Кишечная микробиота

Микробиота кишечника , кишечный микробиом или кишечная флора это микроорганизмы , включая бактерии , археи , грибы и вирусы , которые живут в пищеварительных трактах животных - . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Желудочно -кишечный метагеном является заполнителем всех геномов кишечной микробиоты . ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Кита является основным местоположением человеческого микробиома . ^{[ 5 ]} Микробиота кишечника обладает широким воздействием, включая влияние на колонизацию , устойчивость к патогенам , поддержание кишечного эпителия , метаболизирование диетических и фармацевтических соединений, контроля иммунной функции и даже поведения через ось кишечного мозга . ^{[ 4 ]}

Микробный состав кишечной микробиоты варьируется по областям пищеварительного тракта. Котолога различных содержит самую высокую микробную плотность всех, ассоциированных с человеком микробным сообществом, изученным до сих пор, что составляет от 300 до 1000 видов . ^{[ 6 ]} Бактерии являются крупнейшими и на сегодняшний день, наиболее изученным компонентом, а 99% кишечных бактерий - около 30 или 40 видов. ^{[ 7 ]} До 60% сухой массы фекалий - бактерии. ^{[ 8 ]} Более 99% бактерий в кишечнике составляют анаэробные , но в кишке слепой аэробные бактерии достигают высокой плотности. ^{[ 5 ]} По оценкам, у человеческой кишечной микробиоты есть примерно в сто раз больше генов , чем в геноме человека .

Обзор

У людей микробиота кишечника имеет самые высокие количества и виды бактерий по сравнению с другими областями организма. ^{[ 9 ]} Приблизительное количество бактерий, составляющих кишечную микробиоту, составляет около 10 ¹³–10 ¹⁴. ^{[ 10 ]} У людей кишечная флора создана при рождении и постепенно переходит к государству, напоминающему государство взрослых к двум возрастам, ^{[ 11 ]} совпадает с развитием и созреванием кишечного эпителия и барьера слизистой оболочки кишечника . Этот барьер важен для поддержки симбиотических отношений с кишечной флорой, обеспечивая защиту от патогенных организмов. ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}

Отношения между какой-то кишечной микробиотой и людьми являются не просто комменсальными (безвредное сосуществование), а скорее взаимные отношения. ^{[ 5 ]}^: 700 Некоторые микроорганизмы кишечника человека приносят пользу хозяину, ферментируя диетические волокны в короткоцепочечные жирные кислоты (SCFA), такие как уксусная кислота и масляная кислота , которые затем поглощаются хозяином. ^{[ 9 ]}^{[ 14 ]} Кишечные бактерии также играют роль в синтезе витамина В и витамина К, а также метаболизируют желчные кислоты , стеролы и ксенобиотики . ^{[ 5 ]}^{[ 14 ]} Системное значение SCFA и других соединений, которые они производят, похожи на гормоны , а сама флора кишечника, по -видимому, функционирует как эндокринный орган . ^{[ 14 ]} Дисгуляция кишечной флоры коррелировала с множеством воспалительных и аутоиммунных состояний. ^{[ 9 ]}^{[ 15 ]}

Состав микробиоты кишечника человека меняется с течением времени, когда диета меняется, и по мере изменения общего состояния здоровья. ^{[ 9 ]}^{[ 15 ]} Систематический обзор 2016 года изучал доклинические и небольшие испытания на людях, которые были проведены с определенными коммерчески доступными штаммами пробиотических бактерий, и выявил те, которые имели наибольший потенциал, чтобы быть полезными для определенных расстройств центральной нервной системы . ^{[ 16 ]} Следует также подчеркнуть, что средиземноморская диета, богатая овощами и волокнами, стимулирует активность и рост полезных бактерий для мозга. ^{[ 17 ]}

Классификации

Микробный состав кишечной микробиоты варьируется по всему пищеварительному тракту. В желудке и тонкой кишке обычно присутствует относительно мало видов бактерий. ^{[ 6 ]}^{[ 18 ]} Котоль пор , напротив, содержит самую высокую микробную плотность любого изученного микробного сообщества, связанного с человеком, изученного до сих ^{[ 19 ]} с 10 ¹⁰ и 10 ¹¹ клетки на грамм кишечного содержания. ^{[ 20 ]} Эти бактерии представляют от 300 до 1000 различных видов . ^{[ 6 ]}^{[ 18 ]} Тем не менее, 99% бактерий составляют около 30 или 40 видов. ^{[ 7 ]} Как следствие их изобилия в кишечнике, бактерии также составляют до 60% сухой массы фекалий . ^{[ 8 ]} Грибы , протисты , археи и вирусы также присутствуют во флоре кишечника, но меньше известно о их деятельности. ^{[ 21 ]}

Более 99% бактерий в кишечнике составляют анаэробные , но в кишке слепой аэробные бактерии достигают высокой плотности. ^{[ 5 ]} Предполагается, что у этих кишечных флоры всего в сто раз больше генов , чем в геноме человека . ^{[ 22 ]}

Многие виды в кишечнике не изучались за пределами их хозяев, потому что их нельзя культивировать . ^{[ 18 ]}^{[ 7 ]}^{[ 23 ]} В то время как существует небольшое количество основных микробных видов, разделяемых большинством особей, популяции микробов могут сильно различаться. ^{[ 24 ]} Внутри человека их микробные популяции со временем остаются довольно постоянными, причем некоторые изменения происходят из -за изменений в образе жизни, диете и возрасте. ^{[ 6 ]}^{[ 25 ]} Проект Microbiome Human намеревался лучше описать микробиоту кишечника человека и других мест тела. ^{[ Цитация необходима ]}

Четыре доминантных бактериальных фила в кишечнике человека - бациллота (Firmicutes), бактероидота , актиномицетота и псевдомонадота . ^{[ 26 ]} Большинство бактерий принадлежат к родам Bacteroides , Clostridium , Faecalibacterium , ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Eubacterium , Ruminococcus , Peptococcus , Peptostreptococcus и Bifidobacterium . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Другие роды, такие как Escherichia и Lactobacillus , присутствуют в меньшей степени. ^{[ 6 ]} Виды только из рода Bacteroides составляют около 30% всех бактерий в кишечнике, что позволяет предположить, что этот род особенно важен для функционирования хозяина. ^{[ 18 ]}

Грибковые роды, которые были обнаружены в кишечнике, включают Candida , Saccharomyces , Aspergillus , Penicillium , Rhodotorula , Trametes , Pleospora , Sclerotinia , Bullera и Galactomyces , среди других. ^{[ 27 ]}^{[ 28 ]} Rhodotorula чаще всего встречается у людей с воспалительным заболеванием кишечника , в то время как Candida чаще всего встречается у людей с циррозом гепатита B и хроническим гепатитом B. ^{[ 27 ]}

Из -за распространенности грибов в естественной среде, определение того, какие роды и виды являются постоянными членами микобиома кишечника , трудно. ^{[ 29 ]}^{[ 30 ]} Ведутся исследования относительно того, является ли Penicillium постоянным или временным членом кишечной флоры, полученным из пищевых источников, таких как сыр , хотя известно, что несколько видов в роде выживают при температурах около 37 ° C, примерно так же, как основной организм температура ^{[ 30 ]} Saccharomyces cerevisiae , пивоваренные дрожжи, известно, что он достигает кишечника после проглатывания и может нести ответственность за синдром автоматического заготовки условия в тех случаях, когда он переизбыт, ^{[ 30 ]}^{[ 31 ]}^{[ 32 ]} В то время как Candida Albicans , вероятно, является постоянным членом и, как полагают, приобретается при рождении за счет вертикальной передачи . ^{[ 33 ]}^{[ Медицинская цитата необходима ]}

Archaea составляет еще один большой класс кишечной флоры, которые важны в метаболизме бактериальных продуктов ферментации.

Индустриализация связана с изменениями в микробиоте, и снижение разнообразия может привести к вымиранию определенных видов; В 2018 году исследователи предложили биобанк -репозиторий микробиоты человека. ^{[ 34 ]}

Энтеротип

Энтерпотип экосистеме - это классификация живых организмов, основанных на его бактериологической в микробиоме кишечника человека, не продиктованный по возрасту, полу, массу тела или национальные подразделения. ^{[ 35 ]} Есть признаки того, что долгосрочная диета влияет на энтеротип. ^{[ 36 ]} Были предложены три человека энтеротипа, ^{[ 35 ]}^{[ 37 ]} Но их ценность была поставлена под сомнение. ^{[ 38 ]}

Композиция

Бактериом

Желудок

Из -за высокой кислотности желудка большинство микроорганизмов не могут выжить там. Основные бактерии желудочной микробиоты относятся к пяти основным филам: Firmicutes , Bacteroidetes , Actinobacteria , Fusobacteriota и Proteobacteria . Доминирующими родами являются Prevotella , Streptococcus , Veillonella , Rothia и Haemophilus . ^{[ 39 ]} Взаимодействие между ранее существовавшей желудочной микробиотой с введением H. pylori может влиять на прогрессирование заболевания . ^{[ 39 ]} Когда есть присутствие H. pylori, он становится доминирующим из микробиоты. ^{[ 40 ]}

Кишечник

Бактерия	Заболеваемость (%)
Бактерии обычно встречаются в толстой кишке человека ^{[ 41 ]}
Bacteroides fragilis	100
Bacteroides melaninogenicus	100
Bacteroides Oralis	100
Enterococcus faecalis	100
Они продемонстрировали холод	100
Enterobacter sp.	40–80
Klebsiella sp.	40–80
Bifidobacterium bifidum	30–70
Staphylococcus aureus	30–50
Lactobacillus	20–60
Clostridium perfringens	25–35
Протеус замечательный	5–55
Clostridium tetani	1–35
Clostridium septicum	5–25
Pseudomonas aeruginosa	3–11
Salmonella enterica	3–7
Faecalibacterium prausnitzii	?общий
Peptostreptococcus sp.	?общий
Peptococcus sp.	?общий

Небольшая кишка содержит следовое количество микроорганизмов из -за близости и влияния желудка. Грамположительные бактерии в форме кокки и стержня являются преобладающими микроорганизмами, обнаруженными в тонкой кишке. ^{[ 5 ]} Однако в дистальной части тонкой кишки щелочных условий подтверждают грамотрицательные бактерии Enterobacteriaceae . ^{[ 5 ]} Бактериальная флора тонкой кишки помогает в широком диапазоне кишечных функций. Бактериальная флора обеспечивает регулирующие сигналы, которые позволяют развивать и полезность кишечника. Выращивание бактерий в тонкой кишке может привести к кишечной недостаточности. ^{[ 42 ]} Кроме того, большая кишка содержит самую большую бактериальную экосистему в организме человека. ^{[ 5 ]} Около 99% флоры большой кишки и фекалий состоит из облигатных анаэробных районов, таких как Bacteroides и Bifidobacterium. ^{[ 43 ]} Факторы, которые нарушают популяцию микроорганизма большой кишки, включают антибиотики, стресс и паразиты. ^{[ 5 ]}

Бактерии составляют большую часть флоры в толстой кишке ^{[ 44 ]} и приходится 60% фекального азота. ^{[ 6 ]} Этот факт делает фекалии идеальным источником кишечной флоры для любых испытаний и экспериментов путем экстракции нуклеиновой кислоты из фекальных образцов, а бактериальные последовательности генов 16S рРНК генерируются бактериальными праймерами. Эта форма тестирования также часто предпочтительнее для более инвазивных методов, таких как биопсия.

Пять фила доминируют в кишечной микробиоте: бактероидота , бациллота (Firmicutes), актиномицетота , псевдомонадота и verrucomicrobiota - бактероидота и бациллота, составляющие 90% состава. ^{[ 45 ]} Где -то между 300 ^{[ 6 ]} и 1000 различных видов живут в кишечнике, ^{[ 18 ]} с большинством оценок примерно в 500. ^{[ 46 ]}^{[ 47 ]} Тем не менее, вполне вероятно, что 99% бактерий происходят от примерно 30 или 40 видов, а Faecalibacterium prausnitzii (Phylum Firmicutes) является наиболее распространенным видом у здоровых взрослых. ^{[ 7 ]}^{[ 48 ]}

Исследования показывают, что взаимосвязь между кишечной флорой и людьми является не просто комменсальными (безвредное сосуществование), а скорее взаимная , симбиотическая связь. ^{[ 18 ]} Хотя люди могут выжить без кишечной флоры, ^{[ 46 ]} Микроорганизмы выполняют множество полезных функций, таких как ферментирование неиспользованных энергетических субстратов, обучение иммунной системы посредством конечных продуктов метаболизма, таких как пропионат и ацетат , предотвращая рост вредных видов, регулируя развитие кишечника, производя витамины для хозяина (такой в качестве биотина и витамина К ) и производства гормонов для направления хозяина хранить жиры. ^{[ 5 ]} Обширная модификация и дисбаланс кишечной микробиоты и ее микробиома или сбора генов связаны с ожирением. ^{[ 49 ]} Однако в определенных условиях считается, что некоторые виды способны вызывать заболевание , вызывая инфекцию или увеличивая риск рака для хозяина. ^{[ 6 ]}^{[ 44 ]}

Микобиом

Грибы и протисты также составляют часть кишечной флоры, но меньше известно об их деятельности. ^{[ 50 ]}

Вирус

Вирус человека в основном бактериофаги . ^{[ 51 ]}

Вариация

Возраст

Существуют общие закономерности эволюции состава микробиомов в течение жизни. ^{[ 52 ]} В целом, разнообразие состава микробиоты фекальных образцов значительно выше у взрослых, чем у детей, хотя межличностные различия у детей выше, чем у взрослых. ^{[ 53 ]} Большая часть созревания микробиоты в взрослой конфигурации происходит в течение первых трех лет жизни. ^{[ 53 ]}

По мере изменения композиции микробиома, в кишечнике состав бактериальных белков продуцируется в кишечнике. У взрослых микробиомов была обнаружена высокая распространенность ферментов, участвующих в ферментации, метаногенезе и метаболизме аргинина, глутамата, аспартата и лизина. Напротив, в младенческих микробиомах доминирующие ферменты участвуют в метаболизме цистеина и ферментации. ^{[ 53 ]}

География

Композиция кишечного микробиома зависит от географического происхождения популяций. Различия в компромиссе Prevotella , представления гена UREASE и представления генов, кодирующих глутаматсинтазу/деградацию, или другие ферменты, участвующие в деградации аминокислот или биосинтез витамина, показывают значительные различия между популяциями, Малави или Америндеан. источник. ^{[ 53 ]}

Популяция США имеет высокое представление о ферментах, кодирующих деградацию глутамина витамина и липоевой кислоты и ферментов, участвующих в биосинтезе ; Принимая во внимание, что популяции Малави и АМЕРИНДА имеют высокое представление ферментов, кодирующих глутамат-синтазу, и они также имеют чрезмерное представление α-амилазы в их микробиомах. Поскольку население США имеет диету, богатую жиром, чем население Америды или Малавия, которые имеют богатую кукурузой диета, диета, вероятно, является основным детерминантом кишечной бактериальной композиции. ^{[ 53 ]}

Дальнейшие исследования показали большое различие в составе микробиоты между европейскими и сельскими африканскими детьми. Фекальные бактерии детей из Флоренции сравнивались с детьми из маленькой сельской деревни Булпон в Буркина -Фасо . Диета типичного ребенка, живущего в этой деревне, в основном не хватает жиров и животных белков и богата полисахаридами и растительными белками. В фекальных бактериях европейских детей преобладали фирменные тела и показали заметное снижение биоразнообразия, в то время как в фекальных бактериях детей Боулпона преобладали бактериоиды . Повышенное биоразнообразие и различный состав кишечного микробиома в африканских популяциях могут помочь в переваривании обычно неперевариваемых полисахаридов растений, а также может привести к снижению частоты неинфекционных заболеваний толстой кишки. ^{[ 54 ]}

В меньшем масштабе было показано, что совместное использование многочисленных общих воздействий окружающей среды в семье является сильным фактором, определяющим индивидуальный состав микробиома. Этот эффект не имеет генетического влияния, и он последовательно наблюдается в культурно разных популяциях. ^{[ 53 ]}

Недостаток

Недоедованные дети имеют менее зрелую и менее разнообразную микробиоту кишечника, чем у здоровых детей, и изменения в микробиоме, связанные со дефицитом питательных веществ, могут, в свою очередь, быть патофизиологической причиной недоедания. ^{[ 55 ]}^{[ 56 ]} Недоедованные дети также обычно имеют более потенциально патогенную кишечную флору и больше дрожжей во рту и горле. ^{[ 57 ]} Изменение диеты может привести к изменениям в составе микробиоты кишечника и разнообразия. ^{[ 58 ]}

Раса и этническая принадлежность

Исследователи с Американским проектом кишечника и проектом микробиомов человека обнаружили, что двенадцать семейств микробов варьировались в изобилии в зависимости от расы или этнической принадлежности человека. Сила этих ассоциаций ограничена небольшим размером выборки: американский проект кишечника собрал данные от 1375 человек, 90% из которых были белыми. ^{[ 59 ]} Здоровая жизнь в исследовании городских условий (Хелиус) в Амстердаме показала, что у голландского происхождения имеется самый высокий уровень разнообразия микробиоты кишечника, в то время как у происхождения южноазиатского и суринамского происхождения было самое низкое разнообразие. Результаты исследования показали, что люди одной и той же расы или этнической принадлежности имеют больше сходных микробиомов, чем люди из разных расовых слоев. ^{[ 59 ]}

Социально -экономический статус

человека По состоянию на 2020 год, по крайней мере, два исследования продемонстрировали связь между социально -экономическим статусом (SES) и их кишечной микробиотой. Исследование в Чикаго показало, что люди в районах с более высоким SES имели большее разнообразие микробиоты. Люди из районов высшего SES также имели более распространенные бактерии бактерии . Точно так же исследование близнецов в Великобритании показало, что более высокий SES также был связан с большим разнообразием кишечника. ^{[ 59 ]}

Приобретение у младенцев человека

Создание кишечной флоры имеет решающее значение для здоровья взрослого, а также для функционирования желудочно -кишечного тракта. ^{[ 60 ]} У людей кишечная флора, похожая на взрослого, образуется в течение одного-двух лет рождения, поскольку микробиота приобретается с помощью передачи от родителей к ребенку и переноса из пищи, воды и других источников окружающей среды. ^{[ 61 ]}^{[ 12 ]}

Традиционный взгляд на желудочно -кишечный тракт нормального плода заключается в том, что он стерильный, хотя в последние несколько лет эта точка зрения была оспорена. ^{[ временные рамки? ]}^{[ 62 ]} Появилось множество линий доказательств, которые предполагают, что могут быть бактерии в внутриматочной среде. У людей исследования показали, что микробная колонизация может возникнуть у плода ^{[ 63 ]} С одним исследованием, показывающим Lactobacillus и Bifidobacterium, присутствовали в биопсии плаценты. ^{[ 64 ]} Несколько исследований грызунов продемонстрировали наличие бактерий в амниотической жидкости и плаценте, а также в мекониуме детей, рожденных стерильным кесаревым сечением. ^{[ 65 ]}^{[ 66 ]} В другом исследовании исследователи вводили культуру бактерий перорально беременным мышам и обнаружили бактерии у потомства, вероятно, в результате передачи между пищеварительным трактом и амниотической жидкостью через кровоток. ^{[ 67 ]} Тем не менее, исследователи предупреждают, что источник этих внутриматровых бактерий, будь то живые, и их роль, еще не понят. ^{[ 68 ]}^{[ 64 ]}

Во время родов и быстро после этого бактерии от матери и окружающей среды колонизируют кишечник младенца. ^{[ 12 ]} Точные источники бактерий не до конца понятны, но могут включать в себя родовой канал, другие люди (родители, братья и сестры, работники больницы), грудное молоко, пищу и общую среду, с которой взаимодействует младенец. ^{[ 69 ]} Исследования показали, что микробиом детей, рожденных вагинально, значительно отличается от микробийных детей, рожденных кесарева сечения , и что у детей, рожденных влагалищами, получили большинство своих кишечных бактерий от их матери, в то время как микробиота детей, рожденных кесаревами, имела больше бактерий, связанных с больницей среда. ^{[ 70 ]}

В течение первого года жизни композиция кишечной флоры, как правило, проста и сильно меняет время и не совпадает с людьми. ^{[ 12 ]} Первоначальная бактериальная популяция, как правило, факультативные анаэробные организмы ; Исследователи считают, что эти первоначальные колонизаторы снижают концентрацию кислорода в кишечнике, что, в свою очередь, позволяет обязательно анаэробным бактериям, таким как бактероидота , актиномицетота и бациллота , становятся установленными и процветающими. ^{[ 12 ]} Детям в грудью преобладает бифидобактерии , возможно, из-за содержимого факторов роста бифидобактерий в грудном молоке и из-за того, что грудное молоко несет пребиотические компоненты, что обеспечивает здоровый рост бактерий. ^{[ 64 ]}^{[ 71 ]} Грудное молоко также содержит более высокие уровни иммуноглобулина А (IgA), чтобы помочь с толерантностью и регуляцией иммунной системы ребенка. ^{[ 72 ]} Напротив, микробиота детей, питаемых формулами, является более разнообразной, с большим количеством энтеробактерий , энтерококков , бифидобактерий, бактероидов и clostridia. ^{[ 73 ]}

Кесарево сечение, антибиотики и кормление формулы могут изменить состав микробиома кишечника. ^{[ 64 ]} Дети, лечащие антибиотиками, имеют менее стабильные и менее разнообразные цветочные сообщества. ^{[ 74 ]} Было показано, что кесарево сечение разрушают передачу бактерий по материнству, что влияет на общее здоровье потомства, повышая риск заболевания, такие как целиакия , астма и типа диабет 1 . ^{[ 64 ]} Это еще больше свидетельствует о важности здорового кишечного микробиома. Изучаются различные методы восстановления микробиома, которые обычно включают в себя подверженность младенцу на содержание влагалища матери и пероральные пробиотики. ^{[ 64 ]}

Функции

Когда изучение кишечной флоры началось в 1995 году, ^{[ 75 ]} Считалось, что у него есть три ключевые роли: прямая защита от патогенов , укрепление защиты хозяина благодаря его роли в разработке и поддержании кишечного эпителия и индукции производства антител там и метаболизирования невариваемых соединений в пище. Последующая работа обнаружила свою роль в обучении развивающейся иммунной системы, и в то же время дальнейшая работа была сосредоточена на ее роли в оси кишечника . ^{[ 76 ]}

Прямое торможение патогенов

Сообщество кишечников играет прямую роль в защите от патогенов, полностью колонизируя пространство, используя все доступные питательные вещества и секретируя соединения, известные как цитокины , которые убивают или препятствуют нежелательным организмам, которые будут конкурировать за питательные вещества с ним. ^{[ 77 ]} Различные штаммы кишечных бактерий вызывают выработку различных цитокинов. Цитокины - это химические соединения, продуцируемые нашей иммунной системой для инициирования воспалительного ответа на инфекции. Нарушение кишечной флоры позволяет конкурирующим организмам, таким как Clostridium difficile, становятся установленными, которые в противном случае хранятся. ^{[ 77 ]}

Разработка кишечной защиты и иммунной системы

У людей кишечная флора, похожая на взрослого, образуется в течение одного -двух лет рождения. ^{[ 12 ]} Когда кишечная флора устанавливается, подкладка кишечника - кишечного эпителия и слизистого барьера кишечника, который он выделяет, - развивается и в определенной степени и даже поддерживает комменсалистические микроорганизмы, а также также поддерживает комменсалистические микроорганизмы и даже поддерживает комменсалистические микроорганизмы и даже поддерживает комменсалистические микроорганизмы и даже поддерживает комменсалистические микроорганизмы и даже поддерживает комменсалистические микроорганизмы и даже поддерживает комменсалистические микроорганизмы, и даже поддерживает и даже поддерживает комменсалистические микроорганизмы. обеспечивает барьер для патогенных. ^{[ 12 ]} В частности, кубковые клетки , которые продуцируют слизистую слизистую оболочку, а слой слизистой оболочки утолщается, обеспечивая наружный слой слизистой оболочки, в котором «дружественные» микроорганизмы могут закреплять и кормить, и внутренний слой, который даже эти организмы не могут проникнуть. ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]} Кроме того, развитие кишечной лимфоидной ткани (GALT), которая является частью кишечного эпителия и которая обнаруживает и реагирует на патогены, появляется и развивается в течение времени, когда развивается и устанавливается кишечная флора. ^{[ 12 ]} GALT, который развивается, терпимо к видам кишечника, но не к другим микроорганизмам. ^{[ 12 ]} Галт также обычно становится терпимым к пище, к которой подвергается младенец, а также пищеварительные продукты питания, а также метаболиты кишечной флоры (молекулы, образованные из метаболизма), полученные из пищи. ^{[ 12 ]}

человека Иммунная система создает цитокины , которые могут заставить иммунную систему создавать воспаление, чтобы защитить себя, и которые могут сдержать иммунный ответ, чтобы поддерживать гомеостаз и допустить заживление после оскорбления или травмы. ^{[ 12 ]} Было показано, что различные виды бактерий, которые появляются во флоре кишечника, способны управлять иммунной системой для избирательного создания цитокинов; Например, Bacteroides fragilis и некоторые виды Clostridia , по-видимому, управляют противовоспалительным ответом, в то время как некоторые сегментированные нитевидные бактерии способствуют выработке воспалительных цитокинов. ^{[ 12 ]}^{[ 78 ]} Флора кишечника также может регулировать производство антител иммунной системой. ^{[ 12 ]}^{[ 79 ]} Одна функция этой регуляции состоит в том, чтобы привести к переходу В -клеток на IGA . В большинстве случаев B -клетки нуждаются в активации от T -Helper Cells, чтобы вызвать переключение класса ; Однако в другом пути кишечная флора вызывает передачу сигналов NF-KB с помощью эпителиальных клеток кишечника, что приводит к секретированию дальнейших сигнальных молекул. ^{[ 80 ]} Эти сигнальные молекулы взаимодействуют с B -клетками, чтобы вызвать переключение класса на IgA. ^{[ 80 ]} IgA является важным типом антитела, которое используется в слизистой среде, таких как кишка. Было показано, что IGA может помочь диверсифицировать сообщество кишечников и помогает избавиться от бактерий, которые вызывают воспалительные реакции. ^{[ 81 ]} В конечном счете, IGA поддерживает здоровую среду между хозяином и кишечными бактериями. ^{[ 81 ]} Эти цитокины и антитела могут оказывать эффект за пределами кишечника, в легких и других тканях. ^{[ 12 ]}

Иммунная система также может быть изменена из -за способности кишечных бактерий продуцировать метаболиты , которые могут влиять на клетки в иммунной системе. Например, жирные кислоты с короткой цепью (SCFA) могут быть получены некоторыми кишечными бактериями посредством ферментации . ^{[ 82 ]} SCFAS стимулирует быстрое увеличение продукции врожденных иммунных клеток, таких как нейтрофилы , базофилы и эозинофилы . ^{[ 82 ]} Эти клетки являются частью врожденной иммунной системы, которая пытается ограничить распространение инфекции.

Метаболизм

Метаболизм триптофана с помощью желудочно -кишечной микробиоты человека ( )

Триптофан

Clostridium
Sportogenes

Лакто-
бацилла

Триптофаназа -
выражающий
бактерии

Кишечник
Иммун
ячейки

Кишечник
эпителий

Pxr

Гомеостаз слизистой оболочки:
↓ TNF-A
↑ соединения- белок
кодирование мРНК

L Cell

GLP-1

TJ.

Нейропротектор :
↓ активация глиальных клеток и астроцитов
↓ 4-гидрокси-2-ноннальные уровни
↓ повреждение ДНК
- Антиоксидант
образование –1-амилоидное фибрилл

Поддерживает реакционную способность слизистой оболочки:
↑ IL-22 Производство

Связано с сосудистыми заболеваниями :
↑ Окислительный стресс
↑ клеток гладких мышц Пролиферация
↑ стенки аорты Толщина и кальцификация

Связано с хроническим заболеванием почек :
↑ Почечная дисфункция
- уремический токсин

Почки

Эта диаграмма показывает биосинтез биологически активных соединений ( индол и некоторых других производных) из триптофана бактериями в кишечнике. ^{[ 83 ]} Индол производится из триптофана бактериями, которые экспрессируют триптофаназу . ^{[ 83 ]} Clostridium sporogenes метаболизирует триптофан в индол и впоследствии 3-индолепропионовую кислоту (IPA), ^{[ 84 ]} Высокоэффективный нейропротекторный антиоксидант , который стирает гидроксильные радикалы . ^{[ 83 ]}^{[ 85 ]}^{[ 86 ]} IPA связывается с рецептором X -x беременности (PXR) в кишечных клетках, тем самым облегчая гомеостаз слизистой оболочки и барьерную функцию . ^{[ 83 ]} После поглощения от кишечника и распределения в мозг IPA обеспечивает нейропротекторное действие против церебральной ишемии и болезни Альцгеймера . ^{[ 83 ]} Lactobacillaceae ( Lactobacillus s.l. ) метаболизируют триптофан в индоле-3-альдегид (I3A), который действует на арилоглеводородочный рецептор (AHR) в кишечных иммунных клетках, в свою очередь, увеличивая продукцию интерлейкина-22 (IL-22). ^{[ 83 ]} Сама индоль запускает секрецию глюкагоноподобного пептида-1 (GLP-1) в кишечных L-клетках и действует как лиганд для AHR. ^{[ 83 ]} Индол также может метаболизировать печенью в индоксилсульфат , соединение, которое токсично в высоких концентрациях и связано с сосудистыми заболеваниями и почечной дисфункцией . ^{[ 83 ]} AST-120 ( активированный уголь ), кишечный сорбент , который принимается во рту , адсорбированные индолы, в свою очередь, снижая концентрацию индоксилсульфата в плазме крови. ^{[ 83 ]}

Без кишечниковой флоры человеческое тело не сможет использовать некоторые из непереваренных углеводов, которые он потребляет, потому что некоторые виды кишечника флоры имеют ферменты , которых человеческие клетки не хватает для разрушения определенных полисахаридов . ^{[ 14 ]} Грызуны, поднятые в стерильной среде и отсутствие кишечной флоры, должны есть на 30% больше калорий , чтобы оставаться таким же весом, как и их обычные аналоги. ^{[ 14 ]} Углеводы, которые люди не могут переваривать без бактериальной помощи, включают в себя определенные крахмалы , клетчатки , олигосахариды и сахара , которые организм не смог переваривать и поглощать как лактоза в случае непереносимости лактозы и сахарных спиртов , слизь, продуцируемой кишечником, и белки. ^{[ 9 ]}^{[ 14 ]}

Бактерии превращают углеводы, которые они ферментируют в короткоцепочечные жирные кислоты из-за формы ферментации, называемой сахаролитической ферментацией . ^{[ 47 ]} Продукты включают уксусную кислоту , пропионовую кислоту и мастерную кислоту . ^{[ 7 ]}^{[ 47 ]} Эти материалы могут использоваться клетками -хозяевами, обеспечивая основной источник энергии и питательных веществ. ^{[ 47 ]} Газы (которые участвуют в передаче сигналов ^{[ 87 ]} и могут вызывать метеоризм ), а органические кислоты , такие как молочная кислота , также продуцируются путем ферментации. ^{[ 7 ]} Уксусная кислота используется мышцей , пропионовая кислота способствует печени выработке АТФ , а масла -кислота обеспечивает энергию для кишечных клеток. ^{[ 47 ]}

Флора кишечника также синтезирует витамины, такие как биотин и фолат , и облегчает поглощение диетических минералов , включая магний, кальций и железо. ^{[ 6 ]}^{[ 25 ]} Methanobrevibacter smithii уникален, потому что он не является видом бактерий, а скорее членом домена археи , и является наиболее распространенным метаном , продуктивным видом архиальных видов в микробиоте человека. ^{[ 88 ]}

Микробиота кишечника также служит источником витаминов K и B ₁₂ , которые не производятся организмом или производятся в небольшом количестве. ^{[ 89 ]}^{[ 90 ]}

Деградация целлюлозы

Бактерии, которые разлагают целлюлозу (такие как Ruminococcus ), распространены среди великих обезьян , древних человеческих обществ, общин охотников-собирателей и даже современного сельского населения. Тем не менее, они редки в промышленно развитых обществах. Искусны, связанные с человеком, приобрели гены, которые могут ухудшать определенные волокна растений, такие как кукуруза , рис и пшеница . Бактериальные штаммы, обнаруженные у приматов, также могут разлагать хитин , полимерный, обильный у насекомых, которые являются частью диеты многих нечеловеческих приматов . На снижение этих бактерий в кишечнике человека, вероятно, повлиял сдвиг в сторону западного образа жизни. ^{[ 91 ]}

Pharmacomicrobiomics

Человеческий метагеном (то есть генетический состав индивидуума и всех микроорганизмов, которые находятся на теле или внутри человека), значительно варьируется между людьми. ^{[ 92 ]}^{[ 93 ]} Поскольку общее количество микробных клеток в организме человека (более 100 триллионов) значительно превосходит Homo Sapiens Cltres (десятки триллионов), ^{[ Примечание 1 ]}^{[ 92 ]}^{[ 94 ]} Существует значительный потенциал для взаимодействия между лекарственными средствами и микробиомом человека, в том числе: лекарства, изменяющие состав микробиома человека , метаболизм лекарств профиль препарата с помощью микробных ферментов, модифицирующих фармакокинетический и метаболизм микробного препарата, влияющие на клиническую эффективность препарата и профиль токсичности . ^{[ 92 ]}^{[ 93 ]}^{[ 95 ]}

Помимо углеводов, кишечная микробиота также может метаболизировать другие ксенобиотики, такие как лекарства, фитохимические вещества и пищевые токсиканты. Было показано, что более 30 препаратов метаболизируются с помощью кишечной микробиоты. ^{[ 96 ]} Микробный метаболизм лекарств иногда может инактивировать препарат. ^{[ 97 ]}

Вклад в метаболизм наркотиков

Микробиота кишечника - это обогащенное сообщество, которое содержит разнообразные гены с огромными биохимическими возможностями для модификации лекарств, особенно тех, которые принимаются во рту. ^{[ 98 ]} Микробиота кишечника может влиять на метаболизм лекарств с помощью прямых и косвенных механизмов. ^{[ 99 ]} Прямой механизм опосредуется микробными ферментами, которые могут модифицировать химическую структуру введенных лекарств. ^{[ 100 ]} И наоборот, косвенный путь опосредуется микробными метаболитами, которые влияют на экспрессию метаболизирующих ферментов хозяина, таких как цитохром P450 . ^{[ 101 ]}^{[ 99 ]} Влияние кишечной микробиоты на фармакокинетику и биодоступность препарата было исследовано несколько десятилетий назад. ^{[ 102 ]}^{[ 103 ]}^{[ 104 ]} Эти эффекты могут быть разнообразными; он может активировать неактивные препараты, такие как ловастатин, ^{[ 105 ]} Инактивировать активное лекарство, такое как дигоксин ^{[ 106 ]} или индуцировать лекарственную токсичность, как в иринотекане . ^{[ 107 ]} С тех пор воздействие кишечной микробиоты на фармакокинетику многих препаратов было широко изучено. ^{[ 108 ]}^{[ 98 ]}

Микробиота кишечника человека играет решающую роль в модулировании влияния введенных лекарств на человека. Непосредственно кишечная микробиота может синтезировать и выделять серию ферментов с способностью метаболизировать препараты, такие как микробная биотрансформация L-допа с помощью декарбоксилазы и дегидроксилазы. ^{[ 100 ]} Напротив, кишечная микробиота также может изменить метаболизм лекарств, модулируя метаболизм лекарств -хозяев. Этот механизм может быть опосредован микробными метаболитами или модификацией метаболитов хозяина, которые, в свою очередь, изменяют экспрессию метаболизирующих ферментов хозяина. ^{[ 101 ]}

Большое количество исследований продемонстрировало метаболизм более 50 препаратов кишечной микробиотой. ^{[ 108 ]}^{[ 99 ]} Например, ловастатин (агент, снижающий холестерин), который представляет собой пролекарство лактона, частично активируется микробиотой кишечника человека, образующей метаболиты с активной кислотой. ^{[ 105 ]} И наоборот, дигоксин (препарат, используемый для лечения застойной сердечной недостаточности), инактивируется членом кишечной микробиоты (то есть Eggerthella Lanta ). ^{[ 109 ]} Eggerthella Lanta имеет цитохромодирующий оперон, повышенный дигоксин и связанный с инактивацией дигоксина. ^{[ 109 ]} Микробиота кишечника также может модулировать эффективность и токсичность химиотерапевтических агентов, таких как иринотекан. ^{[ 110 ]} Этот эффект получен из кодируемых микробиомом ферментов β-глюкуронидазы, которые восстанавливают активную форму иринотекана, вызывающего желудочно-кишечную токсичность. ^{[ 111 ]}

Вторичные метаболиты

Это микробное сообщество в кишечнике обладает огромной биохимической способностью производить отдельные вторичные метаболиты, которые иногда производятся при метаболическом преобразовании пищевых продуктов, таких как волокна , эндогенные биологические соединения, такие как индольные или желчные кислоты . ^{[ 112 ]}^{[ 113 ]}^{[ 114 ]} Микробные метаболиты, особенно короткие жирные кислоты (SCFA) и вторичные желчные кислоты (BAS), играют важную роль для человека в состоянии здоровья и болезней. ^{[ 115 ]}^{[ 116 ]}^{[ 117 ]}

Одним из наиболее важных бактериальных метаболитов, продуцируемых кишечной микробиотой, является вторичная желчная кислота (BAS). ^{[ 114 ]} Эти метаболиты продуцируются бактериальной биотрансформацией первичных желчных кислот, таких как холовая кислота (CA) и хенодезоксихолевая кислота (CDCA), во вторичные желчные кислоты (BAS) литохоловая кислота (LCA) и дезокси -холовая кислота (DCA) соответственно. ^{[ 118 ]} Первичные желчные кислоты, которые синтезируются гепатоцитами и хранятся в желчном пузыре, обладают гидрофобными признаками. Эти метаболиты впоследствии метаболизируются кишечной микробиотой во вторичные метаболиты с повышенной гидрофобностью. ^{[ 118 ]} Жиль гидролазы (BSH), которые сохраняются в филах микробиоты кишечника, такие как Bacteroides , Firmicutes и Actinobacteria , ответственные за первый этап метаболизма вторичных желчных кислот. ^{[ 118 ]} Было продемонстрировано, что вторичные желчные кислоты (BAS), такие как DCA и LCA, ингибируют как Clostridium difficile . прорастание, так и исход ^{[ 117 ]}

Дисбиоз

Микробиота кишечника важна для поддержания гомеостаза в кишечнике. Развитие рака кишечника связано с дисбалансом в естественной микрофлоре (дисбиоз). ^{[ 119 ]} Вторичная желчная кислота дезоксихолевая кислота связана с изменениями микробного сообщества, которые приводят к увеличению кишечного канцерогенеза. ^{[ 119 ]} Повышенное воздействие толстой кишки на вторичные желчные кислоты в результате дисбиоза может вызвать повреждение ДНК , а такое повреждение может вызывать канцерогенные мутации в клетках толстой кишки. ^{[ 120 ]} Высокая плотность бактерий в толстой кишке (около 10 ¹² за мл.), которые подвержены дисбиозу по сравнению с относительно низкой плотностью в тонкой кишке (около 10 ² за мл.) Может объяснить более 10 раз выше заболеваемости раком в толстой кишке по сравнению с тонкой кишкой. ^{[ 120 ]}

Ось кишечника -костюма

Ось кишечника -кошелька - это биохимическая передача сигналов, которая происходит между желудочно -кишечным трактом и центральной нервной системой . ^{[ 76 ]} Этот термин был расширен, чтобы включить роль кишечной флоры во взаимодействие; Термин «ось микробиома -мозга» иногда используется для явного описания парадигм, включая кишечную флору. ^{[ 76 ]}^{[ 121 ]}^{[ 122 ]} В широком смысле, ось кишечника -мозга включает в себя центральную нервную систему, нейроэндокринные и нейроиммунные системы, включая ось гипоталамус -питуистого -надпорядочника (ось HPA), симпатическое и парасимпатическое оружие автономной нервной системы, включая энтерическую нервную систему , бродяжную нерву, нерв, нерва, нерва, нерва, нерва . и кишечная микробиота . ^{[ 76 ]}^{[ 122 ]}

Систематический обзор 2016 года изучал доклинические и небольшие исследования человека, которые были проведены с определенными коммерчески доступными штаммами пробиотических бактерий, и обнаружили, что среди протестированных, Bifidobacterium и Lactobacillus Genera ( B. longum , B. Breve , B. Infantis , L. Helveticus , L. Rhamnosus , L. Plantarum и L. Casei ), имели наибольший потенциал, чтобы быть полезным для определенных расстройств центральной нервной системы . ^{[ 16 ]}

Изменения в балансе микробиоты

Влияние использования антибиотиков

Изменение количества кишечных бактерий, например, при принятии антибиотиков широкого спектра , может повлиять на здоровье и способность хозяина переваривать пищу. ^{[ 123 ]} Антибиотики могут вызвать диарею, связанную с антибиотиками, путем раздражения кишечника напрямую, изменяя уровни микробиоты или позволяя патогенных бактерий. расти ^{[ 7 ]} Другим вредным эффектом антибиотиков является увеличение количества устойчивых к антибиотикам бактерий, обнаруженных после их использования, которые, когда они вторгаются в хозяина, вызывают болезни, которые трудно лечить антибиотиками. ^{[ 123 ]}

Изменение количества и видов кишечной микробиоты может снизить способность организма ферментировать углеводы и метаболизировать желчные кислоты и может вызвать диарею . Углеводы, которые не разбиваются, могут поглощать слишком много воды и вызвать насморк, или отсутствие SCFA, полученных кишечной микробиотой, может вызвать диарею. ^{[ 7 ]}

Снижение уровней нативных бактериальных видов также нарушает их способность ингибировать рост вредных видов, таких как C. difficile и Salmonella Kedougou, и эти виды могут выйти из -под контроля, хотя их чрезмерный рост может быть случайным и не быть истинной причиной диарея. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 123 ]} Новые протоколы лечения для инфекций C. difficile включают трансплантацию фекальной микробиоты донорских фекалий (см. Фекальную трансплантацию ). ^{[ 124 ]} Первоначальные сообщения о лечении описывают показатели успеха 90%, с небольшим количеством побочных эффектов. Предполагается, что эффективность является результатом восстановления бактериальных балансов бактероидов и фирменных классов бактерий. ^{[ 125 ]}

Состав кишечного микробиома также изменяется в тяжелых заболеваниях, из -за не только применения антибиотиков, но и с такими факторами, как ишемия кишечника, неспособность питаться и иммунный компромисс . Негативные последствия от этого привели к интересу к селективному дезактивации пищеварительного тракта , лечению для убийства только патогенных бактерий и обеспечения восстановления здоровых. ^{[ 126 ]}

Антибиотики изменяют популяцию микробиоты в желудочно-кишечном тракте , и это может изменить взаимодействие внутри связанности метаболических взаимодействий, модифицировать потребление калорий, используя углеводы и глобально влияет на метаболический, гормональный и иммунный гомеостаз. ^{[ 127 ]}

Существуют разумные доказательства того, что принятие пробиотиков, содержащих виды Lactobacillus, может помочь предотвратить диарею, связанную с антибиотиками, и что принятие пробиотиков Saccharomyces (например, Saccharomyces boulardii ) может помочь предотвратить инфекцию Clostridium difficile после системного антибиотического лечения. ^{[ 128 ]}

Беременность

Микробиота кишечника женщины меняется по мере достижения беременности , причем изменения, аналогичные тем, которые наблюдаются при метаболических синдромах, таких как диабет. Изменение в кишечной микробиоте не вызывает вредных последствий. Микробиота кишечника новорожденной напоминает образцы первого триместра. Разнообразие микробиома уменьшается с первого до третьего триместра, по мере роста числа определенных видов. ^{[ 64 ]}^{[ 129 ]}

Пробиотики, пребиотики, синбиотики и фармабиотики

Пробиотики - это микроорганизмы , которые, как полагают, обеспечивают пользу для здоровья при употреблении. ^{[ 130 ]}^{[ 131 ]} Что касается кишечной микробиоты, пребиотики , как правило, неоплачиваемы, волокнистые соединения, которые проходят непереваренные через верхнюю часть желудочно-кишечного тракта и стимулируют рост или активность выгодной кишечной флоры, действуя в качестве субстрата для них. ^{[ 47 ]}^{[ 132 ]}

Синбиотики относится к пищевым ингредиентам или пищевыми добавками, объединяющими пробиотики и пребиотики в форме синергизма . ^{[ 133 ]}

Термин «фармабиотики» используется различными способами, чтобы означать: фармацевтические составы (стандартизированное производство, которое может получить одобрение регулирующих органов в качестве препарата) пробиотиков, пребиотиков или синбиотиков ; ^{[ 134 ]} Пробиотики, которые были генетически спроектированы или иным образом оптимизированы для лучшей производительности (срок годности, выживание в пищеварительном тракте и т. Д.); ^{[ 135 ]} и натуральные продукты метаболизма кишечника флоры (витамины и т. Д.). ^{[ 136 ]}

Есть некоторые доказательства того, что лечение некоторыми пробиотическими штаммами бактерий может быть эффективным при синдроме раздраженного кишечника , ^{[ 137 ]}^{[ 138 ]} вздутие живота ^{[ 139 ]}и хронический идиопатический запор . Эти организмы, скорее всего, приводят к снижению симптомов, включены:

Bifidobacterium breve
Bifidobacterium Child
Enterococcus faecium
Lactobacillus plants
Lactobacillus reuteri
Lactobacillus rhamnosus
Lactobacillus salivarius
Propionibacterium freudenreichii
Saccharomyces boulardii
Escherichia coli Nissle 1917
Streptococcus thermophilus ^{[ 140 ]}^{[ 141 ]}^{[ 142 ]}

Фекальное плавание

Фекасы около 10–15% людей постоянно плавают в туалетной воде («поплавок»), в то время как остальные производят фекалии, которые погружаются («грузилки»), а производство газа вызывает плавание кала. ^{[ 143 ]} В то время как обычные мыши часто продуцируют «поплавки», гнотобиотические мыши Germfree No кишечной микробиоты (разведенная в изоляторе зародыше «Уколоты» в «плавания». ^{[ 144 ]}

Исследовать

Тесты на то, могут ли не антибиотические препараты влиять на бактерии, связанные с кишечником человека, проводились с помощью анализа in vitro на более чем 1000 продаваемых лекарственных средствах против 40 кишечных бактериальных штаммов, демонстрируя, что 24% лекарств ингибировали рост, по крайней мере, одного из штаммов бактерий. Полем ^{[ 145 ]}

Влияние упражнений

Недавно было показано, что кишечная микробиота и упражнения взаимосвязаны. Как умеренные, так и интенсивные упражнения, как правило, являются частью режима тренировок спортсменов на выносливость, но они оказывают различные эффекты на здоровье. Взаимосвязь между кишечной микробиотой и выносливыми видами спорта зависит от интенсивности упражнений и статуса обучения. ^{[ 146 ]}

Роль в болезнях

Бактерии в пищеварительном тракте могут способствовать и подвергаться воздействию заболевания различными способами. Наличие или переизбыток некоторых видов бактерий могут способствовать воспалительным расстройствам, таким как воспалительное заболевание кишечника . ^{[ 6 ]} Кроме того, метаболиты от некоторых членов кишечной флоры могут влиять на сигнальные пути хозяина, способствуя таким расстройствам, как ожирение и рак толстой кишки . ^{[ 6 ]} Некоторые кишечные бактерии также могут вызывать инфекции и сепсис , например, когда им разрешено переходить из кишечника в остальную часть тела . ^{[ 6 ]}

Язвы

Хеликобактерная инфекция Pylori может инициировать образование язв желудка, когда бактерии проникают в эпителиальную слизистую оболочку желудка, а затем вызывая воспалительный фагоцитотический ответ . ^{[ 147 ]} В свою очередь, воспаление повреждает париетальные клетки, которые выделяют чрезмерную соляную кислоту в желудок и производят меньше защитной слизи. ^{[ 148 ]} Повреждение облицования желудка, приводящая к язвам , развивается, когда желудочная кислота ошеломляет оборонительные свойства клеток и ингибирует синтез эндогенного простагландина , снижает секрецию слизи и бикарбонат, снижает слизистый кровоток и снижает устойчивость к травме. ^{[ 148 ]} Сниженные защитные свойства облицовки желудка увеличивают уязвимость к дальнейшей травме и формировании язвы с помощью желудочной кислоты, пепсина и желчных солей. ^{[ 147 ]}^{[ 148 ]}

Парцирование кишечника

Обычно комменсальные бактерии могут навредить хозяину, если они выдают из кишечного тракта. ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]} Транслокация , которая возникает, когда бактерии покидают кишку через слизистую оболочку, может возникнуть при ряде различных заболеваний. ^{[ 13 ]} Если кишечник перфорирован, бактерии вторгаются в интерстиции , вызывая потенциально смертельную инфекцию . ^{[ 5 ]}^: 715

Воспалительные заболевания кишечника

Два основных типа воспалительных заболеваний кишечника , болезнь Крона и язвенного колита , являются хронические воспалительные расстройства кишечника; Причины этих заболеваний неизвестны, и в этих условиях возникают проблемы с флорой кишечника и ее отношения с хозяином. ^{[ 15 ]}^{[ 149 ]}^{[ 150 ]}^{[ 151 ]} Кроме того, представляется, что взаимодействия кишечной флоры с осью кишечного мозга играют роль в IBD, с физиологическим стрессом, опосредованным через гипоталамускую - пирофизовую ось, приводящие изменения в кишечный эпителий и кишечная флора, в свою очередь, факторы выпуска и метаболиты, которые запускают кишечный эпителий и кишечную флору, в свою очередь и метаболиты, которые вызывают метаболиты, и метаболиты, которые вызывают кишечные. передача сигналов в кишечной нервной системе и блуждающем нерве . ^{[ 4 ]}

Разнообразие кишечной флоры, по -видимому, значительно уменьшается у людей с воспалительными заболеваниями кишечника по сравнению со здоровыми людьми; Кроме того, у людей с язвенным колитом, протеобактерии и актинобактерии, по -видимому, доминируют; У людей с крон, энтерококк Faecium и несколько протеобактерий, по-видимому, чрезмерно представлены. ^{[ 4 ]}

Существуют разумные доказательства того, что исправление дисбаланса кишечника флоры путем принятия пробиотиков с лактобациллами и бифидобактериями может уменьшить висцеральную боль и воспаление кишечника при ВЗК. ^{[ 128 ]}

Синдром раздраженного кишечника

Синдром раздраженного кишечника является результатом стресса и хронической активации оси HPA; Его симптомы включают боль в животе, изменения в движениях кишечника и увеличение провоспалительных цитокинов. В целом, исследования показали, что микробиота люминальной и слизистой оболочки изменяется у индивидуумов синдрома раздраженного кишечника, и эти изменения могут связаться с типом раздражения, такого как диарея или запор . Кроме того, наблюдается снижение разнообразия микробиома с низким уровнем фекальных лактобацилл и бифидобактерий, высоких уровней факультативных анаэробных бактерий, таких как Escherichia coli , и повышенные отношения Firmicutes: бактероидаты. ^{[ 122 ]}

Астма

При астме были представлены две гипотезы, чтобы объяснить ее растущую распространенность в развитом мире. Гипотеза гигиены утверждает, что дети в развитом мире не подвергаются воздействию достаточного количества микробов и, следовательно, могут содержать более низкую распространенность специфических бактериальных таксонов, которые играют защитные роли. ^{[ 152 ]} Вторая гипотеза фокусируется на диете Western Pattern , в которой не хватает цельного зерна и клетчатки и имеет переизбыток простых сахаров . ^{[ 15 ]} Обе гипотезы сходится к роли жирных кислот с короткой цепью (SCFA) в иммуномодуляции . Эти бактериальные метаболиты ферментации участвуют в иммунной передаче сигналов, которая предотвращает запуск астмы, а более низкие уровни SCFA связаны с заболеванием. ^{[ 152 ]}^{[ 153 ]} Отсутствие защитных родов, таких как Lachnospira , Veillonella , Rothia и Faecalibacterium, были связаны с снижением уровней SCFA. ^{[ 152 ]} Кроме того, SCFA являются продуктом бактериальной ферментации волокна, которая низко в западной диете. ^{[ 15 ]}^{[ 153 ]} SCFA предлагают связь между кишечной флорой и иммунными расстройствами, и по состоянию на 2016 год это была активная область исследований. ^{[ 15 ]} Подобные гипотезы также были установлены для роста пищи и других аллергий. ^{[ 154 ]}

Сахарный диабет 1 тип 1

Связь между кишечной микробиотой и сахарным диабетом 1 типа 1 также была связана с SCFA, такими как бутират и ацетат. Диета, дающие бутират и ацетат из бактериальной ферментации, показывают повышенную экспрессию t _-рег . ^{[ 155 ]} T _REGКлетки подавляют эффекторные Т -клетки , что, в свою очередь, снижает воспалительный ответ в кишечнике. ^{[ 156 ]} Бутират является источником энергии для клеток толстой кишки. Таким образом, диета, добывающая бутират, уменьшает проницаемость кишечника , обеспечивая достаточную энергию для образования плотных соединений . ^{[ 157 ]} Кроме того, также было показано, что бутират снижает резистентность к инсулину, что предполагает, что сообщества кишечника низкий уровень бутирата, производящих бутират, могут увеличить шансы на получение сахарного диабета типа 2 . ^{[ 158 ]} Диета, наполняющие бутиратом, также могут иметь потенциальные колоректального рака . эффекты подавления ^{[ 157 ]}

Ожирение и метаболический синдром

Флора кишечника была вовлечена в ожирение и метаболический синдром из -за ключевой роли в пищеварительном процессе; Диета Western Pattern, по -видимому, стимулирует и поддерживает изменения в кишечной флоре, которые, в свою очередь, изменяют, сколько энергии получено из пищи и как используется эта энергия. ^{[ 151 ]}^{[ 159 ]} Одним из аспектов здоровой диеты , которой часто не хватает диеты с западным паттерном, является клетчатка и другие сложные углеводы, которые требуют здоровой флоры кишечника; Изменения в кишечной флоре в ответ на диету с западным паттерном, по-видимому, увеличивают количество энергии, генерируемой кишечной флорой, которая может способствовать ожирению и метаболическому синдрому. ^{[ 128 ]} Существуют также доказательства того, что микробиота влияет на поведение питания, основанное на предпочтениях микробиоты, что может привести к тому, что хозяин потребляет больше пищи, в конечном итоге привести к ожирению. Как правило, наблюдалось, что при более высоком разнообразии микробиомов кишечника микробиота будет тратить энергию и ресурсы на конкуренцию с другой микробиотой и меньше на манипулирование хозяином. Противоположность наблюдается с более низким разнообразием микробиомов с более низким кишечником, и эти микробиоты могут работать вместе, чтобы создать тягу к питанию хозяина. ^{[ 58 ]}

Кроме того, печень играет доминирующую роль в гомеостазе глюкозы в крови , сохраняя баланс между поглощением и хранением глюкозы посредством метаболических путей гликогенеза и глюконеогенеза . Липиды кишечника регулируют гомеостаз глюкозы с участием оси кишечника -мран -ливер. Прямое введение липидов в верхнюю кишку увеличивает уровни с длинной цепью жировой ацил-кофермент A (LCFA-COA) в верхней кишечнике и подавляет выработку глюкозы даже при субдиафрагматической ваготомии или вагальной деафферентации кишечника . Это прерывает нервную связь между мозгом и кишечником и блокирует способность липидов верхней кишки ингибировать выработку глюкозы. Ось оси кишечника -мран -ливер и состав микробиоты кишечника могут регулировать гомеостаз глюкозы в печени и обеспечивать потенциальные терапевтические методы для лечения ожирения и диабета. ^{[ 160 ]}

Подобно тому, как кишечная флора может функционировать в цикле обратной связи, которая может стимулировать развитие ожирения, существуют доказательства того, что ограничение потребления калорий (то есть диета ) может ввести изменения в композицию кишечной флоры. ^{[ 151 ]}

Другие животные

Композиция человеческого кишечного микробиома похож на состав других великих обезьян. Тем не менее, кишечная биота человека снизилась в разнообразии и изменилась в составе с момента нашего эволюционного отделения от PAN . ^{[ 161 ]} Люди демонстрируют увеличение бактериоидетов, бактериального филома, связанного с диетами с высоким содержанием животного белка и жира, и уменьшается в метанобридавибактере и фибробактере, группах, которые ферментируют комплексные полисахариды растений. ^{[ 161 ]} Эти изменения являются результатом комбинированных диетических, генетических и культурных изменений, которые люди подвергались эволюционной дивергенции от PAN . ^{[ Цитация необходима ]}

В дополнение к людям и позвоночным, некоторые насекомые также имеют сложную и разнообразную кишечную микробиоту, которая играет ключевые пищевые роли. ^{[ 2 ]} Микробные сообщества, связанные с термитами, могут составлять большую часть веса людей и выполнять важную роль в пищеварении лигноцеллюлозы и азотной фиксации . ^{[ 162 ]} Эти сообщества являются специфичными для хозяина, и тесно связанные виды насекомых делятся сопоставимым сходством в составе микробиоты кишечника. ^{[ 163 ]}^{[ 164 ]} У тараканов кишечная микробиота собирается детерминированным образом, независимо от инокулята ; ^{[ 165 ]} Причина этой специфической для хозяина собрания остается неясной. Бактериальные сообщества, связанные с насекомыми, такими как термиты и тараканы, определяются комбинацией сил, в первую очередь диетической диеты, но есть некоторые признаки того, что филогения хозяина также может играть роль в выборе линий. ^{[ 163 ]}^{[ 164 ]}

На протяжении более 51 года было известно, что введение низких доз антибактериальных агентов способствует росту фермерских животных для увеличения увеличения веса. ^{[ 127 ]}

В исследовании, проведенном на мышах, отношение Firmicutes и Lachnospiraceae было значительно повышено у животных, получавших субтерапевтические дозы различных антибиотиков. Анализируя содержание калорий в фекалиях и концентрацию небольших цепных жирных кислот (SCFAS) в желудочно -кишечном тракте, был сделан вывод, что изменения в составе микробиоты приводят к увеличению способности извлекать калории из нежелательных составляющих и к Увеличение производства SCFA. Эти результаты свидетельствуют о том, что антибиотики нарушают не только состав микробиома GI, но и его метаболические возможности, особенно в отношении SCFA. ^{[ 127 ]}

Смотрите также

Примечания

^ Существует существенное изменение в составе микробиомов и концентрации микробов с помощью анатомического сайта. ^{[ 92 ]}^{[ 93 ]} Жидкость из толстой кишки человека, которая содержит самую высокую концентрацию микробов любого анатомического сайта, содержит приблизительно один триллион (10^12) бактериальных клеток/мл. ^{[ 92 ]}

Ссылки

^ Мостак, м; Szulińska, M; Богданьский, P (15 апреля 2020 г.). «Вы-то, что вы едите-отношения между диетой, микробиотой и метаболическими расстройствами-обзор» . Питательные вещества . 12 (4): 1096. doi : 10.3390/nu12041096 . PMC 7230850 . PMID 32326604 . S2CID 216108564 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Энгель, П.; Моран, Н. (2013). «Микробиота кишечника насекомых - график в структуре и функции» . Обзоры микробиологии FEMS . 37 (5): 699–735. doi : 10.1111/1574-6976.12025 . PMID 23692388 .
^ Segata, n; Boernigen, D; Щекотка, TL; Морган, XC; Гаррет, WS; Huttenhower, C (14 мая 2013 г.). «Вычислительная мета'омика для исследований микробного сообщества» . Биология молекулярных систем . 9 : 666. DOI : 10.1038/MSB.2013.22 . PMC 4039370 . PMID 23670539 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Saxena, R.; Sharma, VK (2016). «Метагеномное понимание микробиома человека: его последствия для здоровья и болезней» . В Кумаре, Д.; С. Антонаракис (ред.). Геномика медицинской и здоровья . Elsevier Science. п. 117. doi : 10.1016/b978-0-12-420196-5.00009-5 . ISBN 978-0-12-799922-7 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k Шервуд, Линда; Уилли, Джоан; Вулвертон, Кристофер (2013). Микробиология Прескотта (9 -е изд.). Нью -Йорк: МакГроу Хилл. С. 713–721. ISBN 9780073402406 Полем OCLC 886600661 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м ^не ^а Гуарнер, F; Малагелада, Дж. (2003). «Кишечная флора в здоровье и болезнях». Lancet . 361 (9356): 512–519. doi : 10.1016/s0140-6736 (03) 12489-0 . PMID 12583961 . S2CID 38767655 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k Богери, Лоран; Пети, Жан-Клод (2004). «Диарея, связанная с антибиотиком». Лучшая практика и исследования клиническая гастроэнтерология . 18 (2): 337–352. doi : 10.1016/j.bpg.2003.10.002 . PMID 15123074 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Стивен, Ам; Каммингс, JH (1980). «Микробный вклад в массу фекалий человека» . Журнал медицинской микробиологии . 13 (1): 45–56. doi : 10.1099/00222615-13-1-45 . PMID 7359576 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Квигли, Э. М. (2013). «Кишечные бактерии в здоровье и болезнях» . Гастроэнтерология и гепатология . 9 (9): 560–569. PMC 3983973 . PMID 24729765 .
^ Тернбо, Питер Дж.; Лей, Рут Е.; Хамади, Мика; Фрейзер-Лиггетт, Клэр М.; Рыцарь Роб; Гордон, Джеффри И. (октябрь 2007 г.). «Проект микробиома человека» . Природа . 449 (7164): 804–810. Bibcode : 2007natur.449..804t . doi : 10.1038/nature06244 . ISSN 0028-0836 . PMC 3709439 . PMID 17943116 .
^ Ма, Гуаню; Ши, Югуо; Мэн, Лулу; Фанат, Халонг; Тан, Xiaomei; Luo, Huijuan; Ван, Дунджу; Чжоу, Хуан; Сяо, Xiaomin (2023). «Факторы, влияющие на раннее установление кишечной флоры новорожденных и ее меры вмешательства» . Границы в клеточной и инфекционной микробиологии . 13 doi : 10.3389/fcimb.2023.1295111 . ISSN 2235-2988 . PMC 10722192 . PMID 38106467 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м ^не ^а ^п Соммер, Феликс; Bäckhed, Fredrik (2013). «Микробиота кишечника - мастера развития хозяев и физиологии». Nature Reviews Microbiology . 11 (4): 227–238. doi : 10.1038/nrmicro2974 . PMID 23435359 . S2CID 22798964 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Фадерл, Мартин; Нотти, Марио; Корацца, Надия; Мюллер, Кристоф (2015). «Следуйте ошибкам: слой слизи в качестве критического компонента в поддержании гомеостаза кишечника» . Жизнь iubmb . 67 (4): 275–285. doi : 10.1002/iub.1374 . PMID 25914114 . S2CID 25878594 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Кларк, Джерард; Стилла, Роман М; Кеннеди, Пол Дж; Стентон, Кэтрин; Крайан, Джон Ф; Динан, Тимоти Г. (2014). «Minireview: кишечная микробиота: пренебреженный эндокринный орган» . Молекулярная эндокринология . 28 (8): 1221–1238. doi : 10.1210/me.2014-1108 . PMC 5414803 . PMID 24892638 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Шен, SJ; Вонг, Конни Х. Х. (2016). «Воспаление, воспаление: роль кишечной микробиоты» . Клиническая и трансляционная иммунология . 5 (4): E72. doi : 10.1038/cti.2016.12 . PMC 4855262 . PMID 27195115 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Ван, Хуиинг; Ли, In-Сеон; Браун, Кристоф; Enck, Пол (2016). «Влияние пробиотиков на функции центральной нервной системы у животных и людей: систематический обзор» . Журнал нейрогастроэнтерологии и подвижности . 22 (4): 589–605. doi : 10.5056/jnm16018 . PMC 5056568 . PMID 27413138 .
^ Сальвадори, м (20 марта 2024 г.). «Обновите кишечный микробиом в отношении здоровья и болезней» . World J Methodol . 14 (1). doi : 10.5662/wjm.v14.i1.89196 . PMC 10989414 . PMID 38577200 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Сирс, Синтия Л. (2005). «Динамичное партнерство: празднование нашей кишечной флоры». Анаэроб . 11 (5): 247–251. doi : 10.1016/j.anaerobe.2005.05.001 . PMID 16701579 .
^ Шапира, Майкл (2016-07-01). «Микробиоты кишечника и эволюция хозяина: масштабирование симбиоза» . Тенденции в экологии и эволюции . 31 (7): 539–549. Bibcode : 2016tecoe..31..539s . doi : 10.1016/j.tree.2016.03.006 . ISSN 0169-5347 . PMID 27039196 .
^ Уокер, Алан У.; Хойлс, Лесли (август 2023 г.). «Мифы человеческого микробиома и заблуждения» . Природная микробиология . 8 (8): 1392–1396. doi : 10.1038/s41564-023-01426-7 . ISSN 2058-5276 . PMID 37524974 .
^ Лозупоне, Кэтрин А.; Stombaugh, Jesse I.; Гордон, Джеффри I.; Янссон, Джанет К.; Найт, Роб (2012). «Разнообразие, стабильность и устойчивость человеческой кишечной микробиоты» . Природа . 489 (7415): 220–230. Bibcode : 2012natur.489..220L . doi : 10.1038/nature11550 . PMC 3577372 . PMID 22972295 .
^ Цинь, Джуни; Ли, Руицан; Рейс, Джерун; Арумугам, Маниможиан; Бургдорф, Кристоффер Солвстен; Маничан, Чайсванх; Нильсен, Трин; Понс, Николас; Левенес, Флоренция; Ямада, Такуджи; Менде, Даниэль Р.; Ли, Джунхуа; Сюй, Junming; Ли, Шаочуань; Ли, Донгфанг; Цао, Цзяньджун; Ван, Бо; Liang, Huiqing; Чжэн, Хуисонг; Се, Иньлонг; TAP, Жюльен; Лепейдж, Патриция; Берталан, Марсело; Батто, Жан-Мишель; Хансен, Торбен; Le Paslier, Denis; Линнеберг, Аллан; Нильсен, Х. Бьёрн; Пеллетье, Эрик; Renault, Pierre (2010). «Каталог микробных генов человека, созданный метагеномным секвенированием» . Природа . 464 (7285): 59–65. Bibcode : 2010natur.464 ... 59. Полем doi : 10.1038/nature08821 . PMC 3779803 . PMID 20203603 .
^ Шанахан, Фергус (2002). «Интерфейс хоста -миклеба в кишечнике». Лучшая практика и исследования клиническая гастроэнтерология . 16 (6): 915–931. doi : 10.1053/bega.2002.0342 . PMID 12473298 .
^ TAP, Жюльен; Мир, Станислас; Левенес, Флоренция; Пеллетье, Эрик; Карон, Кристоф; Фрет, Жан-Пьер; Угарте, Эдгардо; Муньос-Тамайо, Рафаэль; Paslier, Denis Le; Налин, Рено; Дор, Джоэл; Leclerc, Marion (2009). «На пути к филогногенскому ядру кишечника человека» . Экологическая микробиология . 11 (10): 2574–2584. Bibcode : 2009envi..11.2574t . Doi : 10.1111/j.1462-2920.2009.01982.x . PMID 19601958 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} О'Хара, Энн М; Шанахан, Фергус (2006). «Килочная флора как забытый орган» . Embo сообщает . 7 (7): 688–693. doi : 10.1038/sj.embor.7400731 . PMC 1500832 . PMID 16819463 .
^ Ханна, Сахил; Тош, Притиш К (2014). «Ученик врача о роли микробиома в здоровье человека и болезнях». Майо -клиника . 89 (1): 107–114. doi : 10.1016/j.mayocp.2013.10.011 . PMID 24388028 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Cui, Lijia; Моррис, Элисон; Ghedin, Elodie (2013). «Человеческий микобиом в здоровье и болезнях» . Медицина генома . 5 (7): 63. doi : 10.1186/gm467 . PMC 3978422 . PMID 23899327 .
^ Эрдоган, Аскин; Рао, Сатиш С. С. (2015). «Небольшой кишечник грибковой избыточный рост». Текущие гастроэнтерологические отчеты . 17 (4): 16. doi : 10.1007/s11894-015-0436-2 . PMID 25786900 . S2CID 3098136 .
^ Hallen-Adams, Heather E.; Suhr, Mallory J. (2016-10-13). «Грибы в здоровом желудочно -кишечном тракте человека» . Вирулентность . 8 (3): 352–358. doi : 10.1080/21505594.2016.1247140 . ISSN 2150-5594 . PMC 5411236 . PMID 27736307 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Какие грибы живут в кишечнике? Познакомьтесь с кишечным микобиомом» . Quadram Institute . Получено 2024-07-25 .
^ Кляйн, Алиса (20 октября 2019 г.). «Мужское тело заваривает собственное пиво после того, как дрожжи захватывают свой кишечный микробиом» . Новый ученый . Получено 2024-07-25 .
^ Художник, Келли; Корделл, Барбара Дж.; Sticco, Kristin L. (2024), «Синдром автоматической брата» , Statpearls , Остров Сокровища (FL): Patpearls Publishing, PMID 30020718 , получен 2024-07-25
^ Браун, Хиллари П.; Шао, Ян; Лоули, Тревор Д. (октябрь 2022 г.). «Мать -инфант передача микробиоты человека» . Текущее мнение о микробиологии . 69 doi : 10.1016/j.mib.2022.102173 . PMID 35785616 - Via ScienceDirect.
^ Белло, Мария Г. Домингес; Рыцарь Роб; Гилберт, Джек А.; Blaser, Martin J. (4 октября 2018 г.). «Сохранение микробного разнообразия». Наука . 362 (6410): 33–34. Bibcode : 2018sci ... 362 ... 33b . doi : 10.1126/science.aau8816 . PMID 30287652 . S2CID 52919917 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Амугам, Манимосиан; Рейс, Джерун; Пеллет, Эрик; Пастух, Денис; Ямада, Такуджи; Менде, Даниэль Р.; Фернандес, Габриэль Р.; TAP, Жюльен; Кисть, Томас; Батто, Жан-Мишель; Берталан, Марсело; Заимствованная, Наталья; Замки, Франческ; Фернанд, Лейден; Осторожность, Лоран; Хансен, Торбен; Хаттур, Масахира; Хаяси, Тецуя; Я был зол, Михиэль; Крокава, Кен; Леклер, Марион; Уровень, Флоренция; Манишан, Хадзан; Нильсен, Х. Бьёрн; Нильсен, Трин; Наказание, Николас; Пулен, Джули; Цинь, Джуни; Томас, Томас; Тимс, Себастьян (2011). «Энтерпотипы человеческого микробиома » Природа . 473 (7346): 174–180. Bibcode : 2011nature.473. Полем doi : 10.1038/ nature0 PMC 3728647 . PMID 21508958 .
^ Wu, GD; Чен, Дж.; Хоффманн, С.; Bittinger, K.; Chen, Y.-Y.; Keilbaugh, SA; Bewtra, M.; Рыцари, Д.; Уолтерс, Вашингтон; Рыцарь, Р.; Синха, Р.; Гилрой, Е.; Гупта, К.; Baldassano, R.; Nessel, L.; Li, H.; Бушмен, FD; Льюис, JD (2011). «Связывание долгосрочных пищевых моделей с кишечными микробными энтеротипами» . Наука . 334 (6052): 105–108. Bibcode : 2011sci ... 334..105W . doi : 10.1126/science.1208344 . PMC 3368382 . PMID 21885731 .
^ Циммер, Карл (20 апреля 2011 г.). «Бактерии делят людей на 3 типа, говорят ученые» . New York Times . Получено 21 апреля 2011 года . Группа ученых теперь сообщают только о трех различных экосистемах в мужестве людей, которых они изучали.
^ Рыцари, Дэн; Уорд, Тоня; МакКинлей, Кристофер; Миллер, Ханна; Гонсалес, Антонио; Макдональд, Даниэль; Рыцарь, Роб (8 октября 2014 г.). «Переосмысление» энтеротипов » . Ячейка и микроб . 16 (4): 433–437. doi : 10.1016/j.chom.2014.09.013 . PMC 5558460 . PMID 25299329 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Нардоне, G; Сравнение, D (июнь 2015 г.). «Человеческая желудочная микробиота: пора ли переосмыслить патогенез заболеваний желудка?» Полем Объединенная европейская гастроэнтерологическая журнал . 3 (3): 255–60. doi : 10.1177/2050640614566846 . PMC 4480535 . PMID 26137299 .
^ Яо, х; Смолка, AJ (июнь 2019 г.). «Физиология теменных клеток желудка и геликобактер-индуцированная пилориальная болезнь» . Гастроэнтерология . 156 (8): 2158–2173. doi : 10.1053/j.gastro.2019.02.036 . PMC 6715393 . PMID 30831083 .
^ Тодар, Кеннет (2012). «Нормальная бактериальная флора людей» . Онлайн -учебник Todar по бактериологии . Получено 25 июня 2016 года .
^ Квигли, Имонн М.М.; Кера, Родриго (2006). «Небольшой кишечник бактериального заростка: роли антибиотиков, пребиотиков и пробиотиков» . Гастроэнтерология . 130 (2): S78–90. doi : 10.1053/j.gastro.2005.11.046 . PMID 16473077 . S2CID 16904501 .
^ Адамс, мистер; Мосс, Мо (2007). Пищевая микробиология . doi : 10.1039/9781847557940 . ISBN 978-0-85404-284-5 Полем S2CID 241261974 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Нормальная кишечная флора» (PDF) (слайд -шоу). 2004. Архивировано из оригинала (PDF) 2004-05-26 . Получено 2023-01-02 -через Университет Глазго.
^ Braune A, Blaut M (2016). «Бактериальные виды, участвующие в преобразовании пищевых флавоноидов в кишечнике человека» . Кишечные микробы . 7 (3): 216–234. doi : 10.1080/19490976.2016.1158395 . PMC 4939924 . PMID 26963713 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Steinhoff, U (2005). «Кто контролирует толпу? Новые выводы и старые вопросы о кишечной микрофлоре». Иммунологические письма . 99 (1): 12–16. doi : 10.1016/j.imlet.2004.12.013 . PMID 15894105 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Гибсон, Гленн Р. (2004). «Клетчатка и влияние на пробиотики (пребиотическая концепция)». Клинические добавки питания . 1 (2): 25–31. doi : 10.1016/j.clnu.2004.09.005 .
^ Микель, S; Мартин, R; Росси, О; Бермудес-Хумаран, LG; Chathel, JM; Сокол, ч; Томас, м; Уэллс, JM; Langella, P (2013). «Faecalibacterium prausnitzii и здоровье кишечника человека». Текущее мнение о микробиологии . 16 (3): 255–261. doi : 10.1016/j.mib.2013.06.003 . PMID 23831042 .
^ Лей, Рут Е. (2010). «Ожирение и человеческий микробиом». Текущее мнение в гастроэнтерологии . 26 (1): 5–11. doi : 10.1097/mog.0b013e328333d751 . PMID 19901833 . S2CID 23329156 .
^ Нэш, Андреа К; Аухтунг, Томас А; Вонг, Мэтью С; Смит, Даниэль П; Геселл, Джонатан Р; Росс, Мэтью С; Стюарт, Кристофер Дж; Меткалф, имбирь А; Музни, Донна М; Гиббс, Ричард А; Аджами, Надим Дж; Петросино, Джозеф Ф. (2017). «Микобиоом интуиции человеческого проекта микробиома здоровой когорты» . Микробиом . 5 (1): 153. DOI : 10.1186/S40168-017-0373-4 . PMC 5702186 . PMID 29178920 .
^ Скарпеллини, Эмидио; Iianiro, gianluca; Аттили, Фабия; Басанелли, Чиара; Де Сантис, Адриано; Gasbarrini, Antonio (2015). «Микробиота кишечника человека и виртуопа: потенциальные терапевтические последствия» . Пищеварительный и болезнь печени . 47 (12): 1007–1012. Doi : 10.1016/j.dld.2015.07.008 . PMC 7185617 . PMID 26257129 .
^ Джерритсен, Яколин; Smidt, Hauke; Rijkers, Ger; Де Вос, Виллем (27 мая 2011 г.). «Микробиота кишечника в здоровье и заболеваниях человека: влияние пробиотиков» . Гены и питание . 6 (3): 209–240. doi : 10.1007/s12263-011-0229-7 . PMC 3145058 . PMID 21617937 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Yatsunenko, T.; Рей, Fe; Манари, MJ; Трехан, я.; Домингес-Белло, мг; Contreras, M.; Magris, M.; Hidalgo, G.; Baldassano, RN; Anokhin, Ap; Хит, AC; Warner, B.; Ридер, Дж.; Kuczynski, J.; Капорасо, JG; Lozupone, CA; Lauber, C.; Клементе, JC; Рыцари, Д.; Рыцарь, Р.; Гордон, Джи (2012). «Человеческий кишечный микробиом рассматривается по возрасту и географии» . Природа . 486 (7402): 222–227. Bibcode : 2012natur.486..222y . doi : 10.1038/nature11053 . PMC 3376388 . PMID 22699611 .
^ Де Филиппо, c; Cavalieri, D; Di Paola, M; Рамаццотти, м; Поллет, Дж. Б; Массарт, с; Коллини, S; Pieraccini, G; Лионетти П. (2010). «Влияние диеты на формирование кишечной микробиоты, выявленное сравнительным исследованием детей из Европы и сельской Африки» . Труды Национальной академии наук . 107 (33): 14691–14696. BIBCODE : 2010PNAS..10714691D . doi : 10.1073/pnas.1005963107 . PMC 2930426 . PMID 20679230 .
^ Jonkers, Daisy Mae (2016). «Микробные возмущения и модуляция в условиях, связанных с недоеданием и мультино -сорта». Лучшая практика и исследования клиническая гастроэнтерология . 30 (2): 161–172. doi : 10.1016/j.bpg.2016.02.006 . PMID 27086883 .
^ Миллион, Маттиу; Диало, Алдиума; Раульт, Дидье (май 2017 г.). «Кишечная микробиота и недоедание» (PDF) . Микробный патогенез . 106 : 127–138. doi : 10.1016/j.micpath.2016.02.003 . PMID 26853753 . S2CID 20381329 .
^ Райдер, Марен Йоханн Хейльсков; Колте, Лилиан; Брайенд, Андре; Фрийс, Хенрик; Кристенсен, Vibeke Brix (2014). «Иммунная система у детей с недоеданием - систематический обзор» . Plos один . 9 (8): E105017. BIBCODE : 2014PLOSO ... 9J5017R . Doi : 10.1371/journal.pone.0105017 . PMC 4143239 . PMID 25153531 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Алкок, Джо; Мале, Карло С; Aktipis, C. Athena (2014). «Манипулируется ли поведение питания желудочно -кишечной микробиотой? Эволюционные давления и потенциальные механизмы» . Биологии . 36 (10): 940–949. doi : 10.1002/bies.201400071 . PMC 4270213 . PMID 25103109 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Ренсон, Одри; Стадо, Памела; Доуд, Дженнифер Б. (2020). «Большие люди и больные (микробные) популяции: проблемы в эпидемиологии и микробиомом» . Ежегодный обзор общественного здравоохранения . 41 : 63–80. doi : 10.1146/annurev-publhealth-040119-0944423 . PMC 9713946 . PMID 31635533 .
^ Туррони, Франческа; Пеано, Клелия; Пасс, Даниэль А; Фони, Елена; Severgnini, Marco; Классон, Маркус Дж; Керр, Колм; Hourhane, Джонатан; Мюррей, Дейрдре; Фулиньи, Фабио; Геймонд, Мигель; Марголл, Абелардо; Де Беллис, Джанлука; О'Тул, Пол В; Ван Синдерен, Дуве; Марчеси, Джулиан Р; Вентура, Марко (2012). «Разнообразие бифидобактерий в микробиоте кишечника младенца» . Plos один . 7 (5): E36957. Bibcode : 2012 I ... 736957t . Doi : 10.1371/journal.pone.0036957 . PMC 3350489 . PMID 22606315 .
^ Давенпорт, Эмили Р.; Сандерс, Джон Дж.; Песня, Se Jin; Амато, Кэтрин Р.; Кларк, Эндрю Дж.; Найт, Роб (2017-12-27). «Человеческий микробиом в эволюции» . BMC Biology . 15 (1): 127. DOI : 10.1186/S12915-017-0454-7 . ISSN 1741-7007 . PMC 5744394 . PMID 29282061 .
^ Перес-Муньос, Мария Элиза; Арриета, Мари-Клэр; Рамер-Тайт, Аманда Е; Уолтер, Йенс (2017). «Критическая оценка гипотез« стерильной матки »и« в колонизации утроивания »: последствия для исследования пионерского младенческого микробиома» . Микробиом . 5 (1): 48. doi : 10.1186/s40168-017-0268-4 . PMC 5410102 . PMID 28454555 .
^ Матаморос, Себастьен; Грас-Леги, Кристоль; Le Vacon, Fransoise; Потэл, Жиль; De la Cochetere, Marie-France (2013). «Разработка кишечной микробиоты у детей и ее влияние на здоровье». Тенденции в микробиологии . 21 (4): 167–173. Doi : 10.1016/j.tim.2012.12,001 . PMID 23332725 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин Мюллер, Ноэль Т.; Бакач, Элизабет; Combellick, Joan; Григоян, Зоя; Домингес-Белло, Мария Г. (2015). «Развитие микробиома младенца: мама имеет значение» . Тенденции в молекулярной медицине . 21 (2): 109–117. doi : 10.1016/j.molmed.2014.12.002 . PMC 4464665 . PMID 25578246 .
^ Джименес, Эстер; Фернандес, Леонидс; Марин, Мэри Л; Мартин, Роцио; Одриозола, Джон М; Nuen-Palop, Carmen; Нарбад, Арджан; Оливарес, Муника; Ксаус, Джорди; Родригес, Джон М. (2005). «Изомация грома обезжиренной бактерии лечебных новорожденных в секции кесарева» » Текущая микробелогия 51 (4): 270–2 Doi : 10.1007/ s00284-005-0020-3 Pmit 16187156 . S2CID 43438656
^ Колладо, Мария Кармен; Раутава, Самули; Аакко, Джухани; Изолаури, Эрика; Salminen, Seppo (2016). «Колонизация кишечника человека может быть начата в утробке различными микробными сообществами в плахенте и амниотической жидкости» . Научные отчеты . 6 : 23129. Bibcode : 2016natsr ... 623129c . Doi : 10.1038/srep23129 . PMC 4802384 . PMID 27001291 .
^ Джименес, Эстер; Марин, Мэри Л.; Мартин, Роцио; Odriozola, John M.; Оливарес, Муника; Ксаус, Джорди; Фернандес, Леонидс; Родригес, Джон М. (2008). "Является ли мекониний от здорового новорожденного обновленным ската?" Полем РЕСУАРК В МИКРОЛУГИ 159 (3): 187–1 doi : 10.1016/ j.smic.2007,12,0 Pmit 182811199 .
^ Перес-Муньос, Мария Элиза; Арриета, Мари-Клэр; Рамер-Тайт, Аманда Е; Уолтер, Йенс (2017). «Критическая оценка гипотез« стерильного чрева »и« в колонизации утроивания »: последствия для исследования пионерского младенческого микробиома» . Микробиом . 5 (1): 48. doi : 10.1186/s40168-017-0268-4 . PMC 5410102 . PMID 28454555 .
^ Адлерберт, я; WOLD, AE (2009). «Создание кишечной микробиоты у западных детей». Acta Paediatrica . 98 (2): 229–238. doi : 10.1111/j.1651-2227.2008.01060.x . PMID 19143664 . S2CID 205859933 .
^ «Кисточные бактерии детей, затронутые методом доставки: вагинальная доставка способствует кишечным бактериям матери в кишечнике детей» . Scienceday . 18 сентября 2019 года. Архивировано с оригинала 24 ноября 2021 года . Получено 31 мая 2022 года .
^ Кубок, JN; Zampini, L.; Galeazzi, T.; Габриэлли, О. (2006). «Пребиотики в человеческом молоке: обзор». Пищеварительный и болезнь печени . 38 : S291–294. Doi : 10.1016/s1590-8658 (07) 60013-9 . PMID 17259094 .
^ Мэди, Эман А.; Doghish, Ahmed S.; El-Dakroury, Walaa A.; Elkhawaga, Samy Y.; Исмаил, Ахмед; El-Mahdy, Hesham A.; Эльсакка, Elsayed GE; Эль-Хуссейни, Хусейн М. (2023-07-01). «Влияние микробиоты кишечника матери на микробиомом младенца и развитие мозга». Нейробиологии и биобеводовые обзоры . 150 : 105195. DOI : 10.1016/j.neubiorev.2023.105195 . ISSN 0149-7634 . PMID 37100161 . S2CID 258302702 .
^ Fanaro, S; Священнослужители, R; Guerrini, P; Vigi, V (2007). «Микрофлора кишечника в раннем младенчестве: композиция и развитие». Ландшафт Акта . 92 (441): 48–55. Doi : 10.1111/j.1651-2227.2003.tb00646.x . PMID 14599042 . S2CID 10316311 .
^ Yassour, Моран; Ватанен, Томми; Сильжандер, Хели; Hämäläinen, Anu-Maaria; Härkönen, Taina; Ryhänen, Samppa J; Франзоса, Эрик А; Вламакис, сыворотка; Хаттенхауэр, Кертис; Герс, Дирк; Ландер, Эрик С; Knip, Майкл; Ксавье, Рамник Дж. (2016). «Естественная история детского кишечного микробиома и влияние лечения антибиотиками на разнообразие и стабильность бактериальных штаммов» . Научная трансляционная медицина . 8 (343): 343Ra81. Doi : 10.1126/scitranslmed.aad0917 . PMC 5032909 . PMID 27306663 .
^ Гибсон, Гр; Roberfroid, MB (1995). «Диетическая модуляция микробиоты толстой кишки человека: введение концепции пребиотиков» . Журнал питания . 125 (6): 1401–1412. doi : 10.1093/jn/125.6.1401 . PMID 7782892 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Ван, Ян; Kasper, Lloyd H (2014). «Роль микробиома в расстройствах центральной нервной системы» . Мозг, поведение и иммунитет . 38 : 1–12. doi : 10.1016/j.bbi.2013.12.015 . PMC 4062078 . PMID 24370461 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Юн, мой молодой; Ли, Кихун; Юн, Sang Sun (2014). «Защитная роль кишечных комменсальных микробов против кишечных инфекций». Журнал микробиологии . 52 (12): 983–989. doi : 10.1007/s12275-014-4655-2 . PMID 25467115 . S2CID 54622675 .
^ Reinoso Webb, Синтия; Koboziev, iurii; Фурр, Кэтрин Л; Гришам, Мэтью Б. (2016). «Защитная и провоспалительная роль кишечных бактерий» . Патофизиология . 23 (2): 67–80. doi : 10.1016/j.pathophys.2016.02.002 . PMC 4867289 . PMID 26947707 .
^ Мантис, Нью -Джерси; Rol, n; Corthésy, B (2011). «Секреторные сложные роли IGA в гомеостазе иммунитета и слизистой оболочки в кишечнике» . Слизистая иммунология . 4 (6): 603–611. doi : 10.1038/mi.2011.41 . PMC 3774538 . PMID 21975936 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Петерсон, Ланс W; Артис, Дэвид (2014). «Эпителиальные клетки кишечника: регуляторы барьерной функции и иммунного гомеостаза». Природа обзоры иммунологии . 14 (3): 141–153. doi : 10.1038/nri3608 . PMID 24566914 . S2CID 3351351 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Хонда, Кения; Littman, Dan R (2016). «Микробиота в адаптивном иммунном гомеостазе и болезнях». Природа . 535 (7610): 75–84. Bibcode : 2016natur.535 ... 75H . doi : 10.1038/nature18848 . PMID 27383982 . S2CID 4461492 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Леви, м.; Тайсс, Калифорния; Elinav, E. (2016). «Метаболиты: посланники между микробиотой и иммунной системой» . Гены и развитие . 30 (14): 1589–1597. doi : 10.1101/gad.284091.116 . PMC 4973288 . PMID 27474437 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я Чжан Л.С., Дэвис С.С. (апрель 2016 г.). «Микробный метаболизм диетических компонентов в биологически активные метаболиты: возможности для новых терапевтических вмешательств» . Геном Мед . 8 (1): 46. doi : 10.1186/s13073-016-0296-x . PMC 4840492 . PMID 27102537 . Lactobacillus spp. Преобразовать триптофан в индол-3-альдегид (i3a) через неопознанные ферменты [125]. Clostridium sporogenes преобразует триптофан в IPA [6], вероятно, через триптофан -деаминазу. ... IPA также мощно собирает гидроксильные радикалы
Таблица 2: Микробные метаболиты: их синтез, механизмы действия и влияние на здоровье и заболевание
Рисунок 1: Молекулярные механизмы действия индол и ее метаболитов на физиологию и заболевания хозяина
^ Wikoff WR, Anfora AT, Liu J, Schultz PG, Lesley SA, Peters EC, Siuzdak G (март 2009 г.). «Анализ метаболомики выявляет большое влияние кишечной микрофлоры на метаболиты крови млекопитающих» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 106 (10): 3698–3703. Bibcode : 2009pnas..106.3698w . doi : 10.1073/pnas.0812874106 . PMC 2656143 . PMID 19234110 . Было показано, что продукция IPA полностью зависит от присутствия кишечной микрофлоры и может быть установлена колонизацией с бактериями Clostridium sporogenes .
Диаграмма метаболизма IPA
^ «3-индолепропионовая кислота» . База данных метаболом человека . Университет Альберты . Получено 12 июня 2018 года .
^ Chyan YJ, Poeggeler B, Omar RA, Chain DG, Frangione B, Ghiso J, Pappolla MA (июль 1999 г.). «Мощные нейропротекторные свойства против бета-амилоида Альцгеймера эндогенной мелатонином, связанной с индольной структурой, индол-3-пропионовой кислотой» . Дж. Биол. Химический 274 (31): 21937–21942. doi : 10.1074/jbc.274.31.21937 . PMID 10419516 . S2CID 6630247 . [Индоле-3-пропионовая кислота (IPA)] ранее была идентифицирована в плазме и спинномозговой жидкости людей, но ее функции неизвестны. ... В экспериментах по кинетической конкуренции с использованием средств свободных радикалов захватывающих агентов способность IPA к совокупности гидроксильных радикалов превысила мощность мелатонина, индолий, считается наиболее мощным природным мусорным палатом свободных радикалов. В отличие от других антиоксидантов, IPA не была преобразована в реактивные промежуточные соединения с прооксидантной активностью.
^ Хоппер, Кристофер П.; Де ла Круз, Лади Кимберли; Лайлс, Кристин В.; Wareham, Lauren K.; Гилберт, Джек А.; Эйхенбаум, Зехава; Магьеровски, Марцин; Пул, Роберт К.; Воллборн, Якоб; Ван, Бингхе (2020-12-23). «Роль монооксида углерода в коммуникации микробиома -хозяина - кита». Химические обзоры . 120 (24): 13273–13311. doi : 10.1021/acs.chemrev.0c00586 . ISSN 0009-2665 . PMID 33089988 . S2CID 224824871 .
^ Раджилич-Стоянович, Мирджана; De Vos, Willem M (2014). «Первые 1000 культивируемых видов желудочно -кишечной микробиоты человека» . Обзоры микробиологии FEMS . 38 (5): 996–1047. doi : 10.1111/1574-6976.12075 . PMC 4262072 . PMID 24861948 .
^ Хилл, MJ (март 1997 г.). «Кишечная флора и эндогенный синтез витамина» . Европейский журнал по предотвращению рака . 6 (Suppl 1): S43–45. doi : 10.1097/00008469-199703001-00009 . ISSN 0959-8278 . PMID 9167138 . S2CID 8740364 .
^ «Микробиом» . Тайфты сейчас . 2013-09-17 . Получено 2020-12-09 .
^ Мораис, Сара; Винклер, Сара; Зорея, Альва; Левин, Лирон; Nagies, Falk Sp; Капуст, Нильс; Ламед, Ева; Артан-Фурман, авитал; Болам, Дэвид Н.; Ядав, Мадхав П.; Байер, Эдвард А.; Мартин, Уильям Ф.; Мизрахи, Ицхак (2024-03-15). «Загадочное разнообразие деградирующих целлюлозы бактерий кишечника у промышленно развитых людей» . Наука . 383 (6688): EADJ9223. Bibcode : 2024sci ... 383J9223M . doi : 10.1126/science.adj9223 . ISSN 0036-8075 . PMC 7615765 . PMID 38484069 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Elrakaiby M, Dutilh BE, Rizkallah MR, Boleij A, Cole JN, Aziz RK (июль 2014 г.). «Pharmacomicrobiomics: влияние изменений микробиомов человека на системную фармакологию и персонализированную терапию» . OMICS . 18 (7): 402–414. doi : 10.1089/omi.2014.0018 . PMC 4086029 . PMID 24785449 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в CHO I, Blaser MJ (март 2012 г.). «Человеческий микробиом: на границе со здоровьем и заболеванием» . Природные обзоры. Генетика . 13 (4): 260–270. doi : 10.1038/nrg3182 . PMC 3418802 . PMID 22411464 . Состав микробиома варьируется в зависимости от анатомического сайта (рис. 1). Основным детерминантом состава сообщества является анатомическое местоположение: межличностные вариации являются существенными ^23,24 и выше, чем временная изменчивость, наблюдаемая на большинстве участков у одного человека ²⁵.
^ Хаттер Т., Гимберт С., Бушар Ф., Лапоинте Ф.Дж. (2015). «Быть человеком - это чувство интуиции» . Микробиом . 3 : 9. doi : 10.1186/s40168-015-0076-7 . PMC 4359430 . PMID 25774294 .
^ Кумар К., Дхок Г.В., Шарма А.К., Джайсвал С.К., Шарма В.К. (январь 2019 г.). «Механистическое выяснение метаболизма амфетамина с помощью тираминоксидазы из микробиоты кишечника человека с использованием моделирования молекулярной динамики». Журнал сотовой биохимии . 120 (7): 11206–11215. doi : 10.1002/jcb.28396 . PMID 30701587 . S2CID 73413138 .
^ Соуза, Тиаго; Патерсон, Ронни; Мур, Ванесса; Карлссон, Андерс; Авраамссон, Бертиль; Basit, Abdul W (2008). «Желудочно -кишечная микробиота как место для биотрансформации лекарств». Международный журнал фармацевтики . 363 (1–2): 1–25. doi : 10.1016/j.ijpharm.2008.07.009 . PMID 18682282 .
^ Haiser, H. J; Гутенберг, Д. Б; Чатман, K; Сирасани, g; Balskus, E. P; Тернбо, П. Дж. (2013). «Прогнозирование и манипулирование инактивацией сердечного препарата от кишечной бактерии человека Eggerthella Lenta» . Наука . 341 (6143): 295–298. Bibcode : 2013sci ... 341..295H . doi : 10.1126/science.1235872 . PMC 3736355 . PMID 23869020 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Коппел, Ницан; Майни Рекдал, Вайю; Балкус, Эмили П. (2017-06-23). «Химическая трансформация ксенобиотиков человеческой кишечной микробиотой» . Наука . 356 (6344). doi : 10.1126/science.aag2770 . ISSN 0036-8075 . PMC 5534341 . PMID 28642381 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Spanogiannopoulos, Peter; Бесс, Элизабет Н.; Carmody, Rachel N.; Тернбо, Питер Дж. (2016-03-14). «Микробные фармацевты внутри нас: метагеномный вид ксенобиотического метаболизма» . Nature Reviews Microbiology . 14 (5): 273–287. doi : 10.1038/nrmicro.2016.17 . ISSN 1740-1526 . PMC 5243131 . PMID 26972811 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Майни Рекдал, Вайю; Бесс, Элизабет Н.; Бизанц, Джордан Э.; Тернбо, Питер Дж.; Балкус, Эмили П. (2019-06-14). «Открытие и ингибирование межвидового кишечного бактериального пути метаболизма леводопы» . Наука . 364 (6445). doi : 10.1126/science.aau6323 . ISSN 0036-8075 . PMC 7745125 . PMID 31196984 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Демпси, Джозеф Л.; Cui, Julia Yue (2019-10-19). «Микробиом является функциональным модификатором метаболизма лекарственного средства P450» . Текущие отчеты о фармакологии . 5 (6): 481–490. doi : 10.1007/s40495-019-00200-w . ISSN 2198-641X . PMC 7731899 . PMID 33312848 .
^ Бурнер, Удо; Эббот, Сет; Роу, Роберт Л. (январь 1975 г.). «Метаболизм морфина и героина у человека». Обзоры метаболизма наркотиков . 4 (1): 39–73. doi : 10.3109/03602537508993748 . ISSN 0360-2532 . PMID 1204496 .
^ Добкин, Джей Ф.; Saha, Jnan R.; Батлер, Винсент П.; Neu, Harold C.; Линденбаум, Джон (1983-04-15). «Дигоксин-инактивирующие бактерии: идентификация во флоре кишечника человека». Наука . 220 (4594): 325–327. doi : 10.1126/science.6836275 . ISSN 0036-8075 . PMID 6836275 .
^ Sahota, SS; Брэмли, премьер -министр; Menzies, IS (1982-02-01). «Ферментация лактулозы бактериями толстой кишки» . Микробиология . 128 (2): 319–325. doi : 10.1099/00221287-128-2-319 . ISSN 1350-0872 . PMID 6804597 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Yoo, Dae-Hyoung; Ким, в Суке; Ван Ле, ТИ Ким; Юнг, Иль-Хун; Ю, Хе Хён; Ким, Донг-Хён (2014-06-19). «Медоседованные микробиоты взаимодействия между ловастатином и антибиотиками». Метаболизм и расположение наркотиков . 42 (9): 1508–1513. doi : 10.1124/dmd.114.058354 . ISSN 0090-9556 . PMID 24947972 . S2CID 7524335 .
^ Хайзер, Генри Дж.; Гутенберг, Дэвид Б.; Чатман, Келли; Сирасани, Гопал; Балкус, Эмили П.; Тернбо, Питер Дж. (2013-07-19). «Прогнозирование и манипулирование инактивацией сердечного препарата от кишечной бактерии человека Eggerthella Lenta » . Наука . 341 (6143): 295–298. Bibcode : 2013sci ... 341..295H . doi : 10.1126/science.1235872 . ISSN 0036-8075 . PMC 3736355 . PMID 23869020 .
^ Parvez, MD Masud; Базит, Абдул; Jariwala, Parth B.; Габорик, Зсузсанна; Kis, Emese; Хейворд, Скотт; Рединбо, Мэтью Р.; Прасад, Бхагват (2021-06-01). «Количественное исследование метаболизма, транспорта и микробиома иринотекана» . Метаболизм и расположение наркотиков . 49 (8): 683–693. doi : 10.1124/dmd.121.000476 . ISSN 0090-9556 . PMC 8407663 . PMID 34074730 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Соуза, Тиаго; Патерсон, Ронни; Мур, Ванесса; Карлссон, Андерс; Авраамссон, Бертиль; Базит, Абдул В. (ноябрь 2008 г.). «Желудочно -кишечная микробиота как место для биотрансформации лекарств». Международный журнал фармацевтики . 363 (1–2): 1–25. doi : 10.1016/j.ijpharm.2008.07.009 . ISSN 0378-5173 . PMID 18682282 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Коппел, Ницан; Бизанц, Джордан Э; Панделия, Мария-Эйрини; Тернбо, Питер Дж; Балкус, Эмили П. (2018-05-15). Лей, Рут Эмили (ред.). «Открытие и характеристика распространенного бактериального фермента человека человека, достаточного для инактивации семейства токсинов растений» . элиф . 7 : E33953. doi : 10.7554/elife.33953 . ISSN 2050-084X . PMC 5953540 . PMID 29761785 .
^ Александр, Джеймс Л.; Уилсон, Ян Д.; Три, Джулиан; Marchesi, Julian R.; Николсон, Джереми К.; Кинросс, Джеймс М. (2017-03-08). «Модуляция кишечной микробиоты эффективности и токсичности химиотерапии» . Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology . 14 (6): 356–365. doi : 10.1038/nrgastro.2017.20 . HDL : 10044/1/77636 . ISSN 1759-5045 . PMID 28270698 . S2CID 9654170 .
^ Брэнди, Джованни; Дабард, Джин; Райбо, Пьер; Ди Баттиста, Моника; Бридоно, Шанталь; Писи, Анна Мария; Морселли Лабат, Антонио Мария; Панталео, Мария изобилие; Де Виво, Антонелло; Biasco, Guido (2006-02-15). «Кишечная микрофлора и пищеварительная токсичность иринотекана у мышей». Клиническое исследование рака . 12 (4): 1299–1307. Doi : 10.1158/1078-0432.ccr-05-0750 . ISSN 1078-0432 . PMID 16489087 . S2CID 26655779 .
^ Ко, Ара; Де Ваддер, Филипе; Kovatcheva-Datchary, Petia; Бакхед, Фредрик (июнь 2016 г.). «От диетического волокна до физиологии размещения: жирные кислоты с короткой цепью в качестве ключевых бактериальных метаболитов» . Клетка . 165 (6): 1332–1345. doi : 10.1016/j.cell.2016.05.041 . ISSN 0092-8674 . PMID 27259147 . S2CID 8562345 .
^ Konopelski, Piotr; Ufnal, Marcin (2018-09-14). «Индолы - кишечные бактерии метаболиты триптофана с фармакотерапевтическим потенциалом». Текущий метаболизм лекарств . 19 (10): 883–890. doi : 10.2174/1389200219666180427164731 . ISSN 1389-2002 . PMID 29708069 . S2CID 13979774 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Коллинз, Стефани Л.; Стайн, Джонатан Г.; Бизанц, Джордан Э.; Окафор, С. Дениз; Паттерсон, Эндрю Д. (2022-10-17). «Желченные кислоты и кишечная микробиота: метаболические взаимодействия и влияние на заболевание». Nature Reviews Microbiology . 21 (4): 236–247. doi : 10.1038/s41579-022-00805-x . ISSN 1740-1526 . PMID 36253479 . S2CID 252970168 .
^ Ян, Вендзин; Ю, Тянминг; Хуан, Сянсхенг; Билотта, Энтони Дж.; Сюй, Лейки; Лу, Яо; Солнце, Цзярен; Пан, вентилятор; Чжоу, Цзя; Чжан, Венбо; Яо, Сусия; Мейнард, Крейг Л.; Сингх, Нагендра; Данн, Сара М.; Лю, Чжанджу (2020-09-08). «Производна кишечниками микробиоты с короткоцепочечными кислотами регуляция продукции иммунных клеток IL-22 и иммунитета кишечника» . Природная связь . 11 (1): 4457. Бибкод : 2020natco..11.4457y . doi : 10.1038/s41467-020-18262-6 . ISSN 2041-1723 . PMC 7478978 . PMID 32901017 .
^ Муругесан, Сельванкар; Нирмалкар, Хемлал; Хойо-Вадильо, Карлос; García-Espitia, Matilde; Рамирес-Санчес, Даниэла; García-Mena, Jaime (2017-12-02). «Производство микробиомов кишечника короткоцепочечных жирных кислот и ожирения у детей». Европейский журнал клинической микробиологии и инфекционных пустынь . 37 (4): 621–625. Doi : 10,1007/S10096-017-3143-0 . ISSN 0934-9723 . PMID 29196878 . S2CID 254132108 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Thanissery, Rajani; Уинстон, Jenessa A.; Териот, Кейси М. (июнь 2017 г.). «Ингибирование прорастания спор, роста и токсина клинически значимых штаммов C. difficile с помощью микробиоты кишечника, полученных вторичными желчными кислотами» . Анаэроб . 45 : 86–100. doi : 10.1016/j.anaerobe.2017.03.004 . ISSN 1075-9964 . PMC 5466893 . PMID 28279860 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Джонс, Брайан v.; Бегли, Майр; Хилл, Колин; Гахан, Кормак Г.М.; Marchesi, Julian R. (2008-09-09). «Функциональный и сравнительный метагеномный анализ активности гидролазы желчной соли в кишечном микробиоме человека» . Труды Национальной академии наук . 105 (36): 13580–13585. Bibcode : 2008pnas..10513580J . doi : 10.1073/pnas.0804437105 . ISSN 0027-8424 . PMC 2533232 . PMID 18757757 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Cao H, Xu M, Dong W, Deng B, Wang S, Zhang Y, Wang S, Luo S, Wang W, Qi Y, Gao J, Cao X, Yan F, Wang B (июнь 2017 г.). «Вторичный индуцированный желчным кислотой дисбиоз способствует кишечному канцерогенезу» . Международный журнал рака . 140 (11): 2545–2556. doi : 10.1002/ijc.30643 . PMID 28187526 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Бернштейн Х, Бернштейн С (январь 2023 г.). «Желченные кислоты как канцерогены в толстой кишке и в других участках желудочно -кишечной системы» . Экспериментальная биология и медицина . 248 (1): 79–89. doi : 10.1177/15353702221131858 . PMC 9989147 . PMID 36408538 .
^ Майер Э. А; Рыцарь, R; Мазман, С. К; Cryan, J. F; Тиллиш, К. (2014). «Микробы кишечника и мозг: сдвиг парадигмы в нейробиологии» . Журнал нейробиологии . 34 (46): 15490–15496. doi : 10.1523/jneurosci.3299-14.2014 . PMC 4228144 . PMID 25392516 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Динан, Тимоти Г; Крайан, Джон Ф. (2015). «Влияние кишечной микробиоты на мозг и поведение». Современное мнение клинического питания и метаболической помощи . 18 (6): 552–558. doi : 10.1097/mco.0000000000000221 . PMID 26372511 . S2CID 21424690 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Карман, Роберт Дж.; Саймон, Мэри Алиса; Фернандес, Гайде; Миллер, Маргарет А.; Варфоломей, Мэри Дж. (2004). «Ципрофлоксацин на низких уровнях нарушает устойчивость к колонизации фекальной микрофлоры человека, растущей в хемостатах». Регуляторная токсикология и фармакология . 40 (3): 319–326. doi : 10.1016/j.yrtph.2004.08.005 . PMID 15546686 .
^ HVAS, Кристиан Лодберг; Баунвалл, Саймон Марк Даль; Эриксстроп, Кристиан (2020-07-01). «Трансплантация фекальной микробиоты: спасательная терапия, оспариваемая коммерческими претензиями на эксклюзивность» . EclinicalMedicine . 24 : 100436. DOI : 10.1016/j.eclinm.2020.100436 . ISSN 2589-5370 . PMC 7334803 . PMID 32642633 .
^ Брандт, Лоуренс Дж.; Бороди, Томас Юлий; Кэмпбелл, Джордана (2011). «Эндоскопическая трансплантация фекальной микробиоты» . Журнал клинической гастроэнтерологии . 45 (8): 655–657. doi : 10.1097/mcg.0b013e3182257d4f . PMID 21716124 . S2CID 2508836 .
^ Рыцарь, DJW; Girling, KJ (2003). «Кишечная флора в здоровье и болезнях» . Lancet . 361 (9371): 512–519. doi : 10.1016/s0140-6736 (03) 13438-1 . PMID 12781578 . S2CID 40683723 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Чо, я.; Yamanishi, S.; Cox, L.; Мете, ба; Завадил, Дж.; Ли, К.; Гао, Z.; Махана, Д.; Раджу, К.; Тейтлер, я.; Li, H.; Alekseyenko, Av; Blaser, MJ (2012). «Антибиотики в раннем возрасте изменяют мышиный микробиом и ожирение мышиной толстой кишки» . Природа . 488 (7413): 621–626. Bibcode : 2012natur.488..621c . doi : 10.1038/nature11400 . PMC 3553221 . PMID 22914093 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Schneiderhan, J; Master-Hunter, T; Locke, A (2016). «Нацеливание на кишечную флору для лечения и предотвращения заболеваний». Журнал семейной практики . 65 (1): 34–38. PMID 26845162 .
^ Бейкер, Монья (2012). «Беременность изменяет живые микробы кишечника» . Природа . doi : 10.1038/nature.2012.11118 . S2CID 87078157 .
^ Хилл, Колин; Гуарнер, Франциско; Рейд, Грегор; Гибсон, Гленн Р; Меренштейн, Даниэль Дж; Горшок, Бруно; Морелли, Лоренцо; Канани, Роберто Берни; Флинт, Гарри Дж; Салминен, Сепо; Колдер, Филипп С; Сандерс, Мэри Эллен (2014). «Международная научная ассоциация пробиотиков и пребиотиков консенсус по объему и надлежащее использование термина пробиотики» . Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology . 11 (8): 506–514. doi : 10.1038/nrgastro.2014.66 . HDL : 2164/4189 . PMID 24912386 .
^ Rijkers, Ger T; Де Вос, Виллем М; Браммер, Роберт-Ян; Морелли, Лоренцо; Коршьер, Джерард; Марто, Филипп (2011). «Преимущества для здоровья и претензии на здоровье пробиотиков: соединение науки и маркетинга» . Британский журнал питания . 106 (9): 1291–1296. doi : 10.1017/s000711451100287x . PMID 21861940 .
^ Хаткинс, Роберт В.; Крумбек, Джанина А; Bindels, laure B; Кани, Патрис Д; Фахи, Джордж; Го, Юн Джун; Хамакер, Брюс; Мартенс, Эрик С; Миллс, Дэвид А; Растал, Роберт А; Воган, Элейн; Сандерс, Мэри Эллен (2016). «Пребиотики: почему определения имеют значение» . Текущее мнение о биотехнологии . 37 : 1–7. doi : 10.1016/j.copbio.2015.09.001 . PMC 4744122 . PMID 26431716 .
^ Пандей, Кавита. R; Найк, Суреш. R; Вакил, Бабу. V (2015). «Пробиотики, пребиотики и синбиотики- обзор» . Журнал пищевой науки и техники . 52 (12): 7577–7587. doi : 10.1007/s13197-015-1921-1 . PMC 4648921 . PMID 26604335 .
^ Broeckx, Géraldine; Vandenhevel, Dieter; Claes, Ingmar JJ; Лебер, Сара; Кикенс, Филип (2016). «Методы сушки пробиотических бактерий как важный шаг к развитию новых фармабиотиков» (PDF) . Международный журнал фармацевтики . 505 (1–2): 303–318. doi : 10.1016/j.ijpharm.2016.04.002 . HDL : 10067/1328840151162165141 . PMID 27050865 .
^ Slator, Roy D; Хилл, Колин (2009). «Рациональный дизайн улучшенных фармабиотиков» . Журнал биомедицины и биотехнологии . 2009 : 275287. DOI : 10.1155/2009/275287 . PMC 2742647 . PMID 19753318 .
^ Паттерсон, Элейн; Крайан, Джон Ф; Фицджеральд, Джеральд Ф; Росс, Р. Пол; Динан, Тимоти Г; Стентон, Кэтрин (2014). «Микробиота кишечника, фармабиотики, которые они производят и принимают здоровье» . Труды общества питания . 73 (4): 477–489. doi : 10.1017/s0029665114001426 . PMID 25196939 .
^ "Непрерывная терапевтическая терапевтика для IBS: где мы?" Полем 30 января 2024 года.
^ Гуандалини, Стефано; Магацца, Джузеппе; Ясно, Андреа; Арбалет, Валерия; Ди Нардо, Джованни; Гопалан, Сарат; Сибал, А.; Романо, Клаудио; Канани, Роберто Берни; Лионетти, Паоло; Setty, Mala (июль 2010 г.). «VSL#3 улучшает ситомы у детей с синдромом раздраженного кишечника: многоцентровое рандомизированное плацебо-контролируемое, двойное слепое, кроссоверное исследование» . Журнал педиатрической гастроэнтерологии и питания . 51 (1): 24–30. Doi : 10.1097/mpg.0b013e3181ca4d95 . PMID 20453678 . S2CID 33659736 .
^ Crucillà, Salvatore; Caldart, Federico; Мишелон, Марко; Мараско, Джованни; Костентино, Андреа (2024-08-14). «Функциональное вздутие живота и микробиота кишечника: обновление» . Микроорганизмы . 12 (8): 1669. DOI : 10.3390/Microorganisms12081669 . ISSN 2076-2607 . PMC 11357468 . PMID 39203511 .
^ Форд, Александр С; Квигли, Имонн М.М.; Лейси, Брайан Э; Лембо, Энтони Дж; Сайто, Юрий А; Шиллер, Лоуренс Р; Соффер, Эди Э; Spiegel, Brennan MR; Моайеди, Пол (2014). «Эффективность пребиотиков, пробиотиков и синбиотиков при синдроме раздраженного кишечника и хронических идиопатических запоров: систематический обзор и метаанализ». Американский журнал гастроэнтерологии . 109 (10): 1547–1561, Quiz 1546, 1562. DOI : 10.1038/ajg.2014.202 . PMID 25070051 . S2CID 205100508 .
^ Дюпон, Эндрю; Ричардс; Jelinek, Katherine A; Крилл, Джозеф; Рахими, Эрик; Гури, Езаз (2014). «Систематический обзор рандомизированных контролируемых исследований пробиотиков, пребиотиков и синбиотиков при воспалительных заболеваниях кишечника» . Клиническая и экспериментальная гастроэнтерология . 7 : 473–487. doi : 10.2147/ceg.s27530 . PMC 4266241 . PMID 25525379 .
^ Ю, Ченг Гонг; Хуан, Цинь (2013). «Недавний прогресс в роли кишечной микробиоты в патогенезе воспалительного заболевания кишечника» . Журнал пищеварительных заболеваний . 14 (10): 513–517. doi : 10.1111/1751-2980.12087 . PMID 23848393 . S2CID 26982085 .
^ Левитт, Майкл Д.; Дуэйн, Уильям С. (1972-05-04). «Плавающие табуретки - валюс против жира». Новая Англия Журнал медицины . 286 (18): 973–975. doi : 10.1056/nejm197205042861804 . ISSN 0028-4793 . PMID 5015442 .
^ Аалам, Сайед Мухаммед Мушер; Краста, Дафна Норма; Рой, Пуджа; Миллер, А. Ли; Гамб, Скотт I.; Джонсон, Стивен; До, Лиза М.; Чен, Джун; Кашьяп, Пурна; Канан, Нагараджан (2022-10-27). «Бытие фекального плавания причинно связано с кишечной микробной колонизацией у мышей» . Научные отчеты . 12 (1): 18109. Bibcode : 2022natsr..1218109A . doi : 10.1038/s41598-022-22626-x . ISSN 2045-2322 . PMC 9613883 . PMID 36302811 .
^ Майер, Лиза; Прутеану, Михала; Кун, Майкл; Зеллер, Георг; Telzerow, Anja; Андерсон, Эксен Эрин; Брохадо, Ана Рита; Фернандес, Кит Конрад; Доза, Hitomi; Мори, Хиротада; Патил, Киран Раосахеб; Борк, сверстник; Тип, Афанасиос (2018). «Обширное влияние неантибиотических препаратов на кишечные бактерии человека» . Природа . 555 (7698): 623–628. Bibcode : 2018natur.555..623m . doi : 10.1038/nature25979 . PMC 6108420 . PMID 29555994 .
^ Клаусс, Маттиу; Жерард, Филипп; Моска, Алексис; Леклерк, Марион (2021). «Взаимодействие между физическими упражнениями и кишечным микробиом в контексте здоровья человека и производительности» . Границы в питании . 8 : 637010. DOI : 10.3389/fnut.2021.637010 . PMC 8222532 . PMID 34179053 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Камбодж, Ак; Cotter, Tg; Oxentenko, AS (2017). «Helicobacter pylori: прошлое, настоящее и будущее в управлении» . Майо -клиника . 92 (4): 599–604. doi : 10.1016/j.mayocp.2016.11.017 . ISSN 0025-6196 . PMID 28209367 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Язвенная болезнь» (PDF) . Медицинский факультет Университета Джона Хопкинса. 2013 . Получено 21 октября 2020 года .
^ Буриш, Йохан; Джесс, Тин; Мартинато, Маттео; Лакатос, Питер Л. (2013). «Бремя воспалительного заболевания кишечника в Европе» . Журнал Крона и колита . 7 (4): 322–337. doi : 10.1016/j.crohns.2013.01.010 . PMID 23395397 .
^ Blandino, g; Inturri, R; Lazzara, F; Розы, м; Malaguarnera, L (2016). «Влияние кишечной микробиоты на сахарный диабет». Диабет и метаболизм . 42 (5): 303–315. Doi : 10.1016/j.diabet.2016.04.004 . PMID 27179626 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Буланг, Клэр Л; Невес, Ана Луиза; Чилу, Жюльен; Николсон, Джереми К; Дюма, Марк-Эммануэль (2016). «Влияние кишечной микробиоты на воспаление, ожирение и метаболическое заболевание» . Медицина генома . 8 (1): 42. DOI : 10.1186/S13073-016-0303-2 . PMC 4839080 . PMID 27098727 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Арриета, Мари-Клэр; Stiemsma, Leah T; Dimitriu, pedro a; Торсон, Лиза; Рассел, Шеннон; Юрист-Дауш, Софи; Кузелььевич, Борис; Золото, Мэтью Дж; Бриттон, Хайди М; Lefebvre, Diana L; Суббарао, Падмаджа; Мандхайн, Пюш; Беккер, Аллан; Макнагни, Келли М; Сирс, Малкольм Р; Коллманн, Тобиас; Мон, Уильям У; Турви, Стюарт Э; Бретт Финлей, Б. (2015). «Ранние микробные и метаболические изменения влияют на риск детской астмы» . Научная трансляционная медицина . 7 (307): 307RA152. doi : 10.1126/scitranslmed.aab2271 . PMID 26424567 . S2CID 206687974 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Stiemsma, Leah T; Турви, Стюарт Э. (2017). «Астма и микробиом: определение критического окна в раннем возрасте» . Аллергия, астма и клиническая иммунология . 13 : 3. DOI : 10.1186/S13223-016-0173-6 . PMC 5217603 . PMID 28077947 .
^ IPCI, Каган; Altıntoprak, Niyazi; Мулук, Нурай Баяр; Senturk, Mehmet; Cingi, Cemal (2016). «Возможные механизмы человеческого микробиома при аллергических заболеваниях». Европейские архивы Ото-рхино-ларингологии . 274 (2): 617–626. doi : 10.1007/s00405-016-4058-6 . PMID 27115907 . S2CID 27328940 .
^ Мариньо, Элиана; Ричардс, Джеймс Л.; McLeod, Keiran H.; и др. (Май 2017). «Микробные метаболиты кишечника ограничивают частоту аутоиммунных Т -клеток и защищают от диабета 1 типа» . Природа иммунология . 18 (5): 552–562. doi : 10.1038/ni.3713 . ISSN 1529-2916 . PMID 28346408 . S2CID 30078908 .
^ Bettelli E, Carrier Y, Gao W, Korn T, Strom TB, Oukka M, Weiner HL, Cuchro Vk (май 2006 г.). «Взаимные пути развития для генерации патогенных эффектора Th17 и регуляторных Т -клеток». Природа . 441 (7090): 235–238. Bibcode : 2006natur.441..235b. doi : 10.1038/nature04753. PMID 16648838.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Säemann, Marcus D.; Böhmig, Georg A.; Österreicher, Christoph H.; и др. (Декабрь 2000 г.). «Противовоспалительное влияние бутирата натрия на моноциты человека: мощное ингибирование IL-12 и повышение регуляции продукции IL-10» . Журнал FASEB . 14 (15): 2380–2382. doi : 10.1096/fj.00-0359fje . ISSN 0892-6638 . PMID 11024006 . S2CID 41553220 .
^ Гао, Z; Инь, J; Чжан, J; Уорд Р. Э; Мартин Р. Дж; Лефевр, м; Cefalu, W. T; Ye, J (2009). «Бутират улучшает чувствительность к инсулину и увеличивает расходы на энергию у мышей» . Диабет . 58 (7): 1509–1517. doi : 10.2337/db08-1637 . PMC 2699871 . PMID 19366864 .
^ Мазиди, Мохсен; Резай, Пейман; Кенгне, Андре Паскаль; Mobarhan, Majid Ghayour; Фернс, Гордон А (2016). «Микробиом кишечника и метаболический синдром». Диабет и метаболический синдром: клинические исследования и обзоры . 10 (2): S150–157. doi : 10.1016/j.dsx.2016.01.024 . PMID 26916014 .
^ Чен, Сяо; Д'Суза, Рошан; Hong, Seong-Thool (2013). «Роль кишечной микробиоты на оси кишечника-мозга: текущие проблемы и перспективы» . Белок и клетка . 4 (6): 403–414. doi : 10.1007/s13238-013-3017-x . PMC 4875553 . PMID 23686721 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Мёллер, Эндрю Х.; Ли, Йингинг; Ngole, Eitel mpoudi; Ахука-Мундеке, Стив; Лонсдорф, Элизабет В.; Пьюзи, Энн Э.; Питерс, Мартин; Hahn, Beatrice H.; Ochman, Howard (2014-11-18). «Быстрые изменения в кишечном микробиоме во время эволюции человека» . Труды Национальной академии наук . 111 (46): 16431–16435. Bibcode : 2014pnas..11116431M . doi : 10.1073/pnas.1419136111 . ISSN 0027-8424 . PMC 4246287 . PMID 25368157 .
^ Брун, А. (2014). «Симбиотическое пищеварение лигноцеллюлозы в термитных кишках». Nature Reviews Microbiology . 12 (3): 168–180. doi : 10.1038/nrmicro3182 . PMID 24487819 . S2CID 5220210 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Дитрих, C.; Köhler, T.; Брун, А. (2014). «Происхождение таракана микробиоты Termite кишечника: паттерны в структуре бактериального сообщества отражают серьезные эволюционные события» . Прикладная и экологическая микробиология . 80 (7): 2261–2269. Bibcode : 2014apenm..80.2261d . doi : 10.1128/aem.04206-13 . PMC 3993134 . PMID 24487532 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Микаелан, а.; Дитрих, C.; Köhler, T.; Poulsen, M.; Sillam-Dussès, D.; Брун, А. (2015). «Диета является основной детерминантой структуры бактериального сообщества в кишечниках более высоких термитов». Молекулярная экология . 24 (20): 5824–5895. Bibcode : 2015molec..24.5284m . doi : 10.1111/mec.13376 . PMID 26348261 . S2CID 206182668 .
^ Микаелан, а.; Томпсон, C.; Hofer, M.; Брун, А. (2016). «Детерминистическая сборка сложных бактериальных сообществ в кишечниках тараканов без зародышей» . Прикладная и экологическая микробиология . 82 (4): 1256–1263. doi : 10.1128/aem.03700-15 . PMC 4751828 . PMID 26655763 .

Дальнейшее чтение

Обзор статьи

Де Пратер, Вики; Хамер, Хенрике М; Виндей, Карен; Verbeke, Кристин (2011). «Влияние до и/или пробиотиков на метаболизм толстой кишки человека: влияет ли это на здоровье человека?». Молекулярное питание и исследования питания . 55 (1): 46–57. doi : 10.1002/mnfr.201000451 . PMID 21207512 .
Марандуба, Карлос Магно да Коста; Де Кастро, Сандра Бертелли Рибейро; Souza, Gustavo Torres de; Россато, Криштиану; Да Гия, Франциско Карлос; Валенте, Мария Анете Сантана; Ретторе, Жоао Витор Паес; Maranduba, Claudinéia Pereira; Souza, Camila Maurmann de; Кармо, Антонио Марсио Resende Do; Македо, Гилсон Коста; Сильва, Фернандо де Са (2015). «Микробиота кишечник Модуляторы системы имамунской системы и нейроиммунной системы: воздействие на здоровье хозяина и гомеостаз » . Журнал иммунологических исследований . 2015 : 931574. DOI : 10.1155/2015/931574 . PMC 4352473 . PMID 25759850 .
Пракаш, Сатья; Родес, Латиция; Кусса-Чарли, Майкл; Томаро-Духесно, Кэтрин; Томаро-Духесно, Кэтрин; Кусса-Чарли; Родес (2011). «Микробиота кишечника: следующая граница в понимании здоровья человека и развития биотерапевтических средств» . Биологии: цели и терапия . 5 : 71–86. doi : 10.2147/btt.s19099 . PMC 3156250 . PMID 21847343 .
Wu, GD; Чен, Дж.; Хоффманн, С.; Bittinger, K.; Chen, Y.-Y.; Keilbaugh, SA; Bewtra, M.; Рыцари, Д.; Уолтерс, Вашингтон; Рыцарь, Р.; Синха, Р.; Гилрой, Е.; Гупта, К.; Baldassano, R.; Nessel, L.; Li, H.; Бушмен, FD; Льюис, JD (2011). «Связывание долгосрочных пищевых моделей с кишечными микробными энтеротипами» . Наука . 334 (6052): 105–108. Bibcode : 2011sci ... 334..105W . doi : 10.1126/science.1208344 . PMC 3368382 . PMID 21885731 .

[94] Существует существенное изменение в составе микробиомов и концентрации микробов с помощью анатомического сайта. ^{[ 92 ]}^{[ 93 ]} Жидкость из толстой кишки человека, которая содержит самую высокую концентрацию микробов любого анатомического сайта, содержит приблизительно один триллион (10^12) бактериальных клеток/мл. ^{[ 92 ]}

[Moszak-1] Мостак, м; Szulińska, M; Богданьский, P (15 апреля 2020 г.). «Вы-то, что вы едите-отношения между диетой, микробиотой и метаболическими расстройствами-обзор» . Питательные вещества . 12 (4): 1096. doi : 10.3390/nu12041096 . PMC 7230850 . PMID 32326604 . S2CID 216108564 .

[Engel-2] Jump up to: ^а ^{беременный} Энгель, П.; Моран, Н. (2013). «Микробиота кишечника насекомых - график в структуре и функции» . Обзоры микробиологии FEMS . 37 (5): 699–735. doi : 10.1111/1574-6976.12025 . PMID 23692388 .

[Segata-3] Segata, n; Boernigen, D; Щекотка, TL; Морган, XC; Гаррет, WS; Huttenhower, C (14 мая 2013 г.). «Вычислительная мета'омика для исследований микробного сообщества» . Биология молекулярных систем . 9 : 666. DOI : 10.1038/MSB.2013.22 . PMC 4039370 . PMID 23670539 .

[Saxena2016-4] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Saxena, R.; Sharma, VK (2016). «Метагеномное понимание микробиома человека: его последствия для здоровья и болезней» . В Кумаре, Д.; С. Антонаракис (ред.). Геномика медицинской и здоровья . Elsevier Science. п. 117. doi : 10.1016/b978-0-12-420196-5.00009-5 . ISBN 978-0-12-799922-7 .

[Prescotts-5] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k Шервуд, Линда; Уилли, Джоан; Вулвертон, Кристофер (2013). Микробиология Прескотта (9 -е изд.). Нью -Йорк: МакГроу Хилл. С. 713–721. ISBN 9780073402406 Полем OCLC 886600661 .

[Guarner_and_Malagelada_2003b-6] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м ^не ^а Гуарнер, F; Малагелада, Дж. (2003). «Кишечная флора в здоровье и болезнях». Lancet . 361 (9356): 512–519. doi : 10.1016/s0140-6736 (03) 12489-0 . PMID 12583961 . S2CID 38767655 .

[Beaugerie_L_and_Petit_JC-7] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k Богери, Лоран; Пети, Жан-Клод (2004). «Диарея, связанная с антибиотиком». Лучшая практика и исследования клиническая гастроэнтерология . 18 (2): 337–352. doi : 10.1016/j.bpg.2003.10.002 . PMID 15123074 .

[Stephen_and_Cummings-8] Jump up to: ^а ^{беременный} Стивен, Ам; Каммингс, JH (1980). «Микробный вклад в массу фекалий человека» . Журнал медицинской микробиологии . 13 (1): 45–56. doi : 10.1099/00222615-13-1-45 . PMID 7359576 .

[Quigley2013rev-9] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Квигли, Э. М. (2013). «Кишечные бактерии в здоровье и болезнях» . Гастроэнтерология и гепатология . 9 (9): 560–569. PMC 3983973 . PMID 24729765 .

[10] Тернбо, Питер Дж.; Лей, Рут Е.; Хамади, Мика; Фрейзер-Лиггетт, Клэр М.; Рыцарь Роб; Гордон, Джеффри И. (октябрь 2007 г.). «Проект микробиома человека» . Природа . 449 (7164): 804–810. Bibcode : 2007natur.449..804t . doi : 10.1038/nature06244 . ISSN 0028-0836 . PMC 3709439 . PMID 17943116 .

[11] Ма, Гуаню; Ши, Югуо; Мэн, Лулу; Фанат, Халонг; Тан, Xiaomei; Luo, Huijuan; Ван, Дунджу; Чжоу, Хуан; Сяо, Xiaomin (2023). «Факторы, влияющие на раннее установление кишечной флоры новорожденных и ее меры вмешательства» . Границы в клеточной и инфекционной микробиологии . 13 doi : 10.3389/fcimb.2023.1295111 . ISSN 2235-2988 . PMC 10722192 . PMID 38106467 .

[Sommer2013rev-12] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м ^не ^а ^п Соммер, Феликс; Bäckhed, Fredrik (2013). «Микробиота кишечника - мастера развития хозяев и физиологии». Nature Reviews Microbiology . 11 (4): 227–238. doi : 10.1038/nrmicro2974 . PMID 23435359 . S2CID 22798964 .

[Faderl2015rev-13] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Фадерл, Мартин; Нотти, Марио; Корацца, Надия; Мюллер, Кристоф (2015). «Следуйте ошибкам: слой слизи в качестве критического компонента в поддержании гомеостаза кишечника» . Жизнь iubmb . 67 (4): 275–285. doi : 10.1002/iub.1374 . PMID 25914114 . S2CID 25878594 .

[Clarke2014rev-14] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Кларк, Джерард; Стилла, Роман М; Кеннеди, Пол Дж; Стентон, Кэтрин; Крайан, Джон Ф; Динан, Тимоти Г. (2014). «Minireview: кишечная микробиота: пренебреженный эндокринный орган» . Молекулярная эндокринология . 28 (8): 1221–1238. doi : 10.1210/me.2014-1108 . PMC 5414803 . PMID 24892638 .

[Shen2016rev-15] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Шен, SJ; Вонг, Конни Х. Х. (2016). «Воспаление, воспаление: роль кишечной микробиоты» . Клиническая и трансляционная иммунология . 5 (4): E72. doi : 10.1038/cti.2016.12 . PMC 4855262 . PMID 27195115 .

[CNS_SystRev_2016-16] Jump up to: ^а ^{беременный} Ван, Хуиинг; Ли, In-Сеон; Браун, Кристоф; Enck, Пол (2016). «Влияние пробиотиков на функции центральной нервной системы у животных и людей: систематический обзор» . Журнал нейрогастроэнтерологии и подвижности . 22 (4): 589–605. doi : 10.5056/jnm16018 . PMC 5056568 . PMID 27413138 .

[Microbiome_summary-17] Сальвадори, м (20 марта 2024 г.). «Обновите кишечный микробиом в отношении здоровья и болезней» . World J Methodol . 14 (1). doi : 10.5662/wjm.v14.i1.89196 . PMC 10989414 . PMID 38577200 .

[Sears-18] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Сирс, Синтия Л. (2005). «Динамичное партнерство: празднование нашей кишечной флоры». Анаэроб . 11 (5): 247–251. doi : 10.1016/j.anaerobe.2005.05.001 . PMID 16701579 .

[19] Шапира, Майкл (2016-07-01). «Микробиоты кишечника и эволюция хозяина: масштабирование симбиоза» . Тенденции в экологии и эволюции . 31 (7): 539–549. Bibcode : 2016tecoe..31..539s . doi : 10.1016/j.tree.2016.03.006 . ISSN 0169-5347 . PMID 27039196 .

[20] Уокер, Алан У.; Хойлс, Лесли (август 2023 г.). «Мифы человеческого микробиома и заблуждения» . Природная микробиология . 8 (8): 1392–1396. doi : 10.1038/s41564-023-01426-7 . ISSN 2058-5276 . PMID 37524974 .

[Lozupone2012-21] Лозупоне, Кэтрин А.; Stombaugh, Jesse I.; Гордон, Джеффри I.; Янссон, Джанет К.; Найт, Роб (2012). «Разнообразие, стабильность и устойчивость человеческой кишечной микробиоты» . Природа . 489 (7415): 220–230. Bibcode : 2012natur.489..220L . doi : 10.1038/nature11550 . PMC 3577372 . PMID 22972295 .

[22] Цинь, Джуни; Ли, Руицан; Рейс, Джерун; Арумугам, Маниможиан; Бургдорф, Кристоффер Солвстен; Маничан, Чайсванх; Нильсен, Трин; Понс, Николас; Левенес, Флоренция; Ямада, Такуджи; Менде, Даниэль Р.; Ли, Джунхуа; Сюй, Junming; Ли, Шаочуань; Ли, Донгфанг; Цао, Цзяньджун; Ван, Бо; Liang, Huiqing; Чжэн, Хуисонг; Се, Иньлонг; TAP, Жюльен; Лепейдж, Патриция; Берталан, Марсело; Батто, Жан-Мишель; Хансен, Торбен; Le Paslier, Denis; Линнеберг, Аллан; Нильсен, Х. Бьёрн; Пеллетье, Эрик; Renault, Pierre (2010). «Каталог микробных генов человека, созданный метагеномным секвенированием» . Природа . 464 (7285): 59–65. Bibcode : 2010natur.464 ... 59. Полем doi : 10.1038/nature08821 . PMC 3779803 . PMID 20203603 .

[Shanahan-23] Шанахан, Фергус (2002). «Интерфейс хоста -миклеба в кишечнике». Лучшая практика и исследования клиническая гастроэнтерология . 16 (6): 915–931. doi : 10.1053/bega.2002.0342 . PMID 12473298 .

[Tap-24] TAP, Жюльен; Мир, Станислас; Левенес, Флоренция; Пеллетье, Эрик; Карон, Кристоф; Фрет, Жан-Пьер; Угарте, Эдгардо; Муньос-Тамайо, Рафаэль; Paslier, Denis Le; Налин, Рено; Дор, Джоэл; Leclerc, Marion (2009). «На пути к филогногенскому ядру кишечника человека» . Экологическая микробиология . 11 (10): 2574–2584. Bibcode : 2009envi..11.2574t . Doi : 10.1111/j.1462-2920.2009.01982.x . PMID 19601958 .

[OHara06-25] Jump up to: ^а ^{беременный} О'Хара, Энн М; Шанахан, Фергус (2006). «Килочная флора как забытый орган» . Embo сообщает . 7 (7): 688–693. doi : 10.1038/sj.embor.7400731 . PMC 1500832 . PMID 16819463 .

[pmid24388028-26] Ханна, Сахил; Тош, Притиш К (2014). «Ученик врача о роли микробиома в здоровье человека и болезнях». Майо -клиника . 89 (1): 107–114. doi : 10.1016/j.mayocp.2013.10.011 . PMID 24388028 .

[mycobiome-27] Jump up to: ^а ^{беременный} Cui, Lijia; Моррис, Элисон; Ghedin, Elodie (2013). «Человеческий микобиом в здоровье и болезнях» . Медицина генома . 5 (7): 63. doi : 10.1186/gm467 . PMC 3978422 . PMID 23899327 .

[SIFO-28] Эрдоган, Аскин; Рао, Сатиш С. С. (2015). «Небольшой кишечник грибковой избыточный рост». Текущие гастроэнтерологические отчеты . 17 (4): 16. doi : 10.1007/s11894-015-0436-2 . PMID 25786900 . S2CID 3098136 .

[29] Hallen-Adams, Heather E.; Suhr, Mallory J. (2016-10-13). «Грибы в здоровом желудочно -кишечном тракте человека» . Вирулентность . 8 (3): 352–358. doi : 10.1080/21505594.2016.1247140 . ISSN 2150-5594 . PMC 5411236 . PMID 27736307 .

[Quadram-30] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Какие грибы живут в кишечнике? Познакомьтесь с кишечным микобиомом» . Quadram Institute . Получено 2024-07-25 .

[31] Кляйн, Алиса (20 октября 2019 г.). «Мужское тело заваривает собственное пиво после того, как дрожжи захватывают свой кишечный микробиом» . Новый ученый . Получено 2024-07-25 .

[32] Художник, Келли; Корделл, Барбара Дж.; Sticco, Kristin L. (2024), «Синдром автоматической брата» , Statpearls , Остров Сокровища (FL): Patpearls Publishing, PMID 30020718 , получен 2024-07-25

[33] Браун, Хиллари П.; Шао, Ян; Лоули, Тревор Д. (октябрь 2022 г.). «Мать -инфант передача микробиоты человека» . Текущее мнение о микробиологии . 69 doi : 10.1016/j.mib.2022.102173 . PMID 35785616 - Via ScienceDirect.

[34] Белло, Мария Г. Домингес; Рыцарь Роб; Гилберт, Джек А.; Blaser, Martin J. (4 октября 2018 г.). «Сохранение микробного разнообразия». Наука . 362 (6410): 33–34. Bibcode : 2018sci ... 362 ... 33b . doi : 10.1126/science.aau8816 . PMID 30287652 . S2CID 52919917 .

[Nature-35] Jump up to: ^а ^{беременный} Амугам, Манимосиан; Рейс, Джерун; Пеллет, Эрик; Пастух, Денис; Ямада, Такуджи; Менде, Даниэль Р.; Фернандес, Габриэль Р.; TAP, Жюльен; Кисть, Томас; Батто, Жан-Мишель; Берталан, Марсело; Заимствованная, Наталья; Замки, Франческ; Фернанд, Лейден; Осторожность, Лоран; Хансен, Торбен; Хаттур, Масахира; Хаяси, Тецуя; Я был зол, Михиэль; Крокава, Кен; Леклер, Марион; Уровень, Флоренция; Манишан, Хадзан; Нильсен, Х. Бьёрн; Нильсен, Трин; Наказание, Николас; Пулен, Джули; Цинь, Джуни; Томас, Томас; Тимс, Себастьян (2011). «Энтерпотипы человеческого микробиома » Природа . 473 (7346): 174–180. Bibcode : 2011nature.473. Полем doi : 10.1038/ nature0 PMC 3728647 . PMID 21508958 .

[Wu_et_al-36] Wu, GD; Чен, Дж.; Хоффманн, С.; Bittinger, K.; Chen, Y.-Y.; Keilbaugh, SA; Bewtra, M.; Рыцари, Д.; Уолтерс, Вашингтон; Рыцарь, Р.; Синха, Р.; Гилрой, Е.; Гупта, К.; Baldassano, R.; Nessel, L.; Li, H.; Бушмен, FD; Льюис, JD (2011). «Связывание долгосрочных пищевых моделей с кишечными микробными энтеротипами» . Наука . 334 (6052): 105–108. Bibcode : 2011sci ... 334..105W . doi : 10.1126/science.1208344 . PMC 3368382 . PMID 21885731 .

[37] Циммер, Карл (20 апреля 2011 г.). «Бактерии делят людей на 3 типа, говорят ученые» . New York Times . Получено 21 апреля 2011 года . Группа ученых теперь сообщают только о трех различных экосистемах в мужестве людей, которых они изучали.

[2014cellhostandmicrobentero-38] Рыцари, Дэн; Уорд, Тоня; МакКинлей, Кристофер; Миллер, Ханна; Гонсалес, Антонио; Макдональд, Даниэль; Рыцарь, Роб (8 октября 2014 г.). «Переосмысление» энтеротипов » . Ячейка и микроб . 16 (4): 433–437. doi : 10.1016/j.chom.2014.09.013 . PMC 5558460 . PMID 25299329 .

[Nardone-39] Jump up to: ^а ^{беременный} Нардоне, G; Сравнение, D (июнь 2015 г.). «Человеческая желудочная микробиота: пора ли переосмыслить патогенез заболеваний желудка?» Полем Объединенная европейская гастроэнтерологическая журнал . 3 (3): 255–60. doi : 10.1177/2050640614566846 . PMC 4480535 . PMID 26137299 .

[Yao-40] Яо, х; Смолка, AJ (июнь 2019 г.). «Физиология теменных клеток желудка и геликобактер-индуцированная пилориальная болезнь» . Гастроэнтерология . 156 (8): 2158–2173. doi : 10.1053/j.gastro.2019.02.036 . PMC 6715393 . PMID 30831083 .

[TxtbookBacteriology-41] Тодар, Кеннет (2012). «Нормальная бактериальная флора людей» . Онлайн -учебник Todar по бактериологии . Получено 25 июня 2016 года .

[quigley2006-42] Квигли, Имонн М.М.; Кера, Родриго (2006). «Небольшой кишечник бактериального заростка: роли антибиотиков, пребиотиков и пробиотиков» . Гастроэнтерология . 130 (2): S78–90. doi : 10.1053/j.gastro.2005.11.046 . PMID 16473077 . S2CID 16904501 .

[43] Адамс, мистер; Мосс, Мо (2007). Пищевая микробиология . doi : 10.1039/9781847557940 . ISBN 978-0-85404-284-5 Полем S2CID 241261974 .

[University_of_Glasgow-44] Jump up to: ^а ^{беременный} «Нормальная кишечная флора» (PDF) (слайд -шоу). 2004. Архивировано из оригинала (PDF) 2004-05-26 . Получено 2023-01-02 -через Университет Глазго.

[pmid26963713-45] Braune A, Blaut M (2016). «Бактериальные виды, участвующие в преобразовании пищевых флавоноидов в кишечнике человека» . Кишечные микробы . 7 (3): 216–234. doi : 10.1080/19490976.2016.1158395 . PMC 4939924 . PMID 26963713 .

[Steinhoff-46] Jump up to: ^а ^{беременный} Steinhoff, U (2005). «Кто контролирует толпу? Новые выводы и старые вопросы о кишечной микрофлоре». Иммунологические письма . 99 (1): 12–16. doi : 10.1016/j.imlet.2004.12.013 . PMID 15894105 .

[gibson-47] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Гибсон, Гленн Р. (2004). «Клетчатка и влияние на пробиотики (пребиотическая концепция)». Клинические добавки питания . 1 (2): 25–31. doi : 10.1016/j.clnu.2004.09.005 .

[48] Микель, S; Мартин, R; Росси, О; Бермудес-Хумаран, LG; Chathel, JM; Сокол, ч; Томас, м; Уэллс, JM; Langella, P (2013). «Faecalibacterium prausnitzii и здоровье кишечника человека». Текущее мнение о микробиологии . 16 (3): 255–261. doi : 10.1016/j.mib.2013.06.003 . PMID 23831042 .

[49] Лей, Рут Е. (2010). «Ожирение и человеческий микробиом». Текущее мнение в гастроэнтерологии . 26 (1): 5–11. doi : 10.1097/mog.0b013e328333d751 . PMID 19901833 . S2CID 23329156 .

[Nash_et_al_2017-50] Нэш, Андреа К; Аухтунг, Томас А; Вонг, Мэтью С; Смит, Даниэль П; Геселл, Джонатан Р; Росс, Мэтью С; Стюарт, Кристофер Дж; Меткалф, имбирь А; Музни, Донна М; Гиббс, Ричард А; Аджами, Надим Дж; Петросино, Джозеф Ф. (2017). «Микобиоом интуиции человеческого проекта микробиома здоровой когорты» . Микробиом . 5 (1): 153. DOI : 10.1186/S40168-017-0373-4 . PMC 5702186 . PMID 29178920 .

[ScarpelliniIaniro2015-51] Скарпеллини, Эмидио; Iianiro, gianluca; Аттили, Фабия; Басанелли, Чиара; Де Сантис, Адриано; Gasbarrini, Antonio (2015). «Микробиота кишечника человека и виртуопа: потенциальные терапевтические последствия» . Пищеварительный и болезнь печени . 47 (12): 1007–1012. Doi : 10.1016/j.dld.2015.07.008 . PMC 7185617 . PMID 26257129 .

[Gerritsen_et_al_2012-52] Джерритсен, Яколин; Smidt, Hauke; Rijkers, Ger; Де Вос, Виллем (27 мая 2011 г.). «Микробиота кишечника в здоровье и заболеваниях человека: влияние пробиотиков» . Гены и питание . 6 (3): 209–240. doi : 10.1007/s12263-011-0229-7 . PMC 3145058 . PMID 21617937 .

[Tanya_Yatsunenko_2012-53] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Yatsunenko, T.; Рей, Fe; Манари, MJ; Трехан, я.; Домингес-Белло, мг; Contreras, M.; Magris, M.; Hidalgo, G.; Baldassano, RN; Anokhin, Ap; Хит, AC; Warner, B.; Ридер, Дж.; Kuczynski, J.; Капорасо, JG; Lozupone, CA; Lauber, C.; Клементе, JC; Рыцари, Д.; Рыцарь, Р.; Гордон, Джи (2012). «Человеческий кишечный микробиом рассматривается по возрасту и географии» . Природа . 486 (7402): 222–227. Bibcode : 2012natur.486..222y . doi : 10.1038/nature11053 . PMC 3376388 . PMID 22699611 .

[Carlotta_De_Filippo_2010-54] Де Филиппо, c; Cavalieri, D; Di Paola, M; Рамаццотти, м; Поллет, Дж. Б; Массарт, с; Коллини, S; Pieraccini, G; Лионетти П. (2010). «Влияние диеты на формирование кишечной микробиоты, выявленное сравнительным исследованием детей из Европы и сельской Африки» . Труды Национальной академии наук . 107 (33): 14691–14696. BIBCODE : 2010PNAS..10714691D . doi : 10.1073/pnas.1005963107 . PMC 2930426 . PMID 20679230 .

[Jonkers-55] Jonkers, Daisy Mae (2016). «Микробные возмущения и модуляция в условиях, связанных с недоеданием и мультино -сорта». Лучшая практика и исследования клиническая гастроэнтерология . 30 (2): 161–172. doi : 10.1016/j.bpg.2016.02.006 . PMID 27086883 .

[Million-56] Миллион, Маттиу; Диало, Алдиума; Раульт, Дидье (май 2017 г.). «Кишечная микробиота и недоедание» (PDF) . Микробный патогенез . 106 : 127–138. doi : 10.1016/j.micpath.2016.02.003 . PMID 26853753 . S2CID 20381329 .

[Rytter-57] Райдер, Марен Йоханн Хейльсков; Колте, Лилиан; Брайенд, Андре; Фрийс, Хенрик; Кристенсен, Vibeke Brix (2014). «Иммунная система у детей с недоеданием - систематический обзор» . Plos один . 9 (8): E105017. BIBCODE : 2014PLOSO ... 9J5017R . Doi : 10.1371/journal.pone.0105017 . PMC 4143239 . PMID 25153531 .

[Alcocketal2014-58] Jump up to: ^а ^{беременный} Алкок, Джо; Мале, Карло С; Aktipis, C. Athena (2014). «Манипулируется ли поведение питания желудочно -кишечной микробиотой? Эволюционные давления и потенциальные механизмы» . Биологии . 36 (10): 940–949. doi : 10.1002/bies.201400071 . PMC 4270213 . PMID 25103109 .

[Renson-59] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Ренсон, Одри; Стадо, Памела; Доуд, Дженнифер Б. (2020). «Большие люди и больные (микробные) популяции: проблемы в эпидемиологии и микробиомом» . Ежегодный обзор общественного здравоохранения . 41 : 63–80. doi : 10.1146/annurev-publhealth-040119-0944423 . PMC 9713946 . PMID 31635533 .

[60] Туррони, Франческа; Пеано, Клелия; Пасс, Даниэль А; Фони, Елена; Severgnini, Marco; Классон, Маркус Дж; Керр, Колм; Hourhane, Джонатан; Мюррей, Дейрдре; Фулиньи, Фабио; Геймонд, Мигель; Марголл, Абелардо; Де Беллис, Джанлука; О'Тул, Пол В; Ван Синдерен, Дуве; Марчеси, Джулиан Р; Вентура, Марко (2012). «Разнообразие бифидобактерий в микробиоте кишечника младенца» . Plos один . 7 (5): E36957. Bibcode : 2012 I ... 736957t . Doi : 10.1371/journal.pone.0036957 . PMC 3350489 . PMID 22606315 .

[61] Давенпорт, Эмили Р.; Сандерс, Джон Дж.; Песня, Se Jin; Амато, Кэтрин Р.; Кларк, Эндрю Дж.; Найт, Роб (2017-12-27). «Человеческий микробиом в эволюции» . BMC Biology . 15 (1): 127. DOI : 10.1186/S12915-017-0454-7 . ISSN 1741-7007 . PMC 5744394 . PMID 29282061 .

[62] Перес-Муньос, Мария Элиза; Арриета, Мари-Клэр; Рамер-Тайт, Аманда Е; Уолтер, Йенс (2017). «Критическая оценка гипотез« стерильной матки »и« в колонизации утроивания »: последствия для исследования пионерского младенческого микробиома» . Микробиом . 5 (1): 48. doi : 10.1186/s40168-017-0268-4 . PMC 5410102 . PMID 28454555 .

[Matamoros2013-63] Матаморос, Себастьен; Грас-Леги, Кристоль; Le Vacon, Fransoise; Потэл, Жиль; De la Cochetere, Marie-France (2013). «Разработка кишечной микробиоты у детей и ее влияние на здоровье». Тенденции в микробиологии . 21 (4): 167–173. Doi : 10.1016/j.tim.2012.12,001 . PMID 23332725 .

[Mueller_109–117-64] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин Мюллер, Ноэль Т.; Бакач, Элизабет; Combellick, Joan; Григоян, Зоя; Домингес-Белло, Мария Г. (2015). «Развитие микробиома младенца: мама имеет значение» . Тенденции в молекулярной медицине . 21 (2): 109–117. doi : 10.1016/j.molmed.2014.12.002 . PMC 4464665 . PMID 25578246 .

[65] Джименес, Эстер; Фернандес, Леонидс; Марин, Мэри Л; Мартин, Роцио; Одриозола, Джон М; Nuen-Palop, Carmen; Нарбад, Арджан; Оливарес, Муника; Ксаус, Джорди; Родригес, Джон М. (2005). «Изомация грома обезжиренной бактерии лечебных новорожденных в секции кесарева» » Текущая микробелогия 51 (4): 270–2 Doi : 10.1007/ s00284-005-0020-3 Pmit 16187156 . S2CID 43438656

[66] Колладо, Мария Кармен; Раутава, Самули; Аакко, Джухани; Изолаури, Эрика; Salminen, Seppo (2016). «Колонизация кишечника человека может быть начата в утробке различными микробными сообществами в плахенте и амниотической жидкости» . Научные отчеты . 6 : 23129. Bibcode : 2016natsr ... 623129c . Doi : 10.1038/srep23129 . PMC 4802384 . PMID 27001291 .

[67] Джименес, Эстер; Марин, Мэри Л.; Мартин, Роцио; Odriozola, John M.; Оливарес, Муника; Ксаус, Джорди; Фернандес, Леонидс; Родригес, Джон М. (2008). "Является ли мекониний от здорового новорожденного обновленным ската?" Полем РЕСУАРК В МИКРОЛУГИ 159 (3): 187–1 doi : 10.1016/ j.smic.2007,12,0 Pmit 182811199 .

[68] Перес-Муньос, Мария Элиза; Арриета, Мари-Клэр; Рамер-Тайт, Аманда Е; Уолтер, Йенс (2017). «Критическая оценка гипотез« стерильного чрева »и« в колонизации утроивания »: последствия для исследования пионерского младенческого микробиома» . Микробиом . 5 (1): 48. doi : 10.1186/s40168-017-0268-4 . PMC 5410102 . PMID 28454555 .

[69] Адлерберт, я; WOLD, AE (2009). «Создание кишечной микробиоты у западных детей». Acta Paediatrica . 98 (2): 229–238. doi : 10.1111/j.1651-2227.2008.01060.x . PMID 19143664 . S2CID 205859933 .

[VaginalBirthMicrobiota-70] «Кисточные бактерии детей, затронутые методом доставки: вагинальная доставка способствует кишечным бактериям матери в кишечнике детей» . Scienceday . 18 сентября 2019 года. Архивировано с оригинала 24 ноября 2021 года . Получено 31 мая 2022 года .

[71] Кубок, JN; Zampini, L.; Galeazzi, T.; Габриэлли, О. (2006). «Пребиотики в человеческом молоке: обзор». Пищеварительный и болезнь печени . 38 : S291–294. Doi : 10.1016/s1590-8658 (07) 60013-9 . PMID 17259094 .

[72] Мэди, Эман А.; Doghish, Ahmed S.; El-Dakroury, Walaa A.; Elkhawaga, Samy Y.; Исмаил, Ахмед; El-Mahdy, Hesham A.; Эльсакка, Elsayed GE; Эль-Хуссейни, Хусейн М. (2023-07-01). «Влияние микробиоты кишечника матери на микробиомом младенца и развитие мозга». Нейробиологии и биобеводовые обзоры . 150 : 105195. DOI : 10.1016/j.neubiorev.2023.105195 . ISSN 0149-7634 . PMID 37100161 . S2CID 258302702 .

[73] Fanaro, S; Священнослужители, R; Guerrini, P; Vigi, V (2007). «Микрофлора кишечника в раннем младенчестве: композиция и развитие». Ландшафт Акта . 92 (441): 48–55. Doi : 10.1111/j.1651-2227.2003.tb00646.x . PMID 14599042 . S2CID 10316311 .

[74] Yassour, Моран; Ватанен, Томми; Сильжандер, Хели; Hämäläinen, Anu-Maaria; Härkönen, Taina; Ryhänen, Samppa J; Франзоса, Эрик А; Вламакис, сыворотка; Хаттенхауэр, Кертис; Герс, Дирк; Ландер, Эрик С; Knip, Майкл; Ксавье, Рамник Дж. (2016). «Естественная история детского кишечного микробиома и влияние лечения антибиотиками на разнообразие и стабильность бактериальных штаммов» . Научная трансляционная медицина . 8 (343): 343Ra81. Doi : 10.1126/scitranslmed.aad0917 . PMC 5032909 . PMID 27306663 .

[75] Гибсон, Гр; Roberfroid, MB (1995). «Диетическая модуляция микробиоты толстой кишки человека: введение концепции пребиотиков» . Журнал питания . 125 (6): 1401–1412. doi : 10.1093/jn/125.6.1401 . PMID 7782892 .

[2014Wangrev-76] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Ван, Ян; Kasper, Lloyd H (2014). «Роль микробиома в расстройствах центральной нервной системы» . Мозг, поведение и иммунитет . 38 : 1–12. doi : 10.1016/j.bbi.2013.12.015 . PMC 4062078 . PMID 24370461 .

[Yoon2014rev-77] Jump up to: ^а ^{беременный} Юн, мой молодой; Ли, Кихун; Юн, Sang Sun (2014). «Защитная роль кишечных комменсальных микробов против кишечных инфекций». Журнал микробиологии . 52 (12): 983–989. doi : 10.1007/s12275-014-4655-2 . PMID 25467115 . S2CID 54622675 .

[78] Reinoso Webb, Синтия; Koboziev, iurii; Фурр, Кэтрин Л; Гришам, Мэтью Б. (2016). «Защитная и провоспалительная роль кишечных бактерий» . Патофизиология . 23 (2): 67–80. doi : 10.1016/j.pathophys.2016.02.002 . PMC 4867289 . PMID 26947707 .

[79] Мантис, Нью -Джерси; Rol, n; Corthésy, B (2011). «Секреторные сложные роли IGA в гомеостазе иммунитета и слизистой оболочки в кишечнике» . Слизистая иммунология . 4 (6): 603–611. doi : 10.1038/mi.2011.41 . PMC 3774538 . PMID 21975936 .

[Peterson-80] Jump up to: ^а ^{беременный} Петерсон, Ланс W; Артис, Дэвид (2014). «Эпителиальные клетки кишечника: регуляторы барьерной функции и иммунного гомеостаза». Природа обзоры иммунологии . 14 (3): 141–153. doi : 10.1038/nri3608 . PMID 24566914 . S2CID 3351351 .

[Honda-81] Jump up to: ^а ^{беременный} Хонда, Кения; Littman, Dan R (2016). «Микробиота в адаптивном иммунном гомеостазе и болезнях». Природа . 535 (7610): 75–84. Bibcode : 2016natur.535 ... 75H . doi : 10.1038/nature18848 . PMID 27383982 . S2CID 4461492 .

[Levy-82] Jump up to: ^а ^{беременный} Леви, м.; Тайсс, Калифорния; Elinav, E. (2016). «Метаболиты: посланники между микробиотой и иммунной системой» . Гены и развитие . 30 (14): 1589–1597. doi : 10.1101/gad.284091.116 . PMC 4973288 . PMID 27474437 .

[Microbial_biosynthesis_of_bioactive_compounds-83] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я Чжан Л.С., Дэвис С.С. (апрель 2016 г.). «Микробный метаболизм диетических компонентов в биологически активные метаболиты: возможности для новых терапевтических вмешательств» . Геном Мед . 8 (1): 46. doi : 10.1186/s13073-016-0296-x . PMC 4840492 . PMID 27102537 . Lactobacillus spp. Преобразовать триптофан в индол-3-альдегид (i3a) через неопознанные ферменты [125]. Clostridium sporogenes преобразует триптофан в IPA [6], вероятно, через триптофан -деаминазу. ... IPA также мощно собирает гидроксильные радикалы
Таблица 2: Микробные метаболиты: их синтез, механизмы действия и влияние на здоровье и заболевание
Рисунок 1: Молекулярные механизмы действия индол и ее метаболитов на физиологию и заболевания хозяина

[Microbiome_IPA-84] Wikoff WR, Anfora AT, Liu J, Schultz PG, Lesley SA, Peters EC, Siuzdak G (март 2009 г.). «Анализ метаболомики выявляет большое влияние кишечной микрофлоры на метаболиты крови млекопитающих» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 106 (10): 3698–3703. Bibcode : 2009pnas..106.3698w . doi : 10.1073/pnas.0812874106 . PMC 2656143 . PMID 19234110 . Было показано, что продукция IPA полностью зависит от присутствия кишечной микрофлоры и может быть установлена колонизацией с бактериями Clostridium sporogenes .
Диаграмма метаболизма IPA

[Human_metabolome_IPA-85] «3-индолепропионовая кислота» . База данных метаболом человека . Университет Альберты . Получено 12 июня 2018 года .

[Indolepropionic_acid_scavenging-86] Chyan YJ, Poeggeler B, Omar RA, Chain DG, Frangione B, Ghiso J, Pappolla MA (июль 1999 г.). «Мощные нейропротекторные свойства против бета-амилоида Альцгеймера эндогенной мелатонином, связанной с индольной структурой, индол-3-пропионовой кислотой» . Дж. Биол. Химический 274 (31): 21937–21942. doi : 10.1074/jbc.274.31.21937 . PMID 10419516 . S2CID 6630247 . [Индоле-3-пропионовая кислота (IPA)] ранее была идентифицирована в плазме и спинномозговой жидкости людей, но ее функции неизвестны. ... В экспериментах по кинетической конкуренции с использованием средств свободных радикалов захватывающих агентов способность IPA к совокупности гидроксильных радикалов превысила мощность мелатонина, индолий, считается наиболее мощным природным мусорным палатом свободных радикалов. В отличие от других антиоксидантов, IPA не была преобразована в реактивные промежуточные соединения с прооксидантной активностью.

[87] Хоппер, Кристофер П.; Де ла Круз, Лади Кимберли; Лайлс, Кристин В.; Wareham, Lauren K.; Гилберт, Джек А.; Эйхенбаум, Зехава; Магьеровски, Марцин; Пул, Роберт К.; Воллборн, Якоб; Ван, Бингхе (2020-12-23). «Роль монооксида углерода в коммуникации микробиома -хозяина - кита». Химические обзоры . 120 (24): 13273–13311. doi : 10.1021/acs.chemrev.0c00586 . ISSN 0009-2665 . PMID 33089988 . S2CID 224824871 .

[88] Раджилич-Стоянович, Мирджана; De Vos, Willem M (2014). «Первые 1000 культивируемых видов желудочно -кишечной микробиоты человека» . Обзоры микробиологии FEMS . 38 (5): 996–1047. doi : 10.1111/1574-6976.12075 . PMC 4262072 . PMID 24861948 .

[89] Хилл, MJ (март 1997 г.). «Кишечная флора и эндогенный синтез витамина» . Европейский журнал по предотвращению рака . 6 (Suppl 1): S43–45. doi : 10.1097/00008469-199703001-00009 . ISSN 0959-8278 . PMID 9167138 . S2CID 8740364 .

[90] «Микробиом» . Тайфты сейчас . 2013-09-17 . Получено 2020-12-09 .

[91] Мораис, Сара; Винклер, Сара; Зорея, Альва; Левин, Лирон; Nagies, Falk Sp; Капуст, Нильс; Ламед, Ева; Артан-Фурман, авитал; Болам, Дэвид Н.; Ядав, Мадхав П.; Байер, Эдвард А.; Мартин, Уильям Ф.; Мизрахи, Ицхак (2024-03-15). «Загадочное разнообразие деградирующих целлюлозы бактерий кишечника у промышленно развитых людей» . Наука . 383 (6688): EADJ9223. Bibcode : 2024sci ... 383J9223M . doi : 10.1126/science.adj9223 . ISSN 0036-8075 . PMC 7615765 . PMID 38484069 .

[Pharmacomicrobiomics-92] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Elrakaiby M, Dutilh BE, Rizkallah MR, Boleij A, Cole JN, Aziz RK (июль 2014 г.). «Pharmacomicrobiomics: влияние изменений микробиомов человека на системную фармакологию и персонализированную терапию» . OMICS . 18 (7): 402–414. doi : 10.1089/omi.2014.0018 . PMC 4086029 . PMID 24785449 .

[Human_microbiome-93] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в CHO I, Blaser MJ (март 2012 г.). «Человеческий микробиом: на границе со здоровьем и заболеванием» . Природные обзоры. Генетика . 13 (4): 260–270. doi : 10.1038/nrg3182 . PMC 3418802 . PMID 22411464 . Состав микробиома варьируется в зависимости от анатомического сайта (рис. 1). Основным детерминантом состава сообщества является анатомическое местоположение: межличностные вариации являются существенными ^23,24 и выше, чем временная изменчивость, наблюдаемая на большинстве участков у одного человека ²⁵.

[Gut_feeling-95] Хаттер Т., Гимберт С., Бушар Ф., Лапоинте Ф.Дж. (2015). «Быть человеком - это чувство интуиции» . Микробиом . 3 : 9. doi : 10.1186/s40168-015-0076-7 . PMC 4359430 . PMID 25774294 .

[Microbial_amphetamine_metabolism_-_E._coli-96] Кумар К., Дхок Г.В., Шарма А.К., Джайсвал С.К., Шарма В.К. (январь 2019 г.). «Механистическое выяснение метаболизма амфетамина с помощью тираминоксидазы из микробиоты кишечника человека с использованием моделирования молекулярной динамики». Журнал сотовой биохимии . 120 (7): 11206–11215. doi : 10.1002/jcb.28396 . PMID 30701587 . S2CID 73413138 .

[97] Соуза, Тиаго; Патерсон, Ронни; Мур, Ванесса; Карлссон, Андерс; Авраамссон, Бертиль; Basit, Abdul W (2008). «Желудочно -кишечная микробиота как место для биотрансформации лекарств». Международный журнал фармацевтики . 363 (1–2): 1–25. doi : 10.1016/j.ijpharm.2008.07.009 . PMID 18682282 .

[98] Haiser, H. J; Гутенберг, Д. Б; Чатман, K; Сирасани, g; Balskus, E. P; Тернбо, П. Дж. (2013). «Прогнозирование и манипулирование инактивацией сердечного препарата от кишечной бактерии человека Eggerthella Lenta» . Наука . 341 (6143): 295–298. Bibcode : 2013sci ... 341..295H . doi : 10.1126/science.1235872 . PMC 3736355 . PMID 23869020 .

[:8-99] Jump up to: ^а ^{беременный} Коппел, Ницан; Майни Рекдал, Вайю; Балкус, Эмили П. (2017-06-23). «Химическая трансформация ксенобиотиков человеческой кишечной микробиотой» . Наука . 356 (6344). doi : 10.1126/science.aag2770 . ISSN 0036-8075 . PMC 5534341 . PMID 28642381 .

[Spanogiannopoulos_273–287-100] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Spanogiannopoulos, Peter; Бесс, Элизабет Н.; Carmody, Rachel N.; Тернбо, Питер Дж. (2016-03-14). «Микробные фармацевты внутри нас: метагеномный вид ксенобиотического метаболизма» . Nature Reviews Microbiology . 14 (5): 273–287. doi : 10.1038/nrmicro.2016.17 . ISSN 1740-1526 . PMC 5243131 . PMID 26972811 .

[Maini_Rekdal-101] Jump up to: ^а ^{беременный} Майни Рекдал, Вайю; Бесс, Элизабет Н.; Бизанц, Джордан Э.; Тернбо, Питер Дж.; Балкус, Эмили П. (2019-06-14). «Открытие и ингибирование межвидового кишечного бактериального пути метаболизма леводопы» . Наука . 364 (6445). doi : 10.1126/science.aau6323 . ISSN 0036-8075 . PMC 7745125 . PMID 31196984 .

[Dempsey_481–490-102] Jump up to: ^а ^{беременный} Демпси, Джозеф Л.; Cui, Julia Yue (2019-10-19). «Микробиом является функциональным модификатором метаболизма лекарственного средства P450» . Текущие отчеты о фармакологии . 5 (6): 481–490. doi : 10.1007/s40495-019-00200-w . ISSN 2198-641X . PMC 7731899 . PMID 33312848 .

[103] Бурнер, Удо; Эббот, Сет; Роу, Роберт Л. (январь 1975 г.). «Метаболизм морфина и героина у человека». Обзоры метаболизма наркотиков . 4 (1): 39–73. doi : 10.3109/03602537508993748 . ISSN 0360-2532 . PMID 1204496 .

[Dobkin_325–327-104] Добкин, Джей Ф.; Saha, Jnan R.; Батлер, Винсент П.; Neu, Harold C.; Линденбаум, Джон (1983-04-15). «Дигоксин-инактивирующие бактерии: идентификация во флоре кишечника человека». Наука . 220 (4594): 325–327. doi : 10.1126/science.6836275 . ISSN 0036-8075 . PMID 6836275 .

[105] Sahota, SS; Брэмли, премьер -министр; Menzies, IS (1982-02-01). «Ферментация лактулозы бактериями толстой кишки» . Микробиология . 128 (2): 319–325. doi : 10.1099/00221287-128-2-319 . ISSN 1350-0872 . PMID 6804597 .

[Yoo_1508–1513-106] Jump up to: ^а ^{беременный} Yoo, Dae-Hyoung; Ким, в Суке; Ван Ле, ТИ Ким; Юнг, Иль-Хун; Ю, Хе Хён; Ким, Донг-Хён (2014-06-19). «Медоседованные микробиоты взаимодействия между ловастатином и антибиотиками». Метаболизм и расположение наркотиков . 42 (9): 1508–1513. doi : 10.1124/dmd.114.058354 . ISSN 0090-9556 . PMID 24947972 . S2CID 7524335 .

[107] Хайзер, Генри Дж.; Гутенберг, Дэвид Б.; Чатман, Келли; Сирасани, Гопал; Балкус, Эмили П.; Тернбо, Питер Дж. (2013-07-19). «Прогнозирование и манипулирование инактивацией сердечного препарата от кишечной бактерии человека Eggerthella Lenta » . Наука . 341 (6143): 295–298. Bibcode : 2013sci ... 341..295H . doi : 10.1126/science.1235872 . ISSN 0036-8075 . PMC 3736355 . PMID 23869020 .

[108] Parvez, MD Masud; Базит, Абдул; Jariwala, Parth B.; Габорик, Зсузсанна; Kis, Emese; Хейворд, Скотт; Рединбо, Мэтью Р.; Прасад, Бхагват (2021-06-01). «Количественное исследование метаболизма, транспорта и микробиома иринотекана» . Метаболизм и расположение наркотиков . 49 (8): 683–693. doi : 10.1124/dmd.121.000476 . ISSN 0090-9556 . PMC 8407663 . PMID 34074730 .

[:9-109] Jump up to: ^а ^{беременный} Соуза, Тиаго; Патерсон, Ронни; Мур, Ванесса; Карлссон, Андерс; Авраамссон, Бертиль; Базит, Абдул В. (ноябрь 2008 г.). «Желудочно -кишечная микробиота как место для биотрансформации лекарств». Международный журнал фармацевтики . 363 (1–2): 1–25. doi : 10.1016/j.ijpharm.2008.07.009 . ISSN 0378-5173 . PMID 18682282 .

[:0-110] Jump up to: ^а ^{беременный} Коппел, Ницан; Бизанц, Джордан Э; Панделия, Мария-Эйрини; Тернбо, Питер Дж; Балкус, Эмили П. (2018-05-15). Лей, Рут Эмили (ред.). «Открытие и характеристика распространенного бактериального фермента человека человека, достаточного для инактивации семейства токсинов растений» . элиф . 7 : E33953. doi : 10.7554/elife.33953 . ISSN 2050-084X . PMC 5953540 . PMID 29761785 .

[111] Александр, Джеймс Л.; Уилсон, Ян Д.; Три, Джулиан; Marchesi, Julian R.; Николсон, Джереми К.; Кинросс, Джеймс М. (2017-03-08). «Модуляция кишечной микробиоты эффективности и токсичности химиотерапии» . Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology . 14 (6): 356–365. doi : 10.1038/nrgastro.2017.20 . HDL : 10044/1/77636 . ISSN 1759-5045 . PMID 28270698 . S2CID 9654170 .

[112] Брэнди, Джованни; Дабард, Джин; Райбо, Пьер; Ди Баттиста, Моника; Бридоно, Шанталь; Писи, Анна Мария; Морселли Лабат, Антонио Мария; Панталео, Мария изобилие; Де Виво, Антонелло; Biasco, Guido (2006-02-15). «Кишечная микрофлора и пищеварительная токсичность иринотекана у мышей». Клиническое исследование рака . 12 (4): 1299–1307. Doi : 10.1158/1078-0432.ccr-05-0750 . ISSN 1078-0432 . PMID 16489087 . S2CID 26655779 .

[113] Ко, Ара; Де Ваддер, Филипе; Kovatcheva-Datchary, Petia; Бакхед, Фредрик (июнь 2016 г.). «От диетического волокна до физиологии размещения: жирные кислоты с короткой цепью в качестве ключевых бактериальных метаболитов» . Клетка . 165 (6): 1332–1345. doi : 10.1016/j.cell.2016.05.041 . ISSN 0092-8674 . PMID 27259147 . S2CID 8562345 .

[114] Konopelski, Piotr; Ufnal, Marcin (2018-09-14). «Индолы - кишечные бактерии метаболиты триптофана с фармакотерапевтическим потенциалом». Текущий метаболизм лекарств . 19 (10): 883–890. doi : 10.2174/1389200219666180427164731 . ISSN 1389-2002 . PMID 29708069 . S2CID 13979774 .

[dx.doi.org-115] Jump up to: ^а ^{беременный} Коллинз, Стефани Л.; Стайн, Джонатан Г.; Бизанц, Джордан Э.; Окафор, С. Дениз; Паттерсон, Эндрю Д. (2022-10-17). «Желченные кислоты и кишечная микробиота: метаболические взаимодействия и влияние на заболевание». Nature Reviews Microbiology . 21 (4): 236–247. doi : 10.1038/s41579-022-00805-x . ISSN 1740-1526 . PMID 36253479 . S2CID 252970168 .

[116] Ян, Вендзин; Ю, Тянминг; Хуан, Сянсхенг; Билотта, Энтони Дж.; Сюй, Лейки; Лу, Яо; Солнце, Цзярен; Пан, вентилятор; Чжоу, Цзя; Чжан, Венбо; Яо, Сусия; Мейнард, Крейг Л.; Сингх, Нагендра; Данн, Сара М.; Лю, Чжанджу (2020-09-08). «Производна кишечниками микробиоты с короткоцепочечными кислотами регуляция продукции иммунных клеток IL-22 и иммунитета кишечника» . Природная связь . 11 (1): 4457. Бибкод : 2020natco..11.4457y . doi : 10.1038/s41467-020-18262-6 . ISSN 2041-1723 . PMC 7478978 . PMID 32901017 .

[117] Муругесан, Сельванкар; Нирмалкар, Хемлал; Хойо-Вадильо, Карлос; García-Espitia, Matilde; Рамирес-Санчес, Даниэла; García-Mena, Jaime (2017-12-02). «Производство микробиомов кишечника короткоцепочечных жирных кислот и ожирения у детей». Европейский журнал клинической микробиологии и инфекционных пустынь . 37 (4): 621–625. Doi : 10,1007/S10096-017-3143-0 . ISSN 0934-9723 . PMID 29196878 . S2CID 254132108 .

[:7-118] Jump up to: ^а ^{беременный} Thanissery, Rajani; Уинстон, Jenessa A.; Териот, Кейси М. (июнь 2017 г.). «Ингибирование прорастания спор, роста и токсина клинически значимых штаммов C. difficile с помощью микробиоты кишечника, полученных вторичными желчными кислотами» . Анаэроб . 45 : 86–100. doi : 10.1016/j.anaerobe.2017.03.004 . ISSN 1075-9964 . PMC 5466893 . PMID 28279860 .

[:6-119] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Джонс, Брайан v.; Бегли, Майр; Хилл, Колин; Гахан, Кормак Г.М.; Marchesi, Julian R. (2008-09-09). «Функциональный и сравнительный метагеномный анализ активности гидролазы желчной соли в кишечном микробиоме человека» . Труды Национальной академии наук . 105 (36): 13580–13585. Bibcode : 2008pnas..10513580J . doi : 10.1073/pnas.0804437105 . ISSN 0027-8424 . PMC 2533232 . PMID 18757757 .

[Cao2017-120] Jump up to: ^а ^{беременный} Cao H, Xu M, Dong W, Deng B, Wang S, Zhang Y, Wang S, Luo S, Wang W, Qi Y, Gao J, Cao X, Yan F, Wang B (июнь 2017 г.). «Вторичный индуцированный желчным кислотой дисбиоз способствует кишечному канцерогенезу» . Международный журнал рака . 140 (11): 2545–2556. doi : 10.1002/ijc.30643 . PMID 28187526 .

[Bernstein2022-121] Jump up to: ^а ^{беременный} Бернштейн Х, Бернштейн С (январь 2023 г.). «Желченные кислоты как канцерогены в толстой кишке и в других участках желудочно -кишечной системы» . Экспериментальная биология и медицина . 248 (1): 79–89. doi : 10.1177/15353702221131858 . PMC 9989147 . PMID 36408538 .

[Mayer2014rev-122] Майер Э. А; Рыцарь, R; Мазман, С. К; Cryan, J. F; Тиллиш, К. (2014). «Микробы кишечника и мозг: сдвиг парадигмы в нейробиологии» . Журнал нейробиологии . 34 (46): 15490–15496. doi : 10.1523/jneurosci.3299-14.2014 . PMC 4228144 . PMID 25392516 .

[DinanandCryan2015-123] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Динан, Тимоти Г; Крайан, Джон Ф. (2015). «Влияние кишечной микробиоты на мозг и поведение». Современное мнение клинического питания и метаболической помощи . 18 (6): 552–558. doi : 10.1097/mco.0000000000000221 . PMID 26372511 . S2CID 21424690 .

[Carman-124] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Карман, Роберт Дж.; Саймон, Мэри Алиса; Фернандес, Гайде; Миллер, Маргарет А.; Варфоломей, Мэри Дж. (2004). «Ципрофлоксацин на низких уровнях нарушает устойчивость к колонизации фекальной микрофлоры человека, растущей в хемостатах». Регуляторная токсикология и фармакология . 40 (3): 319–326. doi : 10.1016/j.yrtph.2004.08.005 . PMID 15546686 .

[125] HVAS, Кристиан Лодберг; Баунвалл, Саймон Марк Даль; Эриксстроп, Кристиан (2020-07-01). «Трансплантация фекальной микробиоты: спасательная терапия, оспариваемая коммерческими претензиями на эксклюзивность» . EclinicalMedicine . 24 : 100436. DOI : 10.1016/j.eclinm.2020.100436 . ISSN 2589-5370 . PMC 7334803 . PMID 32642633 .

[Brandt-126] Брандт, Лоуренс Дж.; Бороди, Томас Юлий; Кэмпбелл, Джордана (2011). «Эндоскопическая трансплантация фекальной микробиоты» . Журнал клинической гастроэнтерологии . 45 (8): 655–657. doi : 10.1097/mcg.0b013e3182257d4f . PMID 21716124 . S2CID 2508836 .

[Knight-127] Рыцарь, DJW; Girling, KJ (2003). «Кишечная флора в здоровье и болезнях» . Lancet . 361 (9371): 512–519. doi : 10.1016/s0140-6736 (03) 13438-1 . PMID 12781578 . S2CID 40683723 .

[cho2012-128] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Чо, я.; Yamanishi, S.; Cox, L.; Мете, ба; Завадил, Дж.; Ли, К.; Гао, Z.; Махана, Д.; Раджу, К.; Тейтлер, я.; Li, H.; Alekseyenko, Av; Blaser, MJ (2012). «Антибиотики в раннем возрасте изменяют мышиный микробиом и ожирение мышиной толстой кишки» . Природа . 488 (7413): 621–626. Bibcode : 2012natur.488..621c . doi : 10.1038/nature11400 . PMC 3553221 . PMID 22914093 .

[JFP2016rev-129] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Schneiderhan, J; Master-Hunter, T; Locke, A (2016). «Нацеливание на кишечную флору для лечения и предотвращения заболеваний». Журнал семейной практики . 65 (1): 34–38. PMID 26845162 .

[130] Бейкер, Монья (2012). «Беременность изменяет живые микробы кишечника» . Природа . doi : 10.1038/nature.2012.11118 . S2CID 87078157 .

[Expert-131] Хилл, Колин; Гуарнер, Франциско; Рейд, Грегор; Гибсон, Гленн Р; Меренштейн, Даниэль Дж; Горшок, Бруно; Морелли, Лоренцо; Канани, Роберто Берни; Флинт, Гарри Дж; Салминен, Сепо; Колдер, Филипп С; Сандерс, Мэри Эллен (2014). «Международная научная ассоциация пробиотиков и пребиотиков консенсус по объему и надлежащее использование термина пробиотики» . Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology . 11 (8): 506–514. doi : 10.1038/nrgastro.2014.66 . HDL : 2164/4189 . PMID 24912386 .

[bridging-132] Rijkers, Ger T; Де Вос, Виллем М; Браммер, Роберт-Ян; Морелли, Лоренцо; Коршьер, Джерард; Марто, Филипп (2011). «Преимущества для здоровья и претензии на здоровье пробиотиков: соединение науки и маркетинга» . Британский журнал питания . 106 (9): 1291–1296. doi : 10.1017/s000711451100287x . PMID 21861940 .

[2015defRev-133] Хаткинс, Роберт В.; Крумбек, Джанина А; Bindels, laure B; Кани, Патрис Д; Фахи, Джордж; Го, Юн Джун; Хамакер, Брюс; Мартенс, Эрик С; Миллс, Дэвид А; Растал, Роберт А; Воган, Элейн; Сандерс, Мэри Эллен (2016). «Пребиотики: почему определения имеют значение» . Текущее мнение о биотехнологии . 37 : 1–7. doi : 10.1016/j.copbio.2015.09.001 . PMC 4744122 . PMID 26431716 .

[134] Пандей, Кавита. R; Найк, Суреш. R; Вакил, Бабу. V (2015). «Пробиотики, пребиотики и синбиотики- обзор» . Журнал пищевой науки и техники . 52 (12): 7577–7587. doi : 10.1007/s13197-015-1921-1 . PMC 4648921 . PMID 26604335 .

[135] Broeckx, Géraldine; Vandenhevel, Dieter; Claes, Ingmar JJ; Лебер, Сара; Кикенс, Филип (2016). «Методы сушки пробиотических бактерий как важный шаг к развитию новых фармабиотиков» (PDF) . Международный журнал фармацевтики . 505 (1–2): 303–318. doi : 10.1016/j.ijpharm.2016.04.002 . HDL : 10067/1328840151162165141 . PMID 27050865 .

[136] Slator, Roy D; Хилл, Колин (2009). «Рациональный дизайн улучшенных фармабиотиков» . Журнал биомедицины и биотехнологии . 2009 : 275287. DOI : 10.1155/2009/275287 . PMC 2742647 . PMID 19753318 .

[137] Паттерсон, Элейн; Крайан, Джон Ф; Фицджеральд, Джеральд Ф; Росс, Р. Пол; Динан, Тимоти Г; Стентон, Кэтрин (2014). «Микробиота кишечника, фармабиотики, которые они производят и принимают здоровье» . Труды общества питания . 73 (4): 477–489. doi : 10.1017/s0029665114001426 . PMID 25196939 .

[138] "Непрерывная терапевтическая терапевтика для IBS: где мы?" Полем 30 января 2024 года.

[autogenerated1-139] Гуандалини, Стефано; Магацца, Джузеппе; Ясно, Андреа; Арбалет, Валерия; Ди Нардо, Джованни; Гопалан, Сарат; Сибал, А.; Романо, Клаудио; Канани, Роберто Берни; Лионетти, Паоло; Setty, Mala (июль 2010 г.). «VSL#3 улучшает ситомы у детей с синдромом раздраженного кишечника: многоцентровое рандомизированное плацебо-контролируемое, двойное слепое, кроссоверное исследование» . Журнал педиатрической гастроэнтерологии и питания . 51 (1): 24–30. Doi : 10.1097/mpg.0b013e3181ca4d95 . PMID 20453678 . S2CID 33659736 .

[140] Crucillà, Salvatore; Caldart, Federico; Мишелон, Марко; Мараско, Джованни; Костентино, Андреа (2024-08-14). «Функциональное вздутие живота и микробиота кишечника: обновление» . Микроорганизмы . 12 (8): 1669. DOI : 10.3390/Microorganisms12081669 . ISSN 2076-2607 . PMC 11357468 . PMID 39203511 .

[FordQuigley2014-141] Форд, Александр С; Квигли, Имонн М.М.; Лейси, Брайан Э; Лембо, Энтони Дж; Сайто, Юрий А; Шиллер, Лоуренс Р; Соффер, Эди Э; Spiegel, Brennan MR; Моайеди, Пол (2014). «Эффективность пребиотиков, пробиотиков и синбиотиков при синдроме раздраженного кишечника и хронических идиопатических запоров: систематический обзор и метаанализ». Американский журнал гастроэнтерологии . 109 (10): 1547–1561, Quiz 1546, 1562. DOI : 10.1038/ajg.2014.202 . PMID 25070051 . S2CID 205100508 .

[Ghouri2014-142] Дюпон, Эндрю; Ричардс; Jelinek, Katherine A; Крилл, Джозеф; Рахими, Эрик; Гури, Езаз (2014). «Систематический обзор рандомизированных контролируемых исследований пробиотиков, пребиотиков и синбиотиков при воспалительных заболеваниях кишечника» . Клиническая и экспериментальная гастроэнтерология . 7 : 473–487. doi : 10.2147/ceg.s27530 . PMC 4266241 . PMID 25525379 .

[143] Ю, Ченг Гонг; Хуан, Цинь (2013). «Недавний прогресс в роли кишечной микробиоты в патогенезе воспалительного заболевания кишечника» . Журнал пищеварительных заболеваний . 14 (10): 513–517. doi : 10.1111/1751-2980.12087 . PMID 23848393 . S2CID 26982085 .

[144] Левитт, Майкл Д.; Дуэйн, Уильям С. (1972-05-04). «Плавающие табуретки - валюс против жира». Новая Англия Журнал медицины . 286 (18): 973–975. doi : 10.1056/nejm197205042861804 . ISSN 0028-4793 . PMID 5015442 .

[145] Аалам, Сайед Мухаммед Мушер; Краста, Дафна Норма; Рой, Пуджа; Миллер, А. Ли; Гамб, Скотт I.; Джонсон, Стивен; До, Лиза М.; Чен, Джун; Кашьяп, Пурна; Канан, Нагараджан (2022-10-27). «Бытие фекального плавания причинно связано с кишечной микробной колонизацией у мышей» . Научные отчеты . 12 (1): 18109. Bibcode : 2022natsr..1218109A . doi : 10.1038/s41598-022-22626-x . ISSN 2045-2322 . PMC 9613883 . PMID 36302811 .

[146] Майер, Лиза; Прутеану, Михала; Кун, Майкл; Зеллер, Георг; Telzerow, Anja; Андерсон, Эксен Эрин; Брохадо, Ана Рита; Фернандес, Кит Конрад; Доза, Hitomi; Мори, Хиротада; Патил, Киран Раосахеб; Борк, сверстник; Тип, Афанасиос (2018). «Обширное влияние неантибиотических препаратов на кишечные бактерии человека» . Природа . 555 (7698): 623–628. Bibcode : 2018natur.555..623m . doi : 10.1038/nature25979 . PMC 6108420 . PMID 29555994 .

[147] Клаусс, Маттиу; Жерард, Филипп; Моска, Алексис; Леклерк, Марион (2021). «Взаимодействие между физическими упражнениями и кишечным микробиом в контексте здоровья человека и производительности» . Границы в питании . 8 : 637010. DOI : 10.3389/fnut.2021.637010 . PMC 8222532 . PMID 34179053 .

[kamboj-148] Jump up to: ^а ^{беременный} Камбодж, Ак; Cotter, Tg; Oxentenko, AS (2017). «Helicobacter pylori: прошлое, настоящее и будущее в управлении» . Майо -клиника . 92 (4): 599–604. doi : 10.1016/j.mayocp.2016.11.017 . ISSN 0025-6196 . PMID 28209367 .

[hopkins-149] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Язвенная болезнь» (PDF) . Медицинский факультет Университета Джона Хопкинса. 2013 . Получено 21 октября 2020 года .

[BurischJess2013-150] Буриш, Йохан; Джесс, Тин; Мартинато, Маттео; Лакатос, Питер Л. (2013). «Бремя воспалительного заболевания кишечника в Европе» . Журнал Крона и колита . 7 (4): 322–337. doi : 10.1016/j.crohns.2013.01.010 . PMID 23395397 .

[151] Blandino, g; Inturri, R; Lazzara, F; Розы, м; Malaguarnera, L (2016). «Влияние кишечной микробиоты на сахарный диабет». Диабет и метаболизм . 42 (5): 303–315. Doi : 10.1016/j.diabet.2016.04.004 . PMID 27179626 .

[2016BoulangeRev-152] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Буланг, Клэр Л; Невес, Ана Луиза; Чилу, Жюльен; Николсон, Джереми К; Дюма, Марк-Эммануэль (2016). «Влияние кишечной микробиоты на воспаление, ожирение и метаболическое заболевание» . Медицина генома . 8 (1): 42. DOI : 10.1186/S13073-016-0303-2 . PMC 4839080 . PMID 27098727 .

[:2-153] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Арриета, Мари-Клэр; Stiemsma, Leah T; Dimitriu, pedro a; Торсон, Лиза; Рассел, Шеннон; Юрист-Дауш, Софи; Кузелььевич, Борис; Золото, Мэтью Дж; Бриттон, Хайди М; Lefebvre, Diana L; Суббарао, Падмаджа; Мандхайн, Пюш; Беккер, Аллан; Макнагни, Келли М; Сирс, Малкольм Р; Коллманн, Тобиас; Мон, Уильям У; Турви, Стюарт Э; Бретт Финлей, Б. (2015). «Ранние микробные и метаболические изменения влияют на риск детской астмы» . Научная трансляционная медицина . 7 (307): 307RA152. doi : 10.1126/scitranslmed.aab2271 . PMID 26424567 . S2CID 206687974 .

[:3-154] Jump up to: ^а ^{беременный} Stiemsma, Leah T; Турви, Стюарт Э. (2017). «Астма и микробиом: определение критического окна в раннем возрасте» . Аллергия, астма и клиническая иммунология . 13 : 3. DOI : 10.1186/S13223-016-0173-6 . PMC 5217603 . PMID 28077947 .

[:02-155] IPCI, Каган; Altıntoprak, Niyazi; Мулук, Нурай Баяр; Senturk, Mehmet; Cingi, Cemal (2016). «Возможные механизмы человеческого микробиома при аллергических заболеваниях». Европейские архивы Ото-рхино-ларингологии . 274 (2): 617–626. doi : 10.1007/s00405-016-4058-6 . PMID 27115907 . S2CID 27328940 .

[156] Мариньо, Элиана; Ричардс, Джеймс Л.; McLeod, Keiran H.; и др. (Май 2017). «Микробные метаболиты кишечника ограничивают частоту аутоиммунных Т -клеток и защищают от диабета 1 типа» . Природа иммунология . 18 (5): 552–562. doi : 10.1038/ni.3713 . ISSN 1529-2916 . PMID 28346408 . S2CID 30078908 .

[157] Bettelli E, Carrier Y, Gao W, Korn T, Strom TB, Oukka M, Weiner HL, Cuchro Vk (май 2006 г.). «Взаимные пути развития для генерации патогенных эффектора Th17 и регуляторных Т -клеток». Природа . 441 (7090): 235–238. Bibcode : 2006natur.441..235b. doi : 10.1038/nature04753. PMID 16648838.

[:4-158] Jump up to: ^а ^{беременный} Säemann, Marcus D.; Böhmig, Georg A.; Österreicher, Christoph H.; и др. (Декабрь 2000 г.). «Противовоспалительное влияние бутирата натрия на моноциты человека: мощное ингибирование IL-12 и повышение регуляции продукции IL-10» . Журнал FASEB . 14 (15): 2380–2382. doi : 10.1096/fj.00-0359fje . ISSN 0892-6638 . PMID 11024006 . S2CID 41553220 .

[:5-159] Гао, Z; Инь, J; Чжан, J; Уорд Р. Э; Мартин Р. Дж; Лефевр, м; Cefalu, W. T; Ye, J (2009). «Бутират улучшает чувствительность к инсулину и увеличивает расходы на энергию у мышей» . Диабет . 58 (7): 1509–1517. doi : 10.2337/db08-1637 . PMC 2699871 . PMID 19366864 .

[160] Мазиди, Мохсен; Резай, Пейман; Кенгне, Андре Паскаль; Mobarhan, Majid Ghayour; Фернс, Гордон А (2016). «Микробиом кишечника и метаболический синдром». Диабет и метаболический синдром: клинические исследования и обзоры . 10 (2): S150–157. doi : 10.1016/j.dsx.2016.01.024 . PMID 26916014 .

[Chen2013rev-161] Чен, Сяо; Д'Суза, Рошан; Hong, Seong-Thool (2013). «Роль кишечной микробиоты на оси кишечника-мозга: текущие проблемы и перспективы» . Белок и клетка . 4 (6): 403–414. doi : 10.1007/s13238-013-3017-x . PMC 4875553 . PMID 23686721 .

[ReferenceC-162] Jump up to: ^а ^{беременный} Мёллер, Эндрю Х.; Ли, Йингинг; Ngole, Eitel mpoudi; Ахука-Мундеке, Стив; Лонсдорф, Элизабет В.; Пьюзи, Энн Э.; Питерс, Мартин; Hahn, Beatrice H.; Ochman, Howard (2014-11-18). «Быстрые изменения в кишечном микробиоме во время эволюции человека» . Труды Национальной академии наук . 111 (46): 16431–16435. Bibcode : 2014pnas..11116431M . doi : 10.1073/pnas.1419136111 . ISSN 0027-8424 . PMC 4246287 . PMID 25368157 .

[163] Брун, А. (2014). «Симбиотическое пищеварение лигноцеллюлозы в термитных кишках». Nature Reviews Microbiology . 12 (3): 168–180. doi : 10.1038/nrmicro3182 . PMID 24487819 . S2CID 5220210 .

[ReferenceA-164] Jump up to: ^а ^{беременный} Дитрих, C.; Köhler, T.; Брун, А. (2014). «Происхождение таракана микробиоты Termite кишечника: паттерны в структуре бактериального сообщества отражают серьезные эволюционные события» . Прикладная и экологическая микробиология . 80 (7): 2261–2269. Bibcode : 2014apenm..80.2261d . doi : 10.1128/aem.04206-13 . PMC 3993134 . PMID 24487532 .

[ReferenceB-165] Jump up to: ^а ^{беременный} Микаелан, а.; Дитрих, C.; Köhler, T.; Poulsen, M.; Sillam-Dussès, D.; Брун, А. (2015). «Диета является основной детерминантой структуры бактериального сообщества в кишечниках более высоких термитов». Молекулярная экология . 24 (20): 5824–5895. Bibcode : 2015molec..24.5284m . doi : 10.1111/mec.13376 . PMID 26348261 . S2CID 206182668 .

[166] Микаелан, а.; Томпсон, C.; Hofer, M.; Брун, А. (2016). «Детерминистическая сборка сложных бактериальных сообществ в кишечниках тараканов без зародышей» . Прикладная и экологическая микробиология . 82 (4): 1256–1263. doi : 10.1128/aem.03700-15 . PMC 4751828 . PMID 26655763 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

[ 45 ]

[ 46 ]

[ 47 ]

[ 48 ]

[ 49 ]

[ 50 ]

[ 51 ]

[ 52 ]

[ 53 ]

[ 54 ]

[ 55 ]

[ 56 ]

[ 57 ]

[ 58 ]

[ 59 ]

[ 60 ]

[ 61 ]

[ 62 ]

[ 63 ]

[ 64 ]

[ 65 ]

[ 66 ]

[ 67 ]

[ 68 ]

[ 69 ]

[ 70 ]

[ 71 ]

[ 72 ]

[ 73 ]

[ 74 ]

[ 75 ]

[ 76 ]

[ 77 ]

[ 78 ]

[ 79 ]

[ 80 ]

[ 81 ]

[ 82 ]

[ 83 ]

[ 84 ]

[ 85 ]

[ 86 ]

[ 87 ]

[ 88 ]

[ 89 ]

[ 90 ]

[ 91 ]

[ 92 ]

[ 93 ]

[ Примечание 1 ]

[ 94 ]

[ 95 ]

[ 96 ]

[ 97 ]

[ 98 ]

[ 99 ]

v Т и Человеческая микробиота
Человеческая флора	Кишечник Легкое Рот Кожа Влагалище Во время беременности При бактериальном вагинозе Плацента Матка Слюна Человеческий вирус Микобиота
Расстройства и терапия	Дисбиоз Перенос фекалий
Связанный	Проект человеческого микробиома OpenBiome
Категория