Фосфолипаза D 1
ПЛД1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | PLD1 , фосфолипаза D1, CVDD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 602382 ; МГИ : 109585 ; Гомологен : 116234 ; Генные карты : PLD1 ; ОМА : PLD1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Фосфолипаза D1 ( PLD1) — фермент , который у человека кодируется PLD1 геном . [ 5 ] [ 6 ] хотя аналоги встречаются у растений, грибов, прокариот и даже вирусов. [ 7 ]
История
[ редактировать ]Возможность PLD1 была впервые упомянута в 1947 году авторами Ханаханом и Чайковым из Беркли при описании фермента моркови, который мог «[расщеплять] холин от фосфолипидов ». [ 8 ] PLD был впервые получен у млекопитающих в 1975 году Сайто и Канфером, которые отметили его активность у крыс. [ 9 ] PLD был впервые клонирован из HeLa клеток кДНК в 1995 году, а PLD1 млекопитающих был впервые клонирован из крысы в 1997 году. [ 7 ]
Функция
[ редактировать ]Фосфатидилхолин (PC)-специфичные фосфолипазы D (PLD) EC 3.1.4.4 катализируют гидролиз PC с образованием фосфатидной кислоты (PA) и холина. Ряд агонистов, действующих через рецепторы, связанные с G-белком , и рецепторные тирозинкиназы, стимулируют этот гидролиз. PC-специфическая активность PLD участвует во многих клеточных путях, включая мембранный транспорт , передачу сигнала , коагуляцию тромбоцитов , митоз , апоптоз и создание цитоплазматических липидных капель. [ 6 ] [ 7 ] [ 10 ] [ 11 ]
Мембранный трафик
[ редактировать ]Было показано, что PLD1 связывается с плазматической мембраной , поздней эндосомой , [ 12 ] ранняя эндосома и аппарат Гольджи . [ 7 ] [ 9 ] Есть доказательства того, что PA способен способствовать отрицательной кривизне мембраны, поскольку его головная группа меньше, чем у многих других липидов. [ 7 ] Один эксперимент с нокаутом PLD1 показал значительное снижение количества событий экзоцитотического слияния, что указывает на важную роль в экзоцитозе. [ 13 ]
Преобразование сигнала
[ редактировать ]PLD1 может играть роль в некоторых клетках в эндоцитозе сигнальных рецепторов или экзоцитозе сигнальных молекул. Например, один эксперимент на В-клетках показал, что ограничение PLD1 приводит к значительному снижению эндоцитоза рецептора В-клеток. [ 12 ] Другой эксперимент показал, что нокаут PLD1 может препятствовать способности мышей секретировать катехоламины — молекулы, которые необходимы для везикулярной коммуникации по всему телу. [ 13 ]
Структура
[ редактировать ]PLD1 млекопитающих имеет несколько доменов для активаторов, ингибиторов и катализа, которые он разделяет с PLD2. Домены как для активации, так и для ингибирования называются доменами гомологичности phox (PX) и гомологичности плекстрина (PH). Каталитический домен состоит из двух областей HKD, названных так в честь трех аминокислот, играющих ключевую роль в катализе. Эти домены консервативны у многих организмов. [ 7 ] [ 9 ] Существует два сплайсинговых варианта белка, PLD1a и PLD1b, но, похоже, они не локализуются по-разному. [ 7 ]
Приложения
[ редактировать ]Болезнь Альцгеймера : PA, который частично продуцируется PLD1, по-видимому, участвует в движении β-амилоида, который может предшествовать амилоидогенезу. [ 14 ]
Рак : некоторые опухоли крыс с доминантно-отрицательным PLD, по-видимому, не образуют новых колоний или опухолей. [ 7 ] [ 14 ]
Тромбоз : мыши с нокаутом PLD, по-видимому, имеют уменьшенную окклюзию, что компенсирует тромбоз. [ 7 ]
Диабет II типа : уровень белка PED/PEA15 часто повышается у пациентов с диабетом II типа, тем самым повышая активность PLD1 и, в свою очередь, ослабляя инсулин. [ 7 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что фосфолипаза D1 взаимодействует с:
Ингибиторы
[ редактировать ]- Кальфостин-с , ингибитор [ 7 ]
- VU-0359595: 1700-кратная селективность по сравнению с фосфолипазой D2 , IC 50 = 3,7 нМ. [ 24 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000075651 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027695 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Пак Ш., Чун Ю.Х., Рю Ш., Су П.Г., Ким Х (февраль 1999 г.). «Отнесение человеческого PLD1 к полосе хромосомы человека 3q26 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика . 82 (3–4): 224. дои : 10.1159/000015105 . ПМИД 9858822 . S2CID 46791637 .
- ^ Jump up to: а б Хаммонд С.М., Альтшуллер Ю.М., Сунг Т.К., Радж С.А., Роуз К., Энгебрехт Дж. и др. (декабрь 1995 г.). «Фосфатидилхолин-специфическая фосфолипаза D, активируемая фактором АДФ-рибозилирования человека, определяет новое и высококонсервативное семейство генов» . Журнал биологической химии . 270 (50): 29640–3. дои : 10.1074/jbc.270.50.29640 . ПМИД 8530346 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к Селви П.Е., Лавьери Р.Р., Линдсли К.В., Браун Х.А. (октябрь 2011 г.). «Фосфолипаза D: энзимология, функциональность и химическая модуляция» . Химические обзоры . 111 (10): 6064–119. дои : 10.1021/cr200296t . ПМЦ 3233269 . ПМИД 21936578 .
- ^ Ханахан DJ, Чайкофф И.Л. (апрель 1947 г.). «Фосфорсодержащие липиды моркови» . Журнал биологической химии . 168 (1): 233–40. дои : 10.1016/S0021-9258(17)35110-4 . ПМИД 20291081 .
- ^ Jump up to: а б с Дженкинс Г.М., Фроман М.А. (октябрь 2005 г.). «Фосфолипаза D: липидоцентрический обзор» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 62 (19–20): 2305–16. дои : 10.1007/s00018-005-5195-z . ПМЦ 11139095 . ПМИД 16143829 . S2CID 26447185 .
- ^ «Ген Энтреза: фосфолипаза D1 PLD1, специфичная для фосфатидилхолина» .
- ^ Андерссон Л., Бострем П., Эриксон Дж., Рутберг М., Магнуссон Б., Марчезан Д. и др. (июнь 2006 г.). «PLD1 и ERK2 регулируют образование цитозольных липидных капель» . Журнал клеточной науки . 119 (Часть 11): 2246–57. дои : 10.1242/jcs.02941 . ПМИД 16723731 . S2CID 1628874 .
- ^ Jump up to: а б Дональдсон Дж. Г. (сентябрь 2009 г.). «Фосфолипаза D в эндоцитозе и путях эндосомальной рециркуляции» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1791 (9): 845–9. дои : 10.1016/j.bbalip.2009.05.011 . ПМК 2731818 . ПМИД 19540357 .
- ^ Jump up to: а б Танги Э., Косте де Баньо П., Кассас Н., Аммар М.Р., Ван К., Хэберле А.М. и др. (август 2020 г.). «Моно- и полиненасыщенная фосфатидная кислота регулирует отдельные этапы регулируемого экзоцитоза в нейроэндокринных клетках» . Отчеты по ячейкам . 32 (7): 108026. doi : 10.1016/j.celrep.2020.108026 . ПМИД 32814056 .
- ^ Jump up to: а б Тхакур Р., Найк А., Панда А., Рагху П. (04.06.2019). «Регуляция обмена мембран с помощью фосфатидной кислоты: клеточные функции и последствия заболеваний» . Границы клеточной биологии и биологии развития . 7 : 83. дои : 10.3389/fcell.2019.00083 . ПМК 6559011 . ПМИД 31231646 .
- ^ Ан Б.Х., Рим Х., Ким С.Ю., Сунг Ю.М., Ли М.Ю., Чхве Дж.Ю. и др. (апрель 2002 г.). «Альфа-синуклеин взаимодействует с изоферментами фосфолипазы D и ингибирует индуцированную перванадатом активацию фосфолипазы D в клетках эмбриональной почки-293 человека» . Журнал биологической химии . 277 (14): 12334–42. дои : 10.1074/jbc.M110414200 . ПМИД 11821392 .
- ^ Jump up to: а б Ли С., Ким С.Р., Чанг Дж.К., Фроман М.А., Килиманн М.В., Ри С.Г. (июнь 2000 г.). «Ингибирование фосфолипазы D амфифизинами» . Журнал биологической химии . 275 (25): 18751–8. дои : 10.1074/jbc.M001695200 . ПМИД 10764771 .
- ^ Уокер С.Дж., Ву У.Дж., Серионе Р.А., Браун Х.А. (май 2000 г.). «Активация фосфолипазы D1 с помощью Cdc42 требует вставки области Rho» . Журнал биологической химии . 275 (21): 15665–8. дои : 10.1074/jbc.M000076200 . PMID 10747870 .
- ^ Чжан Ю., Редина О., Альтшуллер Ю.М., Ямадзаки М., Рамос Дж., Хнейвейс Х. и др. (ноябрь 2000 г.). «Регуляция экспрессии фосфолипазы D1 и D2 с помощью PEA-15, нового белка, который с ними взаимодействует» . Журнал биологической химии . 275 (45): 35224–32. дои : 10.1074/jbc.M003329200 . ПМИД 10926929 .
- ^ Оиси К., Такахаси М., Мукаи Х., Банно Ю., Накашима С., Канахо Ю. и др. (май 2001 г.). «PKN регулирует фосфолипазу D1 посредством прямого взаимодействия» . Журнал биологической химии . 276 (21): 18096–101. дои : 10.1074/jbc.M010646200 . ПМИД 11259428 .
- ^ Луо JQ, Лю X, Хаммонд С.М., Колли В.К., Фейг Л.А., Фроман М.А. и др. (июнь 1997 г.). «RalA напрямую взаимодействует с Arf-зависимой PIP2-зависимой фосфолипазой D1» . Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 235 (3): 854–9. дои : 10.1006/bbrc.1997.6793 . ПМИД 9207251 .
- ^ Ким Дж.Х., Ли С.Д., Хан Дж.М., Ли Т.Г., Ким Ю., Пак Дж.Б. и др. (июль 1998 г.). «Активация фосфолипазы D1 путем прямого взаимодействия с фактором АДФ-рибозилирования 1 и RalA». Письма ФЭБС . 430 (3): 231–5. дои : 10.1016/s0014-5793(98)00661-9 . ПМИД 9688545 . S2CID 36075513 .
- ^ Гент Х., Шмидт М., Герхард Р., Акториес К., Джаст I (февраль 2003 г.). «Активация фосфолипазы D1 АДФ-рибозилированным RhoA». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 302 (1): 127–32. дои : 10.1016/s0006-291x(03)00112-8 . ПМИД 12593858 .
- ^ Кай С., Экстон Дж. Х. (май 2001 г.). «Определение сайтов взаимодействия фосфолипазы D1 с RhoA» . Биохимический журнал . 355 (Часть 3): 779–85. дои : 10.1042/bj3550779 . ПМЦ 1221795 . ПМИД 11311142 .
- ^ Льюис Дж.А., Скотт С.А., Лавьери Р., Бак Дж.Р., Селви П.Е., Ступс С.Л. и др. (апрель 2009 г.). «Разработка и синтез изоформ-селективных ингибиторов фосфолипазы D (PLD). Часть I: Влияние альтернативных галогенированных привилегированных структур на специфичность PLD1» . Письма по биоорганической и медицинской химии . 19 (7): 1916–20. дои : 10.1016/j.bmcl.2009.02.057 . ПМЦ 3791604 . ПМИД 19268584 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Хаммонд С.М., Дженко Дж.М., Накашима С., Кадвалладер К., Гу К., Кук С. и др. (февраль 1997 г.). «Характеристика двух попеременно сплайсированных форм фосфолипазы D1. Активация очищенных ферментов фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфатом, фактором АДФ-рибозилирования и мономерными GTP-связывающими белками семейства Rho и протеинкиназой C-альфа» . Журнал биологической химии . 272 (6): 3860–8. дои : 10.1074/jbc.272.6.3860 . ПМИД 9013646 .
- Луо JQ, Лю X, Хаммонд С.М., Колли В.К., Фейг Л.А., Фроман М.А. и др. (июнь 1997 г.). «RalA напрямую взаимодействует с Arf-зависимой PIP2-зависимой фосфолипазой D1» . Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 235 (3): 854–9. дои : 10.1006/bbrc.1997.6793 . ПМИД 9207251 .
- Колли В.К., Сунг Т.С., Ролл Р., Дженко Дж., Хаммонд С.М., Альтшуллер Ю. и др. (март 1997 г.). «Фосфолипаза D2, отдельная изоформа фосфолипазы D с новыми регуляторными свойствами, которая провоцирует реорганизацию цитоскелета» . Современная биология . 7 (3): 191–201. Бибкод : 1997CBio....7..191C . дои : 10.1016/S0960-9822(97)70090-3 . ПМИД 9395408 . S2CID 14008613 .
- Бэ К.Д., Мин Д.С., Флеминг И.Н., Экстон Дж.Х. (май 1998 г.). «Определение мест взаимодействия на малом G-белке RhoA для фосфолипазы D» . Журнал биологической химии . 273 (19): 11596–604. дои : 10.1074/jbc.273.19.11596 . ПМИД 9565577 .
- Лопес I, Арнольд Р.С., Ламбет Дж.Д. (май 1998 г.). «Клонирование и первоначальная характеристика человеческой фосфолипазы D2 (hPLD2). Фактор АДФ-рибозилирования регулирует hPLD2» . Журнал биологической химии . 273 (21): 12846–52. дои : 10.1074/jbc.273.21.12846 . ПМИД 9582313 .
- Ким Дж.Х., Ли С.Д., Хан Дж.М., Ли Т.Г., Ким Ю., Пак Дж.Б. и др. (июль 1998 г.). «Активация фосфолипазы D1 путем прямого взаимодействия с фактором АДФ-рибозилирования 1 и RalA». Письма ФЭБС . 430 (3): 231–5. дои : 10.1016/S0014-5793(98)00661-9 . ПМИД 9688545 . S2CID 36075513 .
- Стид П.М., Кларк К.Л., Бояр У.К., диджей Ласала (октябрь 1998 г.). «Характеристика человеческого PLD2 и анализ вариантов сплайсинга изоформ PLD» . Журнал ФАСЭБ . 12 (13): 1309–17. дои : 10.1096/fasebj.12.13.1309 . ПМИД 9761774 . S2CID 27394831 .
- Ким Дж.Х., Хан Дж.М., Ли С., Ким Ю., Ли Т.Г., Пак Дж.Б. и др. (март 1999 г.). «Фосфолипаза D1 в кавеолах: регуляция протеинкиназой Кальфа и кавеолином-1». Биохимия . 38 (12): 3763–9. дои : 10.1021/bi982478+ . ПМИД 10090765 .
- Ким Ю, Хан Дж.М., Пак Дж.Б., Ли С.Д., О Ю.С., Чунг С. и др. (август 1999 г.). «Фосфорилирование и активация фосфолипазы D1 протеинкиназой C in vivo: определение множественных сайтов фосфорилирования». Биохимия . 38 (32): 10344–51. дои : 10.1021/bi990579h . ПМИД 10441128 .
- Уокер С.Дж., Ву У.Дж., Серионе Р.А., Браун Х.А. (май 2000 г.). «Активация фосфолипазы D1 с помощью Cdc42 требует вставки области Rho» . Журнал биологической химии . 275 (21): 15665–8. дои : 10.1074/jbc.M000076200 . PMID 10747870 .
- Сузуки Дж., Ямазаки Ю., Ли Дж., Казиро Ю., Койде Х., Гуан Л. (июль 2000 г.). «Участие Ras и Ral в хемотаксической миграции скелетных миобластов» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (13): 4658–65. дои : 10.1128/MCB.20.13.4658-4665.2000 . ПМЦ 85875 . ПМИД 10848592 .
- Чжан Ю., Редина О., Альтшуллер Ю.М., Ямадзаки М., Рамос Дж., Хнейвейс Х. и др. (ноябрь 2000 г.). «Регуляция экспрессии фосфолипазы D1 и D2 с помощью PEA-15, нового белка, который с ними взаимодействует» . Журнал биологической химии . 275 (45): 35224–32. дои : 10.1074/jbc.M003329200 . ПМИД 10926929 .
- Дивеча Н., Руфс М., Холстед Дж.Р., Д'Андреа С., Фернандес-Борга М., Омен Л. и др. (октябрь 2000 г.). «Взаимодействие PIPкиназы типа Ialpha с фосфолипазой D: роль локальной генерации фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфата в регуляции активности PLD2» . Журнал ЭМБО . 19 (20): 5440–9. дои : 10.1093/emboj/19.20.5440 . ПМК 314009 . ПМИД 11032811 .
- Оиси К., Такахаси М., Мукаи Х., Банно Ю., Накашима С., Канахо Ю. и др. (май 2001 г.). «PKN регулирует фосфолипазу D1 посредством прямого взаимодействия» . Журнал биологической химии . 276 (21): 18096–101. дои : 10.1074/jbc.M010646200 . ПМИД 11259428 .
- Кай С., Экстон Дж. Х. (май 2001 г.). «Определение сайтов взаимодействия фосфолипазы D1 с RhoA» . Биохимический журнал . 355 (Часть 3): 779–85. дои : 10.1042/bj3550779 . ПМЦ 1221795 . ПМИД 11311142 .
- Ли С., Пак Дж.Б., Ким Дж.Х., Ким Ю., Ким Дж.Х., Шин К.Дж. и др. (июль 2001 г.). «Актин напрямую взаимодействует с фосфолипазой D, подавляя ее активность» . Журнал биологической химии . 276 (30): 28252–60. дои : 10.1074/jbc.M008521200 . ПМИД 11373276 .
- Хьюз В.Е., Паркер П.Дж. (июнь 2001 г.). «Эндосомальная локализация фосфолипазы D 1a и 1b определяется С-концами белков и не зависит от активности» . Биохимический журнал . 356 (Часть 3): 727–36. дои : 10.1042/0264-6021:3560727 . ПМЦ 1221899 . ПМИД 11389680 .
- Мин Д.С., Ан Б.Х., Джо Ю.Х. (июнь 2001 г.). «Дифференциальное фосфорилирование тирозина изоферментов фосфолипазы D перекисью водорода и эпидермальным фактором роста в клетках эпидермоидной карциномы A431» . Молекулы и клетки . 11 (3): 369–78. дои : 10.1016/S1016-8478(23)17049-X . ПМИД 11459228 .