Семейство панкреатических рибонуклеаз
| Панкреатическая рибонуклеаза | |||
|---|---|---|---|
 Структура РНКазы А | |||
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 4.6.1.18 | ||
| Номер CAS. | 9001-99-4 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
| Панкреатическая рибонуклеаза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | РНКазаА | ||
| Пфам | PF00074 | ||
| ИнтерПро | ИПР001427 | ||
| УМНЫЙ | SM00092 | ||
| PROSITE | PDOC00118 | ||
| |||
Семейство панкреатических рибонуклеаз ( EC 4.6.1.18 , РНКаза , РНКаза I , РНКаза A , панкреатическая РНКаза , рибонуклеаза I , эндорибонуклеаза I , рибонуклеиновая фосфатаза , щелочная рибонуклеаза , рибонуклеаза , гликопротеины гена S , щелочная рибонуклеаза Ceratitis capitata , SLSG глик опротеины , локус гена S специфические гликопротеины , S-генотип-ассоциированные гликопротеины , рибонуклеат-3'-пиримидиноолигонуклеотидогидролаза ) — надсемейство пиримидин -специфичных эндонуклеаз, обнаруженных в большом количестве в поджелудочной железе некоторых млекопитающих и некоторых рептилий . [ 1 ]
В частности, ферменты участвуют в эндонуклеолитическом расщеплении 3'-фосфомононуклеотидов и 3'-фосфоолигонуклеотидов, оканчивающихся на CP или UP, с 2',3'-циклическими фосфатными промежуточными соединениями. Рибонуклеаза может раскручивать спираль РНК , образуя комплекс с одноцепочечной РНК; комплекс возникает в результате протяженного многосайтового катион-анионного взаимодействия между лизиновыми и аргининовыми остатками фермента и фосфатными группами нуклеотидов.
Известные члены семьи
[ редактировать ]Рибонуклеаза бычьей поджелудочной железы является наиболее изученным членом семейства и служила модельной системой в работах, связанных со сворачиванием белков , образованием дисульфидных связей , кристаллографией и спектроскопией белков , а также динамикой белков . [ 2 ] Геном человека содержит 8 генов, которые имеют общую структуру и функцию с рибонуклеазой поджелудочной железы крупного рогатого скота, а также 5 дополнительных псевдогенов. Структура и динамика этих ферментов связаны с их разнообразными биологическими функциями. [ 3 ]
Другие белки, принадлежащие к суперсемейству панкреатических рибонуклеаз, включают: бычьи семенные пузырьки и рибонуклеазы головного мозга; несекреторные рибонуклеазы почек; [ 4 ] рибонуклеазы печеночного типа; [ 5 ] ангиогенин , индуцирующий васкуляризацию нормальных и злокачественных тканей; катионный белок эозинофилов , [ 6 ] цитотоксин и гельминтотоксин с рибонуклеазной активностью; и рибонуклеаза печени лягушки и лектин, связывающий сиаловую кислоту лягушки. Последовательность панкреатических рибонуклеаз содержит четыре консервативные дисульфидные связи и три аминокислотных остатка, участвующих в каталитической активности. [ 7 ]
Человеческие гены
[ редактировать ]человека Гены , кодирующие белки, содержащие этот домен, включают:
Цитотоксичность
[ редактировать ]Некоторые члены семейства панкреатических рибонуклеаз обладают цитотоксическим действием. Клетки млекопитающих защищены от этих воздействий благодаря чрезвычайно высокому сродству к ингибитору рибонуклеазы (РИ), который защищает клеточную РНК от деградации рибонуклеазами поджелудочной железы. [ 8 ] Рибонуклеазы поджелудочной железы, не ингибируемые RI, примерно так же токсичны, как альфа-сарцин , дифтерийный токсин или рицин . [ 9 ]
Две панкреатические рибонуклеазы, выделенные из ооцитов северной леопардовой лягушки , - амфиназа и ранпирназа - не ингибируются РИ и проявляют дифференциальную цитотоксичность в отношении опухолевых клеток. [ 10 ] Ранпирназа изучалась в рамках III фазы клинического исследования в качестве кандидата на лечение мезотелиомы , но исследование не продемонстрировало статистической значимости по отношению к первичным конечным точкам. [ 11 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Бейнтема Дж. Дж., ван дер Лаан Дж. М. (1986). «Сравнение структуры рибонуклеазы поджелудочной железы черепахи со структурой рибонуклеазы млекопитающих» . ФЭБС Летт . 194 (2): 338–343. дои : 10.1016/0014-5793(86)80113-2 . ПМИД 3940901 . S2CID 21907373 .
- ^ Маршалл Г.Р., Фэн Дж.А., Кастер DJ (2008). «Назад в будущее: рибонуклеаза А». Биополимеры . 90 (3): 259–77. дои : 10.1002/bip.20845 . ПМИД 17868092 . S2CID 2905312 .
- ^ Нарайанан С., Бернар Д.Н., Бафна К., Ганье Д., Ченнубхотла К.С., Дусе Н., Агарвал П.К. (март 2018 г.). «Сохранение динамики, связанной с биологической функцией в суперсемействе ферментов» . Структура . 26 (3): 426–436. doi : 10.1016/j.str.2018.01.015 . ПМЦ 5842143 . ПМИД 29478822 .
- ^ Розенберг Х.Ф., Тенен Д.Г., Акерман С.Дж. (1989). «Молекулярное клонирование нейротоксина, полученного из эозинофилов человека: члена семейства генов рибонуклеазы» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 86 (12): 4460–4464. Бибкод : 1989PNAS...86.4460R . дои : 10.1073/pnas.86.12.4460 . ПМЦ 287289 . ПМИД 2734298 .
- ^ Хофстиндж Дж., Мэттис Р., Стоун С.Р. (1989). «Первичная структура рибонуклеазы из печени свиньи, нового члена суперсемейства рибонуклеаз». Биохимия . 28 (25): 9806–9813. дои : 10.1021/bi00451a040 . ПМИД 2611266 .
- ^ Розенберг Х.Ф., Акерман С.Дж., Тенен Д.Г. (1989). «Катионный белок эозинофилов человека. Молекулярное клонирование цитотоксина и гельминтотоксина с рибонуклеазной активностью» . Дж. Эксп. Мед . 170 (1): 163–176. дои : 10.1084/jem.170.1.163 . ПМК 2189377 . ПМИД 2473157 .
- ^ Рейнс РТ (1998). «Рибонуклеаза А». хим. Преподобный . 98 (3): 1045–1066. дои : 10.1021/cr960427h . ПМИД 11848924 .
- ^ Гаур, Д; Сваминатан, С; Батра, Дж. К. (6 июля 2001 г.). «Взаимодействие панкреатической рибонуклеазы человека с ингибитором рибонуклеазы человека. Генерация устойчивых к ингибитору цитотоксических вариантов» . Журнал биологической химии . 276 (27): 24978–84. дои : 10.1074/jbc.m102440200 . ПМИД 11342552 .
- ^ Саксена, СК; Рыбак С.М.; Винклер, Г; Мид, HM; МакГрей, П; Юл, Р.Дж.; Акерман, Э.Дж. (5 ноября 1991 г.). «Сравнение РНКаз и токсинов при инъекции в ооциты Xenopus» . Журнал биологической химии . 266 (31): 21208–14. дои : 10.1016/S0021-9258(18)54842-0 . ПМИД 1939163 .
- ^ Ли Дж.Э., Рейнс RT (2008). «Рибонуклеазы как новые химиотерапевтические средства: пример ранпирназы» . Биопрепараты . 22 (1): 53–58. дои : 10.2165/00063030-200822010-00006 . ПМЦ 2802594 . ПМИД 18215091 .
- ^ «Годовой отчет Alfacell за 2009 год» (PDF) . Проверено 2 февраля 2015 г.
