Скваленмонооксигеназа

SQLE
Идентификаторы
Псевдонимы	SQLE , entrez:6713, скваленэпоксидаза
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602019 ; МГИ : 109296 ; Гомологен : 2355 ; Генные карты : SQLE ; OMA : SQLE — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	125,022,283 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	59,203,041 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; gingival epithelium; ; bronchial epithelial cell; ; cartilage tissue; ; nipple; ; C1 segment; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; tibia; ; human penis;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; hair follicle; ; ciliary body; ; corneal stroma; ; trigeminal ganglion; ; iris; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; lip; ; ventricular zone; ; anterior horn of spinal cord;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	oxidoreductase activity; flavin adenine dinucleotide binding; squalene monooxygenase activity; FAD binding;
Cellular component	organelle membrane; integral component of membrane; endoplasmic reticulum membrane; membrane; intracellular membrane-bounded organelle; endoplasmic reticulum;
Biological process	cellular aromatic compound metabolic process; cholesterol biosynthetic process; response to organic substance; cholesterol metabolic process; sterol biosynthetic process; regulation of cholesterol biosynthetic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6713
	20775
	ENSG00000104549
	ENSMUSG00000022351
	Q14534
	P52019
	НМ_003129
	НМ_009270
	НП_003120
	НП_033296
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Скваленэпоксидаза
Скваленэпоксидаза
	Химическая реакция, катализируемая скваленэпоксидазой.
Идентификаторы
Номер ЕС.	1.14.13.132
Номер CAS.	9029-62-3
Базы данных
ИнтЭнк	вид IntEnz
БРЕНДА	БРЕНДА запись
Экспаси	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	КЕГГ запись
МетаЦик	метаболический путь
ПРЯМОЙ	профиль
PDB Структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	АмиГО / QuickGO
PMC
показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Скваленмонооксигеназа (также называемая скваленэпоксидазой ) представляет собой эукариотический фермент , который использует НАДФН и двухатомный кислород для окисления сквалена до 2,3-оксидосквалена (эпоксид сквалена). Скваленэпоксидаза катализирует первую стадию оксигенации в биосинтезе стеринов и считается одним из ферментов, лимитирующих скорость на этом пути. ^{[ 5 ]} У человека скваленэпоксидаза кодируется SQLE геном . ^{[ 6 ]} В геномах некоторых эукариот отсутствует ген, кодирующий скваленмонооксигеназу, но вместо этого кодируется альтернативная скваленэпоксидаза, которая выполняет ту же задачу. ^{[ 7 ]}

Механизм

Каноническая скваленмонооксигеназа представляет флавопротеинмонооксигеназу собой . Флавопротеинмонооксигеназа образует флавина гидроперекиси в фермента активном центре переносят концевой атом кислорода гидроперекиси , которые затем на субстрат . Скваленмонооксигеназа отличается от других флавинмонооксигеназ тем, что кислород вводится в субстрат в виде эпоксида, а не в виде гидроксильной группы. Этот фермент содержит слабосвязанный FAD флавин и получает электроны от НАДФН - редуктазы цитохрома Р450 , а не связывает НАДФН напрямую. Альтернативная скваленэпоксидаза принадлежит к суперсемейству гидроксилаз жирных кислот и получает электроны от цитохрома b5 . ^{[ 7 ]}

Ингибиторы

Ингибиторы скваленэпоксидазы нашли применение преимущественно как противогрибковые препараты : ^{[ 8 ]}

Поскольку скваленэпоксидаза участвует в биосинтетическом пути, ведущем к выработке холестерина , ингибиторы этого фермента могут также найти применение при лечении гиперхолестеринемии . ^{[ 10 ]}

Локализация

У пекарских дрожжей ( Saccharomyces cerevisiae ) скваленэпоксидаза локализуется как в эндоплазматическом ретикулуме, так и в липидных каплях. Активен только белок, локализованный в ЭР.

Дополнительные продукты

Скваленэпоксидаза также катализирует образование диэпоксисквалена (ДОС). DOS превращается в 24(S),25-эпоксиланостерин под действием ланостеринсинтазы.

См. также

Противогрибковый препарат#Аллиламины

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000104549 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000022351 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: скваленэпоксидаза SQLE» .
^ Нагай М., Сакакибара Дж., Вакуи К., Фукусима Ю., Игараси С., Цудзи С., Аракава М., Оно Т. (август 1997 г.). «Локализация гена скваленэпоксидазы (SQLE) в области хромосомы человека 8q24.1». Геномика . 44 (1): 141–3. дои : 10.1006/geno.1997.4825 . ПМИД 9286711 .
^ Jump up to: ^а ^б Поллиер Дж., Ванкестер Э., Кужиумпарамбил У., Викерс К.Э., Вандеполе К., Гуссенс А., Фабрис М. (2019). «Широко распространенная альтернативная скваленэпоксидаза участвует в биосинтезе стероидов эукариот» . Природная микробиология . 4 (2): 226–233. дои : 10.1038/s41564-018-0305-5 . hdl : 1854/LU-8587985 . ПМИД 30478288 . S2CID 53726187 .
^ Фавр Б., Райдер Н.С. (февраль 1996 г.). «Характеристика активности скваленэпоксидазы дерматофита Trichophyton Rubrum и ее ингибирование тербинафином и другими антимикотическими средствами» . Антимикробные средства и химиотерапия . 40 (2): 443–7. дои : 10.1128/AAC.40.2.443 . ПМК 163131 . ПМИД 8834895 .
^ Райдер Н.С. (февраль 1992 г.). «Тербинафин: механизм действия и свойства ингибирования скваленэпоксидазы». Британский журнал дерматологии . 126 (Приложение 39): 2–7. дои : 10.1111/j.1365-2133.1992.tb00001.x . ПМИД 1543672 . S2CID 19780957 .
^ Чу А., Рэй А., Гупта Дж. Б. (январь 2003 г.). «Скваленэпоксидаза как мишень для гипохолестеринемических препаратов». Прогресс в исследованиях липидов . 42 (1): 37–50. дои : 10.1016/S0163-7827(02)00029-2 . ПМИД 12467639 .

Дальнейшее чтение

Ма Дж., Демпси А.А., Стаматиу Д., Маршалл К.В., Лью CC (март 2007 г.). «Идентификация закономерностей экспрессии генов лейкоцитов, связанных с уровнями липидов в плазме у людей». Атеросклероз . 191 (1): 63–72. doi : 10.1016/j.atherosclerosis.2006.05.032 . ПМИД 16806233 .
Ладен Б.П., Тан И., Портер Т.Д. (февраль 2000 г.). «Клонирование, гетерологичная экспрессия и ферментологическая характеристика скваленмонооксигеназы человека». Архив биохимии и биофизики . 374 (2): 381–8. дои : 10.1006/abbi.1999.1629 . PMID 10666321 .
Хелмс М.В., Кемминг Д., Поспишил Х., Фогт У., Бюргер Х., Коршинг Э., Лидтке С., Шлоттер К.М., Ван А., Чан С.Ю., Брандт Б.Х. (сентябрь 2008 г.). «Скваленэпоксидаза, расположенная на хромосоме 8q24.1, активируется при 8q+ раке молочной железы и указывает на плохой клинический исход на стадиях I и II заболевания» . Британский журнал рака . 99 (5): 774–80. дои : 10.1038/sj.bjc.6604556 . ПМК 2528137 . ПМИД 18728668 .
Нагай М., Сакакибара Дж., Накамура Ю., Геджё Ф., Оно Т. (июль 2002 г.). «SREBP-2 и NF-Y участвуют в регуляции транскрипции скваленэпоксидазы». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 295 (1): 74–80. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00623-X . ПМИД 12083769 .
Лю Ю, Сунь В, Чжан К, Чжэн Х, Ма Ю, Линь Д, Чжан Икс, Фэн Л, Лэй В, Чжан Цз, Го С, Хань Н, Тонг В, Фэн Икс, Гао Ю, Ченг С (июнь 2007 г.) ). «Идентификация генов, дифференциально экспрессирующихся при первичной плоскоклеточной карциноме легких человека». Рак легких . 56 (3): 307–17. дои : 10.1016/j.lungcan.2007.01.016 . ПМИД 17316888 .
Сузуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Лу Й, Долле М.Э., Имхольц С., Ван 'т Слот Р., Вершурен В.М., Вейменга С., Фескенс Э.Дж., Бур Дж.М. (декабрь 2008 г.). «Множественные генетические варианты на путях-кандидатах влияют на концентрацию холестерина липопротеинов высокой плотности в плазме» . Журнал исследований липидов . 49 (12): 2582–9. doi : 10.1194/jlr.M800232-JLR200 . ПМИД 18660489 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Накамура Ю., Сакакибара Дж., Изуми Т., Сибата А., Оно Т. (апрель 1996 г.). «Регуляция транскрипции скваленэпоксидазы стеролами и ингибиторами в клетках HeLa» . Журнал биологической химии . 271 (14): 8053–6. дои : 10.1074/jbc.271.14.8053 . ПМИД 8626488 .
Нагай М., Сакакибара Дж., Вакуи К., Фукусима Ю., Игараси С., Цудзи С., Аракава М., Оно Т. (август 1997 г.). «Локализация гена скваленэпоксидазы (SQLE) в области хромосомы человека 8q24.1». Геномика . 44 (1): 141–3. дои : 10.1006/geno.1997.4825 . ПМИД 9286711 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлигер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .

Внешние ссылки

Сквален + монооксигеназа в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000104549 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000022351 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez_6713-5] «Ген Энтрез: скваленэпоксидаза SQLE» .

[pmid9286711-6] Нагай М., Сакакибара Дж., Вакуи К., Фукусима Ю., Игараси С., Цудзи С., Аракава М., Оно Т. (август 1997 г.). «Локализация гена скваленэпоксидазы (SQLE) в области хромосомы человека 8q24.1». Геномика . 44 (1): 141–3. дои : 10.1006/geno.1997.4825 . ПМИД 9286711 .

[pmid30478288-7] Jump up to: ^а ^б Поллиер Дж., Ванкестер Э., Кужиумпарамбил У., Викерс К.Э., Вандеполе К., Гуссенс А., Фабрис М. (2019). «Широко распространенная альтернативная скваленэпоксидаза участвует в биосинтезе стероидов эукариот» . Природная микробиология . 4 (2): 226–233. дои : 10.1038/s41564-018-0305-5 . hdl : 1854/LU-8587985 . ПМИД 30478288 . S2CID 53726187 .

[pmid8834895-8] Фавр Б., Райдер Н.С. (февраль 1996 г.). «Характеристика активности скваленэпоксидазы дерматофита Trichophyton Rubrum и ее ингибирование тербинафином и другими антимикотическими средствами» . Антимикробные средства и химиотерапия . 40 (2): 443–7. дои : 10.1128/AAC.40.2.443 . ПМК 163131 . ПМИД 8834895 .

[pmid1543672-9] Райдер Н.С. (февраль 1992 г.). «Тербинафин: механизм действия и свойства ингибирования скваленэпоксидазы». Британский журнал дерматологии . 126 (Приложение 39): 2–7. дои : 10.1111/j.1365-2133.1992.tb00001.x . ПМИД 1543672 . S2CID 19780957 .

[pmid12467639-10] Чу А., Рэй А., Гупта Дж. Б. (январь 2003 г.). «Скваленэпоксидаза как мишень для гипохолестеринемических препаратов». Прогресс в исследованиях липидов . 42 (1): 37–50. дои : 10.1016/S0163-7827(02)00029-2 . ПМИД 12467639 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

v т и Оксидоредуктазы : диоксигеназы , включая стероидные гидроксилазы ( EC 1.14)
1.14.11: 2-oxoglutarate	Prolyl hydroxylase HIF prolyl-hydroxylase EGLN1 EGLN2 EGLN3 P4HTM Lysyl hydroxylase AlkB ALKBH1 FTO
1.14.13: NADH or NADPH	Flavin-containing monooxygenase FMO1 FMO2 FMO3 FMO4 FMO5 Nitric oxide synthase NOS1 NOS2 NOS3 Cholesterol 7 alpha-hydroxylase Methane monooxygenase 3A4 14α-demethylase 24-hydroxycholesterol 7α-hydroxylase
1.14.14: reduced flavin or flavoprotein	19A1 2D6 2E1
1.14.15: reduced iron–sulfur protein	11B1 11B2 11A1
1.14.16: reduced pteridine (BH4 dependent)	Phenylalanine hydroxylase Tyrosine hydroxylase Tryptophan hydroxylase
1.14.17: reduced ascorbate	Dopamine beta-hydroxylase
1.14.18-19: other	Tyrosinase Stearoyl-CoA desaturase-1
1.14.99 - miscellaneous	Cyclooxygenase Heme oxygenase (HMOX1) Squalene monooxygenase 17A1 21A2 Ecdysone 20-monooxygenase Deoxyhypusine monooxygenase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)