Протопорфириноген оксидаза

показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Протопорфириноген оксидаза
Протопорфириноген оксидаза
	Синтез гема - рассчитывайте, что некоторые реакции происходят в цитоплазме , а некоторые в митохондрионе (желтый)
Идентификаторы
ЕС №.	1.3.3.4
CAS №.	53986-32-6
Базы данных
Intenz	Intenz View
Бренда	Бренда вход
Расширение	Вид Nicezyme
Кегг	Кегг вход
Метатический	Метаболический путь
Напрямую	профиль
PDB Структуры	RCSB PDB PDBE PDBSUM
Джин Онтология	Друг / Quickgo
PMC
показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

PPOPE
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	3NKS, 4IVM, 4IVO
Идентификаторы
Псевдонимы	PPOPES , PPO, V290M, VP, протопорфириногенсидаза
Внешние идентификаторы	Омим : 600923 ; MGI : 104968 ; Гомологен : 262 ; GeneCards : PPOPS ; OMA : PPOX - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	161,178,013 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	171,108,760 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	right uterine tube; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; epithelium of bronchus; ; right hemisphere of cerebellum; ; bronchial epithelial cell; ; left ovary; ; anterior pituitary; ; right ovary; ; granulocyte; ; canal of the cervix;
	Top expressed in
	fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; granulocyte; ; neural layer of retina; ; tibiofemoral joint; ; human fetus; ; right kidney; ; saccule; ; yolk sac; ; genital tubercle; ; neural tube;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	flavin adenine dinucleotide binding; oxidoreductase activity; oxygen-dependent protoporphyrinogen oxidase activity;
Cellular component	mitochondrial inner membrane; mitochondrial intermembrane space; intrinsic component of mitochondrial inner membrane; membrane; mitochondrion; integral component of mitochondrial inner membrane; mitochondrial membranes;
Biological process	heme biosynthetic process; protoporphyrinogen IX metabolic process; protoporphyrinogen IX biosynthetic process; porphyrin-containing compound biosynthetic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5498
	19044
	ENSG00000143224
	Ensmusg00000062729
	P50336
	P51175
showNM_000309 ; NM_001122764 ; NM_001350128 ; NM_001350129 ; NM_001350130 ;
	NM_001350131; NM_001365398; NM_001365399; NM_001365400; NM_001365401
	NM_008911
showNP_000300 ; NP_001116236 ; NP_001337057 ; NP_001337058 ; NP_001337059 ;
	NP_001337060
	NP_032937
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Протопорфириноген оксидаза или протокс - это фермент , который у людей кодируется PPOX геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Протопорфириногенсидаза отвечает за седьмой шаг в биосинтезе протопорфирина IX . Этот порфирин является предшественником гемоглобина , кислородного носителя у животных и хлорофилла , красителя в растениях. Фермент катализирует дегидрирование (удаление атомов водорода ) протопорфириногена IX (продукт шестого этапа в производстве гема) с образованием протопорфирина IX. Один дополнительный фермент должен изменить протопорфирин IX, прежде чем он станет гемом. Ингибирование этого фермента является стратегией, используемой в определенных гербицидах .

Ген

Ген PPOX расположен на длинной (Q) руке хромосомы 1 в положении 22, от пары оснований 157 949 266 до пары оснований 157 954,082.

Функция

Этот ген кодирует предпоследний фермент биосинтеза гема, который катализирует 6-электрическое окисление протопорфириногена IX с образованием протопорфирина IX . Этот белок представляет собой флавопротеин, связанный с внешней поверхностью внутренней митохондриальной мембраны . ^{[ 7 ]}

Гем биосинтетический путь

Следующие гены кодируют ферменты, которые катализируют различные этапы в пути биосинтеза гема :

Алад : Аминолевулинат, Дельта, дегидратаза
ALAS1 : Aminolevulinate, Delta-, Synthase 1
ALAS2 : Aminolevulinate, Delta-, Synthase 2 (Sideroblastic/Hypochromic Anemia)
CPOPES : копропорфириногенсидаза
FECH : Ferrochelatase (протопорфирия)
HMBS : гидроксиметилбилановая синтаза
PPOPES : протопорфириноген оксидаза
Urod : уропорфириноген декарбоксилаза
Uros : Uroporphyrinogen III -синтаза (врожденная эритропоэтическая порфирия)

Клиническое значение

Variegate Porphyria вызвана мутациями в гене PPOX. Более 100 мутаций, которые могут привести к тому, что в гене PPOX было идентифицировано варигская порфирия. Одна мутация, замена аминокислотного триптофана на аргинин в позиции 59 (также написанном как Arg59trp или R59W), обнаруживается примерно в 95 процентах семей южноафриканских семей с порфирией Variegate. Мутации в гене PPOX снижают активность фермента, изготовленного геном, позволяя побочным продуктам выработки гема накапливаться в организме. Это наращивание в сочетании с негенетическими факторами (такими как определенные лекарства, алкоголь и диету), вызывает этот тип порфирии.

Ингибиторы как гербициды

Ингибирование протопорфириногеносцидазы является механизмом действия для нескольких коммерческих гербицидов, включая нитрофениловые эфиры ацифлуорфен и фомезафен и пиримидинион, бутафенацил и сафлуфенацил . Видимыми симптомами лечения являются хлороз и высыхание . Повреждение вызвано накоплением протопорфирина IX в растительных клетках путем ингибирования протокса в пути биосинтеза тетрапиррола . ^{[ 8 ]} Это мощный фотосенсибилизатор , который активирует кислород, что приводит к перекисному окислению липидов . Для этого процесса необходимы как свет, так и кислород. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Смотрите также

Порфирин

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000143224 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000062729 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Такетани С., Иназава Дж., Абэ Т, Фурукава Т., Кохо Х., Токунага Р. и др. (Октябрь 1995). «Ген протопорфириногена оксидазы человека (PPOPS): организация и местоположение в хромосоме 1». Геномика . 29 (3): 698–703. doi : 10.1006/geno.1995.9949 . PMID 8575762 .
^ Фрэнк Дж., МакГрат Дж. А., По-Фитцпатрик М.Б., Хоук Дж.Л., Кристиан А.М. (июль 1999 г.). «Мутации в кодоне инициации трансляции гена протопорфириногена оксидазы лежат в основе виризации порфирии». Клиническая и экспериментальная дерматология . 24 (4): 296–301. doi : 10.1046/j.1365-2230.1999.00484.x . PMID 10457135 . S2CID 40509390 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: протопорфириногеновая оксидаза PPOX» .
^ Brzezowski P, KSAS B, Havaux M, Grimm B, Chazaux M, Peltier G, et al. (2019-05-03). «Функция протопорфириногена IX оксидазы в биосинтезе хлорофилла требует окисленного пластохинона в Chlamydomonas inerhardtii » . Биология связи . 2 (1): 159. DOI : 10.1038/S42003-019-0395-5 . PMC 6499784 . PMID 31069268 .
^ Dayan FE, Reddy KN, Duke SO (1999). «Структурно-активность взаимосвязи дифениловых эфиров и других мостиковых ингибиторов протопорфириногеновой оксидазы кислорода». Пероксидизирующие гербициды . С. 141–161. doi : 10.1007/978-3-642-58633-0_5 . ISBN 978-3-642-63674-5 .
^ Нагано Е. (1999). «Гербицидная эффективность ингибиторов протопорфириногена оксидазы». Пероксидизирующие гербициды . С. 293–302. doi : 10.1007/978-3-642-58633-0_11 . ISBN 978-3-642-63674-5 .
^ Dayan Fe, Duke SO (2010). «Протопорфириногеновая оксидаза, ингибирующие гербициды». Справочник Хейса о токсикологии пестицидов . С. 1733–1751. doi : 10.1016/b978-0-12-374367-1.00081-1 . ISBN 9780123743671 .

Дальнейшее чтение

Старейшина Г.Х. (1998). «Генетические дефекты в порфириях: типы и значимость». Клиники в дерматологии . 16 (2): 225–33. doi : 10.1016/s0738-081x (97) 00202-2 . PMID 9554235 .
Maneli MH, Corrigall AV, Klump HH, Davids LM, Kirsch RE, Meissner PN (август 2003 г.). «Кинетическая и физическая характеристика рекомбинантных диких и мутантных протопорфириногеновых оксидаз человека». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - белки и протеомика . 1650 (1–2): 10–21. doi : 10.1016/s1570-9639 (03) 00186-9 . PMID 12922165 .
Морган Р.Р., Эррингтон Р., Старейшина Г.Х. (январь 2004 г.). «Идентификация последовательностей, необходимых для импорта протопорфириногеноссоцидазы человека в митохондрии» . Биохимический журнал . 377 (Pt 2): 281–7. doi : 10.1042/bj20030978 . PMC 1223874 . PMID 14535846 .
Sassa S, Kappas A (февраль 2000 г.). «Молекулярные аспекты наследственных порфирий» . Журнал внутренней медицины . 247 (2): 169–78. doi : 10.1046/j.1365-2796.2000.00618.x . PMID 10692079 . S2CID 36820694 .
Нишимура К., Такетани С., Инокучи Х (апрель 1995 г.). «Клонирование человеческой кДНК для протопорфириногена оксидазы путем комплементации in vivo мутанта Hemg of Escherichia coli» . Журнал биологической химии . 270 (14): 8076–80. doi : 10.1074/jbc.270.14.8076 . PMID 7713909 .
Dailey TA, Meissner P, Dailey Ha (январь 1994 г.). «Экспрессия клонированной протопорфириногеноссидазы» . Журнал биологической химии . 269 (2): 813–5. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 42182-x . PMID 8288631 .
Dailey TA, Dailey HA, Meissner P, Prasad AR (декабрь 1995 г.). «Клонирование, последовательность и экспрессия протопорфириногеновой оксидазы мыши». Архивы биохимии и биофизики . 324 (2): 379–84. doi : 10.1006/abbi.1995.0051 . PMID 8554330 .
Meissner PN, Dailey TA, Hift RJ, Ziman M, Corrigall AV, Roberts AG, et al. (Май 1996). «Мутация R59W в протопорфириногеновой оксидазе человека приводит к снижению ферментной активности и распространена у южноафриканцев с варигейской порфирией». Природа генетика . 13 (1): 95–7. doi : 10.1038/ng0596-95 . PMID 8673113 . S2CID 11911664 .
Dailey Ta, Dailey Ha (январь 1996 г.). «Человеческий протопорфириноген оксидаза: экспрессия, очистка и характеристика клонированного фермента» . Белковая наука . 5 (1): 98–105. doi : 10.1002/pro.556005050112 . PMC 2143237 . PMID 8771201 .
Puy H, Robréau AM, Rosipal R, Nordmann Y, Deybach JC (сентябрь 1996 г.). «Протопорфириногенсидаза: полная геномная последовательность и полиморфизмы в гене человека». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 226 (1): 226–30. doi : 10.1006/bbrc.1996.1337 . PMID 8806618 .
Deybach JC, Rorréau AM, LaMoril J, Grandchamp B, Nordmann Y (март 1996 г.). Пациенты . После молекулярной генетики 5 (3): 407–10. doi : 10.1093/hmg/5.3.3.407 . PMID 885267 .
Lam H, Dragan L, Tsou HC, Merk H, Peacocke M, Goerz G, et al. (Январь 1997). «Молекулярная основа Variegate Porphyria: мутация вставки de novo в гене протопорфириногена оксидазы». Человеческая генетика . 99 (1): 126–9. doi : 10.1007/s004390050325 . PMID 9003509 . S2CID 32134586 .
Дейли Ха, Дейли Та (февраль 1997 г.). «Характеристики человеческой протопорфириногенсидазы в контрольной группе и порфириях Variegate». Клеточная и молекулярная биология . 43 (1): 67–73. PMID 9074790 .
Фрэнк Дж., По-Фитцпатрик М.Б., Кинг Ле, Кристиан А.М. (август 1998 г.). «Генетическая основа" Scarsdale Gourmet Diet "Variegate Porphyria: миссенс -мутация в гене протопорфириногена оксидазы». Архивы дерматологических исследований . 290 (8): 441–5. doi : 10.1007/s004030050333 . PMID 9763307 . S2CID 32988570 .
Roberts AG, Puy H, Dailey TA, Morgan RR, Wathley SD, Dailey HA, et al. (Ноябрь 1998). «Молекулярная характеристика гомозиготной порфирии» . Молекулярная генетика человека . 7 (12): 1921–5. doi : 10.1093/hmg/7.12.1921 . PMID 9811936 .
Wathley SD, Puy H, Morgan RR, Robreau AM, Roberts AG, Nordmann Y, et al. (Октябрь 1999). «Variegate Porphyria в Западной Европе: идентификация мутаций гена PPOX в 104 семействах, степень аллельной гетерогенности и отсутствие корреляции между фенотипом и типом мутации» . Американский журнал человеческой генетики . 65 (4): 984–94. doi : 10.1086/302586 . PMC 1288269 . PMID 10486317 .
Suzuki Y, Issihare D, Sasaki M, Shot H, Hata H, These T, et al. (Март 2000 г.). КДНК является либераром. Денеры 64 (3): 286–97. doi : 10.1006/Geno . PMID 10756096 .
Corrigall AV, Hift RJ, Davids LM, Hancock V, Meissner D, Kirsch Re, Meissner PN (апрель 2000 г.). «Гомозиготная порфирия в Южной Африке: генотипический анализ в двух случаях». Молекулярная генетика и метаболизм . 69 (4): 323–30. doi : 10.1006/mgme.2000.2975 . PMID 10870850 .
Kauppinen R, Timonen K, Von und Zu Fraunberg M, Laitinen E, Ahola H, Tenhunen R, et al. (Апрель 2001 г.). «Гомозиготная варигская порфирия: 20 лет наблюдение и характеристика молекулярного дефекта» . Журнал следственной дерматологии . 116 (4): 610–3. Doi : 10.1046/j.1523-1747.2001.01293.x . PMID 11286631 .
Palmer RA, Elder GH, Barrett DF, Keohane SG (апрель 2001 г.). «Гомозиготная варигская порфирия: составная гетерозигота с новыми мутациями в ген -протопорфириногеноксидазе». Британский журнал дерматологии . 144 (4): 866–9. doi : 10.1046/j.1365-2133.2001.04147.x . PMID 11298551 . S2CID 41419729 .
Corrigall AV, Hift RJ, Davids LM, Hancock V, Meissner D, Kirsch Re, Meissner PN (май 2001 г.). «Идентификация первой мутации порфирии варигейской порфирии у коренного чернокожих южноафриканских и дополнительных доказательств неоднородности в порфирии Variegate». Молекулярная генетика и метаболизм . 73 (1): 91–6. doi : 10.1006/mgme.2001.3163 . PMID 11350188 .
Donnelly JG, Donepombe S, Hindmarsh JT (2002). «Одноцепочечный конформационный полиморфизм и диалектный гель-градиент электрофореза при скрининге на порфирию Variegate: идентификация двух новых мутаций». Анналы клинической и лабораторной науки . 32 (2): 107–13. PMID 12017191 .

Внешние ссылки

PDBE-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для человеческого протопорфириногена оксидазы

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000143224 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000062729 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8575762-5] Такетани С., Иназава Дж., Абэ Т, Фурукава Т., Кохо Х., Токунага Р. и др. (Октябрь 1995). «Ген протопорфириногена оксидазы человека (PPOPS): организация и местоположение в хромосоме 1». Геномика . 29 (3): 698–703. doi : 10.1006/geno.1995.9949 . PMID 8575762 .

[pmid10457135-6] Фрэнк Дж., МакГрат Дж. А., По-Фитцпатрик М.Б., Хоук Дж.Л., Кристиан А.М. (июль 1999 г.). «Мутации в кодоне инициации трансляции гена протопорфириногена оксидазы лежат в основе виризации порфирии». Клиническая и экспериментальная дерматология . 24 (4): 296–301. doi : 10.1046/j.1365-2230.1999.00484.x . PMID 10457135 . S2CID 40509390 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: протопорфириногеновая оксидаза PPOX» .

[8] Brzezowski P, KSAS B, Havaux M, Grimm B, Chazaux M, Peltier G, et al. (2019-05-03). «Функция протопорфириногена IX оксидазы в биосинтезе хлорофилла требует окисленного пластохинона в Chlamydomonas inerhardtii » . Биология связи . 2 (1): 159. DOI : 10.1038/S42003-019-0395-5 . PMC 6499784 . PMID 31069268 .

[9] Dayan FE, Reddy KN, Duke SO (1999). «Структурно-активность взаимосвязи дифениловых эфиров и других мостиковых ингибиторов протопорфириногеновой оксидазы кислорода». Пероксидизирующие гербициды . С. 141–161. doi : 10.1007/978-3-642-58633-0_5 . ISBN 978-3-642-63674-5 .

[10] Нагано Е. (1999). «Гербицидная эффективность ингибиторов протопорфириногена оксидазы». Пероксидизирующие гербициды . С. 293–302. doi : 10.1007/978-3-642-58633-0_11 . ISBN 978-3-642-63674-5 .

[11] Dayan Fe, Duke SO (2010). «Протопорфириногеновая оксидаза, ингибирующие гербициды». Справочник Хейса о токсикологии пестицидов . С. 1733–1751. doi : 10.1016/b978-0-12-374367-1.00081-1 . ISBN 9780123743671 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

v Т и Белок клеточной : белки мембраны (кроме рецептора клеточной поверхности , ферментов и цитоскелета )
Арест	Провисание Arrb1 Arrb2 Arr3
Мембранный пропаган и 4а	MS4A1 MS4A2 MS4A3 MS4A4A MS4A4E MS4A5 MS4A6A MS4A6E MS4A7 MS4A8B MS4A9 MS4A10 MS4A12 MS4A13 MS4A14 MS4A15 MS4A18
Миель	Миелин базовый белок PMP2 Миелин протеолипидный белок PLP1 Миелиновый олигодендроцит гликопротеин Миелин, ассоциированный гликопротеин Миелин белок ноль
Легочная поверхностно -активная вещества	Белок B-ассоциированное легочный сурфактант B Легочный поверхностно-активный вещества, ассоциированный белок С
Тетраспан	Tspan1 Tspan2 Tspan3 Tspan4 Tspan5 Tspan6 Tspan7 Tspan8 Tspan9 Tspan10 Tspan11 TSPAN12 Tspan13 Tspan14 TSPA15 Tspan16 Tspan17 Tspan18 Tspan19 Tspan20 Tspan21 Tspan22 Tspan23 Tspan24 Tspan25 Tspan26 Tspan27 Tspan28 Tspan29 Tspan30 Tspan31 Tspan32 Tspan33 Tspan34
Другое/негрупп	Кальнексин Связанный с LDL-рецептор белок белок Нейрофибромин 2 ПРЕДИСИЛИН PSEN1 PSEN2 Hfe Белки переноса фосфолипидов Дисферлин Strc Отоф
См. Также другие нарушения белка клеточной мембраны

v Т и Оксидоредуктазы : CH - ch оксидоредуктазы ( EC 1.3)
1.3.1 : NAD / NADP акцептор	Enoyl-acyl-белок-перевозчик редуктаза / enoyl acp редуктаза 7-дегидрохолестерин редуктаза Биливердин редуктаза 2,4 dienoyl-co reductase Дигидроксиметилоксо-тетрагидрохинолин дегидрогеназа
1.3.3 : кислорода акцептор	Дигидроорусная дегидрогеназа Копропорфириноген оксидаза Протопорфириноген оксидаза Билирубинсидаза Ацил-КоА-оксидаза Дигидроурацил оксидаза Тетрагидроберберин оксидаза Secologanin Synthase Триптофан альфа, бета-оксидаза Пирролохинолин-хинон-синтаза L-галактонолактон оксидаза
1.3.5 : Хинон	Сукцинатная дегидрогеназа SDHA SDHB SDHC SDHD
1.3.99 : Другие акцепторы	Фамарат редуктаза Botyryl-CoA дегидрогеназа Ацил -коадегидрогеназа Acadsb Академический 5α-редуктаза SRD5A1 SRD5A2 SRD5A3 Глютарил-КоА дегидрогеназа Изовалерил коэнзим дегидрогеназа 3-оксо-5бета-стероид 4-дегидрогеназа

v Т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связующий сайт Каталитическая триада Оксинион Хоул Распущенность фермента Ограниченный диффузию фермент Кофактор Ферментный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор фермента Фермент активатор
Классификация	ЕС номер Фермент суперсемейство Семья ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика фермента Eadie -court чайная диаграмма Хейнс -Вулф Участок Lineweaver - Burk Stury Михаэлис -Мюминен Кинетика
Типы	EC1 оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4 Lyases ( список ) EC5 изомеразы ( список ) Ec6 лигазы ( список ) EC7 Translocases ( список )