Рецептор-ловушка 3

ТНФРСФ6Б
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3K51, 3MHD, 3MI8, 4J6G, 4KGG, 4KGQ, 4MSV
Идентификаторы
Псевдонимы	TNFRSF6B , DCR3, DJ583P15.1.1, M68, M68E, TR6, член 6b суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли, член 6b суперсемейства рецепторов TNF
Внешние идентификаторы	Опустить : 603361 ; Гомологен : 48242 ; Генные карты : TNFRSF6B ; OMA : TNFRSF6B — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	63,698,684 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	olfactory zone of nasal mucosa; ; spleen; ; subcutaneous adipose tissue; ; right lung; ; upper lobe of left lung; ; C1 segment; ; right hemisphere of cerebellum; ; appendix; ; anterior pituitary; ; amygdala;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; tumor necrosis factor-activated receptor activity; signaling receptor activity;
Cellular component	extracellular region; integral component of plasma membrane; extracellular space;
Biological process	multicellular organism development; apoptotic signaling pathway; response to lipopolysaccharide; inflammatory response; tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; negative regulation of apoptotic process; regulation of cell population proliferation; immune response; apoptotic process; negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8771
	н/д
	ENSG00000243509
	н/д
	О95407
	н/д
	НМ_032945 ; НМ_003823
	н/д
	НП_003814
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Рецептор-ловушка 3 ( Dcr3 ), также известный как член суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли 6B ( TNFRSF6B ), TR6 и M68 , представляет собой растворимый белок суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли , который ингибирует лигандом Fas индуцированный апоптоз, . ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Открытие

Dcr3 был идентифицирован в 1998 году путем поиска генов, гомологичных суперсемейству генов TNFR, в базе данных меток экспрессируемых последовательностей (EST).

Структура

Открытая рамка считывания TNFRSF6B кодирует 300 аминокислот с сигнальной последовательностью из 29 остатков и четырьмя тандемными повторами, богатыми цистеином. Для этого гена наблюдались два варианта транскрипта, кодирующие одну и ту же изоформу, но отличающиеся 5'-UTR. ^{[ 5 ]} В отличие от большинства других членов суперсемейства TNFR, TNFRSF6 представляет собой растворимый белок, не содержащий трансмембранного домена.

Функция

Этот ген принадлежит к суперсемейству рецепторов фактора некроза опухоли . Он действует как рецептор-ловушка, который конкурирует с рецепторами смерти за связывание лиганда. Предполагается, что кодируемый белок играет регуляторную роль в подавлении FasL- и LIGHT-опосредованной гибели клеток и активации Т-клеток, а также индуцирует ангиогенез посредством нейтрализации TL1A . Сверхэкспрессия этого гена была отмечена в различных опухолях, например, опухолях желудочно-кишечного тракта, и он расположен в богатом генами кластере на хромосоме 20 вместе с другими потенциально связанными с опухолью генами. ^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TNFRSF6B взаимодействует с:

ТНФСФ14 ^{[ 4 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}
Фас-лиганд . ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000243509 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Питти Р.М., Марстерс С.А., Лоуренс Д.А., Рой М., Кишкель ФК, Дауд П., Хуанг А., Донахью С.Дж., Шервуд С.В., Болдуин Д.Т., Годовски П.Дж., Вуд В.И., Герни А.Л., Хиллан К.Дж., Коэн Р.Л., Годдард А.Д., Ботштейн Д. , Ашкенази А (январь 1999 г.). «Геномная амплификация рецептора-ловушки для лиганда Fas при раке легких и толстой кишки». Природа . 396 (6712): 699–703. дои : 10.1038/25387 . ПМИД 9872321 . S2CID 4427455 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ю К.Ю., Квон Б., Ни Дж., Чжай Ю., Эбнер Р., Квон Б.С. (июнь 1999 г.). «Недавно идентифицированный член суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли (TR6) подавляет LIGHT-опосредованный апоптоз» . J Биол Хим . 274 (20): 13733–6. дои : 10.1074/jbc.274.20.13733 . ПМИД 10318773 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: суперсемейство рецепторов фактора некроза опухоли TNFRSF6B, член 6b, приманка» .
^ Чжан Дж., Сальседо Т.В., Ван Х, Ульрих С., Ху Б., Грегорио Т., Фэн П., Ци С., Чен Х., Чо Ю.Х., Ли Ю., Мур П.А., Ву Дж. (июнь 2001 г.). «Модуляция ответов Т-клеток на аллоантигены с помощью TR6/DcR3» . Дж. Клин. Инвестируйте . 107 (11): 1459–68. дои : 10.1172/JCI12159 . ПМК 209323 . ПМИД 11390428 .
^ Jump up to: ^а ^б Сюй Т.Л., Чанг Ю.К., Чен С.Дж., Лю Ю.Дж., Чиу А.В., Чио CC, Чен Л., Се С.Л. (май 2002 г.). «Модуляция дифференцировки и созревания дендритных клеток с помощью рецептора-ловушки 3» . Дж. Иммунол . 168 (10): 4846–53. дои : 10.4049/jimmunol.168.10.4846 . ПМИД 11994433 .

Дальнейшее чтение

Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 6 (3): 197–205. дои : 10.1093/dnares/6.3.197 . ПМИД 10470851 .
Бай С., Коннолли Б., Мецкер М.Л. и др. (2000). «Сверхэкспрессия M68/DcR3 в опухолях желудочно-кишечного тракта человека независимо от амплификации гена и его расположения в кластере из четырех генов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (3): 1230–5. Бибкод : 2000PNAS...97.1230B . дои : 10.1073/pnas.97.3.1230 . ПМК 15578 . ПМИД 10655513 .
Делоукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. и др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 20-й хромосомы человека» . Природа . 414 (6866): 865–71. Бибкод : 2001Natur.414..865D . дои : 10.1038/414865a . ПМИД 11780052 .
Мигоне Т.С., Чжан Дж., Луо X и др. (2002). «TL1A представляет собой TNF-подобный лиганд для DR3 и TR6/DcR3 и действует как костимулятор Т-клеток» . Иммунитет . 16 (3): 479–92. дои : 10.1016/S1074-7613(02)00283-2 . ПМИД 11911831 .
Сюй Т.Л., Чанг Ю.К., Чен С.Дж. и др. (2002). «Модуляция дифференцировки и созревания дендритных клеток с помощью рецептора-ловушки 3» . Дж. Иммунол . 168 (10): 4846–53. дои : 10.4049/jimmunol.168.10.4846 . ПМИД 11994433 .
Милд Дж., Бахманн Ф., Булай Дж.Л. и др. (2002). «Локус DCR3 является прогностическим маркером адъювантной химиотерапии на основе 5-фторурацила при колоректальном раке». Межд. Дж. Рак . 102 (3): 254–7. дои : 10.1002/ijc.10711 . ПМИД 12397645 . S2CID 23680078 .
Джилл Р.М.; Ни Дж; Хант Дж.С. (2003). «Дифференциальная экспрессия СВЕТА и его рецепторов в ворсинках плаценты человека и мембранах амниохориона» . Являюсь. Дж. Патол . 161 (6): 2011–7. дои : 10.1016/S0002-9440(10)64479-3 . ПМК 1850908 . ПМИД 12466117 .
Ван X, Чжан Дж, Луо Х и др. (2003). «Член семейства TNF LIGHT преобразует костимулирующие сигналы в Т-клетки человека» . Дж. Иммунол . 169 (12): 6813–21. дои : 10.4049/jimmunol.169.12.6813 . ПМИД 12471113 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ван X, Ши Г, Семенюк М и др. (2003). «DcR3/TR6 модулирует взаимодействие иммунных клеток». Дж. Селл. Биохим . 89 (3): 603–12. дои : 10.1002/jcb.10523 . ПМИД 12761893 . S2CID 39322989 .
Цудзи С., Хосотани Р., Йонехара С. и др. (2003). «Эндогенный рецептор-ловушка 3 блокирует сигналы ингибирования роста, опосредованные лигандом Fas, при аденокарциноме поджелудочной железы человека» (PDF) . Межд. Дж. Рак . 106 (1): 17–25. дои : 10.1002/ijc.11170 . hdl : 2433/148465 . ПМИД 12794752 . S2CID 34900944 .
Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретируемых белков (SPDI), крупномасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые человеком и трансмембранные белки: оценка биоинформатики» . Геном Рез . 13 (10): 2265–70. дои : 10.1101/гр.1293003 . ПМЦ 403697 . ПМИД 12975309 .
Ши Г; У Ю; Чжан Дж; Ву Дж (2004). «Рецептор-ловушка смерти TR6/DcR3 ингибирует хемотаксис Т-клеток in vitro и in vivo» . Дж. Иммунол . 171 (7): 3407–14. doi : 10.4049/jimmunol.171.7.3407 . ПМИД 14500635 .
Ву С.Ф., Лю Т.М., Лин Ю.К. и др. (2004). «Иммуномодулирующий эффект рецептора-ловушки 3 на дифференцировку и функцию дендритных клеток костномозгового происхождения у мышей с диабетом, не страдающих ожирением: от регуляторного механизма к клиническому значению» . Дж. Леукок. Биол . 75 (2): 293–306. дои : 10.1189/jlb.0303119 . ПМИД 14634066 . S2CID 14226200 .
Чанг Ю.К., Сюй Т.Л., Линь Х.Х. и др. (2004). «Модуляция дифференциации и активации макрофагов рецептором-ловушкой 3» . Дж. Леукок. Биол . 75 (3): 486–94. дои : 10.1189/jlb.0903448 . ПМИД 14657214 . S2CID 31939119 .
Ким С., Маколифф В.Дж., Зарицкая Л.С. и др. (2004). «Селективная индукция высвобождения фактора 6 рецептора некроза опухоли/высвобождения рецептора-приманки 3 бактериальными антигенами в моноцитах человека и миелоидных дендритных клетках» . Заразить. Иммунитет . 72 (1): 89–93. дои : 10.1128/IAI.72.1.89-93.2004 . ПМЦ 343977 . ПМИД 14688085 .
Сюй М.Дж., Линь В.В., Цао В.К. и др. (2004). «Усиленная адгезия моноцитов посредством обратной передачи сигналов, запускаемой рецептором-ловушкой 3». Эксп. Сотовый Res . 292 (2): 241–51. дои : 10.1016/j.yexcr.2003.09.019 . ПМИД 14697332 .
Джилл Р.М.; Хант Дж.С. (2004). «Растворимый рецептор (DcR3) и клеточный ингибитор апоптоза-2 (cIAP-2) защищают клетки цитотрофобласта человека от свето-опосредованного апоптоза» . Являюсь. Дж. Патол . 165 (1): 309–17. дои : 10.1016/S0002-9440(10)63298-1 . ПМК 1618528 . ПМИД 15215185 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW об аутоиммунном лимфопролиферативном синдроме

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000243509 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9872321-3] Jump up to: ^а ^б Питти Р.М., Марстерс С.А., Лоуренс Д.А., Рой М., Кишкель ФК, Дауд П., Хуанг А., Донахью С.Дж., Шервуд С.В., Болдуин Д.Т., Годовски П.Дж., Вуд В.И., Герни А.Л., Хиллан К.Дж., Коэн Р.Л., Годдард А.Д., Ботштейн Д. , Ашкенази А (январь 1999 г.). «Геномная амплификация рецептора-ловушки для лиганда Fas при раке легких и толстой кишки». Природа . 396 (6712): 699–703. дои : 10.1038/25387 . ПМИД 9872321 . S2CID 4427455 .

[pmid10318773-4] Jump up to: ^а ^б ^с Ю К.Ю., Квон Б., Ни Дж., Чжай Ю., Эбнер Р., Квон Б.С. (июнь 1999 г.). «Недавно идентифицированный член суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли (TR6) подавляет LIGHT-опосредованный апоптоз» . J Биол Хим . 274 (20): 13733–6. дои : 10.1074/jbc.274.20.13733 . ПМИД 10318773 .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: суперсемейство рецепторов фактора некроза опухоли TNFRSF6B, член 6b, приманка» .

[pmid11390428-6] Чжан Дж., Сальседо Т.В., Ван Х, Ульрих С., Ху Б., Грегорио Т., Фэн П., Ци С., Чен Х., Чо Ю.Х., Ли Ю., Мур П.А., Ву Дж. (июнь 2001 г.). «Модуляция ответов Т-клеток на аллоантигены с помощью TR6/DcR3» . Дж. Клин. Инвестируйте . 107 (11): 1459–68. дои : 10.1172/JCI12159 . ПМК 209323 . ПМИД 11390428 .

[pmid11994433-7] Jump up to: ^а ^б Сюй Т.Л., Чанг Ю.К., Чен С.Дж., Лю Ю.Дж., Чиу А.В., Чио CC, Чен Л., Се С.Л. (май 2002 г.). «Модуляция дифференцировки и созревания дендритных клеток с помощью рецептора-ловушки 3» . Дж. Иммунол . 168 (10): 4846–53. дои : 10.4049/jimmunol.168.10.4846 . ПМИД 11994433 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]