Подтипы ВИЧ

Вирусы иммунодефицита человека
	Филогенетическое вирусов SIV и ВИЧ дерево
Научная классификация
(не вмешательство):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Pararnavirae
Филум:	Art Verviricota
Сорт:	Revtraviricetes
Заказ:	Ортервиралес
Семья:	Retroviridae
Подсемейство:	Орторетровирина
Род:	Лентивирус
Группы включены
	Вирус иммунодефицита человека 1 ; Вирус иммунодефицита человека 2 ;
Кладистически включено, но традиционно исключенные таксоны
	Вирус иммунодефицита обезживания (подгруппы I, II) ;

Подтипы ВИЧ включают два основных подтипа, известные как ВИЧ типа 1 (ВИЧ-1) и ВИЧ типа 2 (ВИЧ-2). Эти подтипы имеют различные генетические различия и связаны с различными эпидемиологическими паттернами и клиническими характеристиками.

ВИЧ-1 демонстрирует генетическую связь с вирусами, коренными к шимпанзе и гориллам, которые обитают в Западной Африке , в то время как вирусы ВИЧ-2 связаны с вирусами, присутствующими в сажах Мангаби , уязвимом западноафриканском примате. ^{[ 2 ]}

Вирусы ВИЧ-1 могут быть дополнительно распределены на группы M, N, O и P. Среди них вирусы ВИЧ-1 Группа М являются наиболее распространенными, заражая почти 90% людей, живущих с ВИЧ и ответственны за глобальную пандемию СПИДа Полем Группа М может быть дополнительно разделена на подтипы на основе данных генетической последовательности . Некоторые подтипы известны своей повышенной вирулентностью или лекарственной устойчивостью к различным лекарствам, используемым для лечения ВИЧ.

Вирусы ВИЧ-2, как правило, считаются менее вирулентными и менее трансмиссируемыми , чем вирусы ВИЧ-1 М, хотя также известно, что ВИЧ-2 все еще вызывает ВИЧ-2.

Одной из преобладающих проблем в стремлении к эффективному управлению ВИЧ вируса является выраженная генетическая изменчивость и быстрая вирусная эволюция . ^{[ 3 ]}

Основные типы

ВИЧ-1

ВИЧ-1 является наиболее распространенным и наиболее патогенным штаммом вируса. По состоянию на 2022 год ^[update]Приблизительно 1,3 миллиона таких инфекций встречаются ежегодно. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Ученые разделяют ВИЧ-1 на крупную группу (группу М) и две или более второстепенных групп, а именно группы n, o и, возможно, группа P. Каждая группа, как полагают, представляет собой независимую передачу вируса об иммунодефицита иммунодефицита (SIV) в людей, на людей исключая подтипы в определенной группе. ^{[ 2 ]} Полная последовательность генома ВИЧ-1 содержит в общей сложности 39 открытых кадров считывания (ORF) во всех шести возможных кадрах считывания (RFS), но лишь некоторые из них функциональны. ^{[ 6 ]}

Группа м

При «M» для «Major» это, безусловно, наиболее распространенный тип ВИЧ, причем более 90% случаев ВИЧ/СПИДа, вызванные инфекцией вирусов ВИЧ-1 группы М. Этот основной вирус ВИЧ, который был источником пандемических вирусов до 1960 года, возник в 1920-х годах в Леопольвилле , Бельгийском Конго , сегодня известном как Киншаса, которая в настоящее время является столицей Демократической Республики Конго (ДРК). ^{[ 7 ]} Его зоонозным происхождением является штамм SIVCPZ , который заражает шимпанзе. Группа M подразделяется дальше на клады , называемые подтипами, которые также получают письмо. Существуют также «циркулирующие рекомбинантные формы» или CRF, полученные из генетической рекомбинации между вирусами различных подтипов, которые, кроме того, каждый из них дает число. CRF12_BF, например, является рекомбинацией между подтипами B и F. ^{[ Цитация необходима ]}

Подтип A распространен в Западной и Центральной Африке. ^{[ 8 ]}^{[ неудачная проверка ]}
Подтип B является доминирующей формой в Европе, Америке, Японии и Австралии. ^{[ 9 ]} Кроме того, подтип B является наиболее распространенной формой на Ближнем Востоке и в Северной Африке. ^{[ 10 ]} Возможно, он был экспортирован из Африки, когда гаитянские специалисты посетили Киншасу в 1960 -х годах и привели его в Гаити в 1964 году. ^{[ 7 ]}
Подтип C является доминирующей формой в Южной Африке, Восточной Африке, Индии, Непале и в некоторых частях Китая. ^{[ 9 ]}
Подтип D, как правило, наблюдается только в восточной и центральной Африке. ^{[ 9 ]}
Подтип E изначально использовался для описания штамма, который теперь учитывается как комбинированный штамм CRF01_AE. ^{[ 11 ]} Это означает, что оригинальный, единственный, E -штамм исчез, но мы знаем, что он существовал, как это видно в этой комбинированной форме деформации. ^{[ Цитация необходима ]}
Подтип F был найден в Центральной Африке, Южной Америке и Восточной Европе. ^{[ 12 ]}
Подтип G (и CRF02_AG) был найден в Африке и Центральной Европе. ^{[ 12 ]}
Подтип H ограничен Центральной Африкой. ^{[ 12 ]}
Подтип I первоначально использовался для описания деформации, которая теперь учитывается как CRF04_CPX, с CPX для «сложной» рекомбинации нескольких подтипов. ^{[ 11 ]}
Подтип J в основном находится в севере, центральной и Западной Африке, и в Карибском бассейне ^{[ 13 ]}
Подтип K ограничен ДРК и Камеруном. ^{[ 12 ]}
Подтип L ограничен DRC. ^{[ 14 ]}

Пространственное движение этих подтипов перемещалось вдоль железных дорог и водных путей ДРК из Киншасы в эти другие области. ^{[ 15 ]} Эти подтипы иногда далее разделяются на подпункты, такие как A1 и A2 или F1 и F2. ^{[ Цитация необходима ]} В 2015 году было обнаружено, что штамм CRF19 CRF19, рекомбинантный подтип A, подтип D и подтип G с протеазой подтипа D сильно связан с быстрым прогрессированием к СПИДу на Кубе . ^{[ 16 ]} Это не считается полным или окончательным списком, и, вероятно, будут найдены дальнейшие типы. ^{[ 17 ]}

Группа n

'N' означает "не-m, не O-O". ^{[ 19 ]} Эта группа была обнаружена франко-камерунской командой в 1998 году, когда они идентифицировали и изолировали штамм варианта ВИЧ-1, YBF380, от камерунской женщины, которая умерла от СПИДа в 1995 году. При тестировании вариант YBF380 отреагировал с вирусным конвертом-конвертом . из SIVCPZ, а не с таковыми в группе M или группе O, что указывает на то, что это действительно новая штамм ВИЧ-1. ^{[ 20 ]} По состоянию на 2015 год ^[update]менее 20 инфекций группы N были записаны. ^{[ 21 ]}

Группа o

Группа O («Outlier») заразила около 100 000 человек, расположенных в Западной Центральной Африке, и обычно не наблюдается за пределами этой области. ^{[ 21 ]} Сообщается, что это наиболее распространено в Камеруне, где опрос 1997 года показал, что около 2% ВИЧ-позитивных образцов были из группы О. ^{[ 22 ]} Его зоонозным происхождением является Сивгор, который заражает горилл (а не более распространенный источник, SIVCPZ). ^{[ 23 ]} Группа вызвала некоторую обеспокоенность, потому что она не может быть обнаружена ранними версиями тестовых наборов ВИЧ-1. более продвинутые тесты на ВИЧ для обнаружения как группы O, так и группы N. В настоящее время были разработаны ^{[ 24 ]}

Группа р

В 2009 году сообщалось, что вновь проанализированная последовательность ВИЧ имеет большее сходство с SIVGOR, чем SIVCPZ. Вирус был изолирован от камерунской женщины, проживающей во Франции, у которой в 2004 году была диагностирована инфекция ВИЧ-1. Ученые, сообщающие об этой последовательности, поместили ее в предлагаемую группу P «в ожидании выявления дальнейших случаев человека». ^{[ 25 ]}^{[ 26 ]}^{[ 27 ]}

ВИЧ-2

ВИЧ-2 в основном встречается в Африке и, следовательно, менее признан в других местах мира. Первая идентификация ВИЧ-2 произошла в 1985 году в Сенегале микробиологом Сулиманом Мбуп и его сотрудниками. ^{[ 28 ]} Первый случай в Соединенных Штатах был в 1987 году. ^{[ 29 ]} Первым подтвержденным случаем ВИЧ-2 был португальский человек, которого лечили в Лондонской больнице от тропических заболеваний , а затем умер в 1987 году. Считалось, что он был подвержен этой болезни в Гвинеи-Бисау , где он жил в период с 1956 по 1966 год. Его патологическим диагнозом в то время был криптоспоридиоз и инфекция энтеровируса , но анализ его хранимой сыворотки в 1987 году показал, что он был заражен ВИЧ-2. ^{[ 30 ]}

Многие тестовые наборы для ВИЧ-1 также обнаруживают ВИЧ-2. ^{[ 31 ]}

Существует восемь известных групп ВИЧ-2, обозначенные от H. из них, только группы A и B являются пандемией . Группа А встречается в основном в Западной Африке, но также распространилась на Анголу, Мозамбик, Бразилия, Индия, Европа и США. Несмотря на присутствие ВИЧ-2 во всем мире, группа В в основном ограничена Западной Африкой. ^{[ 32 ]}^{[ 33 ]}

ВИЧ-2 тесно связан с SIV Endemic в сажах мангабей ( Cercocebus atys ) (SIVSMM), вида обезьян, населяющий леса прибрежной Западной Африки. Филогенетический анализ показывает, что вирус, наиболее тесно связанный с двумя штаммами ВИЧ-2, которые значительно распространяются у людей (ВИЧ-2 групп A и B),-это SIVSMM, обнаруженный в сажих мангабе в лесу Тай , на западном побережье слоновой кости . ^{[ 32 ]}

Есть шесть дополнительных известных групп ВИЧ-2, каждая из которых была найдена только у одного человека. Все они, кажется, происходят из независимых передач от сажих мангабей к людям. Группы C и D были обнаружены у двух человек из Либерии, группы E и F были обнаружены у двух человек из Сьерра -Леоне, а группы G и H были обнаружены у двух человек с побережья слоновой кости. Каждое из этих штаммов ВИЧ-2, для которых люди, вероятно, являются мертвыми хозяевами , наиболее тесно связаны с штаммами SIVSMM из сажи, живущих в той же стране, где была обнаружена человеческая инфекция. ^{[ 32 ]}^{[ 33 ]}

Диагноз

Диагноз ВИЧ-2 может быть поставлен, когда у пациента нет симптомов, но положительная работа в крови указывает на то, что у человека есть ВИЧ. Многопоттевый быстрый тест на ВИЧ-1/ВИЧ-2 в настоящее время является единственным методом, одобренным FDA для такой дифференциации между двумя вирусами. Рекомендации по скринингу и диагностике ВИЧ всегда заключались в использовании иммуноанализа ферментов, которые обнаруживают ВИЧ-1, группу ВИЧ-1 и ВИЧ-2. ^{[ 34 ]} При скрининге комбинации, если тест является положительным с последующим неопределенным вестерн-блоттингом ВИЧ-1 , необходимо провести последующий тест, такой как тестирование на аминокислоты , чтобы отличить, какая инфекция присутствует. ^{[ 35 ]} Согласно NIH, дифференциальный диагноз ВИЧ-2 следует учитывать, когда человек имеет западноафриканский происхождение или имел сексуальный контакт или общие иглы с таким человеком. Западная Африка находится на самом высоком риске, так как это происхождение вируса. ^{[ Цитация необходима ]}

Лечение

ВИЧ-2 было обнаружено менее патогенным, чем ВИЧ-1. ^{[ 36 ]} Механизм ВИЧ-2 не четко определен и не разница от ВИЧ-1, однако скорость передачи намного ниже при ВИЧ-2, чем ВИЧ-1. Оба вируса могут привести к СПИДу у инфицированных людей, и оба могут мутировать для развития лекарственной устойчивости. ^{[ 34 ]} Мониторинг заболеваний у пациентов с ВИЧ-2 включает клиническую оценку и количество клеток CD4, в то время как лечение включает антиретровирусную терапию (АРТ), ингибиторы обратной транскриптазы нуклеозидов (NRTIS), ингибиторы протеазы (PI) и и неклеозид неклеозидные ингибиторы обратной транскриптазы (NNRTIS (PI) ) с добавлением антагонистов CCR5 со-рецепторов и ингибиторов слияния . ^{[ 37 ]}

Выбор начальной и/или терапии второй линии для ВИЧ-2 еще не определен. ВИЧ-2, по-видимому, устойчив к Nnrtis по сути, но может быть чувствительным к NRTI, хотя механизм плохо изучен. Ингибиторы протеазы показали переменный эффект, в то время как ингибиторы интеграции также оцениваются. Комбинированные схемы приведенной выше терапии также рассматриваются также, также показывающие переменный эффект в зависимости от типов терапии вместе взятых. Хотя механизмы не четко поняты для ВИЧ-1 и ВИЧ-2, известно, что они используют разные пути и паттерны, что делает алгоритмы, используемые для оценки связанных с устойчивости ВИЧ-1 мутаций, не относящихся к ВИЧ-2. ^{[ 34 ]}

Каждый вирус может быть заключен индивидуально, или они могут быть заключены вместе в том, что называется коинфекцией. ВИЧ-2, по-видимому, имеет более низкие показатели смертности, менее тяжелые симптомы и более медленное прогрессирование СПИДа, чем только ВИЧ-1 или коинфекция. Однако в коинфекции это в значительной степени зависит от того, какой вирус был сокращен в первую очередь. ВИЧ-1 имеет тенденцию конкурировать с ВИЧ-2 за прогрессирование заболевания. Совместная инфекция, по-видимому, является растущей проблемой во всем мире с течением времени, в большинстве случаев выявлено в странах Западной Африки, а также в некоторых случаях в США. ^{[ 37 ]} Исследование показало, что люди, которые сокращают ВИЧ-2 до ВИЧ-1, имеют тенденцию иметь более медленную скорость прогрессирования заболевания, что позволяет предположить, что иммунный ответ на ВИЧ-2 может ограничить пролиферацию ВИЧ-1. ^{[ 38 ]}

Беременность

Если беременная мать подвергается воздействию, скрининг выполняется как нормальный. Если присутствует ВИЧ-2, в качестве профилактической профилакции можно определить ряд перинатальных художественных препаратов, чтобы снизить риск передачи от матери-ребенка. После рождения ребенка следует инициировать стандартный шестинедельный режим этой профилактики. Грудное молоко также может содержать вирусные частицы ВИЧ-2; Следовательно, грудное вскармливание строго рекомендуется. ^{[ 35 ]}

Эволюция

Быстрая эволюция ВИЧ может быть связана с его высокой скоростью мутации. На ранних стадиях мутации эволюция, по -видимому, является нейтральной из -за отсутствия эволюционного ответа. Однако при изучении вируса у нескольких разных людей можно найти конвергентные мутации, появляющиеся в этих вирусных популяциях независимо. ^{[ 39 ]}

вируса Эволюция ВИЧ в рамках хозяина влияет на факторы, включая вирусную нагрузку . Если вирус имеет низкую установленную вирусную нагрузку, хозяин будет жить дольше, и существует большая вероятность того, что вирус будет передаваться другому человеку. Если вирус имеет вирусную нагрузку с высокой установкой, хозяин будет жить в течение более короткого количества времени, и существует более низкая вероятность того, что вирус будет передаваться другому человеку. ^{[ 40 ]} ВИЧ развивался, чтобы максимизировать количество инфекций к другим хозяевам, и эта тенденция к отбору в пользу промежуточных штаммов показывает, что ВИЧ подвергается стабилизирующему отбору. ^{[ Цитация необходима ]}

Вирус также развивался, чтобы стать более заразительным между хозяевами. Существует три различных механизма, которые позволяют ВИЧ развиваться на уровне популяции. ^{[ 40 ]} Один из них включает в себя непрерывную битву за развитие и преодоление иммунной системы, которая замедляет эволюцию ВИЧ и смещает фокус вируса на уровень популяции. Другой включает в себя медленную эволюцию вирусной нагрузки из -за нейтральной вирусной нагрузки внутри хозяина. Последний механизм фокусируется на предпочтении вируса передавать основополагающие вирусные штаммы, хранящиеся на ранних стадиях инфекции. Это предпочтение вируса передачи его хранимых копий генома объясняет, почему ВИЧ развивается быстрее в хосте, чем между хозяевами. ^{[ 40 ]}

ВИЧ развивается к более мягкой форме, но это все еще «ужасно долгий путь» от того, чтобы больше не быть смертельным, ^{[ 41 ]}^{[ 42 ]} с серьезными вариантами все еще появляются. ^{[ 43 ]}^{[ 44 ]}

Мутации лекарственной устойчивости

Изоляты ВИЧ-1 и ВИЧ-2 с устойчивостью к антиретровирусным препаратам возникают посредством естественного отбора и генетических мутаций, которые были отслеживались и проанализированы. Стэнфордская база данных о лекарственной устойчивости на ВИЧ и Международное общество СПИДа публикует списки наиболее важных из них; Первый год перечисляет 80 общих мутаций, а также последних общих мутаций 93 и предоставленных в базе данных Стэнфордского ВИЧ и протеазы . ^{[ Цитация необходима ]}

Смотрите также

Ссылки

^ Хотя ICTV перечисляет ВИЧ-1 и ВИЧ-2 как отдельные виды от SIV, они кладистически попадают в группу SIV.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Sharp PM, Hahn BH (сентябрь 2011 г.). «Происхождение ВИЧ и пандемии СПИДа» . Перспективы Cold Spring Harbor в медицине . 1 (1): A006841. doi : 10.1101/cshperspect.a006841 . PMC 3234451 . PMID 22229120 .
^ Робертсон Д.Л., Хан Б.Х., Шарп Прем (март 1995 г.). «Рекомбинация в вирусах СПИДа» . Журнал молекулярной эволюции . 40 (3): 249–259. Bibcode : 1995jmole..40..249r . doi : 10.1007/bf00163230 . PMID 7723052 . S2CID 19728830 .
^ Гари Эн, Вейнер Д.Б. (август 2020 г.). «ДНК -вакцины: прайм -тайм сейчас» . Текущее мнение в иммунологии . Вакцины • Специальный раздел по эволюционной и системной иммунологии. 65 : 21–27. doi : 10.1016/j.coi.2020.01.006 . PMC 7195337 . PMID 32259744 .
^ «Глобальная статистика ВИЧ -статистики UNAIDS 2023» (PDF) . UNAIDS 2023 Эпидемиологические оценки . Unaids. 2023 . Получено 2023-09-19 .
^ Дхар Д.В., Амит П., Кумар М.С. (ноябрь 2012 г.). «Идентификация in-silico новых генов в ВИЧ-1 методом прогнозирования ORF» (PDF) . Международный исследовательский журнал биологических наук . 1 (7): 52–54.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Фария Н.Р., Рамбаут А., Сучерд М.А., Баеле Г., Бедфорд Т., Уорд М.Дж. и др. (Октябрь 2014). «Эпидемиология ВИЧ. Раннее распространение и эпидемическое воспламенение ВИЧ-1 в популяциях человека» . Наука . 346 (6205): 56–61. Bibcode : 2014sci ... 346 ... 56f . doi : 10.1126/science.1256739 . PMC 4254776 . PMID 25278604 .
^ Bobkov AF, Kazennova EV, Selimova LM, Khanina TA, Ryabov GS, Bobkova MR, et al. (October 2004). "Temporal trends in the HIV-1 epidemic in Russia: predominance of subtype A". Journal of Medical Virology . 74 (2): 191–196. doi : 10.1002/jmv.20177 . PMID 15332265 . S2CID 33267610 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Goudsmit J (1997). Вирусный пол; Природа СПИДа . Нью -Йорк: издательство Оксфордского университета. С. 51–58 . ISBN 978-0-19-509728-3 .
^ Саллам М., Шахин Гё, Ингман М., Виделл А., Эсбьернссон Дж., Медстранд П (июль 2017 г.). «Генетическая характеристика передачи вируса иммунодефицита человека типа 1 на Ближнем Востоке и в Северной Африке» . Гелион . 3 (7): E00352. Bibcode : 2017Heliy ... 300352S . doi : 10.1016/j.heliyon.2017.e00352 . PMC 5506879 . PMID 28725873 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ)» . Трансфузионная медицина и гемотерапия . 43 (3): 203–222. Май 2016. Дои : 10.1159/000445852 . PMC 4924471 . PMID 27403093 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} «Введение в типы ВИЧ, группы и подтипы» . 3 марта 2008 года. Архивировано с оригинала 13 сентября 2008 года . Получено 25 мая 2008 года .
^ Hemelaar J, Gouws E, Ghys PD, Osmanov S (октябрь 2006 г.). «Глобальное и региональное распределение генетических подтипов и рекомбинантов ВИЧ-1 в 2004 году» . СПИД . 20 (16): W13 - W23. doi : 10.1097/01.aids.0000247564.73009.bc . PMID 17053344 . S2CID 7354033 .
^ Weintraub K (6 ноября 2019 г.). «Первый новый напряжение ВИЧ за 19 лет выявлено» . Scientific American .
^ Коэн J (октябрь 2014 г.). «Вирулогия. Ранний вирус СПИДа может иметь рельсы Африки» . Наука . 346 (6205): 21–22. doi : 10.1126/science.346.6205.21 . PMID 25278591 .
^ Кури В., Хури Р., Германия Ю., Авраантес Ю. (Март 2015 г.). (Кула на Кубасе ebiomedicine . 2 (3): 244–2 doi : 10.1016/j.ebiy . PMC 4444819 . PMID 26137563 .
^ "Что такое ВИЧ и СПИД?" Полем Быть в курсе .
^ Джованетти М., Чиккоцци М., Паролин С, Борсетти А (декабрь 2020 г.). «Молекулярная эпидемиология ВИЧ-1 в африканских странах: всесторонний обзор» . Патогены . 9 (12): 1072. doi : 10.3390/pathogens9121072 . PMC 7766877 . PMID 33371264 .
^ Тебит, Денис М.; Патель, Хэмиш; Рэтклифф, Аннет; Алессандри, Элоди; Лю, Джозеф; Плотник, кристалл; Plantier, Жан-Кристоф; Arts, Eric J. (2016-07-01). «Группа ВИЧ-1 o Генотипы и фенотипы: связь с физической подготовкой и восприимчивость к антиретровирусным препаратам» . Исследование СПИДа и ретровирусы человека . 32 (7): 676–688. doi : 10.1089/apid.2015.0318 . ISSN 0889-2229 . PMC 4931737 . PMID 26861573 .
^ Mourez T, Simon F, Plineier JC (июль 2013 г.). «Не-M варианты вируса иммунодефицита человека типа 1» . Клинические обзоры микробиологии . 26 (3): 448–461. doi : 10.1128/cmr.00012-13 . PMC 3719493 . PMID 23824367 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} D'Arc M, Ayouba A, Esteban A, Learn GH, Boué V, Liegeois F, et al. (Март 2015 г.). «Происхождение эпидемии ВИЧ-1 o в западной низменной гориллах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (11): E1343 - E1352. Bibcode : 2015pnas..112e1343d . doi : 10.1073/pnas.1502022112 . PMC 4371950 . PMID 25733890 .
^ Petters M, Gueye A, Mboup S, Bibollet-ruche F, Ekaza E, Mulanga C, et al. (Март 1997 г.). «Гографическое распределение вирусов ВИЧ-1 в Африке » СПИД (4 ) : 493–4 Doi : 10.1097/ 00002030-199704000000000000000000-0 9084797PMID 24238394S2CID
^ Van Heuverswyn F, Li Y, Neel C, Bailes E, Keele Bf, Liu W, et al. (Ноябрь 2006 г.). «Вирусы иммунодефицита человека: инфекция SIV у диких горилл» . Природа . 444 (7116): 164. Bibcode : 2006natur.444..164V . doi : 10.1038/444164a . PMID 17093443 . S2CID 27475571 .
^ «Анализ Abbott Realtime ВИЧ-1» (PDF) . Эббот Молекулярный . Архивировано из оригинала (PDF) на 2007-09-21 . Получено 2008-05-18 .
^ JC Planner, Leoz M, Dickerson Je, Oliveira (Август 2009 г.). "Новый вирус иммуно дефицита человека. Природная медицина 15 (8): 871–872. два : 10,1038/нм . 19648927PMID 76837833S2CID
^ «Новый штамм ВИЧ обнаружен» . CBC News . Ассошиэйтед Пресс . 2009-08-03 . Получено 2009-08-03 .
^ McNeil DG (16 сентября 2010 г.). «Предшественник ВИЧ был в обезьянах на протяжении тысячелетий» . Нью -Йорк Таймс . Получено 2010-09-17 . Но П, кажется, перешел из гориллы; Это было обнаружено только в прошлом году, и только у одной женщины, которая была из Камеруна, где за мясо охотятся по низменным гориллам.
^ «Сенегальные секс -работники изучают» . Гарвардская инициатива СПИДа . Бостон, Массачусетс: Гарвардский университет. 2018-06-29 . Получено 2020-06-18 .
^ «Вирус иммунодефицита человека тип 2» . Семинар по ВИЧ/СПИДу . Архивировано из оригинала 18 февраля 2009 года.
^ Bryceson A, Tomkins A, Ridley D, Warhurst D, Goldstone A, Bayliss G, et al. (Июль 1988 г.). «СПИД, связанные с ВИЧ-2 в 1970-х годах». Лансет . 2 (8604): 221. DOI : 10.1016/S0140-6736 (88) 92325-2 . PMID 2899693 . S2CID 32378074 .
^ «Анализы скрининга доноров на инфекционные агенты и диагностические анализы ВИЧ» . Центр оценки биологических данных и исследований . Управление по контролю за продуктами и лекарствами США. Архивировано из оригинала 11 мая 2009 года.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Santiago ML, Range F, Keele Bf, Li Y, Bailes E, Bibollet-ruche F, et al. (Октябрь 2005 г.). «Инфекция вируса иммунодефицита иммунодефицита в сажи из свободного сочетания (Cercocebus atys) из леса Таи, Кот-д'Ивуар: последствия для происхождения эпидемического вируса иммунодефицита человека тип 2» . Журнал вирусологии . 79 (19): 12515–12527. doi : 10.1128/JVI.79.19.12515-12527.2005 . PMC 1211554 . PMID 16160179 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Маркс П.А., Алькабс П.Г., Друкер Е (июнь 2001 г.). «Серийный проход человека вируса иммунодефицита об одномине с помощью нестерильных инъекций и появление эпидемического вируса иммунодефицита человека в Африке» . Философские транзакции Королевского общества Лондона. Серия B, биологические науки . 356 (1410): 911–920. doi : 10.1098/rstb.2001.0867 . PMC 1088484 . PMID 11405938 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Клинические рекомендации» . Aidinfo . Национальная библиотека медицины США. Архивировано с оригинала 2016-11-07 . Получено 2014-10-24 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Вирус иммунодефицита человека типа 2 (ВИЧ-2)» . Институт СПИДОГО СПИДОГО МЕСТИКА СТАЦИОННЫХ СТИДЕЙ Нью -Йорк .
^ Балтика С (11 декабря 2018 г.). «ВИЧ-2 смертельно, чем думал, несмотря на медленное прогрессирование СПИДа» . Medscape . Архивировано с оригинала 2019-04-19 . Получено 2018-12-28 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} R Kannangai, S David, G Sridharan. «Вирус иммунодефицита человека типа 2-A более мягкий, добранный вирус: обновление». Индийский журнал медицинской микобиологии , (2012) 30 (1): 6–15.
^ Nyamweya S, Hegedus A, Jaye A, Rowland-Jones S, Flanagan KL, Macallan DC (июль 2013 г.). «Сравнение инфекции ВИЧ-1 и ВИЧ-2: уроки вирусного иммунопатогенеза». Отзывы о медицинской вирусологии . 23 (4): 221–40. doi : 10.1002/rmv.1739 . PMID 23444290 . S2CID 206448956 .
^ Bons E, Bertels F, Regoes RR (июль 2018 г.). «Оценка распределения эффектов мутационной пригодности во время ранней ВИЧ -инфекции» . Эволюция вируса . 4 (2): VEY029. doi : 10.1093/ve/vey029 . PMC 6172364 . PMID 30310682 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Fraser C, Hollingsworth TD, Chapman R, De Wolf F, Hanage WP (октябрь 2007 г.). «Изменение вирусной нагрузки ВИЧ-1: эпидемиологический анализ и эволюционная гипотеза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (44): 17441–17446. Bibcode : 2007pnas..10417441f . doi : 10.1073/pnas.0708559104 . PMC 2077275 . PMID 17954909 .
^ Пейн Р., Муенхофф М., Манн Дж., Робертс Х. Х., Мэтьюз П., Адленд Э. и др. (Декабрь 2014). «Влияние адаптации ВИЧ, управляемой HLA, на вирулентность в популяциях высокой серопревалентности ВИЧ» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (50): E5393 - E5400. BIBCODE : 2014PNAS..111E5393P . doi : 10.1073/pnas.1413339111 . PMC 4273423 . PMID 25453107 .
^ Галлахер Дж (декабрь 2014 г.). «ВИЧ превращается в« более мягкую форму » . BBC News . Получено 20 июля 2017 года .
^ Guglielmi G (февраль 2022 г.). «Высоко вирулентный вариант ВИЧ обнаружен в Европе». Природа . doi : 10.1038/d41586-022-00317-x . PMID 35115695 . S2CID 246530234 .
^ Wymant C, Bezemer D, Blanquart F, Ferretti L, Gall A, Hall M, et al. (Февраль 2022 г.). «Высоко вирулентный вариант ВИЧ-1, циркулирующего в Нидерландах» . Наука . 375 (6580): 540–545. Bibcode : 2022sci ... 375..540t . doi : 10.1126/science.abk1688 . HDL : 1887/3502598 . PMID 35113714 . S2CID 246530612 .

Внешние ссылки

ВИЧ/СПИД в Керли
ВИЧ -типы на ourt.org
3D макромолекулярные структуры ВИЧ-1 в AM Data Bank (EMDB) архивировали 2020-08-08 на машине Wayback
Географическое распределение подтипных последовательностей в базе данных ВИЧ GenBank

[1] Хотя ICTV перечисляет ВИЧ-1 и ВИЧ-2 как отдельные виды от SIV, они кладистически попадают в группу SIV.

[doi10.1101/cshperspect.a006841-2] Jump up to: ^а ^{беременный} Sharp PM, Hahn BH (сентябрь 2011 г.). «Происхождение ВИЧ и пандемии СПИДа» . Перспективы Cold Spring Harbor в медицине . 1 (1): A006841. doi : 10.1101/cshperspect.a006841 . PMC 3234451 . PMID 22229120 .

[pmid7723052-3] Робертсон Д.Л., Хан Б.Х., Шарп Прем (март 1995 г.). «Рекомбинация в вирусах СПИДа» . Журнал молекулярной эволюции . 40 (3): 249–259. Bibcode : 1995jmole..40..249r . doi : 10.1007/bf00163230 . PMID 7723052 . S2CID 19728830 .

[4] Гари Эн, Вейнер Д.Б. (август 2020 г.). «ДНК -вакцины: прайм -тайм сейчас» . Текущее мнение в иммунологии . Вакцины • Специальный раздел по эволюционной и системной иммунологии. 65 : 21–27. doi : 10.1016/j.coi.2020.01.006 . PMC 7195337 . PMID 32259744 .

[5] «Глобальная статистика ВИЧ -статистики UNAIDS 2023» (PDF) . UNAIDS 2023 Эпидемиологические оценки . Unaids. 2023 . Получено 2023-09-19 .

[6] Дхар Д.В., Амит П., Кумар М.С. (ноябрь 2012 г.). «Идентификация in-silico новых генов в ВИЧ-1 методом прогнозирования ORF» (PDF) . Международный исследовательский журнал биологических наук . 1 (7): 52–54.

[Faria_2014-7] Jump up to: ^а ^{беременный} Фария Н.Р., Рамбаут А., Сучерд М.А., Баеле Г., Бедфорд Т., Уорд М.Дж. и др. (Октябрь 2014). «Эпидемиология ВИЧ. Раннее распространение и эпидемическое воспламенение ВИЧ-1 в популяциях человека» . Наука . 346 (6205): 56–61. Bibcode : 2014sci ... 346 ... 56f . doi : 10.1126/science.1256739 . PMC 4254776 . PMID 25278604 .

[pmid15332265-8] Bobkov AF, Kazennova EV, Selimova LM, Khanina TA, Ryabov GS, Bobkova MR, et al. (October 2004). "Temporal trends in the HIV-1 epidemic in Russia: predominance of subtype A". Journal of Medical Virology . 74 (2): 191–196. doi : 10.1002/jmv.20177 . PMID 15332265 . S2CID 33267610 .

[Goudsmit-9] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Goudsmit J (1997). Вирусный пол; Природа СПИДа . Нью -Йорк: издательство Оксфордского университета. С. 51–58 . ISBN 978-0-19-509728-3 .

[10] Саллам М., Шахин Гё, Ингман М., Виделл А., Эсбьернссон Дж., Медстранд П (июль 2017 г.). «Генетическая характеристика передачи вируса иммунодефицита человека типа 1 на Ближнем Востоке и в Северной Африке» . Гелион . 3 (7): E00352. Bibcode : 2017Heliy ... 300352S . doi : 10.1016/j.heliyon.2017.e00352 . PMC 5506879 . PMID 28725873 .

[Arbeitskreis_Blut-11] Jump up to: ^а ^{беременный} «Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ)» . Трансфузионная медицина и гемотерапия . 43 (3): 203–222. Май 2016. Дои : 10.1159/000445852 . PMC 4924471 . PMID 27403093 .

[Avert-12] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} «Введение в типы ВИЧ, группы и подтипы» . 3 марта 2008 года. Архивировано с оригинала 13 сентября 2008 года . Получено 25 мая 2008 года .

[pmid717053344-13] Hemelaar J, Gouws E, Ghys PD, Osmanov S (октябрь 2006 г.). «Глобальное и региональное распределение генетических подтипов и рекомбинантов ВИЧ-1 в 2004 году» . СПИД . 20 (16): W13 - W23. doi : 10.1097/01.aids.0000247564.73009.bc . PMID 17053344 . S2CID 7354033 .

[14] Weintraub K (6 ноября 2019 г.). «Первый новый напряжение ВИЧ за 19 лет выявлено» . Scientific American .

[15] Коэн J (октябрь 2014 г.). «Вирулогия. Ранний вирус СПИДа может иметь рельсы Африки» . Наука . 346 (6205): 21–22. doi : 10.1126/science.346.6205.21 . PMID 25278591 .

[16] Кури В., Хури Р., Германия Ю., Авраантес Ю. (Март 2015 г.). (Кула на Кубасе ebiomedicine . 2 (3): 244–2 doi : 10.1016/j.ebiy . PMC 4444819 . PMID 26137563 .

[17] "Что такое ВИЧ и СПИД?" Полем Быть в курсе .

[18] Джованетти М., Чиккоцци М., Паролин С, Борсетти А (декабрь 2020 г.). «Молекулярная эпидемиология ВИЧ-1 в африканских странах: всесторонний обзор» . Патогены . 9 (12): 1072. doi : 10.3390/pathogens9121072 . PMC 7766877 . PMID 33371264 .

[19] Тебит, Денис М.; Патель, Хэмиш; Рэтклифф, Аннет; Алессандри, Элоди; Лю, Джозеф; Плотник, кристалл; Plantier, Жан-Кристоф; Arts, Eric J. (2016-07-01). «Группа ВИЧ-1 o Генотипы и фенотипы: связь с физической подготовкой и восприимчивость к антиретровирусным препаратам» . Исследование СПИДа и ретровирусы человека . 32 (7): 676–688. doi : 10.1089/apid.2015.0318 . ISSN 0889-2229 . PMC 4931737 . PMID 26861573 .

[20] Mourez T, Simon F, Plineier JC (июль 2013 г.). «Не-M варианты вируса иммунодефицита человека типа 1» . Клинические обзоры микробиологии . 26 (3): 448–461. doi : 10.1128/cmr.00012-13 . PMC 3719493 . PMID 23824367 .

[doi10.1089/aid.2006.22.83-21] Jump up to: ^а ^{беременный} D'Arc M, Ayouba A, Esteban A, Learn GH, Boué V, Liegeois F, et al. (Март 2015 г.). «Происхождение эпидемии ВИЧ-1 o в западной низменной гориллах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (11): E1343 - E1352. Bibcode : 2015pnas..112e1343d . doi : 10.1073/pnas.1502022112 . PMC 4371950 . PMID 25733890 .

[pmid9084797-22] Petters M, Gueye A, Mboup S, Bibollet-ruche F, Ekaza E, Mulanga C, et al. (Март 1997 г.). «Гографическое распределение вирусов ВИЧ-1 в Африке » СПИД (4 ) : 493–4 Doi : 10.1097/ 00002030-199704000000000000000000-0 9084797PMID 24238394S2CID

[VanHeuv-23] Van Heuverswyn F, Li Y, Neel C, Bailes E, Keele Bf, Liu W, et al. (Ноябрь 2006 г.). «Вирусы иммунодефицита человека: инфекция SIV у диких горилл» . Природа . 444 (7116): 164. Bibcode : 2006natur.444..164V . doi : 10.1038/444164a . PMID 17093443 . S2CID 27475571 .

[24] «Анализ Abbott Realtime ВИЧ-1» (PDF) . Эббот Молекулярный . Архивировано из оригинала (PDF) на 2007-09-21 . Получено 2008-05-18 .

[pmid19648927-25] JC Planner, Leoz M, Dickerson Je, Oliveira (Август 2009 г.). "Новый вирус иммуно дефицита человека. Природная медицина 15 (8): 871–872. два : 10,1038/нм . 19648927PMID 76837833S2CID

[CBC_news_HIV_P-26] «Новый штамм ВИЧ обнаружен» . CBC News . Ассошиэйтед Пресс . 2009-08-03 . Получено 2009-08-03 .

[millennia-27] McNeil DG (16 сентября 2010 г.). «Предшественник ВИЧ был в обезьянах на протяжении тысячелетий» . Нью -Йорк Таймс . Получено 2010-09-17 . Но П, кажется, перешел из гориллы; Это было обнаружено только в прошлом году, и только у одной женщины, которая была из Камеруна, где за мясо охотятся по низменным гориллам.

[28] «Сенегальные секс -работники изучают» . Гарвардская инициатива СПИДа . Бостон, Массачусетс: Гарвардский университет. 2018-06-29 . Получено 2020-06-18 .

[29] «Вирус иммунодефицита человека тип 2» . Семинар по ВИЧ/СПИДу . Архивировано из оригинала 18 февраля 2009 года.

[pmid2899693-30] Bryceson A, Tomkins A, Ridley D, Warhurst D, Goldstone A, Bayliss G, et al. (Июль 1988 г.). «СПИД, связанные с ВИЧ-2 в 1970-х годах». Лансет . 2 (8604): 221. DOI : 10.1016/S0140-6736 (88) 92325-2 . PMID 2899693 . S2CID 32378074 .

[31] «Анализы скрининга доноров на инфекционные агенты и диагностические анализы ВИЧ» . Центр оценки биологических данных и исследований . Управление по контролю за продуктами и лекарствами США. Архивировано из оригинала 11 мая 2009 года.

[Santiago2005-32] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Santiago ML, Range F, Keele Bf, Li Y, Bailes E, Bibollet-ruche F, et al. (Октябрь 2005 г.). «Инфекция вируса иммунодефицита иммунодефицита в сажи из свободного сочетания (Cercocebus atys) из леса Таи, Кот-д'Ивуар: последствия для происхождения эпидемического вируса иммунодефицита человека тип 2» . Журнал вирусологии . 79 (19): 12515–12527. doi : 10.1128/JVI.79.19.12515-12527.2005 . PMC 1211554 . PMID 16160179 .

[Marx2001-33] Jump up to: ^а ^{беременный} Маркс П.А., Алькабс П.Г., Друкер Е (июнь 2001 г.). «Серийный проход человека вируса иммунодефицита об одномине с помощью нестерильных инъекций и появление эпидемического вируса иммунодефицита человека в Африке» . Философские транзакции Королевского общества Лондона. Серия B, биологические науки . 356 (1410): 911–920. doi : 10.1098/rstb.2001.0867 . PMC 1088484 . PMID 11405938 .

[NIH-34] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Клинические рекомендации» . Aidinfo . Национальная библиотека медицины США. Архивировано с оригинала 2016-11-07 . Получено 2014-10-24 .

[NYSDH-35] Jump up to: ^а ^{беременный} «Вирус иммунодефицита человека типа 2 (ВИЧ-2)» . Институт СПИДОГО СПИДОГО МЕСТИКА СТАЦИОННЫХ СТИДЕЙ Нью -Йорк .

[36] Балтика С (11 декабря 2018 г.). «ВИЧ-2 смертельно, чем думал, несмотря на медленное прогрессирование СПИДа» . Medscape . Архивировано с оригинала 2019-04-19 . Получено 2018-12-28 .

[Kannangai-37] Jump up to: ^а ^{беременный} R Kannangai, S David, G Sridharan. «Вирус иммунодефицита человека типа 2-A более мягкий, добранный вирус: обновление». Индийский журнал медицинской микобиологии , (2012) 30 (1): 6–15.

[pmid23444290-38] Nyamweya S, Hegedus A, Jaye A, Rowland-Jones S, Flanagan KL, Macallan DC (июль 2013 г.). «Сравнение инфекции ВИЧ-1 и ВИЧ-2: уроки вирусного иммунопатогенеза». Отзывы о медицинской вирусологии . 23 (4): 221–40. doi : 10.1002/rmv.1739 . PMID 23444290 . S2CID 206448956 .

[39] Bons E, Bertels F, Regoes RR (июль 2018 г.). «Оценка распределения эффектов мутационной пригодности во время ранней ВИЧ -инфекции» . Эволюция вируса . 4 (2): VEY029. doi : 10.1093/ve/vey029 . PMC 6172364 . PMID 30310682 .

[Fraser_2007-40] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Fraser C, Hollingsworth TD, Chapman R, De Wolf F, Hanage WP (октябрь 2007 г.). «Изменение вирусной нагрузки ВИЧ-1: эпидемиологический анализ и эволюционная гипотеза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (44): 17441–17446. Bibcode : 2007pnas..10417441f . doi : 10.1073/pnas.0708559104 . PMC 2077275 . PMID 17954909 .

[41] Пейн Р., Муенхофф М., Манн Дж., Робертс Х. Х., Мэтьюз П., Адленд Э. и др. (Декабрь 2014). «Влияние адаптации ВИЧ, управляемой HLA, на вирулентность в популяциях высокой серопревалентности ВИЧ» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (50): E5393 - E5400. BIBCODE : 2014PNAS..111E5393P . doi : 10.1073/pnas.1413339111 . PMC 4273423 . PMID 25453107 .

[42] Галлахер Дж (декабрь 2014 г.). «ВИЧ превращается в« более мягкую форму » . BBC News . Получено 20 июля 2017 года .

[43] Guglielmi G (февраль 2022 г.). «Высоко вирулентный вариант ВИЧ обнаружен в Европе». Природа . doi : 10.1038/d41586-022-00317-x . PMID 35115695 . S2CID 246530234 .

[44] Wymant C, Bezemer D, Blanquart F, Ferretti L, Gall A, Hall M, et al. (Февраль 2022 г.). «Высоко вирулентный вариант ВИЧ-1, циркулирующего в Нидерландах» . Наука . 375 (6580): 540–545. Bibcode : 2022sci ... 375..540t . doi : 10.1126/science.abk1688 . HDL : 1887/3502598 . PMID 35113714 . S2CID 246530612 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

v Т и Инфекции, передаваемые половым путем (ИППП)
Bacterial	Chancroid (Haemophilus ducreyi) Chlamydia, lymphogranuloma venereum (Chlamydia trachomatis) Donovanosis (Klebsiella granulomatis) Gonorrhea (Neisseria gonorrhoeae) Mycoplasma hominis infection (Mycoplasma hominis) Syphilis (Treponema pallidum) Ureaplasma infection (Ureaplasma urealyticum)
Protozoal	Trichomoniasis (Trichomonas vaginalis)
Parasitic	Crab louse Scabies
Viral	AIDS (HIV-1/HIV-2) Cancer cervical vulvar penile anal Human papillomavirus (HPV) Genital warts (condyloma) Hepatitis B (Hepatitis B virus) Herpes simplex HSV-1 & HSV-2 Molluscum contagiosum (MCV) Zika fever (Zika virus)
General inflammation	female Cervicitis Pelvic inflammatory disease (PID) male Epididymitis Prostatitis either Proctitis Urethritis/Non-gonococcal urethritis (NGU)