✖


Jump to content

Онтология (информатика)

(Перенаправлено из Онтологий (информатика) )
Информатика
Общие аспекты
Связанные поля и подполя

В информатике онтология включает в себя представление, формальное наименование и определения категорий, свойств и отношений между понятиями, данными или сущностями, которые относятся к одной, многим или всем областям дискурса . Проще говоря, онтология — это способ показать свойства предметной области и то, как они связаны между собой, путем определения набора терминов и выражений отношений, которые представляют объекты в этой предметной области. Область изучения онтологий, понимаемых таким образом, иногда называют прикладной онтологией . [1]

Каждая академическая дисциплина или область, создавая свою терминологию, тем самым закладывает основу для онтологии. Каждый использует онтологические предположения для создания явных теорий, исследований и приложений. Улучшенные онтологии могут улучшить решение проблем в этой области, совместимость систем данных и возможность обнаружения данных. Перевод научных статей в каждой области становится проблемой, которая упрощается, когда эксперты из разных стран поддерживают контролируемый словарный запас на жаргона каждом из своих языков. [2] Например, определение и онтология экономики являются первоочередной задачей марксистской экономической теории . [3] но и в других областях экономики . [4] Пример экономики, опирающейся на информатику, возникает в тех случаях, когда моделирование или модель предназначены для принятия экономических решений, например, для определения того, какие капитальные активы подвергаются риску и в какой степени (см. Управление рисками ).

в онтологиях как в информатике, так и в философии, Что общего — это попытка представить сущности, включая как объекты, так и события, со всеми их взаимозависимыми свойствами и отношениями, в соответствии с системой категорий. В обеих областях ведется значительная работа по проблемам разработки онтологий (например, Куайн и Крипке в философии, Сова и Гуарино в информатике). [5] и дебаты о том, в какой степени нормативная возможна онтология (например, фундаментализм и когерентизм в философии, BFO и Cyc в искусственном интеллекте).

Некоторые считают прикладную онтологию преемником предшествующих работ в области философии. Однако многие текущие усилия больше связаны с созданием контролируемых словарей узких областей, чем с философскими основными принципами или с такими вопросами, как способ существования фиксированных сущностей или могут ли устойчивые объекты (например, пердурантизм и эндюрантизм ) быть онтологически более первичными, чем процессы. . Искусственный интеллект по-прежнему уделяет значительное внимание прикладной онтологии в таких областях, как обработка естественного языка в машинном переводе и представление знаний , но редакторы онтологий часто используются в ряде областей, включая биомедицинскую информатику, [6] промышленность. [7] В таких усилиях часто используются инструменты редактирования онтологий, такие как Protégé . [8]

Онтология в философии

[ редактировать ]
Дополнительная информация: Метафизика § История.

Онтология является отраслью философии и пересекает такие области, как метафизика , эпистемология и философия языка , поскольку она рассматривает, как знание, язык и восприятие связаны с природой реальности. Метафизика занимается такими вопросами, как «что существует?» и «Какова природа реальности?». Метафизика, одна из пяти традиционных ветвей философии, занимается исследованием существования через свойства, сущности и отношения, например, между частностями и универсалиями , внутренними и внешними свойствами или сущностью и существованием . Метафизика была постоянной темой дискуссий со времен письменной истории.

Этимология

[ редактировать ]
Дополнительная информация: Онтология § Этимология.

Сложное . слово онтология объединяется в онто- , от греческого ὄν , он ( род. ὄντος, онтос ; то, что есть», что является настоящего времени причастием глагола ), т.е. « бытие εἰμί , eimí , т.е. «быть, я есмь» ", и -λογία , -logia , т.е. "логический дискурс", см. классические составные слова для этого типа словообразования. [9] [10]

Хотя этимология греческая, старейшая сохранившаяся запись самого слова, неолатинская форма онтологии , появилась в 1606 году в работе «Огдоас Схоластика» Якоба Лорхарда ( Лорхардус ) и в 1613 году в «Философском лексиконе» Рудольфа Гёккеля ( Гоклениус ). [11]

Первое упоминание онтологии на английском языке , зафиксированное OED ( Оксфордский словарь английского языка , онлайн-издание, 2008 г.), произошло в «Archeologia Philosophica Nova» или «Новые принципы философии» Гидеона Харви .

Формальная онтология

[ редактировать ]
Основная статья: Формальная онтология
Дополнительная информация: Искусственный интеллект § История.

С середины 1970-х годов исследователи в области искусственного интеллекта (ИИ) осознали, что инженерия знаний является ключом к созданию больших и мощных систем ИИ. [ нужна ссылка ] . Исследователи искусственного интеллекта утверждали, что они могут создавать новые онтологии в виде вычислительных моделей , которые позволяют осуществлять определенные виды автоматизированных рассуждений был лишь , но успех незначительным . В 1980-х годах сообщество ИИ начало использовать термин «онтология» для обозначения как теории моделируемого мира, так и компонента систем, основанных на знаниях . В частности, Дэвид Пауэрс ввел в понятие ИИ слово «онтология» для обозначения реального мира или роботизированного заземления. [12] [13] [14] публикация в 1990 году обзоров литературы, в которых особое внимание уделяется обоснованной онтологии, в связи с набором статей для Летнего симпозиума AAAI по машинному обучению естественного языка и онтологии с расширенной версией, опубликованной в бюллетене SIGART и включенной в качестве предисловия к материалам. [15] Некоторые исследователи, черпая вдохновение из философских онтологий, рассматривали вычислительную онтологию как разновидность прикладной философии. [16]

«К принципам проектирования онтологий, используемых для обмена знаниями» В 1993 году широко цитируемая веб-страница и статья Тома Грубера [17] использовал онтологию как технический термин в информатике, тесно связанный с более ранней идеей семантических сетей и таксономий . Грубер ввел этот термин как спецификацию концептуализации :

Онтология — это описание (например, формальная спецификация программы) концепций и отношений, которые формально могут существовать для агента или сообщества агентов. Это определение согласуется с использованием онтологии как набора определений понятий, но является более общим. И это слово имеет иной смысл, чем его использование в философии. [18]

Пытаясь дистанцировать онтологии от таксономий и аналогичных усилий по моделированию знаний , основанных на классах и наследовании , Грубер заявил (1993):

Онтологии часто приравниваются к таксономическим иерархиям классов, определениям классов и отношению включения , но онтологии не обязательно ограничиваются этими формами. Онтологии также не ограничиваются консервативными определениями – то есть определениями в традиционном логическом смысле, которые только вводят терминологию и не добавляют никаких знаний о мире. [19] Чтобы конкретизировать концептуализацию, необходимо сформулировать аксиомы , которые ограничивают возможные интерпретации определенных терминов. [20]

В уточнении определения Грубера Фейлмайр и Вёсс (2016) заявили: «Онтология - это формальная, явная спецификация общей концептуализации, которая характеризуется высокой семантической выразительностью, необходимой для повышенной сложности». [21]

Формальные компоненты онтологии

[ редактировать ]
Основная статья: Компоненты онтологии

Современные онтологии имеют много структурных сходств, независимо от языка, на котором они выражены. Большинство онтологий описывают индивидов (экземпляры), классы (концепции), атрибуты и отношения.

Типы

[ редактировать ]

Онтология предметной области

[ редактировать ]

Онтология предметной области (или онтология предметной области) представляет концепции, принадлежащие какой-либо сфере мира, например биологии или политике. Онтология каждой предметной области обычно моделирует определения терминов, специфичные для предметной области. Например, словесная карточка имеет много разных значений. Онтология области покера будет моделировать значение слова « игральная карта », тогда как онтология области компьютерного оборудования будет моделировать значения « перфокарта » и « видеокарта ».

Поскольку онтологии предметной области пишутся разными людьми, они представляют концепции очень специфическими и уникальными способами и часто несовместимы в рамках одного проекта. По мере расширения систем, основанных на онтологиях предметной области, им часто приходится объединять онтологии предметной области путем ручной настройки каждого объекта или использования комбинации слияния программного обеспечения и ручной настройки. Это представляет собой проблему для проектировщика онтологий. Различные онтологии в одной и той же области возникают из-за разных языков, различного предполагаемого использования онтологий и различного восприятия предметной области (в зависимости от культурного происхождения, образования, идеологии и т. д.). [ нужна ссылка ] .

В настоящее время объединение онтологий, не разработанных на основе общей верхней онтологии, является в значительной степени ручным процессом и, следовательно, трудоемким и дорогостоящим. Онтологии предметной области, которые используют одну и ту же верхнюю онтологию для предоставления набора базовых элементов, с помощью которых можно определить значения объектов онтологии предметной области, могут быть объединены с меньшими усилиями. Существуют исследования по обобщенным методам слияния онтологий, [22] но эта область исследований все еще продолжается, и недавно удалось увидеть, что проблему удалось обойти, используя несколько онтологий предметной области, использующих одну и ту же верхнюю онтологию, как OBO Foundry .

Верхняя онтология

[ редактировать ]
Основная статья: Верхняя онтология

Верхняя онтология (или базовая онтология) — это модель общих отношений и объектов, которые обычно применимы в широком диапазоне онтологий предметной области. Обычно он использует основной глоссарий , который охватывает термины и связанные с ними описания объектов, поскольку они используются в различных онтологиях соответствующих предметных областей.

Доступные для использования стандартизированные верхние онтологии включают BFO , метод BORO , Dublin Core , GFO , Cyc , SUMO , UMBEL и DOLCE . [23] [24] Некоторые считают WordNet онтологией верхнего уровня и используют его в качестве лингвистического инструмента для изучения онтологий предметной области. [25]

Гибридная онтология

[ редактировать ]

Онтология Геллиша является примером комбинации онтологии верхнего уровня и онтологии предметной области.

Визуализация

[ редактировать ]
Деталь Древа познания по мотивам Энциклопедии Дидро и Даламбера Кретьена Фредерика Гийома Рота
Информационное картографирование
Темы и поля
Подходы «узел-связь»
См. также

Обзор методов визуализации онтологий представлен Katifori et al. [26] Обновленный обзор методов и инструментов визуализации онтологий был опубликован Dudás et al. [27] Наиболее признанные методы визуализации онтологий, а именно визуализация дерева с отступом и графа, оценены Fu et al. [28] Визуальный язык для онтологий, представленных в OWL, определяется Визуальной нотацией для онтологий OWL (VOWL) . [29]

Инженерное дело

[ редактировать ]
Основная статья: Разработка онтологий

Проектирование онтологий (также называемое построением онтологий) — это набор задач, связанных с разработкой онтологий для конкретной предметной области. [30] Это подобласть инженерии знаний , которая изучает процесс разработки онтологий, жизненный цикл онтологий, методы и методологии построения онтологий, а также инструменты и языки, которые их поддерживают. [31] [32]

Проектирование онтологий направлено на то, чтобы сделать явными знания, содержащиеся в программных приложениях и организационных процедурах для конкретной области. Разработка онтологий предлагает направление для преодоления семантических препятствий, например, связанных с определениями бизнес-терминов и классов программного обеспечения. Известные проблемы, связанные с разработкой онтологий, включают:

  1. онтологии Обеспечение актуальности с учетом знаний предметной области и использования терминов.
  2. Обеспечение достаточной конкретики и концептуального охвата интересующей области, что сводит к минимуму проблему полноты контента.
  3. Обеспечение поддержки онтологией вариантов использования.

Редакторы

[ редактировать ]

Редакторы онтологий — это приложения, предназначенные для помощи в создании онтологий или манипулировании ими. Обычно редакторы онтологий используют один или несколько языков онтологий .

Аспекты редакторов онтологий включают: возможности визуальной навигации внутри модели знаний , механизмы вывода и извлечение информации ; поддержка модулей; импорт и экспорт иностранных языков представления знаний для сопоставления онтологий ; и поддержка мета-онтологий, таких как OWL-S , Dublin Core и т. д. [33]

Обучение

[ редактировать ]
Основная статья: Обучение онтологии

Обучение онтологии — это автоматическое или полуавтоматическое создание онтологий, включая извлечение терминов предметной области из текста на естественном языке. Поскольку построение онтологий вручную чрезвычайно трудоемко и занимает много времени, существует большая мотивация автоматизировать этот процесс. Извлечение информации и анализ текста были исследованы для автоматического связывания онтологий с документами, например, в контексте задач BioCreative. [34]

Исследовать

[ редактировать ]
Дополнительная информация: Эпистемология.

Эпистемологические предположения, которые в ходе исследования задаются вопросом: «Что вы знаете? Или «Откуда вы это знаете?», создают основу, которую исследователи используют при подходе к определенной теме или области потенциального исследования. Что касается принятия определенных истин, люди, проводящие академические исследования, должны понимать, что позволяет им начать построение теории. Проще говоря, эпистемологические предположения заставляют исследователей задаваться вопросом, как они приходят к имеющимся у них знаниям. [ нужна ссылка ]

Языки

[ редактировать ]
Основная статья: Язык онтологий

Язык онтологии — это формальный язык, используемый для кодирования онтологии. Существует ряд таких языков для онтологий, как собственных, так и основанных на стандартах:

  • Общий язык алгебраических спецификаций — это язык общих логических спецификаций, разработанный рабочей группой IFIP 1.3 «Основы системных спецификаций» и де-факто являющийся стандартным языком для спецификаций программного обеспечения. В настоящее время он применяется к спецификациям онтологий для обеспечения модульности и механизмов структурирования.
  • Общая логика — это стандарт ISO 24707, спецификация семейства языков онтологий, которые можно точно транслировать друг в друга.
  • Проект Cyc имеет собственный язык онтологии под названием CycL , основанный на исчислении предикатов первого порядка с некоторыми расширениями более высокого порядка.
  • DOGMA (Разработка методов и приложений, основанных на онтологии) использует подход моделирования, ориентированный на факты, для обеспечения более высокого уровня семантической стабильности.
  • Язык геллиш включает правила для собственного расширения и, таким образом, объединяет онтологию с языком онтологий.
  • IDEF5 — это метод разработки программного обеспечения для разработки и поддержки удобных и точных онтологий предметной области.
  • KIF — это синтаксис логики первого порядка , основанный на S-выражениях . SUO-KIF — это производная версия, поддерживающая предложенную верхнюю объединенную онтологию .
  • MOF и UML являются стандартами OMG.
  • Олог — это теоретико-категорный подход к онтологиям, в котором упор делается на переводы между онтологиями с использованием функторов .
  • OBO — язык, используемый для биологических и биомедицинских онтологий.
  • OntoUML — это онтологически обоснованный профиль UML для концептуального моделирования онтологий предметной области.
  • OWL — это язык для создания онтологических утверждений, разработанный как продолжение RDF и RDFS , а также более ранних проектов языка онтологий, включая OIL , DAML и DAML+OIL . OWL предназначен для использования во Всемирной паутине , и все его элементы (классы, свойства и отдельные лица) определяются как ресурсы RDF и идентифицируются URI .
  • Формат обмена правилами (RIF) и F-Logic объединяют онтологии и правила.
  • Язык проектирования семантических приложений (SADL) [35] отражает подмножество выразительности OWL , используя английский язык, введенный через Eclipse . подключаемый модуль
  • SBVR (Семантика бизнес-словарей и правил) — это стандарт OMG, принятый в промышленности для построения онтологий.
  • Проект TOVE , проект виртуального предприятия TOronto

Опубликованные примеры

[ редактировать ]
  • Арабская онтология — лингвистическая онтология для арабского языка, которую можно использовать как арабскую сеть Wordnet, но с онтологически чистым контентом. [36]
  • АУРУМ – Онтология информационной безопасности, [37] Онтология для обмена знаниями по информационной безопасности , позволяющая пользователям совместно понимать и расширять совокупность знаний предметной области. Это может служить основой для автоматизированного управления рисками информационной безопасности и соответствия требованиям.
  • BabelNet — очень большая многоязычная семантическая сеть и онтология, лексикализованная на многих языках.
  • Базовая формальная онтология , [38] формальная верхняя онтология, предназначенная для поддержки научных исследований
  • БиоПАКС, [39] онтология для обмена и взаимодействия данных биологических путей (клеточных процессов)
  • БМО, [40] Онтология модели электронного бизнеса, основанная на обзоре онтологий предприятия и литературы по бизнес-моделям.
  • ССБМО, [41] Онтология сильно устойчивой бизнес-модели, основанная на обзоре системной литературы по естественным и социальным наукам (включая бизнес). Включает критику и существенные расширения онтологии бизнес-модели (BMO).
  • CCO и GexKB, [42] Онтологии приложений (APO), которые объединяют различные типы знаний с онтологией клеточного цикла (CCO) и базой знаний по экспрессии генов (GexKB)
  • CContology (Онтология жалоб клиентов), [43] онтология электронного бизнеса для поддержки онлайн-управления жалобами клиентов
  • Концептуальная эталонная модель CIDOC , онтология культурного наследия. [44]
  • КОСМО, [45] фундаментальная онтология (текущая версия в OWL), предназначенная для хранения представлений всех примитивных концепций, необходимых для логического определения значений любой сущности предметной области. Он предназначен для использования в качестве базовой онтологии, которую можно использовать для преобразования представлений в других онтологиях или базах данных. Он начался как слияние основных элементов онтологий OpenCyc и SUMO и был дополнен другими элементами онтологии (типами, отношениями), чтобы включить представления всех слов в словаре Лонгмана, определяющем словарь .
  • Онтология компьютерных наук — автоматически генерируемая онтология тем исследований в области информатики.
  • Cyc , большая онтология основы для формального представления вселенной дискурса.
  • Онтология болезней , [46] предназначен для облегчения сопоставления заболеваний и связанных с ними состояний с конкретными медицинскими кодами
  • DOLCE , описательная онтология для лингвистической и когнитивной инженерии [23] [24]
  • Драмматика, онтология драмы [47]
  • Dublin Core — простая онтология для документов и публикаций.
  • Бизнес-онтология финансовой индустрии (FIBO), концептуальная онтология бизнеса для финансовой индустрии. [48]
  • Фундаментальные, основные и лингвистические онтологии [49]
  • Основополагающая модель анатомии , [50] онтология анатомии человека
  • Друг друга , онтология для описания людей, их деятельности и их отношений с другими людьми и объектами.
  • Генная онтология для геномики
  • Словарь английского языка Gellish — онтология, включающая словарь и таксономию, включающую верхнюю онтологию и нижнюю онтологию, ориентированную на промышленные и бизнес-приложения в области проектирования, технологий и закупок.
  • Геополитическая онтология — онтология, описывающая геополитическую информацию, созданная Продовольственной и сельскохозяйственной организацией (ФАО). Геополитическая онтология включает имена на нескольких языках (английском, французском, испанском, арабском, китайском, русском и итальянском); карты стандартных систем кодирования (UN, ISO, FAOSTAT, AGROVOC и др.); обеспечивает отношения между территориями (сухопутные границы, членство в группах и т. д.); и отслеживает исторические изменения. Кроме того, ФАО предоставляет веб-сервисы геополитической онтологии и средство создания модулей для загрузки модулей геополитической онтологии в различные форматы (RDF, XML и EXCEL). Дополнительную информацию см. в разделе «Профили стран ФАО» .
  • GAO (Общая автомобильная онтология) - онтология для автомобильной промышленности, включающая расширения «автомобиль». [51]
  • ЗОЛОТО, [52] Общая онтология лингвистического описания
  • ГУМ (Обобщенная верхняя модель), [53] лингвистически мотивированная онтология для посредничества между клиентскими системами и технологиями естественного языка
  • Группа ИДЕИ , [54] формальная онтология для архитектуры предприятия, разрабатываемая министерствами обороны Австралии, Канады, Великобритании и США.
  • база ссылок, [55] формальное представление биомедицинской области, основанное на базовой формальной онтологии.
  • LPL, язык шаблонов ориентиров [56]
  • Биопортал НЦБО, [57] биологические и биомедицинские онтологии и связанные с ними инструменты для поиска, просмотра и визуализации
  • Онтологии NIFSTD из Neuroscience Information Framework : модульный набор онтологий для области нейробиологии.
  • OBO-Edit, [58] браузер онтологий для большинства открытых биологических и биомедицинских онтологий.
  • ОБО Литейный завод , [59] набор совместимых эталонных онтологий в биологии и биомедицине
  • ОМНИБУС Онтология, [60] онтология обучения, преподавания и учебного дизайна
  • Онтология биомедицинских исследований — интегрированная онтология биологических и клинических исследований с открытым доступом.
  • ОНСТР, [61] Онтология для последующего скрининга новорожденных и трансляционных исследований, Совместная организация по интеграции данных последующего скрининга новорожденных, Университет Эмори, Атланта.
  • Онтология растений [62] для структур растений и стадий роста/развития и т. д.
  • POPE, Онтология Purdue для фармацевтической инженерии
  • ПРО, [63] Белковая онтология информационного ресурса по белкам, Джорджтаунский университет
  • ProbOnto , база знаний и онтология вероятностных распределений . [64] [65]
  • Таксономия программных абстракций [ нужна ссылка ]
  • Белковая онтология [66] для протеомики
  • RXNO Ontology для названий реакций в химии.
  • SCDO, Онтология серповидноклеточной анемии, [67] облегчает обмен данными и сотрудничество внутри сообщества SDC, среди других приложений (см. список на веб-сайте SCDO ).
  • Онтология последовательности , [68] для представления типов геномных признаков, обнаруженных в биологических последовательностях
  • SNOMED CT (Систематизированная номенклатура медицины – Клинические термины)
  • Предлагаемая верхняя объединенная онтология , [69] формальная верхняя онтология
  • Онтология системной биологии (SBO) для вычислительных моделей в биологии.
  • СЛАДКИЙ, [70] Семантическая сеть для терминологии Земли и окружающей среды
  • ССН/СОСА, [71] Онтология семантической сенсорной сети (SSN) и онтология датчиков, наблюдений, выборок и исполнительных механизмов (SOSA) представляют собой рекомендации W3C и стандарты OGC для описания датчиков и их наблюдений.
  • Онтология «Сокровище мысли»
  • TIME-ITEM , Темы для индексации медицинского образования
  • Уберон , [72] представляющие животных анатомические структуры
  • UMBEL , облегченная справочная структура из 20 000 классов предметных концепций и их отношений, полученная из OpenCyc.
  • WordNet — лексическая справочная система.
  • ЯМАТО, [73] Еще одна более продвинутая онтология верхнего уровня
  • YSO – Общая финская онтология

Проект сообщества W3C Linking Open Data координирует попытки объединить различные онтологии во всемирную семантическую сеть .

Библиотеки

[ редактировать ]

Развитие онтологий привело к появлению сервисов, предоставляющих списки или каталоги онтологий, называемых библиотеками онтологий.

Ниже приведены библиотеки онтологий, выбранных человеком.

  • ЦВЕТ [74] представляет собой открытый репозиторий онтологий первого порядка в Common Logic с формальными связями между онтологиями в репозитории.
  • Библиотека онтологий DAML [75] поддерживает наследие онтологий в DAML.
  • Портал шаблонов проектирования онтологий [76] — это вики-репозиторий повторно используемых компонентов и практик проектирования онтологий, а также поддерживающий список образцовых онтологий .
  • Библиотека онтологий Protégé [77] содержит набор онтологий OWL, Frame-based и других форматов.
  • СхемаWeb [78] — это каталог схем RDF, выраженных в RDFS, OWL и DAML+OIL.

Ниже приведены как каталоги, так и поисковые системы.

  • OBO Foundry — это набор совместимых эталонных онтологий в области биологии и биомедицины. [79] [80]
  • Биопортал (репозиторий онтологий НЦБО) [81]
  • Онтоселект [82] Библиотека онтологий предлагает аналогичные услуги для онтологий RDF/S, DAML и OWL.
  • Онтарио [83] представляет собой «доступный для поиска и просмотра каталог семантических веб-данных», ориентированный на словари RDF с онтологиями OWL. (Примечание: проект «приостановлен» с 2004 г.).
  • Swoogle — это каталог и поисковая система для всех ресурсов RDF, доступных в Интернете, включая онтологии.
  • Инициатива открытого репозитория онтологий [84]
  • ROMULUS — это базовый репозиторий онтологий, предназначенный для улучшения семантической совместимости. На данный момент в репозитории есть три основополагающие онтологии: DOLCE , BFO и GFO . [85]

Примеры приложений

[ редактировать ]

В общем, онтологии можно с пользой использовать в нескольких областях.

  • Корпоративные приложения. [86] Более конкретным примером является SAPPHIRE (Здравоохранение) или Ситуационная осведомленность и готовность к инцидентам в области общественного здравоохранения и механизмы рассуждения , которая представляет собой семантике основанную на систему медицинской информации, способную отслеживать и оценивать ситуации и события, которые могут повлиять на здоровье населения .
  • Географические информационные системы объединяют данные из разных источников и, следовательно, извлекают выгоду из онтологических метаданных, которые помогают связать семантику данных. [87]
  • Онтологии, специфичные для предметной области, чрезвычайно важны в биомедицинских исследованиях, которые требуют устранения неоднозначности именованных объектов различных биомедицинских терминов и сокращений, которые имеют одну и ту же строку символов, но представляют разные биомедицинские концепции. Например, CSF может представлять собой колониестимулирующий фактор или спинномозговую жидкость, оба из которых в биомедицинской литературе представлены одним и тем же термином CSF. [88] Вот почему большое количество публичных онтологий связано с науками о жизни. Инструменты науки о жизни, которые не могут реализовать эти типы биомедицинских онтологий, не смогут точно определять причинно-следственные связи между концепциями. [89]

См. также

[ редактировать ]
Связанные философские концепции

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Онтология . Макгилл – Издательство Королевского университета . 26 ноября 2002 г. п. 4. ISBN  9780773582675 . Прикладная онтология как дисциплина или область науки является научной в том смысле, что она применяет определение бытия для определения онтологических обязательств других дисциплин, особенно, но не исключительно, в естественных науках, во многом таким же образом, как прикладная математика в технике связана с чистой наукой. математика.
  2. ^ Г. Будин (2005), «Управление переводами на основе онтологий» , в Хелле В. Дам (редактор), « Системы знаний и перевод» , Ян Энгберг, Хайдрун Гержимиш-Арбогаст, Вальтер де Грюйтер, стр. 113, ISBN  978-3-11-018297-2
  3. ^ Палермо, Джулио (10 января 2007 г.). «Онтология экономической власти при капитализме: господствующая экономика и Маркс». Кембриджский экономический журнал . 31 (4): 539–561. doi : 10.1093/cje/bel036 – через Oxford Journals.
  4. ^ Зунига, Глория Л. (2 февраля 1999 г.). «Онтология экономических объектов» . Мпра Бумага . Исследовательский отдел Федерального резервного банка Сент-Луиса . Проверено 16 июня 2013 г.
  5. ^ Сова, Дж. Ф. (1995). «Онтологические категории верхнего уровня». Международный журнал человеко-компьютерных исследований . 43 (5–6 (ноябрь/декабрь)): 669–85. дои : 10.1006/ijhc.1995.1068 .
  6. ^ { Биопортал
  7. ^ Литейный цех промышленных онтологий
  8. ^ Мусен, Марк (2015). «Проект Протеже: взгляд назад и взгляд вперед» . ИИ имеет значение . 1 (4): 4–12. дои : 10.1145/2757001.2757003 . ПМЦ   4883684 . ПМИД   27239556 .
  9. ^ «онтология» . Интернет-словарь этимологии .
  10. ^ εἰμί . Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте «Персей»
  11. ^ Смит, Барри (2022). «Рождение онтологии». Журнал структур и систем знаний . 3 : 57–66.
  12. ^ Пауэрс, Дэвид (1983). «Интеллект роботов». Электроника сегодня Интернэшнл .
  13. ^ Пауэрс, Дэвид (1984). «Естественный язык естественным путем». Компьютерные компакты . 2 (3–4): 100–109. дои : 10.1016/0167-7136(84)90088-X .
  14. ^ Пауэрс, Дэвид; Терк, Крис (1989). Машинное обучение естественного языка . Спрингер-Верлаг. ISBN  978-1-4471-1697-4 .
  15. ^ Пауэрс, Дэвид (1991). Предисловие: Цели, проблемы и направления машинного обучения естественного языка и онтологий . Весенний симпозиум AAAI по машинному обучению естественного языка и онтологии. ДФКИ.
  16. ^ Грубер, Т. (2008). «Онтология» . Ин Лю, Лин ; Озсу, М. Тамер (ред.). Энциклопедия систем баз данных . Спрингер-Верлаг. ISBN  978-0-387-49616-0 .
  17. ^ Грубер, Т. (1993). «К принципам проектирования онтологий, используемых для обмена знаниями» . Международный журнал человеко-компьютерных исследований . 43 (5–6): 907–928. дои : 10.1006/ijhc.1995.1081 . S2CID   1652449 .
  18. ^ Грубер, Т. (2001). «Что такое онтология?» . Стэнфордский университет . Архивировано из оригинала 16 июля 2010 г. Проверено 9 ноября 2009 г.
  19. ^ Эндертон, HB (12 мая 1972 г.). Математическое введение в логику (1-е изд.). Сан-Диего, Калифорния: Academic Press. п. 295 . ISBN  978-0-12-238450-9 . 2-е издание; 5 января 2001 г.
  20. ^ Грубер, Томас Р. (июнь 1993 г.). «Подход к переводу спецификаций переносимых онтологий» (PDF) . Приобретение знаний . 5 (2): 199–220. CiteSeerX   10.1.1.101.7493 . дои : 10.1006/knac.1993.1008 . S2CID   15709015 .
  21. ^ Фейлмайр, Кристина; Вёсс, Вольфрам (2016). «Анализ онтологий и факторов их успеха для применения в бизнесе». Инженерия данных и знаний . 101 : 1–23. дои : 10.1016/j.datak.2015.11.003 .
  22. ^ «Проект: Динамическое восстановление онтологии» . Факультет информатики Эдинбургского университета . Проверено 2 января 2012 г.
  23. ^ Перейти обратно: а б «Лаборатория прикладной онтологии – DOLCE» . Лаборатория прикладной онтологии (ЛОА) . Проверено 10 февраля 2011 г.
  24. ^ Перейти обратно: а б «СОВА-версия DOLCE+DnS» . Лаборатория семантических технологий . Проверено 21 февраля 2013 г.
  25. ^ Навильи, Роберто; Веларди, Паола (2004). «Изучение онтологий домена из хранилищ документов и специализированных веб-сайтов». Компьютерная лингвистика . 30 (2). Массачусетский технологический институт Пресс: 151–179. CiteSeerX   10.1.1.329.6965 . дои : 10.1162/089120104323093276 . S2CID   2453822 .
  26. ^ Катифори, А.; Халацис, К.; Лепурас, Г.; Василакис, К.; Джаннопулу, Э. (2007). «Методы визуализации онтологий. Обзор» (PDF) . Обзоры вычислительной техники ACM . 39 (4): 10. CiteSeerX   10.1.1.330.3281 . дои : 10.1145/1287620.1287621 . S2CID   14205872 . Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2016 года.
  27. ^ Дудас, М.; Ломанн, С.; Сватек, В.; Павлов, Д. (2018). «Методы и инструменты визуализации онтологий: обзор современного состояния». Обзор инженерии знаний . 33 (е10). дои : 10.1017/S0269888918000073 . S2CID   52965103 .
  28. ^ Фу, Бо; Ной, Наталья Ф.; Стори, Маргарет-Энн (2013). «Дерево с отступом или график? Исследование удобства использования методов визуализации онтологий в контексте оценки сопоставления классов». Семантическая сеть – ISWC 2013: 12-я Международная конференция по семантической сети, Сидней, Новый Южный Уэльс, Австралия, 21–25 октября 2013 г., Материалы, часть I. Конспекты лекций по информатике. Том. 8218. Берлин: Шпрингер. стр. 117–134. дои : 10.1007/978-3-642-41335-3_8 . ISBN  978-3-642-41335-3 .
  29. ^ Негру, Стефан; Ломанн, Штеффен; Хааг, Флориан (7 апреля 2014 г.). «VOWL: Визуальная нотация для онтологий OWL: Спецификация версии 2.0» . Сеть визуальных данных .
  30. ^ Паучард, Лайн; Ивезич, Ненад; Шленофф, Крейг (март 2000 г.). «Разработка онтологий для распределенного сотрудничества в производстве» (PDF) . Материалы конференции AIS2000 .
  31. ^ Гомес-Перес, Аскуньон; Фернандес-Лопес, Мариано; Корчо, Оскар (2004). Онтологическая инженерия: с примерами из областей управления знаниями, электронной коммерции и семантической сети (1-е изд.). Спрингер. п. 403 . ISBN  978-1-85233-551-9 .
  32. ^ Де Никола, Антонио; Миссикофф, Мишель; Навильи, Роберто (2009). «Подход программной инженерии к построению онтологий» (PDF) . Информационные системы . 34 (2). Эльзевир: 258–275. дои : 10.1016/j.is.2008.07.002 .
  33. ^ Алатриш, Эмхимед (2013). «Сравнение некоторых редакторов онтологий» (PDF) . Информационные системы управления . 8 (2): 18–24.
  34. ^ Краллингер, М; Лейтнер, Ф; Васкес, М; Сальгадо, Д; Марсель, К; Тайерс, М; Валенсия, А; Чатр-Арьямонтри, А (2012). «Как связать онтологии и белок-белковые взаимодействия с литературой: подходы к анализу текста и опыт биокреативности » . База данных . 2012 : bas017. дои : 10.1093/база данных/bas017 . ПМК   3309177 . ПМИД   22438567 .
  35. ^ «САДЛ» . СоурсФордж . Проверено 10 февраля 2011 г.
  36. ^ Джаррар, Мустафа (2021). «Арабская онтология — арабская сеть слов с онтологически чистым содержанием» . Прикладная онтология . 16 :1–26. arXiv : 2205.09664 . дои : 10.3233/AO-200241 . S2CID   231886117 .
  37. ^ «АУРУМ – Онтология информационной безопасности» . Проверено 29 января 2016 г.
  38. ^ «Базовая формальная онтология (BFO)» . Институт формальной онтологии и медицинской информатики (IFOMIS).
  39. ^ «БиоПАКС» . Архивировано из оригинала 25 июня 2011 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  40. ^ Остервальдер, Александр; Пиньёр, Ив (17–19 июня 2002 г.). Онтология модели электронного бизнеса для моделирования электронного бизнеса (PDF) . 15-я электронная конференция в Бледе , Словения . Архивировано из оригинала (PDF) 19 апреля 2011 г.
  41. ^ Вверх, Антоний; Джонс, Питер (2016). «Онтология для сильно устойчивых бизнес-моделей: определение структуры предприятия, совместимой с естественными и социальными науками» . Организация и окружающая среда . 29 (1): 97–123. дои : 10.1177/1086026615592933 . S2CID   145089240 .
  42. ^ «О CCO и GexKB» . Семантическая системная биология. Архивировано из оригинала 30 июля 2012 г.
  43. ^ «Контология» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  44. ^ «Концептуальная эталонная модель CIDOC (CRM)» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  45. ^ «КОСМО» . Компания МИКРА . Проверено 10 февраля 2011 г.
  46. ^ Осборн, доктор юридических наук; Флатов, Дж; Холко, М; Лин, С.М.; Киббе, Вашингтон; Чжу, LJ; Данила, Мичиган; Фэн, Дж; Чисхолм, Р.Л. (2009). «Аннотирование генома человека с помощью онтологии болезней» . БМК Геномика . 10 (Приложение 1): S6. дои : 10.1186/1471-2164-10-S1-S6 . ПМК   2709267 . ПМИД   19594883 .
  47. ^ Ломбардо, Винченцо; Дамиано, Россана; Пиццо, Антонио (2018). «Драмматика: комплексный онтологический ресурс по драме». Семантическая сеть -- ISWC 2018 . Спрингер. стр. 103–118. дои : 10.1007/978-3-030-00668-6_7 . Проверено 11 июля 2024 г.
  48. ^ «Онтология бизнеса финансовой индустрии (FIBO)» . Проверено 15 марта 2017 г.
  49. ^ «Основные, основные и лингвистические онтологии» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  50. ^ «Основная модель анатомии» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  51. ^ «Продление автомобиля» . Архивировано из оригинала 8 декабря 2018 года . Проверено 15 июня 2017 г.
  52. ^ «ЗОЛОТО: запись на FAIRsharing.org» . Проверено 29 июля 2024 г.
  53. ^ «Обобщенная верхняя модель» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  54. ^ «Сайт группы компаний IDEAS» . Архивировано из оригинала 16 декабря 2018 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  55. ^ «База ссылок» . Архивировано из оригинала 18 сентября 2008 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  56. ^ Справочное руководство консоли конфигурации: Язык шаблонов Landmark (LPL). Архивировано 4 февраля 2020 г. на Wayback Machine . Проверено 4 февраля 2020 г.
  57. ^ «Биопортал» . Национальный центр биологической онтологии (NCBO). Архивировано из оригинала 12 июня 2009 г. Проверено 24 октября 2013 г.
  58. ^ «Браузер онтологий для большинства открытых биологических и биомедицинских онтологий» . Проект с открытым исходным кодом по биоинформатике Беркли (BBOP).
  59. ^ «Открытые биологические и биомедицинские онтологии» . Проект с открытым исходным кодом по биоинформатике Беркли (BBOP).
  60. ^ «ОМНИБУС-Онтология» . Архивировано из оригинала 19 июля 2012 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  61. ^ «ОНСТР» . Архивировано из оригинала 16 апреля 2014 года . Проверено 16 апреля 2014 г.
  62. ^ «Онтология растений» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  63. ^ «ПРО» . Архивировано из оригинала 10 марта 2011 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  64. ^ «ПробОнто» . Проверено 1 июля 2017 г.
  65. ^ Сват, MJ; Гренон, П; Вималаратне, С (2016). «ProbOnto: онтология и база знаний вероятностных распределений» . Биоинформатика . 32 (17): 2719–21. doi : 10.1093/биоинформатика/btw170 . ПМК   5013898 . ПМИД   27153608 .
  66. ^ «Белковая онтология» . Архивировано из оригинала 10 марта 2011 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  67. ^ Нембавер, Виктория; Мазанду, Гастон К.; Хочкисс, Джейд; Сафари Серуфури, Жан-Мишель; Кент, Джилл; Кенгне, Андре Паскаль; Ани, Кофи; Мунунг, Нчангви Синтия; Букини, Дайма; Битунги, Валентина Жозиан Нго; Мунубе, Деогратиас (01 октября 2020 г.). «Онтология серповидноклеточной болезни: обеспечение возможности совместных исследований и совместной разработки новых приложений для планетарного здравоохранения» . OMICS: Журнал интегративной биологии . 24 (10): 559–567. дои : 10.1089/omi.2020.0153 . ПМК   7549008 . ПМИД   33021900 .
  68. ^ Эйлбек К., Льюис С.Э. , Мангалл С.Дж., Янделл М., Стейн Л. , Дурбин Р. , Эшбернер М. (2005). «Онтология последовательностей: инструмент для унификации аннотаций генома» . Геномная биология . 6 (5): Р44. дои : 10.1186/gb-2005-6-5-r44 . ПМЦ   1175956 . ПМИД   15892872 .
  69. ^ Найлз И. и Пиз А. (2001), К стандартной верхней онтологии, в материалах 2-й Международной конференции по формальной онтологии в информационных системах (FOIS-2001), Крис Велти и Барри Смит, ред., стр. 2 -9.
  70. ^ "СЛАДКИЙ" . Проверено 11 марта 2022 г.
  71. ^ «ССН» . Проверено 10 ноября 2021 г.
  72. ^ Мунгалл, CJ; Торняй, К; Гкутос, Г.В.; Льюис, SE; Гендель, Массачусетс (2012). «Уберон, интегративная онтология анатомии многих видов» . Геном Биол . 13 (1): С5. дои : 10.1186/gb-2012-13-1-r5 . ПМЦ   3334586 . ПМИД   22293552 .
  73. ^ «ЯМАТО» . Архивировано из оригинала 3 марта 2011 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  74. ^ «ЦВЕТ» . Архивировано из оригинала 28 августа 2011 года . Проверено 4 мая 2011 г.
  75. ^ «Библиотека онтологий DAML» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  76. ^ «Библиотека ОДП» . Проверено 21 февраля 2013 г.
  77. ^ «Библиотека онтологии Protege» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  78. ^ «СхемаВеб» . Архивировано из оригинала 10 августа 2011 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  79. ^ «Литейный завод ОБО» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  80. ^ Смит, Б .; Эшбернер, М .; Росс, К.; Бард, Дж.; Баг, В.; Сестерс, В.; Голдберг, LJ; Эйлбек, К.; Ирландия, А.; Мунгалл, CJ; Леонтис, Н.; Рокка-Серра, П.; Руттенберг, А.; Сансоне, ЮАР; Шойерманн, Р.Х.; Шах, Н.; Ветцель, Польша; Льюис, С. (2007). «The OBO Foundry: Скоординированная эволюция онтологий для поддержки интеграции биомедицинских данных» . Природная биотехнология . 25 (11): 1251–1255. дои : 10.1038/nbt1346 . ПМК   2814061 . ПМИД   17989687 . Значок открытого доступа
  81. ^ «Добро пожаловать на биопортал NCBO | Биопортал NCBO» . bioportal.bioontology.org . Проверено 28 марта 2019 г.
  82. ^ «Онтоселект» . Архивировано из оригинала 11 ноября 2010 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  83. ^ «Онтария» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  84. ^ «OpenOntologyRepository — ОнтологПСМВ» . ontlogforum.org . Проверено 28 марта 2019 г.
  85. ^ Хан, Зубейда Касмод; Кит, К. Мария (2013). «Фундаментальная библиотека онтологий ROMULUS» . Модель и инженерия данных . Конспекты лекций по информатике. Том. 8216. стр. 200–211. дои : 10.1007/978-3-642-41366-7_17 . ISBN  978-3-642-41365-0 . S2CID   1925510 . Проверено 25 июня 2023 г.
  86. ^ Оберле, Дэниел (2014). «Как онтологии приносят пользу корпоративным приложениям» (PDF) . Семантическая сеть . 5 (6). IOS Press: 473–491. дои : 10.3233/SW-130114 .
  87. ^ Фрэнк, Эндрю У. (2001). «Уровни онтологии и ограничения согласованности в географических информационных системах». Международный журнал географической информатики . 15 (7): 667–678. Бибкод : 2001IJGIS..15..667F . дои : 10.1080/13658810110061144 . S2CID   6616354 .
  88. ^ Стивенсон, Марк; Го, Икунь (2010). «Устранение неоднозначности неоднозначных биомедицинских терминов с использованием примеров, созданных на основе метатезавра UMLS» . Журнал биомедицинской информатики . 43 (5): 762–773. дои : 10.1016/j.jbi.2010.06.001 . ПМИД   20541624 .
  89. ^ Боденрейдер, О.; Митчелл, Дж.А.; Маккрей, AT (2003). «Биомедицинские онтологии». Биокомпьютинг 2004 . стр. 164–165. дои : 10.1142/9789812704856_0016 . ISBN  978-981-238-598-7 . ПМК   4300097 . ПМИД   15759615 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Викискладе есть медиафайлы по теме Онтология .
У Схолии есть тематический профиль Онтология (информатика) .
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Ontology_(information_science)&oldid=1238125361"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: f2ab1bc38e5fc001495f38df24b96942__1722572580
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/f2/42/f2ab1bc38e5fc001495f38df24b96942.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Ontology (information science) - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)