, который продавался под названием GloFish (рыба флуоресцентного цвета).

Штаммы

[ редактировать ]

В конце 2003 года трансгенные рыбки данио, экспрессирующие зеленые , красные и желтые флуоресцентные белки, стали коммерчески доступны в Соединенных Штатах. Флуоресцентные штаммы имеют торговое название GloFish ; другие культивируемые сорта включают «золотой», «песчаный», «длинноплавник» и «леопард».

Леопардовый данио

Леопардовый данио, ранее известный как Danio Frankei , представляет собой пятнистую цветовую морфу рыбки данио, возникшую в результате пигментной мутации. [35] Ксантистические формы как зебры, так и леопарда, а также линии с длинными плавниками были получены в рамках программ селекции для аквариумной торговли. [36]

Различные трансгенные и мутантные штаммы рыбок данио хранились в Китайском ресурсном центре рыбок данио (CZRC), некоммерческой организации, деятельность которой осуществлялась при совместной поддержке Министерства науки и технологий Китая и Китайской академии наук . [ нужна ссылка ]

Штаммы дикого типа

[ редактировать ]

( Информационная сеть рыбок данио ZFIN ) предоставляет актуальную информацию об известных на данный момент штаммах дикого типа (WT) D. rerio , некоторые из которых перечислены ниже. [37]

  • АБ (АБ)
  • АБ/С32 (АБ/С32)
  • АБ/ТЛ (АБ/ТЛ)
  • AB/Тюбинген (AB/TU)
  • С32 (С32)
  • Кельн (КОЛЬН)
  • Дарджилинг (ДАР)
  • Эквилл (EKW)
  • ГК/АБ (ГК/АБ)
  • ГК/Синг (ГК/СИНГ)
  • Гонконг (Гонконг)
  • Индия (IND)
  • Индонезия (ИНДО)
  • Надя (NA)
  • РИКЕН WT (RW)
  • Сингапур (SING)
  • СДЖА (СДЖА)
  • СЖД (СЖД)
  • СЖД/С32 (СЖД/С32)
  • Тюбинген (ТУ)
  • Длинный плавник Тупфеля (TL)
  • Перламутр с длинными плавниками Tupfel (TLN)
  • ВИК (ВИК)
  • ВИК/АБ (ВИК/АБ)

Гибриды

[ редактировать ]

Гибриды между разными видами данио могут быть плодовитыми: например, между D. rerio и D. nigrofasciatus . [10]

Научные исследования

[ редактировать ]
рыбок данио Хроматофоры , показанные здесь как посредники фоновой адаптации , широко изучаются учеными.
Мутант пигмента рыбки данио (внизу), полученный методом инсерционного мутагенеза . [10] Для сравнения показан эмбрион дикого типа (вверху). У мутанта отсутствует черный пигмент в меланоцитах , поскольку он не способен должным образом синтезировать меланин .

D. rerio — распространенный и полезный научный модельный организм для изучения развития позвоночных и функций генов . Его использование в качестве лабораторного животного было впервые использовано американским молекулярным биологом Джорджем Стрейзингером и его коллегами из Университета Орегона в 1970-х и 1980-х годах; рыбок данио Штрайзингера Клоны были одними из первых успешных созданных клонов позвоночных. [38] Его важность была подтверждена успешными крупномасштабными генетическими скринингами (обычно называемыми Тюбингенским/Бостонским скринингом). У рыбы есть специальная онлайн-база данных с генетической, геномной информацией и информацией о развитии — Информационная сеть данио (ZFIN). Международный ресурсный центр рыбок данио (ZIRC) представляет собой хранилище генетических ресурсов с 29 250 аллелями , доступными для распространения среди исследовательского сообщества. D. rerio также является одним из немногих видов рыб, отправленных в космос .

Исследования D. rerio принесли успехи в области биологии развития , онкологии , [39] токсикология , [29] [40] [41] репродуктивные исследования, тератология , генетика , нейробиология , науки об окружающей среде , стволовых клеток исследования , регенеративная медицина , [42] [43] мышечные дистрофии [44] и эволюционная теория . [10]

Характеристики модели

[ редактировать ]

Как модельная биологическая система, рыбка данио обладает многочисленными преимуществами для ученых. Его геном , полностью секвенирован и его поведение в процессе развития хорошо изучено, легко наблюдаемо и тестируемо. Его эмбриональное развитие происходит очень быстро, эмбрионы относительно крупные, крепкие и прозрачные и способны развиваться вне матери. [45] Кроме того, легко доступны хорошо охарактеризованные мутантные штаммы.

Другие преимущества включают почти постоянный размер вида на раннем этапе развития, что позволяет использовать простые методы окрашивания , а также тот факт, что его двухклеточный эмбрион можно слить в одну клетку для создания гомозиготного эмбриона. Эмбрионы рыбок данио прозрачны и развиваются вне матки, что позволяет ученым изучать детали развития, начиная с оплодотворения и продолжая на протяжении всего развития. Рыбки данио также явно похожи на модели млекопитающих и людей в тестах на токсичность и демонстрируют суточный цикл сна, сходный с поведением во время сна млекопитающих. [46] Однако рыбки данио не являются универсально идеальной исследовательской моделью; их научное использование имеет ряд недостатков, таких как отсутствие стандартной диеты. [47] и наличие небольших, но важных различий между рыбками данио и млекопитающими в роли некоторых генов, связанных с заболеваниями человека. [48] [49]

Регенерация

[ редактировать ]

Рыбки данио обладают способностью регенерировать сердца и боковой линии волосковые клетки на личиночных стадиях. [50] [51] Регенеративный процесс сердца, вероятно, включает в себя сигнальные пути, такие как Notch и Wnt ; гемодинамические изменения в поврежденном сердце воспринимаются эндотелиальными клетками желудочков и связанными с ними сердечными ресничками посредством механочувствительного ионного канала TRPV4 , что впоследствии облегчает сигнальный путь Notch через KLF2 и активирует различные нижестоящие эффекторы, такие как BMP-2 и HER2/neu . [52] В 2011 году Британский кардиологический фонд провел рекламную кампанию, рекламируя свое намерение изучить применимость этой способности к людям, заявив, что его цель - собрать 50 миллионов фунтов стерлингов на финансирование исследований. [53] [54]

Также было обнаружено, что рыбки данио регенерируют фоторецепторные клетки и нейроны сетчатки после травмы, что, как было показано, опосредовано дедифференцировкой и пролиферацией мюллеровой глии . [55] Исследователи часто ампутируют спинной и брюшной хвостовые плавники и анализируют их отрастание, чтобы проверить наличие мутаций. Было обнаружено, что деметилирование гистонов происходит в месте ампутации, переводя клетки рыбок данио в «активное», регенеративное состояние, подобное стволовым клеткам. [56] [57] В 2012 году австралийские учёные опубликовали исследование, показавшее, что рыбки данио используют специализированный белок , известный как фактор роста фибробластов , для обеспечения спинного мозга заживления без образования глиальных рубцов после травмы. [5] [58] Кроме того, волосковые клетки задне- боковой линии регенерируют после повреждения или нарушения развития. было обнаружено, что [51] [59] Изучение экспрессии генов во время регенерации позволило идентифицировать несколько важных сигнальных путей, участвующих в этом процессе, таких как передача сигналов Wnt и фактор роста фибробластов . [59] [60]

При исследовании заболеваний нервной системы, включая нейродегенеративные заболевания, двигательные расстройства, психические расстройства и глухоту, исследователи используют рыбок данио, чтобы понять, как генетические дефекты, лежащие в основе этих состояний, вызывают функциональные нарушения в человеческом мозге, спинном мозге и органах чувств. [61] [62] [63] [64] Исследователи также изучили рыбок данио, чтобы получить новое представление о сложностях заболеваний опорно-двигательного аппарата человека, таких как мышечная дистрофия . [65] Еще одним направлением исследований рыбок данио является понимание того, как ген под названием Hedgehog , биологический сигнал, лежащий в основе ряда видов рака у человека, контролирует рост клеток.

Генетика

[ редактировать ]

Фоновая генетика

[ редактировать ]

Инбредные штаммы и традиционные аутбредные популяции не были созданы для лабораторных рыбок данио, а генетическая изменчивость линий дикого типа среди учреждений может способствовать кризису репликации в биомедицинских исследованиях. [66] Генетические различия в линиях дикого типа среди популяций, поддерживаемых в разных исследовательских учреждениях, были продемонстрированы с использованием как однонуклеотидных полиморфизмов, так и однонуклеотидных полиморфизмов. [67] и микросателлитный анализ. [68]

Экспрессия генов

[ редактировать ]

Благодаря быстрому и короткому жизненному циклу и относительно большому размеру кладки D. rerio или рыбки данио являются полезной моделью для генетических исследований. Распространенным методом обратной генетики является снижение экспрессии генов или модификация сплайсинга с использованием технологии морфолино антисмысловой . Морфолиноолигонуклеотиды (МО) представляют собой стабильные синтетические макромолекулы , содержащие те же основания , что и ДНК или РНК; связываясь с комплементарными последовательностями РНК, они могут снижать экспрессию определенных генов или блокировать другие процессы, происходящие на РНК. МО можно вводить в одну клетку эмбриона после стадии 32 клеток, снижая экспрессию генов только в клетках, произошедших от этой клетки. Однако клетки раннего эмбриона (менее 32 клеток) проницаемы для крупных молекул, [69] [70] обеспечивая диффузию между клетками. Рекомендации по использованию Morpholinos у рыбок данио описывают соответствующие стратегии борьбы. [71] Морфолинозы обычно микроинъецируют в объеме 500 мкл непосредственно в эмбрионы рыбок данио на 1–2-клеточной стадии. Морфолино способно интегрироваться в большинство клеток эмбриона. [72]

Известная проблема с нокдауном генов заключается в том, что, поскольку геном подвергся дупликации после дивергенции лучепёрых и лопастёрых рыб , не всегда легко надежно заглушить активность одного из двух генов- паралогов счёт комплементации за другой паралог. [73] Несмотря на сложности генома рыбок данио , существует ряд коммерчески доступных глобальных платформ для анализа как экспрессии генов с помощью микрочипов , так и регуляции промотора с использованием ChIP-на-чипе . [74]

Секвенирование генома

[ редактировать ]

Институт Wellcome Trust Sanger начал проект по секвенированию генома рыбок данио в 2001 году, а полная последовательность генома эталонного штамма Tuebingen общедоступна на Национального центра биотехнологической информации (NCBI) странице генома рыбок данио . Эталонная последовательность генома рыбки данио аннотирована как часть Ensembl проекта и поддерживается Консорциумом Genome Reference Consortium . [75]

В 2009 году исследователи из Института геномики и интегративной биологии в Дели, Индия, объявили о секвенировании генома дикой линии рыбок данио, содержащего примерно 1,7 миллиарда генетических букв. [76] [77] Геном дикой рыбы данио секвенировали с 39-кратным охватом. Сравнительный анализ с эталонным геномом рыбки данио выявил более 5 миллионов вариаций отдельных нуклеотидов и более 1,6 миллиона вариаций вставок-делеций. Эталонная последовательность генома рыбки данио размером 1,4 ГБ и более 26 000 генов, кодирующих белки, была опубликована Kerstin Howe et al. в 2013 году. [78]

Митохондриальная ДНК

[ редактировать ]

В октябре 2001 года исследователи из Университета Оклахомы опубликовали D. rerio полную последовательность митохондриальной ДНК . [79] Его длина составляет 16 596 пар оснований. Это находится в пределах 100 пар оснований от других родственных видов рыб, и, в частности, всего на 18 пар длиннее, чем у золотой рыбки ( Carassius auratus ) и на 21 длиннее, чем у карпа ( Cyprinus carpio ). Порядок и содержание ее генов идентичны распространенной позвоночных форме митохондриальной ДНК . Он содержит 13 белок -кодирующих генов и некодирующую контрольную область, содержащую точку начала репликации тяжелой цепи. Между группой из пяти генов тРНК обнаружена последовательность, напоминающая начало репликации легкой цепи у позвоночных. Трудно сделать эволюционные выводы, потому что трудно определить, имеют ли изменения пар оснований адаптивное значение, путем сравнения с нуклеотидными последовательностями других позвоночных. [79]

Генетика развития

[ редактировать ]

Т-боксы и гомеобоксы жизненно важны для данио , как и для других позвоночных. [80] [81] Брюс и др. известны в этой области, а Брюс и др. 2003 г. и Брюс и др. 2005 г. выявили роль двух из этих элементов в ооцитах этого вида. [80] [81] Вмешаясь через доминантный нефункциональный аллель и морфолино, они обнаружили, что активатор транскрипции Т-бокса эомезодермин и его мишень mtx2 – фактор транскрипции – жизненно важны для эпиболии . [80] [81] (В Брюсе и др., 2003 г. они не смогли подтвердить возможность того, что эомезодермин ведет себя как Vegt . [80] Ни им, ни кому-либо другому не удалось обнаружить какую-либо мутацию , которая – у матери – предотвратила бы начало процессов развития мезодермы или энтодермы у этого вида.) [80]

Гены пигментации

[ редактировать ]

В 1999 году мутация перламутра была идентифицирована у рыбок данио, ортологов транскрипционного фактора MITF млекопитающих . [82] Мутации человеческого MITF приводят к дефектам глаз и потере пигмента, типу синдрома Ваарденбурга . В декабре 2005 года исследование золотого штамма идентифицировало ген, ответственный за его необычную пигментацию, как SLC24A5 , растворенный носитель, который, по-видимому, необходим для производства меланина , и подтвердило его функцию с помощью нокдауна морфолино. Затем ортологичный ген был охарактеризован у людей, и было обнаружено , что разница в одну пару оснований сильно разделяет светлокожих европейцев и темнокожих африканцев. [83] Рыбок данио с мутацией перламутра с тех пор скрещивали с рыбами с мутацией roy orbison (roy), чтобы получить рыб штамма Casper, не имеющих меланофоров или иридофоров и прозрачных во взрослом возрасте. Эти рыбы характеризуются равномерно пигментированными глазами и полупрозрачной кожей. [7] [84]

Трансгенезис

[ редактировать ]

Трансгенез — популярный подход к изучению функции генов рыбок данио. Создание трансгенных рыбок данио довольно просто с помощью метода с использованием транспозонной системы Tol2 . Элемент Tol2 , который кодирует ген полностью функциональной транспозазы, способной катализировать транспозицию в зародышевой линии рыбок данио. Tol2 — единственный природный мобильный элемент ДНК у позвоночных, у которого был идентифицирован автономный член. [85] [86] Примеры включают искусственное взаимодействие, возникающее между LEF1 и катенином бета-1 /β-катенином/ CTNNB1 . Дорский и др. 2002 исследовали роль Wnt в развитии путем трансгенной экспрессии репортера Lef1/β-catenin. [87]

Существуют хорошо зарекомендовавшие себя протоколы редактирования генов рыбок данио с использованием CRISPR-Cas9. [88] и этот инструмент использовался для создания генетически модифицированных моделей.

Прозрачные тела взрослых

[ редактировать ]

В 2008 году исследователи из Бостонской детской больницы вывели новый вид рыбок данио под названием Casper, у взрослых особей которого была прозрачная кожа. [7] Это позволяет детально визуализировать клеточную активность, кровообращение, метастазирование и многие другие явления. [7] В 2019 году исследователи опубликовали скрещивание prkdc . -/- и ИЛ2рга -/- штамм, который произвел прозрачное, иммунодефицитное потомство, лишенное естественных клеток-киллеров, а также В- и Т-клеток . Этот штамм может быть адаптирован к теплой воде с температурой 37 ° C (99 ° F), а отсутствие иммунной системы делает возможным использование ксенотрансплантатов, полученных от пациента . [89] В январе 2013 года японские ученые генетически модифицировали прозрачный экземпляр рыбки данио, чтобы он вызывал видимое свечение в периоды интенсивной мозговой активности. [8]

В январе 2007 года китайские исследователи из Фуданьского университета генетически модифицировали рыбок данио, чтобы обнаружить загрязнение озер и рек эстрогеном , которое связано с мужским бесплодием. Исследователи клонировали чувствительные к эстрогену гены и ввели их в оплодотворенные яйца рыбок данио. Модифицированная рыба становилась зеленой, если ее поместить в воду, загрязненную эстрогеном. [6]

Сплайсинг РНК

[ редактировать ]

В 2015 году исследователи из Университета Брауна обнаружили, что 10% генов рыбок данио не нуждаются в U2AF2 белке для инициации сплайсинга РНК . Эти гены имеют пары оснований ДНК AC и TG в виде повторяющихся последовательностей на концах каждого интрона . На 3ss (3'-сайт сплайсинга) пары оснований аденин и цитозин чередуются и повторяются, а на 5ss (5'-сайт сплайсинга) их комплементы тимин и гуанин также чередуются и повторяются. Они обнаружили, что белок U2AF2 меньше зависит от белка, чем у людей, у которых этот белок необходим для процесса сплайсинга. Паттерн повторяющихся пар оснований вокруг интронов, который изменяет вторичную структуру РНК, был обнаружен у других костистых рыб , но не у четвероногих . Это указывает на то, что эволюционные изменения у четвероногих, возможно, привели к тому, что люди стали полагаться на белок U2AF2 для сплайсинга РНК, в то время как эти гены у рыбок данио подвергаются сплайсингу независимо от присутствия белка. [90]

Ортология

[ редактировать ]

D. rerio имеет три трансферрина , каждый из которых тесно связан с другими позвоночными . [91]

Инбредная депрессия

[ редактировать ]

Когда спариваются близкие родственники, потомство может проявлять пагубные последствия инбридинговой депрессии . Инбредная депрессия преимущественно вызвана гомозиготной экспрессией рецессивных вредных аллелей. [92] Можно ожидать, что у рыбок данио инбредная депрессия будет более серьезной в стрессовых условиях, в том числе вызванных антропогенным загрязнением . Воздействие рыбок данио на экологический стресс, вызванный химическим веществом клотримазолом, имидазоловым фунгицидом, используемым в сельском хозяйстве, ветеринарии и медицине, усилило влияние инбридинга на ключевые репродуктивные признаки. [93] Жизнеспособность эмбрионов была значительно снижена у инбредных рыб, подвергшихся воздействию, и наблюдалась тенденция у инбредных самцов давать меньше потомства.

Исследования в области аквакультуры

[ редактировать ]

Рыбки данио являются распространенной моделью для исследований в области рыбоводства , включая патогены. [94] [95] [96] и паразиты [94] [96] вызывая потерю урожая или распространяясь на соседние дикие популяции.

Эта полезность меньше, чем могла бы быть, из-за от таксономической данио удаленности наиболее распространенных видов аквакультуры. [95] Потому что наиболее распространены лососевые и тресковые протакантоптеригии , а также морской окунь , морской лещ , результаты по тилапии и камбале в Percomorpha , данио-рерио могут быть не совсем применимы. [95] Различные другие модели — Золотая рыбка ( Carassius auratus ), Медака ( Oryzias latipes ), Колюшка ( Gasterosteus aculeatus ), Плотва ( Rutilus rutilus ), Иглобрюх ( Takifugu Rubripes ), Меченосец ( Xiphophorus hellerii ) — обычно используются реже, но будут ближе к конкретным. целевые виды [96]

Единственным исключением являются карпы (в том числе белый амур, Ctenopharyngodon idella ). [95] и молочная рыба ( Chanos chanos ) [96] которые довольно близки, оба относятся к Cyprinidae . Однако следует также отметить, что данио во многих случаях последовательно оказывается полезной моделью для млекопитающих, и между ними значительно большая генетическая дистанция , чем между данио и любой рыбой, выращиваемой на фермах. [95]

Нейрохимия

[ редактировать ]

У мутанта с дефектом глюкокортикоидного рецептора и сниженным поведением исследовательским флуоксетин восстанавливал нормальное исследовательское поведение. [97] Это демонстрирует взаимосвязь между глюкокортикоидами, флуоксетином и исследованием у этой рыбы. [97]

восстановление ДНК

[ редактировать ]

Рыбки данио использовались в качестве модели для изучения путей восстановления ДНК. [98] Эмбрионы видов рыб, оплодотворенных извне, таких как рыбки данио, во время своего развития подвергаются непосредственному воздействию условий окружающей среды, таких как загрязнители и активные формы кислорода , которые могут вызвать повреждение их ДНК . [98] различные пути восстановления ДНК . Чтобы справиться с такими повреждениями ДНК, во время развития экспрессируются [98] В последние годы рыбки данио оказались полезной моделью для оценки загрязнителей окружающей среды, которые могут вызвать повреждение ДНК. [99]

Открытие и разработка лекарств

[ редактировать ]
В исследовании FDA использовалась рыба данио, чтобы показать влияние кетамина на неврологическое развитие.

Рыбка данио и личинка рыбки данио являются подходящим модельным организмом для открытия и разработки лекарств. Как позвоночное животное с 70% генетической гомологией с человеком, [78] он может предсказывать здоровье и болезни человека, а его небольшой размер и быстрое развитие облегчают проведение экспериментов в более крупных и быстрых масштабах, чем при более традиционных исследованиях in vivo , включая разработку высокопроизводительных автоматизированных исследовательских инструментов. [100] [101] Как показали текущие исследовательские программы, модель рыбок данио позволяет исследователям не только идентифицировать гены, которые могут лежать в основе заболеваний человека, но и разрабатывать новые терапевтические агенты в программах открытия лекарств. [102] Эмбрионы рыбок данио оказались быстрой, экономичной и надежной моделью тератологического анализа. [103]

Проверка на наркотики

[ редактировать ]

Скрининг на наркотики у рыбок данио можно использовать для выявления новых классов соединений с биологическим действием или для перепрофилирования существующих лекарств для новых целей; Примером последнего может быть скрининг, который показал, что широко используемый статин ( розувастатин ) может подавлять рост рака простаты . [104] На сегодняшний день было проведено 65 скринингов малых молекул, и по крайней мере один из них привел к клиническим испытаниям. [105] В рамках этих скринингов еще предстоит решить множество технических проблем, в том числе различную скорость абсорбции лекарств, приводящую к уровням внутреннего воздействия, которые невозможно экстраполировать по концентрации воды, а также высокие уровни естественных различий между отдельными животными. [105]

Токсико- или фармакокинетика

[ редактировать ]

Чтобы понять эффекты лекарств, необходимо внутреннее воздействие препарата, поскольку оно определяет фармакологический эффект. Перевод экспериментальных результатов с рыбок данио на высших позвоночных (например, людей) требует взаимосвязи концентрация-эффект, которую можно получить на основе фармакокинетического и фармакодинамического анализа. [4] Однако из-за его небольшого размера очень сложно количественно оценить внутреннее воздействие препарата. Традиционно для того, чтобы охарактеризовать профиль концентрации препарата с течением времени, берут несколько образцов крови, но этот метод еще предстоит разработать. только одна фармакокинетическая модель парацетамола на личинках рыбок данио. На сегодняшний день разработана [106]

Компьютерный анализ данных

[ редактировать ]

Используя интеллектуальные методы анализа данных, можно понять патофизиологические и фармакологические процессы и впоследствии перенести их на высших позвоночных, включая человека. [4] [107] Примером может служить использование системной фармакологии , которая представляет собой интеграцию системной биологии и фармакометрики . Системная биология характеризует организм (часть его) посредством математического описания всех соответствующих процессов. Это могут быть, например, разные пути передачи сигнала, которые на конкретный сигнал приводят к определенному ответу. Количественно оценивая эти процессы, можно понять и предсказать их поведение в здоровых и больных ситуациях. Фармакометрика использует данные доклинических экспериментов и клинических испытаний для характеристики фармакологических процессов, лежащих в основе связи между дозой лекарства и его реакцией или клиническим исходом. Это может быть, например, абсорбция лекарственного средства в организме или его выведение из организма, или его взаимодействие с мишенью для достижения определенного эффекта. Путем количественной оценки этих процессов можно понять и спрогнозировать их поведение после разных доз или у разных пациентов и предсказать их поведение после введения новых доз или у разных пациентов.Интегрируя эти две области, системная фармакология может улучшить понимание взаимодействия лекарства с биологической системой путем математического количественного определения и последующего прогнозирования новых ситуаций, таких как новые лекарства, новые организмы или пациенты.Используя эти вычислительные методы, ранее упомянутый анализ внутреннего воздействия парацетамола на личинок рыбок данио показал разумную корреляцию между клиренсом парацетамола у рыбок данио и у высших позвоночных, включая человека. [106]

Медицинские исследования

[ редактировать ]

Рак

[ редактировать ]

Рыбки данио использовались для создания нескольких трансгенных моделей рака, включая меланому , лейкемию , рак поджелудочной железы и гепатоцеллюлярную карциному . [108] [109] BRAF или NRAS, У рыбок данио, экспрессирующих мутированные формы онкогенов развивается меланома при помещении на фон с дефицитом p53. Гистологически эти опухоли очень напоминают заболевания человека, полностью пригодны для трансплантации и демонстрируют крупномасштабные геномные изменения. Модель меланомы BRAF использовалась в качестве платформы для двух экранов, опубликованной в марте 2011 года в журнале Nature . В одном исследовании модель использовалась в качестве инструмента для понимания функциональной важности генов, которые, как известно, амплифицируются и сверхэкспрессируются при меланоме человека. [110] Один ген, SETDB1, заметно ускорял образование опухолей в системе рыбок данио, демонстрируя его важность в качестве нового онкогена меланомы. Это было особенно важно, поскольку известно, что SETDB1 участвует в эпигенетической регуляции, которая все чаще считается центральной в биологии опухолевых клеток.

опухоли, В другом исследовании была предпринята попытка терапевтического воздействия на генетическую программу, присутствующую в исходных клетках нервного гребня с использованием подхода химического скрининга. [111] Это показало, что ингибирование белка DHODH (небольшой молекулой, называемой лефлуномидом) предотвращает развитие стволовых клеток нервного гребня, которые в конечном итоге приводят к меланоме посредством вмешательства в процесс элонгации транскрипции . Поскольку этот подход будет нацелен на «идентичность» клетки меланомы, а не на одну генетическую мутацию, лефлуномид может оказаться полезным при лечении меланомы человека. [112]

Сердечно-сосудистые заболевания

[ редактировать ]

В сердечно-сосудистых исследованиях рыбку данио использовали для моделирования модели инфаркта миокарда у человека. Сердце рыбки данио полностью регенерирует примерно через 2 месяца после травмы без образования рубцов. [113] Механизм передачи адренергических сигналов альфа -1 , участвующий в этом процессе, был идентифицирован в исследовании 2023 года. [114] Рыба данио также используется в качестве модели свертывания крови , развития кровеносных сосудов и врожденных заболеваний сердца и почек . [115]

Иммунная система

[ редактировать ]

В рамках программ исследования острого воспаления , основного процесса, лежащего в основе многих заболеваний, исследователи создали модель воспаления рыб данио и его разрешение. Этот подход позволяет детально изучить генетический контроль воспаления и возможность выявления потенциальных новых лекарств. [116]

Рыба данио широко использовалась в качестве модельного организма для изучения врожденного иммунитета позвоночных. Врожденная иммунная система способна к фагоцитарной активности через 28–30 часов после оплодотворения (HPF). [117] в то время как адаптивный иммунитет функционально не созревает в течение как минимум 4 недель после оплодотворения. [118]

Инфекционные заболевания

[ редактировать ]

Поскольку иммунная система рыбок данио и человека относительно консервативна, на рыбках данио можно моделировать многие инфекционные заболевания человека. [119] [120] [121] [122] Прозрачные ранние стадии жизни хорошо подходят для визуализации in vivo и генетического анализа взаимодействий хозяина и патогена. [123] [124] [125] [126] Уже созданы модели рыб данио для широкого спектра бактериальных, вирусных и паразитарных патогенов; например, модель туберкулеза с рыбками данио дает фундаментальное представление о механизмах патогенеза микобактерий. [127] [128] [129] [130] Кроме того, была разработана роботизированная технология для высокопроизводительного скрининга противомикробных препаратов с использованием моделей инфекции рыбок данио. [131] [132]

Устранение повреждений сетчатки

[ редактировать ]
Развитие одиночной сетчатки рыбки данио, снятое на световом микроскопе, прибл. каждые 12 часов с 1,5 до 3,5 суток после рождения эмбриона

Еще одной примечательной особенностью рыбок данио является то, что они обладают четырьмя типами колбочек , причем чувствительные к ультрафиолету клетки дополняют подтипы красных, зеленых и синих колбочек, обнаруженных у людей. Таким образом, рыбки данио могут наблюдать очень широкий спектр цветов. Этот вид также изучается, чтобы лучше понять развитие сетчатки; в частности, как колбочки сетчатки образуют так называемую «конусную мозаику». Рыбы данио, в дополнение к некоторым другим костистым рыбам, особенно известны чрезвычайной точностью расположения колбочек. [133]

Это исследование характеристик сетчатки рыбок данио также экстраполировалось на медицинские исследования. В 2007 году исследователи из Университетского колледжа Лондона вырастили стволовые клетки взрослых рыбок данио, обнаруженные в глазах рыб и млекопитающих, которые развиваются в нейроны сетчатки. Их можно будет вводить в глаз для лечения заболеваний, повреждающих нейроны сетчатки — почти всех заболеваний глаз, включая дегенерацию желтого пятна , глаукому и диабетом слепоту, связанную с . Исследователи изучили глиальные клетки Мюллера в глазах людей в возрасте от 18 месяцев до 91 года и смогли превратить их во все типы нейронов сетчатки. Они также смогли легко вырастить их в лаборатории. Стволовые клетки успешно мигрировали в сетчатку больных крыс и приобрели характеристики окружающих нейронов. Команда заявила, что они намерены разработать такой же подход на людях. [134] [135]

Мышечные дистрофии

[ редактировать ]

Мышечные дистрофии (МД) представляют собой гетерогенную группу генетических заболеваний, которые вызывают мышечную слабость, аномальные сокращения и атрофию мышц, часто приводя к преждевременной смерти. Рыбки данио широко используются в качестве модельного организма для изучения мышечных дистрофий. [44] Например, мутант sapje ( sap ) является ортологом мышечной дистрофии Дюшенна (МДД) у рыбок данио. [136] Мачука-Цили и его коллеги применили рыбок данио, чтобы определить роль альтернативного фактора сплайсинга, MBNL, в патогенезе миотонической дистрофии типа 1 (DM1). [137] Совсем недавно Тодд и др. описали новую модель рыбок данио, предназначенную для изучения влияния экспрессии повторов CUG на раннем этапе развития заболевания СД1. [138] Рыбка данио также является отличной животной моделью для изучения врожденных мышечных дистрофий, включая ВМД типа 1 А (CMD 1A), вызванную мутацией гена ламинина α2 человека (LAMA2). [139] Рыбки данио, благодаря своим преимуществам, обсуждавшимся выше, и, в частности, способности эмбрионов рыбок данио поглощать химические вещества, стали предпочтительной моделью при скрининге и тестировании новых лекарств против мышечных дистрофий. [140]

Физиология и патология костей

[ редактировать ]

Рыбки данио использовались в качестве модельных организмов для изучения костного метаболизма, обновления тканей и резорбционной активности. Эти процессы во многом эволюционно консервативны. Их использовали для изучения остеогенеза (костеобразования), оценки дифференцировки, активности отложения матрикса и перекрестных помех скелетных клеток, для создания и выделения мутантов, моделирующих заболевания костей человека, а также для тестирования новых химических соединений на способность устранять дефекты костей. [141] [142] Личинки можно использовать для отслеживания образования новых ( de novo ) остеобластов во время развития костей. Они начинают минерализацию костных элементов уже через 4 дня после оплодотворения. В последнее время взрослые рыбы данио используются для изучения сложных возрастных заболеваний костей, таких как остеопороз и несовершенный остеогенез . [143] (Эластоидная) чешуя рыбок данио выполняет функцию защитного внешнего слоя и представляет собой небольшие костные пластинки, образованные остеобластами. Эти экзоскелетные структуры образованы костным матриксом, депонирующим остеобласты, и ремоделируются остеокластами. Чешуя также служит основным хранилищем кальция в рыбе. Их можно культивировать ex-vivo (сохранять живыми вне организма) в многолуночном планшете, что позволяет манипулировать лекарствами и даже проводить скрининг новых лекарств, которые могут изменить костный метаболизм (между остеобластами и остеокластами). [143] [144] [145]

Диабет

[ редактировать ]

Развитие поджелудочной железы рыбок данио очень гомологично млекопитающим, таким как мыши. Сигнальные механизмы и функции поджелудочной железы очень схожи. Поджелудочная железа имеет эндокринный отдел, содержащий множество клеток. Двумя примерами таких клеток являются PP-клетки поджелудочной железы, вырабатывающие полипептиды, и β-клетки, вырабатывающие инсулин. Такая структура поджелудочной железы, наряду с системой гомеостаза глюкозы, полезна при изучении заболеваний, таких как диабет, связанных с поджелудочной железой. Модели функции поджелудочной железы, такие как флуоресцентное окрашивание белков, полезны для определения процессов гомеостаза глюкозы и развития поджелудочной железы. Тесты на толерантность к глюкозе были разработаны с использованием рыбок данио, и теперь их можно использовать для проверки непереносимости глюкозы или диабета у людей. Функция инсулина также тестируется на рыбках данио, что внесет дополнительный вклад в человеческую медицину. Большая часть работы, связанной с знаниями о гомеостазе глюкозы, была получена в результате работы с рыбками данио, перенесенными на человека. [146]

Ожирение

[ редактировать ]

Рыбки данио использовались в качестве модельной системы для изучения ожирения, при этом проводились исследования как генетического ожирения, так и ожирения, вызванного чрезмерным питанием. У рыбок данио, страдающих ожирением, как и у млекопитающих, страдающих ожирением, наблюдается нарушение регуляции метаболических путей, контролирующих липиды, что приводит к увеличению веса без нормального липидного обмена. [146] Как и млекопитающие, рыбки данио хранят избыток липидов во висцеральных, внутримышечных и подкожных жировых отложениях. Эти и другие причины делают рыбок данио хорошими моделями для изучения ожирения у людей и других видов. Генетическое ожирение обычно изучают на трансгенных или мутировавших рыбках данио с генами, вызывающими ожирение. Например, у трансгенных рыбок данио со сверхэкспрессией AgRP, эндогенного антагониста меланокортина, наблюдалась повышенная масса тела и отложение жира во время роста. [146] Хотя гены рыбок данио могут не совпадать с генами человека, эти тесты могут дать важную информацию о возможных генетических причинах и способах лечения генетического ожирения у человека. [146] Модели рыбок данио с ожирением, вызванным диетой, полезны, поскольку диету можно изменить с самого раннего возраста. Диеты с высоким содержанием жиров и общее переедание демонстрируют быстрое увеличение отложения жира, увеличение ИМТ, гепатостеатоз и гипертриглицеридемию. [146] Однако особи с нормальным ожирением и перекормом по-прежнему метаболически здоровы, а особи с высоким содержанием жиров - нет. [146] Понимание различий между типами ожирения, вызванного питанием, может оказаться полезным для лечения людей от ожирения и связанных с ним заболеваний. [146]

Экологическая токсикология

[ редактировать ]

Рыбки данио использовались в качестве модельной системы в исследованиях экологической токсикологии . [29]

Эпилепсия

[ редактировать ]

Рыбки данио использовались в качестве модельной системы для изучения эпилепсии. Судороги у млекопитающих можно воспроизвести молекулярно, поведенчески и электрофизиологически, используя часть ресурсов, необходимых для экспериментов на млекопитающих. [147]

См. также

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б с д Вишванат, В. (2010). « Данио рерио » . Красный список исчезающих видов МСОП . 2010 : e.T166487A6219667. doi : 10.2305/IUCN.UK.2010-4.RLTS.T166487A6219667.en . Проверено 19 ноября 2021 г.
  2. ^ Уайтли, Эндрю Р.; Бхат, Анурадха; Мартинс, Эмили П.; Мэйден, Ричард Л.; Аруначалам, М.; Ууси-Хейккиля, Сильва; Ахмед, АТА; Шреста, Жизнь; Кларк, Мэтью; Стемпл, Дерек; Бернатчес, Луи (2011). «Популяционная геномика диких и лабораторных рыбок данио ( Danio rerio )» . Молекулярная экология . 20 (20): 4259–4276. Бибкод : 2011MolEc..20.4259W . дои : 10.1111/j.1365-294X.2011.05272.x . ПМЦ   3627301 . ПМИД   21923777 .
  3. ^ «Разведение данио (Зебра данио) – Рыбный доктор» . www.thefishdoctor.co.uk . 16 ноября 2013 г. Архивировано из оригинала 27 октября 2023 г. Проверено 17 ноября 2021 г.
  4. ^ Jump up to: а б с Ван Вейк Р.К., Крекелс Э.Х., Ханкемайер Т., Спэнек Х.П., Ван дер Грааф П.Х. (2017). «Системная фармакология печеночного метаболизма личинок рыбок данио» . Открытие лекарств сегодня: модели заболеваний . 22 :27–34. дои : 10.1016/j.ddmod.2017.04.003 . hdl : 1887/49224 .
  5. ^ Jump up to: а б Гольдшмит Ю, Шталь Т.Е., Юсуф П.Р., Холл Т.Э., Нгуен-Чи М., Карри П.Д. (май 2012 г.). «Fgf-зависимые мостики глиальных клеток облегчают регенерацию спинного мозга у рыбок данио» . Журнал неврологии . 32 (22): 7477–7492. doi : 10.1523/JNEUROSCI.0758-12.2012 . ПМК   6703582 . ПМИД   22649227 .
  6. ^ Jump up to: а б «Ученые Фуданя превращают рыбу в сигнализаторы эстрогена» . Синьхуа . 12 января 2007 г. Проверено 15 ноября 2012 г.
  7. ^ Jump up to: а б с д Уайт Р.М., Сесса А., Берк С., Боуман Т., ЛеБлан Дж., Сеол С. и др. (февраль 2008 г.). «Прозрачные взрослые особи рыбок данио как инструмент для анализа трансплантации in vivo» . Клеточная стволовая клетка . 2 (2): 183–189. дои : 10.1016/j.stem.2007.11.002 . ПМК   2292119 . ПМИД   18371439 .
  8. ^ Jump up to: а б «Исследователи снимают на видео мыслительный процесс рыбки данио» . Популярная наука . 31 января 2013. Архивировано из оригинала 3 октября 2016 года . Проверено 4 февраля 2013 г.
  9. ^ Маккласки Б.М., Постлтуэйт Дж.Х. (март 2015 г.). «Филогения рыбок данио, «модельного вида», внутри Данио , «модельного рода» » . Молекулярная биология и эволюция . 32 (3): 635–652. дои : 10.1093/molbev/msu325 . ПМЦ   4327152 . ПМИД   25415969 .
  10. ^ Jump up to: а б с д Паричий Д.М. (сентябрь 2006 г.). «Эволюция развития пигментного рисунка данио» . Наследственность . 97 (3): 200–210. дои : 10.1038/sj.hdy.6800867 . ПМИД   16835593 .
  11. ^ Петр, Т. (1999). «Холодноводная рыба и рыболовство в Бутане» . ФАО . Архивировано из оригинала 28 марта 2019 года . Проверено 28 марта 2019 г.
  12. ^ Jump up to: а б с Причард, В.Л. (январь 2001 г.). Поведение и морфология рыбки данио Danio rerio (кандидатская диссертация). Университет Лидса.
  13. ^ Jump up to: а б с д и ж Энгесзер Р.Э., Паттерсон Л.Б., Рао А.А., Паричи Д.М. (2007). «Рыба данио в дикой природе: обзор естественной истории и новые заметки с мест». Рыбка данио . 4 (1): 21–40. дои : 10.1089/zeb.2006.9997 . ПМИД   18041940 . S2CID   34342799 .
  14. ^ «Рыбка данио в естественной среде» . Университет Отаго. Архивировано из оригинала 28 марта 2019 года . Проверено 28 марта 2019 г.
  15. ^ Jump up to: а б Спенс, Р. (декабрь 2006 г.), Поведение и экология рыбок данио , Данио рерио , Университет Лестера.
  16. ^ Jump up to: а б «Brachydanio rerio (Гамильтон, 1822 г.)» . Серьезно, Рыба. Архивировано из оригинала 7 июня 2023 года . Проверено 28 марта 2019 г.
  17. ^ Фанг Ф (1998). « Данио кьятит , новый вид карповых из Мьичкины, северная Мьянма». Ихтиологическое исследование пресных вод . 8 (3): 273–280.
  18. ^ «Данио рерио» . Неместные водные виды . Геологическая служба США . 14 июня 2013. Архивировано из оригинала 4 августа 2009 года . Проверено 3 июля 2013 г.
  19. ^ Jump up to: а б Фрёзе, Райнер; Поли, Дэниел (ред.) (2019). « Данио рерио » в FishBase . Версия за март 2019 года.
  20. ^ Jump up to: а б с д Спенс Р., Герлах Г., Лоуренс С., Смит С. (февраль 2008 г.). «Поведение и экология рыбки данио Danio rerio». Биологические обзоры Кембриджского философского общества . 83 (1): 13–34. дои : 10.1111/j.1469-185X.2007.00030.x . hdl : 2381/27758 . ПМИД   18093234 . S2CID   18044956 .
  21. ^ Спенс Р., Фатема М.К., Райхард М., Хук К.А., Вахаб М.А., Ахмед З.Ф., Смит С. (2006). «Распространение и предпочтения среды обитания рыбки данио в Бангладеш». Журнал биологии рыб . 69 (5): 1435–1448. Бибкод : 2006JFBio..69.1435S . дои : 10.1111/j.1095-8649.2006.01206.x .
  22. ^ Герхард Г.С., Кауфман Э.Дж., Ван X, Стюарт Р., Мур Дж.Л., Касалес С.Дж. и др. (2002). «Продолжительность жизни и стареющие фенотипы у двух линий рыбок данио ( Danio rerio )». Экспериментальная геронтология . 37 (8–9): 1055–1068. дои : 10.1016/s0531-5565(02)00088-8 . ПМИД   12213556 . S2CID   25092240 .
  23. ^ Гамильтон Т.Дж., Майгланд А., Дюперро Е., Мэй З., Гэллап Дж., Пауэлл Р.А. и др. (ноябрь 2016 г.). «Эпизодическая память у рыбок данио». Познание животных . 19 (6): 1071–1079. дои : 10.1007/s10071-016-1014-1 . ПМИД   27421709 . S2CID   2552608 .
  24. ^ Оргер МБ, де Полавиея Г.Г. (25 июля 2017 г.). «Поведение рыбок данио: возможности и проблемы» . Ежегодный обзор неврологии . 40 (1): 125–147. doi : 10.1146/annurev-neuro-071714-033857 . ПМИД   28375767 . S2CID   46739494 .
  25. ^ Селман К., Уоллес Р.А., Сарка А., Ци Икс (ноябрь 1993 г.). «Стадии развития ооцитов у рыбок данио Brachydanio rerio». Журнал морфологии . 218 (2): 203–224. дои : 10.1002/jmor.1052180209 . ПМИД   29865471 . S2CID   46930941 .
  26. ^ Алестрём П., Д'Анджело Л., Мидтлинг П.Дж., Шордерет Д.Ф., Шульте-Меркер С., Зом Ф., Уорнер С. (июнь 2020 г.). «Рио данио: Рекомендации по содержанию и содержанию» . Лабораторные животные . 54 (3): 213–224. дои : 10.1177/0023677219869037 . ПМК   7301644 . ПМИД   31510859 .
  27. ^ Брэдли К., Брейер П., Мелвилл Д., Броман К., Кнапик Э., Смит-младший (июнь 2011 г.). «Карта связей рыбок данио на основе SNP показывает локусы определения пола» . G3 (Бетесда) . 1 (1): 3–9. дои : 10.1534/g3.111.000190 . ПМК   3178105 . ПМИД   21949597 . S2CID   11161125 .
  28. ^ Jump up to: а б Доксер А (13 января 2012 г.). «Птицы делают это, пчелы делают это, даже рыбки данио делают это — слишком мало» . Уолл Стрит Джорнал . Архивировано из оригинала 15 января 2021 года . Проверено 11 февраля 2012 г.
  29. ^ Jump up to: а б с Хилл А.Дж., Тераока Х., Хайдеман В., Петерсон Р.Э. (июль 2005 г.). «Рыба данио как модель позвоночного для исследования химической токсичности» . Токсикологические науки . 86 (1): 6–19. дои : 10.1093/toxsci/kfi110 . ПМИД   15703261 .
  30. ^ Форнер-Пикер И., Сантанджели С., Марадонна Ф., Раббито А., Писцителли Ф., Хабиби Х.Р. и др. (октябрь 2018 г.). «Нарушение эндоканнабиноидной системы гонад у рыбок данио, подвергшихся воздействию диизононилфталата». Загрязнение окружающей среды . 241 : 1–8. Бибкод : 2018EPoll.241....1F . дои : 10.1016/j.envpol.2018.05.007 . ПМИД   29793103 . S2CID   44120848 .
  31. ^ Вестерфилд М (2007). Книга о рыбках данио: Руководство по лабораторному использованию рыбок данио ( Данио Рерио ) . Издательство Университета Орегона. [ постоянная мертвая ссылка ]
  32. ^ Герхард Г.С., Ченг К.К. (декабрь 2002 г.). «Призыв к плавникам! Рыбка данио как геронтологическая модель» . Стареющая клетка . 1 (2): 104–111. дои : 10.1046/j.1474-9728.2002.00012.x . ПМИД   12882339 .
  33. ^ «Рыбка данио — Danio rerio — Подробности — Энциклопедия жизни» . Энциклопедия жизни . Архивировано из оригинала 12 марта 2018 г. Проверено 12 марта 2018 г.
  34. ^ Гупта, Парт (15 февраля 2024 г.). «Руководство по уходу за рыбой длинноперый леопард данио — питомец Макс» . Архивировано из оригинала 22 февраля 2024 г. Проверено 5 марта 2024 г.
  35. ^ Ватанабе М., Ивашита М., Исии М., Курачи Ю., Каваками А., Кондо С., Окада Н. (сентябрь 2006 г.). «Пятнистость леопарда Danio, вызванная мутацией в гене коннексина 41.8 рыбки данио » ЭМБО Отчеты 7 (9): 893–897. дои : 10.1038/sj.embor.7400757 . ПМЦ   1559663 . ПМИД   16845369 .
  36. ^ Миллс Д. (1993). Справочник очевидца: Аквариумные рыбки . Харпер Коллинз. ISBN  978-0-7322-5012-6 . [ нужна страница ]
  37. ^ «ZFIN: Строки произвольного типа: сводный список» . zfin.org . Архивировано из оригинала 19 мая 2023 г. Проверено 17 июня 2019 г.
  38. ^ «Памяти Джорджа Штрайзингера, «отца-основателя» исследований в области развития и генетики рыбок данио» . Университет Орегона . Архивировано из оригинала 29 сентября 2015 года . Проверено 23 сентября 2015 г.
  39. ^ Сян Дж., Ян Х., Че С., Цзоу Х., Ян Х., Вэй Ю. и др. (2009). Исалан М (ред.). «Идентификация ингибиторов роста опухолевых клеток с помощью комбинаторной химии и анализов на рыбках данио» . ПЛОС ОДИН . 4 (2): e4361. Бибкод : 2009PLoSO...4.4361X . дои : 10.1371/journal.pone.0004361 . ПМК   2633036 . ПМИД   19194508 .
  40. ^ Бюгель С.М., Тангуай Р.Л., Планчарт А (сентябрь 2014 г.). «Рыба данио: чудо высокопроизводительной биологии для токсикологии 21 века» . Текущие отчеты о состоянии окружающей среды . 1 (4): 341–352. дои : 10.1007/s40572-014-0029-5 . ПМЦ   4321749 . ПМИД   25678986 .
  41. ^ Дубиньска-Магера М, Дачевска М, Левицка А, Мигоцка-Патрзалек М, Недбальска-Тарновска Ю, Ягла К (ноябрь 2016 г.). «Рыба данио: модель для изучения токсикантов, влияющих на развитие и функцию мышц» . Международный журнал молекулярных наук . 17 (11): 1941. doi : 10.3390/ijms17111941 . ПМК   5133936 . ПМИД   27869769 .
  42. ^ Майор Р.Дж., Посс К.Д. (2007). «Регенерация сердца рыбок данио как модель восстановления сердечной ткани» . Открытие лекарств сегодня: модели заболеваний . 4 (4): 219–225. дои : 10.1016/j.ddmod.2007.09.002 . ПМЦ   2597874 . ПМИД   19081827 .
  43. ^ «Исследование стволовых клеток взрослых позволяет избежать этических проблем» . Голос Америки. 19 мая 2010 года. Архивировано из оригинала 6 декабря 2014 года . Проверено 21 июня 2013 г.
  44. ^ Jump up to: а б Плантье Э., Мигоцка-Патрзалек М., Дачевска М., Ягла К. (апрель 2015 г.). «Модельные организмы в борьбе с мышечной дистрофией: уроки дрозофилы и рыбки данио» . Молекулы . 20 (4): 6237–6253. дои : 10.3390/molecules20046237 . ПМК   6272363 . ПМИД   25859781 .
  45. ^ Дам Р. (2006). «Рыбка данио разоблачена» . Американский учёный . 94 (5): 446–53. дои : 10.1511/2006.61.446 . Архивировано из оригинала 18 апреля 2017 г. Проверено 15 ноября 2012 г.
  46. ^ Джонс Р. (октябрь 2007 г.). «Пусть спящие рыбки данио лгут: новая модель исследования сна» . ПЛОС Биология . 5 (10): е281. doi : 10.1371/journal.pbio.0050281 . ПМК   2020498 . ПМИД   20076649 .
  47. ^ Пенглас С., Морен М., Хамре К. (ноябрь 2012 г.). «Лабораторные животные: стандартизировать рацион для модели рыбок данио» . Природа . 491 (7424): 333. Бибкод : 2012Natur.491..333P . дои : 10.1038/491333а . ПМИД   23151568 .
  48. ^ Джуринец М.Дж., Ся Р., Макрилл Дж.Дж., Гюнтер Д., Кроуфорд Т., Фланиган К.М. и др. (август 2008 г.). «Селенопротеин N необходим для активности канала высвобождения кальция рианодинового рецептора в мышцах человека и рыбки данио» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (34): 12485–12490. Бибкод : 2008PNAS..10512485J . дои : 10.1073/pnas.0806015105 . ПМК   2527938 . ПМИД   18713863 .
  49. ^ Редерсторфф М., Кастетс П., Арбогаст С., Лайне Дж., Василопулос С., Бёвен М. и др. (2011). «Повышенная чувствительность мышц к стрессу, вызванная инактивацией селенопротеина N у мышей: модель миопатии, связанной с SEPN1, на млекопитающих» . ПЛОС ОДИН . 6 (8): e23094. Бибкод : 2011PLoSO...623094R . дои : 10.1371/journal.pone.0023094 . ПМЦ   3152547 . ПМИД   21858002 .
  50. ^ Уэйд, Николас (24 марта 2010 г.). «Исследование дает ключ к пониманию того, как сердца могут регенерировать у некоторых видов» . Нью-Йорк Таймс . Архивировано из оригинала 1 января 2022 г.
  51. ^ Jump up to: а б Lush ME, Пиотровский Т. (октябрь 2014 г.). «Регенерация сенсорных волосковых клеток в боковой линии рыбок данио» . Динамика развития . 243 (10): 1187–1202. дои : 10.1002/dvdy.24167 . ПМК   4177345 . ПМИД   25045019 .
  52. ^ Теске, Кристофер. «Развивающаяся роль передачи сигналов Notch в регенерации сердца рыбок данио Danio rerio» . Researchgate.com . Архивировано из оригинала 19 мая 2024 года . Проверено 4 октября 2022 г.
  53. ^ «Исцеление разбитых сердец (2011), телереклама Британского кардиологического фонда» . Британский кардиологический фонд через YouTube. 31 января 2011 г. Архивировано из оригинала 17 ноября 2021 г. Проверено 15 ноября 2012 г.
  54. ^ «Британский кардиологический фонд – Наука, лежащая в основе привлекательности» . Bhf.org.uk. 16 февраля 2007 года. Архивировано из оригинала 10 марта 2012 года . Проверено 15 ноября 2012 г.
  55. ^ Бернардос Р.Л., Бартель Л.К., Мейерс-младший, Раймонд П.А. (июнь 2007 г.). «Предшественниками нейронов поздней стадии в сетчатке являются радиальные глия Мюллера, которые функционируют как стволовые клетки сетчатки» . Журнал неврологии . 27 (26): 7028–7040. doi : 10.1523/JNEUROSCI.1624-07.2007 . ПМК   6672216 . ПМИД   17596452 ​​.
  56. ^ Стюарт С., Цун З.Ю., Изписуа Бельмонте Дж.К. (ноябрь 2009 г.). «Деметилаза гистонов необходима для регенерации рыбок данио» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (47): 19889–19894. Бибкод : 2009PNAS..10619889S . дои : 10.1073/pnas.0904132106 . JSTOR   25593294 . ПМЦ   2785262 . ПМИД   19897725 .
  57. ^ «Регенерация органов у рыбок данио: раскрытие механизмов» . ScienceDaily . Архивировано из оригинала 05 февраля 2018 г. Проверено 9 марта 2018 г.
  58. ^ «Исследование раскрывает секрет рыбок данио | Биохимия | Sci-News.com» . Последние научные новости | Sci-News.com . Архивировано из оригинала 11 ноября 2020 г. Проверено 2 июня 2012 г.
  59. ^ Jump up to: а б Руководитель-младший, Гасиок Л., Пенниси М., Мейерс-младший (июль 2013 г.). «Активация канонической передачи сигналов Wnt/β-катенина стимулирует пролиферацию невромастов в задней боковой линии рыбок данио» . Динамика развития . 242 (7): 832–846. дои : 10.1002/dvdy.23973 . ПМИД   23606225 .
  60. ^ Штайнер А.Б., Ким Т., Кэбот В., Хадспет А.Дж. (апрель 2014 г.). «Динамическая экспрессия генов предполагаемыми предшественниками волосковых клеток во время регенерации боковой линии рыбок данио» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (14): E1393–E1401. Бибкод : 2014PNAS..111E1393S . дои : 10.1073/pnas.1318692111 . ПМЦ   3986164 . ПМИД   24706895 .
  61. ^ Кизил С (январь 2018 г.). «Механизмы индуцированной патологией пластичности нервных стволовых клеток и регенерации нейронов в мозге взрослых рыбок данио» . Текущие отчеты по патобиологии . 6 (1): 71–77. дои : 10.1007/s40139-018-0158-x . ПМЦ   5978899 . ПМИД   29938129 .
  62. ^ Косакак М.И., Бхаттараи П., Рейнхардт С., Петцольд А., Даль А., Чжан Ю., Кизил С. (апрель 2019 г.). «Одноклеточный транскриптомический анализ гетерогенности нервных стволовых клеток и контекстуальной пластичности в модели амилоидной токсичности рыб данио» . Отчеты по ячейкам . 27 (4): 1307–1318.e3. дои : 10.1016/j.celrep.2019.03.090 . ПМИД   31018142 .
  63. ^ Бхаттарай П., Косачак М.И., Машкарян В., Демир С., Попова С.Д., Говиндараджан Н. и др. (январь 2020 г.). «Взаимодействие нейронов и глии через ось серотонин-BDNF-NGFR обеспечивает регенеративный нейрогенез в модели мозга взрослых рыбок данио с болезнью Альцгеймера» . ПЛОС Биология . 18 (1): e3000585. doi : 10.1371/journal.pbio.3000585 . ПМЦ   6964913 . ПМИД   31905199 .
  64. ^ Си Ю, Ноубл С, Эккер М (июнь 2011 г.). «Моделирование нейродегенерации у рыбок данио» . Текущие отчеты по неврологии и нейробиологии . 11 (3): 274–282. дои : 10.1007/s11910-011-0182-2 . ПМК   3075402 . ПМИД   21271309 .
  65. ^ Бассетт Д.И., Карри П.Д. (октябрь 2003 г.). «Рыбки данио как модель мышечной дистрофии и врожденной миопатии» . Молекулярная генетика человека . 12 (спец № 2): R265–R270. дои : 10.1093/hmg/ddg279 . ПМИД   14504264 .
  66. ^ Крим MJ, Лоуренс С. (январь 2021 г.). «Рыба — не мышь: понимание различий в фоновой генетике имеет решающее значение для воспроизводимости». Лабораторное животное . 50 (1): 19–25. дои : 10.1038/s41684-020-00683-x . ISSN   0093-7355 . PMID   33268901 . S2CID   227259359 .
  67. ^ Уайтли А.Р., Бхат А., Мартинс Э.П., Мэйден Р.Л., Аруначалам М., Ууси-Хейккиля С. и др. (октябрь 2011 г.). «Популяционная геномика диких и лабораторных рыбок данио ( Danio rerio )» . Молекулярная экология . 20 (20): 4259–4276. Бибкод : 2011MolEc..20.4259W . дои : 10.1111/j.1365-294X.2011.05272.x . ПМЦ   3627301 . ПМИД   21923777 .
  68. ^ Коу Т.С., Гамильтон П.Б., Гриффитс А.М., Ходжсон Д.Д., Вахаб М.А., Тайлер Ч.Р. (январь 2009 г.). «Генетическая изменчивость штаммов рыбок данио ( Danio rerio ) и значение для экотоксикологических исследований». Экотоксикология . 18 (1): 144–150. Бибкод : 2009Ecotx..18..144C . дои : 10.1007/s10646-008-0267-0 . ПМИД   18795247 . S2CID   18370151 .
  69. ^ Киммел CB, Law RD (март 1985 г.). «Клеточное происхождение бластомеров рыбок данио. I. Характер расщепления и цитоплазматические мостики между клетками». Биология развития . 108 (1): 78–85. дои : 10.1016/0012-1606(85)90010-7 . ПМИД   3972182 .
  70. ^ Киммел CB, Law RD (март 1985 г.). «Клеточное происхождение бластомеров рыбок данио. III. Клональный анализ стадий бластулы и гаструлы». Биология развития . 108 (1): 94–101. дои : 10.1016/0012-1606(85)90012-0 . ПМИД   3972184 .
  71. ^ Стейнер Д.Ю., Раз Э., Лоусон Н.Д., Эккер С.С., Бурдин Р.Д., Эйзен Дж.С. и др. (октябрь 2017 г.). «Руководство по использованию морфолино у рыбок данио» . ПЛОС Генетика . 13 (10): е1007000. дои : 10.1371/journal.pgen.1007000 . ПМК   5648102 . ПМИД   29049395 .
  72. ^ Розен Дж. Н., Суини М. Ф., Мабли Дж. Д. (март 2009 г.). «Микроинъекция эмбрионов рыбок данио для анализа функции генов» . Журнал визуализированных экспериментов (25). дои : 10.3791/1115 . ПМЦ   2762901 . ПМИД   19274045 .
  73. ^ Леонг И.Ю., Лан К.С., Скиннер-младший, Шеллинг А.Н., Лав ДР (2012). «Тестирование in vivo нокдауна генов, опосредованного микроРНК, у рыбок данио» . Журнал биомедицины и биотехнологии . 2012 . Хидави: 350352. doi : 10.1155/2012/350352 . ПМК   3303736 . ПМИД   22500088 .
  74. ^ Тан П.К., Дауни Т.Дж., Шпицнагель Е.Л., Сюй П., Фу Д., Димитров Д.С. и др. (октябрь 2003 г.). «Оценка измерений экспрессии генов на коммерческих платформах микрочипов» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (19): 5676–5684. дои : 10.1093/нар/gkg763 . ПМК   206463 . ПМИД   14500831 .
  75. ^ «Консорциум геномных ссылок» . ГРЦ. Архивировано из оригинала 5 октября 2016 года . Проверено 23 октября 2012 г.
  76. ^ «Расшифровка тайны генома». Архивировано 15 июля 2009 г. в Wayback Machine . Индийский экспресс . 5 июля 2009 г. Проверено 5 февраля 2013 г.
  77. ^ FishMap Zv8. Архивировано 19 июля 2018 г. в Wayback Machine . Институт геномики и интегративной биологии (ИГИБ). Проверено 7 июня 2012 г.
  78. ^ Jump up to: а б Хоу К., Кларк М.Д., Торроха К.Ф., Торранс Дж., Бертло С., Муффато М. и др. (апрель 2013 г.). «Эталонная последовательность генома рыбки данио и ее связь с геномом человека» . Природа . 496 (7446): 498–503. Бибкод : 2013Natur.496..498H . дои : 10.1038/nature12111 . ПМЦ   3703927 . ПМИД   23594743 .
  79. ^ Jump up to: а б Бротон Р.Э., Милам Дж.Э., Роу Б.А. (ноябрь 2001 г.). «Полная последовательность митохондриального генома рыбки данио ( Danio rerio ) и закономерности эволюции митохондриальной ДНК позвоночных» . Геномные исследования . 11 (11): 1958–1967. дои : 10.1101/гр.156801 . ПМЦ   311132 . ПМИД   11691861 .
  80. ^ Jump up to: а б с д и Шир, Александр Ф.; Талбот, Уильям С. (1 декабря 2005 г.). «Молекулярная генетика формирования осей у рыбок данио». Ежегодный обзор генетики . 39 (1). Годовые обзоры : 561–613. дои : 10.1146/annurev.genet.37.110801.143752 . ISSN   0066-4197 . ПМИД   16285872 .
  81. ^ Jump up to: а б с Найче, Луизиана; Харрельсон, Закари; Келли, Роберт Г.; Папайоанну, Вирджиния Э. (1 декабря 2005 г.). «Гены T-Box в развитии позвоночных». Ежегодный обзор генетики . 39 (1). Годовые обзоры : 219–239. дои : 10.1146/annurev.genet.39.073003.105925 . ISSN   0066-4197 . ПМИД   16285859 .
  82. ^ Листер Дж.А., Робертсон К.П., Лепаж Т., Джонсон С.Л., Райбл Д.В. (сентябрь 1999 г.). «Перламутр кодирует белок, связанный с микрофтальмией рыбок данио, который регулирует судьбу пигментных клеток нервного гребня». Разработка . 126 (17): 3757–3767. дои : 10.1242/dev.126.17.3757 . ПМИД   10433906 .
  83. ^ Ламасон Р.Л., Мохидин М.А., Мест Дж.Р., Вонг А.С., Нортон Х.Л., Арос М.К. и др. (декабрь 2005 г.). «SLC24A5, предполагаемый катионообменник, влияет на пигментацию у рыбок данио и людей». Наука . 310 (5755): 1782–1786. Бибкод : 2005Sci...310.1782L . дои : 10.1126/science.1116238 . ПМИД   16357253 . S2CID   2245002 .
  84. ^ Джинна Брайнер (6 февраля 2008 г.). «Ученые создают прозрачную рыбу и наблюдают за ростом рака» . www.livscience.com . Архивировано из оригинала 19 мая 2024 года . Проверено 23 января 2022 г.
  85. ^ Каваками К., Такеда Х., Каваками Н., Кобаяши М., Мацуда Н., Мишина М. (июль 2004 г.). «Подход с использованием транспозонов-опосредованных генных ловушек идентифицирует гены, регулируемые развитием, у рыбок данио» . Развивающая клетка . 7 (1): 133–144. дои : 10.1016/j.devcel.2004.06.005 . ПМИД   15239961 .
  86. ^ Паринов С, Кондричин И, Корж В, Емельянов А (октябрь 2004 г.). «Ловушка-энхансер, опосредованная транспозоном Tol2, для идентификации генов рыбок данио, регулируемых развитием, in vivo» . Динамика развития . 231 (2): 449–459. дои : 10.1002/dvdy.20157 . ПМИД   15366023 .
  87. ^ Бароло С., Посакони Дж.В. (май 2002 г.). «Три особенности высокоэффективных сигнальных путей: принципы контроля транскрипции посредством передачи сигналов в клетках развития» . Гены и развитие . 16 (10). Лабораторное издательство Колд-Спринг-Харбор и Общество генетиков : 1167–1181. дои : 10.1101/gad.976502 . ПМИД   12023297 . S2CID   14376483 .
  88. ^ Вейнар, Чарльз Э.; Морено-Матеос, Мигель А.; Сифуэнтес, Дэниел; Баццини, Ариэль А.; Хиральдес, Антонио Дж. (октябрь 2016 г.). «Оптимизированная система CRISPR – Cas9 для редактирования генома рыбок данио» . Протоколы Колд-Спринг-Харбора . 2016 (10): pdb.prot086850. дои : 10.1101/pdb.prot086850 . ISSN   1940-3402 . ПМИД   27698232 . Архивировано из оригинала 19 мая 2024 г. Проверено 5 декабря 2022 г.
  89. ^ Ян С., Брансон Д.С., Тан К., До Д., Ифтимиа Н.А., Мур Дж.К. и др. (июнь 2019 г.). «Визуализация привитого человеческого рака и реакции на терапию у рыбок данио с иммунодефицитом» . Клетка . 177 (7): 1903–1914.e14. дои : 10.1016/j.cell.2019.04.004 . ПМК   6570580 . ПМИД   31031007 .
  90. ^ Лин К.Л., Таггарт А.Дж., Лим К.Х., Сайган К.Дж., Феррарис Л., Кретон Р. и др. (январь 2016 г.). «Структура РНК заменяет необходимость U2AF2 в сплайсинге» . Геномные исследования . 26 (1): 12–23. дои : 10.1101/гр.181008.114 . ПМЦ   4691745 . ПМИД   26566657 .
  91. ^ Габальдон Т., Кунин Е.В. (май 2013 г.). «Функциональные и эволюционные последствия ортологии генов» . Обзоры природы. Генетика . 14 (5): 360–366. дои : 10.1038/nrg3456 . ПМЦ   5877793 . ПМИД   23552219 .
  92. ^ Чарльзворт Д., Уиллис Дж. Х. (ноябрь 2009 г.). «Генетика инбредной депрессии». Обзоры природы. Генетика . 10 (11): 783–796. дои : 10.1038/nrg2664 . ПМИД   19834483 . S2CID   771357 .
  93. ^ Бикли Л.К., Браун А.Р., Хоскен Д.Д., Гамильтон П.Б., Ле Пейдж Дж., Полл Г.К. и др. (февраль 2013 г.). «Интерактивное влияние инбридинга и эндокринных нарушений на воспроизводство модельной лабораторной рыбы» . Эволюционные приложения . 6 (2): 279–289. Бибкод : 2013EvApp...6..279B . дои : 10.1111/j.1752-4571.2012.00288.x . ПМЦ   3689353 . ПМИД   23798977 .
  94. ^ Jump up to: а б Ллевеллин, Мартин С.; Бутен, Себастьен; Хосейнифар, Сейед Хосейн; Дером, Николя (2 июня 2014 г.). «Микробиомы костистых костей: современное состояние их характеристики, манипулирования и значения в аквакультуре и рыболовстве» . Границы микробиологии . 5 . Границы : 207. doi : 10.3389/fmicb.2014.00207 . ISSN   1664-302X . ПМК   4040438 . ПМИД   24917852 . S2CID   13050990 .
  95. ^ Jump up to: а б с д и Дам, Ральф; Гейслер, Роберт (25 апреля 2006 г.). «Учимся у мальков: рыбка данио как генетический модельный организм для видов рыб, выращиваемых в аквакультуре». Морская биотехнология . 8 (4). Европейское общество морской биотехнологии (ESMB) + Японское общество морской биотехнологии (JSMB) + Австралийско-Новозеландское общество морской биотехнологии (ANZMBS) ( Springer ): 329–345. Бибкод : 2006MarBt...8..329D . дои : 10.1007/s10126-006-5139-0 . ISSN   1436-2228 . ПМИД   16670967 . S2CID   23994075 .
  96. ^ Jump up to: а б с д Рибас, Лайя; Пиферрер, Франческ (31 июля 2013 г.). «Рыба данио ( Danio rerio ) как модельный организм с упором на применение в исследованиях аквакультуры рыбы». Обзоры в разделе Аквакультура . 6 (4). Уайли : 209–240. дои : 10.1111/raq.12041 . ISSN   1753-5123 . S2CID   84107971 .
  97. ^ Jump up to: а б
  98. ^ Jump up to: а б с Дей А., Флайшанс М., Пшеничка М., Газо И. Гены репарации ДНК играют разнообразную роль в развитии эмбрионов рыб. Front Cell Dev Biol. 1 марта 2023 г.; 11: 1119229. doi: 10.3389/fcell.2023.1119229. ПМИД 36936683; PMCID: PMC10014602
  99. ^ Канедо А, Роча TL. Рыбка данио (Danio rerio) в качестве модели для оценки генотоксичности и восстановления ДНК: исторический обзор, современное состояние и тенденции. Научная Тотальная Окружающая среда. 25 марта 2021 г.;762:144084. doi: 10.1016/j.scitotenv.2020.144084. Epub, 14 декабря 2020 г. PMID 33383303
  100. ^ Мартин В.К., Теннант А.Х., Конолли Р.Б., Принс К., Стивенс Дж.С., ДеМарини Д.М. и др. (январь 2019 г.). «Высокопроизводительная видеообработка реакций сердечного ритма у нескольких эмбриональных рыбок данио дикого типа на поле визуализации» . Научные отчеты . 9 (1): 145. Бибкод : 2019НатСР...9..145М . дои : 10.1038/s41598-018-35949-5 . ПМК   6333808 . ПМИД   30644404 .
  101. ^ Тейшидо Э., Кисслинг Т.Р., Крупп Э., Кеведо С., Муриана А., Шольц С. (февраль 2019 г.). «Автоматическая оценка морфологических особенностей для проверки токсичности развития эмбрионов рыбок данио» . Токсикологические науки . 167 (2): 438–449. дои : 10.1093/toxsci/kfy250 . ПМК   6358258 . ПМИД   30295906 .
  102. ^ «Рыба ради науки» . Университет Шеффилда. 2011. Архивировано из оригинала 12 ноября 2020 года . Проверено 19 марта 2011 г.
  103. ^ Браннен К.К., Панзика-Келли Дж.М., Дэнберри Т.Л., Августин-Раух К.А. (февраль 2010 г.). «Разработка анализа тератогенности эмбрионов рыбок данио и модели количественного прогнозирования». Исследование врожденных дефектов. Часть B: Токсикология развития и репродуктивной системы . 89 (1): 66–77. дои : 10.1002/bdrb.20223 . ПМИД   20166227 .
  104. ^ Реннекамп А.Дж., Петерсон Р.Т. (февраль 2015 г.). «15 лет химического скрининга рыб данио» . Современное мнение в области химической биологии . 24 : 58–70. дои : 10.1016/j.cbpa.2014.10.025 . ПМК   4339096 . ПМИД   25461724 .
  105. ^ Jump up to: а б Макрей, Калифорния, Петерсон RT (октябрь 2015 г.). «Рио данио как инструмент для открытия лекарств». Обзоры природы. Открытие наркотиков . 14 (10): 721–731. дои : 10.1038/nrd4627 . ПМИД   26361349 . S2CID   1979653 .
  106. ^ Jump up to: а б Кантае В., Крекельс Э.Х., Ордас А., Гонсалес О., ван Вейк Р.К., Хармс А.С. и др. (декабрь 2016 г.). «Фармакокинетическое моделирование поглощения и клиренса парацетамола у личинок рыбок данио: расширение аллометрической шкалы у позвоночных на пять порядков величины» . Рыбка данио . 13 (6): 504–510. дои : 10.1089/zeb.2016.1313 . ПМК   5124745 . ПМИД   27632065 .
  107. ^ Шультесс П., ван Вейк Р.К., Крекельс Э.Х., Йейтс Дж.В., Спэнек Х.П., ван дер Грааф П.Х. (май 2018 г.). «Системная фармакология снаружи внутри сочетает в себе инновационные вычислительные методы с высокопроизводительными исследованиями целых позвоночных» . CPT: Фармакометрика и системная фармакология . 7 (5): 285–287. дои : 10.1002/psp4.12297 . ПМК   5980533 . ПМИД   29693322 .
  108. ^ Лю С., Лич С.Д. (2011). «Модели рыбок данио для рака». Ежегодный обзор патологии . 6 : 71–93. doi : 10.1146/annurev-pathol-011110-130330 . ПМИД   21261518 .
  109. ^ «Модель меланомы человека у рыб данио обнаруживает новый ген рака» . Наука Дейли . 23 марта 2011 года. Архивировано из оригинала 19 мая 2024 года . Проверено 28 апреля 2014 г.
  110. ^ Сеол С.Дж., Уврас И., Джейн-Вальбуэна Дж., Билодо С., Орландо Д.А., Баттисти В. и др. (март 2011 г.). «Гистон-метилтрансфераза SETDB1 рекуррентно амплифицируется при меланоме и ускоряет ее возникновение» . Природа . 471 (7339): 513–517. Бибкод : 2011Natur.471..513C . дои : 10.1038/nature09806 . ПМЦ   3348545 . ПМИД   21430779 .
  111. ^ Уайт Р.М., Чех Дж., Ратанасиринтравут С., Лин С.И., Рал П.Б., Берк С.Дж. и др. (март 2011 г.). «DHODH модулирует элонгацию транскрипции в нервном гребне и меланоме» . Природа . 471 (7339): 518–522. Бибкод : 2011Natur.471..518W . дои : 10.1038/nature09882 . ПМЦ   3759979 . ПМИД   21430780 .
  112. ^ «Лекарство от артрита может помочь победить меланому рака кожи, результаты исследования» . Sciencedaily . 24 марта 2011 года. Архивировано из оригинала 19 мая 2024 года . Проверено 15 ноября 2012 г.
  113. ^ Шабле, Фабиан; Вейт, Юлия; Райнер, Грегор; Язвиньская, Анна (2011). «Сердце рыбок данио регенерирует после инфаркта миокарда, вызванного криоповреждением» . Биология развития BMC . 11:21 . дои : 10.1186/1471-213X-11-21 . ПМК   3078894 . ПМИД   21473762 .
  114. ^ Апайдин, Онур; Алтайкызы, Акерке; Филоса, Алессандро; Савамипхак, Супханса (20 ноября 2023 г.). «Адренергическая передача сигналов альфа-1 стимулирует регенерацию сердца посредством транскрипционной программы ремоделирования внеклеточного матрикса в макрофагах рыбок данио» . Развивающая клетка . 58 (22): 2460–2476.e7. дои : 10.1016/j.devcel.2023.09.011 . ISSN   1534-5807 . ПМИД   37875117 . S2CID   264449103 .
  115. ^ Драммонд, Айова (февраль 2005 г.). «Развитие почек и заболевания рыбок данио». Журнал Американского общества нефрологов . 16 (2): 299–304. дои : 10.1681/ASN.2004090754 . ПМИД   15647335 . S2CID   25428361 .
  116. ^ «Исследование воспалительных заболеваний с использованием рыбок данио» . Рыба для науки. Архивировано из оригинала 9 января 2013 года . Проверено 15 ноября 2012 г.
  117. ^ Ле Гаядер Д., Редд М.Дж., Колуччи-Гийон Э., Мураяма Э., Кисса К., Бриолат В. и др. (январь 2008 г.). «Происхождение и нетрадиционное поведение нейтрофилов у развивающихся рыбок данио» . Кровь . 111 (1): 132–141. doi : 10.1182/blood-2007-06-095398 . ПМИД   17875807 . S2CID   8853409 .
  118. ^ Новоа Б, Фигерас А (01 января 2012 г.). «Рыба данио: модель для изучения воспаления и врожденного иммунного ответа на инфекционные заболевания». В Lambris JD, Hajishengallis G (ред.). Актуальные темы врожденного иммунитета II . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 946. Спрингер Нью-Йорк. стр. 253–275. дои : 10.1007/978-1-4614-0106-3_15 . hdl : 10261/44975 . ISBN  9781461401056 . ПМИД   21948373 . S2CID   6914876 .
  119. ^ Микер Н.Д., Треде Н.С. (2008). «Иммунология и рыбки данио: создание новых моделей болезней человека». Развивающая и сравнительная иммунология . 32 (7): 745–757. дои : 10.1016/j.dci.2007.11.011 . ПМИД   18222541 .
  120. ^ Реншоу С.А., Треде Н.С. (январь 2012 г.). «Модель, созданная 450 миллионов лет назад: рыбки данио и иммунитет позвоночных» . Модели и механизмы заболеваний . 5 (1): 38–47. дои : 10.1242/dmm.007138 . ПМЦ   3255542 . ПМИД   22228790 .
  121. ^ Мейер А.Х., Спэнек Х.П. (июнь 2011 г.). «Взаимодействие хозяина и патогена стало прозрачным с помощью модели рыбки данио» . Текущие цели по борьбе с наркотиками . 12 (7): 1000–1017. дои : 10.2174/138945011795677809 . ПМК   3319919 . ПМИД   21366518 .
  122. ^ ван дер Ваарт М., Спэнек Х.П., Мейер А.Х. (2012). «Распознавание патогенов и активация врожденного иммунного ответа у рыбок данио» . Достижения гематологии . 2012 : 159807. doi : 10.1155/2012/159807 . ПМК   3395205 . ПМИД   22811714 .
  123. ^ Бенард Э.Л., ван дер Сар А.М., Эллетт Ф., Лишке Г.Дж., Спэнек Х.П., Мейер А.Х. (март 2012 г.). «Заражение эмбрионов рыбок данио внутриклеточными бактериальными возбудителями» . Журнал визуализированных экспериментов (61). дои : 10.3791/3781 . ПМК   3415172 . ПМИД   22453760 .
  124. ^ Мейер А.Х., ван дер Ваарт М., Спэнек Х.П. (январь 2014 г.). «Визуализация в реальном времени и генетическое исследование взаимодействий хозяина и микроба у рыбок данио» . Клеточная микробиология . 16 (1): 39–49. дои : 10.1111/cmi.12236 . hdl : 1887/3736301 . ПМИД   24188444 .
  125. ^ Торрака В., Масуд С., Спэнек Х.П., Мейер А.Х. (июль 2014 г.). «Взаимодействие макрофагов и патогенов при инфекционных заболеваниях: новые терапевтические идеи на основе модели хозяина рыбки данио» . Модели и механизмы заболеваний . 7 (7): 785–797. дои : 10.1242/dmm.015594 . ПМЦ   4073269 . ПМИД   24973749 .
  126. ^ Левро Ж.П., Палья Н., Ланжевен С., Будино П. (сентябрь 2014 г.). «Сквозь зазеркалье: наблюдение за взаимодействием вируса-хозяина у рыбок данио». Тенденции в микробиологии . 22 (9): 490–497. дои : 10.1016/j.tim.2014.04.014 . ПМИД   24865811 .
  127. ^ Рамакришнан Л. (2013). «Заглянув внутрь рыбки данио, чтобы понять туберкулезную гранулему». Новая парадигма иммунитета к туберкулезу . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 783. стр. 251–66. дои : 10.1007/978-1-4614-6111-1_13 . ISBN  978-1-4614-6110-4 . ПМИД   23468113 .
  128. ^ Рамакришнан Л. (2013). «Руководство по иммунитету и лечению рыбок данио» . Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии . 78 : 179–192. дои : 10.1101/sqb.2013.78.023283 . ПМИД   24643219 .
  129. ^ Кронан М.Р., Тобин Д.М. (июль 2014 г.). «Пригодны к употреблению: рыбки данио как модель туберкулеза» . Модели и механизмы заболеваний . 7 (7): 777–784. дои : 10.1242/dmm.016089 . ПМК   4073268 . ПМИД   24973748 .
  130. ^ Мейер А.Х. (март 2016 г.). «Защита и патология при туберкулезе: обучение на модели рыбок данио» . Семинары по иммунопатологии . 38 (2): 261–273. дои : 10.1007/s00281-015-0522-4 . ПМЦ   4779130 . ПМИД   26324465 .
  131. ^ Спэнек Х.П., Куи С., Вивегер М.И., Янсен Х.Дж., Венеман В.Дж., Марин-Хуес Р. и др. (август 2013 г.). «Роботизированная инъекция эмбрионов рыбок данио для высокопроизводительного скрининга моделей заболеваний» . Методы . 62 (3): 246–254. дои : 10.1016/j.ymeth.2013.06.002 . hdl : 10044/1/53161 . ПМИД   23769806 .
  132. ^ Венеман В.Дж., Марин-Хуес Р., де Сонневиль Х., Ордас А., Йонг-Раадсен С., Мейер А.Х., Спэнек Х.П. (июнь 2014 г.). «Создание и оптимизация высокопроизводительной установки для изучения инфекции Staphylococcus epidermidis и Mycobacterium marinum в качестве модели для открытия лекарств» . Журнал визуализированных экспериментов . 88 (88): е51649. дои : 10.3791/51649 . ПМК   4206090 . ПМИД   24998295 .
  133. ^ Эллисон В.Т., Бартель Л.К., Скебо К.М., Такечи М., Кавамура С., Раймонд П.А. (октябрь 2010 г.). «Онтогенез мозаики фоторецепторов колбочек у рыбок данио» . Журнал сравнительной неврологии . 518 (20): 4182–4195. дои : 10.1002/cne.22447 . ПМЦ   3376642 . ПМИД   20878782 .
  134. ^ Лоуренс Дж.М., Сингхал С., Бхатия Б., Киган Дж.Д., Рех Т.А., Лютерт П.Дж. и др. (август 2007 г.). «Клетки MIO-M1 и аналогичные линии глиальных клеток Мюллера, полученные из сетчатки взрослого человека, обладают характеристиками нервных стволовых клеток» . Стволовые клетки . 25 (8): 2033–2043. doi : 10.1634/stemcells.2006-0724 . ПМИД   17525239 .
  135. ^ «Рыба-зебра может указать способ лечения слепоты » Почта Китая . 3 августа 2007 г. Архивировано из оригинала 10 сентября 2012 г.
  136. ^ Кункель Л.М., Бахрах Э., Беннетт Р.Р., Гийон Дж., Штеффен Л. (май 2006 г.). «Диагностика и клеточная терапия мышечной дистрофии Дюшенна у людей, мышей и рыбок данио» . Журнал генетики человека . 51 (5): 397–406. дои : 10.1007/s10038-006-0374-9 . ПМЦ   3518425 . ПМИД   16583129 .
  137. ^ Мачука-Цили Л.Е., Бакстон С., Торп А., Тимсон С.М., Вигмор П., Лютер П.К., Брук Дж.Д. (май 2011 г.). «Рыбы данио с дефицитом Muscleblind-like 2 проявляют признаки миотонической дистрофии» . Модели и механизмы заболеваний . 4 (3): 381–392. дои : 10.1242/dmm.004150 . ПМК   3097459 . ПМИД   21303839 .
  138. ^ Тодд ПК, Акал Ф.Ю., Хур Дж., Шарма К., Полсон Х.Л., Даулинг Дж.Дж. (январь 2014 г.). «Транскрипционные изменения и аномалии развития в модели миотонической дистрофии 1 типа у рыбок данио» . Модели и механизмы заболеваний . 7 (1): 143–155. дои : 10.1242/dmm.012427 . ПМК   3882056 . ПМИД   24092878 .
  139. ^ Джонс К.Дж., Морган Дж., Джонстон Х., Тобиас В., Уврье Р.А., Уилкинсон И., Норт К.Н. (октябрь 2001 г.). «Расширяющийся фенотип нарушений цепи ламинина альфа2 (мерозина): серия случаев и обзор» . Журнал медицинской генетики . 38 (10): 649–657. дои : 10.1136/jmg.38.10.649 . ПМЦ   1734735 . ПМИД   11584042 .
  140. ^ Мэйвс Л. (сентябрь 2014 г.). «Последние достижения в использовании моделей животных данио для открытия лекарств от мышечных заболеваний» . Мнение экспертов об открытии лекарств . 9 (9): 1033–1045. дои : 10.1517/17460441.2014.927435 . ПМЦ   4697731 . ПМИД   24931439 .
  141. ^ Виттен П.Е., Хансен А., Холл Б.К. (декабрь 2001 г.). «Особенности одно- и многоядерных клеток, резорбирующих кость, рыбок данио Danio rerio и их вклад в развитие, ремоделирование и рост скелета». Журнал морфологии . 250 (3): 197–207. дои : 10.1002/jmor.1065 . ПМИД   11746460 . S2CID   33403358 .
  142. ^ Карновали М., Банфи Г., Мариотти М. (2019). «Модели скелетных нарушений у рыбок данио: эмбрион и взрослая особь плавают вместе» . БиоМед Исследования Интернэшнл . 2019 : 1253710. дои : 10.1155/2019/1253710 . ПМЦ   6886339 . ПМИД   31828085 .
  143. ^ Jump up to: а б Бергенский ди-джей, Каге Э., Хаммонд КЛ (2019). «Рыба данио как новая модель остеопороза: основная платформа тестирования для скрининга новых остеоактивных соединений» . Границы эндокринологии . 10 :6. дои : 10.3389/fendo.2019.00006 . ПМК   6361756 . ПМИД   30761080 .
  144. ^ де Вриз Э., ван Кессель М.А., Петерс Х.М., Спэнингс Ф.А., Флик Дж., Мец Дж.Р. (февраль 2014 г.). «Преднизолон индуцирует остеопороз-подобный фенотип в регенерирующей чешуе рыбки данио». Международный остеопороз . 25 (2): 567–578. дои : 10.1007/s00198-013-2441-3 . ПМИД   23903952 . S2CID   21829206 .
  145. ^ де Вриз Э., Зетхоф Дж., Шульте-Меркер С., Флик Г., Мец Дж. Р. (май 2015 г.). «Идентификация новых остеогенных соединений с помощью анализа ex-vivo sp7:люцифераза на чешуе рыбки данио». Кость . 74 : 106–113. дои : 10.1016/j.bone.2015.01.006 . hdl : 2066/153047 . ПМИД   25600250 .
  146. ^ Jump up to: а б с д и ж г Занг Л., Мэддисон Л.А., Чен В. (20 августа 2018 г.). «Рыба данио как модель ожирения и диабета» . Границы клеточной биологии и биологии развития . 6 (91): 91. doi : 10.3389/fcell.2018.00091 . ПМК   6110173 . ПМИД   30177968 .
  147. ^ Чо С.Дж., Пак Э., Бейкер А., Рид А.Ю. (10 сентября 2020 г.). «Возрастная предвзятость в моделях эпилепсии у рыбок данио: чему мы можем научиться у старых рыб?» . Границы клеточной биологии и биологии развития . 8 : 573303. дои : 10.3389/fcell.2020.573303 . ПМЦ   7511771 . ПМИД   33015065 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Викискладе есть медиафайлы по теме Данио рерио .
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Zebrafish&oldid=1237074241"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 6a54005651407fec3302f85869f1b36f__1722119280
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/6a/6f/6a54005651407fec3302f85869f1b36f.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Zebrafish - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)