ДНК-геликаза Т7
| ДНК-примаза/геликаза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Организм | |||
| Символ | 4 | ||
| ЮниПрот | P03692 | ||
| |||
ДНК-хеликаза Т7 (gp4) представляет собой гексамерный моторный белок, кодируемый фагами Т7 , который использует энергию dTTP гидролиза для однонаправленного процесса вдоль одноцепочечной ДНК , разделяя ( геликаза ) две цепи по мере продвижения. Это также примаза , образующая короткие участки РНК , которые инициируют синтез ДНК . [ 1 ] Образует комплекс с ДНК-полимеразой Т7 . Его гомологи обнаружены в митохондриях (как Твинкл ) и хлоропластах . [ 2 ] [ 3 ]
Кристаллическая структура
[ редактировать ]Кристаллическая структура была решена с разрешением 3,0 Å в 2000 году, как показано на рисунке в ссылке. [ 4 ] Обратите внимание, что на рисунке (А) отдельные субъединицы связаны посредством взаимодействия между альфа-спиралью и соседней субъединицей. В (Б) имеется шесть наборов по три петли. Красная петля, известная как петля II, содержит три остатка лизина и, как полагают, участвует в связывании оцДНК , которая проходит через центр фермента .
Механизм последовательного гидролиза dTTP
[ редактировать ]Крэмптон и др. предложили механизм зависимого от оцДНК гидролиза dTTP ДНК-хеликазой Т7, как показано на рисунке ниже. [ 5 ] В их модели белковые петли, расположенные на каждой гексамерной субъединице, каждая из которых содержит три остатка лизина , последовательно взаимодействуют с отрицательно заряженным фосфатным остовом оцДНК. Это взаимодействие, по-видимому, вызывает конформационные изменения в активно связанной субъединице, обеспечивая эффективное высвобождение dTDP из сайта связывания dTTP. В процессе высвобождения dTDP оцДНК передается соседней субъединице, которая подвергается аналогичному процессу. Предыдущие исследования уже показали, что оцДНК способна связываться с двумя гексамерными субъединицами одновременно. [ 6 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ли С.Дж., Ричардсон CC (октябрь 2011 г.). «Хореография репликации ДНК бактериофага Т7» . Современное мнение в области химической биологии . 15 (5): 580–586. дои : 10.1016/j.cbpa.2011.07.024 . ПМК 3195405 . ПМИД 21907611 .
- ^ Спелбринк Дж.Н., Ли Ф.Ю., Тиранти В., Никали К., Юань К.П., Тарик М. и др. (июль 2001 г.). «Делеции митохондриальной ДНК человека, связанные с мутациями в гене, кодирующем Twinkle, белок, подобный гену 4 фага Т7, локализованный в митохондриях». Природная генетика . 28 (3): 223–231. дои : 10.1038/90058 . ПМИД 11431692 . S2CID 22237030 .
- ^ Дирей-Арсе Дж., Лю Б., Купп Дж.Д., Хант Т., Нильсен Б.Л. (март 2013 г.). «Ген Arabidopsis At1g30680 кодирует гомолог белка gp4 фага Т7, который обладает как ДНК-примазной, так и ДНК-хеликазной активностью» . Биология растений BMC . 13:36 . дои : 10.1186/1471-2229-13-36 . ПМК 3610141 . ПМИД 23452619 .
- ^ Синглтон М.Р., Савая М.Р., Элленбергер Т., Вигли Д.Б. (июнь 2000 г.). «Кристаллическая структура 4-кольцевой хеликазы гена Т7 указывает на механизм последовательного гидролиза нуклеотидов» . Клетка . 101 (6): 589–600. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80871-5 . ПМИД 10892646 .
- ^ Крэмптон DJ, Мукерджи С., Ричардсон CC (январь 2006 г.). «ДНК-индуцированное переключение с независимого гидролиза dTTP на последовательный в ДНК-хеликазе бактериофага Т7» . Молекулярная клетка . 21 (2): 165–174. doi : 10.1016/j.molcel.2005.11.027 . ПМИД 16427007 .
- ^ Ю Х, Хингорани М.М., Патель С.С., Эгельман Э.Х. (сентябрь 1996 г.). «ДНК связана внутри центрального отверстия с одной или двумя из шести субъединиц ДНК-хеликазы Т7». Структурная биология природы . 3 (9): 740–743. дои : 10.1038/nsb0996-740 . ПМИД 8784344 . S2CID 12425998 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- T7 + ДНК + примаза-геликаза + белок в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
