Гистон ацетилтрансфераза
GCN5 гистон ацетилтрансфераза | |||
---|---|---|---|
![]() | |||
Идентификаторы | |||
ЕС №. | 2.3.1.48 | ||
CAS №. | 9054-51-7 | ||
Базы данных | |||
Intenz | Intenz View | ||
Бренда | Бренда вход | ||
Расширение | Вид Nicezyme | ||
Кегг | Кегг вход | ||
Метатический | Метаболический путь | ||
Напрямую | профиль | ||
PDB Структуры | RCSB PDB PDBE PDBSUM | ||
Джин Онтология | Друг / Quickgo | ||
|
Гистонцетилтрансферазы ( HAT ) представляют собой ферменты , которые ацетилат- консервативные лизина аминокислоты на гистоновых белках путем переноса ацетильной группы из ацетил-КоА с образованием ε- n -ацетиллизин. ДНК обернута вокруг гистонов, и, передавая ацетильную группу в гистоны, гены могут быть включены и выключены. В целом, ацетилирование гистона увеличивает экспрессию генов.
В целом, ацетилирование гистона связано с активацией транскрипции и связано с эухроматином . Эухроматин, который является менее плотно компактным, позволяет более легко связываться факторы транскрипции с регуляторными сайтами на ДНК, вызывая активацию транскрипции. Когда это было впервые обнаружено, считалось, что ацетилирование лизина нейтрализует нормально присутствующий положительный заряд , тем самым снижая аффинность между гистоном и (отрицательно заряженной) ДНК, что делает ДНК более доступной для факторов транскрипции . Исследования, с тех пор, чтобы показать, что ацетилирование лизина и другие посттрансляционные модификации гистонов генерируют сайты связывания для специфических доменов взаимодействия белка-белка, таких как ацетиллизин-связывающий бромодомен [ Цитация необходима ] Полем Гистонцетилтрансферазы также могут ацетилат неистоновые белки, такие как ядерные рецепторы и другие транскрипционные факторы, чтобы облегчить экспрессию генов.
Есть семьи
[ редактировать ]Шляпы традиционно делятся на два разных класса на основе их субклеточной локализации. [ 2 ] Шляпы типа А расположены в ядре и участвуют в регуляции экспрессии генов посредством ацетилирования нуклеосомных гистонов в контексте хроматина. [ 3 ] Они содержат бромодомен , который помогает им распознавать и связываться с ацетилированными остатками лизина на гистоновых субстратах. GCN5, P300/CBP и TAF II 250 являются некоторыми примерами шляп типа A, которые сотрудничают с активаторами для улучшения транскрипции. Шляпы типа B расположены в цитоплазме и отвечают за ацетилирование вновь синтезированных гистонов перед их сборкой в нуклеосомы . Этим шляпам не хватает бромодомена, так как их цели неацетилированы. Ацетильные группы, добавленные шляпами типа B в гистоны, удаляются HDAC, как только они попадают в ядро и включены в хроматин . HAT1 является одним из немногих известных примеров шляпы типа B. [ 4 ] Несмотря на эту историческую классификацию шляп, некоторые белки шляпы функционируют в нескольких комплексах или местах и, таким образом, не будут легко вписаться в конкретный класс. [ 5 ]

Связанные с GCN5 N -ацетилтрансферазы (комары)
[ редактировать ]Шляпы могут быть сгруппированы в несколько различных семейств на основе гомологии последовательности, а также общих структурных особенностей и функциональных ролей. Семейство , связанное с GCN5 N- ацетилтрансферазой (GNAT), включает в себя GCN5, PCAF , HAT1, ELP3 , HPA2, HPA3, ATF-2 и NUT1. Эти шляпы, как правило, характеризуются присутствием бромодомена, и они обнаружили, что они являются ацетилатными остатками лизина на гистонах H2B , H3 , [ 6 ] и H4 . [ 2 ] Все члены семейства GNAT характеризуются до четырех консервативных мотивов (AD), найденных в домене каталитической шляпы. Это включает в себя наиболее высоко консервативный мотив A, который содержит последовательность ARG/GLN-XX-GLY-X-GLY/ALA, которая важна для распознавания и связывания ацетил-КоА . [ 4 ] Мотив C находится в большинстве комаров, но он не присутствует в большинстве других известных шляп. [ 5 ] Шляпа дрожжей GCN5 (общий контроль Nonderepressible-5) является одним из наиболее охарактеризованных членов этой семьи. Он имеет четыре функциональных домена, включая N-концевой домен, высококонсервативный каталитический (HAT) домен, домен взаимодействия ADA2 и C-концевой бромодомен. PCAF (P300/CBP-ассоциированный фактор) и GCN5 являются комарами млекопитающих, которые имеют высокую степень гомологии во всех своих последовательностях. Эти белки имеют N-концевую область из 400 ресурсов, которая отсутствует в дрожжевой GCN5, но их функции HAT эволюционно сохраняются по отношению к последнему. HAT1 был первым белком шляпы, который был идентифицирован. Он отвечает за большую часть активности цитоплазматической шляпы у дрожжей, и он сильно связывается с гистоном H4 в силу своей связи с дополнительной субъединицей, Hat2. ELP3 является примером шляпы типа А, найденной в дрожжах. Он является частью голоевмента РНК -полимеразы II и играет роль в удлинении транскрипции .
Мисты
[ редактировать ]Myst Family of Hats названа в честь четырех членов -основателей Moz , YBF2 (SAS3), SAS2 и TIP60 . [ 2 ] Другие важные члены включают ESA1 , MOF , MORF и HBO1 . Эти шляпы обычно характеризуются присутствием цинковых пальцев и хромодоменов , и они обнаружены ацетилатными остатками лизина на гистонах H2A , H3 и H4. Несколько белков Myst Family содержат цинковые пальцы, а также высококонсервативный мотив A, обнаруженный среди комаров, который облегчает связывание ацетил-КоА. [ 4 ] Область, богатая цистеином, расположенную в N-конечном домене HAT-домена белков Myst, участвует в связывании цинка, что необходимо для активности HAT. [ 7 ] TIP60 (TAT-Interactive Protein, 60 кДа) был первым человеческим членом семьи Myst, который проявил активность HAT. SAS3, обнаруженный у дрожжей, является гомологом MOZ (моноцитарный лейкоз цинковой белок пальцев), который является онкогеном, обнаруженным у людей. ESA1 был первой важной шляпой, которую можно было бы найти в дрожжах, а MOF - его гомолог в фруктовых мухах. Активность последнего шляпы необходима для двойной увеличения транскрипции мужской хромосомы X ( дозировка ) у мух. Человеческий HBO1 (HAT, связанная с ORC1), была первой шляпой, которая была связана с компонентами происхождения комплекса репликации . MORF (связанный с MOZ Factor) демонстрирует очень близкую гомологию MOZ на протяжении всей своей длины. [ 5 ] Он содержит N-концевую область репрессии, которая уменьшает свою активность HAT in vitro , а также C-концевой домен активации, который является функциональным при отсутствии домена HAT.
Другие
[ редактировать ]В дополнение к тем, которые являются членами семейств комара и миста, есть несколько других белков, которые обычно встречаются у более высоких эукариот, которые проявляют активность HAT. К ним относятся P300/CBP, коактиваторы ядерных рецепторов (например, ACTR/SRC-1), TAF II 250, TFIIIC, RTT109 и часы . P300/CBP для метазоя -специфичные [ 8 ] и содержит несколько областей цинковых пальцев, бромодомен, каталитический (HAT) домен и области, которые взаимодействуют с другими факторами транскрипции. [ 4 ] Важно отметить, что в домене HAT не показывает гомологию последовательности для других известных шляп, [ 9 ] и необходимо для того, чтобы P300/CBP функционировал в транскрипционной активации. [ 4 ] Кроме того, эти белки содержат несколько мотивов домена HAT (A, B и D), которые похожи на мотивы комаров. Они также обладают новым мотивом, который гомологичен последовательностям в доменах комаров. TFIIIC является одним из общих факторов транскрипции, участвующих в транскрипции, опосредованной РНК -полимеразой III . Было показано, что три компонента в белке человека обладают независимой активностью HAT ( HTFIIIC220 , HTFIIIC110 и HTFIIIC90 ). [ 10 ] RTT109 -это шляпа, специфичная для грибки , которая требует связи с белками гистон шаперона для активности. [ 8 ] Шляпа деятельности человеческого TAF II 250 и тактовых коактиваторов не была тщательно изучена. TAF II 250 является одной из TBP-ассоциированных факторных субъединиц TFIID , и он имеет паттерн Gly-X-Gly с GCN5, который важен для активности HAT. [ 5 ] Часы - это циркадный ритм -регулятор, который функционирует с BMAL1 для выполнения своей активности HAT. [ 11 ]
Коактиваторы ядерных рецепторов
[ редактировать ]Три важных коактиватора ядерного рецептора, которые демонстрируют активность HAT, являются SRC-1 , ACTR и TIF-2 . Известно, что SRC-1 (SRC-1 (стероидный рецептор коактиватор-1) взаимодействует с P300/CBP и PCAF, а его домен HAT расположен в его C-концевой области. ACTR (также известный как RAC3, AIB1 и TRAM-1 у людей) разделяет значительную гомологию последовательности с SRC-1, в частности в N-концевых и C-концевых (HAT) областях, а также в доменах взаимодействия с рецептором и коактиватором Полем [ 5 ] ACTR также взаимодействует с P300/CBP и PCAF. Первый может предотвратить связывание ACTR и активирование своего рецептора, ацетилизировав его в домене взаимодействия рецептора. TIF-2 (транскрипционный промежуточный фактор 2; также известный как GRIP1) является еще одним коактиватором ядерного рецептора с активностью HAT, а также взаимодействует с P300/CBP.
Таблица, обобщающая различные семейства шляп, вместе с связанными с ними членами, родительскими организмами, мультисубунитными комплексами, гистоновыми субстратами и структурными особенностями, представлена ниже. [ 2 ] [ 5 ] [ 8 ] [ 10 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ]
Семья | Члены | Организм | Связанные комплексы | Субстратная специфичность | Структурные особенности |
---|---|---|---|---|---|
Комар | GCN5 | S. cerevisiae | Сага, Slik (сальса), там,
Hat-A2 |
H2B, H3, (H4) | Bromoodamain |
GCN5 | Д. Меланогастер | Сага, атака | H3, H4 | Bromoodamain | |
GCN5 | H. Sapiens | Staga, tftc | H3, (H4, H2B) | Bromoodamain | |
PCAF | H. Sapiens | PCAF | H3, H4 | Bromoodamain | |
Hat1 | S. cerevisiae H. Sapiens |
Hat-B, Nub4, Hat-A3 | H4, (H2A) | ||
ELP3 | S. cerevisiae | Удлинение | H3, H4, (H2A, H2B) | ||
HPA2 | S. cerevisiae | Шляпа-б | H3, H4 | ||
HPA3 | S. cerevisiae | H3, H4 | |||
ATF-2 | S. cerevisiae H. Sapiens |
H2B, H4 | |||
Орех | S. cerevisiae | Посредник | H3, H4 | ||
Мист | ESA1 | S. cerevisiae | Nua4, маленький nua4 | H2A, H4, (H2B, H3) | Хромодомен |
SAS2 | S. cerevisiae | SAS, NUA4 | H4, (H2A, H3) | ||
SAS3 (YBF2) | S. cerevisiae | Namu3 | H3, (H4, H2A) | ||
TIP60 | H. Sapiens | TIP60, NUA4 | H2A, H4, (H3) | Хромодомен | |
Моф | Д. Меланогастер | MSL | H4, (H2A, H3) | Хромодомен | |
Моз | H. Sapiens | MSL | H3, H4 | ||
Морф | H. Sapiens | MSL | H3, H4 | ||
HBO1 | H. Sapiens | Орк | H3, H4 | ||
P300/CBP | P300 | H. Sapiens | H2A, H2B, H3, H4 | Bromoodamain | |
CBP | H. Sapiens | H2A, H2B, H3, H4 | Bromoodamain | ||
SRC
(коактиваторы ядерных рецепторов) |
SRC-1 | H. Sapiens | ACTR/SRC-1 | H3, H4 | |
ACTR (RAC3, AIB1, TRAM-1, SRC-3) | H. Sapiens | ACTR/SRC-1 | H3, H4 | ||
TIF-2 (GRIP1) | H. Sapiens | H3, H4 | |||
Другой | Тай II 250 (TAF1) | S. cerevisiae H. Sapiens |
TFID | H3, H4, (H2A) | Bromoodamain |
TFIIIC (P220, P110, P90) | H. Sapiens | Tfiiic | H2A, H3, H4 | ||
RTT109 | S. cerevisiae | Гистоновые шапероны | H3 | ||
ЧАСЫ | H. Sapiens | H3, H4 |
Общая структура
[ редактировать ]
В целом, шляпы характеризуются структурно консервативной областью ядра, состоящей из трехцепочечного β-листа , за которым следует длинная α-спираль , параллельная и охватывающая одну его сторону. [ 7 ] [ 8 ] Основная область, которая соответствует мотивам A, B и D белков GNAT, [ 4 ] на противоположных сторонах фланка с помощью N- и C-концевых сегментов α/β, которые структурно уникальны для данного семейства HAT. [ 7 ] [ 8 ] Центральное ядро и фланкирующие сегменты вместе образуют расщелину над первым, где гистоновые субстраты могут связываться до катализа. [ 8 ] В то время как центральный домен ядра (мотив A в монах) участвует в связывании ацетил-КоА и катализе, сегменты N- и C-концевых помогают в субстратах гистонов связывания. [ 7 ] Уникальные особенности, связанные с последовательности и/или структурой N- и C-концевых областей для различных семейств HAT, могут помочь объяснить некоторые наблюдаемые различия между шляпами в специфичке гистонового субстрата. Было обнаружено, что связывание COA расширяет канавку связывания гистонов в центральном ядре, перемещая С-концевой сегмент GCN5 наружу. Кроме того, поскольку контакты между COA и белком облегчают образование благоприятных контактов с гистоном белка, вероятно, что связывание COA предшествует связыванию гистонов in vivo .
Семьи комара и миста
[ редактировать ]Шляпы в семействе GNAT наиболее заметно характеризуются доменом примерно 160 ресурсов и C-концевой бромодоменом, который связывается с ацетилированными остатками лизина. [ 7 ] У тех, кто в семье, есть домены шляпы, которые имеют длину около 250 остатков. Многие белки MySt также содержат богатый цинтеином, связывающий цинк-связывающий домен в области HAT в дополнение к N-концевому хромодомену, который связывается с метилированными остатками лизина .
В более широком масштабе структуры каталитических доменов белков GNAT (GCN5, PCAF) демонстрируют смешанную α/β-глобулярную складку с пятью α-спиралью и шестью β-цепь. [ 4 ] Общая топология напоминает виды с центральным ядром белка у основания и сегментами N- и C-концевых по бокам.
Семья P300/CBP
[ редактировать ]Шляпы P300/CBP имеют большие домены шляпы (около 500 остатков), чем те, которые присутствуют в семьях комара и миста. [ 7 ] Они также содержат бромодомен, а также три богатых цистеина/гистидина, которые, как полагают, опосредуют взаимодействия с другими белками. Структура p300/CBP характеризуется удлиненным шаровидным доменом, который содержит семицепочечный β-лист в центре, который окружен девятью α-спиралями и несколькими петлями. [ 9 ] Структура центральной области ядра, связанная с связыванием ацетил-КоА, сохраняется в отношении комара и миста, но существует много структурных различий в регионах, фланкирующих это центральное ядро. В целом, структурные данные согласуются с тем фактом, что шляпы P300/CBP более беспорядочны, чем GNAT и Myst HAT в отношении связывания субстрата.
RTT109
[ редактировать ]Структура RTT109 очень похожа на структуру p300, несмотря на то, что между двумя белками есть только 7% идентичности последовательности. [ 9 ] Существует семицепочечный β-лист, который окружен α-спиралами, а также петлей, который участвует в связывании субстрата ацетил-КоА. Несмотря на консервативную структуру, RTT109 и P300/CBP функционально уникальны. Например, сайт связывания субстрата первого более похож на сайт комара и миста. Кроме того, остатки в активном участке каждого фермента различны, что предполагает, что они используют различные каталитические механизмы для переноса ацетильной группы.
Каталитические механизмы
[ редактировать ]Основной механизм, катализируемый шляпами, включает в себя перенос ацетильной группы из ацетил-КоА в ε-амино-группу целевой боковой цепи лизина внутри гистона. [ 8 ] Различные семьи шляп используют уникальные стратегии, чтобы добиться такой трансформации.

Семья комаров
[ редактировать ]Члены семейства GNAT имеют консервативный остаток глутамата, который действует как общее основание для катализирования нуклеофильной атаки амина лизина на связь тиоэфира ацетил-КоА. [ 8 ] Эти шляпы используют упорядоченный последовательный механизм Bi-Bi, при котором оба субстрата (ацетил-КоА и гистон) должны связываться с формированием тройного комплекса с ферментом до того, как может произойти катализ. Сначала связывается ацетил-КоА с последующим гистоновым субстратом. Консервативный остаток глутамата (GLU173 в дрожжах GCN5) активирует молекулу воды для удаления протона из аминной группы на лизине, которая активирует ее для прямой нуклеофильной атаки на углерод карбонила ацетил-коа, связанного с ферментами. После реакции ацетилированный гистон высвобождается сначала с последующим COA. [ 4 ] [ 8 ]
Мист Семья
[ редактировать ]Исследования дрожжей ESA1 из семейства шляп Myst выявили механизм пинг-понга, включающий консервативные остатки глутамата и цистеина. [ 18 ] Первая часть реакции включает в себя образование ковалентного промежуточного звена, в котором остаток цистеина становится ацетилированным после нуклеофильной атаки этого остатка на углерод углерода ацетил-КоА. Затем остаток глутамата действует как общее основание для облегчения переноса ацетильной группы от цистеина в гистоновый субстрат способом, аналогичным механизму, используемому комарами. Когда ESA1 собирается в комплексе Piccolo NUA4 , он теряет свою зависимость от остатка цистеина для катализа, что позволяет предположить, что реакция может происходить через тройной механизм Bi-Bi, когда фермент является частью физиологически значимого многопротеинового комплекса.
Семья P300/CBP
[ редактировать ]У человека P300 TYR1467 действует как общая кислота, а TRP1436 помогает ориентировать остаток лизина -мишени гистонового субстрата в активное участие. [ 8 ] Эти два остатка высоко консервативны в семье HAT P300/CBP, и, в отличие от ферментов в семьях GNAT и Myst, P300 не использует общую базу для катализа. Скорее, вероятно, что члены семьи P300/CBP используют теорелл-людский (то есть механизм ацетильного переноса «хит-и бег»).
RTT109
[ редактировать ]RTT109, вероятно, будет использовать механизм, который отличается от механизма других шляп. [ 9 ] Дрожжевой фермент обладает очень низкой каталитической активностью в отсутствие белков гистон шаперона ASF1 и VPS75, которые могут участвовать в доставке гистоновых субстратов в фермент для ацетилирования. [ 8 ] Более того, общая кислота или база еще не были идентифицированы для этой шляпы.
Связывание и специфичность субстрата
[ редактировать ]Структуры нескольких доменов HAT, связанных с ацетил-CoA и гистоновыми субстратными пептидами, показывают, что последний связывается через канавку на белке, который образуется в области центральной ядра у основания и окружают с противоположными сторонами переменным N- и C -Пертные сегменты, которые опосредуют большинство взаимодействий с субстратным пептидом. [ 8 ] Вполне вероятно, что эти переменные области являются, по крайней мере, частично ответственны за наблюдаемую специфичность различных шляп для различных гистоновых субстратов.
Члены семей GNAT и Myst, а также RTT109 демонстрируют большую селективность субстрата, чем P300/CBP, что довольно беспорядочно в отношении связывания субстрата. [ 8 ] Принимая во внимание, что представляется, что только три -пять остатков по обе стороны от лизина, которые должны быть ацетилированными, необходимы для эффективного связывания субстрата и катализа членами семейства комара и p300/CBP, более дистальные области субстрата могут быть важны для эффективного ацетилирования Мистические семейные шляпы. [ 19 ]
Селективность лизина
[ редактировать ]Было показано, что различные шляпы, обычно в контексте мультисубнитных комплексов, в гистонах в гистонах.
Семья комаров
[ редактировать ]GCN5 не может ацетилат нуклеосомные гистоны в отсутствие других белковых факторов. [ 5 ] Однако в контексте таких комплексов, как Saga и ADA, GCN5 способен ацетировать H3K14 среди других сайтов в гистонах H2B, H3 и H4 (например, H3K9, H3K36, H4K8, H4K16). [ 3 ] [ 4 ] [ 7 ] [ 19 ] Как GCN5, так и PCAF имеют наиболее сильное предпочтение сайта для H3K14, либо в виде свободного гистона, либо внутри нуклеосомы. [ 4 ] [ 7 ] Ацетилиты HAT1 H4K5 и H4K12 и HPA2 ацетилита H3K14 in vitro . [ 4 ] [ 5 ]
Мист Семья
[ редактировать ]У мух ацетилирование H4K16 на мужской X -хромосоме MOF в контексте комплекса MSL коррелирует с активацией транскрипции в качестве механизма компенсации дозировки в этих организмах. [ 2 ] У людей комплекс MSL выполняет большую часть ацетилирования H4K16 по всему геному. В контексте их родственных комплексов SAS2 (SAS) и ESA1 (NUA4) также проводят ацетилирование H4K16, в частности в области теломер хромосом. Также наблюдается SAS2 для ацетилита H3K14 in vitro на свободных гистонах. [ 12 ] ESA1 также может также ацетировать H3K14 in vitro на свободных гистонах, а также H2AK5, H4K5, H4K8 и H4K12 либо in vitro , либо in vivo на нуклеосомных гистонах. H2AK7 и H2BK16 также наблюдаются ацетилируются ESA1 in vivo . Примечательно, что ни SAS2, ни ESA1 не могут ацетилат нуклеосомные гистоны in vitro в качестве свободного фермента. Это также относится и к SAS3, который, как наблюдается ацетилит H3K9 и H3K14 in vivo , а также остатки лизина на H2A и H4. Моз также может ацетировать H3K14. [ 19 ]
Другие
[ редактировать ]P300/CBP ацетилит все четыре нуклеосомные гистоны ядра одинаково хорошо. [ 4 ] In vitro наблюдалось, что ацетилит H2AK5, H2BK12, H2BK15, H3K14, H3K18, H4K5 и H4K8. [ 5 ] SRC-1 ацетилиты H3K9 и H3K14, TAF II 230 (Drosophila Homolog of TAF II 250) ацетилитов H3K14 и RTT109 ацетилитов H3K9, H3K23, [ 19 ] и H3K56 в присутствии ASF1 или VPS75. [ 9 ]
Неистоновые субстраты ( in vitro )
[ редактировать ]В дополнение к основным гистонам, определенные шляпы ацетилируют ряд других клеточных белков, включая транскрипционные активаторы , базальные факторы транскрипции , структурные белки, полиамины и белки, участвующие в ядерном импорте. [ 4 ] Ацетилирование этих белков может изменить их способность взаимодействовать с их родственной ДНК и/или белковыми субстратами. Идея о том, что ацетилирование может влиять на функцию белка таким образом, приводила к исследованию, касающейся роли ацетилтрансфераз в путях передачи сигнала, а также для того, может ли в этом отношении подходящая аналогия с киназами и фосфорилированием.
PCAF
[ редактировать ]PCAF и P300/CBP являются основными шляпами, которые, как наблюдалось, ацетилируют ряд неистоновых белков. Для PCAF они включают белки негистонового хроматина ( группа высокой мобильности (HMG) ) HMG-N2/HMG17 и HMG-I (Y) , транскрипционные активаторы P53 , MYOD , E2F (1-3) и ВИЧ-тат и общие факторы транскрипции TFIIE и TFIIF . [ 5 ] Другие белки включают CIITA , BRM (Remodeler Chromatin), NF-κB (P65), TAL1/SCL , BETA2/Neurod , C/EBPβ , IRF2 , IRF7 , YY1 , KLF13 , EVI1 , AME, ER81 и рецептор андрогена (AR ) [ 20 ] Также наблюдается PCAF, а ацетилат C-Myc , GATA-2 , ретинобластома (RB) , Ku70 и E1A- аденовирусный белок. [ 21 ] Он также может автоацетилит, который облегчает внутримолекулярные взаимодействия с его бромодоменом, который может быть вовлечен в регуляцию его активности HAT. [ 4 ]
P300/CBP
[ редактировать ]P300/CBP имеют много негистоновых субстратов, в том числе негистоновые хроматиновые белки HMG1 , HMG-N1/HMG14 и HMG-I (Y), транскрипционные активаторы P53, C-MYB , GATA-1 , EKLF , TCF , и ВИЧ-тат, коактиваторы ядерных рецепторов ACTR, SRC-1 и TIF-2 и общие факторы транскрипции TFIIE и TFIIF. [ 5 ] Другие субстраты включают факторы транскрипции SP1, KLF5 , FOXO1 , MEF2C , SRY , GATA-4 и HNF-6 , [ 12 ] HMG-B2 , [ 21 ] STAT3 , рецепторы андрогена и эстрогена (α) , GATA-2, GATA-3 , MYOD, E2F (1-3), P73 α, ретинобластома (RB), NF-κB (P50, P65), SMAD7 , Impormin-α , Ku70, yap1 , [ 22 ] E1A аденовирусный белок и S-HDAG ( малый дельта-антиген дельта гепатита ). [ 21 ] p300/CBP have also been observed to acetylate β-catenin , RIP140 , PCNA , the DNA metabolic enzymes flap endonuclease-1 , thymine DNA glycosylase , and Werner syndrome DNA helicase , STAT6 , Runx1 (AML1) , UBF, Beta2/NeuroD, CREB , C-Jun , C/EBPβ, NF-E2 , SREBP , IRF2, SP3 , YY1, KLF13, EVI1, BCL6 , HNF-4 , ER81 и FOXO4 (AFX) . [ 20 ]
Multisubunit Hat Complexes
[ редактировать ]Было обнаружено, что формирование мультисубнитных комплексов модулирует специфичность подложки HAT. [ 12 ] В целом, в то время как рекомбинантные шляпы способны не иметь ацетилатных гистонов, шляпы могут ацетилат нуклеосомные гистоны только тогда, когда они находятся в соответствующих комплексах in vivo Hat. [ 5 ] Некоторые из белков, которые ассоциируются с HAT в этих комплексах, функционируют, нацеленные на комплекс HAT на нуклеосомы в определенных областях в геноме . [ 2 ] [ 12 ] Например, было отмечено, что комплексы HAT (например, сага, NUA3) часто используют метилированные гистоны в качестве участков стыковки, так что субъединица каталитической шляпы может более эффективно выполнять ацетилирование гистонов. [ 2 ]
Кроме того, формирование мультисубнитных шляпных комплексов влияет на специфичность лизина шляп. [ 12 ] Конкретные остатки лизина, которые данные ацетилаты Hat могут стать либо более широкими, либо более ограниченными в области ассоциации с соответствующим комплексом. Например, специфичность лизина семейных шляп миста по отношению к их гистоновым субстратам становится более ограниченной, когда они ассоциируются со своими комплексами. Напротив, GCN5 приобретает способность ацетировать несколько участков в обоих гистонах H2B и H3, когда он соединяет другие субъединицы, чтобы сформировать комплексы SAGA и ADA. [ 4 ] Кроме того, специфичность сайта ацетилирования RTT109 продиктована его ассоциацией с VPS75 или ASF1. [ 19 ] В комплексе с первым, RTT109 ацетилита H3K9 и H3K27, но, когда в комплексе с последним он преимущественно ацетилирует H3K56. [ 8 ]
Регулирование активности шляпы
[ редактировать ]Каталитическая активность HAT регулируется двумя типами механизмов: (1) взаимодействие с регуляторными субъединицами белка и (2) аутоацетилирование. [ 8 ] Данная шляпа может регулироваться несколькими способами, и один и тот же эффектор может фактически привести к различным результатам в разных условиях. [ 4 ] Хотя ясно, что ассоциация HAT с мультипротеиновыми комплексами обеспечивает механизм регуляции как активности HAT, так и специфичности субстрата in vivo , молекулярная основа для того, как это на самом деле происходит в значительной степени неизвестно. [ 8 ] Тем не менее, данные свидетельствуют о том, что связанные субъединицы могут способствовать катализу, по крайней мере, частично, облегчая продуктивное связывание комплекса HAT с его нативными подложками гистонов.
Было показано, что семейство шляп, P300/CBP и RTT109 регулируется автоацетилированием. [ 8 ] Человеческий MOF, а также дрожжи ESA1 и SAS2 автоацетилируются в консервативном остатках лизина активного участка, и эта модификация необходима для их функции in vivo . Человек P300 содержит очень основную петлю, встроенный в середину его домена HAT, который гипетилирован в активной форме фермента. [ 8 ] [ 9 ] Было предложено, что при автоацетилировании этот цикл высвобождается из сайта связывания электроотрицательного субстрата, где он находится в неактивной шляпе. [ 23 ] Ацетилирование дрожжей RTT109 в Lys290 также необходимо для того, чтобы он проявил полную каталитическую активность. [ 24 ] Некоторые шляпы также ингибируются ацетилированием. Например, активность HAT коактиватора ядерного рецептора ACTR ингибируется при ацетилировании с помощью p300/cbp. [ 4 ]
Взаимодействие с HDACS
[ редактировать ]Гистонцетилтрансферазы (HAT) и гистоновые деацетилазы (HDAC) рекрутируются в их промоторы-мишени посредством физических взаимодействий с специфичными для последовательности факторов транскрипции. Обычно они функционируют в мультисубнитном комплексе, в котором необходимы другие субъединицы, чтобы они могли изменить остатки гистона вокруг сайта связывания. Эти ферменты также могут модифицировать неистоновые белки.
Биологическая роль
[ редактировать ]Ремоделирование хроматина
[ редактировать ]
Гистон ацетилтрансферазы выполняют много биологических ролей внутри клетки. Хроматин представляет собой комбинацию белков и ДНК, обнаруженных в ядре , и он подвергается многим структурным изменениям в виде различных клеточных событий, таких как репликация ДНК , репарация ДНК и транскрипция . [ 25 ] Хроматин в клетке можно найти в двух состояниях: конденсированный и безоговорочный. Последний, известный как эухроматин , является транскрипционно активным, тогда как первый, известный как гетерохроматин , является транскрипционно неактивным. [ 25 ] [ 26 ] Гистоны включают белковую часть хроматина. Существует пять различных гистоновых белков: H1, H2A, H2B, H3 и H4. Основной гистон образуется, когда два из каждого подтипа гистона, за исключением H1, образуют четвертичный комплекс. Этот октамерный комплекс в сочетании с 147 парами оснований ДНК, свернутой вокруг него, образует нуклеосому . [ 4 ] Гистон H1 блокирует комплекс нуклеосом вместе, и это последний белок, который связывается в комплексе.
Гистоны, как правило, являются положительно заряженными белками с N-концевыми хвостами, которые вытекают из ядра. Фосфодиэстерская основная цепь ДНК является отрицательной, что обеспечивает сильные ионные взаимодействия между гистоновыми белками и ДНК. Гистон ацетилтрансферазы переносят ацетильную группу в специфические остатки лизина на гистонах, что нейтрализует их положительный заряд и, таким образом, снижает сильные взаимодействия между гистоном и ДНК. [ 25 ] Считается, что ацетилирование также нарушает взаимодействия между отдельными нуклеосомами и действует как сайты взаимодействия для других ДНК-ассоциированных белков. [ 4 ]
Там могут быть разные уровни ацетилирования гистонов, а также другие типы модификаций, что позволяет клеткам контролировать уровень упаковки хроматина во время различных клеточных событий, таких как репликация, транскрипция, рекомбинация и восстановление. Ацетилирование является не единственной регуляторной посттрансляционной модификацией гистонов, которая диктует структуру хроматина; Также сообщалось о метилировании, фосфорилировании, АДФ-рибозилировании и убиквитинировании. [ 4 ] [ 25 ] Эти комбинации различных ковалентных модификаций на N-концевых хвостах гистонов были названы кодом гистона , и считается, что этот код может быть наследственный и сохранить в следующей генерации ячеек. [ 26 ]
Гистоновые белки H3 и H4 являются основными мишенями для шляп, но H2A и H2B также являются ацетилированными in vivo . Лизины 9, 14, 18 и 23 H3 и лизины 5, 8, 12 и 16 из H4 целенаправленны на ацетилирование. [ 4 ] [ 25 ] Лизины 5, 12, 15 и 20 ацетилизируются на гистоне H2B, в то время как только лизины 5 и 9 были ацетилированы на гистоне H2A. [ 4 ] [ 25 ] [ 26 ] С таким большим количеством различных сайтов для ацетилирования, высокий уровень специфичности может быть достигнут при запуска конкретных ответов. Примером этой специфичности является то, когда гистон H4 ацетилирован в лизинах 5 и 12. Эта схема ацетилирования наблюдалась во время синтеза гистонов. Другим примером является ацетилирование H4K16, которое было связано с дозирной компенсацией мужской х хромосомы у Drosophila melanogaster . [ 2 ] [ 4 ]
Экспрессия гена
[ редактировать ]
Модификации гистонов модулируют упаковку хроматина. Уровень упаковки ДНК важен для транскрипции генов, поскольку транскрипционная механизм должен иметь доступ к промотору, чтобы произойти транскрипция. [ 4 ] Нейтрализация заряженных остатков лизина с помощью шляп позволяет хроматину деконденс, чтобы этот механизм имел доступ к транскрибированию гена. Однако ацетилирование не всегда связано с повышенной транскрипционной активностью. Например, ацетилирование H4K12 было связано с конденсированным и транскрипционно неактивным хроматином. [ 27 ] Кроме того, некоторые модификации гистонов связаны как с усиленной, так и с подавленной активностью, в зависимости от контекста. [ 28 ]
Шляпы действуют как транскрипционные ко-активаторы или глушители генов и чаще всего встречаются в крупных комплексах, состоящих из 10-20 субъединиц, некоторые из которых разделяют между различными комплексами шляп. [ 25 ] Эти комплексы включают SAGA (SPT/ADA/GCN5L-ацетилтрансфераза), PCAF, ADA (транскрипционная адаптер), TFIID (фактор транскрипции II D), TFTC (не содержащий TBP TAF-комплекса) и NUA3/NUA4 (нуклеосомные ацетилтрансферазы H3 и NUA3/NUA4 (нуклеосомные ацетилтрансферазы H3 и NUA3 (нуклеосомные ацетилтрансферазы и NUA3/NUA4 (нуклеосомные ацетилтрансфера. H4). [ 2 ] [ 25 ] Эти комплексы модулируют специфичность HAT, доставляя шляпы в свои гены -мишени, где они могут затем ацетилат нуклеосомные гистоны. [ 25 ] Некоторые ко-активаторы транскрипции HAT содержат бромодомен , модуль 110 аминокислот, который распознает ацетилированные остатки лизина и функционально связан с ко-активаторами в регуляции транскрипции. [ 29 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Способность гистон ацетилтрансфераз манипулировать структурой хроматина и устанавливать эпигенетическую структуру делает их необходимыми для поддержания и выживания клеток. Процесс ремоделирования хроматина включает в себя несколько ферментов, включая HAT, которые помогают в реформации нуклеосом и необходимы для функционирования систем восстановления повреждений ДНК. [ 30 ] Шляпы участвовали в качестве аксессуаров для прогрессирования заболевания, особенно в нейродегенеративных расстройствах. Например, болезнь Хантингтона - это болезнь, которая влияет на двигательные навыки и умственные способности. Единственная известная мутация, которая была вовлечена в болезнь, находится в N-концевой области белкового хантингтина (HTT) . [ 31 ] Сообщалось, что HTT напрямую взаимодействует со шляпами и подавляет каталитическую активность P300/CBP и PCAF in vitro .
Синдром преждевременного старения человека Хитчинсон Гилфорд Прогерия вызван мутационным дефектом при обработке ламина А , белка ядерного матрикса . В мышиной модели этого состояния рекрутирование восстановления белков в участки повреждения ДНК задерживается. Молекулярный механизм, лежащий в основе этого отложенного отклика восстановления, включает в себя дефект ацетилирования гистона. [ 32 ] В частности, гистон H4 гипоацетилизируется в остатках лизина 16 (H4K16), и этот дефект связан с уменьшенной ассоциацией гистонцетилтрансферазы, MOF, с ядерной матрицей [ 32 ]
Спиноцеребеллярная атаксия типа 1 является нейродегенеративным заболеванием, которое возникает в результате дефектного мутантного белка атаксина-1 . Мутантный атаксин-1 , опосредованной гистонцетилтрансферазой, опосредованной уменьшает ацетилирование гистона, приводящее к репрессированной транскрипции . [ 33 ]
Шляпы также были связаны с управлением функциями обучения и памяти. Исследования показали, что мыши без PCAF или CBP демонстрируют доказательства нейродегенерации . [ 31 ] Мыши с делецией PCAF некомпетентны в отношении обучения, а мыши с делецией CBP, по-видимому, страдают от долговременной потери памяти. [ 34 ]
Неправильная регистрация равновесия между ацетилированием и деацетилированием также была связана с проявлением определенных раковых заболеваний. Если гистонцетилтрансферазы ингибируются, то поврежденная ДНК не может быть восстановлена, что в конечном итоге приводит к гибели клеток. Контроль процесса ремоделирования хроматина в раковых клетках может обеспечить новую лекарственную мишень для исследования рака. [ 35 ] Атака этих ферментов в раковых клетках может привести к увеличению апоптоза из -за высокого накопления повреждения ДНК. Один из таких ингибиторов гистон ацетилтрансферазы называется Гарцинол. Это соединение встречается в кожурах фрукта Garcinia indica , иначе известного как Мангостин . Чтобы изучить влияние Гарцинола на гистоновые ацетилтрансферазы, исследователи использовали HeLa клетки . Клетки подвергались облучению, создавая двойные разрывы в ДНК, и Гарцинол был введен в клетки, чтобы увидеть, повлиял ли они на реакцию повреждения ДНК. Если Гарцинол успешен при подавлении процесса не-гомологичного соединения , механизм репарации ДНК, который показывает предпочтение при фиксации разрывов с двумя цепками, [ 36 ] Затем он может служить радиосенсибилизатором , молекулой, которая увеличивает чувствительность клеток к повреждению радиации. Увеличение радиочувствительности может повысить эффективность лучевой терапии. [ 35 ]
Смотрите также
[ редактировать ]- Модифицирующие гистон ферменты
- Гистондеацетилаза (HDAC)
- Гистонметилтрансфераза (HMT)
- Контроль РНК -полимеразы структурой хроматина
- Ацетилтрансфераза
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Wang Y, Guo Y, Liu K, Yin Z, Liu R, Xia Y, Tan L, Yang P, Lee J, et al. (6 декабря 2017 г.). «KAT2A в сочетании с комплексом α-KGDH действует как гистон H3-сукцинилтрансфераза» . Природа . 552 (7684): 273–277. Bibcode : 2017natur.552..273W . doi : 10.1038/nature25003 . PMC 5841452 . PMID 29211711 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Ли К.К., Workman JL (апрель 2007 г.). «Комплексы гистонцетилтрансферазы: один размер не подходит всем» . Природные обзоры. Молекулярная клеточная биология . 8 (4): 284–95. doi : 10.1038/nrm2145 . PMID 17380162 . S2CID 1091590 .
- ^ Jump up to: а беременный Уивер Р. (2007). Молекулярная биология . МакГроу-Хилл. ISBN 978-0073319940 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k л м не а п Q. ведущий с Т в v В х Roth Sy, Denu JM, Allis CD (2001). «Гистон ацетилтрансферазы» . Ежегодный обзор биохимии . 70 : 81–120. doi : 10.1146/annurev.biochem.70.1.81 . PMID 11395403 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k л Sterner DE, Berger SL (июнь 2000 г.). «Ацетилирование гистонов и транскрипционных факторов» . Микробиология и молекулярная биология обзоры . 64 (2): 435–59. doi : 10.1128/mmbr.64.2.435-459.2000 . PMC 98999 . PMID 10839822 .
- ^ Мюллер, Мануэль М.; Мьюр, Том У. (2014-10-20). «Гистоны: на перекрестке химии пептидов и белков» . Химические обзоры . 115 (6). Американское химическое общество : 2296–2349. doi : 10.1021/cr5003529 . ISSN 0009-2665 . PMC 4378460 . PMID 25330018 . S2CID 33098192 . В этом обзоре приводятся это исследование. Миттал, C; Blacketer, MJ; Shogren-Knaak, MA (2014). «Секвенирование ацетилирования нуклеосом для изучения создания ацетилирования хроматина» . Аналитическая биохимия . 457 (457): 51–8. doi : 10.1016/j.ab.2014.04.024 . PMID 24769374 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час Marmorstein R (август 2001 г.). «Структура гистон ацетилтрансферазы» . Журнал молекулярной биологии . 311 (3): 433–44. doi : 10.1006/jmbi.2001.4859 . PMID 11492997 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k л м не а п Q. ведущий Yuan H, Marmorstein R (февраль 2013 г.). «Гистон ацетилтрансферазы: восходящие древние аналоги до протеинкиназ» . Биополимеры . 99 (2): 98–111. doi : 10.1002/bip.22128 . PMC 4017165 . PMID 23175385 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Marmorstein R, Trievel RC (январь 2009 г.). «Гистоновые модифицирующие ферменты: структуры, механизмы и специфичность» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - механизмы регуляции генов . 1789 (1): 58–68. doi : 10.1016/j.bbagrm.2008.07.009 . PMC 4059211 . PMID 18722564 .
- ^ Jump up to: а беременный Огризко В.В. (май 2001 г.). «Ацетилтрансферазы гистонов млекопитающих и их комплексы» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 58 (5–6): 683–92. doi : 10.1007/pl00000892 . PMC 11337353 . PMID 11437230 . S2CID 20905209 .
- ^ Doi M, Hirayama J, Sassone-Corsi P (май 2006 г.). «Циркадные регуляторные часы - это гистонцетилтрансфераза» . Клетка . 125 (3): 497–508. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.033 . PMID 16678094 . S2CID 5968161 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Кимура А., Мацубара К., Хорикоши М (декабрь 2005 г.). «Десятилетие ацетилирования гистонов: маркировка эукариотических хромосомов специфическими кодами» . Журнал биохимии . 138 (6): 647–62. doi : 10.1093/jb/mvi184 . PMID 16428293 .
- ^ Marmorstein R, Roth Sy (апрель 2001 г.). «Гистонцетилтрансферазы: функция, структура и катализ» . Текущее мнение в области генетики и развития . 11 (2): 155–61. doi : 10.1016/s0959-437x (00) 00173-8 . PMID 11250138 .
- ^ Anamika K, Krebs AR, Thompson J, Poch O, Devys D, Tora L (октябрь 2010 г.). «Уроки из исследований по всему геному: интегрированное определение функции коактиватора гистоновых ацетилтрансфераз» . Эпигенетика и хроматин . 3 (1): 18. doi : 10.1186/1756-8935-3-18 . PMC 2972259 . PMID 20961410 .
- ^ Carrozza MJ, Utley RT, Workman JL, Côté J (июнь 2003 г.). «Разнообразные функции комплексов гистонцетилтрансферазы» . Тенденции в генетике . 19 (6): 321–9. doi : 10.1016/s0168-9525 (03) 00115-x . PMID 12801725 .
- ^ Торок М.С., Грант П.А. (2004). «Белки гистонцетилтрансферазы способствуют транскрипционным процессам на нескольких уровнях» . Белки в эукариотической транскрипции . Достижения в химии белка. Тол. 67. Академическая пресса. С. 181–99. doi : 10.1016/s0065-3233 (04) 67007-0 . ISBN 9780120342679 Полем PMID 14969728 .
- ^ Vernarecci S, Tosi F, Faletici P (февраль 2010 г.). «Настройка ацетилированного хроматина с ингибиторами HAT: новый инструмент для терапии». Эпигенетика . 5 (2): 105–11. doi : 10.4161/epi.5.2.10942 . PMID 20160510 .
- ^ Берндсен CE, Albaugh Bn, Tan S, Denu JM (январь 2007 г.). «Каталитический механизм семейства миста ацетилтрансферазы» . Биохимия . 46 (3): 623–9. doi : 10.1021/bi602513x . PMC 2752042 . PMID 17223684 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и Берндсен CE, Denu JM (декабрь 2008 г.). «Катализ и выбор субстрата с помощью гистонов/белкового лизин ацетилтрансферазы» . Современное мнение в структурной биологии . 18 (6): 682–9. doi : 10.1016/j.sbi.2008.11.004 . PMC 2723715 . PMID 19056256 .
- ^ Jump up to: а беременный Ян XJ (октябрь 2004 г.). «Ацетилирование лизина и бромодомен: новое партнерство для передачи сигналов». Биологии . 26 (10): 1076–87. doi : 10.1002/bies.20104 . PMID 15382140 . S2CID 36755688 .
- ^ Jump up to: а беременный в Глозак М.А., Сенгупта Н., Чжан Х, Сето Е (декабрь 2005 г.). «Ацетилирование и деацетилирование неистоновых белков» . Ген . 363 : 15–23. doi : 10.1016/j.gene.2005.09.010 . PMID 16289629 .
- ^ Хата С., Хираяма Дж., Каджихо Х., Накагава К., Хата Ю., Катада Т., Фурутани-Сейки М., Нишина Х (июнь 2012 г.). «Новый цикл ацетилирования транскрипционного ко-активатора DES-ассоциированный белок, который находится ниже пути бегемота, запускается в ответ на алкилирующие агенты SN2» . Журнал биологической химии . 287 (26): 22089–98. doi : 10.1074/jbc.m111.334714 . PMC 3381167 . PMID 22544757 .
- ^ Лю Х, Ван Л., Чжао К., Томпсон П.Р., Хван Ю., Марморштейн Р., Коул П.А. (февраль 2008 г.). «Структурная основа ацетилирования белка с помощью транскрипционного коактиватора P300/CBP» . Природа . 451 (7180): 846–50. Bibcode : 2008natur.451..846L . doi : 10.1038/nature06546 . PMID 18273021 . S2CID 4426988 .
- ^ Albaugh Bn, Arnold KM, Lee S, Denu JM (июль 2011 г.). «Автоацетилирование гистонцетилтрансферазы RTT109» . Журнал биологической химии . 286 (28): 24694–701. doi : 10.1074/jbc.m111.251579 . PMC 3137045 . PMID 21606491 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Voet D, Voet JG (2004). Биохимия (3 -е и.). Хобокен, Нью -Джерси: Джон Вили и сыновья. ISBN 978-0-471-19350-0 .
- ^ Jump up to: а беременный в Tropp BE (2008). Молекулярная биология: гены белков (3 -е изд.). Садбери, штат Массачусетс: издатели Джонса и Бартлетта. ISBN 9780763709167 .
- ^ Grunstein M (сентябрь 1997 г.). «Ацетилирование гистона в структуре и транскрипции хроматина» . Природа . 389 (6649): 349–52. Bibcode : 1997natur.389..349G . doi : 10.1038/38664 . PMID 9311776 . S2CID 4419816 .
- ^ Voichek Y, Bar-Ziv R, Barkai N (март 2016 г.). «Выражение гомеостаз во время репликации ДНК» . Наука . 351 (6277): 1087–90. BIBCODE : 2016SCI ... 351.1087V . doi : 10.1126/science.aad1162 . PMID 26941319 . S2CID 32751800 .
- ^ Dhalluin C, Carlson JE, Zeng L, He C, Aggarwal AK, Zhou MM (июнь 1999 г.). «Структура и лиганд гистонцетилтрансферазы бромодомена» . Природа . 399 (6735): 491–6. Bibcode : 1999natur.399..491d . doi : 10.1038/20974 . PMID 10365964 . S2CID 1210925 .
- ^ Россетто Д., Трумэн А.В., Крон С.Дж., Кот Дж. (Сентябрь 2010 г.). «Эпигенетические модификации в двухцепочечном разрыве ДНК повреждение передачи сигналов и восстановления» . Клиническое исследование рака . 16 (18): 4543–52. doi : 10.1158/1078-0432.ccr-10-0513 . PMC 2940951 . PMID 20823147 .
- ^ Jump up to: а беременный Klein G, Vande Woude GF (2002). Достижения в области исследований рака, том 86 . Бостон: Академическая пресса. ISBN 978-0-12-006686-5 .
- ^ Jump up to: а беременный Кришнан В., Чоу Мз, Ван З., Чжан Л., Лю Б., Лю Х, Чжоу З. (июль 2011 г.). «Гистон H4 лизин 16 гипоацетилирование связано с дефектным восстановлением ДНК и преждевременным старением у мышей с дефицитом ZMPSTE24» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 108 (30): 12325–30. Bibcode : 2011pnas..10812325K . doi : 10.1073/pnas.1102789108 . PMC 3145730 . PMID 21746928 .
- ^ Cvetanovic M, Kular RK, Opal P (декабрь 2012 г.). «LANP опосредует неврологическую патологию при спиноцеребеллярной атаксии типа 1» . Нейробиол. Диск . 48 (3): 526–32. doi : 10.1016/j.nbd.2012.07.024 . PMC 3987943 . PMID 22884877 .
- ^ Furdas SD, Kannan S, Sippl W, Jung M (январь 2012 г.). «Маленькие ингибиторы молекулы гистон ацетилтрансферазы в качестве эпигенетических инструментов и кандидатов на лекарства» . Архив Дер Фармази . 345 (1): 7–21. doi : 10.1002/ardp.201100209 . PMID 22234972 . S2CID 3125138 .
- ^ Jump up to: а беременный Oike T, Ogiwara H, Torikai K, Nakano T, Yokota J, Kohno T (ноябрь 2012 г.). «Гарцинол, ингибитор гистон ацетилтрансферазы, радиоценсибилизирует раковые клетки, ингибируя нехомологичное соединение конец» . Международный журнал радиационной онкологии, биологии, физики . 84 (3): 815–21. doi : 10.1016/j.ijrobp.2012.01.017 . PMID 22417805 .
- ^ Burma S, Chen BP, Chen DJ (сентябрь 2006 г.). «Роль не-гомологичного конца соединения (NHEJ) в поддержании геномной целостности» . Репарация ДНК . 5 (9–10): 1042–8. doi : 10.1016/j.dnarep.2006.05.026 . PMID 16822724 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Гистон+ацетилтрансферазы в Национальной библиотеке медицины Медицинской библиотеки США (Mesh)