Семья панкреатической рибонуклеазы
| Поджелудочная рибонуклеаза | |||
|---|---|---|---|
 Структура РНКазы А | |||
| Идентификаторы | |||
| ЕС №. | 4.6.1.18 | ||
| CAS №. | 9001-99-4 | ||
| Базы данных | |||
| Intenz | Intenz View | ||
| Бренда | Бренда вход | ||
| Расширение | Вид Nicezyme | ||
| Кегг | Кегг вход | ||
| Метатический | Метаболический путь | ||
| Напрямую | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBE PDBSUM | ||
| Джин Онтология | Друг / Quickgo | ||
| |||
| Поджелудочная рибонуклеаза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | Rnasea | ||
| Pfam | PF00074 | ||
| InterPro | IPR001427 | ||
| УМНЫЙ | SM00092 | ||
| PROSITE | PDOC00118 | ||
| |||
Семейство рибонуклеазы поджелудочной железы ( EC 4.6.1.18 , RNASE , RNASE I , RNASE A , Панкреатическая РНКаза , Рибонуклеаза I , Эндорибонуклеаза I , Рибонуклеиновая фосфатаза , Алкалиновая рибонуклеаза , , гликоприте , ген , -рибонуклеаза , рибонуклеаза, гликопротеины рибонуклеаза ген -алона E S Locus- Специфические , ассокд генотип гликопротеины - - . S [ 1 ]
В частности, ферменты участвуют в эндонуклеолитическом расщеплении 3'-фосфомоно- нуклеотидов и 3'-фосфолигонуклеотида, заканчивающиеся в CP или вверх с 2 ', 3'-циклическими фосфатами. Рибонуклеаза может расслабиться с РНК- спиралью путем комплекса с одноцепочечной РНК; Комплекс возникает благодаря расширенному многозаконичному взаимодействию катион-анионов между остатками лизина и аргинина фермента и фосфатных групп нуклеотидов.
Примечательные члены семьи
[ редактировать ]Бычья поджелудочная железа рибонуклеаза является наиболее изученным членом семейства и служил модельной системой в работе, связанной с складыванием белка , формированием дисульфидной связи , кристаллографией белка и спектроскопией , а также динамикой белка . [ 2 ] Человеческий геном содержит 8 генов, которые разделяют структуру и функцию с бычьей рибонуклеазой поджелудочной железы, с 5 дополнительными псевдогенами. Структура и динамика этих ферментов связаны с их разнообразными биологическими функциями. [ 3 ]
Другие белки, принадлежащие к суперсемейству рибонуклеазы поджелудочной железы, включают в себя: бычьи семинальные пузырьки и рибонуклеазы мозга; Почечные не секреторные рибонуклеазы; [ 4 ] Рибонуклеазы типа печени; [ 5 ] ангиогенин , который индуцирует васкуляризацию нормальных и злокачественных тканей; эозинофильный катионный белок , [ 6 ] цитотоксин и гельминтотоксин с рибонуклеазой активностью; и лягушка печени рибонуклеаза и лектин, связывающий лягушку. Последовательность рибонуклеасов поджелудочной железы содержит четыре консервативные дисульфидные связи и три аминокислотных остатка, участвующих в каталитической активности. [ 7 ]
Человеческие гены
[ редактировать ]Человеческие гены, кодирующие белки, содержащие этот домен, включают:
Цитотоксичность
[ редактировать ]Некоторые члены семейства рибонуклеазы поджелудочной железы оказывают цитотоксические эффекты. Клетки млекопитающих защищены от этих эффектов из -за их чрезвычайно высокого сродства к ингибитору рибонуклеазы (RI), который защищает клеточную РНК от деградации с помощью рибонуклеазы поджелудочной железы. [ 8 ] Рибонуклеазы поджелудочной железы, которые не ингибируются RI, примерно столь же токсичны, как альфа-сарцин , дифтерийный токсин или рицин . [ 9 ]
Два рибонуклеаза поджелудочной железы, выделенные из ооцитов северной леопардовой лягушки - амфиназы и ранпирназы - не ингибируются RI и демонстрируют дифференциальную цитотоксичность в отношении опухолевых клеток. [ 10 ] Ранпирназа была изучена в III фазы клиническом испытании в качестве кандидата от лечения мезотелиомы , но исследование не продемонстрировало статистическую значимость против первичных конечных точек. [ 11 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Beintema JJ, Van Der Laan JM (1986). «Сравнение структуры панкреатической рибонуклеазы черепах с структурой рибонуклеаз млекопитающих» . Фебс Летт . 194 (2): 338–343. doi : 10.1016/0014-5793 (86) 80113-2 . PMID 3940901 . S2CID 21907373 .
- ^ Marshall GR, Feng JA, Kuster DJ (2008). «Вернуться в будущее: рибонуклеаза А». Биополимеры . 90 (3): 259–77. doi : 10.1002/bip.20845 . PMID 17868092 . S2CID 2905312 .
- ^ Нараянан С., Бернард Д.Н., Бафна К., Ганье Д., Ченнубхотла С.С., Дусет Н., Агарвал П.К. (март 2018). «Сохранение динамики, связанная с биологической функцией в суперсемействе фермента» . Структура 26 (3): 426–436. doi : 10.1016/j.str.2018.01.015 . PMC 5842143 . PMID 29478822 .
- ^ Розенберг Х.Ф., Тенен Д.Г., Акерман С.Дж. (1989). «Молекулярное клонирование эозинофильного нейротоксина, происходящего из человека: член семейства генов рибонуклеазы» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 86 (12): 4460–4464. Bibcode : 1989pnas ... 86.4460r . doi : 10.1073/pnas.86.12.4460 . PMC 287289 . PMID 2734298 .
- ^ Hofsteenge J, Matthies R, Stone Sr (1989). «Первичная структура рибонуклеазы из печени свиньи, нового члена суперсемейства рибонуклеазы». Биохимия . 28 (25): 9806–9813. doi : 10.1021/bi00451a040 . PMID 2611266 .
- ^ Розенберг Х.Ф., Акерман С.Дж., Тенен Д.Г. (1989). «Эозинофильный катионный белок человека. Молекулярное клонирование цитотоксина и гельминтотоксина с активностью рибонуклеазы» . J. Exp. Медик 170 (1): 163–176. doi : 10.1084/jem.170.1.163 . PMC 2189377 . PMID 2473157 .
- ^ Рейнс Р.Т. (1998). "Рибонуклеаза А". Химический Преподобный 98 (3): 1045–1066. doi : 10.1021/cr960427h . PMID 11848924 .
- ^ Гаур, D; Swaminathan, S; Батра, JK (6 июля 2001 г.). «Взаимодействие рибонуклеазы поджелудочной железы человека с ингибитором рибонуклеазы человека. Генерация резистентных к ингибиторам цитотоксических вариантов» . Журнал биологической химии . 276 (27): 24978–84. doi : 10.1074/jbc.m102440200 . PMID 11342552 .
- ^ Саксена, SK; Rybak, SM; Винклер, G; Мид, HM; McGray, P; Youle, RJ; Акерман, EJ (5 ноября 1991 г.). «Сравнение РНКаз и токсинов при инъекции в ооциты Xenopus» . Журнал биологической химии . 266 (31): 21208–14. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 54842-0 . PMID 1939163 .
- ^ Lee JE, Raines RT (2008). «Рибонуклеазы как новые химиотерапевтические средства: пример ранпирназы» . Биодруги . 22 (1): 53–58. doi : 10.2165/0006303030822010-00006 . PMC 2802594 . PMID 18215091 .
- ^ «Годовой отчет Alfacell 2009» (PDF) . Получено 2 февраля 2015 года .
