Эволюция биологической сложности
Эволюция биологической сложности является одним из важных результатов процесса эволюции . [ 1 ] Эволюция создала некоторые удивительно сложные организмы – хотя реальный уровень сложности очень сложно определить или точно измерить в биологии, а такие свойства, как содержание генов, количество типов клеток или морфология, предлагаются в качестве возможных показателей. [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]
Многие биологи раньше считали, что эволюция была прогрессивной (ортогенезом) и имела направление, ведущее к так называемым «высшим организмам», несмотря на отсутствие доказательств этой точки зрения. [ 5 ] Эта идея «прогресса» привела к появлению в эволюции терминов « высшие животные » и « низшие животные ». Многие теперь считают это вводящим в заблуждение, поскольку естественный отбор не имеет внутреннего направления и что организмы отбирают либо повышенную, либо пониженную сложность в ответ на местные условия окружающей среды. [ 6 ] наблюдалось увеличение максимального уровня сложности Хотя на протяжении истории жизни , всегда существовало подавляющее большинство мелких и простых организмов, и наиболее распространенный уровень сложности, по-видимому, оставался относительно постоянным.
Выбор по простоте и сложности
[ редактировать ]Обычно организмы, которые имеют более высокую скорость размножения, чем их конкуренты, имеют эволюционное преимущество. Следовательно, организмы могут эволюционировать, становясь проще и, таким образом, быстрее размножаться и производить больше потомства, поскольку для размножения им требуется меньше ресурсов. Хорошим примером являются такие паразиты, как плазмодий (паразит, вызывающий малярию ) и микоплазма ; эти организмы часто обходятся без черт, которые становятся ненужными из-за паразитизма на хозяине. [ 7 ]
Линия также может обойтись без сложности, когда конкретная сложная черта просто не дает селективного преимущества в определенной среде. Потеря этого признака не обязательно должна давать селективное преимущество, но может быть потеряна из-за накопления мутаций, если его потеря не приводит к немедленному селективному недостатку. [ 8 ] Например, паразитический организм может обойтись без синтетического пути метаболита, и он может легко удалить этот метаболит из своего хозяина. Отказ от этого синтеза не обязательно позволит паразиту сохранить значительную энергию или ресурсы и расти быстрее, но потеря может быть зафиксирована в популяции за счет накопления мутаций, если потеря этого пути не причинит вреда. Мутации, приводящие к утрате сложного признака, встречаются чаще, чем мутации, приводящие к приобретению сложного признака. [ нужна ссылка ]
Благодаря отбору эволюция может также создавать более сложные организмы. Сложность часто возникает при совместной эволюции хозяев и патогенов. [ 9 ] каждая сторона разрабатывает все более сложные приспособления, такие как иммунная система и множество методов, разработанных патогенами для уклонения от нее. Например, паразит Trypanosoma brucei , вызывающий сонную болезнь , развил столько копий своего основного поверхностного антигена , что около 10% его генома посвящено различным версиям этого одного гена. Эта огромная сложность позволяет паразиту постоянно менять свою поверхность и, таким образом, уклоняться от иммунной системы посредством антигенных вариаций . [ 10 ]
В более общем смысле, рост сложности может быть вызван совместной эволюцией организма и экосистемы хищников к , добычи и паразитов, которым он пытается адаптироваться: поскольку любой из них становится более сложным, чтобы лучше справляться с разнообразием. угроз, исходящих от экосистемы, сформированной другими, остальным тоже придется адаптироваться, становясь более сложными, что запускает продолжающуюся эволюционную гонку вооружений. [ 9 ] в сторону большей сложности. [ 11 ] Эта тенденция может быть усилена тем фактом, что сами экосистемы со временем имеют тенденцию усложняться по мере увеличения видового разнообразия , а также связей или зависимостей между видами.
Виды тенденций по сложности
[ редактировать ]
Если бы эволюция обладала активной тенденцией к усложнению ( ортогенезу ), как широко считалось в XIX веке, [ 12 ] тогда мы могли бы ожидать увидеть активную тенденцию увеличения с течением времени наиболее распространенного значения (модуса) сложности среди организмов. [ 13 ]
Однако увеличение сложности можно объяснить и пассивным процессом. [ 13 ] Допущение несмещенных случайных изменений сложности и существования минимальной сложности приводит к увеличению со временем средней сложности биосферы. Это предполагает увеличение дисперсии , но режим не меняется. Тенденция к созданию некоторых организмов более высокой сложности с течением времени существует, но она затрагивает все более малый процент живых существ. [ 4 ]
Согласно этой гипотезе, любая видимость эволюции, действующей с внутренней направленностью на все более сложные организмы, является результатом концентрации людей на небольшом количестве крупных и сложных организмов, населяющих правый хвост распределения сложности, и игнорирования более простых и гораздо более распространенных. организмы. Эта пассивная модель предсказывает, что большинство видов являются микроскопическими прокариотами , что подтверждается оценками в 10 6 до 10 9 современные прокариоты [ 14 ] по сравнению с оценками разнообразия в 10 6 до 3·10 6 для эукариот. [ 15 ] [ 16 ] Следовательно, с этой точки зрения на Земле доминирует микроскопическая жизнь, а крупные организмы кажутся более разнообразными только из-за систематической ошибки отбора проб .
Сложность генома в целом возросла с момента зарождения жизни на Земле. [ 17 ] [ 18 ] Некоторые компьютерные модели предполагают, что образование сложных организмов является неизбежным свойством эволюции. [ 19 ] [ 20 ] Белки со временем становятся более гидрофобными. [ 21 ] и чтобы их гидрофобные аминокислоты были более рассеяны вдоль первичной последовательности. [ 22 ] Увеличение размеров тела с течением времени иногда наблюдается в так называемом правиле Коупа . [ 23 ]
Конструктивная нейтральная эволюция
[ редактировать ]Недавно работа в области теории эволюции предположила, что ослабление давления отбора , которое обычно приводит к оптимизации геномов , увеличивает сложность организма за счет процесса, называемого конструктивной нейтральной эволюцией . [ 24 ] Поскольку эффективный размер популяции у эукариот (особенно у многоклеточных организмов) намного меньше, чем у прокариот, [ 25 ] они испытывают более низкие ограничения выбора .
Согласно этой модели, новые гены создаются в результате неадаптивных процессов , например, путем случайного дупликации генов . Эти новые сущности, хотя и не необходимы для жизнеспособности, все же дают организму избыточную способность, которая может способствовать мутационному распаду функциональных субъединиц. Если этот распад приведет к ситуации, когда теперь потребуются все гены, организм окажется в новом состоянии, в котором количество генов увеличится. Этот процесс иногда называют усложняющим механизмом. [ 26 ] Эти дополнительные гены затем могут быть поглощены естественным отбором посредством процесса, называемого неофункционализацией . В других случаях конструктивная нейтральная эволюция не способствует созданию новых частей, а скорее способствует новым взаимодействиям между существующими игроками, которые затем берут на себя новые подрабатывающие роли. [ 26 ]
Конструктивную нейтральную эволюцию также использовали для объяснения того, как древние комплексы, такие как сплайсосома и рибосома , со временем приобретали новые субъединицы, как возникают новые альтернативные сплайсированные изоформы генов, как скремблинг генов у инфузорий развивался , насколько широкое редактирование пан-РНК возможно, возникли у Trypanosoma brucei , как функциональные днРНК, вероятно, возникли из транскрипционного шума и как даже бесполезные белковые комплексы могут сохраняться в течение длительного времени. миллионы лет. [ 24 ] [ 27 ] [ 26 ] [ 28 ] [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ]
Гипотеза мутационной опасности
[ редактировать ]Гипотеза мутационной опасности — это неадаптивная теория повышенной сложности геномов. [ 32 ] В основе гипотезы мутационной опасности лежит то, что каждая мутация некодирующей ДНК требует затрат на приспособленность. [ 33 ] Изменение сложности можно описать формулой 2N e u, где N e — эффективный размер популяции, а u — частота мутаций . [ 34 ]
Согласно этой гипотезе, отбор против некодирующей ДНК можно уменьшить тремя способами: случайным генетическим дрейфом, скоростью рекомбинации и скоростью мутаций. [ 35 ] По мере увеличения сложности от прокариот к многоклеточным эукариотам эффективный размер популяции уменьшается, что впоследствии увеличивает силу случайного генетического дрейфа . [ 32 ] Это наряду с низкой скоростью рекомбинации [ 35 ] и высокая частота мутаций, [ 35 ] позволяет некодирующей ДНК размножаться, не удаляясь в результате очищающей селекции . [ 32 ]
Накопление некодирующей ДНК в более крупных геномах можно увидеть при сравнении размера и содержания генома разных таксонов эукариот. Существует положительная корреляция между размером генома и содержанием некодирующей ДНК в геноме, при этом каждая группа остается в пределах некоторых вариаций. [ 32 ] [ 33 ] При сравнении различий в сложности органелл эффективный размер популяции заменяется генетически эффективным размером популяции (N g ). [ 34 ] Если посмотреть на разнообразие нуклеотидов молчащих сайтов , то ожидается, что более крупные геномы будут иметь меньшее разнообразие, чем более компактные. В митохондриях растений и животных различия в скорости мутаций объясняют противоположные направления сложности: митохондрии растений более сложны, а митохондрии животных более упорядочены. [ 36 ]
Гипотеза мутационной опасности использовалась, по крайней мере, частично для объяснения расширенных геномов у некоторых видов. Например, при сравнении Volvox cateri с близким родственником с компактным геномом, Chlamydomonas Reinhardtii , первый имел меньшее разнообразие молчащих сайтов, чем второй, в ядерном, митохондриальном и пластидном геномах. [ 37 ] Однако при сравнении пластидного генома Volvox cateri с Volvox africanus , видом того же рода, но с половиной размера пластидного генома, наблюдались высокие уровни мутаций в межгенных областях. [ 38 ] У Arabiopsis thaliana эта гипотеза использовалась как возможное объяснение потери интронов и компактного размера генома. По сравнению с Arabidopsis lyrata исследователи обнаружили более высокую частоту мутаций в целом и в потерянных интронах (интронах, которые больше не транскрибируются и не сплайсируются) по сравнению с консервативными интронами. [ 39 ]
У других видов существуют расширенные геномы, которые нельзя объяснить гипотезой мутационной опасности. Например, расширенные митохондриальные геномы Silene noctiflora и Silene conica имеют высокую частоту мутаций, меньшую длину интронов и больше некодирующих элементов ДНК по сравнению с другими геномами того же рода, но не было никаких доказательств долгосрочного низкого эффективного размера популяции. . [ 40 ] Митохондриальные геномы Citrullus lanatus и Cucurbita pepo различаются по нескольким причинам. Citrullus lanatus меньше по размеру, имеет больше интронов и дупликаций, тогда как Cucurbita pepo крупнее, с большим количеством хлоропластов и короткими повторяющимися последовательностями. [ 41 ] Если бы сайты редактирования РНК и скорость мутаций совпадали, то у Cucurbita pepo была бы более низкая частота мутаций и больше сайтов редактирования РНК. Однако частота мутаций в четыре раза выше, чем у Citrullus lanatus , и у них одинаковое количество сайтов редактирования РНК. [ 41 ] Была также попытка использовать эту гипотезу для объяснения больших ядерных геномов саламандр , но исследователи обнаружили результаты, противоположные ожидаемым, включая меньшую долгосрочную силу генетического дрейфа. [ 42 ]
История
[ редактировать ]В XIX веке некоторые ученые, такие как Жан-Батист Ламарк (1744–1829) и Рэй Ланкестер (1847–1929), считали, что природе присуще врожденное стремление усложняться по мере эволюции. Эта вера может отражать существовавшие в то время идеи Гегеля (1770–1831) и Герберта Спенсера (1820–1903), которые предполагали, что Вселенная постепенно эволюционирует к более высокому, более совершенному состоянию.
Эта точка зрения рассматривала эволюцию паразитов из независимых организмов в паразитический вид как « деволюцию » или «вырождение», противоречащую природе. Социальные теоретики иногда интерпретировали этот подход метафорически, осуждая определенные категории людей как «выродившихся паразитов». Более поздние ученые считали биологическую передачу чепухой; скорее, линии передачи становятся проще или сложнее в зависимости от того, какие формы имели избирательное преимущество. [ 43 ]
В книге 1964 года «Появление биологической организации» Квастлер впервые разработал теорию возникновения, разработав модель серии переходов от протобиологических систем к прокариотам без необходимости ссылаться на неправдоподобные события с очень низкой вероятностью. [ 44 ]
В 1983 году было предложено, чтобы эволюция порядка, проявляющаяся как биологическая сложность, в живых системах и порождение порядка в некоторых неживых системах подчинялась общему фундаментальному принципу, названному «дарвиновской динамикой». [ 45 ] Дарвиновская динамика была сформулирована путем рассмотрения того, как создается микроскопический порядок в простых небиологических системах, далеких от термодинамического равновесия . Затем рассмотрение было расширено до коротких, реплицирующихся молекул РНК, которые, как предполагалось, были похожи на самые ранние формы жизни в мире РНК . Было показано, что лежащие в основе процессов формирования порядка в небиологических системах и в реплицирующейся РНК в основном схожи. Этот подход помог прояснить связь термодинамики с эволюцией, а также эмпирическое содержание теории Дарвина .
В 1985 году Моровиц [ 46 ] отметил, что современная эра необратимой термодинамики, начатая Ларсом Онсагером в 1930-х годах, показала, что системы неизменно становятся упорядоченными под действием потока энергии, тем самым указывая на то, что существование жизни не противоречит законам физики.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Вернер, Андреас; Пятек, Моника Дж.; Мэттик, Джон С. (апрель 2015 г.). «Транспозиционное перетасовывание и контроль качества мужских половых клеток для ускорения эволюции сложных организмов» . Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1341 (1): 156–163. Бибкод : 2015NYASA1341..156W . дои : 10.1111/nyas.12608 . ПМК 4390386 . ПМИД 25557795 .
- ^ Адами, К. (2002). «Что такое сложность?» . Биоэссе . 24 (12): 1085–94. дои : 10.1002/bies.10192 . ПМИД 12447974 .
- ^ Уолдроп, М.; и др. (2008). «Язык: спорные определения» . Природа . 455 (7216): 1023–1028. дои : 10.1038/4551023а . ПМИД 18948925 .
- ^ Jump up to: а б Лонго, Джузеппе; Монтевиль, Маэль (1 января 2012 г.). «Случайность увеличивает порядок в биологической эволюции». В Диннине, Майкл Дж.; Хусаинов, Бахадыр; Нис, Андре (ред.). Вычисление, физика и не только . Конспекты лекций по информатике. Том. 7160. Шпрингер Берлин Гейдельберг. стр. 289–308. CiteSeerX 10.1.1.640.1835 . дои : 10.1007/978-3-642-27654-5_22 . ISBN 9783642276538 . S2CID 16929949 .
- ^ Макши, Д. (1991). «Сложность и эволюция: то, что все знают». Биология и философия . 6 (3): 303–324. дои : 10.1007/BF00132234 . S2CID 53459994 .
- ^ Аяла, Ф.Дж. (2007). «Величайшее открытие Дарвина: дизайн без дизайнера» . ПНАС . 104 (Приложение 1): 8567–73. Бибкод : 2007PNAS..104.8567A . дои : 10.1073/pnas.0701072104 . ПМК 1876431 . ПМИД 17494753 .
- ^ Сиранд-Пьюгнет, П.; Лартиг, К.; Маренда, М.; и др. (2007). «Быть патогенным, пластичным и сексуальным, живя с почти минимальным бактериальным геномом» . ПЛОС Генет . 3 (5): е75. дои : 10.1371/journal.pgen.0030075 . ПМК 1868952 . ПМИД 17511520 .
- ^ Моэн, Х.; Мазель, Дж.; Бирки, туалет; Николсон, WL (2007). «Роль накопления мутаций и отбора в потере споруляции в экспериментальных популяциях Bacillus subtilis» . Генетика . 177 (2): 937–948. doi : 10.1534/genetics.107.075663 . ПМК 2034656 . ПМИД 17720926 .
- ^ Jump up to: а б Докинз, Ричард ; Кребс, младший (1979). «Гонка вооружений между видами и внутри них». Труды Королевского общества Б. 205 (1161): 489–511. Бибкод : 1979РСПСБ.205..489Д . дои : 10.1098/rspb.1979.0081 . ПМИД 42057 . S2CID 9695900 .
- ^ Пэйс, Э. (2005). «Регуляция экспрессии генов антигенов у Trypanosoma brucei». Тенденции Паразитол . 21 (11): 517–20. дои : 10.1016/j.pt.2005.08.016 . ПМИД 16126458 .
- ^ Хейлиген, Ф. (1999a) «Рост структурной и функциональной сложности в ходе эволюции », в Ф. Хейлиген, Дж. Боллен и А. Риглер (ред.) Эволюция сложности Kluwer Academic, Дордрехт, 17–44.
- ^ Русе, Майкл (1996). Монада человеку: концепция прогресса в эволюционной биологии . Издательство Гарвардского университета. стр. 526–529 и пассим. ISBN 978-0-674-03248-4 .
- ^ Jump up to: а б Кэрролл С.Б. (2001). «Шанс и необходимость: эволюция морфологической сложности и разнообразия». Природа . 409 (6823): 1102–9. Бибкод : 2001Natur.409.1102C . дои : 10.1038/35059227 . ПМИД 11234024 . S2CID 4319886 .
- ^ Орен, А. (2004). «Разнообразие и таксономия прокариот: современное состояние и будущие проблемы» . Филос. Пер. Р. Сок. Лонд. Б Биол. Наука . 359 (1444): 623–38. дои : 10.1098/rstb.2003.1458 . ПМЦ 1693353 . ПМИД 15253349 .
- ^ Мэй, РМ; Бевертон, RJH (1990). «Сколько видов?». Философские труды Лондонского королевского общества. Серия Б: Биологические науки . 330 (1257): 293–304. дои : 10.1098/rstb.1990.0200 .
- ^ Шлосс, П.; Хандельсман, Дж. (2004). «Состояние микробной переписи» . Микробиол Мол Биол Rev. 68 (4): 686–91. дои : 10.1128/MMBR.68.4.686-691.2004 . ПМК 539005 . ПМИД 15590780 .
- ^ Марков А.В.; Анисимов В.А.; Коротаев, А.В. (2010). «Связь между размером генома и сложностью организма в линии, ведущей от прокариот к млекопитающим». Палеонтологический журнал . 44 (4): 363–373. дои : 10.1134/s0031030110040015 . S2CID 10830340 .
- ^ Шаров, Алексей А (2006). «Увеличение генома как часы зарождения и эволюции жизни» . Биология Директ . 1 (1): 17. дои : 10.1186/1745-6150-1-17 . ПМЦ 1526419 . ПМИД 16768805 .
- ^ Фурусава, К.; Канеко, К. (2000). «Происхождение сложности в многоклеточных организмах». Физ. Преподобный Летт . 84 (26, часть 1): 6130–3. arXiv : nlin/0009008 . Бибкод : 2000PhRvL..84.6130F . doi : 10.1103/PhysRevLett.84.6130 . ПМИД 10991141 . S2CID 13985096 .
- ^ Адами, К.; Офрия, К.; Кольер, TC (2000). «Эволюция биологической сложности» . ПНАС . 97 (9): 4463–8. arXiv : физика/0005074 . Бибкод : 2000PNAS...97.4463A . дои : 10.1073/pnas.97.9.4463 . ЧВК 18257 . ПМИД 10781045 .
- ^ Уилсон, Бенджамин А.; Фой, Скотт Г.; Неме, Рафик; Мазель, Джоанна (24 апреля 2017 г.). «Молодые гены сильно разупорядочены, как и предсказывает гипотеза преадаптации о рождении генов de novo» . Экология и эволюция природы . 1 (6): 0146–146. дои : 10.1038/s41559-017-0146 . ПМЦ 5476217 . ПМИД 28642936 .
- ^ Фой, Скотт Г.; Уилсон, Бенджамин А.; Бертрам, Джейсон; Кордес, Мэтью Х.Дж.; Мазель, Джоанна (апрель 2019 г.). «Сдвиг в стратегии предотвращения агрегации отмечает долгосрочное направление эволюции белков» . Генетика . 211 (4): 1345–1355. дои : 10.1534/genetics.118.301719 . ПМК 6456324 . ПМИД 30692195 .
- ^ Хейм, Северная Каролина; Ноуп, МЛ; Шааль, ЕК; Ван, Южная Каролина; Пейн, Дж.Л. (20 февраля 2015 г.). «Правило Коупа в эволюции морских животных» . Наука . 347 (6224): 867–870. Бибкод : 2015Sci...347..867H . дои : 10.1126/science.1260065 . ПМИД 25700517 .
- ^ Jump up to: а б Штольцфус, Арлин (1999). «О возможности конструктивной нейтральной эволюции». Журнал молекулярной эволюции . 49 (2): 169–181. Бибкод : 1999JMolE..49..169S . CiteSeerX 10.1.1.466.5042 . дои : 10.1007/PL00006540 . ISSN 0022-2844 . ПМИД 10441669 . S2CID 1743092 .
- ^ Сун, В.; Акерман, М.С.; Миллер, Сан-Франциско; Доук, Т.Г.; Линч, М. (2012). «Гипотеза дрейфового барьера и эволюция скорости мутаций» . Труды Национальной академии наук . 109 (45): 18488–18492. Бибкод : 2012PNAS..10918488S . дои : 10.1073/pnas.1216223109 . ПМЦ 3494944 . ПМИД 23077252 .
- ^ Jump up to: а б с Лукеш, Юлиус; Арчибальд, Джон М.; Килинг, Патрик Дж.; Дулиттл, У. Форд; Грей, Майкл В. (2011). «Как нейтральный эволюционный храповик может усложнить клетку» . ИУБМБ Жизнь . 63 (7): 528–537. дои : 10.1002/iub.489 . ПМИД 21698757 . S2CID 7306575 .
- ^ Грей, МВт; Люкс, Дж.; Арчибальд, Дж. М.; Килинг, П.Дж.; Дулитл, WF (2010). «Непоправимая сложность?». Наука . 330 (6006): 920–921. Бибкод : 2010Sci...330..920G . дои : 10.1126/science.1198594 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 21071654 . S2CID 206530279 .
- ^ Дэниел, Чаммиран; Бем, Микаэла; Оман, Мари (2015). «Роль элементов Alu в цис-регуляции процессинга РНК» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 72 (21): 4063–4076. дои : 10.1007/s00018-015-1990-3 . ISSN 1420-682X . ПМЦ 11113721 . ПМИД 26223268 . S2CID 17960570 .
- ^ Ковелло, Патрик С.; Грей, Майкл В. (1993). «Об эволюции редактирования РНК». Тенденции в генетике . 9 (8): 265–268. дои : 10.1016/0168-9525(93)90011-6 . ПМИД 8379005 .
- ^ Палаццо, Александр Ф.; Кунин, Евгений В. (2020). «Функциональные длинные некодирующие РНК развиваются из мусорных транскриптов» . Клетка . 183 (5): 1151–1161. дои : 10.1016/j.cell.2020.09.047 . ISSN 0092-8674 . PMID 33068526 . S2CID 222815635 .
- ^ Хохберг, ГКА; Лю, Ю; Марклунд, Э.Г.; Мецгер, ДГПЖ; Лагановский, А; Торнтон, JW (декабрь 2020 г.). «Гидрофобный храповик закрепляет молекулярные комплексы» . Природа . 588 (7838): 503–508. Бибкод : 2020Natur.588..503H . дои : 10.1038/s41586-020-3021-2 . ПМК 8168016 . ПМИД 33299178 .
- ^ Jump up to: а б с д Линч, Майкл; Конери, Джон С. (21 ноября 2003 г.). «Истоки сложности генома» . Наука . 302 (5649): 1401–1404. Бибкод : 2003Sci...302.1401L . дои : 10.1126/science.1089370 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 14631042 . S2CID 11246091 .
- ^ Jump up to: а б Линч, Майкл; Бобей, Луи-Мари; Катания, Франческо; Подагра, Жан-Франсуа; Ро, Мина (22 сентября 2011 г.). «Репаттернирование геномов эукариот в результате случайного генетического дрейфа» . Ежегодный обзор геномики и генетики человека . 12 (1): 347–366. doi : 10.1146/annurev-genom-082410-101412 . ISSN 1527-8204 . ПМК 4519033 . ПМИД 21756106 .
- ^ Jump up to: а б Линч, М. (24 марта 2006 г.). «Мутационное давление и эволюция геномной архитектуры органелл» . Наука . 311 (5768): 1727–1730. Бибкод : 2006Sci...311.1727L . дои : 10.1126/science.1118884 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 16556832 . S2CID 2678365 .
- ^ Jump up to: а б с Линч, Майкл (1 февраля 2006 г.). «Происхождение структуры генов эукариот» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (2): 450–468. дои : 10.1093/molbev/msj050 . ISSN 1537-1719 . ПМИД 16280547 .
- ^ Линч, Майкл (13 октября 2006 г.). «Оптимизация и упрощение архитектуры микробного генома» . Ежегодный обзор микробиологии . 60 (1): 327–349. дои : 10.1146/annurev.micro.60.080805.142300 . ISSN 0066-4227 . ПМИД 16824010 .
- ^ Смит, доктор медицинских наук; Ли, RW (01 октября 2010 г.). «Низкое нуклеотидное разнообразие расширенных органелл и ядерных геномов Volvox carteri подтверждает гипотезу мутационной опасности» . Молекулярная биология и эволюция . 27 (10): 2244–2256. дои : 10.1093/molbev/msq110 . ISSN 0737-4038 . ПМИД 20430860 .
- ^ Гауда, Хагер, Ямамото, Кайоко; Каваи-Тойока, Хироко; Ногучи, Ёхей; Фудзияма, Нодзаки, Хисаёси Смит (2018–09); -01). Чау, Шу-Мио (ред.). «Исследование границ и причин». Расширение пластидного генома у вольвоциновых зеленых водорослей» . Геномная биология и эволюция . 10 (9): 2248–2254. : 10.1093 /gbe/evy175 . ISSN 1759-6653 . PMC 6128376. . PMID 30102347 doi
- ^ Ян, Ю-Фей; Чжу, Тао; Ню, Дэн-Ке (апрель 2013 г.). «Связь потери интронов с высокой скоростью мутаций у арабидопсиса: последствия для эволюции размера генома» . Геномная биология и эволюция . 5 (4): 723–733. дои : 10.1093/gbe/evt043 . ISSN 1759-6653 . ПМК 4104619 . ПМИД 23516254 .
- ^ Слоан, Дэниел Б.; Алверсон, Эндрю Дж.; Чукаловчак, Джон П.; Ву, Мартин; МакКоли, Дэвид Э.; Палмер, Джеффри Д.; Тейлор, Дуглас Р. (17 января 2012 г.). Грей, Майкл Уильям (ред.). «Быстрая эволюция огромных мультихромосомных геномов в митохондриях цветковых растений с исключительно высокой скоростью мутаций» . ПЛОС Биология . 10 (1): e1001241. дои : 10.1371/journal.pbio.1001241 . ISSN 1545-7885 . ПМК 3260318 . ПМИД 22272183 .
- ^ Jump up to: а б Алверсон, Эндрю Дж; Вэй, Сиосинь; Райс, Дэнни В.; Стерн, Дэвид Б; Барри, Керри; Палмер, Джеффри Д. (29 января 2010 г.). «Изучение эволюции размера митохондриального генома на основе полных последовательностей Citrus lanatus и Cucurbita pepo (Cucurbitaceae)» . Молекулярная биология и эволюция . 27 (6): 1436–1448. дои : 10.1093/molbev/msq029 . ПМЦ 2877997 . ПМИД 20118192 .
- ^ Молхенрих, Эрик Роджер; Локридж Мюллер, Рэйчел (27 сентября 2016 г.). «Генетический дрейф и мутационная опасность в эволюции геномного гигантизма саламандры». Эволюция . 70 (12): 2865–2878. дои : 10.1111/evo.13084 . hdl : 10217/173461 . ПМИД 27714793 . S2CID 205125025 — через JSTOR.
- ^ Догерти, Майкл Дж. (июль 1998 г.). «Человеческая раса развивается или деградирует?» . Научный американец .
С биологической точки зрения такого понятия, как деволюция, не существует. Все изменения в частотах генов в популяциях – а зачастую и в признаках, на которые эти гены влияют – по определению являются эволюционными изменениями. [...] Когда виды действительно эволюционируют, это происходит не из-за необходимости, а потому, что их популяции содержат организмы с вариантами черт, которые обеспечивают репродуктивное преимущество в меняющейся среде.
- ^ Квастлер, Х. (1964) Возникновение биологической организации. Издательство Йельского университета
- ^ Бернштейн Х., Байерли Х.К., Хопф Ф.А., Мишод Р.А., Вемулапалли Г.К. (1983) Дарвиновская динамика. Ежеквартальный обзор биологии 58, 185–207. JSTOR 2828805
- ^ Моровиц, Гарольд Дж. (1985). Майонез и происхождение жизни: мысли разумов и молекул . Нью-Йорк: Скрибнер. ISBN 978-0-684-18444-9 .