✖


Jump to content

Гаммапротеобактерии

(Перенаправлено с Гаммапротеобактерии )

Гаммапротеобактерии
Холерный вибрион
Научная классификация Изменить эту классификацию
Домен: Бактерии
Тип: Псевдомонадота
Сорт: Гаммапротеобактерии
Гаррити и др . 2005 г.
Заказы
Синонимы
  • " Хроматия " Кавальер-Смит 2020

Гаммапротеобактерии — класс бактерий типа Pseudomonadota (синоним Proteobacteria ). Он содержит около 250 родов, что делает его самым богатым по родам таксоном прокариот . [1] К этому классу принадлежат несколько важных с медицинской, экологической и научной точек зрения групп бактерий. Все представители этого класса грамотрицательны . Это наиболее филогенетически и физиологически разнообразный класс Pseudomonadota . [2]

Члены гаммапротеобактерий живут в нескольких наземных и морских средах, в которых они играют различные важные роли, в том числе в экстремальных условиях, таких как гидротермальные источники . Они могут иметь разную форму, палочки, изогнутые палочки, кокки, спириллы и нити. [3] и включают свободноживущие бактерии, образующие биопленки , комменсалов и симбионтов; [4] некоторые также имеют отличительную особенность — биолюминесцентность. [5] обнаружен разнообразный метаболизм У гаммапротеобактерий ; существуют как аэробные, так и анаэробные (облигатные или факультативные) виды, хемолитоавтотрофы , хемоорганотрофы , фотоавтотрофы и гетеротрофы . [6]

Этимология

[ редактировать ]

Элемент « гамма » (третья буква греческого алфавита) указывает на то, что это класс III в « Руководстве по систематической бактериологии» Берджи (том II, стр. 1). Протей относится к греческому морскому богу, который мог менять свою форму. Бактерии (греч. βακτήριον; «палочка», «палочка»), с точки зрения этимологической истории, относятся к Bacillus (палочковидным бактериям), но в данном случае «полезны на промежуточном этапе, пока филогенетические данные интегрируются в формальные бактериальные данные». таксономия». [7]

Филогения

[ редактировать ]

В настоящее время множество различных классификаций основано на разных подходах, таких как Национальный центр биотехнологической информации , основанный на геномике, Список названий прокариот, имеющих номенклатуру , База данных ARB-Silva. [8] на основе рибосомальной РНК или мультипротеинового подхода. Разгадать филогению этого класса бактерий до сих пор очень сложно. [9]

Следующая молекулярная филогения гаммапротеобактерий . основана на наборе из 356 семейств белков

Филогения гаммапротеобактерий

Бетапротеобактерии

Гаммапротеобактерии
Филогения гаммапротеобактерий после [10] Не все отряды монофилетичны, поэтому для Pseudomonadales, Oceanospirillales и Alteromonadales показаны семейства или роды. В случае одноэлементных порядков указывается род. (В бактериальной систематике отряды имеют суффикс -ales, а семейства - -aceae.)

Ряд родов гаммапротеобактерий еще не отнесены к отряду или семейству. К ним относятся Alkalimonas , Gallaecimonas , Ignatzschineria , Litorivivens , Marinicella , Plasticicumulans , Pseudohongiella , Sedimenticola , Thiohalobacter , Thiohalorhabdus , Thiolapillus и Wohlfahrtiimonas . [11]

Значение и применение

[ редактировать ]

Гаммапротеобактерии , особенно отряды Alteromonadales и Vibrionales , играют основополагающую роль в морских и прибрежных экосистемах, поскольку они являются основными группами, участвующими в круговороте питательных веществ. [12] Несмотря на свою известность как патогены, они находят применение в огромном количестве областей, таких как биоремедиация и биосинтез.

Гаммапротеобактерии могут быть использованы в качестве микробного топливного элемента (МТЭ). [13] элемент, который применяет их способность диссимилировать различные металлы. [14] Произведенную энергию можно собирать с помощью одной из наиболее экологически чистых и устойчивых систем производства энергии. [15] Они также используются в качестве биологических фильтров метана. [16]

Фототрофные пурпурные серобактерии используются в процессах очистки сточных вод . [17] Способность некоторых гаммапротеобактерий (например, рода Alcanivorax [18] ) биоремедиации нефти становится все более важным для разложения сырой нефти после разливов нефти. [19] Некоторые виды семейства Chromatiaceae примечательны тем, что могут участвовать в производстве витамина B12 . [20] Некоторые гаммапротеобактерии используются для синтеза поли-b-гидроксиалканоата (ПГА). [21] Это полимер, который используется в производстве биоразлагаемых пластмасс . Многие виды гаммапротеобактерий способны генерировать вторичные метаболиты с антибактериальными свойствами. [22]

Экология

[ редактировать ]

Гаммапротеобактерии широко распространены и многочисленны в различных экосистемах, таких как почва, пресноводные озера и реки, океаны и соленые озера. Например, они составляют около 6–20% (в среднем 14%) бактериопланктона в разных океанах. [23] Они распространены по всему миру как в глубоководных, так и в прибрежных отложениях. [24] В морской воде состав бактериального сообщества может определяться такими параметрами окружающей среды, как наличие фосфора, общий органический углерод, соленость и pH. [25] В почве более высокий уровень pH коррелирует с более высокой относительной численностью альфапротеобактерий , бетапротеобактерий и гаммапротеобактерий . [26] Относительная численность бетапротеобактерий и гаммапротеобактерий также положительно коррелирует с концентрацией растворенного органического углерода (DOC), которая является ключевым параметром окружающей среды, определяющим состав бактериального сообщества. [27] Гаммапротеобактерии также играют ключевую роль в темновой фиксации углерода в прибрежных отложениях, которые являются крупнейшим поглотителем углерода на Земле, и большинство этих бактерий еще не культивировались. [28] Глубоководная гидротермальная система — одна из самых экстремальных сред на Земле. Почти все жерло-эндемичные животные тесно связаны с первичной продукцией эндо- и/или эписимбиотических хемоавтотрофных микроорганизмов. [29] Анализ как симбиотических, так и свободноживущих микробных сообществ в различных глубоководных гидротермальных средах выявил преобладание в биомассе представителей гаммапротеобактерий . [30]

Гаммапротеобактерии обладают широким разнообразием, метаболической универсальностью и функциональной избыточностью в гидротермальных отложениях и отвечают за важный круговорот органического углерода, а также процессы круговорота азота и серы. [31] Бескислородные гидротермальные жидкости содержат несколько восстановленных соединений, таких как H 2 , CH 4 и восстановленные ионы металлов в дополнение к H 2 S. Хемоавтотрофы, которые окисляют сероводород и восстанавливают кислород, потенциально поддерживают первичную продукцию в этих уникальных экосистемах. [32] В последние десятилетия было обнаружено, что отряды, принадлежащие к гаммапротеобактериям , таким как Pseudomonas , Moraxella , способны разлагать различные типы пластика, и эти микробы могут играть ключевую роль в биодеградации пластика. [33]

Метаболизм

[ редактировать ]

Гаммапротеобактерии метаболически разнообразны и используют множество доноров электронов для дыхания и биосинтеза.

Некоторые группы являются нитрит-окислителями. [34] и окислители аммиака, такие как представители Nitrosococcus (за исключением Nitrosococcus mobilis ), а также облигатные галофильные бактерии . [35]

Другие представляют собой хемоавтотрофные окислители серы, такие как Thiotrichales , которые встречаются в таких сообществах, как нитчатые микробные биопленки в мелководном газовом жерле Тор-Калдара в Тирренском море . [36] Более того, благодаря анализу гена 16S рРНК Gammaporteobacteria были обнаружены различные окислители сульфидов в классе , и наиболее важными среди них являются Beggiatoa , Thioploca и Thiomargarita ; кроме того, в богатых органикой прибрежных отложениях сероводород в больших количествах вырабатывается сульфатредуцирующими бактериями. [37]

Морские гаммапротеобактерии включают аэробные аноксигенные фототрофные бактерии (ААР), которые используют бактериохлорофилл для поддержки цепи переноса электронов . Считается, что они представляют собой широко распространенное и важное сообщество в океанах. [38]

Метанотрофы , такие как отряд Mmethylococcales , метаболизируют метан как единственный источник энергии и играют очень важную роль в глобальном углеродном цикле . Они встречаются на любом участке с источниками метана, такими как запасы газа , почвы и сточные воды . [39]

Пурпурные серобактерии — аноксигенные фототрофы, окисляющие серу. [40] но потенциально также и другие субстраты, такие как железо. [41] Они представлены представителями двух семейств Chromatiaceae (например, Allochromatium , Chromatium , Thiodicyton ) и Ectothiorhodospiraceae (например, Ectothiorhodospira ). [40] Несколько видов рода Thermomonas (отряд Lysobacter ) осуществляют такой же метаболизм. [42]

Многие роды представляют собой облигатные или универсальные углеводородкласты . Облигатные гидрокарбонатокластические бактерии (OHCB) используют в качестве источника углерода почти исключительно углеводороды; до сих пор их находили только в морской среде. Примеры включают Alcanivorax , Oleiphilus , Oleispira , Thalassolitus , Cycloclasticus и Neptunomonas , а также некоторые виды Polycyclvorans , Algiphilus (отряд Xanthomonadales ) и Porticoccuscarbonoclasticus (отряд Cellvibrionales ), которые были выделены из фитопланктона. Напротив, аэробные «универсальные» деградаторы углеводородов могут использовать как углеводороды, так и неуглеводородные субстраты в качестве источников углерода и энергии; примеры встречаются в родах Acinetobacter , Colwellia , Glaciecola , Halomonas , Marinobacter , Marinomonas , Mmethylomonas , Pseudoalteromonas , Pseudomonas , Rhodanobacter , Shewanella , Stenotropomonas и Vibrio . [43]

Наиболее распространенным путем фиксации углерода среди гаммапротеобактерий является цикл Кальвина-Бенсона-Бэсшама (CBB) , хотя меньшинство может использовать цикл rTCA . [44] Thioflavicoccus mobilis (свободноживущий вид) и Candidatus Endoriftia persephone (симбионт гигантского трубчатого червя Riftia pachyptila ) могут использовать цикл rTCA в дополнение к циклу CBB и могут экспрессировать эти два разных пути одновременно. [45]

Симбиоз

[ редактировать ]

Симбиоз – это тесное и длительное биологическое взаимодействие двух разных биологических организмов. Большое количество гаммапротеобактерий способны вступать в тесный эндосимбиоз с различными видами. Доказательства этого можно найти в самых разных экологических нишах: на земле, [46] [47] внутри растений, [48] или глубоко на дне океана. [49] Сообщалось, что на суше Gammaproteobacteria. были выделены виды из Robinia pseudoacacia [50] и другие растения, [51] [52] в то время как в глубоком море в трубе гидротермального жерла была обнаружена гаммапротеобактерия, окисляющая серу; [53] вступая в симбиотические отношения в глубоководных районах, сероокисляющие хемолитотрофные микробы получают дополнительные органические углеводороды в гидротермальных экосистемах. Некоторые гаммапротеобактерии симбиотичны с животными, обитающими в геотермических океанских жерлах. [54] и, кроме того, гаммапротеобактерии могут иметь сложные взаимоотношения с другими видами, обитающими вокруг термальных источников. [55] например, с креветкой Rimicaris exoculata, обитающей в гидротермальных источниках Срединно -Атлантического хребта .

Что касается эндосимбионтов, то у большинства из них отсутствуют многие семейные характеристики из-за значительной редукции генома. [56] [57]

Патогены

[ редактировать ]

Гаммапротеобактерии включают несколько важных с медицинской и научной точки зрения групп бактерий, таких как семейства Enterobacteriaceae , Vibrionaceae и Pseudomonadaceae . К этому классу принадлежит ряд патогенов человека, в том числе Yersinia pestis , Vibrio cholerae , Pseudomonas aeruginosa , Escherichia coli и некоторые виды сальмонелл . Класс также содержит патогены растений, такие как Xanthomonas axonopodis pv. citri ( рак цитрусовых ), Pseudomonas syringae pv. actinidiae ( вспышка Psa на киви ) и Xylella fastidiosa . В морской среде несколько видов этого класса могут инфицировать различные морские организмы, например, виды рода Vibrio, поражающие рыб, креветок, кораллов или устриц. [58] и виды сальмонеллы , поражающие серых тюленей ( Halichoerus grypus ). [59] [60]

См. также

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Гаррити ГМ, Белл Дж.А., Лилберн Т.Г. (2005). Класс III. Класс гаммапротеобактерий. ноябрь В: Бреннер Д.Д., Криг Н.Р., Стейли Дж.Т., Гаррити Г.М. (ред.) Руководство Берджи по систематической бактериологии, 2-е изд., том. 2 Спрингер: Нью-Йорк, стр. 1.
  2. ^ Т. Гутьеррес - 2019 - Институт машиностроения, технологического и энергетического машиностроения, Школа инженерных и физических наук, Университет Хериот-Ватт, Эдинбург, Великобритания
  3. ^ Шульц Х.Н., Бринкхофф Т., Фердельман Т.Г., Марине М.Х., Теске А., Йоргенсен Б.Б. (апрель 1999 г.). «Плотные популяции гигантской серной бактерии в отложениях шельфа Намибии». Наука . 284 (5413): 493–5. Бибкод : 1999Sci...284..493S . дои : 10.1126/science.284.5413.493 . ПМИД   10205058 .
  4. ^ Уильямс К.П., Гиллеспи Дж.Дж., Собрал Б.В., Нордберг Е.К., Снайдер Э.Э., Шаллом Дж.М., Дикерман А.В. (май 2010 г.). «Филогения гаммапротеобактерий» . Журнал бактериологии . 192 (9): 2305–14. дои : 10.1128/JB.01480-09 . ПМЦ   2863478 . ПМИД   20207755 .
  5. ^ Манн CB (26 ноября 2019 г.). Морская микробиология: экология и приложения . ЦРК Пресс. ISBN  978-0-429-59236-2 .
  6. ^ «Протеобактерии | Микробиология» . Герой медсестры (учебное пособие). 2016.
  7. ^ Стакебрандт, Э.; Мюррей, RGE; Трупер, Х.Г. (1988). «Proteobacteria classis nov., название филогенетического таксона, включающего «фиолетовые бактерии и их родственники» » . Международный журнал систематической бактериологии . 38 (3): 321–325. дои : 10.1099/00207713-38-3-321 . ISSN   0020-7713 .
  8. ^ «Сильва» . www.arb-silva.de . Проверено 22 ноября 2020 г.
  9. ^ Уильямс К.П., Гиллеспи Дж.Дж., Собрал Б.В., Нордберг Е.К., Снайдер Э.Э., Шаллом Дж.М., Дикерман А.В. (май 2010 г.). «Филогения гаммапротеобактерий» . Журнал бактериологии . 192 (9): 2305–14. дои : 10.1128/JB.01480-09 . ПМЦ   2863478 . ПМИД   20207755 .
  10. ^ Уильямс К.П., Гиллеспи Дж.Дж., Собрал Б.В., Нордберг Е.К., Снайдер Э.Э., Шаллом Дж.М., Дикерман А.В. (май 2010 г.). «Филогения гаммапротеобактерий» . Журнал бактериологии . 192 (9): 2305–14. дои : 10.1128/JB.01480-09 . ПМЦ   2863478 . ПМИД   20207755 .
  11. ^ «Классификация доменов и типов — Иерархическая классификация прокариот (бактерий) — Гаммапротеобактерии » . Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре . Проверено 13 января 2017 г.
  12. ^ Эванс Ф.Ф., Иган С., Кьеллеберг С. (май 2008 г.). «Экология секреции II типа морских гаммапротеобактерий» . Экологическая микробиология . 10 (5): 1101–7. Бибкод : 2008EnvMi..10.1101E . дои : 10.1111/j.1462-2920.2007.01545.x . ПМИД   18218035 .
  13. ^ Цянь Ф., Морс Д.Э. (февраль 2011 г.). «Миниатюризация микробных топливных элементов». Тенденции в биотехнологии . 29 (2): 62–9. дои : 10.1016/j.tibtech.2010.10.003 . ПМИД   21075467 .
  14. ^ Горби Ю.А., Янина С., Маклин Дж.С., Россо К.М., Мойлс Д., Доналкова А. и др. (июль 2006 г.). «Электропроводящие бактериальные нанопроволоки, производимые штаммом Shewanella oneidensis MR-1 и другими микроорганизмами» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (30): 11358–63. Бибкод : 2006PNAS..10311358G . дои : 10.1073/pnas.0604517103 . ПМК   1544091 . ПМИД   16849424 .
  15. ^ Хау Х.Х., Гральник Дж.А. (сентябрь 2007 г.). «Экология и биотехнология рода Shewanella». Ежегодный обзор микробиологии . 61 (1): 237–58. дои : 10.1146/annurev.micro.61.080706.093257 . ПМИД   18035608 .
  16. ^ Розенберг Э., Делонг Э.Ф., Лори Э.Ф., Стакебрандт Э., Эрко Т., Томпсон Ф., ред. (2014). Прокариоты: гаммапротеобактерии (4-е изд.). Берлин Гейдельберг: Springer-Verlag. п. 434. ИСБН  978-3-642-38921-4 .
  17. ^ Кобаяши М., Мичихару Т., Чан Ю.Т. (1 августа 1973 г.). «Очистка растворов промышленных отходов и получение полезных побочных продуктов фотосинтетическим бактериальным методом» . Исследования воды . 7 (8): 1219–1224. Бибкод : 1973WatRe...7.1219K . дои : 10.1016/0043-1354(73)90075-4 . ISSN   0043-1354 .
  18. ^ Хараяма С., Кишира Х., Касаи Ю., Шуцубо К. (август 1999 г.). «Биодеградация нефти в морской среде» . Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . 1 (1): 63–70. ПМИД   10941786 .
  19. ^ Касаи Ю., Кишира Х., Сюцубо К., Хараяма С. (апрель 2001 г.). «Молекулярное обнаружение популяций морских бактерий на пляжах, загрязненных в результате аварии танкера «Находка»» . Экологическая микробиология . 3 (4): 246–55. Бибкод : 2001EnvMi...3..246K . дои : 10.1046/j.1462-2920.2001.00185.x . ПМИД   11359510 .
  20. ^ Коппенгаген В.Б., Шлингманн Г., Шаер В., Дресов. Му-Янг М., Везина С., Сингх К. (ред.). «Внеклеточные метаболиты фототрофных бактерий как возможные промежуточные продукты биосинтеза витамина B12». Продукты ферментации . Пергам: 247–252. ISBN  978-0-08-025385-5 .
  21. ^ де ла Хаба Р.Р., Санчес-Порро К., Маркес М.К., Вентоса А. (апрель 2010 г.). «Таксономическое исследование рода Salinicola: перевод Halomonas salaria и Chromohalobacter salarius в род Salinicola как Salinicola salarius com. nov. и Salinicola halophilus nom. nov. соответственно». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 60 (Часть 4): 963–971. дои : 10.1099/ijs.0.014480-0 . ПМИД   19661506 .
  22. ^ «Морские бактерии, связанные с морскими макроорганизмами: потенциальные противомикробные ресурсы - AMiner» . www.aminer.org . Проверено 20 ноября 2020 г.
  23. ^ Бросат М., Наке Х., Блази Р., Сибе С., Хюбнер Дж., Дэниел Р., Громанн Э. 2014. Орошение сточными водами увеличивает численность потенциально вредных гаммапротеобактерий в почвах в долине Мескиталь, Мексика. Appl Environ Microbiol.
  24. ^ Бьенхольд С., Зингер Л., Боэций А., Раметт А. (27 января 2016 г.). «Разнообразие и биогеография батиальных и абиссальных бактерий морского дна» . ПЛОС ОДИН . 11 (1): e0148016. Бибкод : 2016PLoSO..1148016B . дои : 10.1371/journal.pone.0148016 . ПМЦ   4731391 . ПМИД   26814838 .
  25. ^ Цзян Х, Донг Х, Цзи С, Е Ю, Ву Н (26 сентября 2007 г.). «Микробное разнообразие в глубоководных морских отложениях бассейна Цюндоннань в Южно-Китайском море». Геомикробиологический журнал . 24 (6): 505–517. Бибкод : 2007GmbJ...24..505J . дои : 10.1080/01490450701572473 . S2CID   130552094 .
  26. ^ Руск Дж., Боат Э., Брукс П.С., Лаубер К.Л., Лозупоне С., Капорасо Дж.Г., Найт Р., Фиерер Н. (октябрь 2010 г.). «Почвенные бактериальные и грибковые сообщества в зависимости от градиента pH в пахотной почве» . Журнал ISME . 4 (10): 1340–51. Бибкод : 2010ISMEJ...4.1340R . дои : 10.1038/ismej.2010.58 . ПМИД   20445636 . S2CID   205156612 .
  27. ^ Ли Д., Шарп Д.О., Сайкали П.Е., Али С., Алидина М., Аларави М.С., Келлер С., Хоппе-Джонс С., Древес Дж.Е. (октябрь 2012 г.). «Растворенный органический углерод влияет на состав и разнообразие микробного сообщества в управляемых системах пополнения водоносных горизонтов» . Прикладная и экологическая микробиология . 78 (19): 6819–28. Бибкод : 2012ApEnM..78.6819L . дои : 10.1128/АЕМ.01223-12 . ПМЦ   3457517 . ПМИД   22798375 .
  28. ^ Хеджес Дж.И., Кейл Р.Г. (апрель 1995 г.). «Сохранение осадочного органического вещества: оценка и умозрительный синтез». Морская химия . 49 (2–3): 81–115. Бибкод : 1995Март..49...81H . дои : 10.1016/0304-4203(95)00008-F .
  29. ^ Жантон С. (февраль 2000 г.). «Молекулярная экология микробных сообществ гидротермальных источников». Антони ван Левенгук . 77 (2): 117–33. дои : 10.1023/а:1002463825025 . ПМИД   10768471 . S2CID   24324674 .
  30. ^ Стюарт Ф.Дж., Ньютон, Иллинойс, Кавано К.М. (сентябрь 2005 г.). «Хемосинтетические эндосимбиозы: адаптации к кислородно-бескислородным интерфейсам». Тенденции в микробиологии . 13 (9): 439–48. дои : 10.1016/j.tim.2005.07.007 . ПМИД   16054816 .
  31. ^ Бейкер Б.Дж., Лазар К.С., Теске А.П., Дик Г.Дж. (2015). «Геномное разрешение связей в круговороте углерода, азота и серы среди широко распространенных бактерий эстуарных отложений» . Микробиом . 3 : 14. дои : 10.1186/s40168-015-0077-6 . ПМК   4411801 . ПМИД   25922666 .
  32. ^ Яннаш, HW, и Моттл, MJ (1985). Геомикробиология глубоководных гидротермальных источников. Наука 229, 717–725
  33. ^ soixanteseize (06 января 2015 г.). «Исследуйте, чтобы понять, поделитесь, чтобы добиться перемен» . Фонд Тара Океан . Проверено 22 ноября 2020 г.
  34. ^ Хан С, Ли X, Луо X, Вэнь С, Чен В, Хуан Ц (2018). «На состав и разнообразие сообщества нитрит-окисляющих бактерий влияют режимы внесения удобрений, но они не зависят от почвенного агрегата в кислой субтропической красной почве» . Границы микробиологии . 9 : 885. дои : 10.3389/fmicb.2018.00885 . ПМК   5951965 . ПМИД   29867799 .
  35. ^ Сезар Мота, Дженнифер Риденур, Цзяян Ченг, Фрэнсис Л. де лос Рейес, Высокие уровни нитрифицирующих бактерий в реакторах с периодической аэрацией, очищающих сточные воды с высоким содержанием аммиака. FEMS Микробиология Экология, том 54, выпуск 3, ноябрь 2005 г., стр. 391–400.
  36. ^ Патвардхан С., Фустукос Д.И., Джованнелли Д., Юсель М., Ветриани С. (2018). «Гаммапротеобактерии при колонизации мелководного газоисточника» . Границы микробиологии . 9 : 2970. дои : 10.3389/fmicb.2018.02970 . ПМК   6291522 . ПМИД   30574130 .
  37. ^ Сабина Ленк, Джулия Арндс, Катрис Зерятке, Никулина Мусат, Рудольф Аманн и Марк Муссман * Институт морской микробиологии Макса Планка, Celsiusstraße 1, 28359 Бремен, Германия. Новые группы гаммапротеобактерий катализируют окисление серы и фиксацию углерода в прибрежных приливных отложениях. (2011)
  38. ^ Чо Дж.К., Стейпелс М.Д., Моррис Р.М., Вергин К.Л., Швальбах М.С., Гиван С.А. и др. (июнь 2007 г.). «Гены полифилетических фотосинтетических реакционных центров олиготрофных морских гаммапротеобактерий» . Экологическая микробиология . 9 (6): 1456–63. Бибкод : 2007EnvMi...9.1456C . дои : 10.1111/j.1462-2920.2007.01264.x . ПМИД   17504483 .
  39. ^ Ората Ф.Д., Мейер-Колтхофф Дж.П., Соважо Д., Стейн Л.Ю. (2018). «Метилококковые клетки) призывает к реклассификации членов на уровне рода и вида» . Границы микробиологии . 9 : 3162. дои : 10.3389/fmicb.2018.03162 . ПМК   6315193 . ПМИД   30631317 .
  40. ^ Перейти обратно: а б Мэдиган, Майкл Т.; Юнг, Дебора О. (2009). «Обзор фиолетовых бактерий: систематика, физиология и среда обитания». В К. Ниле Хантере; Февзи Далдал; Мэрион К. Турнауэр; Дж. Томас Битти (ред.). Пурпурные фототропные бактерии . Достижения в области фотосинтеза и дыхания, том. 28. Спрингер. стр. 1–15. дои : 10.1007/978-1-4020-8815-5_1 . ISBN  978-1-4020-8814-8 . ОЛ   25552439М .
  41. ^ Брайс С., Блэквелл Н., Шмидт С., Отте Дж., Хуанг Ю.М., Кляйндиенст С. и др. (октябрь 2018 г.). «Микробное анаэробное окисление Fe(II) - Экология, механизмы и последствия для окружающей среды» . Экологическая микробиология . 20 (10): 3462–3483. Бибкод : 2018EnvMi..20.3462B . дои : 10.1111/1462-2920.14328 . ПМИД   30058270 . S2CID   51865641 .
  42. ^ Сабрина Хедрич, Майкл Шломанн и Д. Барри Джонсон. Железоокисляющие протеобактерии. Школа биологических наук, Колледж естественных наук, Бангорский университет, Дейниол-роуд, Бангор LL57 2UW, Великобритания 2 Междисциплинарный экологический центр, TU Bergakademie Freiberg, Leipziger Strasse 29, 09599 Фрайберг, Германия. (2011)
  43. ^ Терри Дж. МакГенити, Таксономия, геномика и экофизиология микробов, разлагающих углеводороды, 2019 143-152; 181-189; 191-205.
  44. ^ Маркерт С., Арндт С., Фелбек Х., Бехер Д., Зиверт С.М., Хюглер М. и др. (январь 2007 г.). «Физиологическая протеомика некультивируемого эндосимбионта Riftia pachyptila» . Наука . 315 (5809): 247–50. Бибкод : 2007Sci...315..247M . дои : 10.1126/science.1132913 . HDL : 1912/1514 . ПМИД   17218528 . S2CID   45745396 .
  45. ^ Рубин-Блюм М., Дюбилье Н., Кляйнер М. (январь 2019 г.). «Генетические данные о двух путях фиксации углерода (цикл Кальвина-Бенсона-Бэсшема и обратный цикл трикарбоновых кислот) у симбиотических и свободноживущих бактерий» . мСфера . 4 (1). дои : 10.1128/mSphere.00394-18 . ПМК   6315080 . ПМИД   30602523 .
  46. ^ Карамипур Н., Фатипур И., Мехрабади М. (сентябрь 2016 г.). «Гаммапротеобактерии как важные первичные симбионты полосатого щитовника Graphosoma Lineatum (Hemiptera: Pentatomidae)» . Научные отчеты . 6 (1): 33168. Бибкод : 2016НатСР...633168К . дои : 10.1038/srep33168 . ПМК   5016839 . ПМИД   27609055 .
  47. ^ Кикучи Ю., Хосокава Т., Нико Н., Фукацу Т. (февраль 2012 г.). «Кишечные симбиотические бактерии капустных клопов Eurydema Rugosa и Eurydema dominulus (Heteroptera: Pentatomidae)». Прикладная энтомология и зоология . 47 (1): 1–8. Бибкод : 2012AppEZ..47....1K . дои : 10.1007/s13355-011-0081-7 . S2CID   14943700 .
  48. ^ Танненбаум И., Каур Дж., Манн Р., Собридж Т., Родони Б., Спангенберг Г. (август 2020 г.). «Профилирование микробиома Lolium perenne: от семени к семени» . Журнал «Фитобиомы» . 4 (3): 281–9. doi : 10.1094/PBIOMES-03-20-0026-R .
  49. ^ Брейзинг С., Шульц Д.Т., Судек С., Уорден А.З., Янг Ч.Р. (сентябрь 2020 г.). «Высоконепрерывная сборка генома хемосинтезирующего гаммапротеобактериального эндосимбионта трубчатого червя холодного просачивания Lamellibrachia barhami» . Ресурсы молекулярной экологии . 20 (5): 1432–44. дои : 10.1111/1755-0998.13220 . ПМЦ   7540712 .
  50. ^ Сираиси А., Мацусита Н., Хогецу Т. (август 2010 г.). «Нудуляция черной саранчи Gammaproteobacteria Pseudomonas sp. и Betaproteobacteria Burkholderia sp». Систематическая и прикладная микробиология . 33 (5): 269–74. дои : 10.1016/j.syapm.2010.04.005 . ПМИД   20542651 .
  51. ^ Гош ПК, Де ТК, Маити ТК (01 апреля 2015 г.). «Продуцирование аскорбиновой кислоты в корне, клубеньке и видах Enterobacter (Gammaproteobacteria), выделенных из корневых клубеньков бобовых Abrus precatorius L.». Биокатализ и сельскохозяйственная биотехнология . 4 (2): 127–134. дои : 10.1016/j.bcab.2014.11.006 .
  52. ^ Бениция Ю, Бениция Х, Бенгедуар А, Муресу Р, Джакомини А, Сквартини А (август 2004 г.). «Гамма-протеобактерии способны образовывать клубеньки на бобовых растениях рода Hedysarum» Систематическая и прикладная микробиология . 27 (4): 462–8. дои : 10.1078/0723202041438527 . ПМИД   15368852 .
  53. ^ Нунура Т., Такаки Ю., Казама Х., Какута Дж., Симамура С., Макита Х. и др. (18 августа 2014 г.). «Физиологические и геномные особенности новой сероокисляющей гаммапротеобактерии, принадлежащей к ранее некультивируемой симбиотической линии, выделенной из гидротермального источника» . ПЛОС ОДИН . 9 (8): e104959. Бибкод : 2014PLoSO...9j4959N . дои : 10.1371/journal.pone.0104959 . ПМЦ   4136832 . ПМИД   25133584 .
  54. ^ Холт-младший (6 февраля 2013 г.). «Описание типа гаммапротеобактерий» . Университет Саскуэханна — Веб-сайт курса систематической биологии . Проверено 17 апреля 2018 г.
  55. ^ Петерсен Дж. М., Раметт А., Лотт С., Камбон-Бонавита М.А., Збинден М., Дюбилье Н. (август 2010 г.). «Двойной симбиоз жерловой креветки Rimicaris exoculata с нитчатыми гамма- и эпсилонпротеобактериями на четырех гидротермальных полях Срединно-Атлантического хребта» . Экологическая микробиология . 12 (8): 2204–18. Бибкод : 2010EnvMi..12.2204P . дои : 10.1111/j.1462-2920.2009.02129.x . hdl : 21.11116/0000-0001-CADC-4 . ПМИД   21966914 .
  56. ^ Сигенобу С., Ватанабэ Х., Хаттори М., Сакаки Ю., Исикава Х. (сентябрь 2000 г.). «Последовательность генома внутриклеточного бактериального симбионта тли Buchnera sp. APS» . Природа . 407 (6800): 81–6. Бибкод : 2000Natur.407...81S . дои : 10.1038/35024074 . ПМИД   10993077 . S2CID   4405072 .
  57. ^ Берк Г.Р., Моран Н.А. (2011). «Массовый распад генома Serratia symbiotica, недавно появившегося симбионта тли» . Геномная биология и эволюция . 3 : 195–208. дои : 10.1093/gbe/evr002 . ПМК   3056288 . ПМИД   21266540 .
  58. ^ Эванс Ф.Ф., Иган С., Кьеллеберг С. (май 2008 г.). «Экология секреции II типа морских гаммапротеобактерий» . Экологическая микробиология . 10 (5): 1101–7. Бибкод : 2008EnvMi..10.1101E . дои : 10.1111/j.1462-2920.2007.01545.x . ПМИД   18218035 .
  59. ^ Бэйли Дж.Л., Фостер Дж., Браун Д., Дэвисон Н.Дж., Койа Дж.Э., Уотсон Э. и др. (март 2016 г.). «Сальмонеллезная инфекция у серых тюленей (Halichoerus grypus), сторожевого вида морских млекопитающих: патогенность и молекулярное типирование штаммов сальмонеллы по сравнению с изолятами человека и домашнего скота» . Экологическая микробиология . 18 (3): 1078–87. Бибкод : 2016EnvMi..18.1078B . дои : 10.1111/1462-2920.13219 . ПМИД   26768299 .
  60. ^ Дэниэлс Н.А., Маккиннон Л., Бишоп Р., Альтекрус С., Рэй Б., Хаммонд Р.М., Томпсон С., Уилсон С., Бин Н.Х., Гриффин П.М., Слуцкер Л. (май 2000 г.). «Инфекции Vibrio parahaemolyticus в США, 1973–1998 гг.» . Журнал инфекционных болезней . 181 (5): 1661–6. дои : 10.1086/315459 . ПМИД   10823766 .
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Gammaproteobacteria&oldid=1230564794"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: b578b31bf7d5b8e95ca459216bf85d7d__1719136980
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/b5/7d/b578b31bf7d5b8e95ca459216bf85d7d.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Gammaproteobacteria - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)